遺伝子発現の正確性を保証するmRNA品質管理機構

• 研究領域: 多様性と非対称性を獲得するＲＮＡプログラム
• 研究課題/領域番号: 20112006
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東北大学 (2010-2012); 名古屋大学 (2008-2009)
• 研究代表者: 稲田 利文 東北大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (40242812)
• 研究期間 (年度): 2008 – 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 138,840千円 (直接経費: 106,800千円、間接経費: 32,040千円); 2012年度: 33,150千円 (直接経費: 25,500千円、間接経費: 7,650千円); 2011年度: 33,150千円 (直接経費: 25,500千円、間接経費: 7,650千円); 2010年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円); 2009年度: 22,100千円 (直接経費: 17,000千円、間接経費: 5,100千円); 2008年度: 28,340千円 (直接経費: 21,800千円、間接経費: 6,540千円)
• キーワード: mRNA品質管理 / 翻訳アレスト / 新生ポリペプチド鎖 / mRNA分子内切断 / ユビキチン化 / プロテアソーム / リボソーム / リボソーム解離因子 / 異常RNA分解 / 異常タンパク質分解 / ユビキチン化ビキチン化 / RNA / 翻訳伸長阻害 / RMA品質管理 / タンパク質分解 / mRNA分解 / E3ユビキチンライゲース / mRNA分解制御 / 翻訳 / 翻訳伸長阻 / 翻訳制御 / 品質管理 / mRNA暗転性制御

研究概要

生命現象の基盤となる遺伝子発現の正確性は、様々な品質管理機構によって保証される。異常mRNAの品質はリボソームにより感知され、異常な翻訳終結が引き金となって分解が促進される。本研究では、(1)異常翻訳の認識と解消機構1、(2)異常mRNAと異常タンパク質の迅速な分解機構が明らかになり、品質管理機構の全体像の解明に貢献した。

研究成果

• [雑誌論文] Global microRNA elevation by inducible Exportin 5 regulates cell cycle entry (2013)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, Y. W.; Kiga, K.; Kayo, H.; Fukuda-Yuzawa, Y.; Weise, J.; Inada, T.; Tomita, M.; Ishihama, Y..; Fukao, T.
  • 雑誌名: RNA 巻: 19 (4) 号: 4 ページ: 490-7
  • DOI: 10.1261/rna.036608.112
  • 査読あり
• [雑誌論文] A ribosome-bound quality control complex triggers nascent peptides and signals translation stress (2012)
  • 著者名/発表者名: Brandman, O., Ornstein, JS., Wong, D., Larson, A., Williams, C. C, Li, GW., Zhou, S., King, D., Shen, P S, Weibezahn, J., Dunn, J.q Rouskin, S., Inada, T., Frost, A., Weissman, JS
  • 雑誌名: Cell 巻: 151 号: 5 ページ: 1042-1054
  • DOI: 10.1016/j.cell.2012.10.044
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dom34:Hbs1 Plays a General Role in Quality-Control Systems by Dissociation of a Stalled Ribosome at the 3' End of Aberrant mRNA (2012)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhisa Tsuboi, et al
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 46 号: 4 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.03.013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roles of dom34 : hbs1 in nonstop protein clearance from translocators for normal organelle protein influx. (2012)
  • 著者名/発表者名: Toshiaki Izawa, Tatsuhisa Tsuboi, Kazushige Kuroha, et al.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 2 号: 3 ページ: 447-453
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2012.08.010
  • 査読あり
• [雑誌論文] RACK1 stimulates nascent polypeptide-dependent translation arrest (2010)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Akamatsu, M., Dimitrova, L, lto, T.,Kato, Y Shirahige, K. and lnada. T
  • 雑誌名: EMBO. Rep 巻: 11 号: 12 ページ: 956-961
  • DOI: 10.1038/embor.2010.169
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dual functions of yeast tRNA ligase in the unfolded protein response: unconventional cytoplasmic splicing of HAC1 pre-mRNA is not sufficient to release translational attenuation (2010)
  • 著者名/発表者名: Mori T, Ogasawara C, lnada, T, Englert M, Beier H, Takezawa M, Endo T, Yoshihisa T
  • 雑誌名: Mol. Biol. Cell 巻: 21 号: 21 ページ: 3722-3734
  • DOI: 10.1091/mbc.e10-08-0693
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stmctural Basis for mRNA Surveillance by Archaeal Pelota and GTP-bound EF1α Complex (2010)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K. Kikuno,1. Kuroha, K. Saito, K. Ito, K. Ishitani, R. Inada. T. and Nureki, O
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 107 号: 41 ページ: 17575-17579
  • DOI: 10.1073/pnas.1009598107
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tethering of poly(A) binding protein interferes with non-translated mRNA decay from 5' end in yeast (2010)
  • 著者名/発表者名: Tsuboi, T. and Inada, T
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 285 号: 44 ページ: 33589-33601
  • DOI: 10.1074/jbc.m110.117150
  • 査読あり
• [雑誌論文] RACK1 stimulates nascent polypeptide-dependent translation arrest. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Akamatsu, M., Dimitrova, L., Ito, T., Kato, Y.Shirahige, K., Inada, T.
