ヌクレオソーム高次構造とダイナミクスの解析によるクロマチン潜在能の解明

• 研究領域: 遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル
• 研究課題/領域番号: 18H05534
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 胡桃坂 仁志 東京大学, 定量生命科学研究所, 教授 (80300870)
• 研究分担者: 杉山 正明 京都大学, 複合原子力科学研究所, 教授 (10253395) ; 河野 秀俊 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, プロジェクトディレクター (40291918)
• 研究期間 (年度): 2018-06-29 – 2023-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2022年度)
• 配分額: 207,870千円 (直接経費: 159,900千円、間接経費: 47,970千円); 2022年度: 37,440千円 (直接経費: 28,800千円、間接経費: 8,640千円); 2021年度: 37,440千円 (直接経費: 28,800千円、間接経費: 8,640千円); 2020年度: 37,440千円 (直接経費: 28,800千円、間接経費: 8,640千円); 2019年度: 37,440千円 (直接経費: 28,800千円、間接経費: 8,640千円); 2018年度: 58,110千円 (直接経費: 44,700千円、間接経費: 13,410千円)
• キーワード: クロマチン / エピジェネティクス / ヌクレオソーム / ヒストン / クロマチン転写 / クロマチン再構成 / クライオ電子顕微鏡 / 遺伝子発現 / 転写 / 遺伝情報複製・再編

研究成果の概要

真核生物において、ゲノムDNAは様々なタンパク質と結合して折り畳まれたクロマチンとして細胞核内に収納されている。遺伝子発現などのゲノムDNAの機能発現は、多様なクロマチン構造とそのダイナミクスによって制御されると考えられる。本研究では、様々なエピゲノム因子によって規定される、多様なクロマチンの基盤構造とダイナミクスおよびその動作原理を明らかにすることを目指した。独自の試験管内再構成系を用いて調製した、多様なヌクレオソームやクロマチン結合因子複合体の構造および性質、転写伸長複合体によるヌクレオソーム上での転写反応制御機構を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

細胞核内における多様なクロマチン構造とそのダイナミクスの制御機構の解明は、遺伝子発現制御機構の理解にとどまらず、細胞の運命決定や個体への発生制御のメカニズムの理解においても重要であることが明らかになってきた。そのような背景から、本研究は様々な研究分野に対して大きな波及効果を持つと考えられる。また、クロマチン制御の破綻は、がんをはじめとする様々な疾病と密接に関係していることが明らかになっている。このことから、本研究の成果を基礎として、疾患の発生機序解明や新規治療薬の開発研究などにおいても波及効果が期待される。以上のことから、本研究で得られた成果は学術的にも社会的にも意義深いものであると考える。

研究成果

• [国際共同研究] Stony Brook University/The University of Colorado(米国)
• [国際共同研究] Institut Laue-Langevin(フランス)
• [国際共同研究] National University of Ireland Galway(アイルランド)
• [国際共同研究] NIHES/University of North Dakota/Rockefeller University(米国)
• [国際共同研究] ANSTO(オーストラリア)
• [国際共同研究] FMI(スイス)
• [国際共同研究] Colorado School of Medicine/Rockefeller Univesity/NIEHS(米国)
• [国際共同研究] Institut Laue Langevin/Curie Institute(フランス)
• [国際共同研究] University of Cambridge(英国)
• [雑誌論文] High-Speed Atomic Force Microscopy Reveals Spontaneous Nucleosome Sliding of H2A.Z at the Subsecond Time Scale (2023)
  • 著者名/発表者名: Morioka Shin、Sato Shoko、Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Tomita Takuya、Baba Yudai、Kakuta Takahiro、Ogoshi Tomoki、Puppulin Leonardo、Sumino Ayumi、Umeda Kenichi、Kodera Noriyuki、Kurumizaka Hitoshi、Shibata Mikihiro
  • 雑誌名: Nano Letters 巻: 23 号: 5 ページ: 1696-1704
  • DOI: 10.1021/acs.nanolett.2c04346
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The cryo-EM structure of full-length RAD52 protein contains an undecameric ring (2023)
  • 著者名/発表者名: Kinoshita Chiaki、Takizawa Yoshimasa、Saotome Mika、Ogino Shun、Kurumizaka Hitoshi、Kagawa Wataru
  • 雑誌名: FEBS Open Bio 巻: 13 号: 3 ページ: 408-418
  • DOI: 10.1002/2211-5463.13565
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural studies of functional nucleosome complexes with transacting factors (2022)
  • 著者名/発表者名: KURUMIZAKA Hitoshi
  • 雑誌名: Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｊａｐａｎ Ａｃａｄｅｍｙ． Ｓｅｒ． Ｂ： Ｐｈｙｓｉｃａｌ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 巻: 98 号: 1 ページ: 1-14
  • DOI: 10.2183/pjab.98.001
  • NAID: 130008140789
  • ISSN: 0386-2208, 1349-2896
  • 年月日: 2022-01-11
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of the nucleosome containing Komagataella pastoris histones (2022)
  • 著者名/発表者名: Fukushima Yutaro、Hatazawa Suguru、Hirai Seiya、Kujirai Tomoya、Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi、Takizawa Yoshimasa、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: The Journal of Biochemistry 巻: 172 号: 2 ページ: 79-88
  • DOI: 10.1093/jb/mvac043
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural basis for binding diversity of acetyltransferase p300 to the nucleosome (2022)
  • 著者名/発表者名: Hatazawa Suguru、Liu Jiuyang、Takizawa Yoshimasa、Zandian Mohamad、Negishi Lumi、Kutateladze Tatiana G.、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: iScience 巻: 25 号: 7 ページ: 104563-104563
  • DOI: 10.1016/j.isci.2022.104563
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Nucleosome Structures Built from Highly Divergent Histones: Parasites and Giant DNA Viruses (2022)
  • 著者名/発表者名: Sato Shoko、Dacher Mariko、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Epigenomes 巻: 6 号: 3 ページ: 22-22
  • DOI: 10.3390/epigenomes6030022
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Method for Evaluating Effects of Non-coding RNAs on Nucleosome Stability (2022)
  • 著者名/発表者名: Dacher Mariko、Fujita Risa、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: piRNA: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology 巻: 2509 ページ: 195-208
  • DOI: 10.1007/978-1-0716-2380-0_12
  • ISBN: 9781071623794, 9781071623800
• [雑誌論文] Structural basis of nucleosome disassembly and reassembly by RNAPII elongation complex with FACT (2022)
  • 著者名/発表者名: Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Shirouzu Mikako、Kurumizaka Hitoshi、Sekine Shun-ichi
  • 雑誌名: Science 巻: 377 号: 6611
  • DOI: 10.1126/science.abp9466
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural basis for p53 binding to its nucleosomal target DNA sequence (2022)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Masahiro、Takizawa Yoshimasa、Nozawa Kayo、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: PNAS Nexus 巻: 1 号: 4
  • DOI: 10.1093/pnasnexus/pgac177
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-electron microscopy structure of the H3-H4 octasome: A nucleosome-like particle without histones H2A and H2B (2022)
  • 著者名/発表者名: Nozawa Kayo、Takizawa Yoshimasa、Pierrakeas Leonidas、Sogawa-Fujiwara Chizuru、Saikusa Kazumi、Akashi Satoko、Luk Ed、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 119 号: 45
  • DOI: 10.1073/pnas.2206542119
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis of RNA polymerase II transcription on the chromatosome containing linker histone H1 (2022)
  • 著者名/発表者名: Hirano Rina、Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Uejima Tamami、Takizawa Yoshimasa、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 13 号: 1 ページ: 7287-7287
  • DOI: 10.1038/s41467-022-35003-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Efficient Multiple Domain Ligation for Proteins Using Asparaginyl Endopeptidase by Selection of Appropriate Ligation Sites Based on Steric Hindrance (2022)
  • 著者名/発表者名: Okuda Aya、Shimizu Masahiro、Inoue Rintaro、Urade Reiko、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Angewandte Chemie International Edition 巻: 62 号: 1
  • DOI: 10.1002/anie.202214412
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Extracting time series matching a small-angle X-ray scattering profile from trajectories of molecular dynamics simulations (2022)
  • 著者名/発表者名: Shimizu Masahiro、Okuda Aya、Morishima Ken、Inoue Rintaro、Sato Nobuhiro、Yunoki Yasuhiro、Urade Reiko、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 号: 1 ページ: 9970-9970
  • DOI: 10.1038/s41598-022-13982-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Data Collection for Dilute Protein Solutions via a Neutron Backscattering Spectrometer (2022)
  • 著者名/発表者名: Taiki Tominaga, Hiroshi Nakagawa, Masae Sahara, Takashi Oda, Rintaro Inoue and Masaaki Sugiyama
  • 雑誌名: Life 巻: 12 号: 5 ページ: 675-675
  • DOI: 10.3390/life12050675
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Tracking the Structural Development of Amyloid Precursors in the Insulin B Chain and the Inhibition Effect by Fibrinogen (2022)
  • 著者名/発表者名: Naoki Yamamoto, Rintaro Inoue, Yoshiteru Makino, Hiroshi Sekiguchi, Naoya Shibayama, Akira Naito, Masaaki Sugiyama, and Eri Chatani
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: 126 号: 51 ページ: 10797-10812
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c05136
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Orchestration of Proteins in cyanobacterial Circadian Clock System 1 (2022)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama Masaaki、Morishima Ken、Yunoki Yasuhiro、Inoue Rintaro、Sato Nobuhiro、Yagi Hirokazu、Kato Koichi
