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π電子系の関与する生体エネルギー変換過程の理論とシミュレーション

計画研究

研究領域高次π空間の創発と機能開発
研究課題/領域番号 20108017
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関京都大学

研究代表者

安藤 耕司  京都大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (90281641)

研究期間 (年度) 2008 – 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
31,460千円 (直接経費: 24,200千円、間接経費: 7,260千円)
2012年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2011年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2010年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2009年度: 6,630千円 (直接経費: 5,100千円、間接経費: 1,530千円)
2008年度: 4,940千円 (直接経費: 3,800千円、間接経費: 1,140千円)
キーワード電子移動 / プロトンポンプ / エネルギー変換 / 生体分子 / 量子動力学
研究概要

生体エネルギー変換の鍵となる蛋白質中の長距離電子移動反応の微視的機構を明らかにするために、大規模第一原理電子状態計算に立脚した電子移動経路解析の新手法を開発し、光合成反応中心に応用した。また、プロトン移動性有機分子結晶における協同的誘電相転移の機構解析、プロトンの量子波束シミュレーション手法の開発と応用において進展を得た。

報告書

(7件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書   自己評価報告書 ( PDF )
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (111件)

すべて 2013 2012 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (24件) (うち査読あり 24件) 学会発表 (85件) (うち招待講演 6件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Atoms-in-molecules analysis of the effect of intermolecular interactions on dielectric properties in hydrogen-bonded material 5-bromo-9-hydroxyphenalenone2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Otaki and Koji Ando
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 113 号: 3 ページ: 386-392

    • DOI

      10.1002/qua.24058

    • NAID

      120005853252

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Semiquantal Molecular Dynamics Simulations of Hydrogen-Bond Dynamics in Liquid Water using, Spherical Gaussian Wave Packets2013

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Kim Hyeon-Deuk, and Koji Ando
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 113 ページ: 356-365

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2012.02.073

    • NAID

      120005853251

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electron wave packet modeling of chemical bonding: Floating and breathing minimal packets with perfect-pairing valence-bond spin coupling2012

    • 著者名/発表者名
      K. Ando
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 523 ページ: 134-138

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2011.12.019

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Fragment Molecular Orbital Study on Electron Tunneling Mechanisms in Bacterial Photosynthetic Reaction Center2012

    • 著者名/発表者名
      Nishioka and Koji Ando
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B

      巻: 116 号: 43 ページ: 12933-12945

    • DOI

      10.1021/jp3062948

    • NAID

      120005868494

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Semiquantal molecular dynamics simulations of hydrogen-bond dynamics in liquid water using multidimensional Gaussian wave packets2012

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono and Koji Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 137 号: 17

    • DOI

      10.1063/1.4762840

    • NAID

      120005025027

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intermolecular diatomic energies of a hydrogen dimer with non-Born-Oppenheimer nuclear and electron wave packets2012

    • 著者名/発表者名
      Kim Hyeon-Deuk and Koji Ando
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 532 号: 3 ページ: 124-130

    • DOI

      10.1002/qua.24146

    • NAID

      120004025592

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pathway analysis of super-exchange electronic couplings in electron transfer reactions using a multi-configuration self-consistent field method2011

    • 著者名/発表者名
      Nishioka and K. Ando
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 13 号: 15 ページ: 7043-7059

    • DOI

      10.1039/c0cp01051k

    • NAID

      120005893545

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamics of Proton Transfer and Vibrational Relaxation in Dilute Hydrofluoric Acid2011

    • 著者名/発表者名
      T. Joutsuka and K. Ando
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A

      巻: 115 号: 5 ページ: 678-684

    • DOI

      10.1021/jp108413p

    • NAID

      120005853259

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydration Structure in Dilute Hydrofluoric Acid2011

    • 著者名/発表者名
      T. Joutsuka and K. Ando
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A

      巻: 115 号: 5 ページ: 671-677

    • DOI

      10.1021/jp108147e

    • NAID

      120005853258

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of intermolecular hydrogen bond on dielectric properties in hydrogen-bonded material 5-bromo-9-hydroxyphenalenone: theoretical investigation2011

