天然変性タンパク質の動的構造解析

• 研究領域: 天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現
• 研究課題/領域番号: 21113003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 明石 知子 横浜市立大学, その他の研究科, 准教授 (10280728)
• 研究分担者: 菅瀬 謙治 公益財団法人 サントリー生命科学財団 生物有機科学研究所, 主席研究員 (00300822) ; 水口 峰之 富山大学, 大学院医学薬学研究部, 教授 (30332662) ; 西村 善文 横浜市立大学, 大学院生命医科学研究科, 教授 (70107390)
• 研究期間 (年度): 2009-07-23 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 244,790千円 (直接経費: 188,300千円、間接経費: 56,490千円); 2013年度: 39,260千円 (直接経費: 30,200千円、間接経費: 9,060千円); 2012年度: 39,260千円 (直接経費: 30,200千円、間接経費: 9,060千円); 2011年度: 39,260千円 (直接経費: 30,200千円、間接経費: 9,060千円); 2010年度: 39,260千円 (直接経費: 30,200千円、間接経費: 9,060千円); 2009年度: 87,750千円 (直接経費: 67,500千円、間接経費: 20,250千円)
• キーワード: 蛋白質 / 生体分子 / NMR / 質量分析 / 天然変性 / ＮＭＲ / 蛋白 / 生子

研究概要

NMRや質量分析を用いて、天然変性タンパク質の動的構造を解析し、天然変性タンパク質を構造から理解し、分子認識機構の構造的な普遍性を解明することを目的として研究を展開した。その結果、ヒストン多量体および相同組換え補助因子 Swi5-Srf1複合体の構造、iPS細胞を誘導する転写因子Sox2およびOct3/4の動的構造、スプライシング関連因子PQBP1とスプライソソームU5-15kDの複合体およびPQBP1-U5-15kD-U5-52K複合体の立体構造を解析し、神経特異的抑制因子NRSFのN末天然変性領域とコリプレッサーSin3の相互作用を阻害する化合物を同定するなど、多くの成果が挙げられた。

研究成果

• [雑誌論文] Mutations in the gene PQBP1 prevent its interaction with the spliceosomal protein U5-15kD (2014)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi, M., Obita, T., Serita, T., Kojima, R., Nabeshima, Y., and Okazawa, H.
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 5 号: 1 ページ: 3822-3822
  • DOI: 10.1038/ncomms4822
  • 査読あり
• [雑誌論文] Quantitative analysis of location- and sequence-dependent deamination by APOBEC3G using real-time NMR spectroscopy (2014)
  • 著者名/発表者名: Furukawa, A., Sugase, K., Morishita, R., Nagata, T., Kodaki, T., Takaori-Kondo, A., Ryo, A., Katahira, M.
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 巻: 53 号: 9 ページ: 2349-2352
  • DOI: 10.1002/anie.201309940
  • NAID: 120005647511
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The crystal structure of the active domain of Anopheles anti-platelet protein, a powerful anti-coagulant, in complex with an antibody. (2014)
  • 著者名/発表者名: Sugiyama, K., Iyori, M., Sawaguchi, A., Akashi, S., Tame, J.R.H., Park, S.-Y., Yoshida, S.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 289 号: 23 ページ: 16303-16312
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.564526
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary neutron diffraction experiment of human farnesyl pyrophosphate synthase complexed with risedronate. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama T, Ostermann A, Mizuguchi M, Niimura N, Schrader TE, Tanaka I.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F Struct Biol Commun. 巻: 70 号: 4 ページ: 470-472
  • DOI: 10.1107/s2053230x14004087
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structures of human transthyretin complexed with glabridin. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama T, Kosaka Y, Mizuguchi M.
  • 雑誌名: J Med Chem. 巻: 57 号: 3 ページ: 1090-1096
  • DOI: 10.1021/jm401832j
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution Structure of the Ubiquitin-associated (UBA) Domain of Human Autophagy Receptor NBR1 and its Interaction with Ubiquitin and Polyubiquitin. (2014)
  • 著者名/発表者名: E. Walinda, D. Morimoto. K. Sugase. T. Konuma. H. Tochio, M. Shirakawa
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: (印刷中) 号: 20 ページ: 13890-13902
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.555441
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Solid-state NMR spectra of lipid-anchored proteins under magic angle spinning. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nomura, K., Harada, E., Sugase, K., Shimamoto, K.
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B. 巻: 118 号: 9 ページ: 2405-2413
  • DOI: 10.1021/jp4124106
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conclusive evidence of the reconstituted hexasome proven by native mass spectrometry (2013)
  • 著者名/発表者名: Azegami, N., Saikusa, K., Todokoro, Y., Nagadoi, A., Kurumizaka, H., Nishimura, Y., and Akashi, S.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52 号: 31 ページ: 5155-5157
  • DOI: 10.1021/bi4005655
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gas-phase structure of the histone multimers characterized by ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Saikusa K, Fuchigami S, Takahashi K, Asano Y, Nagadoi A, Tachiwana H, Kurumizaka H, Ikeguchi M, Nishimura Y, Akashi S
  • 雑誌名: Anal Chem 巻: 85 号: 8 ページ: 4165-4171
  • DOI: 10.1021/ac400395j
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characterisation of an intrinsically disordered protein complex of Swi5-Sfr1 by ion mobility mass spectrometry and small-angle X-ray scattering (2013)
  • 著者名/発表者名: Saikusa K, Kuwabara N, Kokabu Y, Inoue Y, Sato M, Iwasaki H, Shimizu T, Ikeguchi M, Akashi S
  • 雑誌名: Analys 巻: 138 号: 5 ページ: 1441-14499
  • DOI: 10.1039/c2an35878f
  • NAID: 120006557136
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fast and accurate fitting of relaxation dispersion data using the flexible software package GLOVE (2013)
  • 著者名/発表者名: Sugase, K., Konuma, T., Lansing, J.C., Wright, P.E.