  • 雑誌名: bioRxiv 巻: -
  • DOI: 10.1101/2022.08.26.505376
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Fly casting with ligand sliding and orientational selection supporting complex formation of a GPCR and a middle sized flexible molecule. (2022)
  • 著者名/発表者名: Junichi Higo, Kota Kasahara, Gert-Jan Bekker, Benson Ma, Shun Sakuraba, Shinji Iida, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Hidetoshi Kono, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 12 号: 1 ページ: 13792-13792
  • DOI: 10.1038/s41598-022-17920-7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Free Energy Landscape of H2A-H2B Displacement From Nucleosome (2022)
  • 著者名/発表者名: Ishida Hisashi、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 巻: 434 号: 16 ページ: 167707-167707
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2022.167707
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Chemical catalyst/protein hybrid as artificial histone-modifying enzyme for epigenome manipulation (2022)
  • 著者名/発表者名: Fujimura Akiko、Ishida Hisashi、Nozaki Tamiko、Azumaya Yuto、Ishiguro Tadashi、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Kono Hidetoshi、Yamatsugu Kenzo、Kawashima Shigehiro、Kanai Motomu
  • 雑誌名: ChemRxiv 巻: -
  • DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-xt610
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] 多分散・多成分溶液中の生体高分子の構造解析のための小角散乱と各種成分分離手法の複合的アプローチ (2022)
  • 著者名/発表者名: 守島健、佐藤信浩、井上倫太郎、杉山正明
  • 雑誌名: 波紋 巻: 32 ページ: 16-20
  • 査読あり
• [雑誌論文] 時計タンパク質複合体の構造解析を通して明らかとなった中性子小角散乱の強み (2022)
  • 著者名/発表者名: 柚木康弘、松本淳、守島健、Martel Anne、Porcar Lionel、佐藤信浩、與語理那、富永大輝、矢木真穂、井上倫太郎、河野秀俊、矢木宏和、加藤晃一、杉山正明
  • 雑誌名: 波紋 巻: 32 ページ: 158-164
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] RNAPII driven post-translational modifications of nucleosomal histones (2022)
  • 著者名/発表者名: Chan Justin、Kumar Amarjeet、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Trends in Genetics 巻: 38 号: 10 ページ: 1076-1095
  • DOI: 10.1016/j.tig.2022.04.010
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] HNF1A POU Domain Mutations Found in Japanese Liver Cancer Patients Cause Downregulation of HNF4A Promoter Activity with Possible Disruption in Transcription Networks (2022)
  • 著者名/発表者名: Haque Effi、Teeli Aamir Salam、Winiarczyk Dawid、Taguchi Masahiko、Sakuraba Shun、Kono Hidetoshi、Leszczynski Pawel、Pierzchala Mariusz、Taniguchi Hiroaki
  • 雑誌名: Genes 巻: 13 号: 3 ページ: 413-413
  • DOI: 10.3390/genes13030413
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Overall structure of fully assembled cyanobacterial KaiABC circadian clock complex by an integrated experimental-computational approach (2022)
  • 著者名/発表者名: Yunoki Yasuhiro、Matsumoto Atsushi、Morishima Ken、Martel Anne、Porcar Lionel、Sato Nobuhiro、Yogo Rina、Tominaga Taiki、Inoue Rintaro、Yagi-Utsumi Maho、Okuda Aya、Shimizu Masahiro、Urade Reiko、Terauchi Kazuki、Kono Hidetoshi、Yagi Hirokazu、Kato Koichi、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 5 号: 1 ページ: 184-184
  • DOI: 10.1038/s42003-022-03143-z
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural insight into replicative helicase loading in Escherichia coli (2022)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi Naoki、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: The Journal of Biochemistry 巻: - 号: 6 ページ: 605-607
  • DOI: 10.1093/jb/mvac023
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] NRF2 DLG Domain Mutations Identified in Japanese Liver Cancer Patients Affect the Transcriptional Activity in HCC Cell Lines (2021)
  • 著者名/発表者名: Haque Effi、Smiech Magdalena、Luczynska Kamila、Bouchard Marie France、Viger Robert、Kono Hidetoshi、Pierzchala Mariusz、Taniguchi Hiroaki
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 22 号: 10 ページ: 5296-5296
  • DOI: 10.3390/ijms22105296
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] The N-terminal Tails of Histones H2A and H2B Adopt Two Distinct Conformations in the Nucleosome with Contact and Reduced Contact to DNA (2021)
  • 著者名/発表者名: Ohtomo Hideaki、Kurita Jun-ichi、Sakuraba Shun、Li Zhenhai、Arimura Yasuhiro、Wakamori Masatoshi、Tsunaka Yasuo、Umehara Takashi、Kurumizaka Hitoshi、Kono Hidetoshi、Nishimura Yoshifumi
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 巻: 433 号: 15 ページ: 167110-167110
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2021.167110
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis of the regulation of the normal and oncogenic methylation of nucleosomal histone H3 Lys36 by NSD2 (2021)
  • 著者名/発表者名: Sato Ko、Kumar Amarjeet、Hamada Keisuke、Okada Chikako、Oguni Asako、Machiyama Ayumi、Sakuraba Shun、Nishizawa Tomohiro、Nureki Osamu、Kono Hidetoshi、Ogata Kazuhiro、Sengoku Toru
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 12 号: 1 ページ: 6605-6605
  • DOI: 10.1038/s41467-021-26913-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Interplay among transacting factors around promoter in the initial phases of transcription (2021)
  • 著者名/発表者名: Kumar Amarjeet、Chan Justin、Taguchi Masahiko、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 71 ページ: 7-15
  • DOI: 10.1016/j.sbi.2021.04.008
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Sequence-dependent nucleosome formation in trinucleotide repeats evaluated by in vivo chemical mapping (2021)
  • 著者名/発表者名: Koji Katsumata, Yuichi Ichikawa, Tomohiro Fuse, Hitoshi Kurumizaka, Akio Yanagida , Takeshi Urano, Hiroaki Kato, Mitsuhiro Shimizu
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 556 ページ: 179-184
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2021.03.155
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Chromatin structure-dependent histone incorporation revealed by a genome-wide deposition assay (2021)
  • 著者名/発表者名: Hiroaki Tachiwana, Mariko Dacher, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yosuke Seto, Ryohei Katayama, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka, Noriko Saitoh
  • 雑誌名: eLife 巻: 10
  • DOI: 10.7554/elife.66290
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural basis for DNA sequence recognition by pioneer factors in nucleosomes. (2021)
  • 著者名/発表者名: Kagawa W, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 71 ページ: 59-64
  • DOI: 10.1016/j.sbi.2021.05.011
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing <i>Giardia lamblia</i> histones (2021)
  • 著者名/発表者名: Sato Shoko、Takizawa Yoshimasa、Hoshikawa Fumika、Dacher Mariko、Tanaka Hiroki、Tachiwana Hiroaki、Kujirai Tomoya、Iikura Yukari、Ho Cheng-Han、Adachi Naruhiko、Patwal Indu、Flaus Andrew、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 49 号: 15 ページ: 8934-8946
  • DOI: 10.1093/nar/gkab644
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL‐seq with single thin sections (2021)
  • 著者名/発表者名: Maehara Kazumitsu、Tomimatsu Kosuke、Harada Akihito、Tanaka Kaori、Sato Shoko、Fukuoka Megumi、Okada Seiji、Handa Tetsuya、Kurumizaka Hitoshi、Saitoh Noriko、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: Molecular Systems Biology 巻: 17 号: 11 ページ: 8934-8946
  • DOI: 10.15252/msb.202110323
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Unusual nucleosome formation and transcriptome influence by the histone H3mm18 variant (2021)
  • 著者名/発表者名: Hirai Seiya、Tomimatsu Kosuke、Miyawaki-Kuwakado Atsuko、Takizawa Yoshimasa、Komatsu Tetsuro、Tachibana Taro、Fukushima Yutaro、Takeda Yasuko、Negishi Lumi、Kujirai Tomoya、Koyama Masako、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 50 号: 1 ページ: 72-91
  • DOI: 10.1093/nar/gkab1137
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Organoruthenium-Catalyzed Chemical Protein Synthesis to Elucidate the Functions of Epigenetic Modifications on Heterochromatin Factors (2021)
  • 著者名/発表者名: Kamo, N.; Kujirai, T.; Kurumizaka, H.; Murakami, H.; Hayashi, G.; Okamoto, A.
