計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成

• 研究領域: システム的統合理解に基づくがんの先端的診断、治療、予防法の開発
• 研究課題/領域番号: 22134004
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 複合領域
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 宮野 悟 東京大学, 医科学研究所, 教授 (50128104)
• 研究分担者: 井元 清哉 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (10345027) ; 山口 類 東京大学, 医科学研究所, 講師 (90380675) ; 白石 友一 東京大学, 医科学研究所, 助教 (70516880) ; 玉田 嘉紀 東京大学, 大学院情報理工学研究科, 助教 (80435495) ; 島村 徹平 名古屋大学, 医学系研究科, 特任准教授 (00623943) ; 長崎 正朗 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (90396862)
• 連携研究者: 樋口 知之 大学共同利用機関法人情報, システム研究機構統計数理研究所, 所長 (70202273) ; 茅野 光範 帯広畜産大学, 畜産学部, 講師 (20590095) ; 後藤 典子 東京大学, 医科学研究所, 特任准教授 (10251448)
• 研究期間 (年度): 2010-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 207,740千円 (直接経費: 159,800千円、間接経費: 47,940千円); 2014年度: 38,740千円 (直接経費: 29,800千円、間接経費: 8,940千円); 2013年度: 40,690千円 (直接経費: 31,300千円、間接経費: 9,390千円); 2012年度: 42,640千円 (直接経費: 32,800千円、間接経費: 9,840千円); 2011年度: 42,250千円 (直接経費: 32,500千円、間接経費: 9,750千円); 2010年度: 43,420千円 (直接経費: 33,400千円、間接経費: 10,020千円)
• キーワード: がん / システム生物学 / ゲノム科学 / バイオインフォマティクス / 統計的モデリング / 遺伝統計学 / スーパーコンピュータ / 遺伝子ネットワーク / シークエンス解析

研究成果の概要

数学とスパコンを駆使した大規模データ解析と数理モデリングをがん研究に融合するシステムがん研究を創成した。システムがん研究のためのシステムの構築と計算システム生物学の方法論を班員の各研究に導入し、スパコンを活用し、ウェットとドライの融合研究を活発化させた。その結果、がんのシステムの俯瞰的理解が飛躍的に進み、小川誠司との骨髄異形成症候群の共同研究では、RNAスプライシングの異常ががんの発症に関わることを示した世界で初めて示し、がん研究の歴史に刻まれる発見となった。高橋隆との共同研究では、肺腺がんの予後のスイッチを入れているハブ及びネットワークを発見した。

研究成果

• [雑誌論文] Genomon ITDetector: A tool for somatic internal tandem duplication detection from cancer genome sequencing data. Bioinformatics (2015)
  • 著者名/発表者名: Chiba K, Shiraishi Y, Nagata Y, Yoshida K, Imoto S, Ogawa S, Miyano S.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 31(1) ページ: 116-118
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• [雑誌論文] Whole-genome mutational landscape of liver cancers displaying biliary phenotype reveals hepatitis impact and molecular diversity (2015)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A, Furuta M, Shiraishi Y, Gotoh K, Kawakami Y, Arihiro K, Nakamura T, Ueno M, Ariizumi SI, Hai Nguyen H, Shigemizu D, Abe T, Boroevich KA, Nakano K, Sasaki A, Kitada R, Maejima K, Yamamoto Y, Tanaka H, Shibuya T, Shibata T, Ojima H, Shimada K, Hayami S, Shigekawa Y, Aikata H, Ohdan H, Marubashi S, et al.
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 6 ページ: 6120-6120
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• [雑誌論文] PRPF8 defects cause missplicing in myeloid malignancies (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurtovic-Kozaric A, Przychodzen B, Singh J, Konarska MM, Clemente MJ, Otrock ZK, Nakashima M, Hsi ED, Yoshida K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Ogawa S, Boultwood J, Makishima H, Maciejewski JP, Padgett RA
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 29(1) ページ: 126-136
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• [雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks (2015)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T
  • 雑誌名: MC Syst Biol 巻: 9(1) ページ: 14-14
  • NAID: 120005749949
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• [雑誌論文] Lung adenocarcinoma subtypes definable by lung development-related miRNA expression profiles in association with clinicopathologic features (2014)
  • 著者名/発表者名: Arima C, Kajino T, Tamada Y, Imoto S, Shimada Y, Nakatochi M, Suzuki M, Isomura H, Yatabe Y, Yamaguchi T, Yanagisawa K, Miyano S, Takahashi T
  • 雑誌名: Carcinogenesis 巻: 35(10) ページ: 2224-2231
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• [雑誌論文] Tracing the development of acute myeloid leukemia in CBL syndrome (2014)
  • 著者名/発表者名: Becker H, Yoshida K, Blagitko-Dorfs N, Claus R, Pantic M, Abdelkarim M, Niemoller C, Greil C, Hackanson B, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Dohner K, Schnittger S, Henneke P, Niemeyer CM, Flotho C, Pfeifer D, Ogawa S, Lubbert M
  • 雑誌名: Blood 巻: 123(12) ページ: 1883-1886
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• [雑誌論文] Acquired initiating mutations in early hematopoietic cells of CLL patients (2014)
