遺伝情報収納のダイナミクス

• 研究領域: 遺伝情報収納・発現・継承の時空間場
• 研究課題/領域番号: 20114003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 早稲田大学
• 研究代表者: 大山 隆 早稲田大学, 教育・総合科学学術院, 教授 (60268513)
• 研究期間 (年度): 2008-11-13 – 2013-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 126,230千円 (直接経費: 97,100千円、間接経費: 29,130千円); 2012年度: 21,060千円 (直接経費: 16,200千円、間接経費: 4,860千円); 2011年度: 21,060千円 (直接経費: 16,200千円、間接経費: 4,860千円); 2010年度: 21,060千円 (直接経費: 16,200千円、間接経費: 4,860千円); 2009年度: 29,380千円 (直接経費: 22,600千円、間接経費: 6,780千円); 2008年度: 33,670千円 (直接経費: 25,900千円、間接経費: 7,770千円)
• キーワード: 遺伝情報の収納 / 細胞核 / クロマチン / 染色体 / 核内局在 / 遺伝子発現 / DNAメチル化 / 細胞分化 / マウスES細胞 / 分化誘導 / マイクロインジェクション / 肝細胞特異的遺伝子 / ゲノム / DNA物性 / DNA高次構造 / 自己集合

研究概要

細胞核における遺伝子・DNAの収納原理を探究した。最大の成果として、出芽酵母の間期染色体の構造を決定する主要な因子がDNA物性と細胞核の大きさであることを解明した。また、同一配列DNAを有するヌクレオソーム間の集合能は、互いに異なるDNAを有するヌクレオソーム間の集合能よりも強いことを見出した。以上から、遺伝子・DNAの核内収納において、DNA物性、ヌクレオソームの選択的集合能、細胞核のサイズが決定的に重要な因子であることが明らかになった。また、メチル化されるDNA配列のほとんどは、メチル化後、高次構造または物性の変化を示すことが分かり、DNAの核内収納におけるメチル化の関与も示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Positions of pluripotency genes and hepatocyte-specific genes in the nucleus before and after mouse ES cell differentiation (2014)
  • 著者名/発表者名: Udagawa, K. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Genet. Mol. Res 巻: 13 号: 1 ページ: 1979-1988
  • DOI: 10.4238/2014.march.24.2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Selective association between nucleosomes with identical DNA sequences (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 41 号: 3 ページ: 1544-1554
  • DOI: 10.1093/nar/gks1269
  • 査読あり
• [雑誌論文] S-like ribonuclease gene expression in carnivorous plants (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishimura, E., Kawahara, M., Kodaira, R., Kume, M., Arai, N., Nishikawa, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Planta 巻: 238 号: 5 ページ: 955-967
  • DOI: 10.1007/s00425-013-1945-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Most methylation-susceptible DNA sequences in human embryonic stem cells undergo a change in conformation or flexibility upon methylation (2013)
  • 著者名/発表者名: Shimooka, Y., Nishikawa, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52 号: 8 ページ: 1344-1354
  • DOI: 10.1021/bi301319y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regions of Unusually High Flexibility Occur Frequently in Human Genomic DNA (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H., Kageyama, D., Furuya, M., Sugiyama, S., Murata, N. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ， Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ， ａｎｄ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ 巻: 77 号: 3 ページ: 612-617
  • DOI: 10.1271/bbb.120850
  • NAID: 10031164784
  • ISSN: 0916-8451, 1347-6947
  • 査読あり
• [雑誌論文] The genome folding mechanism in yeast (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura H, Shimooka Y, Nishikawa J, Miura O, Sugiyama S, Yamada S, Ohyama T.