  • 雑誌名: Chem. Sci. 巻: 12 号: 16 ページ: 5926-5937
  • DOI: 10.1039/d1sc00731a
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Solution structure of multi-domain protein ER-60 studied by aggregation-free SAXS and coarse-grained-MD simulation (2021)
  • 著者名/発表者名: Okuda Aya、Shimizu Masahiro、Morishima Ken、Inoue Rintaro、Sato Nobuhiro、Urade Reiko、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 1-13
  • DOI: 10.1038/s41598-021-85219-0
  • NAID: 120006997066
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A feasibility study of inverse contrast-matching small-angle neutron scattering method combined with size exclusion chromatography using antibody interactions as model systems (2021)
  • 著者名/発表者名: Sato Nobuhiro、Yogo Rina、Yanaka Saeko、Martel Anne、Porcar Lionel、Morishima Ken、Inoue Rintaro、Tominaga Taiki、Arimori Takao、Takagi Junichi、Sugiyama Masaaki、Kato Koichi
  • 雑誌名: The Journal of Biochemistry 巻: 0 号: 6 ページ: 1-8
  • DOI: 10.1093/jb/mvab012
  • NAID: 40022687772
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing (2021)
  • 著者名/発表者名: Tjalsma Sjoerd J D、Hori Mayako、Sato Yuko、Bousard Aurelie、Ohi Akito、Raposo Ana Claudia、Roensch Julia、Le Saux Agnes、Nogami Jumpei、Maehara Kazumitsu、Kujirai Tomoya、Handa Tetsuya、Bages‐Arnal Sandra、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi、da Rocha Simao Teixeira、Zylicz Jan J、Kimura Hiroshi、Heard Edith
  • 雑誌名: EMBO reports 巻: 22 号: 3
  • DOI: 10.15252/embr.202051989
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Sequence-dependent Hydration Water Dynamics of Dodecameric DNA (2021)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa Hiroshi、Yonetani Yoshiteru、Nakajima Kenji、Ohira-Kawamura Seiko、Kikuchi Tatsuya、Inamura Yasuhiro、Kataoka Mikio、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Proceedings of the J-PARC Symposium 2019, JPS 巻: 33 ページ: 011101-011101
  • DOI: 10.7566/jpscp.33.011101
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cryo‐EM structure of the CENP‐A nucleosome in complex with phosphorylated CENP‐C (2021)
  • 著者名/発表者名: Ariyoshi Mariko、Makino Fumiaki、Watanabe Reito、Nakagawa Reiko、Kato Takayuki、Namba Keiichi、Arimura Yasuhiro、Fujita Risa、Kurumizaka Hitoshi、Okumura Ei‐ichi、Hara Masatoshi、Fukagawa Tatsuo
  • 雑誌名: The EMBO Journal 巻: 40 号: 5 ページ: 1-20
  • DOI: 10.15252/embj.2020105671
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Torsional stress can regulate the unwrapping of two outer half superhelical turns of nucleosomal DNA (2021)
  • 著者名/発表者名: Ishida Hisashi、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 118 号: 7
  • DOI: 10.1073/pnas.2020452118
  • 査読あり
• [雑誌論文] Histone variant H2A.B-H2B dimers are spontaneously exchanged with canonical H2A-H2B in the nucleosome (2021)
  • 著者名/発表者名: Rina Hirano, Yasuhiro Arimura, Tomoya Kujirai, Mikihiro Shibata, Aya Okuda, Ken Morishima, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Hitoshi Kurumizaka
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 4 号: 1 ページ: 1-11
  • DOI: 10.1038/s42003-021-01707-z
  • NAID: 120006960298
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural basis of nucleosomal histone H4 lysine 20 methylation by SET8 methyltransferase (2021)
  • 著者名/発表者名: Ho Cheng-Han、Takizawa Yoshimasa、Kobayashi Wataru、Arimura Yasuhiro、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Life Science Alliance 巻: 4 号: 4 ページ: e202000919-e202000919
  • DOI: 10.26508/lsa.202000919
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Deuteration Aiming for Neutron Scattering (2021)
  • 著者名/発表者名: Okuda Aya、Inoue Rintaro、Morishima Ken、Saio Tomohide、Yunoki Yasuhiro、Yagi-Utsumi Maho、Yagi Hirokazu、Shimizu Masahiro、Sato Nobuhiro、Urade Reiko、Kato Koichi、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Biophysics and Physicobiology 巻: 18 号: 0 ページ: 16-27
  • DOI: 10.2142/biophysico.bppb-v18.003
  • NAID: 130008000165
  • ISSN: 2189-4779
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Live-cell epigenome manipulation by synthetic histone acetylation catalyst system (2021)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara Yusuke、Yamanashi Yuki、Fujimura Akiko、Sato Yuko、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Yamatsugu Kenzo、Kawashima Shigehiro A.、Kanai Motomu
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 118 号: 4
  • DOI: 10.1073/pnas.2019554118
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidation of the mechanism of subunit exchange in αB crystallin oligomers (2021)
  • 著者名/発表者名: Inoue Rintaro、Sakamaki Yusuke、Takata Takumi、Wood Kathleen、Morishima Ken、Sato Nobuhiro、Okuda Aya、Shimizu Masahiro、Urade Reiko、Fujii Noriko、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 11 号: 1 ページ: 1-9
  • DOI: 10.1038/s41598-021-82250-z
  • NAID: 120006956390
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Contributions of Histone Variants in Nucleosome Structure and Function (2021)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi、Kujirai Tomoya、Takizawa Yoshimasa
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 巻: 433 号: 6 ページ: 166678-166678
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2020.10.012
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Dynamics of proteins with different molecular structures under solution condition (2020)
  • 著者名/発表者名: Inoue Rintaro、Oda Takashi、Nakagawa Hiroshi、Tominaga Taiki、Saio Tomohide、Kawakita Yukinobu、Shimizu Masahiro、Okuda Aya、Morishima Ken、Sato Nobuhiro、Urade Reiko、Sato Mamoru、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 21678-21678
  • DOI: 10.1038/s41598-020-78311-4
  • NAID: 120007193758
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] PV1 Protein from Plasmodium falciparum Exhibits Chaperone-Like Functions and Cooperates with Hsp100s (2020)
  • 著者名/発表者名: Hakamada Kazuaki、Nakamura Manami、Midorikawa Rio、Shinohara Kyosuke、Noguchi Keiichi、Nagaoka Hikaru、Takashima Eizo、Morishima Ken、Inoue Rintaro、Sugiyama Masaaki、Kawamoto Akihiro、Yohda Masafumi
  • 雑誌名: International Journal of Molecular Sciences 巻: 21 号: 22 ページ: 8616-8616
  • DOI: 10.3390/ijms21228616
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Acetylation-modulated communication between the H3 N-terminal tail domain and the intrinsically disordered H1 C-terminal domain (2020)
  • 著者名/発表者名: Hao, F; Murphy, K. J.; Kujirai, T.; Kamo, N.; Kato, J.; Koyama, M.; Okamato, A.; Hayashi, G.; Kurumizaka, H.; Hayes, J. J.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 48 号: 20 ページ: 11510-11520
  • DOI: 10.1093/nar/gkaa949
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Essentiality of CENP-A Depends on Its Binding Mode to HJURP. (2020)
  • 著者名/発表者名: Tetsuya Hori , JingHui Cao , Kohei Nishimura , Mariko Ariyoshi , Yasuhiro Arimura , Hitoshi Kurumizaka , Tatsuo Fukagawa
  • 雑誌名: Cell reports 巻: 33 号: 7 ページ: 108388-108388
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2020.108388
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Nucleosome unwrapping and unstacking (2020)
  • 著者名/発表者名: Kono Hidetoshi、Ishida Hisashi
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 64 ページ: 119-125
  • DOI: 10.1016/j.sbi.2020.06.020
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input. (2020)
  • 著者名/発表者名: Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shoko Sato, Masaru Nakao, Naoki Goto, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura.
  • 雑誌名: Nat Protoc. 巻: 15 号: 10 ページ: 3334-3360
  • DOI: 10.1038/s41596-020-0375-8
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural basis for the inhibition of cGAS by nucleosomes (2020)
  • 著者名/発表者名: Kujirai Tomoya、Zierhut Christian、Takizawa Yoshimasa、Kim Ryan、Negishi Lumi、Uruma Nobuki、Hirai Seiya、Funabiki Hironori、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Science 巻: 370 号: 6515 ページ: 455-458
  • DOI: 10.1126/science.abd0237
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Interaction of the pioneer transcription factor GATA3 with nucleosomes (2020)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Hiroki、Takizawa Yoshimasa、Takaku Motoki、Kato Daiki、Kumagawa Yusuke、Grimm Sara A.、Wade Paul A.、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 11 号: 1 ページ: 4136-4136
  • DOI: 10.1038/s41467-020-17959-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis for designing an array of engrailed homeodomains (2020)
  • 著者名/発表者名: Sunami Tomoko、Hirano Yu、Tamada Taro、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section D Structural Biology 巻: 76 号: 9 ページ: 824-833
  • DOI: 10.1107/s2059798320009237
  • 査読あり
• [雑誌論文] Linker DNA and histone contributions in nucleosome binding by p53 (2020)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Masahiro、Arimura Yasuhiro、Nozawa Kayo、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: The Journal of Biochemistry 巻: 168 号: 6 ページ: 669-675
  • DOI: 10.1093/jb/mvaa081
  • NAID: 40022454706
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nucleosome binding by the pioneer transcription factor OCT4 (2020)
  • 著者名/発表者名: Echigoya Kenta、Koyama Masako、Negishi Lumi、Takizawa Yoshimasa、Mizukami Yuka、Shimabayashi Hideki、Kuroda Akari、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 10 号: 1 ページ: 11832-11832
  • DOI: 10.1038/s41598-020-68850-1
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Integral approach to biomacromolecular structure by analytical-ultracentrifugation and small-angle scattering (2020)
  • 著者名/発表者名: Morishima Ken、Okuda Aya、Inoue Rintaro、Sato Nobuhiro、Miyamoto Yosuke、Urade Reiko、Yagi-Utsumi Maho、Kato Koichi、Hirano Rina、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 3 号: 1 ページ: 294-294
  • DOI: 10.1038/s42003-020-1011-4
  • NAID: 120006850271
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The N‐terminal and C‐terminal halves of histone H2A.Z independently function in nucleosome positioning and stability (2020)
  • 著者名/発表者名: Sato Shoko、Tanaka Naoki、Arimura Yasuhiro、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 25 号: 8 ページ: 538-546
  • DOI: 10.1111/gtc.12791
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Improved Methods for Preparing the Telomere Tethering Complex Bqt1-Bqt2 for Structural Studies (2020)
  • 著者名/発表者名: Yuzurihara H, Aizawa Y, Saotome M, Ichikawa Y, Yokoyama H, Chikashige Y, Haraguchi T, Hiraoka Y, Kurumizaka H, Kagawa W
  • 雑誌名: Protein J 巻: - 号: 2 ページ: 174-181
  • DOI: 10.1007/s10930-020-09887-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Nucleosome destabilization by nuclear non-coding RNAs. (2020)
  • 著者名/発表者名: †Fujita R, †Yamamoto T, Arimura Y, Fujiwara S, Tachiwana H, Ichikawa Y, Sakata S, Yang L, Maruyama R, Hamada M, Nakao M, *Saitoh N, *Kurumizaka H
  • 雑誌名: Commun Biol 巻: 3 号: 1 ページ: 60-60
  • DOI: 10.1038/s42003-020-0784-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Native Mass Spectrometry of Protein and DNA Complexes Prepared in Nonvolatile Buffers (2020)
  • 著者名/発表者名: Saikusa Kazumi、Kato Daiki、Nagadoi Aritaka、Kurumizaka Hitoshi、Akashi Satoko
  • 雑誌名: Journal of the American Society for Mass Spectrometry 巻: 31 号: 3 ページ: 711-718
  • DOI: 10.1021/jasms.9b00145
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Studies of Overlapping Dinucleosomes in Solution (2020)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto Atsushi、Sugiyama Masaaki、Li Zhenhai、Martel Anne、Porcar Lionel、Inoue Rintaro、Kato Daiki、Osakabe Akihisa、Kurumizaka Hitoshi、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Biophysical Journal 巻: 118 号: 9 ページ: 2209-2219
  • DOI: 10.1016/j.bpj.2019.12.010
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Cryo-EM Structures of Centromeric Tri-nucleosomes Containing a Central CENP-A Nucleosome. (2020)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Takizawa, Cheng-Han Ho, Hiroaki Tachiwana, Hideyuki Matsunami, Wataru Kobayashi, Midori Suzuki, Yasuhiro Arimura, Tetsuya Hori, Tatsuo Fukagawa, Melanie D Ohi, Matthias Wolf, Hitoshi Kurumizaka
  • 雑誌名: Structure 巻: 28 号: 1 ページ: 44-53
  • DOI: 10.1016/j.str.2019.10.016
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Heterochromatin protein 1 (HP1): interactions with itself and chromatin components (2020)
  • 著者名/発表者名: Kumar A, *Kono H.
