生体分子および溶媒の構造揺らぎと共役した機能発現過程の理論的解明

• 研究領域: 揺らぎが機能を決める生命分子の科学
• 研究課題/領域番号: 20107008
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系
• 研究機関: 立命館大学 (2012); 分子科学研究所 (2008-2011)
• 研究代表者: 平田 文男 立命館大学, 生命科学部, 教授 (90218785)
• 研究分担者: 吉田 紀生 九州大学, 理学(系)研究科(院), 准教授 (10390650)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 72,020千円 (直接経費: 55,400千円、間接経費: 16,620千円); 2012年度: 16,510千円 (直接経費: 12,700千円、間接経費: 3,810千円); 2011年度: 15,080千円 (直接経費: 11,600千円、間接経費: 3,480千円); 2010年度: 15,990千円 (直接経費: 12,300千円、間接経費: 3,690千円); 2009年度: 14,560千円 (直接経費: 11,200千円、間接経費: 3,360千円); 2008年度: 9,880千円 (直接経費: 7,600千円、間接経費: 2,280千円)
• キーワード: 3D-RISM/RISM / 蛋白質構造揺らき / 分子認識 / 自由エネルギー / 一般化ランジェヴァン理論 / 分散・共分散行列 / 知的創薬 / 化合物スクリーニンク / 蛋白質構造揺らぎ / 化合物スクリーニング / 3D-RISM / タンパク質の揺らぎ / ダイナミクス / 創薬 / アスピリン / Phospholipase A2 / 蛋白質の揺らぎ / 自由エネルギー計算 / 構造揺らぎ / 3D-RISM理論 / オーダーパラメタ / 熱力学積分法 / 薬剤設計 / 蛋白質 / 鳥インフルエンザウイルス / M2チャネル / プロトン透過 / 生体機能 / 揺らぎ

研究概要

本研究では蛋白質の構造揺らぎと共役した分子認識過程を記述する理論を構築することを目的して、以下に列記する4つのサブ課題に関して研究を遂行し、当初の研究計画を成功裏に達成した。
1.分子認識の統計力学理論(平衡論)の構築、
2.分子認識の統計力学理論(平衡論)の「知的創薬」への応用、
3. 3D-RISM/RISM 理論と分子動力学シミュレーションの結合による自由エネルギー曲面上での蛋白質構造ダイナミクス理論の構築。
4. 3D-RISM/RISM理論と一般化ランジェヴァン理論の結合に基づく、「蛋白質構造揺らぎ」理論の提案。

研究成果

• [雑誌論文] (2012)
  • 著者名/発表者名: Bongsoo Kim and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 138
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2012)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, Yutaka; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Chem. Theory Comput 巻: 8 ページ: 3015-3021
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2012)
  • 著者名/発表者名: Hong, Jooyeon; Yoshida, Norio; Chong, Song-Ho; Lee, Chewook; Ham, Sihyun; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Chem. Theory Comput 巻: 8 ページ: 2239-2246
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2012)
  • 著者名/発表者名: Sindhikara, Daniel; Yoshida, Norio; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Comp. Chem 巻: 33 ページ: 1536-1543
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modified Anderson Method for Acceleating 3D-RISM Calculations Using Graphics Processor Unit (2012)
  • 著者名/発表者名: Maruyama, Yutaka; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Chem. Theory Comput 巻: 8 号: 9 ページ: 3015-3015
  • DOI: 10.1021/ct300355r
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural fluctuation of protein in water around its native state: A new statistical mechanics formulation (2012)
  • 著者名/発表者名: Bongsoo Kim and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J J. Chem. Phys 巻: 138 号: 5 ページ: 541-541
  • DOI: 10.1063/1.4776655
  • 査読あり
• [雑誌論文] Placevent : An Algorithm for Predicting of Explicit Solvent Atom Distribution - Application to HIV-1 Protease and F-ATP Synthase (2012)
  • 著者名/発表者名: Sindhikara, Daniel; Yoshida, Norio; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Comp. Chem 巻: 33 号: 18 ページ: 1536-1536
  • DOI: 10.1002/jcc.22984
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidating the Molecular Origin of Hydrolysis Energy of Pyrophosphate in Water (2012)
  • 著者名/発表者名: Hong, Jooyeon; Yoshida, Norio; Chong, Song-Ho; Lee, Chewook; Ham, Sihyun; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Chem. Theory Comput 巻: 8 号: 7 ページ: 2239-2239
  • DOI: 10.1021/ct300099e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvent Effects on Electronic Structures of Coumarin 153 : Parallel Studies by Means of Spectroscopy and RISM-SCF Calculations (2012)
  • 著者名/発表者名: Katsura Nishiyama, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of the Physical Society of Japan 巻: (掲載確定)(未定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Kiyota, N. Yoshida, and F. Hirata
  • 雑誌名: J. Chem. Theor. Comp 巻: 7 ページ: 3803-3815
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Danniel J. Sindhikara, Norio Yoshida, Mikio Kataoka, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Mol. Liq 巻: 164 ページ: 120-122
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Imai, Takashi; Miyashita, Naoyuki; Sugita, Yuji; Kovalenko, Andriy; Hirata, Fumio; Kidera, Akinori
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 115 ページ: 8288-8295
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Miyata, Yasuhiro Ikuta, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 134 ページ: 44127-44144
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Maruyama, Taku Matsushita, Ryuichi Ueoka, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 115 ページ: 2408-2416
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvent penetration in photoactive yellow protein R52Q mutant : a theoretical study (2011)
  • 著者名/発表者名: Daniel, J.Sindhikara
  • 雑誌名: J.Mol.Liq. 巻: 164 号: 1-2 ページ: 120-122
  • DOI: 10.1016/j.molliq.2011.04.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reply to "Comment on 'Molecular Selectivity in Aquaporin Channels Studied by the 3D-RISM Theory" (2011)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphanphanee, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 巻: 115 号: 25 ページ: 8367-8369
  • DOI: 10.1021/jp203661z
  • 査読あり
• [雑誌論文] A new approach for investigating the molecular recognition of protein : Toward structure-based drug-design based on the 3D-RISM theory (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuomi Kiyota, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of Chemical Theory and Computation 巻: 7 号: 11 ページ: 3803-3815
