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土相・水相・気相の三相をまたぐ不規則な環境変動に対するレジリエンス機構

計画研究

研究領域不均一環境変動に対する植物のレジリエンスを支える多層的情報統御の分子機構
研究課題/領域番号 20H05912
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
研究機関名古屋大学

研究代表者

芦苅 基行  名古屋大学, 生物機能開発利用研究センター, 教授 (80324383)

研究分担者 打田 直行  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (40467692)
中園 幹生  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (70282697)
研究期間 (年度) 2020-11-19 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
124,930千円 (直接経費: 96,100千円、間接経費: 28,830千円)
2024年度: 28,600千円 (直接経費: 22,000千円、間接経費: 6,600千円)
2023年度: 28,600千円 (直接経費: 22,000千円、間接経費: 6,600千円)
2022年度: 28,600千円 (直接経費: 22,000千円、間接経費: 6,600千円)
2021年度: 27,040千円 (直接経費: 20,800千円、間接経費: 6,240千円)
2020年度: 12,090千円 (直接経費: 9,300千円、間接経費: 2,790千円)
キーワード低酸素 / 冠水 / レジリエンス / 冠水耐性 / 節間伸長 / 通気組織 / レジリエンス機構 / イネ / シロイヌナズナ / 介在分裂組織 / 深水反応
研究開始時の研究の概要

植物にとって部分冠水による低酸素状態や完全冠水による無酸素状態は死に直結する深刻なストレスである。植物は数分から数日の幅で変動する冠水の長さや強度(程度?)に応じて、多段階に通気組織の発達や茎葉伸長を適切に調節する柔軟な応答機構(段階的なステージゲート応答機構)を持ち合わせている。しかし、植物が環境ストレスの時間や強度をどこでどのように受容し複数の応答からどれを選択し発動するのか?は不明である。本課題では、植物の酸素や水分のストレス感受機構と段階的なステージゲート応答の最適な選択機構を明らかにし、植物の冠水に対するレジリエンス機構の解明を目指す。

研究実績の概要

東南アジアのような洪水多発地域で作付けされる浮イネは、冠水すると節間(茎)を伸長させ葉を水面上に抽出し、酸素や二酸化炭素を摂取することで、過酷な洪水環境でも生存できる。浮きイネの研究を進める中で、浮きイネ品種C9285の葉鞘が紫色に着色していることを観察していた。この葉鞘への着色は、一般的なイネである日本晴やT65では観察されない。浮イネは葉鞘を紫に着色することで茎を遮光し、避陰反応を引き起こすことで、より節間を伸長させているのではないかという仮説を立て研究を進めた。その結果、(1)浮イネの着色が葉鞘の内側特異的であること。(2)2種類のアントシアニン、シアニジン3-O-グリコシドとシアニジン3-O-ルチノシドが高濃度で蓄積すること。(3)浮イネの葉鞘内アントシアニン蓄積の原因遺伝子がアントシアニン生合成遺伝子のDFRであり、浮イネは活性型のDFRを保持しているが、一般的なイネではDFRが機能欠損していること。(4)浮きイネのアントシアニンの蓄積と節間の伸長には正の相関があること。(5)浮イネの葉からの抽出液(アントシアニン)は赤色光をより吸収すること。(6)浮イネの葉鞘が一般的なイネの葉鞘と比べて赤色光をより吸収するが、遠赤色光の吸収はほとんど差がないこと。(7)太陽光の光透過率を波長ごとに比較した結果、アントシアニンを蓄積した浮イネの葉鞘は赤色光を透過しにくいこと。(8)浮イネを白色光および遠赤色光補光条件下で生育させたところ、遠赤色光補光条件では、白色光のみに比べて草丈が著しく高くなり、節間も伸長しており、浮イネが避陰反応を示すことが判明した。以上の結果から、浮イネは葉鞘にアントシアンを蓄積することで、特にFRの少ない水中でも、より赤色光を吸収することで低R/FRの環境を生み出し、避陰反応をうまく利用して環境適応していることが示唆された。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