  • 雑誌名: Biophys Rev 巻: in press 号: 2 ページ: 387-400
  • DOI: 10.1007/s12551-020-00663-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcription through the nucleosome (2020)
  • 著者名/発表者名: Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 61 ページ: 42-49
  • DOI: 10.1016/j.sbi.2019.10.007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Biochemical and structural analyses of the nucleosome containing human histone H2A.J (2019)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Hiroki、Sato Shoko、Koyama Masako、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: The Journal of Biochemistry 巻: 167 号: 4 ページ: 419-427
  • DOI: 10.1093/jb/mvz109
  • NAID: 40022211009
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Incorporation and influence of Leishmania histone H3 in chromatin (2019)
  • 著者名/発表者名: Dacher Mariko、Tachiwana Hiroaki、Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Taguchi Hiroyuki、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 47 号: 22 ページ: 11637-11648
  • DOI: 10.1093/nar/gkz1040
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structure determination of the nucleosome core particle by selenium SAD phasing (2019)
  • 著者名/発表者名: Saotome Mika、Horikoshi Naoki、Urano Kazuki、Kujirai Tomoya、Yuzurihara Hidetaka、Kurumizaka Hitoshi、Kagawa Wataru
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section D Structural Biology 巻: 75 号: 10 ページ: 930-936
  • DOI: 10.1107/s2059798319012713
  • 査読あり
• [雑誌論文] H3K14 ubiquitylation promotes H3K9 methylation for heterochromatin assembly (2019)
  • 著者名/発表者名: Oya Eriko、Nakagawa Reiko、Yoshimura Yuriko、Tanaka Mayo、Nishibuchi Gohei、Machida Shinichi、Shirai Atsuko、Ekwall Karl、Kurumizaka Hitoshi、Tagami Hideaki、Nakayama Jun‐ichi
  • 雑誌名: EMBO reports 巻: 20 号: 10
  • DOI: 10.15252/embr.201948111
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Biochemical analysis of nucleosome targeting by Tn5 transposase (2019)
  • 著者名/発表者名: Sato S, Arimura Y, Kujirai T, Harada A, Maehara K, Nogami J, Ohkawa Y, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Open Biol. 巻: 9 号: 8 ページ: 190116-190116
  • DOI: 10.1098/rsob.190116
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The CHD4-related syndrome: a comprehensive investigation of theclinical spectrum, genotype-phenotype correlations, and molecular basis (2019)
  • 著者名/発表者名: Weiss K, Lazar HP, Kurolap A, Martinez AF, …Kurumizaka H, Gelb BD, Baris Feldman H, Campeau PM, Muenke M, Wade PA, Lachlan K.
  • 雑誌名: Genetics in Medicine 巻: 22 号: 2 ページ: 389-397
  • DOI: 10.1038/s41436-019-0612-0
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Intrabody-based FRET probe to visualize endogenous histone acetylation (2019)
  • 著者名/発表者名: Chung Chan-I、Sato Yuko、Ohmuro-Matsuyama Yuki、Machida Shinichi、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ueda Hiroshi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 10188-10188
  • DOI: 10.1038/s41598-019-46573-2
  • NAID: 120006936925
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structure-based design of an H2A.Z.1 mutant stabilizing a nucleosome in vitro and in vivo (2019)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi Naoki、Kujirai Tomoya、Sato Koichi、Kimura Hiroshi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 515 号: 4 ページ: 719-724
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2019.06.012
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] DNA damage detection in nucleosomes involves DNA register shifting (2019)
  • 著者名/発表者名: Matsumoto Syota、Cavadini Simone、Bunker Richard D.、Grand Ralph S.、Potenza Alessandro、Rabl Julius、Yamamoto Junpei、Schenk Andreas D.、Schubeler Dirk、Iwai Shigenori、Sugasawa Kaoru、Kurumizaka Hitoshi、Thoma Nicolas H.
  • 雑誌名: Nature 巻: 571 号: 7763 ページ: 79-84
  • DOI: 10.1038/s41586-019-1259-3
  • NAID: 120006634977
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of the nuclear pore complex component ELYS identify residues responsible for nucleosome binding (2019)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Wataru、Takizawa Yoshimasa、Aihara Maya、Negishi Lumi、Ishii Hajime、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Communications Biology 巻: 2 号: 1 ページ: 163-163
  • DOI: 10.1038/s42003-019-0385-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Biochemical characterization of the placeholder nucleosome for DNA hypomethylation maintenance (2019)
  • 著者名/発表者名: Hirano Rina、Kujirai Tomoya、Negishi Lumi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Biochemistry and Biophysics Reports 巻: 18 ページ: 100634-100634
  • DOI: 10.1016/j.bbrep.2019.100634
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Free energy profile for unwrapping outer superhelical turn of CENP-A nucleosome (2019)
  • 著者名/発表者名: Kono Hidetoshi、Sakuraba Shun、Ishida Hisashi
  • 雑誌名: Biophysics and Physicobiology 巻: 16 号: 0 ページ: 337-343
  • DOI: 10.2142/biophysico.16.0_337
  • NAID: 130007752747
  • ISSN: 2189-4779
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Balance between DNA‐binding affinity and specificity enables selective recognition of longer target sequences in vivo (2019)
  • 著者名/発表者名: Sunami Tomoko、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: Protein Science 巻: 28 号: 9 ページ: 1630-1639
  • DOI: 10.1002/pro.3677
  • 査読あり
• [雑誌論文] Histone H3K23-specific acetylation by MORF is coupled to H3K14 acylation (2019)
  • 著者名/発表者名: Klein BJ, Jang SM, Lachance C, Mi W, Lyu J, Sakuraba S, Krajewski K, Wang WW, Sidoli S, Liu J, Zhang Y, Wang X, Warfield BM, Kueh AJ, Voss AK, Thomas T, Garcia BA, Liu WR, Strahl BD, Kono H, Li W, Shi X, Cote J, Kutateladze TG.