    • 著者名/発表者名
      H. Otaki and K. Ando
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 13 号: 22 ページ: 10719-10728

    • DOI

      10.1039/c1cp20264b

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Electronic coupling calculation and pathway analysis of electron transfer reaction using ab initio fragment-based method. I. FMO-LCMO approach2011

    • 著者名/発表者名
      H. Nishioka and K. Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 134 号: 20

    • DOI

      10.1063/1.3594100

    • NAID

      120005853261

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Vibrational spectroscopy and relaxation of an anharmonic oscillator coupled to harmonic bath2011

    • 著者名/発表者名
      T.Joutsuka、K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 134 号: 20

    • DOI

      10.1063/1.3594093

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Hydration Structure in Dilute Hydrofluoric Acid2011

    • 著者名/発表者名
      T.Joutsuka, K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A Vol.115

      ページ: 671-677

    • NAID

      120005853258

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamics of Proton Transfer and Vibrational Relaxation in Dilute Hydrofluoric Acid2011

    • 著者名/発表者名
      T.Joutsuka, K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry A Vol.115

      ページ: 678-684

    • NAID

      120005853259

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Pathway analysis of super-exchange electronic couplings in electron transfer reactions using a multi-configuration self-consistent field method2011

    • 著者名/発表者名
      H.Nishioka, K.Ando
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics Vol.13

      ページ: 7043-7059

    • NAID

      120005893545

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantum effects of hydrogen atoms on the dynamical rearrangement of hydrogen-bond networks in water2010

    • 著者名/発表者名
      K. Hyeon-Deuk and K. Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 132 号: 16

    • DOI

      10.1063/1.3397809

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The axial methionine ligand may control the redox reorganizations in the active site of blue copper proteins2010

    • 著者名/発表者名
      K. Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 133 号: 17

    • DOI

      10.1063/1.3495983

    • NAID

      120002723146

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The axial methionine ligand may control the redox reorganizations in the active site of blue copper proteins2010

    • 著者名/発表者名
      K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics Vol.133

    • NAID

      120002723146

    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The axial methionine ligand may control the redox reorganizations in the active site of blue copper proteins2010

    • 著者名/発表者名
      K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 133

    • NAID

      120002723146

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Quantum effects of hydrogen atoms on the dynamical rearrangement of hydrogen-bond networks in water2010

    • 著者名/発表者名
      K.Hyeon-Deuk, K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics 132

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Semiquantal valence-bond wavepacket description of chemical bonding2009

    • 著者名/発表者名
      K. Ando
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn

      巻: Vol.823 号: 8 ページ: 975-983

    • DOI

      10.1246/bcsj.82.975

    • NAID

      10025126990

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Semiquantum molecular dynamics simulation of liquid water by time-dependent Hartree approach2009

    • 著者名/発表者名
      K. Hyeon-Deuk and K. Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: Vol.131 号: 6

    • DOI

      10.1063/1.3200937

    • NAID

      120001822421

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Semiquantal valence-bond wavepacket description of chemical bonding2009

    • 著者名/発表者名
      K.Ando
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan 82

      ページ: 975-983

    • NAID

      10025126990

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Semiquantum molecular dynamics simulation of liquid water by time-dependent Hartree approach2009

    • 著者名/発表者名
      K.Hyeon-Deuk, K.Ando
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics 131

    • NAID

      120001822421

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 量子モンテカルロ法を用いた水素結合性分子結晶における 誘電相転移と同位体効果の研究2013

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹, 安藤耕司
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発 第9回公開シンポジウム
    • 発表場所
      シーサイドホテル舞子ビラ神戸
    • 年月日
      2013-03-13
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 第一原理電子状態計算を用いた電子移動経路解析2013

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発 第9回公開シンポジウム
    • 発表場所
      シーサイドホテル舞子ビラ神戸
    • 年月日
      2013-03-13
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Electron Wave Packet Modeling of Chemical Bonding2013