  • 雑誌名: J. Biochemistry 巻: 154 号: 2 ページ: 137-147
  • DOI: 10.1093/jb/mvt033
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intrinsic homology-sensing and assembling property of chromatin fiber (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa, J., Shimooka, Y. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Meiosis (Bernstein, H. and Bernstein, C. (eds.)) (InTech)
  • DOI: 10.5772/56548
  • ISBN: 9789535111979
• [雑誌論文] Selective association between nucleosomes with identical DNA sequences. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 41 ページ: 1544-1554
  • 査読あり
• [雑誌論文] Most methylation-susceptible DNA sequences in human embryonic stem cells undergo a change in conformation or flexibility upon methylation. (2013)
  • 著者名/発表者名: Shimooka, Y., Nishikawa, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52 ページ: 1344-1354
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regions with unusually high flexibility occur frequently in human genomic DNA. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H., Kageyama, D., Furuya, M., Sugiyama, S., Murata, N. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Biosci. Biotechnol. Biochem. 巻: 77 ページ: 612-617
  • 査読あり
• [雑誌論文] Positions of pluripotency genes and hepatocyte-specific genes in the nucleus before and after mouse ES cell differentiation. (2013)
  • 著者名/発表者名: Udagawa, K. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Genet. Mol. Res. 巻: /
  • 査読あり
• [雑誌論文] The genome folding mechanism in yeast. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H., Shimooka, Y., Nishikawa, J., Miura, O., Sugiyama, S., Yamada, S. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: J. Biochemistry 巻: /
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nuclear localization of reporter genes activated by curved DNA (2012)
  • 著者名/発表者名: Udagawa, K., Kimura, H., Tanabe, H. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: J. Biosci. Bioeng 巻: 113 号: 4 ページ: 431-437
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2011.11.022
  • NAID: 110009444545
  • 査読あり
• [雑誌論文] A designed curved DNA sequence remarkably enhances transgene expression from plasmid DNA in mouse liver. (2012)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, S., Kanda, G., Tanase, J., Harashima, H., Ohyama, T. and Kamiya, H.
  • 雑誌名: Gene Therapy 巻: 19 ページ: 828-835
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nuclear localization of reporter genes activated by curved DNA. (2012)
  • 著者名/発表者名: Udagawa, K., Kimura, H., Tanabe, H. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: J. Biosci. Bioeng. 巻: 113 ページ: 431-437
  • NAID: 110009444545
  • 査読あり
• [雑誌論文] Competence of an artificial bent DNA as a transcriptional activator in mouse ES cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., Mitani, T., Udagawa, K., Nishikawa, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Mol. Biol. Rep 巻: 38 号: 1 ページ: 37-47
  • DOI: 10.1007/s11033-010-0075-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Competence of an artificial bent DNA as a transcriptional activator in mouse ES cells. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., Mitani, T., Udagawa, K., Nishikawa, J., Ohyama, T.
  • 雑誌名: Mol.Biol.Rep. 38 ページ: 37-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Competence of an artificial bent DNA as a transcriptional activator in mouse ES cells. (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., 中3名, Ohyama, T.
  • 雑誌名: Mol.Biol.Rep. 巻: 38 ページ: 37-47
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly efficient chromatin transcription induced by superhelically curved DNA segments: the underlying mechanism revealed by a yeast system (2010)
  • 著者名/発表者名: Tanase J, Morohashi N, Fujita M, Nishikawa J, Shimizu M, and Ohyama T
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 49 号: 11 ページ: 2351-2358
  • DOI: 10.1021/bi901950w
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly efficient chromatin transcription induced by superhelically curved DNA segments : the underlying mechanism revealed by a yeast system. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., Morohashi, N., Fujita, M., Nishikawa, J., Shimizu, M., Ohyama, T.
  • 雑誌名: Biochemistry 49 ページ: 2351-2358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Highly efficient chromatin transcription induced by superhelically curved DNA segments : the underlying mechanism revealed by a yeast system. (2010)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., 中4名, Ohyama, T.
