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細胞分化にともなうクロマチンポテンシャルの変化とその分子基盤

計画研究

研究領域遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
研究課題/領域番号 18H05530
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

眞貝 洋一  国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 主任研究員 (20211972)

研究分担者 平谷 伊智朗  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (40583753)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
112,840千円 (直接経費: 86,800千円、間接経費: 26,040千円)
2022年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円)
2021年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円)
2020年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円)
2019年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円)
2018年度: 24,440千円 (直接経費: 18,800千円、間接経費: 5,640千円)
キーワードクロマチン / エピジェネティクス / 生化学 / 3Dゲノム構造 / クロマチンリモデリング / クロマチンドメイン / 核内コンパートメント
研究成果の概要

遺伝子の発現は、ヌクレオソームレベルと細胞核レベル、そしてその中間に位置する「クロマチンドメイン」や「核内コンパートメント」と呼ばれるメガベース(Mb塩基)単位のクロマチン高次構造レベルにより多階層的に制御されている。このクロマチン高次構造は細胞分化に伴って変動し、クロマチンが潜在的にもつ転写の起こりやすさの変化と密接な関係があると考えられている。今回、生化学的アプローチと初期胚やマウス胚性幹細胞(ES 細胞)などを用いたゲノム構造の解析を通じて、細胞分化に伴って起きているMb単位レベルのクロマチン構造制御機構の一端を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本課題では、初期発生や細胞分化に伴ってクロマチン構造がダイナミックに構造変換することで遺伝子発現が調節される分子機構の一端を明らかにした。また、細胞複製のタイミングと遺伝子発現制御の関係性に関しても新たな知見を得た。本研究の成果は、生命現象のより深い理解に寄与するだけでなく、任意に特定の遺伝子の発現を調節する技術の開発にも有用な情報を提供しており、それを通して、様々な社会的unmet needsの解決に貢献することが期待される。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 2018 実績報告書
  • 研究成果

    (162件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (8件) 雑誌論文 (37件) (うち国際共著 11件、 査読あり 35件、 オープンアクセス 35件) 学会発表 (107件) (うち国際学会 12件、 招待講演 28件) 備考 (10件)

  • [国際共同研究] Radboud University Medical Center(オランダ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University of British Columbia(カナダ)

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  • [国際共同研究] University of Aberdeen(英国)

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  • [国際共同研究] University of Paris, CNRS(フランス)

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  • [国際共同研究] Radboud University(オランダ)

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      2021 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Aberdeen(英国)

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  • [国際共同研究] University Paris, CNRS(フランス)

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  • [国際共同研究] University of Aberdeen(英国)

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      2019 実績報告書
  • [雑誌論文] A specific G9a inhibitor unveils BGLT3 lncRNA as a universal mediator of chemically induced fetal globin gene expression2023

    • 著者名/発表者名
      Takase S, Hiroyama T, Shirai F, Maemoto Y, Nakata A, Arata M, Matsuoka S, Sonoda T, Niwa H, Sato S, Umehara T, Shirouzu M, Nishigaya Y, Sumiya T, Hashimoto N, Namie R, Usui M, Ohishi T, Ohba SI, Kawada M, Hayashi Y, Harada H, Yamaguchi T, Shinkai Y, Nakamura Y, Yoshida M, Ito A
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 23-23

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35404-0

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Epigenetic plasticity safeguards heterochromatin configuration in mammals2023

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Shimi Takeshi、Shimura Chikako、Ono Takao、Suzuki Takehiro、Onoue Kenta、Okayama Satoko、Miura Hisashi、Hiratani Ichiro、Ikeda Kazuho、Okada Yasushi、Dohmae Naoshi、Yonemura Shigenobu、Inoue Azusa、Kimura Hiroshi、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: - 号: 12 ページ: 6190-6207

    • DOI

      10.1093/nar/gkad387

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] METTL18-mediated histidine methylation of RPL3 modulates translation elongation for proteostasis maintenance2022

    • 著者名/発表者名
      Matsuura-Suzuki Eriko、Shimazu Tadahiro、Takahashi Mari、Kotoshiba Kaoru、Suzuki Takehiro、Kashiwagi Kazuhiro、Sohtome Yoshihiro、Akakabe Mai、Sodeoka Mikiko、Dohmae Naoshi、Ito Takuhiro、Shinkai Yoichi、Iwasaki Shintaro
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11 ページ: 1-33

    • DOI

      10.7554/elife.72780

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Large-Scale Chromatin Rearrangements in Cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi Kosuke、Chen Xiaoying、Oji Asami、Hiratani Ichiro、Defossez Pierre-Antoine
    • 雑誌名

      Cancers

      巻: 14 号: 10 ページ: 2384-2384

    • DOI

      10.3390/cancers14102384

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      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Cell cycle dynamics and developmental dynamics of the 3D genome: toward linking the two timescales2022

    • 著者名/発表者名
      Miura Hisashi、Hiratani Ichiro
    • 雑誌名

      Current Opinion in Genetics & Development

      巻: 73 ページ: 101898-101898

    • DOI

      10.1016/j.gde.2021.101898

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      2022 実績報告書 2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 不活性X染色体の三次元構造と遺伝子発現制御2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗、プーンパーム・ラウィン
    • 雑誌名