  • 著者名/発表者名: Damm F, Mylonas E, Cosson A, Yoshida K, Della Valle V, Mouly E, Diop M, Scourzic L, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Kikushige Y, Davi F, Lambert J, Gautheret D, Merle-Beral H, Sutton L, Dessen P, Solary E, Akashi K, Vainchenker W, Mercher T, Droin N, Ogawa S, Nguyen-Khac F, Bernard OA
  • 雑誌名: Cancer Discov 巻: 4(9) ページ: 1088-1101
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• [雑誌論文] A tutorial to identify nonlinear associations in gene expression time series data (2014)
  • 著者名/発表者名: Fujita A, Miyano S
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 1164 ページ: 87-95
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• [雑誌論文] Landscape of genetic lesions in 944 patients with myelodysplastic syndromes (2014)
  • 著者名/発表者名: Haferlach T, Nagata Y, Grossmann V, Okuno Y, Bacher U, Nagae G, Schnittger S, Sanada M, Kon A, Alpermann T, Yoshida K, Roller A, Nadarajah N, Shiraishi Y, Shiozawa Y, Chiba K, Tanaka H, Koeffler HP, Klein HU, Dugas M, Aburatani H, Kohlmann A, Miyano S, Haferlach C, Kern W, Ogawa S
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 28(2) ページ: 241-247
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• [雑誌論文] An efficient data assimilation schema for restoration and extension of gene regulatory networks using time-course observation data (2014)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Akutsu T
  • 雑誌名: J Comput Biol 巻: 21(11) ページ: 785-798
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• [雑誌論文] An efficient method of exploring simulation models by assimilating literature and biological observational data (2014)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa T, Nagasaki M, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: Biosystems 巻: 121 ページ: 54-66
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• [雑誌論文] Recurrent genetic defects on chromosome 7q in myeloid neoplasms (2014)
  • 著者名/発表者名: Hosono N, Makishima H, Jerez A, Yoshida K, Przychodzen B, McMahon S, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Miyano S, Sanada M, Gomez-Segui I, Verma AK, McDevitt MA, Sekeres MA, Ogawa S, Maciejewski JP
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 28(6) ページ: 1348-1351
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• [雑誌論文] Comprehensive analysis of genetic alterations and their prognostic impacts in adult acute myeloid leukemia patients (2014)
  • 著者名/発表者名: Kihara R, Nagata Y, Kiyoi H, Kato T, Yamamoto E, Suzuki K, Chen F, Asou N, Ohtake S, Miyawaki S, Miyazaki Y, Sakura T, Ozawa Y, Usui N, Kanamori H, Kiguchi T, Imai K, Uike N, et. al.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 28(8) ページ: 1586-1595
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• [雑誌論文] CSML2SBML: a novel tool for converting quantitative biological pathway models from CSML into SBML (2014)
  • 著者名/発表者名: Li C, Nagasaki M, Ikeda E, Sekiya Y, Miyano S
  • 雑誌名: Biosystems 巻: 121 ページ: 22-28
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• [雑誌論文] Clonal leukemic evolution in myelodysplastic syndromes with TET2 and IDH1/2 mutations (2014)
  • 著者名/発表者名: Lin TL, Nagata Y, Kao HW, Sanada M, Okuno Y, Huang CF, Liang DC, Kuo MC, Lai CL, Lee EH, Shih YS, Tanaka H, Shiraishi Y, Chiba K, Lin TH, Wu JH, Miyano S, Ogawa S, Shih LY
  • 雑誌名: Haematologica 巻: 99(1) ページ: 28-36
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• [雑誌論文] Haploinsufficiency of Sf3b1 leads to compromised stem cell function but not to myelodysplasia (2014)
  • 著者名/発表者名: Matsunawa M, Yamamoto R, Sanada M, Sato-Otsubo A, Shiozawa Y, Yoshida K, Otsu M, Shiraishi Y, Miyano S, Isono K, Koseki H, Nakauchi H, Ogawa S
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 28(9) ページ: 1844-1850
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• [雑誌論文] Robust prediction of anti-cancer drug sensitivity and sensitivity-specific biomarker (2014)
  • 著者名/発表者名: Park H, Shimamura T, Miyano S, Imoto S
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9(1)
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• [雑誌論文] Somatic RHOA mutation in angioimmunoblastic T cell lymphoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Sakata-Yanagimoto M, Enami T, Yoshida K, Shiraishi Y, Ishii R, Miyake Y, Muto H, Tsuyama N, Sato-Otsubo A, Okuno Y, Sakata S, Kamada Y, Nakamoto-Matsubara R, et. al.
