mRNA制御システムによる生殖細胞形成機構

• 研究領域: 多様性と非対称性を獲得するＲＮＡプログラム
• 研究課題/領域番号: 20112003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 神戸大学
• 研究代表者: 井上 邦夫 神戸大学, 大学院・理学研究科, 教授 (40252415)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 108,810千円 (直接経費: 83,700千円、間接経費: 25,110千円); 2012年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円); 2011年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円); 2010年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円); 2009年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円); 2008年度: 20,410千円 (直接経費: 15,700千円、間接経費: 4,710千円)
• キーワード: 生殖細胞 / 生殖顆粒 / mRNA 制御 / miRNA / RNA 結合蛋白質 / TALEN 法 / 発現制御 / 発生・分化 / mRNA / 翻訳制御 / TALEN法 / 生殖質 / mRNA制御 / RNA結合蛋白質

研究概要

ゼブラフィッシュ始原生殖細胞形成をモデル系とした解析を行い、数種の生殖質mRNA が体細胞でmiRNA による抑制制御を受けるのに対し、始原生殖細胞ではRNA 結合タンパク質DAZL がその抑制解除に働くことを示した。また、miRNA によるサイレンシング機構として、PABP に依存しない翻訳抑制機構の役割を示した。一方、生殖顆粒構成因子Gra タンパク質が翻訳開始因子eIF4E との結合を介して翻訳抑制を行う可能性を見出した。さらに、TALEN 法によって、いくつかのmRNA 制御因子の変異体系統を樹立した。