      医学のあゆみ『X染色体不活性化と疾患-新たな展開』

      巻: 283 ページ: 23486-23491

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      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Mammalian HEMK1 methylates glutamine residue of the GGQ motif of mitochondrial release factors2022

    • 著者名/発表者名
      Fang Qi、Kimura Yusuke、Shimazu Tadahiro、Suzuki Takehiro、Yamada Ayumi、Dohmae Naoshi、Iwasaki Shintaro、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 4104-4104

    • DOI

      10.1038/s41598-022-08061-y

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Potential role of KRAB-ZFP binding and transcriptional states on DNA methylation of retroelements in human male germ cells2022

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Makino Yoshinori、Kaneko Satoru、Shimura Chikako、Okada Yuki、Ichiyanagi Kenji、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 11

    • DOI

      10.7554/elife.76822

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Highly rigid H3.1/H3.2-H3K9me3 domains set a barrier for cell fate reprogramming in trophoblast stem cells2022

    • 著者名/発表者名
      Hada M, Miura H, Tanigawa A, Matoba S, Inoue K, Ogonuki N, Hirose M, Watanabe N, Nakato R, Fujiki K, Hasegawa A, Sakashita A, Okae H, Miura K, Shikata D, Arima T, Shirahige K, Hiratani I, Ogura A.
    • 雑誌名

      Genes Dev

      巻: 36 号: 1-2 ページ: 84-102

    • DOI

      10.1101/gad.348782.121

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] SAF-A promotes origin licensing and replication fork progression to ensure robust DNA replication2022

    • 著者名/発表者名
      Connolly Caitlin、Takahashi Saori、Miura Hisashi、Hiratani Ichiro、Gilbert Nick、Donaldson Anne D.、Hiraga Shin-Ichiro
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 135 号: 2

    • DOI

      10.1242/jcs.258991

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Regulation of mammalian 3D genome organization and histone H3K9 dimethylation by H3K9 methyltransferases2021

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Shimura Chikako、Miura Hisashi、Tanigawa Akie、Suzuki Takehiro、Dohmae Naoshi、Hiratani Ichiro、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1 ページ: 571-571

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02089-y

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A cost efficient protocol to introduce epitope tags by CRISPR-Cas9 mediated gene knock-in with asymmetric semi-double stranded template2021

    • 著者名/発表者名
      Fang Qi、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      MethodsX

      巻: 8 ページ: 101365-101365

    • DOI

      10.1016/j.mex.2021.101365

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Derepression of inflammation-related genes link to microglia activation and neural maturation defect in a mouse model of Kleefstra syndrome2021

    • 著者名/発表者名
      Yamada Ayumi、Hirasawa Takae、Nishimura Kayako、Shimura Chikako、Kogo Naomi、Fukuda Kei、Kato Madoka、Yokomori Masaki、Hayashi Tetsutaro、Umeda Mana、Yoshimura Mika、Iwakura Yoichiro、Nikaido Itoshi、Itohara Shigeyoshi、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 7 ページ: 102741-102741

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102741

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DMRT1-mediated reprogramming drives development of cancer resembling human germ cell tumors with features of totipotency2021

    • 著者名/発表者名
      Taguchi Jumpei、Shibata Hirofumi、Kabata Mio、Kato Masaki、Fukuda Kei、Tanaka Akito、Ohta Sho、Ukai Tomoyo、Mitsunaga Kanae、Yamada Yosuke、Nagaoka So I、Yamazawa Sho、Ohnishi Kotaro、Woltjen Knut、Ushiku Tetsuo、Ozawa Manabu、Saitou Mitinori、Shinkai Yoichi、Yamamoto Takuya、Yamada Yasuhiro
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 5041-5041

    • DOI

      10.1038/s41467-021-25249-4

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A loss-of-function variant in SUV39H2 identified in autism-spectrum disorder causes altered H3K9 trimethylation and dysregulation of protocadherin β-cluster genes in the developing brain2021

    • 著者名/発表者名
      Balan Shabeesh、-25名-, Shinkai Yoichi、Yoshikawa Takeo
    • 雑誌名

      Molecular Psychiatry

      巻: 26 号: 12 ページ: 7550-7559

    • DOI

      10.1038/s41380-021-01199-7

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Propargylic Se-adenosyl-l-selenomethionine: A Chemical Tool for Methylome Analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Sohtome Yoshihiro、Shimazu Tadahiro、Shinkai Yoichi、Sodeoka Mikiko
    • 雑誌名

      Accounts of Chemical Research

      巻: 54 号: 20 ページ: 3818-3827

    • DOI

      10.1021/acs.accounts.1c00395

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      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Dynamics of transcription-mediated conversion from euchromatin to facultative heterochromatin at the Xist promoter by Tsix2021

    • 著者名/発表者名
      Ohhata Tatsuya、Yamazawa Kazuki、Miura-Kamio Asuka、Takahashi Saori、Sakai Satoshi、Tamura Yuka、Uchida Chiharu、Kitagawa Kyoko、Niida Hiroyuki、Hiratani Ichiro、Kobayashi Hisato、Kimura Hiroshi、Wutz Anton、Kitagawa Masatoshi
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 34 号: 13 ページ: 108912-108912