  • 雑誌名: Nat Genet. 巻: 46(2) ページ: 171-175
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• [雑誌論文] Recurrent somatic mutations underlie corticotropin-independent Cushing's syndrome (2014)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Maekawa S, Ishii R, Sanada M, Morikawa T, Shiraishi Y, Yoshida K, Nagata Y, Sato-Otsubo A, Yoshizato T, Suzuki H, Shiozawa Y, Kataoka K, Kon A, Aoki K, Chiba K, Tanaka H, Kume H, Miyano S, Fukayama M, Nureki O, Homma Y, Ogawa S
  • 雑誌名: Science 巻: 344(6186) ページ: 917-920
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• [雑誌論文] Loss of CDCP1 expression promotes invasiveness and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Sawada G, Takahashi Y, Niida A, Shimamura T, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Uchi R, Takano Y, Ueda M, Hirata H, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol 巻: 21 Suppl 4 ページ: 640-647
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• [雑誌論文] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: 74（１０） ページ: 2742-2749
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• [雑誌論文] A feature selection method using fixed-point algorithm for DNA microarray gene expression data (2014)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Paliwal KK, Imoto S, Miyano S, Sharma V, Ananthanarayanan R
  • 雑誌名: International Journal of Knowledge Based and Intelligent Engineering Systems 巻: 18(1) ページ: 55-59
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• [雑誌論文] A feature selection method using improved regularized linear discriminant analysis (2014)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Paliwal KK, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: Mach Vis Appl. 巻: 25(3) ページ: 775-786
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• [雑誌論文] Deep sequencing reveals stepwise mutation acquisition in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria (2014)
  • 著者名/発表者名: Shen W, Clemente MJ, Hosono N, Yoshida K, Przychodzen B, Yoshizato T, Shiraishi Y, Miyano S, Ogawa S, Maciejewski JP, Makishima H
  • 雑誌名: J Clin Invest 巻: 124(10) ページ: 4529-4538
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• [雑誌論文] Integrated analysis of whole genome and transcriptome sequencing reveals diverse transcriptomic aberrations driven by somatic genomic changes in liver cancers (2014)
  • 著者名/発表者名: Shiraishi Y, Fujimoto A, Furuta M, Tanaka H, Chiba K, Boroevich KA, Abe T, Kawakami Y, Ueno M, Gotoh K, Ariizumi S, Shibuya T, Nakano K, Sasaki A, Maejima K, Kitada R, Hayami S, Shigekawa Y, Marubashi S, Yamada T, Kubo M, et. al.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 9(12)
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• [雑誌論文] Allelic Imbalance at an 8q24 Oncogenic SNP is involved in activating MYC in human colorectal cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Sugimachi K, Niida A, Yamamoto K, Shimamura T, Imoto S, Iinuma H, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Sugihara K, Maehara Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol 巻: 21 Suppl 4 ページ: 515-521
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• [雑誌論文] The AURKA/TPX2 axis drives colon tumorigenesis cooperatively with MYC (2014)
  • 著者名/発表者名: Takahashi Y, Sheridan P, Niida A, Sawada G, Uchi R, Mizuno H, Kurashige J, Sugimachi K, Sasaki S, Shimada Y, Hase K, Kusunoki M, Kudo S, Watanabe M, Yamada K, Sugihara K, Yamamoto H, Suzuki A, Doki Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
  • 雑誌名: Ann Oncol. 巻: 26(5) ページ: 935-942
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• [雑誌論文] Unique mutation portraits and frequent COL2A1 gene alteration in chondrosarcoma (2014)
  • 著者名/発表者名: Totoki Y, Yoshida A, Hosoda F, Nakamura H, Hama N, Ogura K, Yoshida A, Fujiwara T, Arai Y, Toguchida J, Tsuda H, Miyano S, Kawai A, Shibata T
  • 雑誌名: Genome Res 巻: 24(9) ページ: 1411-1420
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• [雑誌論文] HapMuC: somatic mutation calling using heterozygous germline variants near candidate mutations (2014)
  • 著者名/発表者名: Usuyama N, Shiraishi Y, Sato Y, Kume H, Homma Y, Ogawa S, Miyano S, Imoto S
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 30(23) ページ: 3302-3309
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• [雑誌論文] BCOR and BCORL1 mutations in myelodysplastic syndromes and related disorders (2013)
  • 著者名/発表者名: Damm F, Chesnais V, Nagata Y, Yoshida K, Okuno Y, Itzykson R, Sanada M, Shiraishi Y, Gelsi-Boyer V, Miyano S, Mori H, Shih LY, Park S, Dreyfus F, Rose C, Cheze S, Vey N, Legentil M, Duffourd Y, de Botton S, Preudhomme C, Birnbaum D, Bernard OA, Ogawa S, Fontenay M, Kosmider O.
  • 雑誌名: Blood 巻: 122(18) ページ: 3169-3177
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• [雑誌論文] Novel recurrent mutations in the RAS-like GTP-binding gene RIT1 in myeloid malignancies (2013)
  • 著者名/発表者名: Gomez-Segui I, Makishima H, Jerez A, Yoshida K, Przychodzen B, Miyano S, Shiraishi Y, Husseinzadeh HD, Guinta K, Clemente M, Hosono N, McDevitt MA, Moliterno AR, Sekeres MA, Ogawa S, Maciejewski JP.
  • 雑誌名: Leukemia 巻: 27(9) ページ: 1943-1946
  • 査読あり
• [雑誌論文] Twist2 functions as a tumor suppressor in murine osteosarcoma cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Ishikawa T, Shimizu T, Ueki A, Yamaguchi SI, Onishi N, Sugihara E, Kuninaka S, Miyamoto T, Morioka H, Nakayama R, Kobayashi E, Toyama Y, Mabuchi Y, Matsuzaki Y, Yamaguchi R, Miyano S, Saya H.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 104(7) ページ: 880-888
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multi-omics approach for estimating metabolic networks using low-order partial correlations (2013)
  • 著者名/発表者名: Kayano M, Imoto S, Yamaguchi R, Miyano S.
  • 雑誌名: J Comput Biol. 巻: 20(8) ページ: 571-582
  • 査読あり
• [雑誌論文] Recurrent mutations in multiple components of the cohesin complex in myeloid neoplasms (2013)
  • 著者名/発表者名: Kon A, Shih LY, Sanada M, Shiraishi Y, Okuno Y, Nagae G, Nishimoto A, Nowak D, Sato Y, Shimamura T, Tanaka H, Chiba K, Yamaguchi T, Otsu M, Obara N, Nakamaki T, Ishiyama K, Nolte F, Hofmann WK, Miyawaki S, Chiba S, Mori H, Nakauchi H, Koeffler HP, Aburatani H, Haferlach T, Shirahige K, Miyano S, Ogawa S.