  • DOI: 10.1021/ct200358h
  • 査読あり
• [雑誌論文] The electronic-structure theory of a large-molecular system in solution : Application to the intercalation of proflavine with solvated DNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Mole.Liq. 巻: 159 号: 1 ページ: 83-92
  • DOI: 10.1016/j.molliq.2010.04.019
  • 査読あり
• [雑誌論文] Affinity of Small Ligands to Myoglobin Studied by the 3D-RISM Theory (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuomi Kiyota, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Mole.Liq. 巻: 159 号: 1 ページ: 93-98
  • DOI: 10.1016/j.molliq.2010.07.016
  • 査読あり
• [雑誌論文] Statistical Mechanics Theory of Molecular Recognition and Pharmaceutical Design (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Saree Phongphanphanee, Yutaka Maruyama, Takashi Imai, Fumio Hirata
  • 雑誌名: International Review in Physical Chemistry 巻: 30 号: 4 ページ: 445-478
  • DOI: 10.1007/s12539-011-0104-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvent and Salt Effects on Structural Stability of Human Telomere (2011)
  • 著者名/発表者名: Y. Maruyama, T. Matsushita, R. Ueoka, F. Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 115 号: 10 ページ: 2408-2416
  • DOI: 10.1021/jp1096019
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free energy calculation using molecular dynamics simulation combined with three dimensional reference interaction site model (3D-RISM) theory.II.Thermodynamic integration along reaction coordinates (2011)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Miyata, Yasuhiro Ikuta, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Chem.Phys. 巻: 134 号: 4 ページ: 44127-44144
  • DOI: 10.1063/1.3532078
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functionality Mapping on Internal Surfaces of Multidrug Transporter AcrB Based on Molecular Theory of Solvation : Implications for Drug Efflux Pathway (2011)
  • 著者名/発表者名: Takashi Imai, Naoyuki Miyashita, Yuji Sugita, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata, Akinori Kidera
  • 雑誌名: J.Phys.Chem.B 巻: 115 号: 25 ページ: 8288-8295
  • DOI: 10.1021/jp2015758
  • 査読あり
• [雑誌論文] 分子認識の統計力学と生体機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生、丸山豊、Saree Phongphanphanee、清田泰臣、平田文男
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 51 ページ: 222-225
  • NAID: 10029482473
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Recognition Explored by a Statistical-Mechanics Theory of Liquids (2011)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphanphanee, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Current Pharmaceutical Design 巻: 17 号: 17 ページ: 1740-1757
  • DOI: 10.2174/138161211796355100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Affinity of Small Ligands to Myoglobin Studied by the 3D-RISM Theory (2011)
  • 著者名/発表者名: Yasuomi Kiyota, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of Molecular Liquids 巻: Vol.159 ページ: 93-98
  • 査読あり
• [雑誌論文] The electronic-structure theory of a large-molecular system in solution : Application to the intercalation of proflavine with solvated DNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of Molecular Liquids 巻: Vol.159 ページ: 83-92
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvent and Salt Effects on Structural Stability of Human Telomere (2011)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Maruyama, Taku Matsushita, Ryuichi Ueoka, Fumio Hirata
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: Vol.115 ページ: 2408-2416
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free energy calculation using molecular dynamics simulation combined with the three dimensional reference interaction site model theory. II. Thermodynamic integration along a spatial reaction coordinate (2011)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Miyata, Yasuhiro Ikuta, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: Vol.134
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Miyata, Yasuhiro Ikuta, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 113 ページ: 44114-44114
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2010)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphonphanee, Thanyada Rungromongkol, Norio Yoshida, Supot Hannongbua, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 巻: 132 ページ: 9782-9788
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2010)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphonphanee, Norio Yoshida, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 114 ページ: 7967-7967
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2010)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Maruyama, Norio Yoshida, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 114 ページ: 6464-6471
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free energy calculation using molecular dynamics simulation combined with three dimensional reference interaction site model (3D-RISM) theory.I.Free energy perturbation and thermodynamic integration along coupling parameter (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Miyata, Yasuhiro Ikuta, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Chem.Phys. 113 ページ: 44114-44129