    • 著者名/発表者名
      Koji Ando
    • 学会等名
      Symposium of Quantum and Classical Dissipative Dynamics
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • 年月日
      2013-03-07
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Semiquantal Wave Packet Molecular Dynamics Simulation of Hydrogen-Bond Dynamics in Water2012

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司,
    • 学会等名
      Workshop on Structure and Dynamics of Water in Gas, Liquid and Solid Phases
    • 発表場所
      台湾大学・中央研究院原子興分子科学研究所
    • 年月日
      2012-11-28
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Semiquantal Wave Packet Molecular Dynamics Simulation of Hydrogen-Bond Dynamics in Water2012

    • 著者名/発表者名
      Koji Ando
    • 学会等名
      Workshop on Structure and Dynamics of Water in Gas, Liquid and Solid Phases
    • 発表場所
      台湾大学 中央研究院原子興分子科学研究所
    • 年月日
      2012-11-28
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Electron Transfer Pathway Analysis in Biomolecules2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka and Koji Ando
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発第4回国際シンポジウム
    • 発表場所
      浜名湖ロイヤルホテル
    • 年月日
      2012-11-13
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Electron Transfer Pathway Analysis in Bacterial Photosynthetic Reaction Center2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka, Koji Ando
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大
    • 年月日
      2012-09-24
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Electron Transfer Pathway Analysis in Bacterial Photosynthetic Reaction Center2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka and Koji Ando
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-09-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 光合成バクテリア反応中心における電子トンネル移動機構2012

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      第6回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京大学本郷キャンパス
    • 年月日
      2012-09-18
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 電子とプロトンのダイナミクス2012

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      CMSI第一部会「新物質新量子相の基礎科学」 夏の学校
    • 発表場所
      タカミヤビレッジホテル樹林(山形県蔵王)
    • 年月日
      2012-08-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 光合成バクテリア反応中心の電子移動経路解析2012

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      高次π空間の創発と機能開発 第8回公開シンポジウム
    • 発表場所
      石川県加賀市ホテルアローレ
    • 年月日
      2012-07-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Electron transfer pathway analysis in large biomolecules2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka and Koji Ando
    • 学会等名
      China-Japan-Korea Tripartite Workshop on Theoretical and Computational Chemistry
    • 発表場所
      北京大学
    • 年月日
      2012-07-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Electron transfer pathway analysis in large biomolecules2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka and Koji Ando
    • 学会等名
      ISSP-CMSI international symposium on MAterial Simulation in Petaflops era (MASP2012)
    • 発表場所
      東京大学物性研究所
    • 年月日
      2012-07-12
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Semiquantal Wave Packet Molecular Dynamics Simulation of Hydrogen-Bond Dynamics in Water2012

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司,
    • 学会等名
      2012 Workshop on Exploring the Structures and Dynamics of Water at Interfaces
    • 発表場所
      台湾大学・中央研究院原子興分子科学研究所
    • 年月日
      2012-06-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Semiquantal Wave Packet Molecular Dynamics Simulation of Hydrogen-Bond Dynamics in Water2012

    • 著者名/発表者名
      Koji Ando
    • 学会等名
      2012 Workshop on Exploring the Structures and Dynamics of Water at Interfaces
    • 発表場所
      台湾大学 中央研究院原子興分子科学研究所
    • 年月日
      2012-06-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Floating and Breathing Minimal Electron Wave Packet Modeling of Chemical Bonding2012

    • 著者名/発表者名
      Koji Ando
    • 学会等名
      第28回化学反応討論会
    • 発表場所
      九州大学筑紫キャンパス
    • 年月日
      2012-06-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] FMO-LCMO 法を用いた長距離電子移動反応の理論的研究II2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka, Koji Ando
    • 学会等名
      第15回理論化学討論会
    • 発表場所
      仙台市福祉プラザ
    • 年月日
      2012-05-25
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] FMO-LCMO法を用いた長距離電子移動反応の理論的研究II2012

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      第15回理論化学討論会
    • 発表場所
      仙台市福祉プラザ
    • 年月日
      2012-05-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 浮動幅可変ガウス波束と原子価結合法による化学結合の記述2012

