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細胞核・クロマチン構造のダイナミクスと遺伝子制御

計画研究

研究領域遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
研究課題/領域番号 18H05527
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関東京工業大学

研究代表者

木村 宏  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (30241392)

研究分担者 伊藤 由馬  東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (70803245)
大川 恭行  九州大学, 生体防御医学研究所, 教授 (80448430)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
235,690千円 (直接経費: 181,300千円、間接経費: 54,390千円)
2022年度: 46,150千円 (直接経費: 35,500千円、間接経費: 10,650千円)
2021年度: 46,150千円 (直接経費: 35,500千円、間接経費: 10,650千円)
2020年度: 46,150千円 (直接経費: 35,500千円、間接経費: 10,650千円)
2019年度: 46,150千円 (直接経費: 35,500千円、間接経費: 10,650千円)
2018年度: 51,090千円 (直接経費: 39,300千円、間接経費: 11,790千円)
キーワードクロマチン / 遺伝子発現 / 転写制御 / エピジェネティクス / ヒストン修飾 / 遺伝子発現制御 / 転写調節 / エピジェネティクス制御 / 転写 / ヒストン / 細胞核
研究成果の概要

転写活性化のされやすさ(ポテンシャル)という観点から、ヒストン修飾を介したクロマチン構造の機能を明らかにすることを目的として本研究を行った。ゼブラフィッシュ初期胚の生細胞イメージングにより、ヒストンアセチル化が転写活性化のポテンシャルを高めることを明らかにした。また、RNAポリメラーゼIIの転写開始型と伸長型のリン酸化を特異的に認識する遺伝子コード型の一本鎖可変領域抗体プローブを開発し、転写開始部位と転写伸長部位は局在や動態が異なることを明らかにし、細胞核内における転写モデルを提唱した。また、少数細胞エピゲノム解析法を開発した。

研究成果の学術的意義や社会的意義

ヒトなどの真核生物の細胞核に存在するDNAはヒストンタンパク質と結合しクロマチン構造をとって存在している。このクロマチン構造が遺伝子発現の制御に働くことが最近明らかになってきたが、生きた細胞中でどのように転写が起こるのについてはよくわかっていない。本研究では、ヒストンや転写を担う酵素であるRNAポリメラーゼIIの翻訳後修飾を生細胞観察することにより、転写の活性化や抑制にヒストン修飾が働くこと、および、転写が開始する場所と伸長する場所が異なることを明らかにした。本研究による転写の基本メカニズムに関する知見は、再生医療や細胞治療などの研究に波及効果がある。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (165件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (17件) 雑誌論文 (85件) (うち国際共著 37件、 査読あり 65件、 オープンアクセス 69件) 学会発表 (45件) (うち国際学会 20件、 招待講演 27件) 図書 (1件) 備考 (17件)

  • [国際共同研究] Hubrecht Institute(オランダ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Memorial Sloan Kettering Cencer Center/Colorado State University(米国)

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      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Lausanne University(スイス)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Cambridge University(英国)

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      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Colorado State University/Florida State University(米国)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] Hubrecht Institute(オランダ)

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] European Moleclar Biology Laboratory/Max Planck Institute-CBG/Karlsruhe Institute of Technology(ドイツ)

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      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Copenhagen(デンマーク)

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      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Cambridge/Crick Institute(英国)

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      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] Colorado State University(米国)

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      2020 実績報告書
  • [国際共同研究] New York University/Colorado State University/Florida State University(米国)

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      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Cambridge University/New Castle University(英国)

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      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] EMBL/Max Panck Institute, Dresden/Karlsruhe Institute of Technology(ドイツ)

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      2019 実績報告書
  • [国際共同研究] Colorado State University/HHMI Janelia Research Campus(米国)

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      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Cambridge University(英国)

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      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] MPI - Molecular Cell Biology & Genetics/Karlsruhe Institute of Technology/EMBL(ドイツ)

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      2018 実績報告書
  • [国際共同研究] Curie Insitute(フランス)

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      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] Epigenetic plasticity safeguards heterochromatin configuration in mammals2023

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Shimi Takeshi、Shimura Chikako、Ono Takao、Suzuki Takehiro、Onoue Kenta、Okayama Satoko、Miura Hisashi、Hiratani Ichiro、Ikeda Kazuho、Okada Yasushi、Dohmae Naoshi、Yonemura Shigenobu、Inoue Azusa、Kimura Hiroshi、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: - 号: 12 ページ: 6190-6207

    • DOI

      10.1093/nar/gkad387

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Actin filaments accumulated in the nucleus and remain in the vicinity of condensing chromosomes during prophase in zebrafish early embryo2023

    • 著者名/発表者名
      Oda Haruka、Sato Yuko、Kawashima Shigehiro A.、Fujiwara Yusuke、Palfy Mate、Wu Edlyn、Vastenhouw Nadine L.、Kanai Motomu、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Biology Open

      巻: 12 号: 5

    • DOI

      10.1242/bio.059783

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Live-cell tracking of γ-H2AX kinetics reveals the distinct modes of ATM and DNA-PK in the immediate response to DNA damage2023

    • 著者名/発表者名
      Trakarnphornsombat Watanya、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 136 号: 8

    • DOI

      10.1242/jcs.260698

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  • [雑誌論文] Dense and Acidic Organelle-Targeted Visualization in Living Cells: Application of Viscosity-Responsive Fluorescence Utilizing Restricted Access to Minimum Energy Conical Intersection2023

    • 著者名/発表者名
      Adachi Junya、Oda Haruka、Fukushima Toshiaki、Lestari Beni、Kimura Hiroshi、Sugai Hiroka、Shiraki Kentaro、Hamaguchi Rei、Sato Kohei、Kinbara Kazushi
    • 雑誌名