  • 雑誌名: Biochemistry 49 ページ: 2351-2358
  • 査読あり
• [雑誌論文] ゲノムDNAはいかにして折り畳まれるか-DNA物性とゲノム収納- (2009)
  • 著者名/発表者名: 大山隆, 木村元, 下岡保俊
  • 雑誌名: 実験医学増刊号「細胞核-遺伝情報制御と疾患」 巻: 27 ページ: 2715-2722
• [雑誌論文] The human actin-related protein hArp5 : nucleo-cytoplasmic shuttling and involvement in DNA repair (2009)
  • 著者名/発表者名: Kitayama, K., Kamo, M., Oma, Y., Matsuda, R., Uchida, T., Ikura, T., Tashiro, S., Ohyama,T., Winsor, B. and Harata, M.
  • 雑誌名: Exp. Cell Res 巻: 315 号: 2 ページ: 206-217
  • DOI: 10.1016/j.yexcr.2008.10.028
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effects of carriers on transgene expression from plasmids containing a DNA sequence with high histone affinity. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kamiya, H., Fukunaga, S., Ohyama, T., Harashima, H.
  • 雑誌名: Int.J.Pharm. 376 ページ: 99-103
  • NAID: 120001364374
  • 査読あり
• [雑誌論文] The human actin-related protein hArp5 : nucleo-cytoplasmic shuttling and involvement in DNA repair. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kitayama, K., Kamo, M., Oma, Y., Matsuda, R., Uchida, T., Ikura, T., Tashiro, S., Ohyama, T., Winsor, B., Harata, M.
  • 雑誌名: Exp.Cell Res. 315 ページ: 206-217
  • 査読あり
• [雑誌論文] ゲノムDNAはいかにして折り畳まれるか-DNA物性とゲノム収納- (2009)
  • 著者名/発表者名: 大山隆, 木村元, 下岡保俊
  • 雑誌名: 実験医学増刊号「細胞核-遺伝情報制御と疾患」 27 ページ: 35-42
• [雑誌論文] The human actin-related protein hArp5 : nucleo-cytoplasmic shuttling and involvement in DNA repair. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kitayama, K., 中6名, Ohyama, T., Winsor, B., Harata, M.
  • 雑誌名: Exp. Cell Res. 315 ページ: 206-217
  • 査読あり
• [雑誌論文] ゲノムDNAはいかにして折り疊まれるか-DNA物性とゲノム収納- (2009)
  • 著者名/発表者名: 大山隆, 木村元, 下岡保俊
  • 雑誌名: 実験医学増刊号「細胞核-遺伝情報制御と疾患」 27 ページ: 35-42
• [雑誌論文] 酵母のヌクレオソームDNAに共通した機械的特性 (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 20 号: 1/2 ページ: 37-40
  • DOI: 10.2978/jsas.20.37
  • NAID: 130004487834
  • ISSN: 0915-5651, 1881-3917
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNAの高次構造と物理的特性に印された遺伝情報 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大山隆
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 巻: 53 ページ: 1-11
  • NAID: 40015771159
• [雑誌論文] A common mechanical property shared by yeast nucleosomal DNAs. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: J. Adv. Sci. 20 ページ: 37-40
  • NAID: 130004487834
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and functional characteristics of S-like ribonucleases from carnivorous plants
  • 著者名/発表者名: Nishimura, E., Jumyo, S., Arai, N., Kanna, K., Kume, M., Nishikawa, J., Tanase, J. and Ohyama, T.
  • 雑誌名: Planta 巻: (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] DNA sequence-dependent self-assembling property of chromatin fiber (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa J., Shimooka Y. and Ohyama T.
  • 学会等名: The 2013 ASCB annual meeting
  • 発表場所: New Orleans
• [学会発表] Intrinsic homology-sensing and assembling property of chromatin (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T.
  • 学会等名: 23^<rd> Wilhelm Bernhard Workshop on the cell nucleus
  • 発表場所: Debrecen
• [学会発表] Self-organizing and self-assembling properties of chromatin fiber (2013)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T.
  • 学会等名: 1st Singapore-Japan-India Joint Symposium on Protein-DNA interactions in prokaryotic nucleoid and eukaryotic chromatin
  • 発表場所: Singapore
  • 招待講演
• [学会発表] Characteristics of DNA in meiotic recombination hotspots (2012)
  • 著者名/発表者名: Miura O., Kimura H., Ogake T. and Ohyama T.