  • 雑誌名: Nature Genet. 巻: 45(10) ページ: 1232-1237
  • 査読あり
• [雑誌論文] Somatic SETBP1 mutations in myeloid malignancies (2013)
  • 著者名/発表者名: Makishima H, Yoshida K, Nguyen N, Okuno Y, Ng KP, Gudmundsson KO, Vishwakarma BA, Jerez A, Gomez-Segui I, Takahashi M, Shiraishi Y, Nagata Y, Guinta K, Mori H, Sekeres MA, Chiba K, Tanaka H, Muramatsu H, Sakaguchi H, Paquette RL, McDevitt MA, Kojima S, Saunthararajah Y, Miyano S, Shih LY, Du Y, Ogawa S, Maciejewski JP.
  • 雑誌名: Nature Genet. 巻: 45(8) ページ: 942-946
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multilayer cluster heat map visualizing biological tensor data (2013)
  • 著者名/発表者名: Niida A, Tremmel G, Imoto S, Miyano S.
  • 雑誌名: Lecture Notes in Bioinformatics 巻: 8213 ページ: 116-125
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor associated macrophages (2013)
  • 著者名/発表者名: Osawa T, Tsuchida R, Muramatsu M, Shimamura T, Wang F, Suehiro JI, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M.
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: 73(10) ページ: 3019-3028
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clonal selection in xenografted TAM recapitulates the evolutionary process of myeloid leukemia in Down syndrome (2013)
  • 著者名/発表者名: Saida S, Watanabe K, Sato-Otsubo A, Terui K, Yoshida K, Okuno Y, Toki T, Wang RN, Shiraishi Y, Miyano S, Kato I, Morishima T, Fujino H, Umeda K, Hiramatsu H, Adachi S, Ito E, Ogawa S, Ito M, Nakahata T, Heike T.
  • 雑誌名: Blood 巻: 121(21) ページ: 4377-4387
  • 査読あり
• [雑誌論文] Exome sequencing identifies secondary mutations of SETBP1 and JAK3 in juvenile myelomonocytic leukemia (2013)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi H, Okuno Y, Muramatsu H, Yoshida K, Shiraishi Y, Takahashi M, Kon A, Sanada M, Chiba K, Tanaka H, Makishima H, Wang X, Xu Y, Doisaki S, Hama A, Nakanishi K, Takahashi Y, Yoshida N, Maciejewski JP, Miyano S, Ogawa S, Kojima S.
  • 雑誌名: Nature Genet. 巻: 45(8) ページ: 937-941
  • 査読あり
• [雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renal cell carcinoma (2013)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Yoshizato T, Shiraishi Y, Maekawa S, Okuno Y, Kamura T, Shimamura T, Sato-Otsubo A, Nagae G, Suzuki H, Nagata Y, Yoshida K, Kon A, Suzuki Y, Chiba K, Tanaka H, Niida A, Fujimoto A, Tsunoda T, Morikawa T, Maeda D, Kume H, Sugano S, Fukayama M, Aburatani H, Sanada M, Miyano S, Homma Y, Ogawa S.
  • 雑誌名: Nature Genet. 巻: 45(8) ページ: 860-867
  • 査読あり
• [雑誌論文] A strategy to select suitable physicochemical attributes of amino acids for protein fold recognition (2013)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Paliwal KK, Dehzangi A, Lyons J, Imoto S, Miyano S.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 14(1) ページ: 233-233
  • 査読あり
• [雑誌論文] Principal component analysis using QR decomposition (2013)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Paliwal KK, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: International J Machine Learning and Cybernetics 巻: 4(6) ページ: 679-683
  • 査読あり
• [雑誌論文] An empirical Bayesian framework for somatic mutation detection from cancer (2013)
  • 著者名/発表者名: Shiraishi Y, Sato Y, Chiba K, Okuno Y, Nagata Y, Yoshida K, Shiba N, Hayashi Y, Kume H, Homma Y, Sanada M, Ogawa S, Miyano S
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 41(7)
  • 査読あり
• [雑誌論文] The rs6983267 SNP is associated with MYC transcription efficiency, which promotes progression and worsens prognosis of colorectal cancer (2013)
  • 著者名/発表者名: Takatsuno Y, Mimori K, Yamamoto K, Sato T, Niida A, Inoue H, Imoto S, Kawano S, Yamaguchi R, Toh H, Iinuma H, Ishimaru S, Ishii H, Suzuki S, Tokudome S, Watanabe M, Tanaka JI, Kudo SE, Mochizuki H, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Moriya Y, Miyano S, Sugihara K, Mori M
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol. 巻: 20(4) ページ: 1395-1402
  • 査読あり
• [雑誌論文] Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis (2013)
  • 著者名/発表者名: Yokobori T, Iinuma H, Shimamura T, Imoto S, Sugimachi K, Ishii H, Iwatsuki M, Ota D, Ohkuma M, Iwaya T, Nishida N, Kogo R, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Toh H, Sato T, Barnard GF, Fukagawa T, Yamamoto S, Nakanishi H, Sasaki S, Miyano S, Watanabe T, Kuwano H, Mimori K, Pantel K, Mori M
  • 雑誌名: Cancer Res. 巻: 73(7) ページ: 2059-2069
  • 査読あり
• [雑誌論文] The landscape of somatic mutations in Down syndrome-related myeloid disorders (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshida K, Toki T, Okuno Y, Kanezaki R, Shiraishi Y, Sato-Otsubo A, Kon A, Nagata Y, Sato Y, Wang R, Shiba N, Chiba K, Tanaka H, Hama A, Hasegawa D, Nakamura K, Kanegane H, Tsukamoto K, Adachi S, Kawakami K, Kato K, Nishimura R, Izraeli S, Hayashi Y, Miyano S, Kojima S, Ito E, Ogawa S
  • 雑誌名: Nature Genet. 巻: 45 ページ: 1293-1299
  • 査読あり
• [雑誌論文] Targeting BIG3-PHB2 interaction to overcome tamoxifen resistance in breast cancer cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshimaru T, Komatsu M, Matsuo T, Chen YA, Murakami Y, Mizuguchi K, Mizohata E, Inoue T, Akiyama M, Yamaguchi R, Imoto S, Miyano S, Miyoshi Y, Sasa M, Nakamura Y, Katagiri T
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 4 ページ: 2443-2013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Vasohibin-1 is identified as a master-regulator of endothelial cell apoptosis using gene network analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: Affara M, Sanders D, Araki H, Tamada Y, Dunmore B, Humphreys S, Imoto S, Savoie C, Miyano S, Kuhara S, Print C, Charnock-Jones DS
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 14(1) 号: 1 ページ: 23-23
  • DOI: 10.1186/1471-2164-14-23
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Tumor-suppressive mir-497-195 cluster targets multiple cell-cycle regulators in hepatocellular carcinoma. (2013)
  • 著者名/発表者名: Furuta M
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8 号: 3 ページ: e60155-e60155
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0060155
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular features of triple negative breast cancer cells by genome-wide gene expression profiling analysis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Komatsu M, Yoshimaru T, Matsuo T, Kiyotani K, Miyoshi Y, Tanahashi T, Rokutan K, Yamaguchi R, Saito A, Imoto S, Miyano S, Nakamura Y, Sasa M, Shimada M, Katagiri T.