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proton Transport through the Influenza A M2 Channel : 3D-RISM Study (2010)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphonphanee, Thanyada Rungromongkol, Norio Yoshida, Supot Hannongbua, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc. 132 ページ: 9782-9788
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free energy calculation using molecular dynamics simulation combined with the three dimensional reference interaction site model theory. I. Free energy perturbation and thermodynamic integration along a coupling parameter (2010)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Miyata, Yasuhiro Ikuta, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 巻: Vol.133
  • 査読あり
• [雑誌論文] Proton transport through the Influenza A M2 channel : 3D-RISM Study (2010)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphanphanee, Thanyada Rungrotmongkol, Norio Yoshida, Supot Hannongbua, Fumio Hirata
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 巻: Vol.132 ページ: 9782-9788
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Selectivity in Aquaporin Channels Studied by the 3D-RISM Theory (2010)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphanphanee, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: Vol.114 ページ: 7967-7973
  • 査読あり
• [雑誌論文] Revisiting the Salt-Induced Conformational Change of DNA with 3D-RISM Theory (2010)
  • 著者名/発表者名: Yutaka Maruyama, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: Vol.114 ページ: 6464-6471
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: Yui, Toshifumi; Shiiba, Hirohide; Tsutsumi, Yuya; Hayashi, Sachio; Miyata, Tatsuhiko; Hirata, Fumio
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 114 ページ: 49-58
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: Takashi Imai, Koji Oda, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata, and Akinori Kidera
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 巻: 131 ページ: 12430-12440
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: Takashi Imai, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata, and Akinori Kidera
  • 雑誌名: Interdiscip. Sci. Comput. Life Sic 巻: 1 ページ: 156-160
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasuomi Kiyota, Ryusuke Hiraoka, Norio Yoshida, Yutaka Maruyama, Takashi Imai, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc 巻: 131 ページ: 3852-3853
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Takashi Imai, Saree Phongphanphanee, Andriy Kovalenko, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 113 ページ: 873-886
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2009)
  • 著者名/発表者名: Katusra Nishiyama, Tsuyoshi Yamaguchi, and Fumio Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B 巻: 113 ページ: 2800-2804
  • 査読あり
• [雑誌論文] Theoretical Study of CO escaping pathway in Myoglobin with the 3D-RISM Theory (2009)
  • 著者名/発表者名: Yasuomi Kiyota, Ryusuke Hiraoka, Norio Yoshida, Yutaka Maruyama, Takashi Imai, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc. 131 ページ: 3852-3853
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Recognition in Biomolecules Studied by Statistical-Mechanical Integral- Equation Theory of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Takashi Imai, Saree Phongphanphanee, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Phys.Chem.(Feature article) 113 ページ: 873-886
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Thermodynamics of Trifluoroethanol-Induced Helix Formation : Analysis of the Solvation Structure and Free Energy by the 3D-RISM Theory (2009)
  • 著者名/発表者名: Takashi Imai, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata, Akinori Kidera
  • 雑誌名: Interdisciplinary Sciences : Computational Life Sciences 1 ページ: 156-160
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ligand Mapping on Protein Surfaces by the 3D-RISM Theory ; Toward Computational Fragment-Based Drug Design (2009)
  • 著者名/発表者名: Takashi Imai, Koji Oda, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata, Akinori Kidera
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 131 ページ: 12430-12440
  • 査読あり
• [雑誌論文] Theoretical study of CO escaping pathway in Myoglobin with 3D-RISM Theory (2009)
  • 著者名/発表者名: Y. Kiyota, R. Hiraoka, N. Yoshida, Y. Maruyama, T. Imai, F. Hirata
  • 雑誌名: Journal of the American Chemical Society 131 ページ: 3852-3853
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular Recognition in Biomolecules Studied by Statistical-Mechanical Integral-Equation Theory of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Yoshida, T. Imai, S. Phongphanphanee, A. Kovalenko, F. Hirata
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 113 ページ: 873-886
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solvation Dynamics in Polar Solvents Studied by Means of RISM / Mode-Coupling Theory (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Nishiyama, T. Yamaguchi, F. Hirata
  • 雑誌名: Journal of Physical Chemistry B 113 ページ: 2800-2804
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2008)
  • 著者名/発表者名: Yoshiteru Yonetani, Yutaka Maruyama, Fumio Hirata, and Hidetoshi Kono
  • 雑誌名: J. Chem. Phys 巻: 128
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Ikuta, S. Karita, Y. Kitago, N. Watanabe, and F. Hirata