  • 学会等名: 2012 Annual Meeting of the American Society for Cell Biology
  • 発表場所: San Francisco
• [学会発表] ヒト21番染色体におけるDNA物性特異領域の配置 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池田美奈子、関瑞穂、木村元、大山隆
  • 学会等名: 平成24年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 群馬
• [学会発表] 特殊DNA構造のゲノム内分布とヌクレオソーム配置 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大懸俊廣、三浦理、木村元、大山隆
  • 学会等名: 平成24年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 群馬
• [学会発表] 遺伝子の核内局在に影響を及ぼす構造因子 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宇田川紘司、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 食虫植物のS-likeリボヌクレアーゼ：捕虫様式と遺伝子発現制御機構との関係 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、久米茉莉奈、荒井直樹、寿命伸哉、安武奏大、野崎直仁、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 核内イオン環境の変化によるマウスES細胞の分化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 棚瀬潤一、木下誠、大懸俊廣、草薙哲成、柴田彰之、末盛博文、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] メチル化に伴うDNAの高次構造変化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 下岡保俊、大懸俊廣、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 特殊DNA構造とヌクレオソーム配置の関係：各種生物を用いたゲノムワイドな解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 大懸俊廣、三浦理、木村元、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 同一DNAをもつヌクレオソームの自己集合 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西川純一、下岡保俊、清水貴行、永井尚美、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] ゲノム折り畳みに見られる自己組織化原理 (2012)
  • 著者名/発表者名: 木村元、西川純一、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会 シンポジウム「自己組織化と生命：分子と生命をつなぐ架け橋」
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 減数分裂期組換えホットスポットのDNA特性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三浦理、木村元、大懸俊廣、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] ヒトゲノムDNAの物性特異領域と間期染色体構造の関係 (2012)
  • 著者名/発表者名: 関瑞穂、池田美奈子、三好晶子、酒井陽太、木村元、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] 分裂期ヒト染色体におけるDNA物性特異領域の配置 (2012)
  • 著者名/発表者名: 池田美奈子、関瑞穂、酒井陽太、三好晶子、木村元、大山隆
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] DNAのメチル化がクロマチン繊維の自己集合能におよぼす影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西川 純一、下岡保俊、大山隆
  • 学会等名: 第29回 染色体ワークショップ
  • 発表場所: 淡路
• [学会発表] Structure of yeast interphase chromosomes and the genome folding principle. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T., 他8名
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji
  • 年月日: 2011-06-24
• [学会発表] Structure of yeast interphase chromosomes and the genome folding principle (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T., 中7名, Yamada S.
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji
  • 年月日: 2011-01-24
• [学会発表] The prime determinants of interphase chromosome structures (2011)
  • 著者名/発表者名: Kimura H., Shimooka Y., Nishikawa J., Miura O., Yamada S., Ohyama T.
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji
  • 年月日: 2011-01-24
• [学会発表] Sequence-dependent selective interaction between nucleosomes (2011)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa J., Ohyama T.
  • 学会等名: International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
  • 発表場所: Awaji
  • 年月日: 2011-01-24
• [学会発表] ヌクレオソーム間の選択的相互作用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 西川純一、大山隆
  • 学会等名: 第28回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 加賀
  • 年月日: 2011-01-12
• [学会発表] 出芽酵母間期染色体の三次元構造とゲノム折り畳み原理 (2011)
  • 著者名/発表者名: 木村元、下岡保俊、西川純一、三浦理、山田修司、大山隆
  • 学会等名: 第28回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 加賀
  • 年月日: 2011-01-12
• [学会発表] The genome folding principle as revealed by modelling of yeast interphase chromosomes (2011)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T.
  • 学会等名: The 22ndWilhelm Bernhard Workshop
  • 発表場所: Latvia
• [学会発表] The genome folding principle in yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: Kimura H., Shimooka Y., Nishikawa J., Miura O., Sugiyama S., Yamada S. and Ohyama T.