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      第15回理論化学討論会
    • 発表場所
      仙台市福祉プラザ
    • 年月日
      2012-05-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Electron Wave Packet Modeling of Chemical Bonding2012

    • 著者名/発表者名
      Koji Ando
    • 学会等名
      JST International Symposium on Multi-scale Simulation of Condensed-phase Reacting Systems
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-05-11
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Fragment Molecular Orbital Study on Electron Tunneling Mechanism of Electron Transfer Reaction from Heme c-559 to Photo-oxidized Special Pair P960+ in Bacterial Photosynthetic Reaction Center2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka, Koji Ando
    • 学会等名
      JST International Symposium on Multi-scale Simulation of Condensed-phase Reacting Systems
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2012-05-10
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Enhancement of dipole moment in hydrogen-bonded molecular crystal 5-bromo-9-hydroxyphenalenone: Computational study2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Otaki, Koji Ando
    • 学会等名
      NTHU-KAIST-KYOTO junior chemist symposium
    • 発表場所
      National Tsing Hua University
    • 年月日
      2012-02-15
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Enhancement of dipole moment in hydrogen-bonded molecular crystal 5-bromo-9-hydroxyphenalenone : Computational study2012

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹, 安藤耕司
    • 学会等名
      NTHU-KAIST-KYOTO junior chemist symposium
    • 発表場所
      National Tsing Hua University
    • 年月日
      2012-02-15
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Atoms-in-Molecules Analysis of Dipole Moment Enhancement in Hydrogen-Bonded Molecular Crystal 5-Bromo-9-hydroxyphenalenone2012

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹, 安藤耕司
    • 学会等名
      第9回京都大学福井謙一記念研究センターシンポジウム
    • 発表場所
      京都大学福井謙一記念研究センター
    • 年月日
      2012-01-06
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 電子とプロトンのダイナミクス2012

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司,
    • 学会等名
      CMSI第1部会「新物質新量子相の基礎科学」夏の学校
    • 発表場所
      タカミヤビレッジホテル樹林(山形県蔵王)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Electron transfer pathway analysis in large biomolecules2012

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Kitoh-Nishioka, Koji Ando
    • 学会等名
      China-Japan-Korea Tripartite Workshop on Theoretical and computational Chemistry
    • 発表場所
      北京大学(中国)
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 光合成細菌反応中心の電子トンネル移動経路解析2012

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      第20回光合成の色素系と反応中心に関するセミナー
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] The effect of intermolecular interactions on dielectric properties in hydrogen-bonded molecular crystal 5-X-9-hydroxyphenalenone (X=Br, I, Methyl)2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Otaki, Koji Ando
    • 学会等名
      New Zealand Institute of Chemistry Conference 2011
    • 発表場所
      The University of Waikato
    • 年月日
      2011-11-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] The effect of intermolecular interactions on dielectric properties in hydrogen-bonded molecular crystal 5-X-9-hydroxyphenalenone (X=Br, I, Methyl)2011

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹, 安藤耕司
    • 学会等名
      New Zealand Institute of Chemistry Conference 2011
    • 発表場所
      The University of Waikato
    • 年月日
      2011-11-29
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 楕円状ガウス波束を用いた水の準量子的分子動力学シミュレーション:水素結合の組み換えに伴う核の量子揺らぎのメカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      小野 純一, 安藤 耕司
    • 学会等名
      第5回分子科学討論会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2011-09-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] プロトン移動性分予結晶5-ブロモ-9-ヒドロキシフェナレノンにおける誘電物性の理論的研究2011

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹, 安藤耕司
    • 学会等名
      第5回分子科学討論会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2011-09-20
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] フラグメント分子軌道法を用いた電子移動反応の電子的相互作用計算と経路解析2011

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学
    • 年月日
      2011-09-17
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the effect of intermolecular interactions on dielectric properties in hydrogen-bonded material 5-bromo-9-hydroxyphenalenone2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroki Otaki, Koji Ando
    • 学会等名
      7th Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2011-09-03
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] Electronic coupling calculation and pathway analysis of electron transfer reaction by using ab initio fragment-based method2011