浮イネは、冠水すると節間を伸長させ、葉を水面上に抽出して、酸素や二酸化炭素を摂取することで過酷な洪水環境でも生存できる。今回、この冠水依存的な節間伸長にアントシアニンが関与していることを明らかにした。具体的には、浮イネは葉鞘の内側に特異的にアントシアニンを蓄積し、葉鞘で覆った節間のRed/Fred比を低下させることで、避難反応を誘導し、より節間が伸長しやすい環境を作り出していることを見いだした。アントシアニンは紫外線吸収作用を持つため、植物はアントシアニンを蓄積することで、紫外線によるDNAのダメージを低減させることが知られていたが、その他の理由はあまり分かっていなかった。今回の研究で、植物がアントシアニンを利用して環境適応性を向上させていることが明らかになった。また、トウモコロシの祖先種であるニカラグアテオシントのROLバリア形成の分子機構を解明するために、トウモロコシ自殖系統Mi29を遺伝背景として、ニカラグアテオシントのROLバリア形成制御遺伝子(RBF1)を含む領域をホモ型で持つ準同質遺伝子系統を用いた根の外層組織特異的なRNA-Seq解析を行い、酸素漏出バリア形成に関与する重要遺伝子を探索した。その結果、ROLバリア形成部位で多くのリグニン生合成関連遺伝子の転写産物量が増加していることが明らかとなった。一方で、スベリン生合成遺伝子に関しては、リグニン生合成遺伝子と比較すると少数ではあったが転写産物量が増加していることが明らかになった。また、前年までにシロイヌナズナを用いた化合物スクリーニングにより、低酸素時に作動する仕組みを介して胚軸伸長を促進すると期待できる低分子化合物を同定していたが、その解析の結果、シロイヌナズナの胚軸がこの化合物の添加時や冠水時に伸長するにはエチレン経路の活性化が必要となることを見出した。以上の様に研究は順調に進んでいる。

今後の研究の推進方策

イネはアジアと西アフリカの2ヶ所で栽培化された穀物である。我々はこれまでアジアの栽培イネ“Oryza sativa”の浮イネを用いて冠水耐性機構の研究を進めてきたが、アフリカの栽培イネ“Oryza glaberrima”の一部にも冠水抵抗性があることが見えてきた。そこでまず国立遺伝学研究所から分譲頂いた147系統のOryza glaberrimaを育成後、冠水処理前後の草丈および節間長を計測したところ、数系統が冠水依存的な節間伸長を示した。中でも1系統は我々がこれまで実験に供試してきたアジアの浮イネ(C9285)に匹敵するほど深水で節間伸長性を示した。そこで、冠水依存的に節間伸長するOryza glaberrima系統と節間伸長しないOryza glaberrima系統を交配しF1を得たのち、世代促進し、F2雑種集団を得た。2023年度はこれらの雑種集団を用いて、冠水依存的な節間伸長のQTL解析を行いアフリカイネの冠水依存的な節間伸長の分子メカニズムの解明を目指し、アジアとアフリカで独立に栽培されたイネの洪水耐性機構の相同性と相違性について研究を進める。
トウモロコシ自殖系統Mi29およびニカラグアテオシントのRBF1遺伝子領域を詳細に調査したところ、Mi29の5’UTR上にMULE型のトランスポゾンが挿入されていることが明らかとなった。今後は、トランスポゾンの挿入起源やトランスポゾンがどのようにRBF1の機能へ影響を及ぼすかについて解析を進める。また、同定した化合物がシロイヌナズナの胚軸を伸長させるにはエチレン応答の活性化が必要となることを見出したが、そもそもシロイヌナズナの胚軸のどの部位にエチレンに対する応答能が存在するのか、化合物添加時や冠水時にそのエチレン応答能がどのように制御されているのかについて解析を進める。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書
  • 2021 実績報告書
  • 2020 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (11件) (うち国際共著 5件、 査読あり 11件、 オープンアクセス 11件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 2件)

  • [雑誌論文] Identification of a pluripotency-inducing small compound, PLU, that induces callus formation via Heat Shock Protein 90-mediated activation of auxin signaling.2023

    • 著者名/発表者名
      Nakashima Y, Kobayashi Y, Murao M, Kato R, Endo H, Higo A, Iwasaki R, Kojima M, Takebayashi Y, Sato A, Nomoto M, Sakakibara H, Tada Y, Itami K, Kimura S, Hagihara S, Torii KU, Uchida N
    • 雑誌名

      Front. Plant Sci.