  • 学会等名: The 22nd Wilhelm Bernhard Workshop
  • 発表場所: Latvia
• [学会発表] Structural and physical properties of methylated DNA (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimooka Y. and Ohyama T.
  • 学会等名: The 22ndWilhelm Bernhard Workshop
  • 発表場所: Latvia
• [学会発表] Three-dimensional architecture of chromatin fibers in the interphase nucleus. (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura H., 中4名, Ohyama T.
  • 学会等名: The American Society for Cell Biology 50th Annual Meeting
  • 発表場所: Philadelphia
  • 年月日: 2010-12-13
• [学会発表] DNA flexibility maps of eukaryotic genomes (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura H., Miura O., Arakawa J., Seki M., Yamada S., Ohyama T.
  • 学会等名: The American Society for Cell Biology 50th Annual Meeting
  • 発表場所: Philadelphia
  • 年月日: 2010-12-13
• [学会発表] 間期クロマチンの三次元構造とゲノム収納の原理 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大山隆、木村元、下岡保俊、西川純一、三浦理、荒川潤、横尾岳大、関瑞穂
  • 学会等名: BMB2010ワークショップ「クロマチンと染色体の構造:学際的アプローチによる挑戦」
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] 間期クロマチン三次元構造の構築原理 (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村元、下岡保俊、西川純一、三浦理、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-10
• [学会発表] DNAの機械的特性と遺伝子機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 三浦理、木村元、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] メチル化DNAの高次構造と物性 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下岡保俊、杉山滋、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] ヌクレオソームの自己集合 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西川純一、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 正の超らせんを擬態したベントDNA上に形成されるヌクレオソーム (2010)
  • 著者名/発表者名: 佐藤有吾、西川純一、駒知明、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 核内イオン環境の変化が細胞分化に及ぼす影響 (2010)
  • 著者名/発表者名: 横尾岳大、松村祐紀、末盛博文、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-09
• [学会発表] 食虫植物のS-likeリボヌクレアーゼ:その発現様式と生物学的意義 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、堀内沙織、漢那憲祐、野崎直仁、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] ゲノムにおける物性の特異領域とその生物学的意義 (2010)
  • 著者名/発表者名: 荒川潤、関瑞穂、木村元、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] 人工ベントDNAにより活性化されたトランスジーンの核内局在 (2010)
  • 著者名/発表者名: 宇田川紘司、棚瀬潤一、田辺秀之、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] クロマチン構造の人為的改変による遺伝子の高効率発現 (2010)
  • 著者名/発表者名: 棚瀬潤一、宇田川紘司、西川純一、大山隆
  • 学会等名: BMB2010第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2010-12-08
• [学会発表] ヌクレオソームの自己集合 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西川純一, 浅野士郎, 大山隆
  • 学会等名: 第9回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 修善寺
  • 年月日: 2010-05-27
• [学会発表] 食虫植物の生存戦略:環境応答遺伝子の転用とその発現のエピジェネティクス (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、堀内沙織、漢那憲祐、野崎直仁、大山隆
  • 学会等名: 第9回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 修善寺
  • 年月日: 2010-05-27
• [学会発表] ゲノム収納の原理とクロマチン織維の基本構造 (2010)
  • 著者名/発表者名: 大山隆、古屋美香、荒川潤、木村元、下岡保俊、西川純一、浅野士郎、杉山滋
  • 学会等名: 第27回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 御殿場
  • 年月日: 2010-01-22
• [学会発表] ヌクレオソームの自己集合 (2010)
  • 著者名/発表者名: 浅野士郎、西川純一、大山隆
  • 学会等名: 第27回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 御殿場
  • 年月日: 2010-01-21
• [学会発表] 間期クロマチン構造のin silicoモデリング (2010)
  • 著者名/発表者名: 木村元、下岡保俊、西川純一、三浦理、杉山滋、大山隆
  • 学会等名: 第27回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 御殿場
  • 年月日: 2010-01-21
• [学会発表] イオン環境とDNAの空間的拡がり (2010)
  • 著者名/発表者名: 下岡保俊、木村元,杉山滋、大山隆
  • 学会等名: 第27回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 御殿場
  • 年月日: 2010-01-21
• [学会発表] ヒトゲノムの物理的特性とクロマチン構造 (2010)
  • 著者名/発表者名: 古屋美香、荒川潤、木村元、景山大、堀哲也、深川竜郎、大山隆
  • 学会等名: 第27回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 御殿場
  • 年月日: 2010-01-21
• [学会発表] Three-dimensional architecture of chromatin fibers in the interphase nucleus (2010)
  • 著者名/発表者名: Kimura H., Shimooka Y., Nishikawa J., Miura O., Yamada S. and Ohyama T.