  • 雑誌名: Chem. Phys. Lett 巻: 465 ページ: 279-284
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2008)
  • 著者名/発表者名: N. Yoshida, T. Ishida, and F. Hirata
  • 雑誌名: J. Phys. Chem 巻: 112 ページ: 433-440
  • 査読あり
• [雑誌論文] On the proton exclusion of aquaporins : A statistical mechanics study (2008)
  • 著者名/発表者名: Saree Phongphonphanee, Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 雑誌名: J.Am.Chem.Soc. 130 ページ: 1540-1541
  • 査読あり
• [雑誌論文] An intergral equation theory for inhomogeneous molecular fluids : The reference interaction site model approach (2008)
  • 著者名/発表者名: R. Ishizuka, S.-H. Chong, F. Hirata
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 128 ページ: 34504-34513
  • 査読あり
• [雑誌論文] Detecting Reaction Intermediate in Enzymatic Reaction of Ce144A, GH family 44 endoalucanase with 3D-RISM Theory (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Ikuta, S. Karita, Y. Kitago, N. Watanabe, F. Hirata
  • 雑誌名: Chemical Physics Letters 465 ページ: 279-284
  • 査読あり
• [雑誌論文] An attempt toward the generalized Langevin dynamics simulation (2008)
  • 著者名/発表者名: B. Kim, S-H. Chong, R. Ishizuka, F. Hirata
  • 雑誌名: Condensed Matter Physics 11 ページ: 179-190
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comparison of DNA hydration patterns obtained using two distinct computational methods, molecular dynamics simulation and three-dimensional reference interaction site model theory (2008)
  • 著者名/発表者名: Y. Yonetani, Y. Maruyama, F. Hirata, H. Kono
  • 雑誌名: Journal of Chemical Physics 128
  • 査読あり
• [学会発表] 3D-RISM/RISM Theory: Present and Future (2013)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 2013 Workshop on 3D-RISM/RISM: Present and Future
  • 発表場所: 立命館大学BKCエポック立命21、滋賀県
  • 年月日: 2013-03-26
  • 招待講演
• [学会発表] Protein, Fluctuation, Molecular Recognition, and Water (2013)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: International Symposium on Protein Folding and its Biological Significance,
  • 発表場所: 岡崎市、岡崎コンファレンスセンター、愛知県
  • 年月日: 2013-03-06
  • 招待講演
• [学会発表] Structural Fluctuation of Proetin in Water around Its Native State: A New Statistical Mechanics Formulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Fifth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences - Experiments and Simulations
  • 発表場所: Gohan, Korea
  • 年月日: 2013-02-26
• [学会発表] 水は生命の神様である (2013)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: シンポジウム「生命進化と水」
  • 発表場所: 立命館大学BKCエポック立命21、滋賀県草津市
  • 年月日: 2013-01-28
  • 招待講演
• [学会発表] Ligand Binding by Protein Probed with the 3D-RISM Microscope (2013)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 「次世代の物質科学・ナノサイエンスを探る」研究会
  • 発表場所: 北海道大学百年記念会館、北海道
  • 年月日: 2013-01-11
• [学会発表] Ligand Binding by Protein Probed with the 3D-RISM Microscope (2013)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 次世代の物質科学・ナノサイエンスを探る
  • 発表場所: 北海道大学百年記念会館、北海道
  • 年月日: 2013-01-11
  • 招待講演
• [学会発表] The molecular mechanism of the pressure denaturation of protein clarified by the 3D-RISM theory (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 7th International Conference on High Pressure Bioscience and Biotechnology
  • 発表場所: ピアザ淡海、滋賀県
  • 年月日: 2012-10-29
  • 招待講演
• [学会発表] Exploring life phenomena with a theory featuring chemical 'specificity' and physical 'universality' (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: "Israel -Japan Joint Symposium on Biophysics: Protein Dynamics: From single molecules to whole cell" in Biophysics Society meeting in Japan
  • 発表場所: 兵庫県立大学(兵庫県)
  • 年月日: 2012-09-16
• [学会発表] Ligand Binding by Protein Probed with the 3D-RISM Microscope (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: The ACS Symposium on "Continuum Solvation Modeling in Biological Systems
  • 発表場所: Philadelphia, USA
  • 年月日: 2012-08-20
• [学会発表] Ligand Binding by Protein Probed with 3D-RISM Microscope (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Foundation of Molecular Modeling and Simulation(FOMMS)
  • 発表場所: Mt. Hood, Oregon, USA
  • 年月日: 2012-07-25
• [学会発表] Ligand Binding by Protein Probed with 3D-RISM Microscop (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Foundation of Molecular Modeling and Simulation(FOMMS)
  • 発表場所: Mt. Hood, USA
  • 年月日: 2012-07-25
  • 招待講演
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Theory Featuring Chemical Specificity and Physical Universality (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: International Conference on Pure and Applied Chemistry: The key for our Future
  • 発表場所: Flic-en-Flac, Mauritius
  • 年月日: 2012-07-04
• [学会発表] 分子認識の統計力学(3D-RISM/RISM)と構造生物学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 第12回蛋白質科学シンポジウム「YouTube 時代の構造生物学」
  • 発表場所: 名古屋国際会議場(愛知県)
  • 年月日: 2012-06-22
• [学会発表] 分子認識の統計力学（3D-RISM/RISM）と構造生物学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 第１２回蛋白質科学シンポジウム「YouTube時代の構造生物学」
  • 発表場所: 名古屋国際会議場、愛知県
  • 年月日: 2012-06-22
  • 招待講演
• [学会発表] Theory of Molecular Recognition and Its Application to Pharmaceutical Design (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 12^<th> Eurasia Conference on Chemical Sciences EuAsC2S-12
  • 発表場所: Corfu, Greece
  • 年月日: 2012-04-20
• [学会発表] Theory of Molecular Recognition and Its Application to Pharmaceutical Design (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 12th Eurasia Conference on Chemical Sciences EuAsC2S-12
