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In vivoドリル戦車の遺伝的基盤とその進化

計画研究

研究領域微生物が動く意味~レーウェンフックを超えた微生物行動学の創生~
研究課題/領域番号 22H05068
研究種目

学術変革領域研究(B)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

菊池 義智  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ長 (30571864)

研究分担者 竹下 和貴  秋田県立大学, 生物資源科学部, 助教 (40799194)
下地 博之  琉球大学, 農学部, 准教授 (50726388)
研究期間 (年度) 2022-05-20 – 2025-03-31
研究課題ステータス 交付 (2024年度)
配分額 *注記
53,560千円 (直接経費: 41,200千円、間接経費: 12,360千円)
2024年度: 17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2023年度: 17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円)
2022年度: 17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円)
キーワード行動学 / 微生物 / べん毛 / 遺伝的基盤 / 進化
研究開始時の研究の概要

ホソヘリカメムシは土壌中からBurkholderia共生細菌を獲得するが、土壌には数10万種もの細菌が生息していることを考えると、この共生特異性は驚異的である。この特異性は一体どのように決まっているのだろうか?これまでに我々は、ホソヘリカメムシの消化管には細菌選別器官が存在すること、この選別器官を突破するために共生細菌は新規運動性「ドリル戦車型べん毛運動」を発達させていることを明らかにしてきた。本研究では、選別器官内の物理環境の解明、ドリル戦車運動時の遺伝子発現解析、およびドリル運動不全株のスクリーニングを実施し、共生特異性の肝となる「ドリル戦車型べん毛運動」の遺伝的基盤と進化過程を解明する。

研究実績の概要

本研究領域では、我々独自の発見である共生・病原性細菌の「ドリル戦車型べん毛運動」に的を絞り、宿主体内(即ち”in vivo”)における動きを観察し、そのin vivo における動作原理を解明し、種間比較および遺伝子移植実験を通してその進化原理を解明することを具体的な達成目標とする。具体的には以下のような6つの研究を遂行する:① In vivoの動きを視る(高感度顕微鏡による微細観察);② In vivo運動を再現する(マイクロデバイス開発);③ In vivo運動の動作原理を解明する( シミュレーション);④ In vivoの物理的環境を解明する(粘性分析・化学分析);⑤ In vivo運動の遺伝的基盤を解明する(オミクス解析・逆遺伝学);⑥ In vivo運動の進化を解明する(細菌の種間比較・遺伝子移植)。本計画研究では、これら6つの領域達成目標のうち目標④‐⑥を担当し、ホソヘリカメムシのBurkholderia共生細菌に見られるドリル戦車型べん毛運動の遺伝的基盤およびその進化プロセスの解明を目指す。具体的には、Burkholderia共生細菌のゲノム比較や遺伝子発現比較、トランスポゾンを用いた網羅的変異株スクリーニング(Tn-seq)、べん毛形成に関わる遺伝子変異株のスクリーニングを行い、ドリル戦車型べん毛運動の遺伝的基盤を解明する。
本年度は、物理シミュレーションや顕微計測の結果からドリル運動に関連すると推測されたフックとその周辺のべん毛パーツについて解析を開始した。ドリル運動ができる共生Burkholderias種とドリル運動ができない非ドリル種とでフックの構造比較を行い、またこれら細菌種間でフックの交換実験を行った。その結果、これらべん毛パーツがドリル運動の発現において重要な役割を果たすことが明らかとなってきた。また本年は、共生細菌がドリル戦車で突破する狭窄部(CR:Constricted region)の遺伝子発現解析をすすめ、その発現遺伝子の網羅的解析に着手した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

べん毛ドリル運動を司る遺伝子の特定に大きく近づき、順調な成果を得ることができたと言える。

今後の研究の推進方策

領域内の他の計画班とも協力し、べん毛ドリル運動に関わると考えられる他のパーツについても調査を進める。また、CRの発現遺伝子についても解析を進め、宿主昆虫側の細菌選別機構の進化についても調査を進める。

報告書

(1件)
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 国際共同研究 (3件) 雑誌論文 (6件) (うち国際共著 3件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 4件、 招待講演 6件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] CNRS(フランス)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] University of Arizona(米国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] Gachon University(韓国)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Symbiont coordinates stem cell proliferation, apoptosis, and morphogenesis of gut symbiotic organ in the stinkbug-Caballeronia symbiosis2023

    • 著者名/発表者名
      Jang Seonghan、Matsuura Yu、Ishigami Kota、Mergaert Peter、Kikuchi Yoshitomo
    • 雑誌名

