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がんのバイオインフォマティクスと遺伝統計学的解析

計画研究

研究領域システム的統合理解に基づくがんの先端的診断、治療、予防法の開発
研究課題/領域番号 22134008
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

角田 達彦  独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, グループディレクター (10273468)

研究分担者 藤本 明洋  独立行政法人理化学研究所, 統合医科学研究センター, 副チームリーダー (30525853)
宮 冬樹  独立行政法人理化学研究所, 統合医科学研究センター, リサーチアソシエイト (50415311)
ジョンソン トッド (TODD・A Johnson / JOHNSON Todd・A / Todd・A Johnson)  独立行政法人理化学研究所, 統合医科学研究センター, リサーチアソシエイト (90392042)
連携研究者 中川 英刀  独立行政法人理化学研究所, 統合医科学研究センター, チームリーダー (50361621)
研究期間 (年度) 2010-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
97,240千円 (直接経費: 74,800千円、間接経費: 22,440千円)
2014年度: 18,070千円 (直接経費: 13,900千円、間接経費: 4,170千円)
2013年度: 18,980千円 (直接経費: 14,600千円、間接経費: 4,380千円)
2012年度: 20,020千円 (直接経費: 15,400千円、間接経費: 4,620千円)
2011年度: 19,760千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 4,560千円)
2010年度: 20,410千円 (直接経費: 15,700千円、間接経費: 4,710千円)
キーワード癌 / ゲノム / 統計数学 / 遺伝学 / オミックス解析 / 次世代シークエンサー / 予測 / オーダーメイド医療 / 情報工学 / 肝臓がん / 遺伝子 / 遺伝統計学 / クロマチン制御遺伝子 / がんゲノム / 多様性 / コピー数多型 / 構造多型 / 日本人ゲノム / 国際がんゲノムコンソーシアム / ゲノムワイド関連解析
研究成果の概要

がんを体系的網羅的解析により理解し、個々の患者の体質や状態、環境要因を鑑みた医療を実現することを目的とした。そのため、次世代シークエンサー等の最新のオミックス観測技術の解析方法の確立、オミックス情報と臨床像や薬剤応答との関係の解明、マーカー同定、オミックスの因果関係を解明、予測手法の開発を行った。それらを用い、世界初の日本人ゲノムの解析、がん全ゲノムデータの解析、肝内胆管癌の全ゲノム解析、がんのドライバー変異・遺伝子の同定、がん発症のメカニズムの解明を行う新たな方法や、診断や薬剤応答などの予測システムの構築などを達成した。

報告書

(6件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 研究成果

    (77件)

すべて 2015 2014 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 (35件) (うち査読あり 33件、 オープンアクセス 4件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (41件) (うち招待講演 14件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Whole-genome mutational landscape of liver cancers displaying biliary phenotype reveals hepatitis impact and molecular diversity2015

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Furuta M, Shiraishi Y, Shigemizu D, Abe T, Boroevich KA, Nakano K, Yamamoto Y, Tanaka H, Shibuya T, Shibata T, Kubo M, Chayama K, Miyano S, Tsunoda T, Nakagawa H, 他
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 6 号: 1 ページ: 6120-6120

    • DOI

      10.1038/ncomms7120

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] WHSC1 Promotes Oncogenesis through Regulation of NIMA-related-kinase-7 in Squamous Cell Carcinoma of the Head and Neck2015

    • 著者名/発表者名
      Saloura V, Cho HS, Kyiotani K, Alachkar H, Zuo Z, Nakakido M, Tsunoda T, Seiwert T, Lingen M, Licht J, Nakamura Y, Hamamoto R
    • 雑誌名

      Molecular Cancer Research

      巻: 13 号: 2 ページ: 293-304

    • DOI

      10.1158/1541-7786.mcr-14-0292-t

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] 数理科学・計算科学とゲノム2015

    • 著者名/発表者名
      角田 達彦
    • 雑誌名

      血管医学

      巻: 16 ページ: 85-91

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] Integrated analysis of whole genome and transcriptome sequencing reveals diverse transcriptomic aberrations driven by somatic genomic changes in liver cancers2014