      Analytical Chemistry

      巻: 95 号: 12 ページ: 5196-5204

    • DOI

      10.1021/acs.analchem.2c04133

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Nanog organizes transcription bodies2023

    • 著者名/発表者名
      Kuznetsova Ksenia、Chabot No?mie M.、Ugolini Martino、Wu Edlyn、Lalit Manan、Oda Haruka、Sato Yuko、Kimura Hiroshi、Jug Florian、Vastenhouw Nadine L.
    • 雑誌名

      Current Biology

      巻: 33 号: 1 ページ: 164-173.e5

    • DOI

      10.1016/j.cub.2022.11.015

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Transient Methionine Deprivation Triggers Histone Modification and Potentiates Differentiation of Induced Pluripotent Stem Cells.2023

    • 著者名/発表者名
      Ozawa H, Kambe A, Hibi K, Murakami S, Oikawa A, Handa T, Fujiki K, Nakato R, Shirahige K, Kimura H, Shiraki N, Kume S
    • 雑誌名

      Stem Cells.

      巻: 41(3) 号: 3 ページ: 271-286

    • DOI

      10.1093/stmcls/sxac082

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The role of H3K9me3 in oral squamous cell carcinoma2023

    • 著者名/発表者名
      Tanaka Misako、Harada Hiroyuki、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 640 ページ: 56-63

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.11.102

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Euchromatin factors HULC and Set1C affect heterochromatin organization and mating-type switching in fission yeast <i>Schizosaccharomyces pombe</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Esquivel-Chavez Alfredo、Maki Takahisa、Tsubouchi Hideo、Handa Testuya、Kimura Hiroshi、Haber James E.、Thon Genevieve、Iwasaki Hiroshi
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems

      巻: 97 号: 3 ページ: 123-138

    • DOI

      10.1266/ggs.22-00012

    • ISSN
      1341-7568, 1880-5779
    • 年月日
      2022-06-01
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] STREAMING-tag system reveals spatiotemporal relationships between transcriptional regulatory factors and transcriptional activity2022

    • 著者名/発表者名
      Ohishi Hiroaki、Shimada Seiru、Uchino Satoshi、Li Jieru、Sato Yuko、Shintani Manabu、Owada Hitoshi、Ohkawa Yasuyuki、Pertsinidis Alexandros、Yamamoto Takashi、Kimura Hiroshi、Ochiai Hiroshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 7672-7672

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35286-2

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-cell profiling of transcriptome and histone modifications with EpiDamID2022

    • 著者名/発表者名
      Rang Franka J.、de Luca Kim L.、de Vries Sandra S.、Valdes-Quezada Christian、Boele Ellen、Nguyen Phong D.、Guerreiro Isabel、Sato Yuko、Kimura Hiroshi、Bakkers Jeroen、Kind Jop
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 82 号: 10 ページ: 1956-1970.e14

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.03.009

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      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Nucleoplasmic lamin C rapidly accumulates at sites of nuclear envelope rupture with BAF and cGAS2022

    • 著者名/発表者名
      Kono Yohei、Adam Stephen A.、Sato Yuko、Reddy Karen L.、Zheng Yixian、Medalia Ohad、Goldman Robert D.、Kimura Hiroshi、Shimi Takeshi
    • 雑誌名

      Journal of Cell Biology

      巻: 221 号: 12

    • DOI

      10.1083/jcb.202201024

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Superfluid helium nanoscope insert with millimeter working range2022

    • 著者名/発表者名
      Kamiya Naoki、Kuramoto Kazuki、Takishima Kento、Yumoto Tatsuya、Oda Haruka、Shimi Takeshi、Kimura Hiroshi、Matsushita Michio、Fujiyoshi Satoru
    • 雑誌名

      Review of Scientific Instruments

      巻: 93 号: 10 ページ: 103703-103703

    • DOI

      10.1063/5.0107395

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Intra Q-body: an antibody-based fluorogenic probe for intracellular proteins that allows live cell imaging and sorting2022

    • 著者名/発表者名
      Dai Yancen、Sato Yuko、Zhu Bo、Kitaguchi Tetsuya、Kimura Hiroshi、Ghadessy Farid J.、Ueda Hiroshi
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 13 号: 33 ページ: 9739-9748

    • DOI

      10.1039/d2sc02355e

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Imaging transcription elongation dynamics by new technologies unveils the organization of initiation and elongation in transcription factories2022

    • 著者名/発表者名
      Kimura Hiroshi、Sato Yuko
    • 雑誌名

      Current Opinion in Cell Biology

      巻: 74 ページ: 71-79

    • DOI

      10.1016/j.ceb.2022.01.002

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      2021 実績報告書
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  • [雑誌論文] Live imaging of transcription sites using an elongating RNA polymerase II-specific probe.2022

    • 著者名/発表者名
      Uchino S, Ito Y, Sato Y, Handa T, Ohkawa Y, Tokunaga M, Kimura H.
    • 雑誌名

      J Cell Biol.

      巻: 221 号: 2 ページ: 1-23

    • DOI

      10.1083/jcb.202104134

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      2021 実績報告書
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  • [雑誌論文] High-throughput single-cell epigenomic profiling by targeted insertion of promoters (TIP-seq).2021

    • 著者名/発表者名
      Bartlett DA, Dileep V, Handa T, Ohkawa Y, Kimura H, Henikoff S, Gilbert DM.
    • 雑誌名

      J Cell Biol.