  • 雑誌名: Int J Oncol. 巻: 42(2) 号: 2 ページ: 478-506
  • DOI: 10.3892/ijo.2012.1744
  • 査読あり
• [雑誌論文] XiP: a computational environment to create, extend and share workflows (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki M, Fujita A, Sekiya Y, Saito A, Ikeda E, Li C, Miyano S
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 29(1) 号: 1 ページ: 137-139
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts630
  • 査読あり
• [雑誌論文] PRD : A protein-RNA interaction database (2012)
  • 著者名/発表者名: Shigeo Fujimori, Katsuya Hino, Ayumu Saito, Satoru Miyano, Etsuko Miyamoto-Sato
  • 雑誌名: Bioinformation 巻: 8(15) 号: 15 ページ: 729-730
  • DOI: 10.6026/97320630008729
  • 査読あり
• [雑誌論文] IRView : a database and viewer for protein interacting regions (2012)
  • 著者名/発表者名: Shigeo Fujimori, Naoya Hirai, Kazuyo Masuoka, Tomohiro Oshikubo, Tatsuhiro Yamashita, Takanori Washio, Ayumu Saito, Masao Nagasaki, Satoru Miyano, Etsuko Miyamoto-Sato
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28(14) 号: 14 ページ: 1949-1950
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts289
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators. (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto A, Totoki Y, Abe T, Boroevich KA, Hosoda F, Nguyen HH, Aoki M, Hosono N, Kubo M, Miya F, Arai Y, Takahashi H, Shirakihara T, Nagasaki M, Shibuya T, Nakano K, Watanabe-Makino K, Tanaka H, Nakamura H, Kusuda J, Ojima H, Shimada K, Okusaka T, Ueno M, Shigekawa Y, Kawakami Y, Arihiro K, Ohdan H, Gotoh K, Ishikawa O, Ariizumi S, Yamamoto M, Yamada T, Chayama K, Kosuge T, Yamaue H, Kamatani N, Miyano S, Nakagama H, Nakamura Y, Tsunoda T, Shibata T, Nakagawa H
  • 雑誌名: Nature Genetic 巻: 44 号: 7 ページ: 760-764
  • DOI: 10.1038/ng.2291
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional clustering of time series gene expression data by Granger causality (2012)
  • 著者名/発表者名: Fujita A, Severino P, Kojima K, Sato JR, Patriota AG, Miyano S
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 巻: 6 号: 1 ページ: 137-137
  • DOI: 10.1186/1752-0509-6-137
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene network inference and visualization tools for biologists: application to new human transcriptome datasets (2012)
  • 著者名/発表者名: Hurley D, Araki H, Tamada Y, （４名）, Imoto S, Yasuda K, Tomiyasu Y, Tashiro K, Savoie C, Cho V, Smith S, Kuhara S, Miyano S, Charnock-Jones DS, Crampin EJ, Print CG
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 40(6) 号: 6 ページ: 2377-2398
  • DOI: 10.1093/nar/gkr902
  • 査読あり
• [雑誌論文] Increased Risk for CRC in Diabetic Patients with the Nonrisk Allele of SNPs at 8q24 (2012)
  • 著者名/発表者名: Ishimaru S, Iinuma H, et al
  • 雑誌名: Ann Surg Oncol 巻: 21(in press) 号: 9 ページ: 21-21
  • DOI: 10.1245/s10434-012-2278-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identifying Gene pathways associated with cancer characteristics via sparse statistical methods (2012)
  • 著者名/発表者名: Kawano S, Shimamura T, Niida A, Imoto S, Yamaguchi R, Nagasaki M, Yoshida R, Print C, Miyano S
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 巻: 9(4) 号: 4 ページ: 966-972
  • DOI: 10.1109/tcbb.2012.48
  • 査読あり
• [雑誌論文] Statistical model-based testing to evaluate the recurrence of genomic aberrations (2012)
  • 著者名/発表者名: Niida A, Imoto S, Shimamura T, Miyano S
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 28(12) 号: 12 ページ: i115-i120
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts203
  • 査読あり
• [雑誌論文] Computational gene network analysis reveals TNF-induced angiogenesis (2012)
  • 著者名/発表者名: Ogami K, Yamaguchi R, Imoto S, Tamada Y, Araki H, Print C, Miyano S
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 巻: 6(Supple 2) 号: S2
  • DOI: 10.1186/1752-0509-6-s2-s12
  • 査読あり
• [雑誌論文] A between-class overlapping filter-based method for transcriptome data analysis (2012)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: J Bioinformatics and Computational Biology 巻: 10(5) 号: 05 ページ: 1250010-1250010
  • DOI: 10.1142/s0219720012500102
  • 査読あり
• [雑誌論文] A top-r feature selection algorithm for microarray gene expression data (2012)
  • 著者名/発表者名: Sharma A, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 巻: 9(3) 号: 3 ページ: 754-764
  • DOI: 10.1109/tcbb.2011.151
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell cycle gene networks are associated with melanoma prognosis (2012)
  • 著者名/発表者名: Wang L, Hurley D, Watkins W, Araki H, Tamada Y, Muthukaruppan A, Ranjard L, Derkac E, Imoto S, Miyano S, Crampin E, Print C
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7(4) 号: 4 ページ: e34247-e34247
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0034247
  • 査読あり
• [雑誌論文] Epidermal growth factor receptor tyrosine kinase defines critical prognostic genes of stage I lung adenocarcinoma (2012)
  • 著者名/発表者名: 後藤 典子
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 7 号: 9 ページ: e43923-e43923
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0043923
  • 査読あり
• [雑誌論文] ChopSticks: High-resolution analysis of homozygous deletions by exploiting concordant read pairs (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuda T, Suzuki S, Nagasaki M, Miyano S
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 13(1) 号: 1 ページ: 279-279