      巻: 14 ページ: 1099587-1099587

    • DOI

      10.3389/fpls.2023.1099587

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] EPFL peptide signaling ensures robust self‐pollination success under cool temperature stress by aligning the length of the stamen and pistil.2023

    • 著者名/発表者名
      Negoro S, Hirabayashi T, Iwasaki R, Torii KU, Uchida N
    • 雑誌名

      Plant Cell Environ.

      巻: 46 号: 2 ページ: 451-463

    • DOI

      10.1111/pce.14498

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Deep Fluorescence Observation in Rice Shoots via Clearing Technology2022

    • 著者名/発表者名
      Niimi Yoko、Nagai Keisuke、Ashikari Motoyuki、Mizuta Yoko
    • 雑誌名

      Journal of Visualized Experiments

      巻: 184 号: 184 ページ: 1-13

    • DOI

      10.3791/64116

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Modeling-based age-dependent analysis reveals the net patterns of ethylene-dependent and -independent aerenchyma formation in rice and maize roots.2022

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi T., Nakazono M
    • 雑誌名

      Plant Science

      巻: 321 ページ: 111340-111340

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2022.111340

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] SNORKEL Genes Relating to Flood Tolerance Were Pseudogenized in Normal Cultivated Rice2022

    • 著者名/発表者名
      Nagai Keisuke、Kurokawa Yusuke、Mori Yoshinao、Minami Anzu、Reuscher Stefan、Wu Jianzhong、Matsumoto Takashi、Ashikari Motoyuki
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 11 号: 3 ページ: 376-376

    • DOI

      10.3390/plants11030376

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Mechanisms of lysigenous aerenchyma formation under abiotic stress.2022

    • 著者名/発表者名
      akaki Yamauchi, Mikio Nakazono.
    • 雑誌名

      Trends in Plant Science

      巻: 27 号: 1 ページ: 13-15

    • DOI

      10.1016/j.tplants.2021.10.012

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The boundary-expressed <i>EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-LIKE2</i> gene encoding a signaling peptide promotes cotyledon growth during <i>Arabidopsis thaliana</i> embryogenesis2021

    • 著者名/発表者名
      Fujihara Rina、Uchida Naoyuki、Tameshige Toshiaki、Kawamoto Nozomi、Hotokezaka Yugo、Higaki Takumi、Simon Rudiger、Torii Keiko U、Tasaka Masao、Aida Mitsuhiro
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology

      巻: 38 号: 3 ページ: 317-322

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.0508a

    • NAID

      130008091603

    • ISSN
      1342-4580, 1347-6114
    • 年月日
      2021-09-25
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Noninvasive imaging of hollow structures and gas movement revealed the gas partial‐pressure‐gradient‐driven long‐distance gas movement in the aerenchyma along the leaf blade to submerged organs in rice2021

    • 著者名/発表者名
      Yin Yong‐Gen、Mori Yoshinao、Suzui Nobuo、Kurita Keisuke、Yamaguchi Mitsutaka、Miyoshi Yuta、Nagao Yuto、Ashikari Motoyuki、Nagai Keisuke、Kawachi Naoki
    • 雑誌名

      New Phytologist

      巻: 232 号: 5 ページ: 1974-1984

    • DOI

      10.1111/nph.17726

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Exploring the loci responsible for awn development in rice through comparative analysis of all AA genome species.2021