研究成果

• [雑誌論文] Characterization of the compact bicistronic microRNA precursor, miR-1/miR-133, expressed specifically in Ciona muscle tissues (2013)
  • 著者名/発表者名: Kusakabe, R., Tani, S., Nishitsuji, K., Shindo, M., Okamura, K., Miyamoto, Y., Nakai, K., Suzuki, Y., Kusakabe, T. G., and Inoue, K
  • 雑誌名: Gene Exp. Patterns 巻: 13 ページ: 43-50
  • 査読あり
• [雑誌論文] A specific set of exon junction complex subunits is required for the nuclear retention of unspliced RNAs in Caenorhabditis elegans (2013)
  • 著者名/発表者名: Shiimori, M., Inoue, K., and Sakamoto, H
  • 雑誌名: Mol. Cell. Biol 巻: 33 ページ: 444-456
  • 査読あり
• [雑誌論文] A specific set of EJC subunits is required for the nuclear retention of unspliced RNAs in C. elegans (2013)
  • 著者名/発表者名: Masami Shiimori, KunioInoue, Hiroshi Sakamoto
  • 雑誌名: Molecular and Cellular Biology 巻: Jan ; 33(2) 号: 2 ページ: 444-56
  • DOI: 10.1128/mcb.01298-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterization of the compact bicistronic microRNA precursor, miR-1/miR-133, expressed specifically in Ciona muscle tissues. (2013)
  • 著者名/発表者名: Rie Kusakabe, Saori Tani, Koki Nishitsuji, Miyuki Shindo, Kohji Okamura, Yuki Miyamoto, Kenta Nakai, Yutaka Suzuki, Takehiro G Kusakabe, Kunio Inoue
  • 雑誌名: Gene Expression Patterns 巻: 13 号: 1-2 ページ: 43-50
  • DOI: 10.1016/j.gep.2012.11.001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of MIWI-associated poly(A) RNAs by immunoprecipitation with an anti-MIWI monoclonal antibody (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishibu, T., Hayashida, Y., Tani, S., Kurono, S., Ukekawa, R., Kojima-Kita, K., Kurokawa, T., Kuramochi-Miyagawa, S., Nakano, T., Inoue, K., and Honda, S
  • 雑誌名: BioScience Trends 巻: 6 ページ: 248-261
  • NAID: 130005054634
  • 査読あり
• [雑誌論文] Translational inhibition by deadenylation-independent mechanisms is central to microRNA-mediated silencing in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Mishima, Y., Fukao, A., Kishimoto, T., Sakamoto, H., Fujiwara, T., and Inoue, K
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 109 ページ: 1104-1109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional and direct interaction between the RNA binding protein HuD and active Akt1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, T., Fukao, A., Sasano, Y., Matsuzaki, H., Kikkawa, U., Imataka, A., Inoue, K., Endo, S., Sonenberg, N. Thoma, C., and Sakamoto, H
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 ページ: 1944-1953
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of MIWI-associated poly(A) RNAs by immunoprecipitation with an anti-MIWI monoclonal antibody. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishibu, T. et al.
  • 雑誌名: BioScience Trends 巻: 6 ページ: 248-261
  • 査読あり
• [雑誌論文] Translational inhibition by deadenylation-independent mechanismsis central to microRNA-mediated silencing in zebrafish (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuichiro Mishima
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 109(4) 号: 4 ページ: 1104-1109
  • DOI: 10.1073/pnas.1113350109
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional and direct interaction between the RNA binding protein HuD and active Akt1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Toshinobu Fujiwara
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 40(5) 号: 5 ページ: 1944-1953
  • DOI: 10.1093/nar/gkr979
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microtubule association of a neuronal RNA-binding protein HuD through its binding to the light chain of MAP1B (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, Y., Kasashima, K., Saito, K., Fukuda, M., Fukao, A., Sasano, Y., Inoue, K., Fujiwara, T., and Sakamoto, H
  • 雑誌名: Biochimie 巻: 93 ページ: 817-822
  • 査読あり
• [雑誌論文] Microtubule association of a neuronal RNA-binding protein HuD through its binding to the light chain of MAP1B. (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, Yukiko.
  • 雑誌名: Biochimie 巻: (印刷中)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes): insights into the post-transcriptional gene regulation in early development (2010)
  • 著者名/発表者名: Tani, S., Kusakabe, R., Naruse, K., Sakamoto, H., and Inoue, K
  • 雑誌名: Gene 巻: 449 ページ: 41-49
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias latipes) : insights into the post-transcriptional gene regulation in early development. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tani, S., Kusakabe, R., Naruse, K., Sakamoto, H., Inoue, K.
  • 雑誌名: Gene 449 ページ: 41-49
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic organization and embryonic expression of miR-430 in medaka (Oryzias Latipes) : insights into the post-transcriptional gene regulation in early devlopment. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tani, S., et al.
  • 雑誌名: Gene 449 ページ: 41-49
  • 査読あり
• [雑誌論文] DAZL relieves miRNA-mediated repression of germline mRNAs by controlling poly(A) tail length in zebrafish (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeda, Y., Mishima, Y., Fujiwara, T., Sakamoto, H., and Inoue, K
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] The ELAV protein HuD stimulates cap-dependent translation in a poly(A)- and eIF4A-dependent manner (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukao, A., Sasano, Y., Imataka, H., Inoue, K., Sakamoto, H., Sonenberg, N., Thoma, C. and Fujiwara, T
  • 雑誌名: Mol. Cell 巻: 36 ページ: 1007-1017
  • 査読あり
• [雑誌論文] A useful approach to total analysis of RISC-associated RNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashida, Y., Nishibu, T., Inoue, K., and Kurokawa, T
  • 雑誌名: BMC Research Notes 巻: 2 ページ: 169-169
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role and mechanism of U1-independent pre-mRNA splicing in the regulation of alternative splicing (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukumura, K. and Inoue, K
  • 雑誌名: RNA Biol 巻: 6 ページ: 395-398