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 10 号: 1 ページ: 12551-12555
  • DOI: 10.1038/s41467-019-12551-5
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Newly developed Laboratory-based Size exclusion chromatography Small-angle x-ray scattering System (La-SSS) (2019)
  • 著者名/発表者名: R. Inoue, T. Nakagawa, K. Morishima, N. Sato, A. Okuda, R. Urade, R. Yogo, S. Yanaka, M. Yagi-Utsumi, K. Kato, K. Omoto, K. Ito, M. Sugiyama
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1038/s41598-019-48911-w
  • NAID: 120006799252
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural transition of the nucleosome during chromatin remodeling and transcription (2019)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Wataru、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Current Opinion in Structural Biology 巻: 59 ページ: 107-114
  • DOI: 10.1016/j.sbi.2019.07.011
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The CENP-A centromere targeting domain facilitates H4K20 monomethylation in the nucleosome by structural polymorphism. (2019)
  • 著者名/発表者名: Arimura Y, Tachiwana H, Takagi H, Hori T, Kimura H, Fukagawa T, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 10 号: 1 ページ: 576-576
  • DOI: 10.1038/s41467-019-08314-x
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Structural insight into nucleosome transcription by RNA polymerase II with elongation factors (2019)
  • 著者名/発表者名: Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Fujino Yuka、Shirouzu Mikako、Kurumizaka Hitoshi、Sekine Shun-ichi
  • 雑誌名: Science 巻: 363 号: 6428 ページ: 744-747
  • DOI: 10.1126/science.aav8912
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cancer-associated mutations of histones H2B, H3.1 and H2A.Z.1 affect the structure and stability of the nucleosome (2018)
  • 著者名/発表者名: Arimura Yasuhiro、Ikura Masae、Fujita Risa、Noda Mamiko、Kobayashi Wataru、Horikoshi Naoki、Sun Jiying、Shi Lin、Kusakabe Masayuki、Harata Masahiko、Ohkawa Yasuyuki、Tashiro Satoshi、Kimura Hiroshi、Ikura Tsuyoshi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: - ページ: 10007-10018
  • DOI: 10.1093/nar/gky661
  • NAID: 120006545208
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural basis of the nucleosome transition during RNA polymerase II passage (2018)
  • 著者名/発表者名: Kujirai Tomoya、Ehara Haruhiko、Fujino Yuka、Shirouzu Mikako、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Science 巻: 362 号: 6414 ページ: 595-598
  • DOI: 10.1126/science.aau9904
  • 査読あり
• [雑誌論文] Investigating the Influence of Arginine Dimethylation on Nucleosome Dynamics Using All-Atom Simulations and Kinetic Analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Li Zhenhai、Kono Hidetoshi
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: 122 号: 42 ページ: 9625-9634
  • DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b05067
  • 査読あり
• [雑誌論文] A chromatin integration labelling method enables epigenomic profiling with lower input (2018)
  • 著者名/発表者名: Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Handa Tetsuya、Arimura Yasuhiro、Nogami Jumpei、Hayashi-Takanaka Yoko、Shirahige Katsuhiko、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
  • 雑誌名: Nature Cell Biology 巻: 21 号: 2 ページ: 287-296
  • DOI: 10.1038/s41556-018-0248-3
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Crystallographic analysis of the overlapping dinucleosome as a novel chromatin unit (2018)
  • 著者名/発表者名: Nishimura Masahiro、Nozawa Kayo、Kurumizaka Hitoshi
  • 雑誌名: Biophysics and Physicobiology 巻: 15 号: 0 ページ: 251-254
  • DOI: 10.2142/biophysico.15.0_251
  • NAID: 130007535611
  • ISSN: 2189-4779
  • 査読あり / オープンアクセス
• [学会発表] 蛋白質の階層構造ダイナミクスの解明 (2023)
  • 著者名/発表者名: 中川洋、井上倫太郎、小田隆、矢木-内海真穂、斎尾智英、苙口友隆、長田裕也、杉山正明、佐藤衛、川北至信、岩瀬裕希、富永大輝、高田慎一
  • 学会等名: 2022年度量子ビームサイエンスフェスタ
• [学会発表] BL02による希薄タンパク質溶液のデータ収集最適化 (2023)
  • 著者名/発表者名: 富永大輝, 中川洋, 佐原雅恵, 小田隆, 井上倫太郎, 杉山正明
  • 学会等名: 2022年度量子ビームサイエンスフェスタ
• [学会発表] X線小角散乱と全原子分子動力学シミュレーションによるα-glucosidaseの溶液構造研究 (2023)
  • 著者名/発表者名: 會澤直樹、清水将裕、横田幸紀、守島健、柚木康弘、奥田綾、佐藤信浩、井上倫太郎、大田ゆかり、裏出令子、杉山正明
  • 学会等名: 2022年度量子ビームサイエンスフェスタ
• [学会発表] The effect of Mg2+ ions on nucleosomal array under external force (2023)
  • 著者名/発表者名: Amarjeet Kumar、Tomoko Sunami、Shoko Sato、Hitoshi Kurumizaka、Hidetoshi Kono
  • 学会等名: The 67th Biophysical Society Annual Meeting
  • 国際学会
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるクロマチン構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 日本顕微鏡学会 第78回学術講演会
• [学会発表] Structural dynamics of the nucleosome during transcription elongation (2022)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: The 2022 (6th) Telluride Workshop on Chromatin Structure and Dynamics
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Impact of torque and TF-binding on nucleosome investigated by molecular dynamics simulation and SAXS (2022)
  • 著者名/発表者名: Kono Hidetoshi
  • 学会等名: The 2022 (6th) Telluride Workshop on Chromatin Structure and Dynamics
  • 国際学会
• [学会発表] Structural insights into chromatin dynamics during gene expression (2022)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Laboratory "Epigenetics & Chromatin" Meeting
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 遺伝子転写におけるクロマチン構造ダイナミクス (2022)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 2022年度国立遺伝学研究所クロマチン研究会 令和4年度遺伝研研究会 (クロマチン・細胞核構造の動的変換とゲノム機能制御)
• [学会発表] ジヌクレオソームを用いたヘテロクロマチン基盤構造のクライオ電子顕微鏡解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 何承翰、鯨井智也、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 新学術領域・学術変革A合同「若手の会 2022」
• [学会発表] ヒストンバリアントによるクロマチン転写の制御機構 (2022)
  • 著者名/発表者名: 赤津綜隆、鯨井智也、滝沢由政、平野里奈、江原晴彦、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 新学術領域・学術変革A合同「若手の会 2022」
• [学会発表] ヌクレオソームにおけるヒストンN末端テールの機能 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大石匠美、畠澤卓、鯨井智也、林剛介、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 新学術領域・学術変革A合同「若手の会 2022」
• [学会発表] エピジェネティックな遺伝子制御のクロマチン構造基盤 (2022)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] 病原性寄生虫Giardia lambliaのクロマチン基盤構造 (2022)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 祥子、滝沢 由政、Dacher Mariko、田中大貴、立和名博昭、飯倉ゆかり、鯨井智也、Ho Cheng-Han、安達成彦、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] リンカーヒストンH1を含むヘテロクロマチン基盤構造のクライオ電顕解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 何承翰、鯨井智也、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] 転写におけるクロマチン構造の維持機構 (2022)
  • 著者名/発表者名: 赤津綜隆、江原晴彦、鯨井智也、藤田理紗、滝沢由政、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] メタノール資化酵母 K. pastorisヌクレオソームにおける転写解析およびcryo-EM構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 福島友太郎、畠澤卓、平井誠也、鯨井智也、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] ヒストンアセチル化酵素p300によるヌクレオソーム結合の構造基盤 (2022)
  • 著者名/発表者名: 畠澤卓、Liu Jiuyang、滝沢由政、Zandian Mohamad、根岸瑠美、Kutateladze Tatiana G.、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] ヒストンN末端テールがヌクレオソームの機能に与える影響 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大石匠美、畠澤卓、鯨井智也、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] 核内タンパク質による高次クロマチン形成機構の構造生物学的解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 堀越直樹、三宅諒祐、曽川千鶴、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡による色素性乾皮症E群タンパク質DDB2の紫外線損傷認識機構の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 松本翔太、滝沢由政、小笠原光雄、橘春奈、山元淳平、岩井成憲、菅澤薫、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第95回日本生化学会大会
• [学会発表] 転写におけるクロマチン構造とダイナミクス (2022)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] ヒストンH3バリアントを標的とした細胞核抽出クロマチンの構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 塩井琢郎、畠澤卓、大川恭行、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡解析から明らかになった新しいサブヌクレオソーム・H3-H4オクタソームの構造機能解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 野澤佳世、滝沢由政、七種和美、明石知子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] H3-H4オクタソーム上で起こる転写機構の解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大井茉祐子、野澤佳世、西村正宏、滝沢由政、鯨井智也、江原晴彦、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] piRNA因子Rhinoとヌクレオソームの複合体構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大畑健汰、大角健、滝沢由政、塩見美喜子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] ピキア酵母ヌクレオソームの立体構造および転写解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 福島友太郎、畠澤卓、平井誠也、鯨井智也、江原晴彦、滝沢由政、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] ヒストンH3バリアントH3.8を含むヌクレオソームの性状解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 平井誠也、鯨井智也、大川恭行、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 転写共役修復におけるRNAポリメラーゼII-ヌクレオソーム複合体の構造ダイナミクス (2022)
  • 著者名/発表者名: 大角健、鯨井智也、滝沢由政、江原晴彦、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] クロマチン結合因子DEKの構造とクロマチン制御機構 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、越後谷健太、岸雄介、滝沢由政、佐伯麻衣、増本博司、木村宏、後藤由季子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 細胞核内より抽出したクロマチンユニットのクライオ電顕構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 滝沢由政、畠澤卓、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
• [学会発表] NSD2酵素のメチル基付加機構と翻訳後修飾のヌクレオソームに与える影響 (2022)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊、Kumar Amarjeet、佐藤光、仙石徹
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソームDNAのほどけやすさに見られる非対称性 (2022)
  • 著者名/発表者名: 角南智子、石田恒、河野秀俊
  • 学会等名: 第45回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 転写におけるヌクレオソーム構造のダイナミクス (2022)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第15回日本エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] クロマトソーム上での転写伸長機構に関する解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 平野里奈、江原晴彦、鯨井智也、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第15回日本エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] 転写因子p53によるヌクレオソーム中のDNA配列認識機構の構造的研究 (2022)
  • 著者名/発表者名: 西村正宏
  • 学会等名: 第15回日本エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] NSD2によるヌクレオソーム上H3 Lys36メチル化の構造基盤 (2022)