    • 著者名/発表者名
      Shiraishi Y, Fujimoto A, Furuta M, Chayama K, Tsunoda T, Miyano S, and Nakagawa H, 他
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 号: 12 ページ: e114263-e114263

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0114263

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The construction of risk prediction models using GWAS data and its application to a type 2 diabetes prospective cohort2014

    • 著者名/発表者名
      Shigemizu D, Abe T, Morizono T, Johnson TA, Boroevich KA, Hirakawa Y, Ninomiya T, Kiyohara Y, Kubo M, Nakamura Y, Maeda S, Tsunoda T
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 号: 3 ページ: e92549-e92549

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0092549

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] がん研究におけるゲノムビッグデータ解析と臨床応用2014

    • 著者名/発表者名
      角田 達彦
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 32 ページ: 2046-2051

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [雑誌論文] A practical method to detect SNVs and indels from whole genome and exome sequencing data.2013

    • 著者名/発表者名
      Shigemizu D, Fujimoto A, Akiyama S, Abe T, Nakano K, Boroevich KA, Yamamoto Y, Furuta M, Kubo M, Nakagawa H, Tsunoda T.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 3 号: 1 ページ: 2161-2161

    • DOI

      10.1038/srep02161

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renal cell carcinoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Yoshida K
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45 号: 8 ページ: 860-867

    • DOI

      10.1038/ng.2699

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The oncogenic polycomb histone methyltransferase EZH2 methylates lysine 120 on histone H2B and competes ubiquitination.2013

    • 著者名/発表者名
      Kogure M, Takawa M, Saloura V, Sone K, Piao L, Ueda K, Ibrahim R, Tsunoda T, Sugiyama M, Atomi Y, Nakamura Y, Hamamoto R.
    • 雑誌名

      Neoplasia

      巻: 15 号: 11 ページ: 1251-1261

    • DOI

      10.1593/neo.131436

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deregulation of the histone demethylase JMJD2A is involved in human carcinogenesis through regulation of the G(1)/S transition.2013

    • 著者名/発表者名
      Kogure M, Takawa M, Cho HS, Toyokawa G, Hayashi K, Tsunoda T, Kobayashi T, Daigo Y, Sugiyama M, Atomi Y, Nakamura Y, Hamamoto R.
    • 雑誌名

      Cancer Letters

      巻: 336 号: 1 ページ: 76-84

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2013.04.009

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Morphological and microarray analyses of human hepatocytes from xenogeneic host livers.2013

    • 著者名/発表者名
      Tateno C, Miya F, Wake K, Kataoka M, Ishida Y, Yamasaki C, Yanagi A, Kakuni M, Wisse E, Verheyen F, Inoue K, Sato K, Kudo A, Arii S, Itamoto T, Asahara T, Tsunoda T, Yoshizato K.
    • 雑誌名

      Laboratory investigation

      巻: 93 号: 1 ページ: 54-71

    • DOI

      10.1038/labinvest.2012.158

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The histone methyltransferase Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1-like 1 (WHSC1L1) is involved in human carcinogenesis.2013

    • 著者名/発表者名
      Kang D, Cho HS, Toyokawa G, Kogure M, Yamane Y, Iwai Y, Hayami S, Tsunoda T, Field HI, Matsuda K, Neal DE, Ponder BA, Maehara Y, Nakamura Y, Hamamoto R.
    • 雑誌名

      Genes Chromosomes Cancer

      巻: 52 号: 2 ページ: 126-139

    • DOI

      10.1002/gcc.22012

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-nucleotide polymorphisms in GALNT8 are associated with the response to interferon therapy for chronic hepatitis C2013