  • 雑誌名: J. Biomol. NMR 巻: 56 号: 3 ページ: 275-283
  • DOI: 10.1007/s10858-013-9747-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] タンパク質複合体のイオンモビリティ質量分析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子、七種和美
  • 雑誌名: エアロゾル研究 巻: 28 号: 2 ページ: 119-124
  • DOI: 10.11203/jar.28.119
  • NAID: 130003367549
  • ISSN: 0912-2834, 1881-543X
  • 査読あり
• [雑誌論文] Telomeric repeats act as nucleosome-disfavouring sequences in vivo. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa Y., Morohashi N., Nishimura Y., Kurumizaka H., Shimizu M.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 29 号: 3 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1093/nar/gkt1006
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution structure of the Q41N variant of ubiquitin as a model for the alternatively folded N2 state of ubiquitin (2013)
  • 著者名/発表者名: Soichiro Kitazawa, Tomoshi Kameda, Maho Yagi-Utsumi, Kenji Sugase, Nicola J. Baxter, Koichi Kato, Michael P. Williamson, Ryo Kitahara.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52 号: 11 ページ: 1874-1885
  • DOI: 10.1021/bi301420m
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural characterization of a trapped folding intermediate of pyrrolidone carboxyl peptidase from a hyperthermophile (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi, M., Takeuchi, M., Ohki, S., Nabeshima, Y., Kouno, T., Aizawa, T., Demura, M., Kawano, K., Yutani, K.
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 51 号: 31 ページ: 6089-6096
  • DOI: 10.1021/bi300608e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Intrinsic Nucleic Acid-Binding activity of Chp1 Chromodomain Is Required for Heterochromatic Gene Silencing (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishida M, Shimojo H, Hayashi A, Kawaguchi R, Ohtani Y, Uegaki K, Nishimura Y, Nakayama J
  • 雑誌名: Mol Cell 巻: 47 号: 2 ページ: 228-241
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.05.017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structures of penicillin-binding protein 3 (PBP3) from methicillin-resistant Staphylococcus aureus in the apo and cefotaxime-bound forms (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshida H, Kawai F, Obayashi E, Akashi S, Roper DI, Tame JR, Park SY
  • 雑誌名: J Mol Biol 巻: 423 号: 3 ページ: 351-364
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2012.07.012
  • 査読あり
• [雑誌論文] Triple bioaffinity mass spectrometry concept for thyroid transporter ligands (2012)
  • 著者名/発表者名: Aqai, P., Fryganas, C., Mizuguchi, M., 他2名
  • 雑誌名: Anal Chem. 巻: 84 号: 15 ページ: 6488-6493
  • DOI: 10.1021/ac300543u
  • 査読あり
• [雑誌論文] The monomer-seed interaction mechanism in the formation of the β2-microglobulin amyloid fibril clarified by solution NMR techniques. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yanagi K
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 巻: 422 号: 3 ページ: 390-402
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2012.05.034
  • 査読あり
• [雑誌論文] 実践relaxation dispersion法 (2012)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 雑誌名: NMR 巻: 3 ページ: 82-85
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functions of homo- and hetero-oligomers of human Nucleoplasmin/Nucleophosmin family proteins NPM1, NPM2, and NPM3 during sperm chromatin remodeling (2012)
  • 著者名/発表者名: Okuwaki M, Sumi A, Hisaoka M, Saotome-Nakamura A, Akashi S, Nishimura Y, Nagata K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40 号: 11 ページ: 4861-4878
  • DOI: 10.1093/nar/gks162
  • 査読あり
• [雑誌論文] Impact of Limited Oxidation on Protein Ion Mobility and Structure of Importance to Footprinting by Radical Probe Mass Spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Downard, K.M., Maleknia, S.D., Akashi, S.
  • 雑誌名: Rapid Commun.Mass Spectrom. 巻: 26 号: 3 ページ: 226-230
  • DOI: 10.1002/rcm.5320
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydrogen-bond network and pH sensitivity in transthyretin : neutron crystal structure of human transthyretin (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, T., Mizuguchi, M., 他9名
  • 雑誌名: Journal of Structural Biology 巻: 177 号: 2 ページ: 283-290
  • DOI: 10.1016/j.jsb.2011.12.022
  • 査読あり
• [雑誌論文] Elucidating slow binding kinetics of a protein without observable bound resonances by longitudinal relaxation NMR spectroscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: Sugase, K.
  • 雑誌名: J. Biomol. NMR 巻: 50 号: 3 ページ: 219-227
  • DOI: 10.1007/s10858-011-9511-7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene (2011)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi N, Tachiwana H, Saito K, Osakabe A, Sato M, Yamada M, Akashi S, Nishimura Y, Kagawa W, Kurumizaka H
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallog 巻: 67 号: 2 ページ: 112-118
  • DOI: 10.1107/s0907444910051711
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fission yeast Swi5-Sfr1 protein complex, an activator of Rad51 recombinase, forms an extremely elongated dogleg-shaped structure (2011)
  • 著者名/発表者名: Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
  • 雑誌名: J Biol Chem 巻: 286 号: 50 ページ: 43569-43576
  • DOI: 10.1074/jbc.m111.303339
  • 査読あり
• [雑誌論文] Homology Modelled Structure of the βB2B3-Crystallin Heterodimer Studied by Ion Mobility and Radical Probe Mass Spectrometry (2011)
  • 著者名/発表者名: Downard, K.M., Kokabu, Y., Ikeguchi, M., Akashi, S.
  • 雑誌名: FEBS J. 巻: 278 号: 21 ページ: 4044-4054
  • DOI: 10.1111/j.1742-4658.2011.08309.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Boosting protein dynamics studies using quantitative nonuniform sampling NMR spectroscopy (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsuki Y, Konuma T, Fujiwara T, Sugase K
  • 雑誌名: J.Phys.Chem.B 巻: 115 号: 46 ページ: 13740-13745
  • DOI: 10.1021/jp2081116
  • 査読あり
• [雑誌論文] Free-energy Landscape for Coupled Folding and Binding of an Intrinsically Disordered Protein in Explicit Solvent from Detailed All-atom Computations (2011)
  • 著者名/発表者名: Higo J, Nishimura Y, Nakamura H
  • 雑誌名: J Am Chem Soc 巻: 133 号: 27 ページ: 10448-10458
  • DOI: 10.1021/ja110338e
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene (2011)
  • 著者名/発表者名: Horikoshi N, Tachiwana H, Saito K, Osakabe A, Sato M, Yamada M, Akashi S, Nishimura Y, Kagawa W, Kurumizaka H.
  • 雑誌名: Acta Cryst. 巻: D67 ページ: 112-118
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deimination stabilizes histone H2A/H2B dimers as revealed by electrospray ionization mass spectrometry (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimoyama, S., Nagadoi, A., Tachiwana, H., Yamada, M., Sato, M., Kurumizaka, H., Nishimura, Y., Akashi, S.