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.108912

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      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] The Temporal Order of DNA Replication Shaped by Mammalian DNA Methyltransferases2021

    • 著者名/発表者名
      Takebayashi Shin-ichiro、Ryba Tyrone、Wimbish Kelsey、Hayakawa Takuya、Sakaue Morito、Kuriya Kenji、Takahashi Saori、Ogata Shin、Hiratani Ichiro、Okumura Katsuzumi、Okano Masaki、Ogata Masato
    • 雑誌名

      Cells

      巻: 10 号: 2 ページ: 266-266

    • DOI

      10.3390/cells10020266

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      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Formation of a multi‐layered 3‐dimensional structure of the heterochromatin compartment during early mammalian development2021

    • 著者名/発表者名
      Poonperm Rawin、Hiratani Ichiro
    • 雑誌名

      Development, Growth & Differentiation

      巻: 63 号: 1 ページ: 5-17

    • DOI

      10.1111/dgd.12709

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      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SETDB1-Mediated Silencing of Retroelements2020

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Viruses

      巻: 12 号: 6 ページ: 596-596

    • DOI

      10.3390/v12060596

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The fibronectin type-III (FNIII) domain of ATF7IP contributes to efficient transcriptional silencing mediated by the SETDB1 complex2020

    • 著者名/発表者名
      Tsusaka Takeshi、Fukuda Kei、Shimura Chikako、Kato Masaki、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Epigenetics & Chromatin

      巻: 13 号: 1 ページ: 52-52

    • DOI

      10.1186/s13072-020-00374-4

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Mapping replication timing domains genome wide in single mammalian cells with single-cell DNA replication sequencing2020

    • 著者名/発表者名
      Miura Hisashi、Takahashi Saori、Shibata Takahiro、Nagao Koji、Obuse Chikashi、Okumura Katsuzumi、Ogata Masato、Hiratani Ichiro、Takebayashi Shin-ichiro
    • 雑誌名

      Nature Protocols

      巻: 15 号: 12 ページ: 4058-4100

    • DOI

      10.1038/s41596-020-0378-5

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Microrheology for Hi-C Data Reveals the Spectrum of the Dynamic 3D Genome Organization2020

    • 著者名/発表者名
      Soya Shinkai, Takeshi Sugawara, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Shuichi Onami
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 118 号: 9 ページ: 2220-2228

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2020.02.020

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Multifaceted Hi-C benchmarking: what makes a difference in chromosome-scale genome scaffolding?2020

    • 著者名/発表者名
      Kadota M, Nishimura O, Miura H, Tanaka K, Hiratani I, *Kuraku S.
    • 雑誌名

      Gigascience

      巻: 9 号: 1

    • DOI

      10.1093/gigascience/giz158

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] ATF7IP regulates SETDB1 nuclear localization and increases its ubiquitination2019

    • 著者名/発表者名
      Tsusaka T. Shimura C. *Shinkai Y.
    • 雑誌名

      EMBO reports

      巻: 20 号: 12

    • DOI

      10.15252/embr.201948297

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis.2019

    • 著者名/発表者名
      †Abdalla MOA, †Yamamoto T, Maehara K, Ohkawa Y, Miura H, Hiratani I, Nakayama H, Nakao M, *Saitoh N
    • 雑誌名

      Nat Commun

      巻: 10 号: 1 ページ: 3778-3778

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11378-4

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Single-cell DNA Replication Profiling Identifies Spatiotemporal Developmental Dynamics of Chromosome Organization.2019

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Takahashi S, Poonperm R, Tanigawa A, Takebayashi S I, and Hiratani I.
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 51 号: 9 ページ: 1356-1368

    • DOI

      10.1038/s41588-019-0474-z

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Structure of the UHRF1 Tandem Tudor Domain Bound to a Methylated Non-histone Protein, LIG1, Reveals Rules for Binding and Regulation2019

    • 著者名/発表者名
      Kori, S. Ferry, L. Matano, S. Jimenji, T. Kodera, N. Tsusaka, T. Matsumura, R. Oda, T. Sato, M. Dohmae, N. Ando, T. Shinkai, Y. Defossez, P. A. Arita, K.
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 27 号: 3 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1016/j.str.2018.11.012

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Histone H3K9 Methyltransferase G9a in Oocytes Is Essential for Preimplantation Development but Dispensable for CG Methylation Protection.2019

    • 著者名/発表者名
      Yeung WKA, Brind’Amour J, Hatano Y, Yamagata K, Feil R, Matthew C. Lorincz MC, Tachibana M, Shinkai Y, Sasaki H*.
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 27 号: 1 ページ: 282-293

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.03.002

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Genome-wide stability of the DNA replication program in single mammalian cells2019

    • 著者名/発表者名
      Saori Takahashi, Hisashi Miura, Takahiro Shibata, Koji Nagao, Katsuzumi Okumura, Masato Ogata, Chikashi Obuse, Shin-ichiro Takebayashi and Ichiro Hiratani
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 51 号: 3 ページ: 529-540

    • DOI

      10.1038/s41588-019-0347-5

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNA replication timing enters the single-cell era2019