      巻: 220 号: 12

    • DOI

      10.1083/jcb.202103078

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Chromatin loading of MCM hexamers is associated with di-/tri-methylation of histone H4K20 toward S phase entry.2021

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Takanaka Y, Hayashi Y, Hirano Y, Miyawaki-Kuwakado A, Ohkawa Y, Obuse C, Kimura H, Haraguchi T, Hiraoka Y.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 49 号: 21 ページ: 12152-12166

    • DOI

      10.1093/nar/gkab1068

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Recent advances in single-cell epigenomics2021

    • 著者名/発表者名
      Harada Akihito、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 71 ページ: 116-122

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2021.06.010

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      2021 実績報告書
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  • [雑誌論文] Visualizing looping of two endogenous genomic loci using synthetic zinc‐finger proteins with anti‐FLAG and anti‐HA frankenbodies in living cells2021

    • 著者名/発表者名
      Liu Yang、Zhao Ning、Kanemaki Masato T.、Yamamoto Yotaro、Sadamura Yoshifusa、Ito Yuma、Tokunaga Makio、Stasevich Timothy J.、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 26 号: 11 ページ: 905-926

    • DOI

      10.1111/gtc.12893

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL‐seq with single thin sections2021

    • 著者名/発表者名
      Maehara Kazumitsu、Tomimatsu Kosuke、Harada Akihito、Tanaka Kaori、Sato Shoko、Fukuoka Megumi、Okada Seiji、Handa Tetsuya、Kurumizaka Hitoshi、Saitoh Noriko、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology

      巻: 17 号: 11 ページ: 8934-8946

    • DOI

      10.15252/msb.202110323

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Multiplexed Imaging of Posttranslational Modifications of Endogenous Proteins in Live Cells2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Yuko、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2350 ページ: 31-41

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1593-5_3

    • ISBN
      9781071615928, 9781071615935
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      2021 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Live-cell imaging probes to track chromatin modification dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Yuko、Nakao Masaru、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Microscopy

      巻: 70 号: 5 ページ: 415-422

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfab030

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    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamic Behavior of Inactive X During the Cell Cycle as Revealed by H3K27me3-Specific Intracellular Antibody2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Yuko、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2329 ページ: 237-247

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1538-6_17

    • ISBN
      9781071615379, 9781071615386
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  • [雑誌論文] Live-cell imaging reveals the spatiotemporal organization of endogenous RNA polymerase II phosphorylation at a single gene2021

    • 著者名/発表者名
      Forero-Quintero Linda S.、Raymond William、Handa Tetsuya、Saxton Matthew N.、Morisaki Tatsuya、Kimura Hiroshi、Bertrand Edouard、Munsky Brian、Stasevich Timothy J.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 3158-3158

    • DOI

      10.1038/s41467-021-23417-0

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    • 著者名/発表者名
      M. Shibuta, T. Sakamoto, T. Yamaoka, M. Yoshikawa, S. Kasamatsu, N. Yagi, S. Fujimoto, T. Suzuki, S. Uchino, Y. Sato. H. Kimura, and S. Matsunaga
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 580-580

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      10.1038/s42003-021-02106-0

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    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Tachiwana, Mariko Dacher, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yosuke Seto, Ryohei Katayama, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka, Noriko Saitoh
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      巻: 10

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      10.7554/elife.66290

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      Imada Takashi、Shimi Takeshi、Kaiho Ai、Saeki Yasushi、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

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      巻: - 号: 5 ページ: 298-312

    • DOI

      10.1111/gtc.12840

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    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 6 号: 15 ページ: 10039-10046

    • DOI

      10.1021/acsomega.0c06281

    • NAID

      120007034011

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      Ho Cheng-Han、Takizawa Yoshimasa、Kobayashi Wataru、Arimura Yasuhiro、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Life Science Alliance

      巻: 4 号: 4 ページ: e202000919-e202000919

    • DOI

      10.26508/lsa.202000919

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      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing2021

    • 著者名/発表者名
      Tjalsma Sjoerd J D、Hori Mayako、Sato Yuko、Bousard Aurelie、Ohi Akito、Raposo Ana Claudia、Roensch Julia、Le Saux Agnes、Nogami Jumpei、Maehara Kazumitsu、Kujirai Tomoya、Handa Tetsuya、Bages‐Arnal Sandra、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi、da Rocha Simao Teixeira、Zylicz Jan J、Kimura Hiroshi、Heard Edith
    • 雑誌名

      EMBO reports

      巻: 22 号: 3

    • DOI

      10.15252/embr.202051989

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dynamics of transcription-mediated conversion from euchromatin to facultative heterochromatin at the Xist promoter by Tsix2021

    • 著者名/発表者名
      Ohhata Tatsuya、Yamazawa Kazuki、Miura-Kamio Asuka、Takahashi Saori、Sakai Satoshi、Tamura Yuka、Uchida Chiharu、Kitagawa Kyoko、Niida Hiroyuki、Hiratani Ichiro、Kobayashi Hisato、Kimura Hiroshi、Wutz Anton、Kitagawa Masatoshi
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 34 号: 13 ページ: 108912-108912

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.108912

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Live-cell epigenome manipulation by synthetic histone acetylation catalyst system2021

    • 著者名/発表者名
      Fujiwara Yusuke、Yamanashi Yuki、Fujimura Akiko、Sato Yuko、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Yamatsugu Kenzo、Kawashima Shigehiro A.、Kanai Motomu
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 118 号: 4

    • DOI

      10.1073/pnas.2019554118

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide analysis of chromatin structure changes upon MyoD binding in proliferative myoblasts during the cell cycle2021

    • 著者名/発表者名
      Wu Qianmei、Fujii Takeru、Harada Akihito、Tomimatsu Kosuke、Miyawaki-Kuwakado Atsuko、Fujita Masatoshi、Maehara Kazumitsu、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 6 ページ: 653-661

    • DOI

      10.1093/jb/mvab001

    • NAID

      40022687719

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Transcription organizes euchromatin via microphase separation2021

    • 著者名/発表者名
      Hilbert Lennart、Sato Yuko、Kuznetsova Ksenia、Bianucci Tommaso、Kimura Hiroshi、Julicher Frank、Honigmann Alf、Zaburdaev Vasily、Vastenhouw Nadine L.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 1360-1360