  • 雑誌名: J.Mass Spectrom. 巻: 45 ページ: 900-908
  • 査読あり
• [雑誌論文] Guidelines for reporting the use of capillary electrophoresis in proteomics. (2010)
  • 著者名/発表者名: Domann, P.J., Akashi, S., 他13名
  • 雑誌名: Nat Biotechnol. 巻: 28 ページ: 654-655
• [雑誌論文] Crystal structure of human REV7 in complex with a human REV3 fragment and structural implication of the interaction between DNA polymerase ζ and REV1 (2010)
  • 著者名/発表者名: Hara K, Hashimoto H, Murakumo Y, Kobayashi S, Kogame T, Unzai S, Akashi S, Takeda S, Shimizu T, Sato M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 巻: 285 ページ: 12299-12307
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polyglutamine tract-binding protein-1 binds to U5-15kD via a continuous 23-residue segment of the C-terminal domain. (2010)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, M., Mizuguchi, M., et al.
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta-Proteins and Proteomic 巻: 1804 ページ: 1500-1507
  • 査読あり
• [雑誌論文] Side-chain conformational changes of transcription factorPhoB upon DNA binding : a population-shift mechanism. (2010)
  • 著者名/発表者名: Yamane, T., Okamura, H., Nishimura, Y., Kidera, A., Ikeguchi, M.
  • 雑誌名: J Am Chem Soc. 巻: 132 ページ: 12653-12659
  • 査読あり
• [雑誌論文] The structure of the N-tenninal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications (2010)
  • 著者名/発表者名: Oda, T., Hashimoto, H., Kuwabara, N., Akashi, S., Hayashi, K., Kojima, C., Wong, H.L., Kawasaki, T., Shimamoto, K., Sato, M., ^*Shimizu, T.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 285 ページ: 1435-1445
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Self-Assembled Protein Nanotube with High Aspect Ratio. (2009)
  • 著者名/発表者名: Miranda, F.F., Iwasaki, K., Akashi, S., Sumitomo, K., Kobayashi, M., Yamashita, I., ^*Tame, J.R., ^*Heddle, J.G.
  • 雑誌名: Small 5 ページ: 2077-2084
  • 査読あり
• [雑誌論文] Purification, crystallization and initial X-ray diffraction study of human REV7 in complex with a REV3 fragment (2009)
  • 著者名/発表者名: Hara, K., Shimizu, T., Unzai, S., Akashi, S., Sato, M., ^*Hashimoto, H.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. F65 ページ: 1302-1305
  • 査読あり
• [雑誌論文] Polyglutamine tract binding protein-1 is an intrinsically unstructured protein. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, M., Mizuguchi, M., et al.
  • 雑誌名: Biochim.Biophys.Acta 1794 ページ: 936-943
  • 査読あり
• [雑誌論文] Calcitonin in a protochordate, Ciona intestinalis--the prototype of the vertebrate calcitonin/calcitonin gene-related peptide superfamily. (2009)
  • 著者名/発表者名: Sekiguchi T, Suzuki N, Fujiwara N, Aoyama M, Kawada T, Sugase K, Murata Y, Sasayama Y, Ogasawara M, Satake H
  • 雑誌名: FEBS J. 276 ページ: 4437-4447
  • 査読あり
• [雑誌論文] 巨大タンパク質の質量分析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 雑誌名: ぶんせき ページ: 422-427
• [学会発表] セグメントラベル法によるタンパク質の重水素化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 平成25年度第2回生物構造学研究会 タンパク質の重水素化と中性子構造生物学
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-03-17
  • 招待講演
• [学会発表] MS と SAXS を組み合わせたタンパク質の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: SPRUC拡大研究会・SPring-8利用ワークショップ -SPring-8 とユーザーのさらなる連携を目指して-
  • 発表場所: SPring-8、播磨
  • 招待講演
• [学会発表] 天然変性タンパク質の動的構造解析 -質量分析による解析- (2014)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第3回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学、福岡
• [学会発表] セグメントラベル法によるタンパク質の重水素化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 平成25年度第2回生物構造学研究会
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] 天然変性タンパク質の現状：クロマチン関連タンパク質の動的認識 (2014)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第３回公開シンポジウム
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] やわらかいタンパク質のNMR (2014)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会 第49回ワークショップ 「高磁場ＮＭＲの応用」
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] 質量分析による構造生物学 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 中性子連携研究会（第4 回中性子小角散乱解析法研究会）
  • 発表場所: 京都大学東京オフィス（東京）
  • 年月日: 2013-03-13
  • 招待講演
• [学会発表] Relaxation dispersion spectroscopy (2013)
  • 著者名/発表者名: Sugase, K.
  • 学会等名: 2013 Taiwan magnetic resonance society annual meeting
  • 発表場所: Chiayi, Taiwan
  • 年月日: 2013-01-29
  • 招待講演
• [学会発表] Mechanism of coupled folding and binding of an intrinsically disordered protein (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase
  • 学会等名: 2013 Taiwan magnetic resonance society annual meeting
  • 発表場所: Chiayi, Taiwan
  • 年月日: 2013-01-29
  • 招待講演
• [学会発表] Characterization of IDPs by Mass Spectrometry and MD simulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoko Akashi
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Intrinsically Disordered Proteins
  • 発表場所: Riken Yokohama Institute Koryuto Hall (Yokohama)
  • 年月日: 2013-01-23
• [学会発表] IDP structures of chromatin-related proteins (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Intrinsically Disordered Proteins
  • 発表場所: Riken Yokohama Institute Koryuto Hall (Yokohama)
  • 年月日: 2013-01-23
• [学会発表] Recognition mode of histone H2A-H2B by the NAP1 flexible acidic string (2013)
  • 著者名/発表者名: Nishimura, Y.