    • 著者名/発表者名
      Ichiro Hiratani and Saori Takahashi
    • 雑誌名

      Genes

      巻: 10 号: 3 ページ: 221-221

    • DOI

      10.3390/genes10030221

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] A CRISPR knockout screen Identifies SETDB1-target retroelement silencing factors in embryonic stem cells2018

    • 著者名/発表者名
      Fukuda Kei、Okuda Akihiko、Yusa Kosuke、Shinkai Yoichi
    • 雑誌名

      Genome Research

      巻: 28 号: 6 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1101/gr.227280.117

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Tri-methylation of ATF7IP by G9a/GLP recruits the chromodomain protein MPP8.2018

    • 著者名/発表者名
      Tsusaka T, Kikuchi M, Shimazu T, Suzuki T, Sohtome Y, Akakabe M, Sodeoka M, Dohmae N, Takashi Umehara T, Shinkai Y*.
    • 雑誌名

      Epigenetics and chromatin.

      巻: 11 号: 1 ページ: 56-56

    • DOI

      10.1186/s13072-018-0231-z

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] G9a-dependent histone methylation can be induced in G1 phase of cell cycle.2018

    • 著者名/発表者名
      Fukuda M, Sakaue-Sawano A, Shimura C, Tachibana M, Miyawaki A, Shinkai Y.
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 9 号: 1 ページ: 956-956

    • DOI

      10.1038/s41598-018-37507-5

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Practical Analysis of Hi-C Data: Generating A/B Compartment Profiles2018

    • 著者名/発表者名
      Hisashi Miura, Rawin Poonperm, Saori Takahashi and Ichiro Hiratani
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1861 ページ: 221-245

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8766-5_16

    • ISBN
      9781493987658, 9781493987665
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Srf destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs2018

    • 著者名/発表者名
      Ikeda T, Hikichi T, Miura H, Shibata H, Mitsunaga K, Yamada Y, Woltjen K, Miyamoto K, Watanabe A, Hiratani I, Yamada Y, Yamamoto T, Hotta A, Okita K, Masui S
    • 雑誌名

      Nat Commun.

      巻: 9 号: 1 ページ: 1387-1387

    • DOI

      10.1038/s41467-018-03748-1

    • NAID

      120006517799

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Epigenetic differences between naive and primed pluripotent stem cells2018

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Saori、Kobayashi Shin、Hiratani Ichiro
    • 雑誌名

      Cellular and Molecular Life Sciences

      巻: 75 号: 7 ページ: 1191-1203

    • DOI

      10.1007/s00018-017-2703-x

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Somatic DNA replication timing program emerges with a unique transitional S-phase during early mouse embryogenesis2023

    • 著者名/発表者名
      Hiratani I
    • 学会等名
      RIKEN BDR Symposium 2023 “Transitions in Biological Systems”
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] The embryonic-to-somatic DNA replication program switch is accompanied by the emergence of a fragile S-phase2023

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第3回有性生殖研究会「生殖の多様性」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理2023

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      JST CREST・さきがけ「ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出」研究領域 Zoomオンラインセミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Unraveling the dynamic 3D genome architecture through single-cell DNA replication profiling2022

    • 著者名/発表者名
      Hiratani I
    • 学会等名
      The 14th International Congress of Cell Biology & 9th Asian Pacific Organization for Cell Biology (2022 ICCB & APOCB)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Replication dynamics identifies the folding principles of the inactive X chromosome2022

    • 著者名/発表者名
      Hiratani I
    • 学会等名
      Japan-UK Regulation through Chromatin Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析からゲノム三次元構造動態を探る2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      染色体学会 第73回年会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 哺乳類でのヘテロクロマチンのエピジェネティック可塑性2022

    • 著者名/発表者名
      眞貝洋一
    • 学会等名
      日本遺伝学会第94回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エピゲノム可塑性によるヘテロクロマチン維持機構2022

    • 著者名/発表者名
      福田渓、井上梓、志村知古、眞貝洋一
    • 学会等名
      第40 回染色体ワークショップ/第21 回核ダイナミクス研究会合同集会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] クリーフストラ症候群モデルマウス脳内における炎症状態の解析2022

    • 著者名/発表者名
      山田亜夕美、西村佳也子、眞貝洋一
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] モデルマウスを用いたクリーフストラ症候群症状改善方法の探究2022

    • 著者名/発表者名
      山田亜夕美、西村佳也子、眞貝洋一
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒト生殖細胞形成過程におけるトランスポゾンの制御と個体差2022

    • 著者名/発表者名
      福田渓、眞貝洋一
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] リボソームタンパク質に起きるヒスチジンメチル化修飾の機能-コドンの読み取り速度を調節し、高品質タンパク質を合成する-2022

    • 著者名/発表者名
      松浦絵里子、島津忠広、髙橋真梨、事柴芳、鈴木健裕、柏木一宏、五月女宜裕、赤壁麻依、袖岡幹子、堂前直、伊藤拓宏、眞貝洋一、岩崎信太郎
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヘテロクロマチンの核内空間制御におけるクロマチン修飾の役割2022

    • 著者名/発表者名
      福田渓、志村知古、志見剛、木村宏、眞貝 洋一
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 反復配列に引き起こされる哺乳類異所的高次クロマチン形成系の構築と解析2022