    • 著者名/発表者名
      Nakano R, Maekawa T, Abe H, Hayashida Y, Ochi H, Tsunoda T, Kumada H, Kamatani N, Nakamura Y, Chayama K
    • 雑誌名

      The Journal of General Virology

      巻: 94 号: 1 ページ: 81-89

    • DOI

      10.1099/vir.0.044396-0

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators.2012

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Totoki Y, Abe T, Boroevich KA, Hosoda F, Nguyen HH, Aoki M, Hosono N, Kubo M, Miya F, Arai Y, Takahashi H, Shirakihara T, Nagasaki M, Shibuya T, Nakano K, Watanabe-Makino K, Tanaka H, Nakamura H, Kusuda J, Ojima H, Shimada K, Okusaka T, Ueno M, Shigekawa Y, Kawakami Y, Arihiro K, Ohdan H, Gotoh K, Ishikawa O, Ariizumi S, Yamamoto M, Yamada T, Chayama K, Kosuge T, Yamaue H, Kamatani N, Miyano S, Nakagama H, Nakamura Y, Tsunoda T, Shibata T, Nakagawa H
    • 雑誌名

      Nature Genetic

      巻: 44 号: 7 ページ: 760-764

    • DOI

      10.1038/ng.2291

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Histone lysine methyltransferase SETD8 promotes carcinogenesis by deregulating PCNA expression2012

    • 著者名/発表者名
      M. Takawa, H. S. Cho, S. Hayami, G. Toyokawa, M. Kogure, Y. Yamane, Y. Iwai, K. Maejima, K. Ueda, A. Masuda, N. Dohmae, H. I. Field, T. Tsunoda, T. Kobayashi, T. Akasu, M. Sugiyama, S. Ohnuma, Y. Atomi, B. A. Ponder, Y. Nakamura, and R. Hamamoto
    • 雑誌名

      Cancer research

      巻: 72(13) 号: 13 ページ: 3217-27

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-11-3701

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese.2012

    • 著者名/発表者名
      赤松秀輔
    • 雑誌名

      Plos One

      巻: 7 号: 10 ページ: 46454-46454

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0046454

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-Risk Ovarian Cancer Based on 126-Gene Expression Signature Is Uniquely Characterized by Downregulation of Antigen Presentation Pathway2012

    • 著者名/発表者名
      Kosuke Yoshihara
    • 雑誌名

      Clinical Cancer Research

      巻: 18 号: 5 ページ: 1374-1385

    • DOI

      10.1158/1078-0432.ccr-11-2725

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] IRX4 at 5p15 suppresses prostate cancer growth through the interaction with vitamin D receptor, conferring prostate cancer2012

    • 著者名/発表者名
      Ha Nguyen H, 他
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: 21 号: 9 ページ: 2076-2085

    • DOI

      10.1093/hmg/dds025

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] hzAnalyzer : Detection, quantification, and visualization of contiguous homozygosity in high-density genotyping datasets2011

    • 著者名/発表者名
      T.A.Johnson, Y.Niimura, H.Tanaka, Y.Nakamura, T.Tsunoda
    • 雑誌名

      Genome Biology

      巻: 12 号: 3

    • DOI

      10.1186/gb-2011-12-3-r21

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inferring Haplotypes of Copy Number Variations From High-Throughput Data With Uncertainty2011

    • 著者名/発表者名
      M.Kato, S.Yoon, N.Hosono, A.Leotta, J.Sebat, T.Tsunoda, M.Q.Zhang
    • 雑誌名

      G3 : Genes, Genomes, Genetics

      巻: 1 号: 1 ページ: 35-42

    • DOI

      10.1534/g3.111.000174

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Variation in the DEPDC5 locus is associated with progression to hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis C virus carriers2011

    • 著者名/発表者名
      Miki D, Ochi H, Hayes CN, Abe H, Yoshima T, Aikata H, Ikeda K, KumadaH, Toyota J, Morizono T, Tsunoda T, Kubo M, Nakamura Y, Kamatani N, Chayama K
    • 雑誌名