  • 学会等名: The 5th Asia-Pacific NMR Symposium (The 5th APNMR Symposium) アジア-太平洋NMR シンポジウム
  • 発表場所: Brisbane Convention and Exhibition Centre(オーストラリア・ブリスベン)
  • 招待講演
• [学会発表] タンパク質複合体のイオンモビリティ質量分析 －構造生物学での利用－ (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第2回イオン移動度研究会
  • 発表場所: 大阪府立大学、大阪
  • 招待講演
• [学会発表] Structure of histone H2A/H2B dimer analyzed by ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Sotaro Fuchigami, Yuuki Asano, Aritaka Nagadoi, Hiroaki Tachiwana, Hitoshi Kurumizaka, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi
  • 学会等名: The 61st ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Minneapolis Convention Center, Minneapolis, USA
• [学会発表] イオンモビリティ質量分析と分子動力学シミュレーションを用いたヒストン多量体の構造解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 七種和美、渕上壮太郎、浅野裕輝、高橋恭平、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、池口満徳、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第61回質量分析総合討論会
  • 発表場所: つくば国際会議場、つくば
• [学会発表] ヌクレオソームコアの再構成生成物の質量分析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 畔上奈々子、七種和美、戸所泰人、長土居有隆、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第61回質量分析総合討論会
  • 発表場所: つくば国際会議場、つくば
• [学会発表] 天然変性蛋白質PQBP1のセグメント同位体標識 (2013)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之、鍋島裕子
  • 学会等名: 第52回NMR討論会
  • 発表場所: 金沢市
• [学会発表] 神経疾患における天然変性タンパク質の認識と創薬 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第13回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館(鳥取県)
• [学会発表] パターンデザインペプチドライブラリーを用いたPAH1結合天然変性領域配列の設計開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 半田雅憲、寺西弘志、西村 善文、新井亮一
  • 学会等名: 第13回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館(鳥取県)
• [学会発表] 構造解析用核内タンパク質等の生産と評価および相関構造解析法のための NMR相互作用による創薬基盤技術の開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会第47回ワークショップ「創薬等プラットフォーム」
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] Structural epigenetics on heterochromatin-related proteins (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: Structural Research Center for Innovative Drug Development（ソウル国立大学）(ソウル 韓国)
  • 招待講演
• [学会発表] 創薬基盤としてのNMR (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー 世界をリードするＮＭＲとその科学技術・社会へのインパクト 文部科学省先端研究基盤共用・プラットフォーム形成事業「NMR共用プラットフォーム」
  • 発表場所: 大阪大学(大阪府)
• [学会発表] 横浜市大における先端NMR共用施設の高度化と拡充 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会セミナー「ＮＭＲ共用プラットフォーム」
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] パターンデザインペプチドライブラリーを用いたPAH1結合天然変性領域配列の設計開発 (2013)
  • 著者名/発表者名: 半田雅憲、寺西弘志、西村善文、新井亮一
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] Recognition mode of histone H2A-H2B by the NAP1 flexible acidic string (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: The 5th Asia-Pacific NMR Symposium (The 5th APNMR Symposium) アジア-太平洋NMRシンポジウム
  • 発表場所: Brisbane Convention and Exhibition Centre(オーストラリア・ブリスベン)
  • 招待講演
• [学会発表] N-terminal phosphorylated tail of HP1&alpha behaves like an extended hard acidic string to promote the binding to methylated histone H3K9 tail (2013)
  • 著者名/発表者名: Ayumi Kawaguchi, Hideaki Shimojo, Jun-ichi Nakayama, Takashi Oda, Mamoru Sato, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ﾎﾟｰﾄｱｲﾗﾝﾄﾞ(兵庫県)
• [学会発表] Analysis of protein dynamics in living human cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase, Erisa Harada, Toshio Takahashi, Shoko Mori
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド、神戸
• [学会発表] Extracting Information on Protein Dynamics from Crowded NMR Spectra Using Relaxation Dispersion Difference (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Konuma, Erisa Harada, Kenji Sugase
  • 学会等名: 5th Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: the Brisbane Convention and Exhibition Centre, Brisbane, Australia
• [学会発表] Mechanism of the distal regulation of substrate binding through intrinsic fluctuation in an enzyme (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase
  • 学会等名: The 10th Korea-Japan Bilateral Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Seoul National University, Seoul, Korea
  • 招待講演
• [学会発表] 揺らぎが制御するヘム分解酵素反応の遠位効果 (2013)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第14回若手NMR研究会
  • 発表場所: 京都トラベラーズ・イン、京都
  • 招待講演
• [学会発表] テロメアリピート配列はin vivoでのヌクレオソーム形成を阻害する (2013)
  • 著者名/発表者名: 市川雄一、諸橋伸行、三界博忠、 西村善文、 胡桃坂仁志、清水光弘
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] NMRによるエピゲノム関連タンパク質の機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会第46回ワークショップ
  • 発表場所: 理化学研究所交流棟ホール(神奈川県)
• [学会発表] 高分子としてのタンパク質構造解析：様々の手法のシンクロナイゼーション －質量分析の立場から－ (2012)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第6回ソフトマター中性子散乱研究会
  • 発表場所: 研究社英語センタービル 大会議室（東京）
  • 年月日: 2012-12-21
  • 招待講演
• [学会発表] 質量分析を用いたヌクレオソームのアセチル化に伴う構造変化の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 畔上奈々子、七種和美、神蔵祐典、戸所泰人、立和名博昭、長土居有隆、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡）
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] ヘテロクロマチン構造形成因子Swi6クロモドメインとヒストンH3K9me3ペプチドの複合体の構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中村紗里、下條秀朗、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] ヒストンシャペロン hNap1のＣ末酸性ドメインとヒストンH2A/H2Bの相互作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、奥脇暢、永田恭介、戸所泰人、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] ヒストンシャペロン hNap1のＣ末酸性ドメインとヒストンH2A/H2Bの相互作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、奥脇暢、永田恭介、戸所泰人、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 固体NMRを用いたクロマチン構造におけるヒストンの構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 戸所泰人、森脇義仁、長土居有隆、立和名博昭、須賀則之、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] ヘテロクロマチン形成因子HP1αセリンリン酸化クロモドメインのNMR構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 川口あゆみ、下條秀朗、濱田京子、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 出芽酵母ミニ染色体においてヒトテロメア配列およびテロメア結合因子がヌクレオソーム形成に及ぼす影響 (2012)
