パーソナルゲノム解析に基づくＡＬＳの疾患関連遺伝子探索と病態解明

• 研究領域: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明
• 研究課題/領域番号: 22129005
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 横浜市立大学 (2011-2014); 名古屋大学 (2010)
• 研究代表者: 田中 章景 横浜市立大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30378012)
• 研究分担者: 土井 宏 横浜市立大学, 医学部, 講師 (10326035) ; 熱田 直樹 名古屋大学, 医学部附属病院, 講師 (90547457)
• 連携研究者: 祖父江 元 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (20148315)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 51,740千円 (直接経費: 39,800千円、間接経費: 11,940千円); 2014年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円); 2013年度: 10,140千円 (直接経費: 7,800千円、間接経費: 2,340千円); 2012年度: 10,660千円 (直接経費: 8,200千円、間接経費: 2,460千円); 2011年度: 10,530千円 (直接経費: 8,100千円、間接経費: 2,430千円); 2010年度: 10,790千円 (直接経費: 8,300千円、間接経費: 2,490千円)
• キーワード: ALS / 次世代シーケンサー / エクソーム解析 / 遺伝子診断 / 病因遺伝子 / 家族性ALS

研究成果の概要

家族性ALSの網羅的遺伝子診断システムを開発し、孤発性ALS 469例について解析を行ったところ、対象とした家族性ALS関連28遺伝子のエクソン領域内で、既知の変異が14例に、新規多型が115個認められた。このうち病原性の疑われる多型は30例で計35個であった。また、孤発性ALS患者、コントロール合わせて800例のエクソームシークエンスを行い、データ解析を進めている。JaCALSの前向き臨床情報とリンクさせることで、進行・予後に関わるSNPsの同定をすすめ、少なくとも2つのSNPsにおいてminor alleleを有する患者が急速に進行することを明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] A Japanese case of cerebellar ataxia, spastic paraparesis and deep sensory impairment associated with a novel homozygous TTC19 mutation (2015)
  • 著者名/発表者名: Kunii M, Doi H, Higashiyama Y, Kugimoto C, Ueda N, Hirata J, Tomita-Katsumoto A, Kashikura-Kojima M, Kubota S, Taniguchi M, Murayama K, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N, Tanaka F.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 60 号: 4 ページ: 187-191
  • DOI: 10.1038/jhg.2015.7
  • NAID: 40020433141
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Late-onset spastic ataxia phenotype in a patient with a homozygous DDHD2 mutation (2014)
  • 著者名/発表者名: Doi H, Ushiyama M, Baba T, Tani K, Shiina M, Ogata K, Miyatake S, Yuzawa YF, Tsuji S, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Ikeda S, Tanaka F, Matsumoto N, Yoshida K
  • 雑誌名: Sci Rep 巻: 4 号: 1 ページ: 7132-7132
  • DOI: 10.1038/srep07132
  • NAID: 120007100602
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Early onset epileptic encephalopathy caused by de novo SCN8A mutations (2014)
  • 著者名/発表者名: Ohba C, Kato M, Takahashi S, Lerman-Sagie T, Lev D, Terashima H, Kubota M, Kawawaki H, Matsufuji M, Kojima Y, Tateno A, Goldberg-Stern H, Straussberg R, Marom D, Leshinsky-Silver E, Nakashima M, Nishiyama K, Tsurusaki Y, Miyake N, Tanaka F, Matsumoto N, Saitsu H:
  • 雑誌名: Epilepsia 巻: 55 号: 7 ページ: 994-1000
  • DOI: 10.1111/epi.12668
  • 査読あり
• [雑誌論文] Neck weakness is a potent prognostic factor in sporadic amyotrophic lateral sclerosis patients. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakamura R, Atsuta N, Watanabe H, Hirakawa A, Watanabe H, Ito M, Senda J, Katsuno M, Tanaka F, Izumi Y, Morita M, Ogaki K, Taniguchi A, Aiba I, Mizoguchi K, Okamoto K, Hasegawa K, Aoki M, Kawata A, Abe K, Oda M, Konagaya M, Imai T, Nakagawa M, Tsuji S, Kaji R, Nakano I, Sobue G.
  • 雑誌名: J Neurol Neurosurg Psychiatry 巻: 84 号: 12 ページ: 1365-1371
  • DOI: 10.1136/jnnp-2013-306020
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Spliceosome integrity is defective in the motor neuron diseases ALS and SMA (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsuiji H, Iguchi Y, Furuya A, Kataoka A, Hatsuta H, Atsuta N, Tanaka F, Hashizume Y, Akatsu H, Murayama S, Sobue G, Yamanaka K
  • 雑誌名: EMBO Mol Med 巻: 5 号: 2 ページ: 221-234
  • DOI: 10.1002/emmm.201202303
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A novel SCARB2 mutation causing late-onset progressive myoclonus epilepsy (2013)
  • 著者名/発表者名: Higashiyama Y, Doi H, Wakabayashi M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Ohba C, Fukai R, Miyatake S, Joki H, Koyano S, Suzuki Y, Tanaka F, Kuroiwa Y, Matsumoto N
  • 雑誌名: Mov Disord 巻: 28 号: 4 ページ: 552-553
  • DOI: 10.1002/mds.25296
  • 査読あり