    • DOI

      10.1038/s41467-021-21589-3

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Variable immersion microscopy with a high numerical aperture2021

    • 著者名/発表者名
      Keita Ishida, Kanta Naruse, Yuta Mizouchi, Yoshihiro Ogawa, Michio Matsushita, Takeshi Shimi, Hiroshi Kimura, Satoru Fujiyoshi
    • 雑誌名

      Optics Letters

      巻: 46 号: 4 ページ: 856-859

    • DOI

      10.1364/ol.416006

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualizing transcription sites in living cells using a genetically encoded probe specific for the elongating form of RNA polymerase II2021

    • 著者名/発表者名
      Uchino Satoshi、Ito Yuma、Sato Yuko、Handa Tetsuya、Ohkawa Yasuyuki、Tokunaga Makio、Kimura Hitoshi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 441582-441582

    • DOI

      10.1101/2021.04.27.441582

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Discriminative feature of cells characterizes cell populations of interest by a small subset of genes2021

    • 著者名/発表者名
      Fujii Takeru、Maehara Kazumitsu、Fujita Masatoshi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 435089-435089

    • DOI

      10.1101/2021.03.12.435089

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cohesin and condensin extrude DNA loops in a cell cycle-dependent manner2020

    • 著者名/発表者名
      Golfier Stefan、Quail Thomas、Kimura Hiroshi、Brugues Jan
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 9

    • DOI

      10.7554/elife.53885

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Transcription-dependent cohesin repositioning rewires chromatin loops in cellular senescence2020

    • 著者名/発表者名
      Olan Ioana、Parry Aled J.、Schoenfelder Stefan、Narita Masako、Ito Yoko、Chan Adelyne S. L.、Slater Guy St.C.、Bihary Dora、Bando Masashige、Shirahige Katsuhiko、Kimura Hiroshi、Samarajiwa Shamith A.、Fraser Peter、Narita Masashi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 6049-6049

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19878-4

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-molecule imaging reveals control of parental histone recycling by free histones during DNA replication2020

    • 著者名/発表者名
      Gruszka D. T.、Xie S.、Kimura H.、Yardimci H.
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 6 号: 38

    • DOI

      10.1126/sciadv.abc0330

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Histone modification dynamics as revealed by multicolor immunofluorescence-based single-cell analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Takanaka Yoko、Kina Yuto、Nakamura Fumiaki、Becking Leontine E.、Nakao Yoichi、Nagase Takahiro、Nozaki Naohito、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 133 号: 14

    • DOI

      10.1242/jcs.243444

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide kinetic properties of transcriptional bursting in mouse embryonic stem cells2020

    • 著者名/発表者名
      Ochiai Hiroshi、Hayashi Tetsutaro、Umeda Mana、Yoshimura Mika、Harada Akihito、Shimizu Yukiko、Nakano Kenta、Saitoh Noriko、Liu Zhe、Yamamoto Takashi、Okamura Tadashi、Ohkawa Yasuyuki、Kimura Hiroshi、Nikaido Itoshi
    • 雑誌名

      Science Advances

      巻: 6 号: 25

    • DOI

      10.1126/sciadv.aaz6699

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genomic Profiling by ALaP-Seq Reveals Transcriptional Regulation by PML Bodies through DNMT3A Exclusion2020

    • 著者名/発表者名
      Kurihara Misuzu、Kato Kagayaki、Sanbo Chiaki、Shigenobu Shuji、Ohkawa Yasuyuki、Fuchigami Takeshi、Miyanari Yusuke
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 78 号: 3 ページ: 493-505

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2020.04.004

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Physics of chromatin dynamics at the 57th Biophysical Society of Japan meeting.2020

    • 著者名/発表者名
      Yuma Ito、Akatsuki Kimura
    • 雑誌名

      Biophys Rev

      巻: - 号: 2 ページ: 265-266

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00642-3

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL-seq with single-thin sections2020

    • 著者名/発表者名
      Maehara Kazumitsu、Tomimatsu Kosuke、Harada Akihito、Tanaka Kaori、Sato Shoko、Okada Seiji、Handa Tetsuya、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 423434-423434

    • DOI

      10.1101/2020.12.18.423434

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Live-cell imaging reveals the spatiotemporal organization of endogenous RNA polymerase II phosphorylation at a single gene2020

    • 著者名/発表者名
      Forero-Quintero Linda S.、Raymond William、Handa Tetsuya、Saxton Matthew、Morisaki Tatsuya、Kimura Hiroshi、Bertrand Edouard、Munsky Brian、Stasevich Timothy J.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 024414-024414

    • DOI

      10.1101/2020.04.03.024414

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Subnuclear gene positioning through lamina association affects copper tolerance2020

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto Yuki、Sato Mayuko、Sato Yoshikatsu、Harada Akihito、Suzuki Takamasa、Goto Chieko、Tamura Kentaro、Toyooka Kiminori、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki、Hara-Nishimura Ikuko、Takagi Shingo、Matsunaga Sachihiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 5914-5914

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19621-z

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Kinase inhibition profiles as a tool to identify kinases for specific phosphorylation sites2020

    • 著者名/発表者名
      Watson Nikolaus A.、Cartwright Tyrell N.、Lawless Conor、Camara-Donoso Marcos、Sen Onur、Sako Kosuke、Hirota Toru、Kimura Hiroshi、Higgins Jonathan M. G.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1684-1684