  • 著者名/発表者名: 市川雄一、諸橋伸行、半田圭汰、西村善文、胡桃坂仁志、清水光弘
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 出芽酵母のUme6のactivatorとrepressorとしての機能に関する天然変性領域の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 諸橋伸行、大島えりか、大島綾子、牧野紋子、市川雄一、胡桃坂仁志、福地佐斗志、西村善文、清水光弘
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] ラマン分光法とNMRによる構造生物学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 平成24年度日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 東京工業大学百年記念館(東京都)
  • 年月日: 2012-11-27
• [学会発表] 天然変性蛋白質 PQBP1 のセグメント標識 (2012)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之、鍋島裕子
  • 学会等名: 第51回 NMR 討論会
  • 発表場所: 名古屋市
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] 緩和分散差スペクトル法による混みあったNMRスペクトルの緩和分散データの解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小沼剛、菅瀬謙治
  • 学会等名: 第51回 NMR討論会
  • 発表場所: 名古屋市
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] ヘテロクロマチンタンパク質HP1αセリンリン酸化クロモドメインのNMR構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 川口あゆみ、下條秀朗、濱田京子、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] ヘテロクロマチン構造形成因子Swi6クロモドメインとヒストンH3K9me3ペプチドの複合体の構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中村紗里、下條秀朗、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] テロメアDNAとhTRF2塩基性ドメインの相互作用解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 鈴木啓介、下條秀朗、岩沢佳尚、村井元気、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] Chp1クロモドメインの立体構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗、石田真由美、中山潤一、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] ヒストンシャペロン hNap1のＣ末酸性ドメインとヒストンH2A/H2Bの相互作用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、奥脇暢、永田恭介、戸所泰人、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] 固体NMRを用いたヌクレオソームおけるヒストンH2Aの構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 戸所泰人、森脇義仁、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 第51回NMR討論会
  • 発表場所: ウインク愛知(愛知県)
  • 年月日: 2012-11-08
• [学会発表] Dynamics of nuclear proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: Yokohama NMR The 3rd International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
  • 発表場所: Riken Yokohama Institute Koryuto Hall (Yokohama)
  • 年月日: 2012-10-11
• [学会発表] Characterization of histone multimers in the gas phase by ion mobility mass spectrometry and molecular dynamics simulation (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Sotaro Fuchigami, Kyohei Takahashi, Yuuki Asano, Aritaka Nagadoi, Hiroaki Tachiwana, Hitoshi Kurumizaka, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi
  • 学会等名: 第50回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学(愛知県)
  • 年月日: 2012-09-22
• [学会発表] What happens on the histone multimers in the gas phase? (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Sotaro Fuchigami, Kyohei Takahashi, Yuuki Asano, Aritaka Nagadoi, Hiroaki Tachiwana, Hitoshi Kurumizaka, Mitsunori Ikeguchi, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi
  • 学会等名: 19th International Conference on Mass Spectrometry
  • 発表場所: Kyoto International Conference Center, Kyoto
  • 年月日: 2012-09-16
• [学会発表] Behavior of intrinsically disordered regions within a protein complex ofSwi5-Sfr1 characterized by IM-MS and SAXS (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Naoyuki Kuwabara, Yuichi Kokabu, Mamoru Sato, Hiroshi Iwasaki, Mitsunori Ikeguchi, Toshiyuki Shimizu, Satoko Akashi
  • 学会等名: 19th International Conference on Mass Spectrometry
  • 発表場所: Kyoto International Conference Center, Kyoto
  • 年月日: 2012-09-16
• [学会発表] Structure of a Beta-Crystallin Heterodimer by Ion Mobility and Radical Probe Mass Spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Kevin Downard, Yuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Satoko Akashi
  • 学会等名: 19th International Conference on Mass Spectrometry
  • 発表場所: Kyoto International Conference Center, Kyoto
  • 年月日: 2012-09-16
• [学会発表] Behavior of Intrinsically Disordered Regions within a Protein Complex of Swi5-Sfr1 Characterized by Ion Mobility Mass Spectrometry (2012)
  • 著者名/発表者名: Kazumi Saikusa, Naoyuki Kuwabara, Yuichi Kokabu, Mamoru Sato, Hiroshi Iwasaki, Mitsunori Ikeguchi, Toshiyuki Shimizu, and Satoko Akashi
  • 学会等名: The 60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Vancouver Convention Center, Canada
  • 年月日: 2012-05-20
• [学会発表] Application of Homology Modelling, Ion Mobility and Protein Footprinting in Unison to Characterize Protein Bimolecular Complexes (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Satoko Akashi, Kevin Downard
  • 学会等名: The 60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Vancouver Convention Center, Canada
  • 年月日: 2012-05-20
• [学会発表] Impact of Protein Oxidation on their Ion Mobility for Protein Footprinting Applications (2012)
  • 著者名/発表者名: Simin Maleknia, Satoko Akashi, Kevin Downard
  • 学会等名: The 60th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Vancouver Convention Center, Canada
  • 年月日: 2012-05-20
• [学会発表] ポリグルタミン結合タンパク質の構造生物学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会
  • 発表場所: 北海道大学
  • 年月日: 2012-03-29
• [学会発表] Structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mineyuki Mizuguchi
  • 学会等名: 9th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Sapporo
  • 年月日: 2012-03-16
  • 招待講演
• [学会発表] Structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi M.
  • 学会等名: 9th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Hokkaido University
  • 年月日: 2012-03-16
• [学会発表] 揺らぎから機能をどのように見るか (2012)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会第43回ワークショップ
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川)
  • 年月日: 2012-02-06
• [学会発表] Dynamic structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mizuguchi M.