  • DOI: 10.1186/1471-2105-13-279
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identifying regulational alterations in gene regulatory networks by state space representation of vector autoregressive models and variational annealing (2012)
  • 著者名/発表者名: 後藤 典子
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: Suppl. 1, 号: S1
  • DOI: 10.1186/1471-2164-13-s1-s6
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of genes up-regulated in ALK-positive and EGFR/KRAS/ALK-negative lung adenocarcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: 後藤 典子
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 72 号: 1 ページ: 100-111
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-11-1403
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inferring contagion in regulatory networks (2011)
  • 著者名/発表者名: Fujita A, Sato JR, Demas MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar, MC, Miyano S
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 巻: 8(2) 号: 2 ページ: 570-576
  • DOI: 10.1109/tcbb.2010.40
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive pharmacogenomic pathway screening by data assimilation (2011)
  • 著者名/発表者名: Hasegawa T, Yamaguchi R, Nagasaki M, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: Lecture Notes in Bioinformatics 巻: 6674 ページ: 160-171
  • DOI: 10.1007/978-3-642-21260-4_18
  • ISBN: 9783642212598, 9783642212604
  • 査読あり
• [雑誌論文] MIRACH : Efficient model checker for quantitative biological pathway models (2011)
  • 著者名/発表者名: Koh CH, Nagasaki M, Saito A, Li C, Wong L, Miyano S
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 27(5) 号: 5 ページ: 734-735
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btq727
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel network profiling analysis reveals system changes in epithelial-mesenchymal transition (2011)
  • 著者名/発表者名: Shimamura, T., Imoto, S., Shimada, Y., Hosono, Y., Niida, A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Takahashi, T., Miyano, S
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 6 号: 6 ページ: e20804-e20804
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0020804
  • 査読あり
• [雑誌論文] A rank-based statistical test for measuring synergistic effects between two gene sets (2011)
  • 著者名/発表者名: Shiraishi U, Okada-Hatakeyama M, Miyano S
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 27(17) 号: 17 ページ: 2399-2405
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr382
  • 査読あり
• [雑誌論文] ClipCrop : a tool for detecting structural variations with single-base resolution using soft-clipping information (2011)
  • 著者名/発表者名: Suzuki S, Yasuda T, Shiraishi Y, Miyano S, Nagasaki M
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 12 号: S14
  • DOI: 10.1186/1471-2105-12-s14-s7
  • 査読あり
• [雑誌論文] Parallel algorithm for learning optimal Bayesian network structure (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamada Y, Imoto S, Miyano S
  • 雑誌名: J Machine Learning Research 巻: 12 ページ: 2437-2459
  • 査読あり
• [雑誌論文] Estimating genome-wide gene networks using nonparametric Bayesian network models on massively parallel computers (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamada Y, Imoto S, Araki H, Nagasaki M, Print C, Charnock-Jones DS, Miyano S
  • 雑誌名: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics 巻: 8(3) 号: 3 ページ: 683-697
  • DOI: 10.1109/tcbb.2010.68
  • 査読あり
• [雑誌論文] SiGN : large-scale gene network estimation environment for high performance computing (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamada Y, Shimamura T, Yamaguchi R, Imoto S, Nagasaki M, Miyano S
  • 雑誌名: Genome Informatics 巻: 25 ページ: 40-52
  • NAID: 130004567842
  • 査読あり
• [雑誌論文] SiGN-SSM : open source parallel software for estimating gene networks with state space models (2011)
  • 著者名/発表者名: Tamada Y, Yamaguchi R, Imoto S, Hirose O, Yoshida R, Nagasaki M, Miyano S
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 27(8) 号: 8 ページ: 1172-1173
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btr078
  • 査読あり
• [雑誌論文] MRG-binding protein contributes to development of colorectal cancer (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi K, Sakai M, Kim J, Tsunesumi SI, Fujii T, Ikenoue T, Yamada Y, Akiyama Y, Muto Y, Yamaguchi R, Miyano S, Nakamura Y, Furukawa Y
  • 雑誌名: Cancer Science 巻: 102(8) 号: 8 ページ: 1486-1492
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2011.01971.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] N-cadherin expression is a potential survival mechanism of gefitinib-resistant lung cancer cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi M, Yoshino I, Yamaguchi R, Shimamura T, Nagasaki M, Imoto S, Niida A, Koizumi F, Kohno T, Yokota J, Miyano S, Gotoh N
  • 雑誌名: Am J Cancer Res 巻: 1(7) ページ: 828-833
  • 査読あり
• [雑誌論文] Frequent pathway mutations of splicing machinery in myelodysplasia (2011)
  • 著者名/発表者名: Kenichi Yoshida
  • 雑誌名: Nature 巻: 478 号: 7367 ページ: 64-69
  • DOI: 10.1038/nature10496
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing (2010)
  • 著者名/発表者名: Fujimoto, A., Nakagawa, H., Hosono, N., Nakano, K., Abe, G., Boroevich, K.A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Shibuya, T., Kubo, M., Miyano, S., Nakamura, Y., Tsunoda, T.