    • DOI

      10.1038/s41467-020-15428-0

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2020

    • 著者名/発表者名
      Higashijima Y, Matsui Y, Shimamura T, Nakaki R, Nagai N, Tsutsumi S, Abe Y, Link VM, Osaka M, Yoshida M, Watanabe R, Tanaka T, Taguchi A, Miura M, Ruan X, Li G, Inoue T, Nangaku M, Kimura H, Furukawa T, Aburatani H, Wada Y, Ruan Y, Glass CK, Kanki Y
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 39 号: 7 ページ: 1-1

    • DOI

      10.15252/embj.2019103949

    • NAID

      120006902140

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Histone modification dynamics as revealed by a multicolor immunofluorescence-based single-cell analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Takanaka Yoko、Kina Yuto、Nakamura Fumiaki、Becking Leontine E.、Nakao Yoichi、Nagase Takahiro、Nozaki Naohito、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 892299-892299

    • DOI

      10.1101/2020.01.01.892299

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] ヒストン修飾解析の最前線2020

    • 著者名/発表者名
      半田哲也、木村 宏
    • 雑誌名

      遺伝子医学

      巻: 10 ページ: 124-129

    • NAID

      40022142663

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] タンパク質1分子を翻訳過程からイメージング可能なプローブ「HA Frankenbody」2020

    • 著者名/発表者名
      趙 寧、森崎達也、小田春佳、佐藤優子、木村 宏、Stasevich Timothy J
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 38 ページ: 617-613

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際共著
  • [雑誌論文] Comprehensive epigenome characterization reveals diverse transcriptional regulation across human vascular endothelial cells2019

    • 著者名/発表者名
      Nakato R, Wada Y, Nakaki R, Nagae G, Katou Y, Tsutsumi S, Nakajima N, Fukuhara H, Iguchi A, Kohro T, Kanki Y, Saito Y, Kobayashi M, Izumi-Taguchi A, Osato N, Tatsuno K, Kamio A, Hayashi-Takanaka Y, Wada H, Ohta S, Aikawa M, Nakajima H, Nakamura M, McGee RC, Heppner KW, Kawakatsu T, Genno M, Yanase H, Kume H, et al.
    • 雑誌名

      Epigenetics & Chromatin

      巻: 12 号: 1 ページ: 77-77

    • DOI

      10.1186/s13072-019-0319-0

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A genetically encoded probe for imaging nascent and mature HA-tagged proteins in vivo2019

    • 著者名/発表者名
      Zhao Ning、Kamijo Kouta、Fox Philip D.、Oda Haruka、Morisaki Tatsuya、Sato Yuko、Kimura Hiroshi、Stasevich Timothy J.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 2947-2947

    • DOI

      10.1038/s41467-019-10846-1

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Intrabody-based FRET probe to visualize endogenous histone acetylation2019

    • 著者名/発表者名
      Chung Chan-I、Sato Yuko、Ohmuro-Matsuyama Yuki、Machida Shinichi、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ueda Hiroshi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 10188-10188

    • DOI

      10.1038/s41598-019-46573-2

    • NAID

      120006936925

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Incorporation and influence of Leishmania histone H3 in chromatin2019

    • 著者名/発表者名
      Dacher Mariko、Tachiwana Hiroaki、Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Taguchi Hiroyuki、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 47 号: 22 ページ: 11637-11648

    • DOI

      10.1093/nar/gkz1040

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The CENP-A centromere targeting domain facilitates H4K20 monomethylation in the nucleosome by structural polymorphism.2019

    • 著者名/発表者名
      Arimura Y, Tachiwana H, Takagi H, Hori T, Kimura H, Fukagawa T, Kurumizaka H
    • 雑誌名

      Nature Commun.

      巻: 10 号: 1 ページ: 576-576

    • DOI

      10.1038/s41467-019-08314-x

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書 2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Histone H3K27 acetylation precedes active transcription during zebrafish zygotic genome activation as revealed by live cell analysis.2019

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Hilbert L, Oda H, Wan Y, Heddleston JM, Chew T-L, Zaburdaev V, Keller P, Lionnet T, Vastenhouw N, and Kimura H
    • 雑誌名

      Development

      巻: 146 号: 19

    • DOI

      10.1242/dev.179127

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Structure-based design of an H2A.Z.1 mutant stabilizing a nucleosome in vitro and in vivo2019

    • 著者名/発表者名
      Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Sato Koichi、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 515 号: 4 ページ: 719-724

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2019.06.012

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Effect of mycalolides isolated from a marine sponge Mycale aff. nullarosette on actin in living cells2019

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Takanaka Yoko、Kina Yuto、Nakamura Fumiaki、Yamazaki Shota、Harata Masahiko、Soest Rob W. M. van、Kimura Hiroshi、Nakao Yoichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 7540-7540

    • DOI

      10.1038/s41598-019-44036-2

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Chromatin-bound CRM1 recruits SET-Nup214 and NPM1c onto HOX clusters causing aberrant HOX expression in leukemia cells.2019

    • 著者名/発表者名
      Oka M, Mura S, Otani M, Miyamoto Y, Nogami J, Maehara K, Harada A, Tachibana T, Yoneda Y, Ohkawa Y
    • 雑誌名

      Elife

      巻: 8

    • DOI

      10.7554/elife.46667

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cell competition corrects noisy Wnt morphogen gradients to achieve robust patterning in the zebrafish embryo2019

    • 著者名/発表者名
      Akieda Yuki、Ogamino Shohei、Furuie Hironobu、Ishitani Shizuka、Akiyoshi Ryutaro、Nogami Jumpei、Masuda Takamasa、Shimizu Nobuyuki、Ohkawa Yasuyuki、Ishitani Tohru
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 4710-4710

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12609-4

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis.2019

    • 著者名/発表者名
      †Abdalla MOA, †Yamamoto T, Maehara K, Ohkawa Y, Miura H, Hiratani I, Nakayama H, Nakao M, *Saitoh N
    • 雑誌名

      Nat Commun

      巻: 10 号: 1 ページ: 3778-3778

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11378-4

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Dmrt factors determine the positional information of cerebral cortical progenitors via differential suppression of homeobox genes.2019

    • 著者名/発表者名
      Konno D, Kishida C, Maehara K, Ohkawa Y, Kiyonari H, Okada S, Matsuzaki F
    • 雑誌名

      Development

      巻: 146 号: 15 ページ: 174243-174243

    • DOI

      10.1242/dev.174243

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Calcineurin Broadly Regulates the Initiation of Skeletal Muscle-Specific Gene Expression by Binding Target Promoters and Facilitating the Interaction of the SWI/SNF Chromatin Remodeling Enzyme.2019

    • 著者名/発表者名
      Witwicka H, Nogami J, Syed SA, Maehara K, Padilla-Benavides T, Ohkawa Y, Imbalzano AN
    • 雑誌名

      Mol Cell Biol.