  • 発表場所: Corfu, Greece
  • 年月日: 2012-04-20
  • 招待講演
• [学会発表] 酵素反応解析へ向けた、3D-RISM理論による分子認識解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: 文部科学省「革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ(HPCI)の構築」次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第6回公開シンポジウム
  • 発表場所: ニチイ学館,神戸市(兵庫県)
  • 年月日: 2012-03-06
• [学会発表] バイオマス利用に向けた酵素反応解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: 第2回CMSI研究会
  • 発表場所: 東北大学金属材料研究所,仙台市(宮城県)
  • 年月日: 2012-01-31
• [学会発表] RISM理論による生体分子の分子認識と化学反応へ向けた研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: スーパーコンピュータワークショップ2012
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター,岡崎市(愛知県)
  • 年月日: 2012-01-25
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Asian Core symposium on "The 4^<th> Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences: Experiment and Simulation
  • 発表場所: 国際会議場(奈良県)
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: The 71^<st> Okazaki International Conference: New perspectives on molecular science of glycoconjugate
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution (2012)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Asian Core symposium on "The 4^<th> Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences : Experiment and Simulation,"
  • 発表場所: Nara, Nara
• [学会発表] 液体の積分方程式理論に基づく溶液内生体分子の電子状態理論 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: 液体・溶液の微視的構造からダイナミクスまで～最近の研究結果から見えてくるもの～
  • 発表場所: 愛媛大学,松山市(愛媛県)
  • 年月日: 2011-11-28
• [学会発表] 液体の積分方程式理論を用いた溶液内化学過程に関する研究 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: 第34回溶液化学シンポジウム
  • 発表場所: 名古屋大学,名古屋市(愛知県)
  • 年月日: 2011-11-16
• [学会発表] QM/MM/3D-RISM理論の開発とプログラムの高速化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: 第3回HPCI戦略プログラム合同研究交流会
  • 発表場所: 計算科学研究機構,神戸市(兵庫県)
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] Solvent Effects on Electronic Structures of Coumarin 153 : RISM-SCF Analysis (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生, 西山桂, 平田文男
  • 学会等名: 分子科学討論会2011
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター,札幌市(北海道)
  • 年月日: 2011-09-20
• [学会発表] Molecular Ornstein-Zernike self-consistent-field approach to hydrated electron (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida
  • 学会等名: 8th Liquid Matter Conference
  • 発表場所: University of Vienna, Vienna, Austria
  • 年月日: 2011-09-06
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 32th International Conference on Solution Chemistry
  • 発表場所: La Grande Motte, France
  • 年月日: 2011-08-28
• [学会発表] 3D-RISMプログラムの開発と応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生、清田泰臣、Daniel J.Sindhikara、平田文男
  • 学会等名: 計算物質科学イニシアティブ・計算分子科学研究拠点第2回研究会
  • 発表場所: 計算科学研究機構,神戸市(兵庫県)
  • 年月日: 2011-08-11
• [学会発表] 液体の統計力学と量子力学に基づくATP加水分解の自由エネルギー解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 学会等名: 「水を主役としたATPエネルギー変換」後期第一回研究会議
  • 発表場所: 大阪ガーデンパレス,大阪市(大阪府)
  • 年月日: 2011-08-11
• [学会発表] Statistical Mechanics Theory of Molecular Recognition and its Application to Pharmaceutical Design (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Telluride Wrokshop on Free Energy Simulation
  • 発表場所: Telluride, Colorado, USA
  • 年月日: 2011-07-03
• [学会発表] Collaboration between computer and computational scientists make high performance computing on the K-computer a reality (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: ISC'11 HPC in Asia Workshop
  • 発表場所: Hamburg, Germany
  • 年月日: 2011-06-18
• [学会発表] Exploring life phenomena with a theory featuring chemical 'specificity' and physical 'universality' (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Statistical Mechanics Approaches to Biomolecular Applications
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2011-06-13
• [学会発表] Development of the QM/MM/RISM theory : Application to the intercalation of proflavine with solvated DNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida
  • 学会等名: Statistical Mechanics Approaches to Nano/Bio-Sciences
  • 発表場所: Sookmyung Women's University, Soeul, Korea
  • 年月日: 2011-06-13
• [学会発表] Theory of Molecular Recognition and its Application to Drug Design (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: International Conference on Computer Science (ICCS) 2011
  • 発表場所: Singapore
  • 年月日: 2011-06-02
• [学会発表] Molecular Ornstein-Zernike self-consistent-field approach to hydrated electron (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida
  • 学会等名: International Congress on Computational Science 2011
  • 発表場所: Nanyang Technological University, Singapore
  • 年月日: 2011-06-02
• [学会発表] Statistical Mechanics of Molecular Liquids Reveals Elementary Processes in Life Phenomena (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Third Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences-Experiments and Simulations
  • 発表場所: Lotte hotel, Jeju, Korea
  • 年月日: 2011-02-27
• [学会発表] 分子認識の統計力学と生体機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 自然科学研究機構岡崎統合バイオサイエンスセンター「10周年記念シンポジウム」
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • 年月日: 2011-02-12
• [学会発表] Statistical Mechanics of Molecular Liquids Reveals Elementary Processes in Life Phenomena (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Third Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: - Experiments and Simulations
