横断的ゲノム比較から俯瞰する両性花多様化の変遷

• 研究領域: 植物の挑戦的な繁殖適応戦略を駆動する両性花とその可塑性を支えるゲノム動態
• 研究課題/領域番号: 22H05181
• 研究種目: 学術変革領域研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
• 研究機関: 公益財団法人かずさDNA研究所
• 研究代表者: 白澤 健太 公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 室長 (60527026)
• 研究分担者: 青柳 優太 公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 特任研究員 (61011804) ; 佐藤 光彦 公益財団法人かずさDNA研究所, 先端研究開発部, 研究員 (30783013)
• 研究期間 (年度): 2022-06-16 – 2027-03-31
• 研究課題ステータス: 交付 (2026年度)
• 配分額: 97,890千円 (直接経費: 75,300千円、間接経費: 22,590千円); 2026年度: 19,370千円 (直接経費: 14,900千円、間接経費: 4,470千円); 2025年度: 19,110千円 (直接経費: 14,700千円、間接経費: 4,410千円); 2024年度: 18,850千円 (直接経費: 14,500千円、間接経費: 4,350千円); 2023年度: 19,760千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 4,560千円); 2022年度: 20,800千円 (直接経費: 16,000千円、間接経費: 4,800千円)
• キーワード: ゲノム / 非モデル生物 / 非モデル植物

研究開始時の研究の概要

被子植物の遺伝的多様性を維持する生殖システムは、両性花を起点として多彩な進化を遂げており、本領域でも扱う性決定や自家不和合性などの他殖性機構を独立して種ごとに成立させるだけでなく、そのシステム間における自由な往来を可能としている。本研究では、両性花の活用を巡る幅広い植物群全体をカバーする横断的ゲノム解読によって、植物の進化全体を俯瞰する視点からゲノム・エピゲノム動態変化を検出する。各生殖システムの成立・破壊と連動するゲノム・遺伝子の進化パターンを数理的に定義するとともに、頻繁な生殖システムの移行に関わる潜在的な共通性を検証する。

研究実績の概要

被子植物の遺伝的多様性を維持する生殖システムは、両性花を起点として多彩な進化を遂げており、本領域でも扱う性決定や自家不和合性などの他殖性機構を独立して種ごとに成立させるだけでなく、そのシステム間における自由な往来を可能としている。本計画研究班では、両性花の活用を巡る幅広い植物群全体をカバーする横断的ゲノム解読によって、植物の進化全体を俯瞰する視点からゲノム・エピゲノム動態変化を検出する。各生殖システムの成立・破壊と連動するゲノム・遺伝子の進化パターンを数理的に定義するとともに、頻繁な生殖システムの移行に関わる潜在的な共通性を検証する。
染色体の端から端までを一続きで配列決定するテロメア・ツー・テロメア (T2T)全ゲノム解読を、クローバ、トマト、およびアセロラで達成し、植物ゲノムの完全解読への道筋を得た。植物のパンゲノム解析におけるT2Tゲノム解読の重要性を解説する総説を発表した。巨大なゲノムを持つ裸子植物（カラマツ、ヒノキ、スギ、およびコウヨウザン）ではゲノム解読結果を報告し、体細胞変異を利用することでクローンの系統解析が可能であることを示した。また、オオムギのパンゲノム解析により種内のゲノム変異を明らかにするとともに、イチジクの雌雄株のゲノム解析により性決定遺伝子領域を明らかにするなど、横断的ゲノム比較により種々の植物の多様性の変遷を明らかにした。領域内共同研究として、赤木班、藤井班、伊藤班、榊原班、奥田班、清水班、井澤班、須崎班と植物のゲノム解析を進めた。赤木班とはマンテマのゲノム解読を通して、植物の性染色体の進化を解明した。また、サクラやアサガオを題材としたアウトリーチ活動に取り組んだ。

現在までの達成度

2: おおむね順調に進展している

理由

両性花の活用を巡る幅広い植物群全体をカバーする横断的ゲノム解読を実施し、着実に成果を挙げている。ゲノム解読が及んでいない被子植物の基部群および複数の他殖性システムを有している目などの系統群を中心にしてロングリード技術やシングルセルゲノミクスの解析手法による高効率化を達成し、植物ゲノムの完全解読への道筋を得た。