    • 著者名/発表者名
      白井温子
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      JST CREST・さきがけ「ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出」研究領域 第5回領域会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Unraveling the dynamic 3D genome architecture through single-cell DNA replication profiling(1細胞全ゲノムDNA複製解析からゲノム三次元構造動態を探る)2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会シンポジウム「先端技術と理論で迫るクロマチン機能の理解(Chromatin function as revealed by cutting-edge technique and theory)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析から探るゲノム三次元構造の発生制御2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第3回ゲノム生物物理学セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製動態から見えた不活性X染色体三次元構造の構築原理2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第5回JSTさきがけ「エピジェネティクスの制御と生命機能」終了領域研究会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析から探るゲノム三次元構造の発生制御2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所研究会「染色体安定維持研究会」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide screening of A/B compartment regulators using a DNA replication reporter system2022

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      新学術領域研究「遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル」第5回領域会議
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] A genome-wide CRISPR screening reveals a role for an essential DNA replication factor in nuclear compartment segregation2022

    • 著者名/発表者名
      Oji A, Yusa K, Hiratani I
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノムCRISPRスクリーニングで明らかになったDNA複製因子の核内構造制御における役割2022

    • 著者名/発表者名
      大字亜沙美
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所研究会「染色体安定維持研究会」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノムCRISPRスクリーニングで明らかになったDNA複製因子の核内コンパートメント制御における役割2022

    • 著者名/発表者名
      大字亜沙美
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Replication dynamics identifies the folding principles of the inactive X chromosome2022

    • 著者名/発表者名
      Poonperm R, Ichihara S, Miura H, Tanigawa A, Nagao K, Obuse C, Sado T, Hiratani I
    • 学会等名
      The 45th Annual Meeting of MBSJ
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Cell-cycle dynamics of A/B compartment organization in mammalian cells2022

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Tanigawa A, Oji A, Choubani L, Poonperm R, Hiratani I
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] ヒスチジンメチル化修飾の分子標的に関する生化学的解析2022

    • 著者名/発表者名
      渡邊優衣、島津忠広、眞貝 洋一
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母を用いたH3K9メチル化酵素/HP1発現による遺伝子発現への影響解析2022

    • 著者名/発表者名
      清水泰希、沖昌也、眞貝洋一
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Mitochondrial respiratory complex I failure and cellular CoQ10 deficiency in PYURF KO HeLa cells2022

    • 著者名/発表者名
      ファンチー、島津忠広、眞貝洋一
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質ヒスチジンπ型メチル化酵素欠損マウスは胎生致死になる2022

    • 著者名/発表者名
      島津忠広、芳本玲、事柴芳、鈴木建裕、赤壁麻衣、五月女宣裕、袖岡幹子、堂前直、眞貝洋一
    • 学会等名
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] GINS4, an essential factor for DNA replication, is involved in regulating the 3D genome architecture during G1 phase2022

    • 著者名/発表者名
      Oji A, Yusa K, Hiratani I
    • 学会等名
      NIG International Symposium 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Replication dynamics identifies the folding principles of the inactive X chromosome2022

    • 著者名/発表者名
      Poonperm R, Ichihara S, Miura H, Tanigawa A, Nagao K, Obuse C, Sado T, Hiratani I
    • 学会等名
      NIG international symposium 2022
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Replication dynamics identifies the folding principles of the inactive X chromosome2022

    • 著者名/発表者名
      Poonperm R, Ichihara S, Miura H, Tanigawa A, Nagao K, Obuse C, Sado T, Hiratani I
    • 学会等名
      新学術領域・学術変革領域A合同「若手の会 2022」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Integrated data science approach for understanding the 3D genome organization2022

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Hiratani I
    • 学会等名
      NIG International Symposium 2022, Chromosome Replication in the New Era; Old and New Questions in Life Science
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 哺乳類3Dゲノム構築原理の理解に向けた統合データサイエンス2022

    • 著者名/発表者名
      三浦尚、平谷伊智朗
    • 学会等名
      2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] H3K9 and H3K27 methylation pathways exclusively and coordinately regulate heterochromatin organization2022

    • 著者名/発表者名
      Shinkai Yoichi
    • 学会等名
      The 30th Hot Spring Harbor International Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Coordinate regulation of heterochromatin organization by H3K9 and H3K27 methylation pathways2022

    • 著者名/発表者名
      Shinkai Yoichi
    • 学会等名
      2022 International Symposium of the Epigenome Dynamics Control Research Center
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Establishment of the late-replicating inactive X chromosome during differentiation2022

    • 著者名/発表者名
      Poonperm Rawin
    • 学会等名
      The 30th Hot Spring Harbor International Symposium
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Discovery of novel protein histidine pi-methyltransferase2021

    • 著者名/発表者名
      Shinkai Yoichi
    • 学会等名
      Pacifichem 2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Establishment of the late-replicating inactive X chromosome during differentiation2021

    • 著者名/発表者名
      Hiratani Ichiro
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on DNA Replication & Genome Maintenance
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 反復配列に引き起こされる哺乳類異所的 高次クロマチン形成系の構築と解析2021

    • 著者名/発表者名
      白井温子、眞貝洋一
    • 学会等名
      トランスポゾン研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Reversibility of neurological phenotypes in Kleefstra syndrome model mouse by post-natal GLP supply2021