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 42 ページ: 931-936
  • 査読あり
• [雑誌論文] A fast and robust statistical test based on likelihood ratio with Bartlett correction to identify Granger causality between gene sets (2010)
  • 著者名/発表者名: Fujita, A., Kojima, K., Patriota, A.G., Sato, J.R., Severino, P., Miyano, S.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 26(18) ページ: 2349-2351
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identifying hidden confounders in gene networks by Bayesian networks (2010)
  • 著者名/発表者名: Higashigaki, T., Kojima, K., Yamaguchi, R., Inoue, M., Imoto, S., Miyano, S.
  • 雑誌名: Proc.10th IEEE Bioinformatics and Bioengineering ページ: 168-173
  • 査読あり
• [雑誌論文] Granger causality in systems biology : modeling gene networks in time series microarray data using vector autoregressive models (2010)
  • 著者名/発表者名: Fujita, A., Severino, P., Sato, J.R., Miyano, S.
  • 雑誌名: Lecture Notes in Computer Science 巻: 6268 ページ: 13-24
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovering functional gene pathways associated with cancer heterogeneity via sparse supervised learning (2010)
  • 著者名/発表者名: Kawano, S., Shimamura, T., Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Yoshida, R., Print, C., Miyano, S.
  • 雑誌名: Proc.IEEE 10th International Symposium on Bioinformatics & Bioengineering ページ: 253-258
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene regulatory network clustering for graph layout based on microarray gene expression data (2010)
  • 著者名/発表者名: Kojima, K., Imoto, S., Nagasaki, M., Miyano, S.
  • 雑誌名: Genome Informatics 巻: 24 ページ: 84-95
  • 査読あり
• [雑誌論文] An efficient biological pathway layout algorithm combining grid-layout and spring embedder for complicated cellular location information (2010)
  • 著者名/発表者名: Kojima, K., Nagasaki, M., Miyano, S.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics 巻: 11:335(掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell Illustrator 4.0 : A computational platform for systems biology (2010)
  • 著者名/発表者名: Nagasaki, M., Saito, A., Jeong, E., Li, C., Kojima, K., Ikeda, E., Miyano, S.
  • 雑誌名: In Silico Biology 巻: 10:0002(掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gene set-based module discovery decodes cis-regulatory codes governing diverse gene expression across human multiple tissues (2010)
  • 著者名/発表者名: Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Miyano, S.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 5(6):e10910(掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Model-free unsupervised gene set screening based on information enrichment in expression profiles (2010)
  • 著者名/発表者名: Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Fujita, A., Shimamura, T., Miyano, S.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 26(24) ページ: 3090-3097
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inferring dynamic gene networks under varying conditions for transcriptomic network comparison (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimamura, T., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Miyano, S.
  • 雑誌名: Bioinformatics 巻: 26(8) ページ: 1064-1072
  • 査読あり
• [雑誌論文] Collocation-based sparse estimation for constructing dynamic gene networks (2010)
  • 著者名/発表者名: Shimamura, T., Imoto, S., Nagasaki, M., Yamauchi, M., Yamaguchi, R., Fujita, A., Tamada, Y, Gotoh, N., Miyano, S.
  • 雑誌名: Genome Informatics 巻: 24 ページ: 164-178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphoproteomics-based modeling defines the regulatory mechanism underlying aberrant EGFR signaling (2010)
  • 著者名/発表者名: Tasaki, S., Nagasaki, M., Kozuka-Hata, H., Semba, K., Gotoh, N., Hattori, S., Inoue, J., Yamamoto, T., Miyano, S., Sugano, S., Oyama, M.