  • 著者名/発表者名: 仙石徹、佐藤光、クマールアマラジート、濱田恵輔、河野秀俊、緒方一博
  • 学会等名: 第15回日本エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるヒトヌクレオソームの高分解能構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 滝沢由政、佐藤祥子、何承翰、ダネフラドスティン、胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 新しいクロマチン基盤構造 H3-H4 オクタソームのクライオ電子顕微鏡解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 野澤佳世、滝沢由政、七種和美、明石知子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 小角散乱及び中性子準弾性散乱によるHef-IDRの構造・ダイナミクス解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 井上 倫太郎、小田隆、中川洋、富永大輝、川北至信、佐藤衛、杉山 正明
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] X線小角散乱プロファイルと粗視化分子動力学計算に基づく4ドメインタンパク質ER-60の構造研究 (2022)
  • 著者名/発表者名: 清水将裕、奥田綾、守島健、柚木康弘、井上倫太郎、佐藤信浩、裏出令子、杉山正明
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 小角散乱と超遠心分析を組み合わせた多分散溶液中の蛋白質構造解析法の開発 (2022)
  • 著者名/発表者名: 守島健、奥田綾、佐藤信浩、井上倫太郎、清水将裕、柚木康弘、裏出令子、杉山正明
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] 生物物理と計算科学の統合手法による時計タンパク質KaiABC複合体全長の溶液構造の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 柚木康弘、松本淳、守島健、マーテル アン、ポーカー リオネル、佐藤信浩、與語理那、富永大輝、井上倫太郎、矢木真穂、奥田綾、清水将裕、裏出令子、寺内一姫、河野秀俊、矢木宏和、加藤晃一、杉山正明
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] X線小角散乱法による酸化的フォールディング酵素ER-60の溶液構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 奥田綾、清水将裕、守島健、井上倫太郎、佐藤信浩、柚木康弘、裏出令子、杉山正明
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] ヌクレオソームとその関連タンパク質との相互作用 (2022)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソームDNAの配列依存的アンラッピングのFRET解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 角南智子、河野秀俊
  • 学会等名: 第22回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] JRR3で最先端の生体高分子の中性子溶液散乱を！ (2022)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 日本中性子科学会第22回年会
• [学会発表] 好熱性古細菌由来天然変性タンパク質の生理的温度における動的構造とダイナミクス (2022)
  • 著者名/発表者名: 小田隆、井上倫太郎、富永大輝、中川洋、守島健、岩瀬裕希、石野良純、佐藤衛、杉山正明
  • 学会等名: 日本中性子科学会第22回年会
• [学会発表] 超遠心分析と小角散乱の複合手法による時計タンパク質複合体の溶液構造解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 守島健、柚木康弘、清水将裕、奥田綾、井上倫太郎、佐藤信浩、矢木宏和、加藤晃一、杉山正明
  • 学会等名: 日本中性子科学会第22回年会
• [学会発表] 逆転コントラスト同調中性子小角散乱解析を目指したER-60の重水素化試料調製 (2022)
  • 著者名/発表者名: 奥田綾、井上倫太郎、守島健、柚木康弘、清水将裕、佐藤信浩、裏出令子、杉山正明
  • 学会等名: 日本中性子科学会第22回年会
• [学会発表] 高濃度環境下のα-クリスタリンのサブユニット交換 (2022)
  • 著者名/発表者名: 井上倫太郎、守島健、奥田綾、佐藤信浩、 杉山正明
  • 学会等名: 日本中性子科学会第22回年会
• [学会発表] Future Perspective of Biological Small-Angle Scattering (2022)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama M
  • 学会等名: Neutron Scattering on continuous sources - future developments, US-Japan workshop, Oak Ridge National Laboratory, USA
  • 国際学会
• [学会発表] SANS for soft matter (2022)
  • 著者名/発表者名: Inoue R, Sugiyama M
  • 学会等名: Neutron Scattering on continuous sources - future developments, US-Japan workshop, Oak Ridge National Laboratory, USA
  • 国際学会
• [学会発表] Integrated Method with Analytical Ultracentrifugation and Small-Angle Scattering (AUC-SAS) for the Structural Analysis of a Biomacromolecule in a Polydisperse Solution (2022)
  • 著者名/発表者名: Morishima K, Okuda A, Sato N, Shimizu M, Yunoki Y, Inoue R, Urade R, Sugiyama M
  • 学会等名: XVIII International Small-Angle Scattering Conference (SAS2022)
  • 国際学会
• [学会発表] Solution Structure Analysis of the Multi-domain Protein, ER-60 by Small Angle Scattering (2022)
  • 著者名/発表者名: Okuda A, Shimizu M, Morishima K, Inoue R, Sato N, Yunoki Y, Urade R, Sugiyama M
  • 学会等名: XVIII International Small-Angle Scattering Conference (SAS2022)
  • 国際学会
• [学会発表] Domain Conformation of Multi-domain Protein ER-60 Studied with Hybrid Approach of Coarse-grained Simulations and Small-angle X-ray Scattering (2022)
  • 著者名/発表者名: Shimizu M, Okuda A, Morishima K, Sato N, Inoue R, Yunoki Y, Urade R, Sugiyama M
  • 学会等名: XVIII International Small-Angle Scattering Conference (SAS2022)
  • 国際学会
• [学会発表] Dynamics and Structure of Intrinsically Disordered Region of Hef as Studied by Solution Scattering (2022)
  • 著者名/発表者名: Inoue R, Oda T, Nakagwa H, Tominaga T, Kawakita Y, Sato M, Sugiyama M
  • 学会等名: XVIII International Small-Angle Scattering Conference (SAS2022)
  • 国際学会
• [学会発表] 新しいクロマチン基盤ユニットであるH3-H4オクタソームのクライオ電子顕微鏡解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 野澤佳世、滝沢由政、七種和美、明石知子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] Internal Dynamics of Intrinsically Disordered Protein as Studied by Neutron Scattering (2022)
  • 著者名/発表者名: 井上倫太郎、小田隆、中川洋、富永大輝、川北至信、佐藤衛、杉山正明
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] 多分散溶液中の生体高分子の構造解析のための超遠心分析と小角散乱による統合アプローチ (2022)
  • 著者名/発表者名: 守島健、井上倫太郎、奥田綾、佐藤信浩、清水将裕、柚木康弘、裏出令子、杉山正明
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] Kai 時計システムにおける分子の統合運動 (2022)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明、守島健、柚木康弘、井上倫太郎、佐藤信浩、矢木宏和、加藤晃一
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] ヌクレオソームからH2A-H2B2量体が脱離する際の自由エネルギー局面解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: Ishida H, Kono H.
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] Study on photoactivated enzyme OaPAC by QM/MM molecular simulation (2022)
  • 著者名/発表者名: Taguchi M, Sakuraba S, Wai S. Chan, Kono H.
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] Building a Coarse-grained Model of Chromatin (2022)
  • 著者名/発表者名: Justin Chan, Hidetoshi Kono
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] FRET study of the sequence dependence of nucleosomal DNA unwrapping (2022)
  • 著者名/発表者名: Sunami T, Kono H.
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] Benchmark of force fields to characterize the short intrinsically disordered region of FUS-LC domain (2022)
  • 著者名/発表者名: Maud Chan-Yao-Chong, Justin Chan, Hidetoshi Kono
  • 学会等名: 第60回日本生物物理学会年会
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular insight into photoactivation mechanism of BLUF protein by QM/MM free energy simulation (2022)
  • 著者名/発表者名: Taguchi M, Sakuraba S, Wai S. Chan, Kono H.
  • 学会等名: The 5th International Forum on Quantum Metrology and Sensing
  • 国際学会
• [学会発表] 転写伸長におけるヌクレオソームの崩壊と再構築機構の構造生物学的解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
• [学会発表] ヌクレオソームにおけるヒストンN末端テールによる転写制御 (2022)
  • 著者名/発表者名: 大石匠美、畠澤卓、赤津綜隆、鯨井智也、林剛介、江原晴彦、関根俊一、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
• [学会発表] ヌクレオソームからのH2A-H2B脱離における重要なアミノ酸残基の特定 (2022)
  • 著者名/発表者名: 石田恒、河野秀俊
  • 学会等名: 第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
• [学会発表] Benchmark of force fields to characterize the intrinsically disordered region of FUS-LC domain (2022)
  • 著者名/発表者名: Chan-Yao-Chong Maud, Chan S. Wai, Kono H.
  • 学会等名: 量子生命科学会 第４回大会
• [学会発表] Building a Coarse-grained Model of Chromatin: Nucleosome-Nucleosome Interaction Patterns (2022)
  • 著者名/発表者名: Chan S. Wai, Kono H.
  • 学会等名: 量子生命科学会 第４回大会
• [学会発表] 転写開始点のヌクレオソームDNAアンラッピングのFRET解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 角南智子、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会 第４回大会
• [学会発表] 全原子分子動力学シミュレーションを用いた、ヒストンH2A-H2B のヌクレオソームからの脱離メカニズム解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 石田恒、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会 第４回大会
• [学会発表] QM/MM 分子シミュレーションによ る光活性化酵素 PAC の機能解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 田口真彦、櫻庭俊、ソオンチワ、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会 第４回大会
• [学会発表] 核内DNA収納体の構造形成崩壊の自由エネルギー地形解析 (2022)
  • 著者名/発表者名: 石田恒
  • 学会等名: 第9回「富岳」を中核とするHPCIシステム利用研究課題
• [学会発表] 溶液散乱と計算手法の統合解析によるシアノバクテリアの時計タンパク質KaiABC複合体の全体構造の解明 (2022)
  • 著者名/発表者名: 柚木康弘、松本淳、守島健、Martel A、Porcar L、佐藤信浩、與語 理那、富永大輝、井上倫太郎、矢木真穂、et al.
  • 学会等名: 第29回日本時間生物学会学術大会
• [学会発表] Structure and dynamics of nucleosomes, the fundamental structural unit of chromatin (2022)
  • 著者名/発表者名: Hidetoshi Kono、Jinzen Ikebe、Hisashi Ishida、Shun Sakuraba
  • 学会等名: Joint Meeting of the 20th KIAS Conference on Protein Structure and Function and The 7th Korean-Polish Conference on "Protein Folding: Theoretical and Experimental Approaches"
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural insights into the dynamics of the chromatin architecture (2022)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: The 30th Hot Spring Harbor International Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] クロマチン構造生物学の現状と将来 (2022)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: ２０２１年度中性子構造生物学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] リプログラミング因子によるクロマチン結合と構造変換 (2022)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第21回日本再生医療学会総会
  • 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソームDNA解離の配列依存性 (2021)
  • 著者名/発表者名: 角南智子、ルオディ、河野秀俊
  • 学会等名: 第21回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Integrative approach to structure of huge protein complex in Kai-clock protein system (2021)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama M.
  • 学会等名: MLZ symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 転写開始点に特徴的な塩基配列を有するヌクレオソームのFRET解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 角南智子、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会第3回大会
• [学会発表] Molecular dynamics simulation of displacement of H2A-H2B from nucleosome (2021)
  • 著者名/発表者名: 石田恒、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会第3回大会
• [学会発表] 計算と実験の協奏による生体高分子の作る溶液中での高次構造とそのダイナミクス解析の挑戦 (2021)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 第7回大型実験施設とスーパーコンピュータとの連携利用シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 散乱法を主とした統合的な手法による溶液中の生体高分子の構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 関東高分子若手会・ミニシンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] Disentangling the Effects of Histone Post-Translational Modifications on Nucleosome Packing and Chromatin Structure (2021)
  • 著者名/発表者名: Chan J., Kono H.