  • 学会等名: The American Society for Cell Biology 50th Annual Meeting
  • 発表場所: Philadelphia
• [学会発表] Self-assembly of nucleosomes (2010)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa J. and Ohyama T.
  • 学会等名: The American Society for Cell Biology 50th Annual Meeting
  • 発表場所: Philadelphia
• [学会発表] S-like RNase gene expression in carnivorous plants (2010)
  • 著者名/発表者名: Nishimura E., Horiuchi S., Nozaki N. and Ohyama T.
  • 学会等名: The American Society for Cell Biology 50th Annual Meeting
  • 発表場所: Philadelphia
• [学会発表] ゲノム収納の原理とクロマチン織維の基本構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 大山隆、木村元、古屋蔓香、荒川潤、下岡保俊、杉山滋
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] 正の超らせんを擬態したベントDNAのゲノム内分布 (2009)
  • 著者名/発表者名: 佐藤有吾、木村元、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] 食虫植物S-likeリボヌクレアーゼ遺伝子の発現とエピジェネティクス (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、堀内沙織.漠那憲祐、上田展、大山隆
  • 学会等名: 築32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] ハエトリソウにおけるS-likeリボヌクレアーゼ遺伝子の発現制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 堀内沙織、西村恵美、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-12
• [学会発表] ヌクレオソームの自己集合 (2009)
  • 著者名/発表者名: 浅野士郎、西川純一、佐藤有吾、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 間期クロマチン構造のin silicoモデリング (2009)
  • 著者名/発表者名: 木村元、下岡保俊、三浦理、杉山滋、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] クロマチン工学による外来遺伝子の安定的発現 (2009)
  • 著者名/発表者名: 棚瀬潤一、宇田川紘司、西川純一、三谷匡、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 遺伝子発現に有利なクロマチン構造の人為的構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 伊藤美月、棚瀬潤一、山内恵理、清水光弘、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 人工ベントDNAにより活性化されたトランスジーンの核内局在:HeLa細胞を用いた解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 山本拓弥、宇田川紘司、松村祐紀、横屋岳大、深川竜郎、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 人工ベントDNAにより活性化されたトランスジーンの核内局在:マウスES細胞を用いた解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 宇田川紘司、山本拓弥、棚瀬潤一、深川竜郎、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] ヒトゲノムDNAにおける物性特異領域の生物学的意義:動態解析の試み (2009)
  • 著者名/発表者名: 景山大、中田勇人、木村元、古屋美香、荒川潤、深川竜郎、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] ヒトゲノムの物理的特性とクロマチン構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 古屋美香、荒川潤、木村元、景山大、堀哲也、深川竜郎、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] 出芽酵母におけるDNA構造による遺伝子発現とクロマチン構造の制御 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤田仁、諸橋伸行、棚瀬潤一、大山隆、清水光弘
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] イオン環境とDNAの空間的拡がり (2009)
  • 著者名/発表者名: 下岡保俊、木村元、杉山滋、大山隆
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] 食虫植物の生存戦略:環境応答遺伝子の食虫機構への転用 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、堀内沙織、大山隆
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-24
• [学会発表] 間期細胞核におけるクロマチン織維の構造 (2009)
  • 著者名/発表者名: 木村元、下岡保俊、杉山滋、大山隆
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 3D structure of 10nm chromatin fiber deduceu from DNA flexibility (2009)
  • 著者名/発表者名: Kimura, H., Shimooka, Y., Sugiyama, S., Ohyama, T.