      Nat Genet

      巻: 43 号: 8 ページ: 797-800

    • DOI

      10.1038/ng.876

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A genome-wide association study identifies locus at 10q22 associated with clinical outcomes of adjuvant tamoxifen therapy for breast cancer patients in Japanese2011

    • 著者名/発表者名
      K.Kiyotani, T.Mushiroda, T.Tsunoda, T.Morizono, N.Hosono, M.Kubo, Y.Tanigawara, CK.Imamura, DA.Flockhart, F.Aki, K.Hirata, Y.Takatsuka, M.Okazaki, S.Ohsumi, T.Yamakawa, M.Sasa, Y.Nakamura, H.Zembutsu
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: (オンライン出版済) 号: 7 ページ: 1665-1672

    • DOI

      10.1093/hmg/ddr597

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Common variants on 14q32 and 13q12 are associated with DLBCL susceptibility2011

    • 著者名/発表者名
      V.Kumar, K.Matsuo, A.Takahashi, N.Hosono, T.Tsunoda, N.Kamatani, S.Y.Kong, H.Nakagawa, R.Cui, C.Tanikawa, M.Seto, Y.Morishima, M.Kubo, Y.Nakamura, K.Matsuda
    • 雑誌名

      Journal of Human Genetics

      巻: 56 号: 6 ページ: 436-439

    • DOI

      10.1038/jhg.2011.35

    • NAID

      10030659704

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Common variant in 6q26-q27 is associated with distal colon cancer in an Asian population2011

    • 著者名/発表者名
      R.Cui, Y.Okada, S.G.Jang, J.L.Ku, J.G.Park, Y.Kamatani, N.Hosono, T.Tsunoda, V.Kumar, C.Tanikawa, N.Kamatani, R.Yamada, M.Kubo, Y.Nakamura, K.Matsuda
    • 雑誌名

      Gut

      巻: 60 号: 6 ページ: 799-805

    • DOI

      10.1136/gut.2010.215947

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association of a novel long non-coding RNA in 8q24 with prostate cancer susceptibility2011

    • 著者名/発表者名
      S.Chung, H.Nakagawa, M.Uemura, L.Piao, K.Ashikawa, N.Hosono, R.Takata, S.Akamatsu, T.Kawaguchi, T.Morizono, T.Tsunoda, Y.Daigo, K.Matsuda, N.Kamatani, Y.Nakamura, M.Kubo
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 102 号: 1 ページ: 245-252

    • DOI

      10.1111/j.1349-7006.2010.01737.x

    • NAID

      10029289301

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Histone Lysine Methyltransferase Wolf-Hirschhorn Syndrome Candidate 1 Is Involved in Human Carcinogenesis through Regulation of the Wnt Pathway2011

    • 著者名/発表者名
      G.Toyokawa, H.S.Cho, K.Masuda, Y.Yamane, M.Yoshimatsu, S.Hayami, M.Takawa, Y.Iwai, Y.Daigo, E.Tsuchiya, T.Tsunoda, H.I.Field, J.D.Kelly, D.E.Neal, Y.Maehara, B.A.Ponder, Y.Nakamura, R.Hamamoto
    • 雑誌名

      Neoplasia

      巻: 13 号: 10 ページ: 887-898

    • DOI

      10.1593/neo.11048

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The JmjC domain-containing histone demethylase KDM3A is a positive regulator of the G(1)/S transition in cancer cells via transcriptional regulation of the HOXA1 gene2011

    • 著者名/発表者名
      Cho HS, Toyokawa G, Daigo Y, Hayami S, Masuda K, Ikawa N, Yamane Y, Maejima K, Tsunoda T, Field HI, Kelly JD, Neal DE, Ponder BA, Maehara Y, Nakamura Y, Hamamoto R
    • 雑誌名

      Int J Cancer

      巻: (in press) 号: 3

    • DOI

      10.1002/ijc.26501

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The histone demethylase JMJD2B plays an essential role in human carcinogenesis through positive regulation of cyclin-dependent kinase 62011

    • 著者名/発表者名
      Toyokawa G, Cho H-S, Iwai Y, Yoshimatsu M, Takawa M, Hayami S, Maejima K, Shimizu N, Tanaka H, Tsunoda T, Field H, Kelly J, Neal D, Ponder B, Maehara Y, Nakamura Y, Hamamoto R
    • 雑誌名

      Cancer Prev.Res.