• [雑誌論文] ALSのパーソナルゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中章景，曽根 淳，熱田直樹，中村亮一，土井 宏，児矢野 繁，祖父江 元
  • 雑誌名: Brain and Nerve 巻: 65 ページ: 257-265
• [雑誌論文] 次世代シーケンサーによる神経変性疾患の解析と展望 ALSのパーソナルゲノム解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中章景
  • 雑誌名: BRAIN and NERVE 巻: 65 ページ: 19-30
• [雑誌論文] Corticobasal Syndrome CBSと関連する遺伝子変異 (2013)
  • 著者名/発表者名: 土井宏
  • 雑誌名: BRAIN and NERVE 巻: 65 ページ: 19-30
• [雑誌論文] Neuropathology and omics in motor neuron diseases (2012)
  • 著者名/発表者名: Tanaka F
  • 雑誌名: Neuropathology 巻: 32 号: 4 ページ: 458-462
  • DOI: 10.1111/j.1440-1789.2011.01281.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] 神経疾患治療の進歩2011年 運動ニューロン疾患の治療の進歩 (2012)
  • 著者名/発表者名: 田中章景
  • 雑誌名: 神経治療学 巻: 29 ページ: 401-403
• [雑誌論文] A functional variant in ZNF512B is associated with susceptibility to amyotrophic lateral sclerosis in Japanese. (2011)
  • 著者名/発表者名: Iida A
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 20 号: 18 ページ: 3684-3692
  • DOI: 10.1093/hmg/ddr268
  • 査読あり
• [雑誌論文] A functional variant in ZNF512B is associated with susceptibility to a myotrophic lateral sclerosis in Japanese (2011)
  • 著者名/発表者名: Iida A, et al
  • 雑誌名: Hum Mol Genet 巻: 20 ページ: 3684-3692
  • 査読あり
• [学会発表] Analysis of major amyotrophic lateral sclerosis genes in Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakamura R, Sone J, Atsuta N, Watanabe H, Hirakawa A, Watanabe H, Ito M, Senda J, Katsuno K, Tanaka F, Izumi Y, Morita M, Ogaki K, Taniguchi A, Aiba A, Mizoguchi K, Okamoto K, Hasegawa K, Aoki M, Kawata A, Abe K, Oda M, Konagaya M, Imai T, Nakagawa M, Tsuji S, Kaji R, Nakano I, Sobue G
  • 学会等名: 64th Annual Meeting of the American Society of Human Genetics
  • 発表場所: San Diego Convention Center, San Diego, CA, USA
  • 年月日: 2014-10-18 – 2014-10-22
• [学会発表] SCARB2遺伝子に変異を認めた高齢発症の進行性ミオクローヌスてんかん兄妹例 (2013)
  • 著者名/発表者名: 東山雄一，土井宏，阿部弘基，中村治子，工藤洋祐，上木英人，児矢野 繁，鈴木ゆめ，黒岩義之，松本直通，田中章景
  • 学会等名: 第54回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム（東京都千代田）
  • 年月日: 2013-05-29 – 2013-06-01
• [学会発表] 運動ニューロン特異的TDP-43ノックアウトマウスの病理学的検討 (2013)
  • 著者名/発表者名: 井口洋平, 勝野雅央, 丹羽淳一, 高木伸之介, 山中宏二, 三澤日出巳, 高橋良 輔, 佐々木彰一, 田中章景, 祖父江元
  • 学会等名: 第54回日本神経学会学術大会
  • 発表場所: 東京国際フォーラム（東京都千代田）
  • 年月日: 2013-05-29 – 2013-06-01
• [学会発表] ALS疾患関連遺伝子の探索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田中章景
  • 学会等名: 新学術領域研究 脳疾患ゲノム情報班会議
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール（東京都）
  • 年月日: 2013-02-09
• [学会発表] 孤発性および家族性ALS疾患関連遺伝子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 田中章景
  • 学会等名: 新学術領域研究 脳疾患ゲノム情報班会議
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール（東京都）
  • 年月日: 2012-09-01
• [学会発表] 家族性および孤発性ALS関連遺伝子の探索 (2012)
  • 著者名/発表者名: 中村亮一, ら
  • 学会等名: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明班班会議
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス理学部1号館小柴ホール(東京)
  • 年月日: 2012-02-18
• [学会発表] パーソナルゲノム解析に基づくALSの疾患関連遺伝子探索と病態解明 (2011)
  • 著者名/発表者名: 田中章景, ら
  • 学会等名: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明班班会議
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス理学部1号館小柴ホール(東京)
  • 年月日: 2011-09-10
• [学会発表] パーソナルゲノム解析に基づくALSの疾患関連遺伝子探索と病態解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中章景, ら
  • 学会等名: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明班班会議
  • 発表場所: 学術総合センター(東京)
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] パーソナルゲノム解析に基づくALSの疾患関連遺伝子探索と病態解明 (2010)
  • 著者名/発表者名: 田中章景, ら
  • 学会等名: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明班班会議
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル(神戸)
  • 年月日: 2010-08-20
• [学会発表] JaCALS (Japanese Consortium for Amyotrophic Lateral Sclerosis research)について (2010)
  • 著者名/発表者名: 熱田直樹, ら
  • 学会等名: パーソナルゲノム情報に基づく脳疾患メカニズムの解明班班会議
  • 発表場所: 神戸ポートピアホテル(神戸)
  • 年月日: 2010-08-20
• [学会発表] パーソナルゲノム解析に基づくALSの疾患関連遺伝子探索と病態解明
  • 著者名/発表者名: 田中章景
  • 学会等名: 新学術領域研究 脳疾患ゲノム情報班会議
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール（東京都）
• [学会発表] 家族性および孤発性ALS関連遺伝子の探索
  • 著者名/発表者名: 中村亮一
  • 学会等名: 新学術領域研究 脳疾患ゲノム情報班会議
  • 発表場所: 東京大学小柴ホール（東京都）