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 5(11):e13926
  • 査読あり
• [学会発表] スーパーコンピュータによる薬物標的、疾病応答遺伝子の探索 (2015)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 医薬ライセンシング協会第 239回月例会
  • 発表場所: 学士会館(東京都千代田区)
  • 年月日: 2015-03-18
  • 招待講演
• [学会発表] Understanding Cancer Heterogeneity with Supercomputers (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The Third BMIRC International Symposium
  • 発表場所: 池のおく園(福岡県田川市)
  • 年月日: 2015-03-05
  • 招待講演
• [学会発表] Identification of Oncogenic Co-regulators using Infinite Relational Models (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Chikahara, Atsushi Niida, Rui Yamaguchi, Seiya Imoto, Satoru Miyano
  • 学会等名: The 15th International Conference on Systems Biology (ICSB) 2014
  • 発表場所: メルボルン(オーストラリア)
  • 年月日: 2014-09-14 – 2014-09-18
• [学会発表] Supercomputers for Cancer Research and Cancer Big Data (2014)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 3rd SNU International Bioinformatics Workshop 2014
  • 発表場所: ソウル(韓国)
  • 年月日: 2014-06-23
  • 招待講演
• [学会発表] バイオインフォマティクスとシステム生物学によるバイオマーカー探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第21回HAB研究機構学術年会
  • 発表場所: 昭和大学(東京都品川区)
  • 年月日: 2014-05-17
  • 招待講演
• [学会発表] Cancer Gene Network Analysis with Supercomputer (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 3rd IEEE International Conference on Computational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS 2013)
  • 発表場所: Crowne Plaza New Orleans-Airport, New Orleans, USA
  • 招待講演
• [学会発表] ancer Gene Network Analysis with Supercomputer (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 9th ISCB Student Council Symposium
  • 発表場所: Roof Graden, ICC, Berlin, Germany
  • 招待講演
• [学会発表] Uncovering Gene Networks in Cancer by Computational Systems Biology (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 48th Meeting of The Polish Biochemistry Society
  • 発表場所: Torun, Poland
  • 招待講演
• [学会発表] Accelerating Systems Cancer Research by Supercomputer (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: CSHL Asia Symposium “Frontiers in Bioinformatics and Computational Biology”
  • 発表場所: Suzhou Dushu Lake Conference Center, Cold Spring Harbor Laboratory Asia Watson Auditorium, PR China
  • 招待講演
• [学会発表] Cancer Gene Network Analysis (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 24th International Conference on Genome Informatics (GIW 2013)
  • 発表場所: Biopolis, Singapore
  • 招待講演
• [学会発表] Supercomputer for Personalized Genomic Medicine and Cancer Systems Biology (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The University of Chicago Department of Medicine Section of Hematology/ Oncology Seminar
  • 発表場所: 米国 シカゴ
  • 招待講演
• [学会発表] Uncovering Diversity of Cancer as System by supercomputer (2013)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: 第6回高度医療都市を創出する未来技術国際シンポジウム
  • 発表場所: 岡山大学
  • 招待講演
• [学会発表] Supercomputing for Next-Generation Cancer Research (2012)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The Fourth Biosupercomputing Symposium
  • 発表場所: 東京国際フォーラム
  • 招待講演
• [学会発表] スパコンで焙り出すがんのシステムとしての薬剤応答性と多様性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 宮野 悟
  • 学会等名: 第７１回日本癌学会学術総会 モーニングレクチャー
  • 発表場所: 札幌市教育文化会館
  • 招待講演
• [学会発表] Whole genome sequencing and supercomputer for personalized genomic medicine: The IMSUT plan (2012)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 11th Surugadai International Symposium
  • 発表場所: 東京医科歯科大学
  • 招待講演
• [学会発表] Uncovering Molecular Networks in Cancer by Supercomputer Towards Personalized Medicine (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: The 11th IEEE International Conference on BIOINFORMATICS & BIOENGINEERING
  • 発表場所: Splendor Hotel Taichung, Taiwan(招待講演)
  • 年月日: 2011-10-24
• [学会発表] Uncovering Systems in Cancer by Supercomputer (2011)
  • 著者名/発表者名: Miyano S
  • 学会等名: JCA-AACR Joint Symposium at the 70th Annual Meeting of JCA
  • 発表場所: Nagoya Congress Center(招待講演)
  • 年月日: 2011-10-03
• [学会発表] スパコンで焙り出すがんのシステム (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 生物物理学会シンポジウム
  • 発表場所: 兵庫県立大学(招待講演)
  • 年月日: 2011-09-16
• [学会発表] スパコンが焙り出すシステムとしてのがんの薬剤応答性、個性、多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 日本がん分子標的治療学会学術集会
  • 発表場所: ホテル日航東京(招待講演)
  • 年月日: 2011-06-24
• [学会発表] Breaking the Keys to Cancer Systems by Supercomputer (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: The 21st International Conference on Genome Informatics
  • 発表場所: The First World Hotel, Hangzhou, China
  • 年月日: 2010-12-16
• [学会発表] Can Supercomputer Hack Cancer Systems? (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Asian Regional Conference on Systems Biology
  • 発表場所: The Royal Chulan Kuala Lumpur, Malaysia
  • 年月日: 2010-11-30
• [学会発表] Breaking the Keys to Cancer Systems with Supercomputer (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Seoul National University Cancer Research Institute Symposium
  • 発表場所: Seoul National University Dental Hospital, Seoul, Korea
  • 年月日: 2010-11-06
• [学会発表] Can Supercomputer Hack Cancer Systems? (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: CSH Asia Conference on Computational Biology
  • 発表場所: Suzhou, China
  • 年月日: 2010-09-27
• [学会発表] がんをシステムとして読み解くために (2010)
  • 著者名/発表者名: 宮野悟
  • 学会等名: 統計関連連合大会
  • 発表場所: 早稲田大学
  • 年月日: 2010-09-07
• [学会発表] Supercomputing for Systems Biology (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoru Miyano
  • 学会等名: Brazilian Symposium on Bioinformatics 2010
  • 発表場所: Ferradura Resort, Buzios, Rio de Janeiro, Brazil
  • 年月日: 2010-09-01
• [備考] システム的統合理解に基づくがんの先端的診断、治療、予防法の開発
  • URL: http://cancersystem.hgc.jp/
• [備考] PART and PART-up
  • URL: http://www.hgc.jp/~niiyan/PART/manual.html
• [備考] Genomon-fusion
  • URL: http://genomon.hgc.jp/rna/
• [備考] Cancer integrative Pipeline
  • URL: http://cancerip.hgc.jp/
• [備考] エキソームシークエンサーデータ解析パイプラインGENOMON
  • URL: http://genomon.hgc.jp/exome/