  • 学会等名: 4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences, Experiments and Simulations
  • 発表場所: Cultural Center of Todaiji-Temple
  • 年月日: 2012-01-11
• [学会発表] ポリグルタミン結合タンパク質の構造生物学的研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 日本薬学会第132年会
  • 発表場所: 札幌
  • 招待講演
• [学会発表] Dynamic structural changes of the intrinsically disordered protein PQBP-1 (2012)
  • 著者名/発表者名: Mineyuki Mizuguchi
  • 学会等名: 4th Japan-Korea Seminar on Biomolecular Sciences, Experiments and Simulations
  • 発表場所: Nara
  • 招待講演
• [学会発表] Structural analysis of Chip1 chromodomain required for heterochromatin assembly (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: Structural Research Center for Innovative Drug Development（ソウル・韓国）
  • 招待講演
• [学会発表] NMR Studies on Chromatin-Related Proteins (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: International Workshop on Pharmaceutical NMR - Nucleic Acids and Prion Protein -
  • 発表場所: 大阪大学（大阪府）
  • 招待講演
• [学会発表] イオンモビリティ質量分析によるIDPの構造解析-Swi5-Sfr1の気相中での構造- (2012)
  • 著者名/発表者名: 七種和美、明石知子
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第2回公開シンポジウム
  • 発表場所: 吹田・千里ライフサイエンスセンター
• [学会発表] 質量分析で観測されるヒストンテイルの挙動 (2012)
  • 著者名/発表者名: 七種和美、明石知子, 他6名
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第2回公開シンポジウム
  • 発表場所: 吹田・千里ライフサイエンスセンター
• [学会発表] 質量分析で観るタンパク質の姿 (2011)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 理研シンポジウム 第12回分析・解析技術と化学の最先端
  • 発表場所: 和光
  • 年月日: 2011-12-12
  • 招待講演
• [学会発表] 質量分析で観るタンパク質の姿 (2011)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 理研シンポジウム第12回分析・解析技術と化学の最先端
  • 発表場所: 和光・理化学研究所
  • 年月日: 2011-12-12
• [学会発表] 精神遅滞の原因タンパク質PQBP-1の構造と機能 (2011)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 第21回WSフォーラム タンパク質・ペプチド研究の現状と展望
  • 発表場所: 九州大学
  • 年月日: 2011-11-19
• [学会発表] Boosting Protein Dynamics Studies using Quantitative Non-Uniform Sampling (NUS) NMR (2011)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第50回NMR討論会
  • 発表場所: 大さん橋ホール(神奈川)
  • 年月日: 2011-11-16
• [学会発表] 天然変性蛋白質PQBP-1の動的な構造変化 (2011)
  • 著者名/発表者名: 水口峰之
  • 学会等名: 物理学会2011年秋季大会
  • 発表場所: 富山大学
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] 動的構造解析による酵素ヘムオキシゲナーゼの機能発現メカニズムの解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第17回創薬情報研究会
  • 発表場所: 新大阪丸ビル新館(大阪)
  • 年月日: 2011-09-13
• [学会発表] 質量分析によるタンパク質複合体の相互作用解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第1回生体分子相互作用解析フォーラム
  • 発表場所: 東京・ベックマンコールター本社
  • 年月日: 2011-03-10
• [学会発表] Mass Spectrometry for Charactedzation of IDPs (2011)
  • 著者名/発表者名: Satoko Akashi
  • 学会等名: The 1^<st> International Symposium on Intrinsically Disordered Proteins
  • 発表場所: 横浜・はまぎんホールヴィアマーレ
  • 年月日: 2011-01-27
• [学会発表] Intrinsically disordered proteins in nuclear networks (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: The 1^<st> International Symposium on Intrinsically Disordered Proteins
  • 発表場所: 横浜・はまぎんホールヴイアマーレ
  • 年月日: 2011-01-27
• [学会発表] Structural biology on Chromatin- related proteins (2011)
  • 著者名/発表者名: Nishimura, Y., H.Shimojo, A.Kawaguchi, M.Okuda, Y.Moriwaki, K.Iizumi, A.Nagadoi
  • 学会等名: The 4th Asia-Pacific NMR Symposium (The 4th APNMR Symposium) アジア-太平洋NMR シンポジウム
  • 発表場所: Beijing Central Garden Hotel, (中国 北京)
  • 招待講演
• [学会発表] Mass Spectrometry of Histone Multimer (2011)
  • 著者名/発表者名: Satoko Akashi
  • 学会等名: The 2^<nd> Asian Oceanic Mass Spectrometry Conference (2^<nd> AOMSC)
  • 発表場所: Busan
  • 招待講演
• [学会発表] Dimeric transthyretin variant assembles into cytotoxic aggregates (2011)
  • 著者名/発表者名: Mineyuki Mizuguchi
  • 学会等名: VIIIth International Symposium on Familial Amyloidotic Polyneuropathy
  • 発表場所: Kumamoto
  • 招待講演
• [学会発表] Eukaryotic nuclear IUPs (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 2010KRIBB Conference on Structural Bioinformatics(2nd Asia-Pacific symposium on Intrinsically Unfolded Proteins)
  • 発表場所: 韓国生命工学研究院(大田KRIBB、韓国)
  • 招待講演
• [学会発表] 機能するタンパク質の構造変化を質量分析で探る (2011)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 公開シンポジウム「蛋白質の機能を解き明かす多彩なアプローチ」
  • 発表場所: 横浜・横浜市立大学鶴見キャンパス(招待講演)
• [学会発表] イオンモビリティ質量分析とX線小角散乱による基本転写因子TFIIEの構造解析 (2011)
  • 著者名/発表者名: 七種和美、小田隆、奥田昌彦、池口満徳、佐藤衛、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第59回質量分析総合討論会(2011)
  • 発表場所: 吹田・阪急エキスポパークホテル
• [学会発表] Mass Spectrometry of Histone Multimers (2011)
  • 著者名/発表者名: Satoko Akashi
  • 学会等名: The 2nd Asian Oceanic Mass Spectrometry Conference (2nd AOMSC)
  • 発表場所: Busan・Busan Exhibition & Convention Center (BEXCO)(招待講演)
• [学会発表] Characterization of histone multimers by ESI-MS (2011)
  • 著者名/発表者名: Shingo Shimoyama, Satoko Akashi, 他7名
  • 学会等名: The 59th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
  • 発表場所: Denver, Colorado Convention Center
• [学会発表] Eukaryotic nuclear IUPs(真核生物の核内天然変性タンパク質) (2011)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 2010KRIBB Conference on Structural Bioinformatics (2nd Asia-Pacific symposium on Intrinsicany Unfolded Proteins)
  • 発表場所: 韓国・大田(KRIBB)
• [学会発表] タンパク質複合体を観る -イオンモビリティMS の実際- (2010)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: BMS シンポジウム「機能するタンパク質の構造を探る」
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-12-11
• [学会発表] タンパク質複合体を観る-イオンモビリティMSの実際- (2010)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: BMSシンポジウム「機能するタンパク質の構造を探る」
  • 発表場所: 東京・(財)微生物化学研究所
  • 年月日: 2010-12-11
• [学会発表] 転写制御に関わる天然変性タンパク質の質量分析による構造機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 酵素工学研究会第64回講演会
  • 発表場所: 東京・東京大学山上会館
  • 年月日: 2010-11-19
• [学会発表] Polymorphism of chromodomains (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 構造エピゲノム研究会第2回ワークショップ
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール
  • 年月日: 2010-11-08
• [学会発表] Fluctuation and function of nuclear proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大学、岩手
  • 年月日: 2010-09-20
  • 招待講演
• [学会発表] Fluctuation and function of nuclear proteins (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 東北大学(岩手県)
  • 年月日: 2010-09-20
• [学会発表] Fitting Relaxation Dispersion Data With A New Software Package GLOVE (2010)
  • 著者名/発表者名: Sugase, K., Lansing, J.C. Wright, P.E.