      巻: 39 号: 19

    • DOI

      10.1128/mcb.00063-19

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cohesin and condensin extrude loops in a cell-cycle dependent manner2019

    • 著者名/発表者名
      Golfier Stefan、Quail Thomas、Kimura Hiroshi、Brugues Jan
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 821306-821306

    • DOI

      10.1101/821306

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-molecule imaging reveals control of parental histone recycling by free histones during DNA replication2019

    • 著者名/発表者名
      Gruszka Dominika T.、Xie Sherry、Kimura Hiroshi、Yardimci Hasan
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 789578-789578

    • DOI

      10.1101/789578

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Transcription-driven cohesin repositioning rewires chromatin loops in cellular senescence2019

    • 著者名/発表者名
      Olan Ioana、Parry Aled J.、Schoenfelder Stefan、Narita Masako、Ito Yoko、Chan Adelyne S.L.、Slater Guy St.C.、Bihary Dora、Bando Masashige、Shirahige Katsuhiko、Kimura Hiroshi、Samarajiwa Shamith A.、Fraser Peter、Narita Masashi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 823831-823831

    • DOI

      10.1101/823831

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 遺伝子発現の理解と制御のための「ヌクレオーム」研究とエピゲノム編集2019

    • 著者名/発表者名
      木村 宏、佐藤優子
    • 雑誌名

      JATAFFジャーナル

      巻: 7 ページ: 3-6

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] クロマチン挿入標識法(ChIL)による単一細胞エピゲノム解析2019

    • 著者名/発表者名
      原田 哲仁、大川 恭行
    • 雑誌名

      実験医学(増刊)

      巻: 37 ページ: 178-183

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] Signs of biological activities of 28,000-year-old mammoth nuclei in mouse oocytes visualized by live-cell imaging2019

    • 著者名/発表者名
      Kazuo Yamagata, Kouhei Nagai, Hiroshi Miyamoto, ...., Tetsuya Handa (17番目), Hiroshi Kimura, Yoshihiko Hosoi, Tasuku Mitani, Kazuya Matsumoto, Akira Iritani
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 巻 号: 1 ページ: 4050-4050

    • DOI

      10.1038/s41598-019-40546-1

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] A mosaic of old and young nucleoporins2019

    • 著者名/発表者名
      Shimi Takeshi、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      The Journal of Cell Biology

      巻: 218 号: 2 ページ: 385-386

    • DOI

      10.1083/jcb.201811170

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Heterochromatin suppresses gross chromosomal rearrangements at centromeres by repressing Tfs1/TFIIS-dependent transcription2019

    • 著者名/発表者名
      Okita Akiko K.、Zafar Faria、Su Jie、Weerasekara Dayalini、Kajitani Takuya、Takahashi Tatsuro S.、Kimura Hiroshi、Murakami Yota、Masukata Hisao、Nakagawa Takuro
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 2 号: 1 ページ: 17-17

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0251-z

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Quantitative measurements of chromatin modification dynamics during zygotic genome activation2019

    • 著者名/発表者名
      Yuko Sato, Lennart Hilbert, Haruka Oda, Yinan Wan, John M. Heddleston, Teng-Leong Chew, Vasily Zaburdaev, Philipp Keller, Timothee Lionnet, Nadine Vastenhouw, Hiroshi Kimura
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: 601393 ページ: 601393-601393

    • DOI

      10.1101/601393

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 生細胞内の1分子動態と相互作用の定量解析2019

    • 著者名/発表者名
      伊藤由馬、徳永万喜洋
    • 雑誌名

      パリティ

      巻: 36 ページ: 72-74

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Modeling latent flows on single-cell data using the Hodge decomposition2019

    • 著者名/発表者名
      Maehara Kazumitsu、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 592089-592089

    • DOI

      10.1101/592089

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] A chromatin integration labelling method enables epigenomic profiling with lower input2018

    • 著者名/発表者名
      Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Handa Tetsuya、Arimura Yasuhiro、Nogami Jumpei、Hayashi-Takanaka Yoko、Shirahige Katsuhiko、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
    • 雑誌名

      Nature Cell Biology

      巻: 21 号: 2 ページ: 287-296

    • DOI

      10.1038/s41556-018-0248-3

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Visualizing the Dynamics of Inactive X Chromosomes in Living Cells Using Antibody-Based Fluorescent Probes2018

    • 著者名/発表者名
      Sato Yuko、Stasevich Timothy J.、Kimura Hiroshi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1861 ページ: 91-102

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8766-5_8

    • ISBN
      9781493987658, 9781493987665
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 遺伝子不活性化マークを生細胞で観察できる蛍光プローブ2018

    • 著者名/発表者名
      佐藤優子、木村宏
    • 雑誌名

      化學工業

      巻: 69 ページ: 589-594

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] ヌクレオームコンソーシアム2018

    • 著者名/発表者名
      TASHIRO Satoshi、KIMURA Hiroshi
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 58 号: 4 ページ: 221-222