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel application of metabolomics in vertebrate development (2009)
  • 著者名/発表者名: Hayashi, S., Akiyama, S., Tamaru, Y., Takeda, Y., Fujiwara, T., Inoue, K., Kobayashi, A., Maegawa, S., and Fukusaki, E
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 386 ページ: 268-272
  • 査読あり
• [雑誌論文] Localization of c-mos mRNA around the animal pole in the zebrafish oocyte with Zor-1/Zorba (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H., Tsukahara, T., and Inoue, K
  • 雑誌名: BioScience Trends 巻: 3 ページ: 96-104
  • 査読あり
• [雑誌論文] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulation of alternative splicing (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukumura, K., Taniguchi, I., Sakamoto, H., Ohno, M., and Inoue, K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 37 ページ: 1907-1914
  • 査読あり
• [雑誌論文] DAZL relieves miRNA-mediated repression of germline mRNAs by controlling poly(A) tail length in zebrafish. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeda, Y., Mishima, Y., Fujiwara, T., Sakamoto, H., Inoue, K.
  • 雑誌名: PLoS ONE 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] The ELAV protein HuD stimulates cap-dependent translation in a poly(A)- and eIF4A-dependent manner. (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukao, A., Sasano, Y., Imataka, H., Inoue, K., Sakamoto, H., Sonenberg, N., Thoma, C., Fujiwara, T.
  • 雑誌名: Mol.Cell 36 ページ: 1007-1017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Localization of c-mos mRNA around the animal pole in the zebrafish oocyte with Zor-1/Zorba. (2009)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, H., Tsukahara, T., Inoue, K.
  • 雑誌名: BioScience Trends 3 ページ: 96-104
  • 査読あり
• [雑誌論文] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulation of alternative splicing. (2009)
  • 著者名/発表者名: Fukumura, K., Taniguchi, I., Sakamoto, H., Ohno, M., Inoue, K.
  • 雑誌名: Nucl.Acids Res. 37 ページ: 1907-1914
  • 査読あり
• [雑誌論文] DAZL relieves miRNA-mediated repression of germline mRNAs by controlling poly (A) tail length in zebrafish. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeda, Y., et al.
  • 雑誌名: PLoS ONE 4
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生殖細胞と体細胞の分化とmiRNAの関与 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井上邦夫
  • 雑誌名: 生体の科学 59 ページ: 356-357
• [雑誌論文] R. Developmental expression and evolution of muscle-specific microRNAs conserved in vertebrates
  • 著者名/発表者名: Tani, S., Kuraku, S., Sakamoto, H., Inoue, K., and Kusakabe, R
  • 雑誌名: Evolution & Development 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] ゼブラフィッシュ胚発生を制御するmicroRNAシステムの分子基盤 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三嶋雄一郎
  • 学会等名: 第３５回分子生物学会年会 ワークショップ「RNA制御の細胞生物学」
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] ゼブラフィッシュ生殖顆粒構成因子Granulitoタンパク質の機能解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲川陽介
  • 学会等名: 第３５回分子生物学会年会 ワークショップ「RNA制御の細胞生物学」
  • 発表場所: 福岡国際会議場
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] RNA regulation in zebrafish germ cell formation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K.
  • 学会等名: 2012 Taiwan-Japan Joint Symposium on cell signaling and gene regulation
  • 発表場所: 台南
  • 年月日: 2012-11-11
  • 招待講演
• [学会発表] RNA regulation in zebrafish germ cell formation (2012)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: 2012 Taiwan-Japan Joint Symposium on cell signaling and gene regulation
  • 発表場所: 台南・台湾
• [学会発表] Molecular mechanisms and regulations of microRNA-mediated gene silencing inzebrafish (2011)
  • 著者名/発表者名: Mishima, Y., and Inoue, K
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会・ワークショップ
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Molecular mechanisms and regulations of microRNA-mediated gene sile ncing in zebrafish (2011)
  • 著者名/発表者名: Mishima, Yuichiro
  • 学会等名: 第34回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)(招待講演)
• [学会発表] Control of germline/somatic cell distinction by miRNA function in zebrafish. (2010)
  • 著者名/発表者名: Inoue, Kunio
  • 学会等名: A satellite symposium on Germ Cells in SDB-JSDB Joint Meeting 2010
  • 発表場所: Albuquerque Convention Center (New Mexico, USA)(招待講演)
  • 年月日: 2010-08-05
• [学会発表] Control of germline/somatic cell distinction by miRNA function in zebrafish (2010)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: A satellite symposium on Germ Cells in SDB-JSDB Joint Meeting 2010
  • 発表場所: New Mexico.America
• [学会発表] Control of germline/somatic cell distinction by miRNA function in zebrafish. (2010)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K.
  • 学会等名: A satellite symposium on Germ Cells in SDB-JSDB Joint Meeting 2010.
  • 発表場所: Albuquerque Convention Center (New Mexico, USA) 招待講演
• [学会発表] U1-independent splicing and the splicing regulation (2009)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会 ワークショップ「多様性を生むRNAプログラム」
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-09
• [学会発表] Control of germline/somatic cell distinctions by miRNA function (2009)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: The NIBB International Practical course "Developmental Genetics of zebrafish and medaka"
  • 発表場所: 基生研
  • 年月日: 2009-01-29
• [学会発表] U1-independent pre-mRNA splicing contributes to the regulationof alternative splicing (2008)
  • 著者名/発表者名: Inoue, K
  • 学会等名: 国際シンポジウム "The expanding world of post-transcriptional regulation of gene expression"
  • 発表場所: 東京医科歯科大学
  • 年月日: 2008-12-13
• [学会発表] ゼブラフィッシュmiRNA制御システムによる生殖細胞形成機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井上邦夫
  • 学会等名: 第41回日本発生生物学会・サテライトワークショップ
  • 発表場所: 徳島県郷土文化会館
  • 年月日: 2008-05-27
• [備考]
• [備考]
  • URL: http://www.org.kobe-u.ac.jp/rna/
• [備考]
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/
• [備考] ホームページ
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/
• [備考]
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/
• [備考]
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/
• [備考]
  • URL: http://www.research.kobe-u.ac.jp/fsci-rna/