  • 学会等名: XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Cairns convention centre, Australia
  • 年月日: 2010-08-24
• [学会発表] Fitting Relaxation Dispersion Data With A New Software Package GLOVE (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: XXIVth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Cairns convention centre (Australia)
  • 年月日: 2010-08-24
• [学会発表] NMRによるヘムオキシゲナーゼのヘム認識機構の解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所(大阪府)
  • 年月日: 2010-07-30
• [学会発表] 転写関連因子のNMR構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー「超高磁場が拓く生体系NMR:最新技術と応用」
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所(大阪府)
  • 年月日: 2010-07-29
• [学会発表] NMR による天然変性タンパク質の動的構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター、北海道
  • 年月日: 2010-06-18
  • 招待講演
• [学会発表] NMRによる天然変性タンパク質の動的構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター(北海道)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 緩和分散解析用プログラムGLOVE (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第49回NMR討論会
  • 発表場所: タワーホール船堀(東京)
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 天然変性タンパク質の認識機構の多様性と創薬への道 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文、平尾優佳、長土居有隆
  • 学会等名: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター
  • 年月日: 2010-06-18
• [学会発表] 翻訳後修飾に伴う蛋白質の構造変化-H2A/H2Bのシトルリン化- (2010)
  • 著者名/発表者名: 下山真吾、長土居有隆、立和名博昭、浅野裕輝、山田道之、佐藤衛、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第58回質量分析総合討論会(2010) & 1^<st> Asian and Oceanic Mass Spectrometry Conference
  • 発表場所: つくば国際会議場
  • 年月日: 2010-06-16
• [学会発表] 転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 長土居有隆、奥田昌彦、明石知子、西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム(東京都)
  • 年月日: 2010-03-05
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中亜紀、水田翔子、奥田昌彦、西村善文、大熊芳明
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム(東京都)
  • 年月日: 2010-03-05
• [学会発表] 動きの面から見た核内タンパク質の機能 (2010)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム第3回研究交流会
  • 発表場所: 東京大学(東京)
  • 年月日: 2010-03-04
• [学会発表] 転写関連因子の天然変性状態 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
  • 発表場所: 東京大学山上会館(東京都)
  • 年月日: 2010-03-04
• [学会発表] 天然変性タンパク質の構造解析-質量分析によるアプローチ (2010)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 新学術領域研究「天然変性タンパク質の分子認識機構と機能発現」第1回公開シンポジウム
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
  • 年月日: 2010-01-19
• [学会発表] タンパク質のNMR による構造解析 : 天然変性状態と動的挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 平成22年度日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館(京都)
  • 招待講演
• [学会発表] NMR studies on gene regulation-related proteins : intrinsic disordered states and drug screening (2010)
  • 著者名/発表者名: Nishimura, Y.
  • 学会等名: Korean Magnetic Resonance Society Meeting (KMRS:韓国磁気共鳴学会)
  • 発表場所: 釜山(韓国)
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis of TRAP-antiTRAP interactions by sedimentation velocity analytical ultracentrifugation (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoru Unzai, Masahiro Watanabe, Satoko Akashi, Jonathan Heddle, Sam-Yong Park, Jeremy R.H.Tame
  • 学会等名: 第48回日本生物物理学会年会(2010)
  • 発表場所: 仙台市・東北大学川内キャンパス
• [学会発表] Mass spectrometry of DNA G-quadruplex bound to a human telomedc protein, hTRF2 (2010)
  • 著者名/発表者名: Naohiro Kodama, Yuuka Hirao, Noriyuki Iwasaki, Yoshiyuki Itoh, Yoshifumi Nishimura, Satoko Akashi
  • 学会等名: 第37回国際核酸化学シンポジウム(ISNAC 2010)
  • 発表場所: 横浜・はまぎんホールヴィアマーレ
• [学会発表] 質量分析を用いた生体超分子の構造機能研究-構造生物学から見たCEへの期待- (2010)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第30回キャピラリー泳動シンポジウム
  • 発表場所: 岐阜・長良川国際会議場
• [学会発表] 質量分析を用いたヒストンH2A-H2Bのシトルリン化の解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 浅野裕輝、下山真吾、長土居有隆、立和名博昭、山田道之、佐藤衛、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会 合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] NMR studies on gene regulation-related proteins : intrinsic disordered states and drug screening (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: Korean Magnetic Resonance Society Meeting
  • 発表場所: 韓国・釜山
• [学会発表] Intrinsically disordered proteins and NMR screening of drug candidates (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: Symposium on the Structure and Folding of Disease Related Proteins
  • 発表場所: 韓国・ソウル
• [学会発表] ホメオボックス遺伝子産物Six3のSix domainの立体構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗、岡村英保、長土居有隆、池田啓子、川上潔、西村善文
  • 学会等名: 第49回NMR討論会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 第49回NMR討論会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] タンパク質のNMRによる構造解析:天然変性状態と動的挙動 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 平成22年度日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 平成22年度日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] ホメオボックス遺伝子産物Six3のSix domainの立体構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗、岡村英保、長土居有隆、池田啓子、川上潔、西村善文
  • 学会等名: 平成22年度日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 京都大学百周年時計台記念館
• [学会発表] クロマチン関連因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会 合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、立和名博昭、胡桃坂仁志、西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会 合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] テロメアDNA結合タンパク質hTRF2の塩基性ドメインとテロメアDNAとの相互作用解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 村井元気、下條秀朗、菅野良、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会 合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] ヒストンH3-H4と相互作用する分裂酵母クロマチン関連因子Mlo2の構造解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 飯泉勝也、長土居有隆、伊縫美妃、田上英明、西村善文
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会 合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] 基本転写因子TFIIE-TFIIHの機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 山田華那、田中亜紀、水田翔子、高澤学、吉國達也、奥田昌彦、西村善文、大熊芳明