      巻: 4 号: 12 ページ: 2051-2061

    • DOI

      10.1158/1940-6207.capr-11-0290

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enhanced Expression of EHMT2 Is Involved in the Proliferation of Cancer Cells through Negative Regulation of SIAH12011

    • 著者名/発表者名
      H.S.Cho, J.D.Kelly, S.Hayami, G.Toyokawa, M.Takawa, M.Yoshimatsu, T.Tsunoda, H.I.Field, D.E.Neal, B.A.Ponder, Y.Nakamura, R.Hamamoto
    • 雑誌名

      Neoplasia

      巻: 13 号: 8 ページ: 676-684

    • DOI

      10.1593/neo.11512

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Predicting response of bladder cancers to gemcitabine and carboplatin neoadjubant chemotherapy through genome-wide gene expression profiling2011

    • 著者名/発表者名
      Y.Kato, H.Zembutsu, R.Takata, F.Miya, T.Tsunoda, W.Obara, T.Fujioka, Y.Nakamura
    • 雑誌名

      Experimental and Therapeutic Medicine

      巻: 2 号: 1 ページ: 47-56

    • DOI

      10.3892/etm.2010.166

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dysregulation of PRMT1 and PRMT6, type I arginine methyltransferases, is involved in various types of human cancers2011

    • 著者名/発表者名
      M.Yoshimatsu, G.Toyokawa, S.Hayami, M.Unoki, T.Tsunoda, H.I.Field, J.D.Kelly, D.E.Neal, Y.Maehara, B.A.Ponder, Y.Nakamura, R.Hamamoto
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer

      巻: 128 号: 3 ページ: 562-573

    • DOI

      10.1002/ijc.25366

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Overexpression of LSD1 contributes to human carcinogenesis through chromatin regulation in various cancers2011

    • 著者名/発表者名
      S.Hayami, J.D.Kelly, H.S.Cho, M.Yoshimatsu, M.Unoki, T.Tsunoda, H.I.Field, D.E.Neal, H.Yamaue, B.A.J.Ponder, Y.Nakamura, R.Hamamoto
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer

      巻: 128 号: 3 ページ: 574-586

    • DOI

      10.1002/ijc.25349

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Whole genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing.2010

    • 著者名/発表者名
      A.Fujimoto, H.Nakagawa, N.Hosono, K.Nakano, T.Abe, K.A.Boroevich, M.Nagasaki, R.Yamaguchi, T.Shibuya, M.Kubo, S.Miyano, Y.Nakamura, T.Tsunoda.
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 42 ページ: 931-936

    • NAID

      40019159184

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] International network of cancer genome projects.2010

    • 著者名/発表者名
      The International Cancer Genome Consortium.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 464 ページ: 993-998

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Population-genetic nature of copy number variations in the human genome.2010

    • 著者名/発表者名
      M.Kato, T.Kawaguchi, S.Ishikawa, T.Umeda, R.Nakamichi, M.H.Shapero, K.W.Jones, Y.Nakamura, H.Aburatani, T.Tsunoda.
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: 19 ページ: 761-773

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Analysis of mutational landscape and genetic heterogeneity in liver cancer with whole genome sequencing2014