  • 雑誌名: EMBO Reports 11 ページ: 956-961
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis for mRNA Surveillance by Archaeal Pelota and GTP-bound EF1α Complex. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K.Kikuno, I.Kuroha, K.Saito, K.Ito, K.Ishitani, R.Inada, T., Nureki, O.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA 107 ページ: 17575-17579
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tethering of poly(A) binding protein interferes with non-translated mRNA decay from 5' end in yeast. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tsuboi, T., Inada, T.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 285 ページ: 33589-33601
  • 査読あり
• [雑誌論文] RACK1 stimulates nascent polypeptide-dependent translation arrest (2010)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Akamatsu, M., Dimitrova, L., Ito, T., Kato, Y.Shirahige, K., Inada, T.
  • 雑誌名: EMBO Reports 巻: 11 ページ: 956-961
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis for mRNA Surveillance by Archaeal Pelota and GTP-bound EF1α Complex (2010)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, K.Kikuno, I.Kuroha, K.Saito, K.Ito, K.Ishitani, R.Inada, T., Nureki, O.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA 巻: 107 ページ: 17575-17579
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tethering of poly (A) binding protein interferes with non-translated mRNA decay from 5' end in yeast (2010)
  • 著者名/発表者名: Tsuboi, T., Inada, T
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 巻: 285 ページ: 33589-33601
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upflp stimulates proteasome-mediated degradation of the product derived from the specific nonsense-containing mRNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Tatematsu, T. and lnada, T
  • 雑誌名: EMBO Rep 巻: 10 号: 11 ページ: 1265-1271
  • DOI: 10.1038/embor.2009.200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nascent peptide-dependent translation arrest leads to not4p-mediated protein degradation by the proteasome (2009)
  • 著者名/発表者名: Dimitrova, L, Kuroha, K., Tatematsu, T. and lnada, T
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 284 号: 16 ページ: 10343-10352
  • DOI: 10.1074/jbc.m808840200
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nucleolar structure and function regulated by a deubiquitinating enzyme USP36 (2009)
  • 著者名/発表者名: Endo, A., Matsumoto, M, Inada. T., Yamamoto, A., Nakayama, K.I., Kitamura, N. and Komada, M
  • 雑誌名: J. Cell. Sci 巻: 122 号: 5 ページ: 678-685
  • DOI: 10.1242/jcs.044461
  • 査読あり
• [雑誌論文] I Analysis of nonstop mRNA translation in the absence of tmRNA in E.coli (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Horiguchi, N., Aiba, H. and Inada, T
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 14 ページ: 739-749
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upf1p stimulates proteasome-mediated degradation of the product derived from the specific nonsense-containing mRNA. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Tatematsu, T., Inada, T.
  • 雑誌名: EMBO Reports 10 ページ: 1265-1271
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nascent peptide-dependent translation arrest leads to not4p-mediated protein degradation by the proteasome. (2009)
  • 著者名/発表者名: Dimitrova, N., Kuroha, K., Tatematsu, T., Inada, T.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 284 ページ: 10343-10352
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of nonstop mRNA translation in the absence of tmRNA in E.coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Horiguchi, N., Aiba, H., Inada, T.
  • 雑誌名: Genes to Cells 14 ページ: 739-749
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upflp stimulates proteasome-mediated degradation of the product derived from the specific nonsense-containing mRNA. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Tatematsu, T., Inada, T.
  • 雑誌名: EMBO report 10 ページ: 1265-1271
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of nonstop mRNA translation in the absence of tmRNA in E.coli. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kuroha, K., Horiguchi, N., Aiba, H., *Inada, T.