  • 発表場所: Jeju, Korea
• [学会発表] Theory of Molecular Recognition and its Application to Drug Design (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: ICCS2011
  • 発表場所: Singapore
• [学会発表] Statistical Mechanics Theory of Molecular Recognition and its Applic ation to Pharmaceutical Design (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Telluride Wrokshop on Free Energy Simulation
  • 発表場所: Telluride, USA
• [学会発表] 高速3D-RISMの開発について (2011)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: CMSI・計算分子科学研究拠点、第2回研究会
  • 発表場所: 神戸市(兵庫県)
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution," "32th International Conference on Solution Chemistry (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 32th International Conference on Solution Chemistry
  • 発表場所: La Grande Motte, France
• [学会発表] Exploring life phenomena with a theory featuring chemical 'specificity' and physical 'universality' (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Israel-Japan Joint Symposium on Biophysics : Protein Dynamics : From single molecules to whole cell in Biophysics Society meeting in Japan
  • 発表場所: Himeji, Hyogo
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution (2011)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: The 71^<st> Okazaki International Conference : New perspectives on molecular science of glycoconjugate
  • 発表場所: Okazaki, Aichi
• [学会発表] Exploring life phenomena with a Statistical Mechanics of Molecular Solution (2011)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 液体溶液の微視的構造からダイナミクスまで～最近の研究結果から見えてくるもの
  • 発表場所: 松山市(愛媛県)
• [学会発表] Solvent Effects on Electronic Structures of Coumarin 153.I.RISM-SCF Analysis of the Solvent Distribution and Electronic Properties (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Katsura Nishiyama, Fumio Hirata
  • 学会等名: EMLG/JMLG Annual Meeting 2011
  • 発表場所: University of Warsaw, Warsaw, Poland
• [学会発表] Electronic structure theory of biomolecule in solution (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Fumio Hirata
  • 学会等名: Ninth Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists
  • 発表場所: University of Santiago, Santiago de compostela, Spain
• [学会発表] Ligand binding and escaping pathway in myoglobin studied by the 3D-RISM theory (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Dynamics and Mechanisms of Photochemical Reactions of Biological Proteins, Pacifichem 2010
  • 発表場所: Honolulu, Hawaii, USA
  • 年月日: 2010-12-15
• [学会発表] Molecular Recognition in Biological Functions Revealed by Statistical mechanics of Molecular Liquids (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 4th International symposium on "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • 発表場所: ピアザ淡海(滋賀県)
  • 年月日: 2010-12-01
• [学会発表] Molecular Recognition in Biological Functions Revealed by Statistical mechanics of Molecular Liquids (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 4th International symposium on "Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • 発表場所: ピアザ淡海、滋賀
  • 年月日: 2010-12-01
• [学会発表] Statistical Mechanics of Molecular Liquids Reveals Elementary Processes in Life Phenomena (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: The Overseas Sokendai Lecture in Bankok : The Inaugural CU-IMS Joint Symposium
  • 発表場所: Bankok, Thailand
  • 年月日: 2010-10-20
• [学会発表] Statistical Mechanics of Molecular Liquids Reveals Elementary Processes in Life Phenomena (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: EMLG-JMLG joint meeting 2010
  • 発表場所: Ivan Franko National University, Lviv, Ukraine
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Statistical Mechanics of Molecular Liquids Reveals Elementary Processes in Life Phenomena (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: EMLG-JMLG joint meeting 2010
  • 発表場所: Lviv, Ukraine
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] On the origin of energy produced by the hydrolysis reaction of ATP:3D-RISM-SCF study (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: ICPOC-20: 20th International Conference on Physical Organic Chemistry
  • 発表場所: Busan, Republic of Korea
  • 年月日: 2010-08-25
• [学会発表] On the origin of energy produced by the hydrolysis reaction of ATP : 3D-RISM-SCF study (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: ICPOC-20 : 20th International Conference on Physical Organic Chemistry
  • 発表場所: Busan, Republic of Korea
  • 年月日: 2010-08-22
• [学会発表] RISM-SCF理論の開発と発展～RISM-SCF理論誕生秘話～ (2010)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 加藤重樹教授記念シンポジウム「化学反応のポテンシャル曲面とダイナミックス」
  • 発表場所: 京都大学 理学研究科セミナーハウス、京都布
  • 年月日: 2010-06-19
• [学会発表] ナノ分野における「グランドチャレンジ」課題への挑戦と計算科学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 第一回「学際計算科学による新たな知の発見・統合・創出」シンポジウム
  • 発表場所: 筑波大学計算科学研究センター、つくば市
  • 年月日: 2010-05-06
• [学会発表] Ligand binding and escaping pathway in myoglobin studied by the 3D-RISM theory (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Dynamics and Mechanisms of Photochemical Reactions of Biological Proteins, Pacifichem 2010
  • 発表場所: Honolulu, USA
• [学会発表] Statistical Mechanics of Molecular Liquids Revelas Elementary Processes in Life Phenomena (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: EMLG/JMLG Annual Meeting "Complex Liquids "