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto A, Furuta M, Shiraishi Y, Chayama K, Miyano S, Tsunoda T, and Nakagawa H, 他
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics
    • 発表場所
      San Diego, USA
    • 年月日
      2014-10-20
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Medical Science Mathematics for Cancer Genome Analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Tsunoda T
    • 学会等名
      Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      パシフィコ横浜, Yokohama
    • 年月日
      2014-09-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 全ゲノムビッグデータ解析によるオーダーメイド医療2014

    • 著者名/発表者名
      角田 達彦
    • 学会等名
      富士通 知創薬コンソーシアム
    • 発表場所
      汐留シティセンター, 東京
    • 年月日
      2014-04-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Whole Genome Big Data Analysis for Complex Diseases2014

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiko Tsunoda
    • 学会等名
      3rd Global COE Workshop between BGI and University of Tokyo – Advances in Medical Genomics
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Big data for personalized medicine: whole-genome analysis of BioBank and cancer samples2014

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiko Tsunoda
    • 学会等名
      英国大使館 日英 ビッグデータ研究 ワークショップ
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Comprehensive analysis of genetic variation by whole genome sequencing2014

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 十時泰, 宮野悟, 角田逹彦, 柴田龍弘, 中川英刀
    • 学会等名
      金沢国際がん生物学&アカデミア創薬シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Whole Genome Approach Is Revolutionizing Medicine2013

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiko Tsunoda
    • 学会等名
      The 10th International Workshop on Advanced Genomics
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Whole genome sequencing and comprehensive mutation analysis of liver cancer2013

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiko Tsunoda
    • 学会等名
      SNUCRI & SNUCH Cancer Symposium
    • 発表場所
      Korea
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 全ゲノムとエクソームシークエンス解析2013

    • 著者名/発表者名
      角田 達彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第58回大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 次世代シークエンサーによるがんの全ゲノム解析と解釈2013

    • 著者名/発表者名
      角田 達彦
    • 学会等名
      日本癌学会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 肝がん全ゲノム解析から判明した 変異のパターンと腫瘍内遺伝的多様性2013

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 白石 友一, 古田 繭子, 後藤 邦仁, 中村 透, 平野 聡, 山本 雅一, 山上 裕機, 茶山 一彰, 宮野 悟, 角田 達彦, 中川 英刀
    • 学会等名
      日本遺伝学会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 全ゲノムシークエンス解析による遺伝的多様性の統合的理解2013

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 中川英刀, 角田達彦
    • 学会等名
      日本分子生物学会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Comprehensive analysis of genetic variation by whole genome sequencing2013

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 十時泰, 宮野悟, 角田逹彦, 柴田龍弘, 中川英刀
    • 学会等名
      CBI学会2013年大会・生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 全ゲノム/全エクソームシークエンスデータからのSNVs,Indels を同定する実用的手法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      重水大智, 藤本明洋, 秋山真太郎, 阿部哲雄, 中野かおる, Keith Boroevich, 山本裕二郎, 古田繭子, 久保充明, 中川英刀, 角田達彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第58回大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 日本人における全ゲノム間の関連についての網羅的eQTL解析2013

    • 著者名/発表者名
      宮冬樹, 森園隆, 阿部哲雄, 久保充明, 角田達彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会 第58回大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノムシークエンスによる肝臓がんの変異と遺伝的多様性の解析2013

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 白石友一, 古田繭子, 後藤邦仁, 中村透, 平野聡, 山本雅一, 山上裕機, 茶山一彰, 宮野悟, 角田達彦
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Whole genome sequencing reveals past population history and signature of natural selection in the Japanese population2013

    • 著者名/発表者名
      Akihiro Fujimoto, Tetuo Abe, Keith A Boroevich, Kaoru Nakano, Aya Sasaki, Rina Kitada, Hiroko Tanaka, Yusuke Nakamura, Satoru Miyano, Michiaki Kubo, Hidewaki Nakagawa, Tatsuhiko Tsunoda
    • 学会等名
      American Society of Human Genotics
    • 発表場所
      Boston, USA
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノム・全エクソームシークエンスデータからSNV/Indelを同定する実用的手法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      重水大智, 藤本 明洋, 秋山 真太郎, 阿部 哲雄, 中野 かおる, Boroevich Keith, 山本 裕二郎, 古田 繭子, 久保 充明, 中川 英刀, 角田 達彦
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide cis-and trans-eQTL analysis using next generation sequencer in Japanese population.2013