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Nishioka, Koji Ando
    • 学会等名
      7th Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2011-09-03
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] Simple wavepacket modeling of electron and nuclear dynamics2011

    • 著者名/発表者名
      Koji Ando
    • 学会等名
      7th Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics
    • 発表場所
      早稲田大学
    • 年月日
      2011-09-03
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] 水の構造やダイナミクスにおいて核の量子効果は重要なのか?2011

    • 著者名/発表者名
      小野純一, 安藤耕司
    • 学会等名
      放射光学会第3回若手研究会
    • 発表場所
      姫路市立美術館講堂
    • 年月日
      2011-08-18
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Semiquantum valence-bond wavepacket description of chemical bonding2011

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      第27回化学反応討論会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2011-06-10
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] FMO-LCMO法を用いた長距離電子移動反応の理論的研究2011

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任, 安藤耕司
    • 学会等名
      第14回理論化学討論会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-05-12
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] 有機反強誘電体5-ブロモ-9-ヒドロキシフェナレノンにおける誘電物性の理論的研究2011

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹, 安藤耕司
    • 学会等名
      第14回理論化学討論会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-05-12
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2011 実績報告書
  • [学会発表] 楕円状ガウス波束を用いた水の準量子的MD シミュレーション:核の量子波束の異方性と揺らぎのメカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      小野 純一, 安藤 耕司
    • 学会等名
      第14回理論化学討論会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-05-12
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 楕円状ガウス波束を用いた水の準量子的MDシミュレーション:核の量子波束の異方性と揺らぎのメカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      小野純一, 安藤耕司
    • 学会等名
      第14回理論化学討論会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2011-05-12
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] プロトン移動性分子結晶5-ブロモ-9-ヒドロキシフェナレノンの誘電物性に関する理論的研究2011

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹、安藤耕司
    • 学会等名
      日本物理学会第66回年次大会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2011-03-28
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] プロトン移動性分子結晶5-ブロモ-9-ヒドロキシフェナレノンの誘電物性に関する理論的研究2011

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹・安藤耕司
    • 学会等名
      日本物理学会 第66回年次大会
    • 発表場所
      新潟大学
    • 年月日
      2011-03-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 球状ガウス波束を用いた水の準量子的MDシミュレーション:水素結合の組み換えに伴う核の量子揺らぎのメカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      小野純一、安藤耕司
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2011
    • 発表場所
      自然科学研究機構岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2011-01-24
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 球状ガウス波束を用いた水の準量子的MDシミュレーション:水素結合の組み換えに伴う核の量子揺らぎのメカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      小野純一・安藤耕司
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2011
    • 発表場所
      自然科学研究機構 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2011-01-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] プロトン移動性分子結晶5-ブロモ-9-ヒドロキシフェナレノンの誘電物性に関する理論的研究2010

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹、安藤耕司
    • 学会等名
      第8回 京都大学福井謙一記念研究センターシンポジウム
    • 発表場所
      京都大学福井謙一記念研究センター
    • 年月日
      2010-12-03
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] プロトン移動性分子結晶5-ブロモ-9-ヒドロキシフェナレノンの誘電物性に関する理論的研究2010

    • 著者名/発表者名
      大滝大樹・安藤耕司
    • 学会等名
      第8回京都大学福井謙一記念研究センターシンポジウム
    • 発表場所
      京都大学福井謙一記念研究センター
    • 年月日
      2010-12-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Semiquantum molecular dynamics simulation of liquid water2010

    • 著者名/発表者名
      金賢得、安藤耕司
    • 学会等名
      第24回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      福井県県民ホール
    • 年月日
      2010-11-24
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書 2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 水の水素結合ダイナミクスにおける核の量子効果の理論的解析2010

    • 著者名/発表者名
      小野 純一・金 賢得・安藤 耕司
    • 学会等名
      第33回溶液化学シンポジウム
    • 発表場所
      京都大学百周年時計台記念館2階国際交流ホール
    • 年月日
      2010-11-17
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] 水の水素結合ダイナミクスにおける核の量子効果の理論的解析2010