    • DOI

      10.2142/biophys.58.221

    • NAID

      130007420879

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] A genetically encoded probe for imaging HA-tagged protein translation, localization, and dynamics in living cells and animals2018

    • 著者名/発表者名
      Zhao Ning、Kamijo Kouta、Fox Philip、Oda Haruka、Morisaki Tatsuya、Sato Yuko、Kimura Hiroshi、Stasevich Timothy J.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 474668-474668

    • DOI

      10.1101/474668

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2018

    • 著者名/発表者名
      Higashijima Y, Matsui Y, Shimamura T, Tsutsumi S, Nakaki R, Abe Y, Link VM, Osaka M, Yoshida M, Watanabe R, Tanaka T, Taguchi A, Miura M, Inoue T, Nangaku M, Kimura H, Furukawa T, Aburatani H, Wada Y, Glass CK, Kanki Y
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 456491-456491

    • DOI

      10.1101/456491

    • NAID

      120006902140

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] CLIP-170 is essential for MTOC repositioning during T cell activation by regulating dynein localisation on the cell surface2018

    • 著者名/発表者名
      Lim Wei Ming、Ito Yuma、Sakata-Sogawa Kumiko、Tokunaga Makio
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 8 号: 1 ページ: 17747-17747

    • DOI

      10.1038/s41598-018-35593-z

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 全反射照明蛍光顕微鏡 ― 対物レンズ型2018

    • 著者名/発表者名
      徳永万喜洋、伊藤由馬
    • 雑誌名

      実験医学増刊

      巻: 36 ページ: 36-37

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [雑誌論文] 共焦点レーザー走査顕微鏡 iii. FRAP/FLIP2018

    • 著者名/発表者名
      木村 宏
    • 雑誌名

      実験医学増刊

      巻: 36 ページ: 50-51

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] クロマチン修飾と転写の生細胞ダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      木村 宏
    • 学会等名
      第4回ゲノム生物物理学セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamics of chromatin organization and transcription in early zebrafish embryos2023

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      RIKEN BDR Symposium 2023
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dynamics of histone RNA polymerase II modifications in living cells2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      EMBO Workshop “Nuclear structure and dynamics”
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dynamics of histone and RNA polymerase II modifications in living cells2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Japan-UK Regulation through Chromatin Conference 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Histone modification dynamics during transcription activation in living cells and embryos2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Gordon Research Conference “Chromatin Structure and Function: Chromatin Modifications, RNA and Metabolism”
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chromatin domain organization and dynamics in zebrafish embryos as revealed by live-cell imaging2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      EMBO Workshop “Awakening of the genome: The maternal-to-zygotic transition”
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 生細胞プローブを用いた不活性X染色体動態と転写制御の解析2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤 優子, 内野 哲志, 伊藤 由馬, 前原 一満, 大川 恭行, 徳永 万喜洋, 木村 宏
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] アセチル化H3K9特異的生細胞プローブの改良とin vitro可溶性評価法の確立2021

    • 著者名/発表者名
      岡 翔平, 佐藤 優子, 木村 宏
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 酵母ディスプレイ法による細胞内修飾特異的抗体の特異性改変2021

    • 著者名/発表者名
      小松原 新大, 木村 宏, 小田 春佳
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] PHIP/ICEN4 centromere function depends on CENP-B2021

    • 著者名/発表者名
      Marinela Perpelescu, 小布施 力史, 舛本 寛, 鐘巻 将人, 木村 宏
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ショウジョウバエ幼虫の脂肪体におけるリソソーム機能の抑制は変態に重要である2021

    • 著者名/発表者名
      村川 直柔, 中村 毅, 川口 紘平, 村山 歩駿, 木村 宏, 藤田 尚信
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ゼブラフィッシュ初期胚における核アクチンの動態と役割2021

    • 著者名/発表者名
      小田 春佳, 佐藤 優子, 藤原 侑亮, 川島 茂裕, 金井 求, 木村 宏
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 単一遺伝子イメージングを用いた転写活性と制御因子クラスタリングの時空間的な関連解明2021

    • 著者名/発表者名
      大石 裕晃, 島田 聖瑠, 内野 哲志, Li Jieru, 佐藤 優子, Alexandros Pertsinidis, 山本 卓, 木村 宏, 落合 博
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ライブセルイメージングを用いたウシ受精卵における染色体動態の可視化2021

    • 著者名/発表者名
      肖 テイ, 小田 春佳, 八尾 竜馬, 植田 朱音, 朝香 未来, 中橋 美貴子, 木村 宏, 山縣 一夫
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] ChIL法による単一細胞マルチオミクスプロファイリング2021

    • 著者名/発表者名
      原田 哲仁, 藤井 健, 前原 一満, 田中 かおり, 木村 宏, 大川 恭行
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 転写伸長型RNAポリメラーゼII可視化プローブによる生細胞内における 転写伸長部位の観察2021

    • 著者名/発表者名
      内野 哲志, 伊藤 由馬, Jessica Dai, 佐藤 優子, 半田 哲也, 大川 恭行, 徳永 万喜洋, 木村 宏
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Tracking histone and RNA polymerase II modifications in living cells using genetically encoded probes2021

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      RIKEN BDR Symposium
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Gene regulation and chromatin dynamics in living cells2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      The 79th of Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 転写活性化に伴うヒストンアセチル化とクロマチンのダイナミクス2020

    • 著者名/発表者名
      木村 宏
    • 学会等名
      第93回 日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Roles of histone acetylation and nuclear F-actin in zebrafish embryo development2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Chromosome Dynamics - An international symposium on chromatin and chromosome stability
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ゼブラフィッシュ胚性ゲノム活性化におけるヒストンアセチル化の役割と核内環境変化2019