    • 著者名/発表者名
      Fuyuki Miya, Takashi Morizono, Michiaki Kubo, Tatsuhiko Tsunoda
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Supercomputing accelerates genomic medicine2012

    • 著者名/発表者名
      T.Tsunoda
    • 学会等名
      Biosupercomputing Symposium
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2012-12-04
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた日本人における全ゲノム網羅的eQTL解析2012

    • 著者名/発表者名
      宮 冬樹, 阿部 哲雄, 森園 隆, 秋山 真太郎, 久保 充明, 角田 達彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2012-10-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Genome medicine's milestones and future2012

    • 著者名/発表者名
      T.Tsunoda
    • 学会等名
      International Conference on Bioinformatics
    • 発表場所
      Bangkok, Thailand
    • 年月日
      2012-10-03
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 腎炎明細細胞癌の全ゲノム解析2012

    • 著者名/発表者名
      奥野 友介, 佐藤 悠佑, 前川 滋克, 佐藤 亜以子, 鈴木 啓道, 藤本 明洋, 白石 友一, 千葉 健一, 田中 洋子, 本間 之夫, 角田 達彦, 宮野 悟, 小川 誠司.
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2012-09-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] リプルネガティブ乳がんのエクソーム解析. 第71回日本癌学会学術総会2012

    • 著者名/発表者名
      清谷 一馬, 藤本 明洋, 小松 正人, 吉丸 哲郎, 松尾 泰佑, 角田 達彦, 三好 康雄, 笹 三徳, 片桐 豊雅
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2012-09-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 局所浸潤性膀胱癌に対するネオアジュバント療法感受性予測前向き試験2012

    • 著者名/発表者名
      加藤 陽一郎, 前佛 均, 高田 亮, 岩崎 一洋, 小原 航, 角田 達彦, 中村 祐輔, 藤岡 知昭
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2012-09-19
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Genome-wide association study and whole-genome sequence analysis2011

    • 著者名/発表者名
      T.Tsunoda
    • 学会等名
      JAPANESE-FINNISH JOINT SYMPOSIUM
    • 発表場所
      Helsinki, Finland(招待講演)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] A genome-wide association study identified a novel susceptibility locus for hepatocellular carcinoma in chronic hepatitis C virus carriers2011

    • 著者名/発表者名
      D.Miki, H.Ochi, C.Hayes, H.Abe, T.Yoshima, Y.Hayashida, H.Aikata, K.Ikeda, H.Kumada, J.Toyota, T.Tsunoda, M.Kubo, Y.Nakamura, N.Kamatani, K.Chayama
    • 学会等名
      Annual Meeting of the American Association for the Study of Liver Diseases
    • 発表場所
      San Francisco
    • 年月日
      2011-11-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] COMPREHENSIVE WHOLE-GENOME SEQUENCE ANALYSIS OF CANCER2011

    • 著者名/発表者名
      T.Tsunoda
    • 学会等名
      Cancer Genomics and Epigenomics: Towards Personalized Cancer Medicine
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2011-10-24
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 疾患の未解明の遺伝力の問題に対する日本とアジアでのアプローチ2011

    • 著者名/発表者名
      角田達彦
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋(招待講演)
    • 年月日
      2011-10-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 日本人と韓国人の肺腺癌発症に関連するTP63の一塩基多型の同定2011

    • 著者名/発表者名
      三木大樹, 久保充明, 角田達彦, 鎌谷直之, 茶山一彰, 高橋隆, 稲澤譲治, 中村祐輔, 醍醐弥太郎
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ゲノムワイド関連解析による乳癌タモキシフェン治療反応性予測2011