    • 著者名/発表者名
      小野純一、金賢得、安藤耕司
    • 学会等名
      第33回溶液化学シンポジウム
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2010-11-17
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Pathway Analysis of Electron Tunneling through Protein Media Using Divide-and-Conquer Electronic Structure Calculation2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任・安藤耕司
    • 学会等名
      日本生物物理学会 第48回年会
    • 発表場所
      東北大学川内キャンパス
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] Pathway Analysis of Electron Tunneling through Protein Media Using Divide-and-Conquer Electronic Structure Calculation2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任、安藤耕司
    • 学会等名
      日本生物物理学会 第48回年会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 準量子的分子動力学法による水の水素結合ダイナミクスの理論的解析2010

    • 著者名/発表者名
      小野 純一・金 賢得・安藤 耕司
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] 水溶液中の振動緩和とプロトン移動2010

    • 著者名/発表者名
      城塚達也、安藤耕司
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 準量子的分子動力学法による水の水素結合ダイナミクスの理論的解析2010

    • 著者名/発表者名
      小野純一、金賢得、安藤耕司
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 水溶液中の振動緩和とプロトン移動2010

    • 著者名/発表者名
      城塚達也・安藤耕司
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス
    • 年月日
      2010-09-17
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 分割統治(DC)電子状態計算を用いた蛋白質中電子移動反応のトンネル経路解析2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任・安藤耕司
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス
    • 年月日
      2010-09-16
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] 分割統治(DC)電子状態計算を用いた蛋白質中電子移動反応のトンネル経路解析2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任、安藤耕司
    • 学会等名
      第4回分子科学討論会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-09-16
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Quantum effects on hydrogen-bond network dynamics in water2010

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      第26回化学反応討論会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2010-06-02
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Quantum effects on hydrogen-bond network dynamics in water2010

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      第26回化学反応討論会
    • 発表場所
      広島大学東広島キャンパス
    • 年月日
      2010-06-02
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 多配置SCF法を用いた電子移動反応のトンネル経路解析2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任、安藤耕司
    • 学会等名
      第13回理論化学討論会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2010-05-25
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] 多配置SCF法を用いた電子移動反応のトンネル経路解析2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任・安藤耕司
    • 学会等名
      第13回理論化学討論会
    • 発表場所
      北海道大学 学術交流会館
    • 年月日
      2010-05-25
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 希釈フッ化水素酸中の振動緩和とプロトン移動2010

    • 著者名/発表者名
      城塚達也・安藤耕司
    • 学会等名
      第13回理論化学討論会
    • 発表場所
      北海道大学 学術交流会館
    • 年月日
      2010-05-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2010 実績報告書
  • [学会発表] 希釈フッ化水素酸中の振動緩和とプロトン移動2010

    • 著者名/発表者名
      城塚達也、安藤耕司
    • 学会等名
      第13回理論化学討論会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2010-05-23
    • 関連する報告書
      2010 自己評価報告書
  • [学会発表] Semiquantum Molecular Dynamics Simulation of Liquid Water2010

    • 著者名/発表者名
      金賢得、安藤耕司
    • 学会等名
      American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      San Francisco Moscone Center (USA)
    • 年月日
      2010-03-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Semiquantum Molecular Dynamics Simulation of Liquid Water2010

    • 著者名/発表者名
      金賢得、安藤耕司
    • 学会等名
      American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      San Fransisco Moscone Center
    • 年月日
      2010-03-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] π電子系の関与する生体工ネルギー変換の理論とシミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司、西岡宏任
    • 学会等名
      「π空間」第三回公開シンポジウム
    • 発表場所
      分子科学研究所(岡崎市)
    • 年月日
      2010-03-15
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Long-distance electron tunneling through an α-helix or β-strand peptide backbone: Divide-and-conquer Hartree-Fock analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Hirotaka Nishioka, Koji Ando
    • 学会等名
      名古屋大学生物物理国際シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2010-03-10
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Long-distance electron tunneling through an α-helix or β-strand peptide backbone : Divide-and-conquer Hartree-2010