      Frontiers in Physiology

      巻: 13 ページ: 01-13

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.1071987

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] High Prevalence of <i>Pantoea</i> spp. in Microbiota Associated with the Sorghum Plant Bug <i>Stenotus rubrovittatus</i> (Heteroptera: Miridae)2023

    • 著者名/発表者名
      Sato Yuto、Akao Tatsuki、Takeshita Kazutaka
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 38 号: 3 ページ: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME22110

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Intercontinental Diversity of <i>Caballeronia</i> Gut Symbionts in the Conifer Pest Bug <i>Leptoglossus occidentalis</i>2022

    • 著者名/発表者名
      Ohbayashi Tsubasa、Cossard Raynald、Lextrait Ga?lle、Hosokawa Takahiro、Lesieur Vincent、Takeshita Kazutaka、Tago Kanako、Mergaert Peter、Kikuchi Yoshitomo
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 37 号: 3 ページ: n/a

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME22042

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Resilience of native ant community against invasion of exotic ants after anthropogenic disturbances of forest habitats2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Shimoji, Mayuko Suwabe, Tomonori Kikuchi, Hitoshi Ohnishi, Hirotaka Tanaka, Kengo Kawara, Yusuke Hidaka, Tsutomu Enoki, Kazuki Tsuji
    • 雑誌名

      Ecology and Evolution

      巻: 12 号: 7

    • DOI

      10.1002/ece3.9073

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Individual experience influences reconstruction of division of labour under colony disturbance in a queenless ant species2022

    • 著者名/発表者名
      Yasunari Tanaka, Masaru K. Hojo, Hiroyuki Shimoji
    • 雑誌名

      Frontiers in Zoology

      巻: 19 号: 1

    • DOI

      10.1186/s12983-022-00466-9

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of “ <i>Candidatus</i> Hydrogeosomobacter endosymbioticus,” an Intracellular Bacterial Symbiont of the Anaerobic Ciliate Scuticociliate GW72022

    • 著者名/発表者名
      Shiohama Yasuo、Takeshita Kazutaka、Hirakata Yuga、Nobu Masaru K.、Ito Michihiro、Shinzato Naoya
    • 雑誌名

      Microbiology Resource Announcements

      巻: 11 号: 2 ページ: 438-447

    • DOI

      10.1128/mra.01150-21

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] 昆虫の腸内共生における特異性の進化2022

    • 著者名/発表者名
      菊池義智
    • 学会等名
      第6回原生生物学・共生生物学談話会(共催:原生生物・寄生虫・進化セミナー)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 昆虫の生き方を決める腸内微生物2022

    • 著者名/発表者名
      菊池義智
    • 学会等名
      バイオミメティクス市民セミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 共生細菌のちからで害虫が農薬に強くなる助け合いの仕組み2022

    • 著者名/発表者名
      菊池義智
    • 学会等名
      バイオインダストリー協会 “未来へのバイオ技術”勉強会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Transmissible Pesticide Resistance: Invisible Friends of Insects2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshitomo Kikuchi
    • 学会等名
      GRC Drug Resistance
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 昆虫と腸内細菌の共生特異性を決める多層メカニズム2022

    • 著者名/発表者名
      菊池義智
    • 学会等名
      日本マイコトキシン学会第 88 回学術講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 北海道のワイン用ブドウに発生するカスミカメに関する研究2022

    • 著者名/発表者名
      菊池義智
    • 学会等名
      2022年度道産ワイン懇談会培醸造技術検討委員会オンラインセミナー
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploring the intricacies of relationships between social insects and microorganisms.2022

    • 著者名/発表者名
      Marielle Postava-Davignon, Tatsuya Inagaki, Hiroyuki Shimoji.
    • 学会等名
      19TH Congress of the International Union for the Study of Social Insects.
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A novel defensive gut symbiont of Diacamma cf . indicum from Japan.2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Shimoji
    • 学会等名
      19TH Congress of the International Union for the Study of Social Insects.
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Obligate gut symbiosis with environmentally-acquired Paraburkholderia in a stink bug, Physopelta gutta (Pyrrhocoroidea: Largidae).2022

    • 著者名/発表者名
      Kazutaka Takeshita, Yoshitomo Kikuchi.
    • 学会等名
      18th International Symposium on Microbial Ecology (ISME18)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [備考] 微生物が動く意味

    • URL

      https://ugokuimi.com/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

URL: 

公開日: 2022-05-25   更新日: 2024-12-25  

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