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Free energy profile of H2A-H2B dimer displacement from nucleosome (2021)
  • 著者名/発表者名: Ishida Hisashi, Kono Hidetoshi
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Catalytic enhancement of NSD2 following oncogenic mutations E1099K and T1150A is caused by increase in the auto-inhibitory loop dynamics (2021)
  • 著者名/発表者名: Kumar A., Sato K., Sakuraba S., Ogata K., Sengoku T., Kono H.
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Sequence dependence of nucleosomal DNA unwrapping (2021)
  • 著者名/発表者名: Sunami Tomoko, Kono Hidetoshi
  • 学会等名: 第59回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 三位一体（試料・測定・解析）の中性子溶液散乱で迫る生体高分子の溶液構造 (2021)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: CBI学会2021大会シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 第21回日本中性子科学会年会 (2021)
  • 著者名/発表者名: Kono Hidetoshi
  • 学会等名: Modeling Protein Complexes by Integrated Approach
  • 招待講演
• [学会発表] NSD2によるヌクレオソーム上H3 Lys36メチル化の構造基盤 (2021)
  • 著者名/発表者名: 仙石徹、佐藤光、クマールアマラジート、濱田恵輔、岡田千佳子、小國麻子、町山歩、櫻庭俊、西澤知宏、濡木理、河野秀俊、緒方一博
  • 学会等名: 第44回 日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] NSD2 によるヌクレオソーム上H3K36メチル化の構造基盤 (2021)
  • 著者名/発表者名: 仙石徹、佐藤光、クマールアマラジート、濱田恵輔、岡田千佳子、小國麻子、町山歩、櫻庭俊、西澤知宏、濡木理、河野秀俊、緒方一博
  • 学会等名: 第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
• [学会発表] ヌクレオソーム中のH2A-H2BテイルとDNAの動的相互作用 (2021)
  • 著者名/発表者名: 大友秀明、栗田順一、櫻庭俊、Zhenhai L.、有村泰宏、若森昌聡、津中康央、梅原崇史、胡桃坂仁志、河野秀俊、西村善文
  • 学会等名: 第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
• [学会発表] ヌクレオソームにおけるヒストンH2A-H2Bテイルの動的構造 (2021)
  • 著者名/発表者名: 大友秀明、栗田順一、櫻庭俊、Zhenhai, L.、有村泰宏、若森昌聡、津中康央、梅原崇史、胡桃坂仁志、河野秀俊、西村善文
  • 学会等名: 第44回 日本分子生物学会年会
• [学会発表] 小角散乱による溶液生体高分子構造解析への新たなる挑戦 (2021)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 小角散乱とナノ粒子製剤のCMC
  • 招待講演
• [学会発表] クロマチン構造における RNA ポリメラーゼ II による転写伸長機構 (2021)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 日本生化学会関東支部例会
  • 招待講演
• [学会発表] Structural studies for chromatin as a regulator of the genome function (2021)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: Vienna Biocenter general seminar series
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] クロマチン構造による遺伝子発現制御機構 (2021)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 日本生化学会 第94回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] Structural Studies of DNA Function in Nucleosomes (2021)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 招待講演
• [学会発表] 核内因子によるクロマチン転写制御機構の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第44回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] Structural basis for genome regulation by chromatin (2021)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: Pacifichem 2021
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Nucleosome contribution to epigenetic genome regulation (2021)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: Biophysical Society 65th Annual Meeting
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソームポテンシャルからクロマチンポテンシャル (2021)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊
  • 学会等名: 金沢大学異分野融合セミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Structural Studies for Nucleosome Core Particle Complexed with Its Binding Factors (2021)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka Hitoshi
  • 学会等名: RIKEN BDR Symposium
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソームによる自然免疫DNAセンサーcGASの不活性化機構 (2021)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、Christian Zierhut、滝沢由政、Ryan Kim、根岸瑠美、粉間信樹、平井誠也、船引宏則、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第38回染色体ワークショップ
• [学会発表] モノメチル化酵素SET8とヌクレオソーム複合体の構造解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 何承翰、滝沢由政、小林航、有村泰宏、木村宏、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第38回染色体ワークショップ
• [学会発表] ヒストンバリアントH2A.Bを含むヌクレオソームの 新規動態の解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 平野里奈、有村泰宏、鯨井智也、柴田幹大、奥田綾、守島健、井上倫太郎、杉山正明、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第38回染色体ワークショップ
• [学会発表] マウスのヒストンH3バリアントH3mm18を含むヌクレオソームの生化学的解析 (2021)
  • 著者名/発表者名: 平井誠也、小山昌子、武田泰子、小松哲郎、大川恭行、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第14回エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] パイオニア転写因子OCT4のヌクレオソームへの結合メカニズムの解明 (2021)
  • 著者名/発表者名: 越後谷健太、小山昌子、根岸瑠美、滝沢由政、水上優夏、島林秀伎、黒田明里、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第14回エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] エピジェネティクスの根幹を担うクロマチン機能構造の可視化 (2020)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第93回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] 中性子散乱データを活用した超分子のモデリング (2020)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊
  • 学会等名: CBI学会2020大会
  • 招待講演
• [学会発表] Observation of protein dynamics with solution scattering (2020)
  • 著者名/発表者名: Masaaki Sugiyama
  • 学会等名: 第58回日本生物物理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] システム内の分子動態を溶液散乱で探る ～DA-SANS からBC-SANS を目指して～ (2020)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 令和2年度BINS公開シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] クライオEM 単粒子解析によるクロマチンダイナミクスの理解 (2020)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 日本中性子科学会2020年会
  • 招待講演
• [学会発表] 相分離への計算科学的アプローチ (2020)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊
  • 学会等名: 第6回蛋白質工学研究会ワークショップ
  • 招待講演
• [学会発表] クロマチン構造による遺伝子発現のエピジェネティック制御 (2020)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] クロマチンダイナミクスの構造生物学的研究 (2020)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志
  • 学会等名: 第16回日本臨床プロテオゲノミクス研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Structural basis for an array of engrailed homeodomains toward the development of genome-editing enzymes (2020)
  • 著者名/発表者名: Sunami T, Hirano Y, Tamada T, Kono H,.
  • 学会等名: The 58th Annual Meeting of the Biophysics Society of Japan
• [学会発表] 光活性化アデニル酸シクラーゼの量子/古典ハイブリッド分子シミュレーション (2020)
  • 著者名/発表者名: 田口真彦、櫻庭俊、チャンワイソオン、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会 第２回大会
  • 国際学会
• [学会発表] 全原子分子動力学シミュレーションを用いた、ヌクレオソーム安定性に対するねじれストレス影響の解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 石田恒、河野秀俊
  • 学会等名: 量子生命科学会 第２回大会
  • 国際学会
• [学会発表] Understanding the Dinucleosome Structural Dynamics at All Atom Resolution (2020)
  • 著者名/発表者名: Kumar A, Matsumoto A, Kono H,
  • 学会等名: 量子生命科学会 第２回大会
  • 国際学会
• [学会発表] 核内因子ネットワークによる遺伝子制御機構 (2020)
  • 著者名/発表者名: 藤田理紗、山本達郎、江原晴彦、有村泰宏、鯨井智也、関根俊一、斉藤典子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第93回日本生化学会大会
• [学会発表] Structural analysis of highter-order chromatin containing CENP-A nucleosome (2020)
  • 著者名/発表者名: 滝沢由政、何承翰、立和名博昭、ウォルフ マティアス、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] パイオニア転写因子GATA3による標的ヌクレオソームへの結合メカニズム (2020)
  • 著者名/発表者名: 田中大貴、滝沢由政、高久誉大、熊川雄祐、WADE Paul A、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] パイオニア転写因子OCT4によるヌクレオソーム結合の生化学的解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 越後谷健太、小山昌子、根岸瑠美、滝沢由政、水上優夏、島林秀伎、黒田明里、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 転写因子p53はリンカーDNAとヒストンH3-H4を介してヌクレオソームと結合する (2020)
  • 著者名/発表者名: 西村正宏、有村泰宏、野澤佳世、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] DNA損傷認識タンパク質DDB2による新たなクロマチン動態制御機構の解明 (2020)
  • 著者名/発表者名: 松本翔太、CAVADINI Simone、BUNKER Richard D.、GRAND Rslph S.、山本淳平、SCHUEBELER Dirk、岩井成憲、菅澤薫、胡桃坂仁志、THOMAE Nicolas H.
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] cGAS-ヌクレオソーム複合体構造から明らかになったヌクレオソームによるcGAS不活性化のメカニズム (2020)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、ZIERHUT Christian、滝沢由政、KIM RYAN、根岸瑠美、粉間信樹、平井誠也、船引宏則、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第43回日本分子生物学会年会
• [学会発表] Challenges for the chromatin structure determination by cryo-EM. (2020)
  • 著者名/発表者名: Takizawa Y.
  • 学会等名: Cryo-Electron Microscopy Course at OIST
  • 招待講演
• [学会発表] Chromatin structure and dynamics as the platform for DNA repair. (2020)
  • 著者名/発表者名: Takizawa Y, Ho C-H, Kobayashi W, Ishii H, Arimura Y, Kurumizaka H
  • 学会等名: 4th DNA Repair/Replication Structures and Cancer Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural studies of chromatin: Toward understanding the regulation of genomic DNA. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka H.
  • 学会等名: Multiscale Modeling of Chromatin: Bridging Experiment with Theory.
