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精密高分子に高親和性をもつ生体分子の共進化システムの開発(共進化システム)

計画研究

研究領域精密高分子による次世代医薬開拓
研究課題/領域番号 22H05050
研究種目

学術変革領域研究(B)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関東京工業大学

研究代表者

澤田 敏樹  東京工業大学, 物質理工学院, 准教授 (20581078)

研究期間 (年度) 2022-05-20 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
26,650千円 (直接経費: 20,500千円、間接経費: 6,150千円)
2024年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
2023年度: 7,540千円 (直接経費: 5,800千円、間接経費: 1,740千円)
2022年度: 11,570千円 (直接経費: 8,900千円、間接経費: 2,670千円)
キーワードペプチド / ファージディスプレイ法 / 高分子 / 親和性 / 分子進化 / 精密高分子 / 相互作用 / ファージディスプレイ / 結合特異性 / タンパク質 / 進化分子工学 / スクリーニング
研究開始時の研究の概要

精密高分子に高い親和性・特異性をもつペプチドをスクリーニングによって獲得し、精密高分子の親和性分子としての潜在性を明らかにする。相互作用を解析し、高親和性・特異性が発現される精密高分子とペプチドの組み合わせを多数見出し、精密高分子による生体分子認識について分子論的に明らかにすることで、精密高分子の医薬としての潜在性を最大限明らかにすることを目指す。さらに、得られるペプチド配列から、ペプチドのスクリーニング時には標的として用いた精密高分子が標的とすべき生体分子を明らかにし、医薬としての可能性を評価する。

研究実績の概要

ファージディスプレイ法を利用したスクリーニングにより同定された、2ユニットのアクリル酸と2ユニットのt-ブチル基からなる精密高分子(A2T2)に結合するペプチドの結合評価を実施した。様々なアミノ酸配列のペプチドにCysをC末端側に導入し、Cysを介して環境応答性の蛍光色素であるN-(4-アニリノ-1-ナフチル)マレイミド(ANM)を導入し、それらペプチドと標的であるA2T2に加え、様々なモノマーユニットや配列からなる精密高分子とを相互作用させて蛍光スペクトルを測定した。蛍光強度の上昇や波長のシフトから、ペプチドの親和性について評価した。その結果、一部の配列のペプチドでは、アクリル酸のみからなる精密高分子と比較して特異的にA2T2に結合するペプチドが得られていることが明らかとなった。また、最大蛍光波長のシフトから、相互作用様式がそれぞれ異なっていることも示唆された。その蛍光強度や最大蛍光波長の変化はペプチドのアミノ酸配列や精密高分子の配列によってそれぞれ異なっていることから、アミノ酸それぞれが相互作用に確かに寄与しているものと推察される。また、円二色性スペクトル測定の結果、コンホメーションを変化させて相互作用しているものと推察される。また、Cysを介してペプチドを金基板上に固定化し、精密高分子をフローし、その結合を表面プラズモン共鳴(SPR)法により実時間観察して相互作用を動力学的に評価した。その結果、12残基ペプチドという比較的短鎖ペプチドでありながら、標的精密高分子に対して10の5乗程度の親和性を示すことが明らかとなった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

分子量の小さな精密高分子に対して、特異性をもつペプチドのアミノ酸配列を同定することができた。さらに、その親和性を評価することにより、十分な親和性を示すことが明らかとなったため。

今後の研究の推進方策

得られているペプチドと様々な配列の精密高分子との相互作用を動力学的に解析することにより、その相互作用について明らかにする。また、核磁気共鳴法なども利用して相互作用する部位を特定することにより、その相互作用についてさらに明らかにする。また、確かに親和性をもつことが明らかになったペプチドについては、BLASTなどによりその配列を含むタンパク質などを見出し、それらとの相互作用を評価し、タンパク質レベルでの相互作用についても明らかにする。他方、他の配列をもつ精密高分子を標的とした新たなスクリーニングも進め、精密高分子が生体分子に対して十分な親和性を示すことを一般に明らかにする。

報告書

(2件)
  • 2023 実績報告書
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2023 2022

すべて 学会発表 (3件) (うち国際学会 1件、 招待講演 1件)

  • [学会発表] Screening and Characterization of Peptides with Affinity for a Homogeneous Oligomer with Uniform Monomer Sequence and Molecular Weight2023

    • 著者名/発表者名
      村上日優、澤田敏樹、斎藤勇輔、三浦佳子、星野友、芹澤武
    • 学会等名
      第60回ペプチド討論会
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
  • [学会発表] Construction of Functional Polymeric Materials Using Phage-Displayed Peptides2023

    • 著者名/発表者名
      Toshiki Sawada
    • 学会等名
      26th Korean Peptide Society
    • 関連する報告書
      2023 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] モノマー配列ならびに分子量が定まった均一オリゴマーに結合するペプチドの探索2022

    • 著者名/発表者名
      村上日優, 澤田敏樹, 斎藤勇輔, 三浦佳子, 星野友, 芹澤武
    • 学会等名
      日本化学会第102春季年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-05-25   更新日: 2024-12-25  

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