    • 著者名/発表者名
      6.Yamada A. Hirasawa T. Nishimura K. Shimura C. Kogo N. Fukuda K. Kato M. Yokomori M. Hayashi T. Umeda M. Yoshimura M. Iwakura Y. Nikaido I. Itohara S. Shinkai Y.
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第66回大会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゲノム三次元構造とその発生動態の理解2021

    • 著者名/発表者名
      三浦尚
    • 学会等名
      神戸大学大学院医学研究科シグナル伝達医学研究展開センター(CSMI)ワークショプEmergence Conference
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析法scRepli-seqを用いたマウス胚発生初期の染色体三次元構造の予測2021

    • 著者名/発表者名
      高橋沙央里
    • 学会等名
      第6回兵庫県立こども病院&理化学研究所BDRサテライトセミナー
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA複製タイミング制御因子の全ゲノムスクリーニングからゲノム三次元構造制御を理解する2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所研究会「染色体安定維持研究会」
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploring the developmental regulation of 3D genome organization through single-cell DNA replication profiling2021

    • 著者名/発表者名
      Hiratani Ichiro
    • 学会等名
      第18回幹細胞シンポジウム
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] METTL18-mediated histidine methylation on ribosome protein modulates tyrosine translation for proteostasis maintenance2021

    • 著者名/発表者名
      12.Matsuura-Suzuki E. Shimazu T. Takahashi M. Dohmae N. Ito T. Shinkai Y. Iwasaki S.
    • 学会等名
      第22回日本RNA学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 抑制性クロマチン修飾による核内高次クロマチン構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      福田渓、志見剛、志村知古、木村宏、眞貝洋一
    • 学会等名
      第39回 染色体ワークショップ・第19回 核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製タイミング可視化システムを利用したゲノム三次元構造制御因子の網羅的同定と機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      大字亜沙美、遊佐宏介、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      JST CREST・さきがけ「ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出」研究領域 Zoomオンラインミーティング
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      JST CREST・さきがけ「ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出」研究領域 第4回領域会議
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Establishment of the late-replicating inactive X chromosome during differentiation2021

    • 著者名/発表者名
      Poonperm R, Tanigawa A, Ichihara S, Sado T, Hiratani I.
    • 学会等名
      第26回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] マウスの体細胞型DNA複製タイミングプログラムは4細胞期に確立する2021

    • 著者名/発表者名
      高橋沙央里、京極博久、三浦尚、柴田隆豊、林哲太郎、芳村美佳、長尾恒治、小布施力史、二階堂愛、竹林慎一郎、北島智也、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第26回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] DNA複製タイミング可視化レポーターシステムを利用したゲノム三次元構造制御因子の網羅的同定2021

    • 著者名/発表者名
      大字亜沙美、遊佐宏介、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第26回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Unraveling the dynamic 3D genome architecture through single-cell DNA replication profiling2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      新学術領域研究「遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル」Chromatin Potential Pitch Seminar
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] METTL18-mediated histidine methylation on ribosome protein modulates tyrosine translation for proteostasis maintenance.2021

    • 著者名/発表者名
      Matsuura-Suzuki E. Shimazu T. Takahashi M. Dohmae N. Ito T. Shinkai Y. Iwasaki S.
    • 学会等名
      RNA2021
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 自発運動によるクリーフストラ症候群脳神経症状の改善効果2021

    • 著者名/発表者名
      山田亜夕美、西村佳也子、眞貝洋一
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] マウス細胞における異所的へテロクロマチン形成系の構築2021

    • 著者名/発表者名
      宮野可菜, 白井温子, 眞貝洋一, 大関淳一郎, 舛本寛, 中山学, 阿部訓也, 鈴木伸之介
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Establishment of the late-replicating inactive X chromosome during differentiation2021

    • 著者名/発表者名
      Poonperm R, Tanigawa A, Miura H, Ichihara S, Sado T, Hiratani I
    • 学会等名
      第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Integrative data analysis approach to understand the developmental dynamics of the chromosome organization and DNA replication timing2021

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Takahashi S, Poonperm R, Tanigawa A, Shibata T, Takebayashi SI, Hiratani I
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on DNA Replication & Genome Maintenance
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell genome-wide DNA replication profiling of early embryonic development in mice2021

    • 著者名/発表者名
      Takahashi S, Miura H, Shibata T, Kyogoku H, Hayashi T, Yoshimura M, Nagao K, Obuse C, Nikaido I, Kitajima TS, Takebayashi SI, Hiratani I
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on DNA Replication & Genome Maintenance
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 反復配列に引き起こされる哺乳類異所的高次クロマチン形成系の構築と解析2021

    • 著者名/発表者名
      白井温子、大関淳一、舛本寛、中山学、眞貝洋一
    • 学会等名
      第38回染色体WS・第19回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Between H3K9 and DNA methylations-the crosstalk in two main gene silencing pathways2021

    • 著者名/発表者名
      Fang Qi
    • 学会等名
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] H3K9メチル化を介した遺伝子発現抑制機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      清水泰希、沖昌也、眞貝洋一
    • 学会等名
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 反復配列に引き起こされる哺乳類異所的高次クロマチン形成系の構築と解析2021