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural studies of the chromatin: Towards the understanding of epigenetics (2019)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第13回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 招待講演
• [学会発表] 創薬の基盤となるエピジェネティクスの構造生物学 (2019)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第56回薬剤学懇談会研究討論会
  • 招待講演
• [学会発表] Cryo-EM imaging of the chromatin architecture (2019)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
  • 招待講演
• [学会発表] ヌクレオソームの崩壊と転写 (2019)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊、Luo D、石田恒
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
  • 招待講演
• [学会発表] Structural studies of chromatin towards the understanding of epigenetics mechanisms. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka H.
  • 学会等名: Telluride workshop
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Cryo-EM studies for nucleosome and chromatin (2019)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] Integrated approach of experimental data and computer modeling and simulation for understanding chromatin structure and dynamics. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kono H, Matsumoto A, Sakuraba S, Ishida H.
  • 学会等名: 第57回日本生物物理学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] モデリングとシミュレーションによる生体高分子の構造機能解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊
  • 学会等名: CBI学会2019年大会
  • 招待講演
• [学会発表] クライオ電子顕微鏡によるクロマチン構造基盤の解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 滝沢由政
  • 学会等名: CBI 学会 2019 年大会（Thermo Fisher スポンサーセッション）
  • 招待講演
• [学会発表] Integrative approach to complex structure and system. (2019)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama M.
  • 学会等名: 3rd Asia-Oceania Conference on Neutron Scattering
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural study of transcription on chromatin (2019)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、江原晴彦、藤野優佳、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第13回日本エピジェネティクス研究会年会
• [学会発表] クロマチンによる転写制御の構造生物学的解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、江原晴彦、藤野優佳、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
• [学会発表] クロマチン構造における転写反応の構造基盤の解明 (2019)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
• [学会発表] Biochemical and structural analyses of histone methyltransferase PR-Set7 (2019)
  • 著者名/発表者名: 何承翰、滝沢由政、小林航、石井初芽、平野里奈、有村泰宏、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
• [学会発表] パイオニア転写因子による標的ヌクレオソームの認識と作用 (2019)
  • 著者名/発表者名: 小山昌子、島林秀伎、滝沢由政、根岸留美、越後谷健太、水上優夏、黒田明里、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
• [学会発表] クロマチン高次構造によるヒストンの取り込み制御機構 (2019)
  • 著者名/発表者名: 立和名博昭、ダッシェ マリコ、前原一満、原田哲仁、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志、斉藤典子
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
• [学会発表] 転写因子p53によるヌクレオソーム中のDNA認識機構 (2019)
  • 著者名/発表者名: 西村正宏、有村泰宏、野澤佳世、滝沢由政、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第92回日本生化学会大会
• [学会発表] Structural transition of nucleosome during RNA polymerase II transcription revealed by cryo-EM. (2019)
  • 著者名/発表者名: Kujirai T, Ehara H, Fujino Y, Shirouzu M, Sekine SI, Kurumizaka H.
  • 学会等名: 第57回生物物理学会年会
• [学会発表] Structural and functional basis of the Mediator complex in the eukaryotic transcriptional system (2019)
  • 著者名/発表者名: 野澤佳世
  • 学会等名: 第57回生物物理学会年会
• [学会発表] セントロメア特異的CENP-Aヌクレオソームを含む高次クロマチンのクライオ電子顕微鏡構造解析 (2019)
  • 著者名/発表者名: 滝沢由政、何承翰、立和名博昭、Matthias Wolf、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] クロマチン転写制御において非コードRNAがヌクレオソームに及ぼす影響 (2019)
  • 著者名/発表者名: 藤田理紗、山本達郎、江原晴彦、有村泰宏、関根俊一、斉藤典子、胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] クロマチンの構造多様性による遺伝子発現制御 (2019)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志 (滝沢代理)
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 中性子散乱で探る溶液中の蛋白質の構造・ダイナミクス －in Cell SANSを目指して－ (2019)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 第42回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 溶液散乱法を用いた生体高分子の構造・ダイナミクスの研究 (2019)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 2018 年度 第2 回水和ナノ構造研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Sequence-Dependent Asymmetric Unwrapping of nucleosomes of yeast (2019)
  • 著者名/発表者名: Luo, D., Kato, D., Nogami, J., Ohkawa, Y., Kurumizaka, H., and Kono, H.
  • 学会等名: The 63rd Annual Meeting of the Biophysical Society
  • 国際学会
• [学会発表] クロマチン機能発現の構造基盤 (2019)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 染色体研究の最前線2019
  • 招待講演
• [学会発表] スーパーコンピュータで知るタンパク質、DNAの形と動き (2019)
  • 著者名/発表者名: 河野秀俊
  • 学会等名: パコンを知る集い in 岐阜「京」からポスト「京」へ
• [学会発表] 新世代中性子構造生物学が目指すサイエンス＋現状紹介 (2019)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 平成30年度構造生物学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Contribution of CENP-A into centromeric chromatin architecture (2018)
  • 著者名/発表者名: Kurumizaka H.
  • 学会等名: 2018 Centromere Gordon Conference
  • 招待講演
• [学会発表] 核酸―タンパク質相互作用制御 (2018)
  • 著者名/発表者名: 石田恒; 河野秀俊
  • 学会等名: ポスト「京」重点課題１ワークショップ
• [学会発表] エピジェネティック創薬の基盤となるクロマチン構造とダイナミクスに関する研究 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: PPF2018 第16回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] ree energy profiles of the intra- and inter-nucleosomal interactions by all-atom molecular dynamics simulations (2018)
  • 著者名/発表者名: Ishida, H. and Kono, H.
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Investigating the influence of Argine Dimethylation on Nucleosome Dynamics using All-atom Simulation and Kinetic Analysis (2018)
  • 著者名/発表者名: Li, Z. and Kono, H.
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Designing an artificial transcription factor with a small molecular weight based on engrailed homeodomain (2018)
  • 著者名/発表者名: Sunami, T. and Kono, H.
  • 学会等名: 第56回日本生物物理学会年会
• [学会発表] クロマチンによる遺伝子発現制御の構造基盤 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第91回日本生化学会大会
• [学会発表] 動的構造生物学によるクロマチン機能解析 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー 構造生物学と計算科学の融合による動的構造生物学の新しい展開
  • 招待講演
• [学会発表] Future Perspective of Laboratory-Based SAXS (2018)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: XVII International Small Angle Scattering Conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ゲノム機能を制御するクロマチンの動的構造変換 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 平成３０年度遺伝研研究会「クロマチン・細胞核の動的構造変換とゲノム機能制御」
• [学会発表] 再構成によるクロマチン高次構造の可視化 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第2回 定量生命科学研究所シンポジウム「生命を支える生体超分子の可視化と動態」
• [学会発表] Structural studies of genomic DNA regulation by chromatin (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 3R+3C:Replication, Recombination and Repair (3R) with special focus on Chromosome, Chromatin and Cell Cycle (3C)
  • 国際学会
• [学会発表] クロマチンに潜在する遺伝子制御能の構造基盤 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志
  • 学会等名: 第41回日本分子生物学会年会
• [学会発表] 中性子溶液散乱を基軸とした蛋白質の構造・ダイナミクス解析への挑戦 (2018)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 学会等名: 第18回日本中性子科学会年会
• [図書] 実験医学 増刊号Vol.40 No.12「セントラルドグマの新常識」 『転写・翻訳の驚きの新機構と再定義されるDNA・RNA・タンパク質の世界』第2章「転写の新常識」1.「クロマチンにおける転写機構の新たな知見」 (2022)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、胡桃坂仁志
  • 総ページ数: 264
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 9784758104043
• [図書] 生体の化学 vol.71 No.4「ヌクレオソームによるクロマチンの構造多様性」 (2020)
  • 著者名/発表者名: 藤田理紗、胡桃坂仁志
  • 総ページ数: 96
  • 出版者: 公益財団法人金原一郎記念医学医療振興財団/医学書院
• [図書] 月刊細胞 5月号 遺伝子制御の基盤となる細胞核・クロマチン構造 「転写におけるクロマチン構造研究」 (2020)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、胡桃坂仁志
  • 総ページ数: 60
  • 出版者: ニューサイエンス社
• [図書] 相分離生物学の全貌（現代化学増刊46) 第V部 60.溶液散乱法Ⅰ：静的構造解析 (2020)
  • 著者名/発表者名: 杉山正明
  • 総ページ数: 400
  • 出版者: 東京化学同人
  • ISBN: 9784807913466
• [図書] イメージング時代の構造生命科学 (2020)
  • 著者名/発表者名: 鯨井智也、滝沢由政、胡桃坂仁志/著 田中 啓二、若槻 壮市/編
  • 総ページ数: 248
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 9784758103855
• [図書] 日本の科学者「遺伝子の働きを制御するヒストン」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 小山昌子、胡桃坂仁志
  • 総ページ数: 64
  • 出版者: 本の泉社
• [図書] あなたのタンパク質精製、大丈夫ですか？ (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂 仁志、有村 泰宏
  • 総ページ数: 186
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 9784758122382
• [図書] 教科書を書き換えろ！染色体の新常識 (2018)
  • 著者名/発表者名: 平野 達也、胡桃坂 仁志
  • 総ページ数: 214
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 9784758103749
• [図書] 医学のあゆみ Vol.267, No.13「クロマチンによるエピジェネティックな転写制御」 (2018)
  • 著者名/発表者名: 胡桃坂仁志、鯨井智也
  • 総ページ数: 267
  • 出版者: 医歯薬出版
• [備考] 東京大学 定量生命科学研究所 胡桃坂仁志研究室
  • URL: https://www.iqb.u-tokyo.ac.jp/kurumizakalab/
• [備考] 京都大学 複合原子力科学研究所 粒子線物性学研究室
  • URL: https://www.rri.kyoto-u.ac.jp/PSlab/