    • 著者名/発表者名
      木村 宏
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Single-cell histone modification analysis: from live-cell imaging to epigenome profiling2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Single Cell Omics Germany Workshop "Advances in single cell epigenomics 2019"
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Tracking RNA polymerase II and histone modification dynamics during the zygotic genome activation2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chromatin modification dynamics during the activation and inactivation of transcription2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Gordon Research Conference "Genome Architecture in Cell Fate and Disease"
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] クロマチン挿入法による単一細胞エピゲノム解析2019

    • 著者名/発表者名
      大川 恭行
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第64回大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Modification-specific intracellular antibodies for monitoring histone modification in vivo2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      3rd Epigenetics and Bioengineering Conference (EpiBio 2019)
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A single-molecule localization approach to quantify the interaction between transcriptional machinery and chromatin structure2019

    • 著者名/発表者名
      Yuma Ito, Makio Tokunaga
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Chromatin integration labelling Technology for expanding multi-omics2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuyuki Ohkawa
    • 学会等名
      EMBO Symposia: Multi-Omics
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 遺伝子の発現されやすさはどのように決まるのか?~クロマチンが規定する遺伝子発現制御能力~2019

    • 著者名/発表者名
      大川 恭行
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Histone H3.3 sub-variants are required for regulating skeletal muscle differentiation2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuyuki Ohkawa
    • 学会等名
      2018 Federation of American Societies for Experimental Biology (FASEB)
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromatin Integration Labeling- an Epigenomic Profiling for Single Cell Analysis2019

    • 著者名/発表者名
      Yasuyuki Ohkawa
    • 学会等名
      Cell Symposium: Single Cells: Technology to Biology
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Chromatin modification dynamics during gene activation and inactivation in living cells2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      CSHL Meeting "Nuclear Organization & Function"
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chromatin Modification Dynamics in Living Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Gordon Research Conference "Chromatin Structure and Function"
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Sensing Histone Modification and Transcription Dynamics in Living Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      2nd Epigenetics and Bioengineering Conference
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chromatin modification dynamics during gene activation in living cells and embryos2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      Joint Annual Meeting of JSDB 51st and JSCB 70th
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] A chromatin integration labeling method enables epigenomic profiling with lower input2018

    • 著者名/発表者名
      Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yasuhiro Arimura, Jumpei Nogami, Yoko Hayashi-Takanaka, Katsuhiko Shirahige, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa and Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      3R&3C Symposium
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] クロマチン修飾ダイナミクス 生細胞イメージングとエピゲノム解析の融合に向けて2018

    • 著者名/発表者名
      木村 宏
    • 学会等名
      第91回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ヒストン修飾と転写の生細胞動態から捉えるクロマチンポテンシャル2018

    • 著者名/発表者名
      木村 宏
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Chromatin integration labeling (ChIL) technology: an immunoprecipitation-free method for low-input epigenomic profiling2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      IHEC Meeting 2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 蛍光1分子イメージングにおける動態解析法の開発と核内タンパク質挙動の定量解析2018

    • 著者名/発表者名
      伊藤由馬
    • 学会等名
      第91回大会日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 骨格筋分化・再生司るクロマチン構造制御機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      大川恭行
    • 学会等名
      日本筋学会第4回学術集会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 免疫沈降をしない1細胞エピゲノム解析技術の開発2018

    • 著者名/発表者名
      大川恭行
    • 学会等名
      第91回日本生化学会学大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 空間トランスクリプトミクスで解明する骨格筋再生2018

    • 著者名/発表者名
      大川恭行
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 骨格筋再生におけるヒストン転換2018

    • 著者名/発表者名
      大川恭行
    • 学会等名
      第7回骨格筋生物学研究会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ChILT-an Epigenomic Profiling for Single Cell Analysis2018

    • 著者名/発表者名
      Yasuyuki Ohkawa
    • 学会等名
      Gordon Research Conference"Chromatin Structure and Function"
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [図書] クロマチン解析実践プロトコール2020

    • 著者名/発表者名
      大川 恭行、宮成 悠介
    • 総ページ数
      270
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122481
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 東工大 木村研究室

    • URL

      http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 東工大 細胞制御工学研究センター

    • URL

      http://www.rcb.iir.titech.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 新学術領域「遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル」

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/potentia/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] リサーチマップ 木村宏

    • URL

      https://researchmap.jp/hiroshikimura

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] ORCID Hiroshi Kimura

    • URL

      https://orcid.org/0000-0003-0854-083X

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [備考] 遺伝子制御の基盤となる クロマチンポテンシャル

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/potentia/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学 木村研究室

    • URL

      http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学 科学技術創成研究院 細胞制御工学研究センター

    • URL

      http://www.rcb.iir.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書 2018 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学・科学技術創成研究院・細胞制御工学研究センター

    • URL

      http://www.rcb.iir.titech.ac.jp/index.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学・科学技術創成研究院・細胞制御工学研究センター・木村研究室

    • URL

      http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学リサーチディボジトリ/木村宏

    • URL

      http://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/researcherinfo.cgi?q_researcher_content_number=CTT100673940

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] 新学術領域「クロマチン潜在能」

    • URL

      http://www.nibb.ac.jp/potentia/

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2018 実績報告書
  • [備考] 東工大 木村研

    • URL

      http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 東工大 科学技術創成研究院 細胞制御工学研究センター

    • URL

      http://www.rcb.iir.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 東工大 T2R2 リサーチディポジトリ

    • URL

      http://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/researcherinfo.cgi?q_researcher_content_number=CTT100673940

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学 木村宏研究室

    • URL

      http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [備考] 東京工業大学 研究者情報

    • URL

      https://t2r2.star.titech.ac.jp/cgi-bin/researcherinfo.cgi?q_researcher_content_number=CTT100673940

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書

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公開日: 2018-07-20   更新日: 2024-01-30  

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