    • 著者名/発表者名
      白井温子、大関淳一、舛本寛、中山学、眞貝洋一
    • 学会等名
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Compartment-dependent regulation of heterochromatin formation in mouse embryonic stem cells2021

    • 著者名/発表者名
      福田渓、三浦尚、谷川明恵、平谷伊智朗、眞貝洋一
    • 学会等名
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] クロマチンリモデリング酵素HELLSとCDCA7タンパク質との機能的相互作用2021

    • 著者名/発表者名
      新海暁男
    • 学会等名
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析から探るゲノム三次元構造の発生制御(Exploring the developmental regulation of 3D genome organization through single-cell DNA replication profiling)2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第14回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 4Dヌクレオーム研究の現状-ヌクレオーム研究のスクリーニング計画の紹介から分野の将来展望まで-2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      大塚製薬株式会社・社内講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploring the developmental regulation of 3D genome organization through single-cell DNA replication profiling.2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      The 15th Asia Epigenomics Meeting Online (Singapore)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Unraveling the genome organization through DNA replication studies.2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      The 3rd Kobe-RIKEN BDR Joint Symposium - Development and Disease
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 1細胞からの全ゲノムDNA複製解析を可能にするscRepli-seqの紹介2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      東京医科歯科大学・トランスオミクス講習会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 潜在的不安定性から読み解くゲノム設計原理2021

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      JST CREST・さきがけ「ゲノムスケールのDNA設計・合成による細胞制御技術の創出」研究領域 第3回 合同キックオフ及び領域会議
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Dissecting the 3D genome architecture dynamics through single-cell DNA replication profiling.2020

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析法scRepli-seqを用いたゲノム三次元構造の発生制御の解析(Unraveling the dynamic 3D genome architecture through single-cell DNA replication profiling)2020

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第65回大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] DNA複製レポーターシステムを用いたA/Bコンパートメント制御因子のゲノムワイドスクリーニング(Genome-wide screening of A/B compartment regulators using a DNA replication reporter system)2020

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      新学術領域研究「遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル」第3回領域会議
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] エピゲノムによる転写抑制機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      眞貝洋一
    • 学会等名
      第37回染色体ワークショップ・第18回核ダイナミクス研究会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] ゲノム三次元構造の発生制御とその分子基盤2019

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所研究会「染色体安定維持研究会」
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] エピゲノム操作による生命機能への介入の可能性2019

    • 著者名/発表者名
      眞貝洋一
    • 学会等名
      第112回日本繁殖生物学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unraveling the dynamic 3D genome architecture through single-cell DNA replication profiling2019

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      日本遺伝学会大91回年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unraveling the dynamic 3D genome architecture through single-cell DNA replication profiling2019

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      シングルセルゲノミクス研究会2019
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] METTL9はタンパク質のヒスチジン残基をπ-メチル化する酵素である2019

    • 著者名/発表者名
      島津忠弘、鈴木健裕、赤壁麻衣、五月女宜裕、 袖岡幹子、堂前直、 眞貝 洋一
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製解析法を用いたゲノム三次元構造の発生制御の解析2019

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Development of a DNA replication reporter system for genome-wide screening of A/B compartment regulators.2019

    • 著者名/発表者名
      大字亜沙美、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication profiling reveals the principles of 3D genome organization dynamics at the megabase scale2019

    • 著者名/発表者名
      Hiratani I, Miura H, Takahashi S, Shibata T, Poonperm R, Tanigawa A, Nagao K, Obuse C, Takebayashi SI
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Genome Architecture in Cell Fate and Disease “The Eukaryotic Genome in 4 Dimensions: Integrative Approaches to Bridging Genotype and Phenotype.
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 1細胞全ゲノムDNA複製タイミング解析手法とマウス初期胚解析への応用に向けて2019

    • 著者名/発表者名
      高橋沙央里、三浦尚、柴田隆豊、長尾恒治、小布施力史、竹林慎一郎、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第19回蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication sequencing and its application to studies of early mouse embryonic development.2019

    • 著者名/発表者名
      高橋沙央里、三浦尚、柴田隆豊、長尾恒治、小布施力史、竹林慎一郎、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Kleefstra症候群モデルマウスを用いた神経症状発症機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      山田亜夕美、西村佳也子、志村知古、平澤孝枝、眞貝洋一
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Toward biochemical study of the regulation of the de novo DNA methylation.2019

    • 著者名/発表者名
      新海暁男、眞貝洋一
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] モデルマウスを用いたKleefstra症候群の神経症状発症機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      山田亜夕美、西村佳也子、志村知古、平澤孝枝、眞貝洋一
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] 反復配列に引き起こされる哺乳類異所的高次クロマチン形成2019

    • 著者名/発表者名
      白井温子、大関淳一郎、舛本寛、中山学、眞貝洋一
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Uncovering the molecular basis of glutamine methylation of mitochondrial translation release factors2019

    • 著者名/発表者名
      Fang Q, Shinkai Y
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication profiling reveals spatiotemporal developmental dynamics of chromosome organization2019