  • 雑誌名: Genes to Cells 14 ページ: 739-749
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nascent peptide-dependent translation arrest leads to not 4 p-mediated protein degradation by the proteasome (2009)
  • 著者名/発表者名: Dimitrova, L., Kuroha, K., Tatematsu, T. and Inada, T.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 284 ページ: 10343-10352
  • 査読あり
• [雑誌論文] Semaphorin controls epidermal morphogenesis by stimulating mRNA translation via eIF2a in Caenorhabditis elegans (2008)
  • 著者名/発表者名: Nukazuka, A., Fujisawa, H., Inada, T., Oda, Y, Takagi, S
  • 雑誌名: Genes Dev 巻: 22 号: 8 ページ: 1025-1036
  • DOI: 10.1101/gad.1644008
  • 査読あり
• [雑誌論文] Semaphorin controls epidermal morphogenesis by stimulating mRNA translation via eIF2a in C.elegans. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nukazuka, A.Fujisawa, H.Inada, T.Oda, Y.Takagi, S.
  • 雑誌名: Genes Dev. 22 ページ: 1025-1036
  • 査読あり
• [学会発表] Protein quality control systems coupled with No-Go and Non-Stop mRNA surveillance in yeast (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Quality control
  • 発表場所: Heidelberg, Germany
  • 年月日: 2012-09-19
• [学会発表] Dom34:Hbs1 Plays a General Role in Quality Control Systems by Dissociation of a Stalled Ribosome at the 3’ End of Aberrant mRNA (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Protein synthesis and translational control
  • 発表場所: CSH, NY, USA
  • 年月日: 2012-09-04
• [学会発表] Stalled ribosomes induce the degradation of aberrant mRNA and protein (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: FASB meeting mechanism of mRNA decay
  • 発表場所: Colorado, USA
  • 年月日: 2012-06-24
• [学会発表] Stalled ribosomes induce mRNA and protein quality control systems (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Jacques Monod conferences 25th anniversary
  • 発表場所: Roscoff, France
  • 年月日: 2012-06-02
• [学会発表] 終止コドン非依存サブユニット解離による異常mRNA分解促進機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 坪井達久、池内健、黒羽一誠、鹿島勲、工藤和兵、牧野志保、井上絵里、稲田利文
  • 学会等名: Ribosome meeting
  • 発表場所: 広島、日本
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] Novel roles of Dom34:Hbs1 and RACK1 in mRNA quality control systems (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド、神戸
• [学会発表] Protein quality control systems coupled with No-Go and Non-Stop mRNA surveillance in yeast (2012)
  • 著者名/発表者名: Inada. T
  • 学会等名: EMBO meeting on 'Quality control'
  • 発表場所: EMBL, Heidelberg, Germany
• [学会発表] Dom34:Hbs1 Plays a General Role in Quality Control Systems by Dissociation of a Stalled Ribosome at the 3'End of Aberrant mRNA (2012)
  • 著者名/発表者名: Inada, T
  • 学会等名: Protein synthesis and translational control
  • 発表場所: Cold Spring Harbor, NewYork, USA
• [学会発表] Quality control of mRNA and protein in eukaryotes (2012)
  • 著者名/発表者名: Inada, T
  • 学会等名: The 22nd CDB meeting on"RNA Sciences in Cell and Developmental Biology II
  • 発表場所: Kobe, Japan
• [学会発表] Stalled ribosomes induce mRNA and protein quality control systems (2012)
  • 著者名/発表者名: Inada, T
  • 学会等名: Jacques Monod conferences 25th anniversary
  • 発表場所: Roscoff, France
• [学会発表] The mechanism of quality control coupled with translation arrest in yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Toshifumi Inada
  • 学会等名: ISNAC2011
  • 発表場所: 札幌、日本(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-10
• [学会発表] RNAの識別と管理-自己、異常な自己、そして非自己- (2011)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: フォーラムinドージン
  • 発表場所: 熊本、日本(招待講演)
  • 年月日: 2011-11-04
• [学会発表] Dual function of Dom34:Hbs1 complex in mRNA clearance coupled with translation arrest in yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Toshifumi Inada
  • 学会等名: Protein Synthesis and Translational Control Meeting
  • 発表場所: EMBL, Heidelberg, Germany
  • 年月日: 2011-09-08
