パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患の発症機構の解明

• 研究領域: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明
• 研究課題/領域番号: 22129002
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 辻 省次 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (70150612)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 403,260千円 (直接経費: 310,200千円、間接経費: 93,060千円); 2014年度: 74,100千円 (直接経費: 57,000千円、間接経費: 17,100千円); 2013年度: 77,740千円 (直接経費: 59,800千円、間接経費: 17,940千円); 2012年度: 81,510千円 (直接経費: 62,700千円、間接経費: 18,810千円); 2011年度: 80,730千円 (直接経費: 62,100千円、間接経費: 18,630千円); 2010年度: 89,180千円 (直接経費: 68,600千円、間接経費: 20,580千円)
• キーワード: ゲノム / 個人ゲノム / 脳疾患 / インフォマティクス / シーケンサー / ゲノムインフォマティクス

研究成果の概要

次世代シーケンサーを用いた網羅的なゲノム配列解析により，遺伝性神経疾患の病因遺伝子の解明，孤発性神経疾患の疾患感受性遺伝子の解明を目指した．遺伝性神経疾患については，近位筋優位型遺伝性運動感覚ニューロパチー，家族性筋萎縮性側鎖句硬化症の新規病因遺伝子としてTFG，ERBB4を発見した．孤発性神経疾患については，多発家系に注目することにより，CO2遺伝子が病因遺伝子であること，さらに，孤発性多系統萎縮症においても，COQ2のmultiple rare variantsが多系統萎縮症の発症リスクを高めていることを見いだした．