    • 著者名/発表者名
      前佛均, 清谷一馬, 莚田泰誠, 角田達彦, 森園隆, 久保充明, 谷川原祐介, 今村知世, 平田公一, 大住省三, 山川卓, 笹三徳, 中村祐輔
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] ウイルス性肝細胞がんの全ゲノムシークエンス解析2011

    • 著者名/発表者名
      中川英刀, 藤本明洋, 角田達彦, 長崎正朗, 柴田龍弘, 十時泰, 上野昌樹, 川上由育, 山田晃正, 茶山一彰, 山上裕機, 宮野悟, 中村祐輔
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 網羅的遺伝子発現解析に基づいた浸潤性膀胱癌におけるCaGおよびM-VAC術前化学療法に対する反応性予測2011

    • 著者名/発表者名
      加藤陽一郎, 前佛均, 高田亮, 小原渉, 角田達彦, 中村祐輔, 藤岡知昭
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 日本人の前立腺癌発症に関連する遺伝子多型を組み合わせた発症リスク予測モデルの構築2011

    • 著者名/発表者名
      高田亮, 赤松秀輔, 中川英刀, 高橋篤, Nguyen Ha, 久保充明, 角田達彦, 鎌谷直之, 羽渕友則, 小川修, 中村祐輔, 藤岡知昭
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2011-10-04
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 全ゲノム解析の衝撃-疾患関連遺伝子研究の爆発的進展2011

    • 著者名/発表者名
      角田達彦
    • 学会等名
      バイオスーパーコンピューティング・シンポジウム
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2011-02-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シークエンサーを用いた日本人一個体の全ゲノムシークエンスと遺伝的多様性の包括的解析2010

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 中川英刀, 細野直哉, 中野かおる, 阿部哲雄, 長崎正朗, 山口類, 渋谷哲朗, 久保充明, 宮野悟, 中村祐輔, 角田達彦
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーとタイリングアレイの転写解析データの比較検証2010

    • 著者名/発表者名
      宮冬樹, 岡田洋平, 阿部哲雄, 森園隆, 鎌谷直之, 岡野栄之, 角田達彦
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analyzing contiguous homozygosity to quantify haplotype structure differences between case and control samples.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Johnson, T.Tanaka, M.Kubo, Y.Nakamura, T.Tsunoda.
    • 学会等名
      The American Society of Human Genetics 60th Annual Meeting (ASHG 2010)
    • 発表場所
      Washington DC, USA
    • 年月日
      2010-11-04
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Whole genome sequencing and accurate variant calls of a Japanese individual using massively parallel sequencing.2010

    • 著者名/発表者名
      A.Fujimoto, H.Nakagawa, N.Hosono, K.Nakano, T.Abe, M.Nagasaki, R.Yamaguichi, T.Shibuya, M.Kubo, S.Miyano, Y.Nakamura, T.Tsunoda.
    • 学会等名
      American Society of Human Genetics 60th Annual Meeting (ASHG 2010)
    • 発表場所
      Washigton DC, USA
    • 年月日
      2010-11-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analyzing contiguous homozygosity to quantify haplotype structure differences between case and control samples.2010

    • 著者名/発表者名
      Johnson A.Todd, 田中敏博, 久保充明, 中村祐輔, 角田達彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • 発表場所
      大宮市
    • 年月日
      2010-10-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 国際がんゲノムコンソーシアムにおける情報解析2010

    • 著者名/発表者名
      藤本明洋, 渋谷哲朗, 宮野悟, 中村祐輔, 中川英刀, 角田達彦
    • 学会等名
      ゲノムテクノロジー第164委員会第34回研究会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2010-09-10
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.riken.jp/r-world/info/release/press/2010/101025

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書

URL: 

公開日: 2010-08-23   更新日: 2019-07-29  

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