  • 発表場所: Lviv, Ukraine(招待講演)
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2010)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: EMLG/JMLG Annual Meeting "Intermolecular Interactions and Liquid Structure, "
  • 発表場所: Salzburg(招待講演)
• [学会発表] A Statistical Mechanics Study of Molecular Recognition and Drug Design (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 2^<nd> Japan-Korea Seminar on Biomolecular Science - Experiments and Simulations
  • 発表場所: 名古屋大学(愛知県)
  • 年月日: 2009-12-23
• [学会発表] Biomolecules in water and water in biomolecules on the Physics, Chemistry, and Biology of Water 2009 (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirata
  • 学会等名: the Fourth Annual Conference
  • 発表場所: Snow Mountain, USA
  • 年月日: 2009-10-22
• [学会発表] Model Free "Solvent Modeling" in Chemistry and Biochemistry Based on the Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: International Workshop on "Continuum Modeling of Biomolecules
  • 発表場所: Beijin, China
  • 年月日: 2009-09-14
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio, Hirata
  • 学会等名: EMLG/JMLG Annual Meeting "Intermolecular Interactions and Liquid Structure,"
  • 発表場所: Salzburg, Austlia
  • 年月日: 2009-09-11
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 6^<th> International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems
  • 発表場所: Roma, Italy
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] Statistical mechanics reached at the point where it can explain elementary processes in life phenomena (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Statistical Physics: Modern Trends and Applications dedicated to the 100-th anniversary of Prof. M.M.Bogolyubov
  • 発表場所: Lviv, Ukraine
  • 年月日: 2009-06-24
• [学会発表] 蛋白質一溶液界面と分子認識 : 統計力学的研究 (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 特定領域研究「高次系分子科学」・SFG研究会合同シンポジウム「表面・界面を観る非線形分光の新しい展開」
  • 発表場所: 埼玉県和光市理化学研究所
  • 年月日: 2009-03-23
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: The 6^<th> Open Workshop on "Water and Biomolecules," and The 2^<nd> Open Workshop on "Fluctuation and Function,"
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • 年月日: 2009-03-16
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: The 6th Open Workshop on "Water and Biomolec ules" and the 2nd Open Symposium on "Fluctuati on and Biological Functions"
  • 発表場所: 愛知県岡崎市岡崎コンファレンスセンター
  • 年月日: 2009-03-16
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: Asian Core Symposium "First Korea-Japan Semin ars on Biomolecular Sciences Experiments and Si mulations"
  • 発表場所: KIAS in Seoul, Korea
  • 年月日: 2009-03-01
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Asian Core symposium "First Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences - Experiments and Simulations"
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2009-02-28
• [学会発表] 生体分子および溶媒の構造揺らぎと共役した機能発現過程の理論的解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 新学術領域「揺らぎと生体機能」第一回公開シンポジウム
  • 発表場所: 京都テルサ(京都府)
  • 年月日: 2009-01-06
• [学会発表] 生体分子および溶媒の構造揺らぎと共役した機能発現過程の理論的解明 (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 新学術領域「揺らぎと生体機能」第一回公開シンポジウム
  • 発表場所: 京都府京都市京都テルサ
  • 年月日: 2009-01-06
• [学会発表] Statistical mechanics reached at the point where it can explain elementary processes in life phenomena (2009)
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: Statistical Physics : Modern Trends and Applications dedicated to the 100-th anniversary of Prof.M.M.Bogolyubov
  • 発表場所: Lviv, Ukraine(招待講演)
• [学会発表] Possibility of Parallelization of the 3D-RISM Program on the Next-generation Supercomputer (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 3^<rd> French-Japanese Workshop on "Petascale Applications, Algorithms and Programing(PAAP)
  • 発表場所: 京都市 芝欄館
• [学会発表] An attempt toward the generalized Langevin dynamics simulation (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: KIAS meeting on "Recent Progress in Computer Simulations in Molecular Sciences
  • 発表場所: Seoul(Korea)
• [学会発表] Statistical mechanics reached at the point where it can explain elementary processes in life phenomena (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: Statistical Physics : Modem Trends and Applications dedicated to the 100-th anniversary of□Prof.M.M.Bogolyubov
  • 発表場所: Lviv(Ukraine)
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 6^<th> International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems
  • 発表場所: Roma(Italy)
• [学会発表] Molecular Recognition, Fluctuation, and Function of Protein Studied by a Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: EMLG/JMLG Annual Meeting "Intermolecular Interactions and Liquid Structure
  • 発表場所: Salzburg(Austria)
• [学会発表] Model Free "Solvent Modeling" in Chemistry and Biochemistry Based on the Statistical Mechanics of Liquids (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: International Workshop on "Continuum Modeling of Biomolecules
  • 発表場所: Beijin(China)
• [学会発表] Biomolecules in water and water in biomolecules (2009)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: the Fourth Annual Conference on the Physics, Chemistry, and Biology of Water 2009
  • 発表場所: Vermont(U.S.A.)