今後の研究の推進方策

ゲノム解読が及んでいない被子植物の基部群および複数の他殖性システムを有している目などの系統群を中心にして、最新鋭のシークエンス技術を活用して、染色体レベルあるいはテロメア・ツー・テロメアレベルでのゲノム解読を行う。ゲノム構造、遺伝子配列、および転移因子等のリピート配列に着目して比較するための解析手法を確立する。

研究成果

• [雑誌論文] The impact of telomere-to-telomere genome assembly in the plant pan-genomics era (2025)
  • 著者名/発表者名: Aoyagi Blue Yuta、Iimura Hideaki、Sato Mitsuhiko P.、Shirasawa Kenta
  • 雑誌名: Ｂｒｅｅｄｉｎｇ Ｓｃｉｅｎｃｅ 巻: 75 号: 1 ページ: 3-12
  • DOI: 10.1270/jsbbs.24065
  • ISSN: 1344-7610, 1347-3735
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Rapid and dynamic evolution of a giant Y chromosome in Silene latifolia (2025)
  • 著者名/発表者名: Akagi Takashi、Fujita Naoko、Shirasawa Kenta、Tanaka Hiroyuki、Nagaki Kiyotaka、Masuda Kanae、Horiuchi Ayano、Kuwada Eriko、Kawai Kanta、Kunou Riko、Nakamura Koki、Ikeda Yoko、Toyoda Atsushi、Itoh Takehiko、Ushijima Koichiro、Charlesworth Deborah
  • 雑誌名: Science 巻: 387 号: 6734 ページ: 637-643
  • DOI: 10.1126/science.adk9074
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Near-complete genome assembly of tomato (<i>Solanum lycopersicum</i>) cultivar Micro-Tom (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa Kenta、Ariizumi Tohru
  • 雑誌名: Ｐｌａｎｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ 巻: 41 号: 4 ページ: 367-374
  • DOI: 10.5511/plantbiotechnology.24.0522a
  • ISSN: 1342-4580, 1347-6114
  • 年月日: 2024-12-25
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] みんなのカタバミ，みんなでカタバミ (2024)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 光彦、飯村 秀明、平岡 桐子、白澤 健太
  • 雑誌名: 生物工学会誌 巻: 102 号: 9 ページ: 477-478
  • DOI: 10.34565/seibutsukogaku.102.9_477
  • ISSN: 0919-3758, 2435-8630
  • 年月日: 2024-09-25
• [雑誌論文] Near-complete telomere-to-telomere de novo genome assembly in Egyptian clover (Trifolium alexandrinum) (2024)
  • 著者名/発表者名: Sato Mitsuhiko P、Arafa Ramadan A、Rakha Mohamed T、Emeran Amero A、Isobe Sachiko、Shirasawa Kenta
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 32 号: 1
  • DOI: 10.1093/dnares/dsae036
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Propagation path of a flowering cherry (Cerasus × yedoensis) cultivar ‘Somei-Yoshino’ traced by somatic mutations (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa Kenta、Esumi Tomoya、Itai Akihiro、Hatakeyama Katsunori、Takashina Tadashi、Yakuwa Takuji、Sumitomo Katsuhiko、Kurokura Takeshi、Fukai Eigo、Sato Keiichi、Shimada Takehiko、Shiratake Katsuhiro、Hosokawa Munetaka、Monden Yuki、Kusaba Makoto、Ikegami Hidetoshi、Isobe Sachiko
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 31 号: 5
  • DOI: 10.1093/dnares/dsae025
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Chromosome-scale genome assembly of acerola (Malpighia emarginata DC.) (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa Kenta、Harada Kazuhiko、Haramoto Noriaki、Aoki Hitoshi、Kammera Shota、Yamamoto Masashi、Nishizawa Yu
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 31 号: 6
  • DOI: 10.1093/dnares/dsae029
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome-wide association studies using chromosome-scale genomes of male and female lines redefines two sex-linked loci in linkage disequilibrium in Ficus carica L. (2024)
  • 著者名/発表者名: Ikegami Hidetoshi、Shirasawa Kenta、Yakushiji Hiroshi、Toyoda Atsuhi、Hayashi Takeshi、Yabe Shiori、Mori Kazuki、Hirata Chiharu、Nogata Hitoshi、Tashiro Kosuke
