計画研究
学術変革領域研究(A)
細胞競合は細胞間の相互作用を介した細胞排除現象であり、多細胞生命システムが自身の構造や機能を最適化する「自律性」を生み出す要の一つであると考えられる。細胞競合のプロセスを完全に理解するには、、細胞集団内の細胞間にわずかな性質の差を細胞間の時空間的な相互作用と遺伝子発現・シグナル変化を単一細胞レベルで定量的に解析する必要がある。そこで本研究では、これまでに開発した独自の空間オミクス解析技術を基盤として、細胞競合における細胞間相互作用を計測するための新たな空間マルチオミクス技術の開発と独自空間オミクス技術を駆使し、本領域内の細胞競合の分子基盤と多細胞生命システムの自律性生成原理の理解に迫る。
細胞競合は細胞間の相互作用を介した細胞排除現象であり、多細胞生命システムが自身の構造や機能を最適化する「自律性」を生み出す要の一つであると考えられる。細胞競合のプロセスを完全に理解するには、細胞集団内の細胞間にわずかな性質の差を細胞間の時空間的な相互作用と遺伝子発現・シグナル変化を単一細 胞レベルで定量的に解析する必要がある。そこで本研究では、これまでに開発した独自の空間オミクス解析技術を基盤として、細胞競合における細胞間相互作用を計測するための新たな空間マルチオミクス技術の開発と独自空間オミクス技術を駆使し、本領域内の細胞競合の分子基盤と多細胞生命システムの自律性生成原理の理解を目指す。本年度は、本領域で対象となる組織や細胞の形態や状態の違いに適した空間トランスクリプトーム解析のプロトコル改変を進めた結果、いくつかの生物種でのプロトコルを開発した。また、空間トランスクリプトーム解析、空間エピゲノム解析に加えて、空間プロテオミクスを加えた空間マルチオミクスの可能性を検討した。その結果、試薬の入れ替えにより切り離しが可能な小分子化合物をリンカーとして、蛍光色素を抗体に結合させたPrecise Emission Canceling Antibodiesプローブを作製した。本プローブを用いて、100種類以上の空間プロテオミクス解析を達成し、論文公開を行った。
1: 当初の計画以上に進展している
当初予定に沿って、データ取得を進めており当初の計画通りに進展している。
研究計画に従って進めていく。
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すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 1件、 招待講演 6件) 図書 (4件) 備考 (1件)
Monoclonal Antibodies in Immunodiagnosis and Immunotherapy
巻: 43 号: 2 ページ: 75-80
10.1089/mab.2023.0025
bioRxiv
巻: -
10.1101/2023.10.17.561810
Cell Reports
巻: 42(5) 号: 5 ページ: 112530-112530
10.1016/j.celrep.2023.112530
STAR Protocols
巻: 3 号: 2 ページ: 101346-101346
10.1016/j.xpro.2022.101346
PLoS One.
巻: 17
Curr Opin Struct Biol.
Mol Syst Biol.
https://tx.bioreg.kyushu-u.ac.jp/