  • 学会等名: The Wilhelm Bernhard Workshop 21st International Workshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] Localization of transgenes activated by an artificial curved DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Udagawa, K., Yamamoto, T., Fukagawa, T., Ohyama, T
  • 学会等名: The Wilhelm Bernhard Workshop 21st International Workshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] Stable transgene expression based on chromatin engineering (2009)
  • 著者名/発表者名: Tanase, J., Udagawa, K., Ohyama, T.
  • 学会等名: The Wilhelm Bernhard Workshop 21st International Workshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
  • 年月日: 2009-09-03
• [学会発表] How genomic DNA is functionally folded in a nucleus. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T., 他6名
  • 学会等名: The Wilhelm Bernhard Workshop 21st International Workshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
  • 年月日: 2009-09-01
• [学会発表] How genomic DNA is functionally folded in a nucleus (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohyama, T., 他6名
  • 学会等名: The Wilhelm Bernhard Workshop 21st International Workshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
  • 年月日: 2009-09-01
• [学会発表] How genomic DNA is functionally folded in a nucleus. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T., 他6名
  • 学会等名: 18th Lake Shirakaba Conference
  • 発表場所: Copenhagen
  • 年月日: 2009-06-20
• [学会発表] How genanic DNA is functionally folded in a nucleus (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohyama, T., 他6名
  • 学会等名: 18th Lake Shirakaba Conference
  • 発表場所: Copenhagen, Denmark
  • 年月日: 2009-06-20
• [学会発表] ツルギバモウセンゴケda-l遺伝子発現のエピジェネティクス (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、堀内沙織、大山隆
  • 学会等名: 第8回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 修善寺
  • 年月日: 2009-06-18
• [学会発表] クロマチン繊維の自己組識化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 木村元、下岡保俊、古屋美香、景山大、杉山滋、大山隆
  • 学会等名: 第26回染色体ワークショップ
  • 発表場所: 姫路
  • 年月日: 2009-01-26
• [学会発表] How genomic DNA is functionally folded in a nucleus (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T., Kimura H., Shimooka Y., Kageyama D., Furuya M., Udagawa K. and Tanase J.
  • 学会等名: TheWilhelm Bernhard Workshop 21st InternationalWorkshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
• [学会発表] 3D structure of 10 nm chromatin fiber deduced from DNA flexibility (2009)
  • 著者名/発表者名: Kimura H., Shimooka Y., Sugiyama S. and Ohyama T.
  • 学会等名: TheWilhelm Bernhard Workshop 21st InternationalWorkshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
• [学会発表] Localization of transgenes activated by an artificial curved DNA (2009)
  • 著者名/発表者名: Udagawa K., Yamamoto T., Fukagawa T. and Ohyama T.
  • 学会等名: TheWilhelm Bernhard Workshop 21st InternationalWorkshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
• [学会発表] Stable transgene expression based on chromatin engineering (2009)
  • 著者名/発表者名: Tanase J., Udagawa K. and Ohyama T.
  • 学会等名: TheWilhelm Bernhard Workshop 21st InternationalWorkshop on the Cell Nucleus
  • 発表場所: Ustron, Poland
• [学会発表] How genomic DNA is functionally folded in a nucleus (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohyama T., Kimura H., Kageyama D., Furuya M., Shimooka Y., Udagawa K. and Tanase J.