• [学会発表] 「生命階層と物質階層の境界 : 分子認識」、自然科学研究機構「自然科学における階層と全体」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 学会等名: 自然科学研究機構「自然科学における階層と全体」シンポジウム
  • 発表場所: 愛知県蒲郡市
  • 年月日: 2008-12-17
• [学会発表] Molecular Recognition in Life Phenomena Probed with the Statistical Mechanics of Liauids (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: IMA Annual Program Year Workshop "Solvation"
  • 発表場所: University of Minesota, Minneapolis, USA
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] Molecular Recognition in Life Phenomena Probed with the Statistical Mechanics of Liquids (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: IMA Annual Program Tear Workshop "Solvation,"
  • 発表場所: Minneapolis, USA
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] Statistical-mechanics theory of molecular recognition: water and other molecules recognized by protein (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: Water in Biological System, A French-Japanese Workshop
  • 発表場所: 京都大学(京都府)
  • 年月日: 2008-11-26
• [学会発表] Molecular Recognition in Life Phenomena Probed with the Statistical Mechanics of Liquids (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: The 8^<th> KIAS-Yonsei Conference on Protein Structure and Function
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2008-10-10
• [学会発表] Molecular Recognition Realized by the Statistical Mechanics Theory of Liquids (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC)
  • 発表場所: Shanghai, China
  • 年月日: 2008-09-25
• [学会発表] Theory of molecular recognition and it's application to the enzymatic reaction (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: The grand challenge to Next Generation Integrated Nano-science
  • 発表場所: 未来科学館(東京都)
  • 年月日: 2008-06-04
• [学会発表] Statistical theory of molecular recognition, and it's application to aquaporin (2008)
  • 著者名/発表者名: F. Hirata
  • 学会等名: The 5^<th> Open Workshop on "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules
  • 発表場所: 能楽堂(奈良県)
  • 年月日: 2008-01-24
• [学会発表] A Statistical Mechanics Study of Molecular Recognition and Anesthesia
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: 第47回生物物理学会シンポジウム"麻酔作用の分子機構:生物物理から明らかにされる生体分子と麻酔 薬の相互作用
  • 発表場所: 文理大学(徳島県)
• [学会発表] An attempt toward the generalized Langevin dynamics simulation
  • 著者名/発表者名: Fumio Hirata
  • 学会等名: KIAS meeting on "Recent Progress in Computer Simulations in Molecular Sciences,"
  • 発表場所: Seoul, Korea
• [図書] 「水と生体分子のハーモニー」。日本化学会編「巨大分子系の計算科学」第15章 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生、丸山豊、清田泰臣、平田文男、今井隆志
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 「新しい分子統計力学・統計的動力学記述法」、日本化学会編「巨大分子系の計算科学」第7章 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 巨大分子系の統計力学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 平田文男
  • 総ページ数: 12
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 巨大分子系の統計力学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 吉田紀生
  • 総ページ数: 12
  • 出版者: 化学同人
• [図書] Chapter 4 in Bihan and Fukuyama(Ed.) : "Water, the forgotten biological molecule." (2011)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Thanyada Rungrotmongkol, Saree Phongphanphanee, Takashi Imai, Fumio Hirata
  • 総ページ数: 24
  • 出版者: Pan Stanford Publishing
• [図書] Statistical-mechanics theory of molecular recognition: water and other molecules recognized by protein, in Bihan and Fukuyama(Ed.): "Water, the forgotten biological molecule." (2010)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Saree Phongphanphanee, Takashi Imai and Fumio Hirata
  • 出版者: Pan Stanford Publishing, Singapore
• [図書] 揺らぎと生体機能(別冊・メディカルバイオ)(Statistical Mechanics theory of molecular recognition and ion channels) (2010)
  • 著者名/発表者名: 平田文男, 吉田紀生
  • 出版者: Saree Phonphanphanee
• [図書] Water, theforgottenbiologicalmolecule(Statistical-mechanics theory of molecular recognition : water and other molecules recognized by protein)(in Bihan and Fukuyama(Ed.))(Chapter 4) (2010)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Saree Phongphanphanee, Takashi Imai, Fumio Hirata
  • 出版者: Pan Stanford Publishing
• [図書] "分子認識とイオンチャネルの統計力学理論",Medical Bio 10月別冊 揺らぎと生体機能、寺嶋正秀 監修 (2010)
  • 著者名/発表者名: 平田文男、吉田紀生、Saree Phongphanphanee
  • 総ページ数: 6
  • 出版者: オーム社
• [図書] Model-Free "Solvent Modeling" in Chemistry and Biochemistry Based on the Statistical Mechanics of Liquids, in Feig(Ed.) : "Modeling Solvent Environ ments." (2010)
  • 著者名/発表者名: Norio Yoshida, Yasuomi Kiyota, Yasuhiro Ikuta, Takashi Imai, Ffumio Hirata
  • 総ページ数: 24
  • 出版者: Willy-VCH
• [図書] "Model-Free "Solvent Modeling" in Chemistry and Biochemistry Based on the Statistical Mechanics of Liquids," in "Modeling Solvent Environment," Ed. M. Feig (2009)
  • 著者名/発表者名: N. Yoshida, Y. Kiyota, Y. Ikuta, T. Imai, and F. Hirata
  • 出版者: Wiley-VCH
• [図書] "A Statistical Mechanics Theory of Molecular Recognition," in "Water and Biomolecules," Eds, K. Kuwajima, Y. Goto, F. Hirata, M. Kataoka, and M, Terazima (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Imai, N. Yoshida, A. Kovalenko, and F. Hirata
  • 出版者: Springer
• [図書] A Statistical Mechanics Theory of Molecular Recognition, Chapter 10, in Water and Biomolecules - Physical Chemistry of Life Phenomena. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takashi Imai, Norio Yoshida, Andriy Kovalenko, Fumio Hirata
  • 総ページ数: 24
  • 出版者: Springer Science
• [産業財産権] 溶液中の生体高分子の構造揺らぎとダイナミクスを 記述する方程式 (2013)
  • 発明者名: 平田文男;Kim,Bongsoo
  • 権利者名: 平田文男; Kim Bongsoo
  • 出願年月日: 2013-01-23
  • 外国
• [産業財産権] Analysis of Biomolecular Solvation site by the 3D-RISM Theory (2013)
  • 発明者名: Hirata, Fumio; Sindhikara, Daniel, Jon
  • 権利者名: Hirata, Fumio; Sindhikara, Daniel, Jon
  • 出願年月日: 2013-04-05
  • 外国
• [産業財産権] 溶液中の生体高分子の構造揺らぎとダイナミクスを記述する方程式 (2013)
  • 発明者名: 平田文男
  • 権利者名: 平田文男
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2013-01-23
  • 外国