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化学班:CO環境で駆動される前駆代謝システムの実証

計画研究

研究領域CO環境の生命惑星化学
研究課題/領域番号 22H05153
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関国立研究開発法人海洋研究開発機構

研究代表者

北台 紀夫  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究開発プログラム), 主任研究員 (80625723)

研究分担者 山口 晃  東京科学大学, 物質理工学院, 助教 (00756314)
中村 龍平  東京科学大学, 未来社会創成研究院, 教授 (10447419)
李 惠銀  東京科学大学, 未来社会創成研究院, 特任助教 (10841926)
スミス エリック  東京科学大学, 地球生命研究所, 特任教授 (50770468)
山本 正浩  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門(超先鋭研究開発プログラム), 副主任研究員 (60435849)
大岡 英史  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (90825994)
Li Yamei  東京工業大学, 地球生命研究所, 特任准教授 (10745128)
研究期間 (年度) 2022-06-16 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
303,420千円 (直接経費: 233,400千円、間接経費: 70,020千円)
2025年度: 53,560千円 (直接経費: 41,200千円、間接経費: 12,360千円)
2024年度: 53,300千円 (直接経費: 41,000千円、間接経費: 12,300千円)
2023年度: 58,240千円 (直接経費: 44,800千円、間接経費: 13,440千円)
2022年度: 84,110千円 (直接経費: 64,700千円、間接経費: 19,410千円)
キーワードアストロバイオロジー / 生命の起源 / 自己触媒作用 / 生命起源
研究開始時の研究の概要

本研究計画では、CO大気を持つ惑星環境下で進行する化学反応を開拓し、これらの有機的な繋がりから自己触媒作用などの堅牢性を創発する。COを含む単純な無機物から、アミノ酸・ペプチド・核酸塩基などの生命のBuilding blocksが持続的に供給されるシステム(前駆代謝)の実証を目指す。まず数理モデルから、自己触媒作用の発生に必要な反応ステップの組み合わせ候補と選択性の数値目標を導く。そして、この設計を実現できる反応条件を実験から探索する。さらにフローリアクターを開発し、実験で開拓した素反応を連結することで、一連のシステムとして前駆代謝を提案する。

研究実績の概要

本研究では、一酸化炭素に富む惑星環境(CO world)下で進行する化学反応を開拓し、これらの有機的な繋がりから自己触媒作用等の堅牢性を備えた反応ネットワークを創発する。この達成により、COを含む単純な無機物から、アミノ酸・核酸塩基等の生体分子が持続的に生じる前駆代謝システムの実態解明を目指す。
初年度となる本年度ではまず、研究環境のセットアップを行った。そして、数種の生体分子をターゲットとした反応ルートの開拓及び制御に着手した。
理論研究においては、モデルとなる反応ネットワークを設定し、素過程の活性・選択性を変化させた数値シミュレーションを行った。これにより、自己触媒作用が実現する条件を探った。
実験では、多様な有機物を同定・定量するための分析機器を東工大及び海洋研究開発機構に整備した。これらを用いて、対象となる化学反応を順次調査した。具体的には、天然の電気化学反応場を模した実験にて、アミノ酸の生成・分解過程を追跡した。また、ヒスチジンなどのアミノ酸やペプチドが、硫化金属を触媒としたCO2の電気還元活性に与える影響を調査し、赤外・ラマン分光法によりメカニズムを評価した。さらに、COから生じる硫化カルボニルを利用し、アミノ酸の重合化に適した水溶液条件を探った。加えて、尿素やヒドラジンを出発物質とした核酸塩基の生成も検討した。
これらの反応ステップを連結し一連のシステムとして実証するため、多段階ステップをカスケード式に駆動できるフローリアクターを構想し、試作機を設計した。反応選択性の最大化を重視するトップダウン型においては、光と電気の作用により、CO2やSO2から有機物をシームレスに合成するリアクターを構想した。惑星環境の再現を重視するボトムアップ型については、深海熱水噴出孔に生じる発電現象を再現するフローリアクターの設計と試作を行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

本研究は当初の計画に沿って順調に進捗している。

今後の研究の推進方策

今後も研究計画に沿って課題遂行を進めていく。

報告書

(1件)
  • 2022 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2023 2022 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 6件) 学会発表 (13件) (うち国際学会 8件、 招待講演 6件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] 重回帰分析による金属硫化物系CO<sub>2</sub>還元電極触媒の設計指針の提示2023

    • 著者名/発表者名
      山口晃,新井勝樹,An Niza El Aisnada, Lee Ji-Eun, 北台紀夫,中村龍平,宮内雅浩
    • 雑誌名

      まてりあ

      巻: 62 号: 1 ページ: 40-47

    • DOI

      10.2320/materia.62.40

    • ISSN
      1340-2625, 1884-5843
    • 年月日
      2023-01-01
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Elemental sulfur, hydrogen sulfide, and carbon monoxide-driven dimerization of glycine at sub-millimolar concentrations: Implications for the orgin of life2023

    • 著者名/発表者名
      Norio Kitadai, Shigeru Shimamura, Wataru Takahagi, Masayuki Miyazaki, Eiji Tasumi, Satoshi Okada
    • 雑誌名

      Geochimica et Cosmochimica Acta

      巻: 349 ページ: 55-63

    • DOI

      10.1016/j.gca.2023.03.033

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Quantification of Polysulfide Species in Aqueous Sulfur Thermocell2023