• [学会発表] The novel roles of Dom34:Hbs1 complex in No-Go-Decay quality control systems in yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhisa Tsuboi, Isao Kashima, Kazushige Kuroha, Shiho Makino, Kazuhei Kudo, Toshifumi Inada
  • 学会等名: mRNA processing Meeting
  • 発表場所: CSHL, NY, USA
  • 年月日: 2011-08-24
• [学会発表] Dual functions of Dom34:Hbs1 complex in mRNA clearance coupled with translation arrest in yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Toshifumi Inada
  • 学会等名: RNA Society Meeting 2011
  • 発表場所: Kyoto, Japan
  • 年月日: 2011-06-17
• [学会発表] 1W20 異常翻訳の認識と品質管理機構におけるDom34/Hbs1複合体の新たな役割 (2010)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: BMB2010(日本分子生物学会・日本生化学会、合同年会)
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 1W20 翻訳の分子基盤からRNA品質管理機構の理解へ (2010)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: BMB2010(日本分子生物学会・日本生化学会、合同年会)
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 2010-12-07
• [学会発表] 40S-ribosome-bound RACK1 functions in nascent peptide-dependent translation arrest that leads to Dom34/Hbs1-independent NGD (2010)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Translational Control Meeting
  • 発表場所: CSHL, NY, USA
  • 年月日: 2010-09-15
• [学会発表] Rack1 participates in nascent polypeptide-dependent translation arrest (2010)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Ribosome 2010
  • 発表場所: Orvieto, Italy
  • 年月日: 2010-05-15
• [学会発表] 12S12p 多様性と非対称性を獲得するRNAプログラム「新生ポリペプチド鎖依存翻訳アレスト因子RACK1の同定」 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会シンポジウム
  • 発表場所: 神戸国際会議場
  • 年月日: 2009-10-22
• [学会発表] 40S ribosome-bound RACK1 functions in nascent peptide-dependent translation arrest (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Translational control meeting
  • 発表場所: EMBL, Hidelberg, Germany
  • 年月日: 2009-09-05
• [学会発表] 40S ribosome-bound RACK1 functions in nascent peptide-dependent translation arrest that leads to Hbs1/Dom34-independent NGD (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 学会等名: Eukaryotic mRNA processing
  • 発表場所: CSHL, NY, USA
  • 年月日: 2009-08-20
• [学会発表] Nascent peptide-dependent translation arrest leads to Not 4 p-mediated protein degradation by the proteasome (2008)
  • 著者名/発表者名: Kazushige Kuroha, Lyudmil Dimitrova, Tsuyako Tatematsu, Toshifumi Inada
  • 学会等名: BMB2008
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [図書] 「RNA品質管理機構iにおける停滞リボソーム解離複合体の普遍的機能」 生化学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 日本生化学学会
• [図書] 「RNA品質管理機構とあらたな遺伝子疾患治療薬の開発」医学のあゆみ『RNA医学・医療一あらたな診断治療を拓く』 (2011)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 医歯薬出版株式会社
• [図書] 蛋白質核酸酵素増刊号『mRNAプログラムー多様性と非対称性の獲得戦略一』 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文、大野睦人編
  • 出版者: 共立出版
• [図書] 多様性と非対称性を獲得するRNAプログラム(概論:遺伝子発現制御の中核をなすRNAプログラム)(蛋白質核酸酵素増刊号) (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 共立出版社
• [図書] 多様性と非対称性を獲得するRNAプログラム(RNAプログラムを支える品質管理機構)(蛋白質核酸酵素増刊号) (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 共立出版社
• [図書] 蛋白質核酸酵素増刊号『多様性と非対称性を獲得するRNAプログラム』 (2009)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 共立出版
• [図書] 「転写後制御を標的とした遺伝子疾患治療一異常mRNAから正常なタンパク質を合成させる低分子化合物」実験医学増刊『RNAの機能解明と医療応用』 (2008)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 羊土社
• [図書] 「mRNAの動態とプロテアソーム」実験医学増刊『タンパク質の分解機構』 (2008)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 羊土社
• [図書] RNAの機能解明と医療応用(転写後制御を標的とした遺伝子疾患治療─異常mRNAから正常なタンパク質を合成させる低分子化合物)(実験医学増刊) (2008)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 羊土社
• [図書] タンパク質の分解機構(実験医学増刊)(mRNAの動態とプロテアソーム) (2008)
  • 著者名/発表者名: 稲田利文
  • 出版者: 羊土社
• [備考]
• [備考] 遺伝子制御薬学分野HP
  • URL: http://www.pharm.tohoku.ac.jp/~idenshi/inada_lab_HP/HOME(Japanese).html
• [備考]
  • URL: http://www.pharm.tohoku.ac.jp/~idenshi/idenshi-j.shtml
• [備考]
  • URL: http://web.me.com/toshiinada/Inada_Lab/Home.html
• [備考]
  • URL: http://www.org.kobe-u.ac.jp/rna/