    • 著者名/発表者名
      Hiratani I, Miura H, Takahashi S, Shibata T, Poonperm R, Tanigawa A, Nagao K, Obuse C, Takebayashi SI
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Meeting on Eukaryotic DNA Replication & Genome Maintenance
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication profiling identifies spatiotemporal dynamics of chromosome organization2019

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Takahashi S, Poonperm R, Tanigawa A, Takebayashi SI, Hiratani I
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Genome Architecture in Cell Fate and Disease “The Eukaryotic Genome in 4 Dimensions: Integrative Approaches to Bridging Genotype and Phenotype.”
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication profiling reveals the principles of 3D genome organization dynamics at the megabase scale2019

    • 著者名/発表者名
      Hiratani I, Miura H, Takahashi S, Shibata T, Poonperm R, Tanigawa A, Nagao K, Obuse C, Takebayashi SI
    • 学会等名
      Gordon Research Conference on Genome Architecture in Cell Fate and Disease “The Eukaryotic Genome in 4 Dimensions: Integrative Approaches to Bridging Genotype and Phenotype.”
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication sequencing and its application to studies of early mouse embryonic development2019

    • 著者名/発表者名
      高橋沙央里、三浦尚、柴田隆豊、長尾恒治、小布施力史、竹林慎一郎、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Smchd1 is required for maintaining late replication of the inactive X chromosome2019

    • 著者名/発表者名
      Rawin Poonperm、三浦尚、佐渡敬、平谷伊智朗
    • 学会等名
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [学会発表] Setdb1-Atf7ip 複合体による転写抑制機構2019

    • 著者名/発表者名
      眞貝洋一
    • 学会等名
      研究会「染色体研究の最前線2019」
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] H3K9メチル化酵素によるレトロウイルス転写抑制の分子機構2018

    • 著者名/発表者名
      眞貝洋一
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] エピゲノムの確立・維持と可変・可塑性のダイナミクス2018

    • 著者名/発表者名
      眞貝洋一
    • 学会等名
      日本生化学会北陸支部第36回大会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 内在性レトロウイルスの活性化機構と自然免疫反応2018

    • 著者名/発表者名
      竹本 経緯子、加藤 雅紀、眞貝 洋一
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Kleefstra症候群の後天的エピゲノム改変による治療可能性の探求と発症機構の解明2018

    • 著者名/発表者名
      山田亜夕美、西村佳也子、志村知古、平澤孝枝、眞貝洋一
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] G9aは細胞周期のどのタイミングでヒストンH3K9をメチル化できるのか?2018

    • 著者名/発表者名
      福田 幹子、阪上-沢野 朝子、宮脇 敦史、志村 知古、立花 誠、眞貝 洋一
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Kleefstra症候群モデルマウスの自閉症様表現型は後天的エピゲノム改変により回復できるか-そのタイミングと効果-2018

    • 著者名/発表者名
      横森 将輝、加藤 まどか、山田 亜夕美、西村 佳也子、眞貝 洋一、平澤 孝枝
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell DNA replication timing profiling and 3D genome organization dynamics during development.2018

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Takahashi S, Shibata T, Nagao K, Obuse C, Takebayashi S-i, Hiratani I.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on Nuclear Organization & Function.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Single-cell DNA replication timing profiling and 3D genome organization dynamics during development.2018

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Takahashi S, Shibata T, Poonperm R, Nagao K, Obuse C, Takebayashi S-i, Hiratani I.
    • 学会等名
      EMBO Symposia 2018: Principles of Chromosome Structure and Function.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Single-cell DNA replication timing profiling and 3D genome organization dynamics during development.2018

    • 著者名/発表者名
      Miura H, Takahashi S, Shibata T, Poonperm R, Nagao K, Obuse C, Takebayashi S-i, Hiratani I.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on Epigenetics & Chromatin.
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 1細胞ゲノムワイドDNA複製解析から見えるゲノム高次構造の発生制御2018

    • 著者名/発表者名
      平谷伊智朗
    • 学会等名
      第91回日本生化学会大会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] 精子のエピゲノムは人それぞれ-生殖細胞におけるレトロエレメントの不完全制御-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2022/20220413_2/index.html

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実績報告書
  • [備考] エピゲノム異常に起因する脳機能不全の治療の可能性-クリーフストラ症候群の治療法開発に前進-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2021/20210706_2/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] ヒストンメチル化による自閉症の新しいメカニズムを発見-自閉スペクトラム症の治療薬開発に役立つ可能性-

    • URL

      https://www.riken.jp/press/2021/20210715_2/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] A genetic brain disease reversed after birth

    • URL

      https://www.riken.jp/en/news_pubs/research_news/pr/2021/20210706_2/index.html

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [備考] インフォマティクス初心者でも1細胞全ゲノムDNA解析が可能に

    • URL

      http://www.bdr.riken.jp/jp/news/2020/research021.html

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [備考] Research News

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 研究最前線「染色体の形が細胞の個性を生む」

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] Research News

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] ゲノムDNAの立体構造から見えた乳がん細胞の弱点 -再発乳がんの治療に新たな道-

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
  • [備考] 染色体の形は細胞分化と共にこう変わる-分化に伴うゲノムの三次元構造変化を1細胞レベルで明らかに-

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書

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公開日: 2018-07-20   更新日: 2024-01-30  

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