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会・日本生化学会大会 合同大会BMB2010
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
• [学会発表] NMR Experiments on Drug Candidates for the Sin3 Corepressor Bound to the Neural Repressor (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: PepCon2010
  • 発表場所: 北京(中国)
• [学会発表] 転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 長土居有隆、奥田昌彦、明石知子、西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
  • 発表場所: 新神戸(兵庫県)
• [学会発表] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中亜紀、水田翔子、奥田昌彦、西村善文、大熊芳明
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
  • 発表場所: 新神戸(兵庫県)
• [学会発表] クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2010)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
  • 発表場所: 新神戸(兵庫県)
• [学会発表] 天然変性状態と機能の相関 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
  • 年月日: 2009-12-11
• [学会発表] NMR Studies on Nuclear Proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会 第39回ワークショップ「RNAの構造生物学」
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
  • 年月日: 2009-11-12
• [学会発表] Elucidation of protein-protein interactions by relaxation NMR spectroscopy (2009)
  • 著者名/発表者名: Sugase, K
  • 学会等名: The 3rd APNMR Biannual Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Ramada hotel, Korea
  • 年月日: 2009-10-27
  • 招待講演
• [学会発表] Elucidation of protein-protein interactions by relaxation NMR spectroscopy (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: The 3rd APNMR Biannual Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Ramada hotel (Jeju, Korea)
  • 年月日: 2009-10-27
• [学会発表] シトルリン化によるヒストンH2A/HBの構造変化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下山真吾、長土居有隆、立和名博昭、山田道之、佐藤衛、胡桃坂仁志、西村善文、明石知子
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • 年月日: 2009-10-21
• [学会発表] 天然変性タンパク質の構造と機能の最前線 (2009)
  • 著者名/発表者名: 菅瀬謙治
  • 学会等名: 第49回 生命科学 夏の学校
  • 発表場所: 神戸セミナーハウス(三田)
  • 年月日: 2009-08-30
• [学会発表] 天然変性タンパク質と結合化合物のスクリーニング (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村義文
  • 学会等名: サントリー生有研フォーラム
  • 発表場所: 大阪府
  • 年月日: 2009-08-20
• [学会発表] ヒストンアセチル化酵素Esa1のRNA認識 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: よこはまNMR構造生物学研究会 第37回ワークショップ「RNAの構造生物学」
  • 発表場所: 理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
  • 年月日: 2009-07-24
• [学会発表] 遺伝子のスイッチに働くタンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: サタデーサイエンス～高校生のための「生命科学シンポジウム」
  • 発表場所: 横浜サイエンスフロンティア高校(神奈川県)
  • 年月日: 2009-05-16
• [学会発表] 生命のメカニズムに迫るESI-MS-X線結晶構造解析とのcollaborationで見えてくる生体超分子の構造- (2009)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 学会等名: 第57回質量分析総合討論会
  • 発表場所: 大阪国際交流センター(大阪府)
• [学会発表] 天然変性タンパク質による転写調節機構(ワークショップテーマ) (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第32回日本分子生物学会年会(MBSJ)
  • 発表場所: パシフィコ横浜(神奈川県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 平成21年度 日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 東京工業大学百年記念館(東京都)
• [学会発表] ヒストンアセチルトランスフェラーゼEsalのクロモドメインの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗, 佐野徳彦, 森脇義仁, 奥田昌彦, 堀越正美, 西村善文
  • 学会等名: 平成21年度 日本分光学会年次講演会
  • 発表場所: 東京工業大学百年記念館(東京都)
• [学会発表] ヒト基本転写因子TFIIE alhpa酸性ドメインの動的構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 小松正史, 奥田昌彦, 長土居有隆, 菅瀬謙治, 西村善文
  • 学会等名: 第48回NMR討論会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第48回NMR討論会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] ヒストンアセチルトランスフェラーゼEsalのクロモドメインの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗, 佐野徳彦, 森脇義仁, 奥田昌彦, 堀越正美, 西村善文
  • 学会等名: 第48回NMR討論会
  • 発表場所: 九州大学医学部百年講堂(福岡県)
• [学会発表] Intrinsically Disordered Transcription-related Proteins (2009)
  • 著者名/発表者名: Masahiko Okuda, Aritaka Nagadoi, Masashi Komatsu, Yoshifumi Nishimura
  • 学会等名: 第3回アジア-太平洋NMRシンポジウム(APNMR)
  • 発表場所: Ramada Plaza Jeju Hotel(韓国)
• [学会発表] 天然変性転写関連タンパク質 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] NMRによるヒストンヌクレオソームコアの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 森脇義仁、佐藤昌彦、長土居有隆、西村善文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] ヒストンアセチルトランスフェラーゼEsa1のクロモドメインの立体構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 下條秀朗, 佐野徳彦, 森脇義仁, 奥田昌彦, 堀越正美, 西村善文
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
• [学会発表] クロマチン上での基本転写因子、転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: ターゲットタンパク全体交流会
  • 発表場所: ウエスティン都ホテル京都(京都府)
• [学会発表] 核内天然変性タンパク質の分子認識機構 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第9回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 熊本全日空ホテルニュースカイ(熊本県)
• [学会発表] 核内タンパク質の構造的柔軟性と機能発現 (2009)
  • 著者名/発表者名: 西村善文
  • 学会等名: 第36回構造生物応用研究会
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル(静岡県)
• [図書] 現代質量分析学、高山光男、早川滋雄、瀧浪欣彦、和田芳直編 第26章 生体超分子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子(共著)
  • 出版者: 化学同人
• [図書] “現代質量分析学”、第26章 生体超分子 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 出版者: 化学同人
• [図書] “試料分析講座 タンパク質分析”、日本分析化学会編 5.3 タンパク質複合体のネイティブ質量分析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 出版者: 丸善出版
• [図書] "翻訳後修飾のプロテオミクス-質量分析装置を中心とした分析法の原理-"、4章4.13.2質量分析法による脱イミノ化の検出(平野久、大野茂男編) (2011)
  • 著者名/発表者名: 明石知子
  • 出版者: 講談社
• [図書] Water and Biomolecules : Physical Chemistry of Life Phenomena (Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering) (2009)
  • 著者名/発表者名: Wright, P.E., Felitsky, D.J., Sugase, K., Dyson, H.J.
  • 総ページ数: 307
  • 出版者: Springer-Verlag
• [産業財産権] 線維筋痛症の予防または治療薬 (2012)
  • 発明者名: 西村善文、植田弘師
  • 権利者名: 公立大学法人横浜市立大学、公国立大学法人長崎大学、PRISM BioLab 株式会社
  • 出願年月日: 2012-12-06
• [産業財産権] 神経選択的転写抑制因子NRSF に特異的に結合するmSin3B に結合する化合物の利用 (2011)
  • 発明者名: 西村善文、長土居有隆、平尾優佳、五嶋良郎、山下直也、植田弘師、宮田直樹、鈴木孝禎、平石龍大
  • 権利者名: 公立大学法人横浜市立大学、公立大学法人名古屋市立大学、国立大学法人長崎大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2011-02-09
  • 外国