  • 学会等名: 18th Lake Shirakaba Conference
  • 発表場所: Copenhagen
  • 招待講演
• [学会発表] ハエトリソウS-like RNase遺伝子の構造と発現 (2008)
  • 著者名/発表者名: 小平玲菜、西村恵美、堀内沙繊、岡部隆宏、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] フクロユキノシタS-like RNase遺伝子の構造と発現 (2008)
  • 著者名/発表者名: 西村恵美、小平玲菜、堀内沙織、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] ゲノムの階層的折り畳みの基盤となるDNA物性 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大山隆、木村元、景山大、古屋美香、深川竜郎、浅野士郎
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)シンポジウム「クロマチンを基盤とした遺伝情報の収納と発現」
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] 真核生物ゲノムのDNA物性とクロマチン基盤構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 木村元、景山大、古屋美香、村田昇、下岡保俊、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回本分子生物学会年会・第81回本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] ヒトゲノムの物理的特性と染色体構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 古屋美香、景山大、木村元、深川竜郎、荒川潤、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] ヌクレオソームの自己集合 (2008)
  • 著者名/発表者名: 浅野士郎、木村元、佐藤有吾、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] 人工ベントDNAにより活性化された外来遺伝子の核内局在 (2008)
  • 著者名/発表者名: 宇田川紘司、山本拓弥、松村祐紀、深川竜郎、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] 遺伝子発現に有利なクロマチン構造の人為的構築 (2008)
  • 著者名/発表者名: 伊藤美月、棚瀬潤一、山内恵理、清水光弘、大山隆
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] DNA構造によるクロマチンの改変と人為的遺伝子発現制御 : 出芽酵母レポータープラスミドによる解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤田仁、諸橋伸行、棚瀬潤一、大山隆、清水光弘
  • 学会等名: BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] The DNA flexibility maps of eukaryotic genomes. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohyama, T., 他3名.
  • 学会等名: 8th EMBL Transcription Meeting
  • 発表場所: Heidelberg
  • 年月日: 2008-08-23
• [学会発表] ヒト染色体DNAの折り畳み機構に関する研究
  • 著者名/発表者名: 三好 晶子, 池田 美奈子, 大山 隆
  • 学会等名: 平成25年度日本生化学会関東支部例会
  • 発表場所: 甲府
• [学会発表] Self-organizing and self-assembling properties of chromatin fiber
  • 著者名/発表者名: Takashi Ohyama
  • 学会等名: 1st Singapore-Japan-India joint symposium on protein-DNA interactions in prokaryotic nucleoid and eukaryotic chromatin
  • 発表場所: Singapore
  • 招待講演
• [学会発表] Cation-induced differentiation of mouse ES cells
  • 著者名/発表者名: Jun-ichi Tanase, Junki Sagawa, Hirofumi Suemori, Takashi Ohyama
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] 分裂期ヒト染色体におけるDNAの軌道
  • 著者名/発表者名: 池田 美奈子, 三好 晶子, 吉田 快,浦西 桃梨, 松本 大亮, 大山 隆
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] DNA のメチル化がDNAの自己集合能におよぼす影響
  • 著者名/発表者名: 清水 貴行, 下岡 保俊, 池田 桃子, 大山 隆
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] DNAのメチル化がヌクレオソームの自己集合能におよぼす影響
  • 著者名/発表者名: 下岡 保俊, 清水 貴行, 池田 桃子, 大山 隆
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] 間期核におけるヒト染色体DNAの軌道
  • 著者名/発表者名: 三好 晶子, 池田 美奈子, 吉田 快, 松本 大亮, 浦西 桃梨, 大山 隆
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] クロマチン繊維の自己集合能
  • 著者名/発表者名: 大山 隆, 下岡 保俊, 清水 貴行
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] DNA sequence-dependent self-assembling property of chromatin fiber
  • 著者名/発表者名: Jun-ichi Nishikawa, Yasutoshi Shimooka, Takashi Ohyama
  • 学会等名: The 2013 ASCB annual meeting
  • 発表場所: New Orleans
• [図書] Meiosis (Bernstein, H. and Bernstein, C., eds.), chapter title: Intrinsic homology-sensing and assembling property of chromatin fiber. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishikawa, J., Shimooka, Y. and Ohyama, T.
  • 出版者: InTech
• [図書] ベーシックマスター生化学 (2008)
  • 著者名/発表者名: 大山隆監修, 西川一八・清水光弘共編
  • 総ページ数: 427
  • 出版者: オーム社