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任、安藤耕司
    • 学会等名
      名古屋大学生物物理国際シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2010-03-10
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Semiquantal wavepacket modeling of reaction dynamics and chemical bonding2010

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      The 60th Okazaki Conference on "New Frontier in Quantum Chemical Dynamics
    • 発表場所
      分子科学研究所(岡崎市)
    • 年月日
      2010-02-23
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Semiquantal wavepacket modeling of reaction dynamics and chemical bonding2010

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      The 60th Okazaki Conference on "New Frontier in Quantum Chemical Dynamics"
    • 発表場所
      分子科学研究所(岡崎市)
    • 年月日
      2010-02-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Ligand π-space at the Red-ox Center of a Type I Blue Copper Protein Plastocyanin : A Theoretical QM/MM Study2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      「π空間」第一回国際シンポジウム
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪市)
    • 年月日
      2009-12-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Pathway Analysis for Long-Range Electronic Couplings Using Multiconfiguration Self-consistent Method2009

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任、安藤耕司
    • 学会等名
      「π空間」第一回国際シンポジウム
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪市)
    • 年月日
      2009-12-18
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Metal-ligand d-π interaction in electron transfer mechanism of blue copper protein: A theoretical study2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま(徳島市)
    • 年月日
      2009-10-30
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Metal-ligand d-π interaction in electron transfer mechanism of blue copper protein : A theoretical study2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま(徳島市)
    • 年月日
      2009-10-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 水の構造ダイナミクスの準量子的波束シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      金賢得、安藤耕司
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Pathway Analysis for Long-Range Electronic Couplings Using ORMAS CI Method2009

    • 著者名/発表者名
      西岡宏任、安藤耕司
    • 学会等名
      第3回分子科学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 分子多体系における量子移動過程の理論とシミュレーション:現状と展望2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      科研費特定領域「実在系の分子理論」研究交流会
    • 発表場所
      金沢文化ホール(金沢市)
    • 年月日
      2009-09-05
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Semiquantal valence-bond description of chemical bonding2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      Nonequilibrium Phenomena, Nonadiabatic Dynamics and Spectroscopy
    • 発表場所
      Telluride, USA
    • 年月日
      2009-07-20
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書 2009 実績報告書
  • [学会発表] Semiquantal Valence-Bond Wavepacket Description of Chemical Bonding2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2009-06-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 準量子的原子価結合波束法による化学結合の記述2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      第12回 理論化学討論会
    • 発表場所
      東京大学 本郷キャンパス 武田先端知ビル
    • 年月日
      2009-05-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Semiquantal Time-dependent Hartree Theory for Hydrogen Bonding and Transfers2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      The Horiba International Symposium on Simulations and Dynamics for Nanoscale and Biological Systems
    • 発表場所
      Semiquantal Time-dependent Hartree
    • 年月日
      2009-03-04
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] π電子系の関与する生体エネルギー変換過程の理論とシミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      新学術領域研究「高次π空間の創発と機能開発」第1回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京国際交流館プラザ平成メディアホール
    • 年月日
      2009-02-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 水素結合構造とプロトン移動反応の準量子的解析2009

    • 著者名/発表者名
      安藤 耕司
    • 学会等名
      計算科学研究センター・ワークショップ「次世代理論化学の新展開と超並列計算への挑戦」
    • 発表場所
      分子科学研究所岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2009-01-09
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] 水素結合構造とプロトン移動反応の準量子的解析2009

    • 著者名/発表者名
      安藤耕司
    • 学会等名
      計算科学研究センター・ワークショップ「次世代理論化学の新展開と超並列計算への挑戦」
    • 発表場所
      分子科学研究所岡崎コンファレンスセ
    • 年月日
      2009-01-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] 高次π空間の創発と機能開発 4.1節 光合成反応中心における長距離電子移動の経路解析2013

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任・安藤耕司
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [図書] 高次π空間の創発と機能開発 4.1節 光合成反応中心における長距離電子移動の経路解析2013

    • 著者名/発表者名
      鬼頭-西岡宏任, 安藤耕司
    • 総ページ数
      5
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2008-04-01   更新日: 2018-03-28  

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