    • 著者名/発表者名
      Bessho-Uehara, K., Yamagata, Y., Takashi, T., Makino, T., Yasui, H., Yoshimura, A., and Ashikari, M.
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 10 号: 4 ページ: 725-725

    • DOI

      10.3390/plants10040725

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Radial oxygen loss from plant roots methods2021

    • 著者名/発表者名
      Juan de la Cruz Jimenez, Elisa Pellegrini, Ole Pedersen, Mikio Nakazono.
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 10 号: 11 ページ: 2322-2322

    • DOI

      10.3390/plants10112322

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Formation of a barrier to radial oxygen loss in L-type lateral roots of rice2020

    • 著者名/発表者名
      Noorrohmah, S., Takahashi, H. and Nakazono, M.
    • 雑誌名

      Plant Root

      巻: 14 号: 0 ページ: 33-41

    • DOI

      10.3117/plantroot.14.33

    • NAID

      130007967938

    • ISSN
      1881-6754
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] アフリカ野生イネOryza longistaminataにおける節間伸長関連QTLの探索2022

    • 著者名/発表者名
      HA Thi Quynh, 山形 悦透, 安井 秀, 吉村 淳, 永井 啓祐, 芦苅 基行
    • 学会等名
      日本育種学会第143回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] How does plant stem grow? Discovering of antagonistic regulation of stem growth in rice.2022

    • 著者名/発表者名
      芦苅 基行
    • 学会等名
      KAAB International Symposium 2023「Frontiers in Ecologically Friendly crop Production」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Antagonistic regulation of stem growth in rice.2022

    • 著者名/発表者名
      芦苅 基行
    • 学会等名
      日本ナス科コンソーシアムシンポジウム
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Oxygen content and developmental status of internode optimize internode growth in deepwater rice to adapt to submergence at different water levels.2022

    • 著者名/発表者名
      田中 梨紗, 永井 啓祐, 芦苅 基行
    • 学会等名
      ISPA22 conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Elucidation of water-tolerant mechanism by gas permeability in rice node.2022

    • 著者名/発表者名
      永井 啓祐
    • 学会等名
      ISPA22 conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] イネの根における活性酸素種・Ca2+シグナルを介した誘導的通気組織形成の分子機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      李 京霞, 石井 陽大, 吉岡 美樹, 吉岡 博文, 髙橋 宏和, 山内 卓樹, 中園 幹生
    • 学会等名
      日本育種学会 第142回講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 冠水による茎伸長のステージゲート2022

    • 著者名/発表者名
      芦苅基行、永井啓祐
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 節間伸長促進因子SNORKEL-LIKEの偽遺伝子化による水田イネ短稈化機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      永井啓祐、芦苅基行
    • 学会等名
      第141回講演会日本育種学会 2022年3月
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] Zea属植物の酸素漏出バリア形成制御遺伝子の機能解析2022

    • 著者名/発表者名
      伊藤拓摩、髙橋宏和、森 仁志、野元美佳、多田安臣、犬飼義明、髙橋秀和、大森史恵、間野吉郎、中園幹生
    • 学会等名
      第141回日本育種学会講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 根における冠水応答のステージゲート2022

    • 著者名/発表者名
      中園幹生、山内卓樹、高橋宏和
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] イネにおける成長相転換とジベレリン生合成の時空間的解析(1)2021

    • 著者名/発表者名
      新美陽子、永井啓祐、保浦徳昇、水多陽子、竹林裕美子、小嶋美紀子、榊原均、島谷善平、寺田理枝、辻寛之、芦苅基行
    • 学会等名
      第140回講演会日本育種学
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] イネの側根による通気組織形成の抑制機構2020

    • 著者名/発表者名
      中園幹生、清水春衣、高橋宏和、志水(佐藤) 佐江、佐藤 豊
    • 学会等名
      日本植物学会第84回講演会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Manipulation of plant hormone responses and its application to rapid depletion of target proteins in animal cells2020

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Uchida, Kohei Nishimura
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書

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公開日: 2020-11-24   更新日: 2024-12-25  

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