研究成果

• [雑誌論文] Novel mutations in the PNPLA6 gene in Boucher-Neuhäuser syndrome. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takiyama Y, Koh K, Kobayashi F, Miwa M, Shindo K, Isozaki E, Ishiura H, and Tsuji S.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: in press 号: 4 ページ: 217-220
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Variants associated with Gaucher disease in multiple system atrophy (2015)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Sasaki H, (中略), Tsuji S.
  • 雑誌名: Ann Clin Transl Neurol 巻: 2 号: 1 ページ: 59-63
  • DOI: 10.1002/acn3.18
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genotype-Phenotype Correlations in Alternating Hemiplegia of Childhood (2014)
  • 著者名/発表者名: Sasaki M, Ishii A, Saito Y, (中略）, Tsuji S and Hirose S.
  • 雑誌名: Neurology 巻: 82 号: 6 ページ: 482-490
  • DOI: 10.1212/wnl.0000000000000102
  • 査読あり
• [雑誌論文] Rapid detection of expanded short tandem repeats in personal genomics using hybrid sequencing. (2014)
  • 著者名/発表者名: Doi K, Monjo T, Hoang PH, Yoshimura J, Yurino H, Mitsui J, Ishiura H, Takahashi Y, Ichikawa Y, Goto J, Tsuji S, Morishita S.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 30 号: 6 ページ: 815-822
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btt647
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Molecular epidemiology and clinical spectrum of hereditary spastic paraplegia in the Japanese population based on comprehensive mutational analyses. (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, Takahashi Y, Hayashi T, Saito K, Furuya H, Watanabe M, Murata M, Suzuki M, Sugiura A, Sawai S, Shibuya K, Ueda N, Ichikawa Y, Kanazawa I, Goto J and Tsuji S
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 59 号: 3 ページ: 163-172
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.139
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Exome sequencing shows a novel de novo mutation in ATL1. (2014)
  • 著者名/発表者名: Koh K, Ishiura H, Miwa M, Doi K, Yoshimura J, Mitsui J, Goto J, Morishita S, Tsuji S and Takiyama Y.
  • 雑誌名: Neurology and Clinical Neuroscience 巻: 2 号: 1 ページ: 1-4
  • DOI: 10.1111/ncn3.72
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genomic Aspects of Sporadic Neurodegenerative Diseases. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J and Tsuji S.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 巻: 452 号: 2 ページ: 221-225
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2014.07.098
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Neurogenomics view of neurological diseases. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsuji S.
  • 雑誌名: Arch. Neurol. 巻: 70 ページ: 689-694
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome analysis reveals a Japanese family with spinocerebellar ataxia, autosomal recessive 1. (2013)
  • 著者名/発表者名: Ichikawa Y, Ishiura H, Mitsui J, Takahashi Y, Kobayashi S, Takuma H, Kanazawa I, Doi K, Yoshimura J, Morishita S, Goto J, Tsuji S
  • 雑誌名: J. Neurol. Sci. 巻: 331 号: 1-2 ページ: 158-160
  • DOI: 10.1016/j.jns.2013.05.018
  • 査読あり
• [雑誌論文] ERBB4 Mutations that Disrupt the Neuregulin-ErbB4 Pathway Cause Amyotrophic Lateral Sclerosis Type 19. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Y, Fukuda Y, Yoshimura J, Toyoda A, (33名省略）, Morishita S, Goto J and Tsuji S.
  • 雑誌名: Am J Hum Genet 巻: 93 号: 5 ページ: 900-905
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2013.09.008
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in COQ2 in familial and sporadic multiple-system atrophy. (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, et. al.
  • 雑誌名: N Engl J Med 巻: 369 号: 3 ページ: 233-244
  • DOI: 10.1056/nejmoa1212115
  • 査読あり
• [雑誌論文] The TRK-fused gene is mutated in hereditary motor and sensory neuropathy with proximal dominant involvement. (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H
  • 雑誌名: Am J Hum Genet. 巻: 91(2) 号: 2 ページ: 320-9
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2012.07.014
  • 査読あり
• [雑誌論文] CSF1R mutations identified in three families with autosomal dominantly inherited leukoencephalopathy. (2012)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Matsukawa T, Ishiura H, Higasa K, Yoshimura J, Saito TL, Ahsan B, Takahashi Y, Goto J, Iwata A, Niimi Y, Riku Y, Goto Y, Mano K, Yoshida M, Morishita S, Tsuji S.
  • 雑誌名: Am J Med Genet B Neuropsychiatr Genet. 巻: 159B(8) 号: 8 ページ: 951-7
  • DOI: 10.1002/ajmg.b.32100
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of novel SNPs of ABCD1, ABCD2, ABCD3 and ABCD4 genes in patients with X-linked adrenoleukodystrophy (ALD) based on comprehensive resequencing and association studies with ALD phenotypes (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsukawa T, Asheuer M, Takahashi Y, Goto J, Suzuki Y, Shimozawa N, Takano H, Onodera O, Nishizawa M, Aubourg P, Tsuji S
  • 雑誌名: Neurogenetics 巻: 12 ページ: 41-50
  • 査読あり
• [雑誌論文] Posterior column ataxia with retinitis pigmentosa in a Japanese family with a novel mutation in FLVCR1 (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, Fukuda Y, Mitsui J, Nakahara Y, Ahsan B, Takahashi Y, Ichikawa Y, Goto J, Sakai T, Tsuji S
  • 雑誌名: Neurogenetics 巻: 12 ページ: 117-121
  • 査読あり
• [雑誌論文] Adult-onset leukoencephalopathies with vanishing white matter with novel missense mutations in EIF2B2, EIF2B3, and EIF2B5 (2011)
  • 著者名/発表者名: Matsukawa T, Wang X, Liu R, Onuki Y, Kubota A, Hida A, Kowa H, Fukuda Y, Ishiura H, Mitsui J, Takahashi Y, Aoki S, Takizawa T, Shimizu J, Goto J, Proud CG, Tsuji S
  • 雑誌名: Neurogenetics 巻: 12 ページ: 259-261
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiplexed resequencing analysis to identify rare variants in pooled DNA with barcode indexing employing next-generation sequencer (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Fukuda Y, Azuma K, Tozaki H, Ishiura H, Takahashi Y, Goto J, Tsuji S
  • 雑誌名: J.Hum.Genet. 巻: 55 ページ: 448-455
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetics of neurodegenerative diseases : insights from high-throughput resequencing (2010)
  • 著者名/発表者名: Tsuji S.
  • 雑誌名: Hum.Mol.Genet. 巻: 19 ページ: 65-70
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanisms of genomic instabilities underlying two common fragile site-associated loci, PARK2 and DMD, in germ cell and cancer cell lines (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Takahashi Y, Goto J, Tomiyama H, Ishikawa S, Yoshino H, Minami N, Smith DI, Lesage S, Aburatani H, Nishino I, Brice I, Hattori N, Tsuji S
  • 雑誌名: Amer J Hum Genet 巻: 87 ページ: 75-89
  • 査読あり
• [学会発表] The TRK-fused gene is mutated in hereditary motor and sensory neuropathy with proximal dominant involvement (HMSN-P). (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishiura, H. 他29名，Tsuji, S.
  • 学会等名: American Society of Human Genetics
  • 発表場所: San Francisco, USA
  • 年月日: 2012-11-06
• [備考] 筋萎縮性側索硬化症の新たな原因遺伝子を発見・根本治療への手がかりを得る
  • URL: http://www.h.u-tokyo.ac.jp/press/press_archive/20131011.html
• [備考] 新しい運動ニューロン病の原因遺伝子を発見
  • URL: http://www.h.u-tokyo.ac.jp/press/press_archives/20120810.html
• [備考] 新しい運動ニューロン病の原因遺伝子を発見
  • URL: http://www.h.u-tokyo.ac.jp/vcms_lf/release_20120803.pdf
• [産業財産権] 筋萎縮性側索硬化症の新規病因遺伝子 (2013)
  • 発明者名: 辻 省次，高橋 祐二
  • 権利者名: 辻 省次，高橋 祐二
  • 産業財産権種類: 特許
  • 出願年月日: 2013-08-02
  • 外国