    • 著者名/発表者名
      Wataru Takahagi, Norio Kitadai, Satoshi Okada, Hongyao Zhou, Ken Takai, Teppei Yamada
    • 雑誌名

      Chemistry Letters

      巻: 52 号: 3 ページ: 197-201

    • DOI

      10.1246/cl.220486

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Action functional gradient descent algorithm for estimating escape paths in stochastic chemical reaction networks2023

    • 著者名/発表者名
      Praful Gagrani, Eric Smith
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 107 号: 3

    • DOI

      10.1103/physreve.107.034305

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Polysulfide-assisted urea synthesis from carbon monoxide and ammonia in water2022

    • 著者名/発表者名
      Norio Kitadai, Satoshi Okada, Akiko Makabe, Eiji Tasumi, Masayuki Miyazaki
    • 雑誌名

      PeerJ Organic Chemistry

      巻: 4 ページ: e6-e6

    • DOI

      10.7717/peerj-ochem.6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Geoelectrochemistry-driven alteration of amino acids to derivative organics in carbonaceous chondrite parent bodies2022

    • 著者名/発表者名
      Li Yamei、Kitadai Norio、Sekine Yasuhito、Kurokawa Hiroyuki、Nakano Yuko、Johnson-Finn Kristin
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32596-3

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 生命起源のケミストリーは地球のハビタビリティーの存続に寄与できるか?2022

    • 著者名/発表者名
      北台紀夫
    • 雑誌名

      Viva Origino

      巻: 50 号: 3 ページ: 4

    • DOI

      10.50968/vivaorigino.50_4

    • ISSN
      0910-4003, 1346-6933
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] In situ electrosynthetic bacterial growth using electricity generated by a deep-sea hydrothermal vent2022

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Masahiro、Takaki Yoshihiro、Kashima Hiroyuki、Tsuda Miwako、Tanizaki Akiko、Nakamura Ryuhei、Takai Ken
    • 雑誌名

      The ISME Journal

      巻: 17 号: 1 ページ: 12-20

    • DOI

      10.1038/s41396-022-01316-6

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The information geometry of two-field functional integrals2022

    • 著者名/発表者名
      Eric Smith
    • 雑誌名

      Information Geometry

      巻: 5 号: 2 ページ: 427-492

    • DOI

      10.1007/s41884-022-00071-z

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] Gradient-Driven Electrocatalysis at Submarine Hydrothermal Vents2023

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Nakamura
    • 学会等名
      KU BK21 Mini-Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Chemistry of CO world: Progress report 20222023

    • 著者名/発表者名
      Norio Kitadai
    • 学会等名
      Workshop on chemical roots of metabolism
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Towards quantitative predictions of chemical reaction networks2023

    • 著者名/発表者名
      Ooka Hideshi
    • 学会等名
      Workshop on chemical roots of metabolism
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 深海熱水噴出孔の放電によって集積された独立栄養性細菌とその細胞外電子伝達経路2022

    • 著者名/発表者名
      山本正浩、高木善弘、鹿島裕之、津田美和子、谷崎明子、中村龍平、高井研
    • 学会等名
      第35回 日本微生物生態学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 深海熱水噴出域由来の電気合成微生物の細胞外電子伝達タンパク質群の構造・局在性予測2022

    • 著者名/発表者名
      増川日向子、小林瑠那、高木善弘、高井研、新井博之、山本正浩
    • 学会等名
      第62回 生物物理若手の会 夏の学校
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] 深海熱水噴出域由来の電気合成微生物による炭酸固定能の実証2022

    • 著者名/発表者名
      増川 日向子, 小林 瑠那 , 松井 洋平, 高井 研, 新井 博之, 山本 正浩
    • 学会等名
      第35回 日本微生物生態学会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Geo-Electricityが駆動する窒素サイクル2022

    • 著者名/発表者名
      中村龍平
    • 学会等名
      日本地球化学会第69回年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Geoelectrochemistry-driven alteration of amino acids to derivative organics in carbonaceous chondrite parent bodies2022

    • 著者名/発表者名
      Yamei Li, Norio Kitadai, Yasuhito Sekine, Hiroyuki Kurokawa, Yuko Nakano, Kristin Johnson-Finn
    • 学会等名
      AbSciCon meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Geo-electrochemistry drove chemical evolution in water/rock interacted environments on Earth and icy planetesimals2022

    • 著者名/発表者名
      Yamei Li
    • 学会等名
      The 45th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Molecular descriptors of aqueous alteration-induced organic decomposition in parent body of carbonaceous chondrites and Ryugu asteroid2022

    • 著者名/発表者名
      Yamei Li
    • 学会等名
      Hayabusa 2022 Symposium
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Combinatorics in evolution: From rule-based systems to the thermodynamics of selectivities2022

    • 著者名/発表者名
      Eric Smith
    • 学会等名
      American Physical Society March Meeting
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Information Gateways to Life2022

    • 著者名/発表者名
      Eric Smith
    • 学会等名
      The 4th Information Universe Conference
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Combinatorial Chemistry with Rule-Based Systems and its Associated Information Theory2022

    • 著者名/発表者名
      Eric Smith
    • 学会等名
      Workshop: Life in the Universe
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [備考] 太陽系初期の化学進化に影響を与える新たな化学プロセスを解明

    • URL

      https://www.elsi.jp/news_events/highlights/2022/chemical_evolution_early_solar_system/

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書

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公開日: 2022-06-20   更新日: 2025-06-20  

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