  • 雑誌名: Scientia Horticulturae 巻: 336 ページ: 113424-113424
  • DOI: 10.1016/j.scienta.2024.113424
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural variation in the pangenome of wild and domesticated barley (2024)
  • 著者名/発表者名: Jayakodi Murukarthick et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 636 号: 8043 ページ: 654-662
  • DOI: 10.1038/s41586-024-08187-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Chromosome-level genome assemblies for two quinoa inbred lines from northern and southern highlands of Altiplano where quinoa originated (2024)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi Yasufumi、Hirakawa Hideki、Shirasawa Kenta、Nishimura Kazusa、Fujii Kenichiro、Oros Rolando、Almanza Giovanna R.、Nagatoshi Yukari、Yasui Yasuo、Fujita Yasunari
  • 雑誌名: Frontiers in Plant Science 巻: 15 ページ: 1434388-1434388
  • DOI: 10.3389/fpls.2024.1434388
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Comprehensive expression analysis of ERF transcription factors during chilling acclimation in Saintpaulia (2024)
  • 著者名/発表者名: Kurata Daichi、Fukutomi Kento、Kubo Kanae、Shirasawa Kenta、Hirakawa Hideki、Hosokawa Munetaka
  • 雑誌名: Plant Growth Regulation 巻: 104 号: 2 ページ: 745-759
  • DOI: 10.1007/s10725-024-01181-7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The SEP homologous gene TEMARY regulates inflorescence phenotypes in Hydrangea macrophylla (2024)
  • 著者名/発表者名: Nashima Kenji、Uemachi Tatsuya、Shirasawa Kenta、Shimizu Akifumi、Takeuchi Toshiki、Obata Tatsuya、Isobe Sachiko、Azuma Mirai、Akutsu Midori、Nakazawa Yoshiko、Kodama Masaharu、Namai Kiyoshi、Kurokura Takeshi、Suyama Takuro
  • 雑誌名: Horticulture Research 巻: 12 号: 3
  • DOI: 10.1093/hr/uhae332
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Telomere-to-telomere genome assembly of matsutake (<i>Tricholoma matsutake</i>) (2023)
  • 著者名/発表者名: Kurokochi Hiroyuki、Tajima Naoyuki、Sato Mitsuhiko P、Yoshitake Kazutoshi、Asakawa Shuichi、Isobe Sachiko、Shirasawa Kenta
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 30 号: 3 ページ: 1-6
  • DOI: 10.1093/dnares/dsad006
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Telomere-to-telomere genome assembly of an allotetraploid pernicious weed, <i>Echinochloa phyllopogon</i> (2023)
  • 著者名/発表者名: Sato Mitsuhiko P、Iwakami Satoshi、Fukunishi Kanade、Sugiura Kai、Yasuda Kentaro、Isobe Sachiko、Shirasawa Kenta
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 30 号: 5 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1093/dnares/dsad023
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Haplotype-resolved <i>de novo</i> genome assemblies of four coniferous tree species (2023)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa Kenta、Mishima Kentaro、Hirakawa Hideki、Hirao Tomonori、Tsubomura Miyoko、Nagano Soichiro、Iki Taiichi、Isobe Sachiko、Takahashi Makoto
  • 雑誌名: Journal of Forest Research 巻: 29 号: 2 ページ: 151-157
  • DOI: 10.1080/13416979.2023.2267304
• [雑誌論文] Potential contribution of floral thermogenesis to cold adaptation, distribution pattern, and population structure of thermogenic and non/slightly thermogenic <i>Symplocarpus</i> species (2023)
  • 著者名/発表者名: Sato Mitsuhiko P.、Matsuo Ayumi、Otsuka Koichi、Takano Kohei Takenaka、Maki Masayuki、Okano Kunihiro、Suyama Yoshihisa、Ito‐Inaba Yasuko
  • 雑誌名: Ecology and Evolution 巻: 13 号: 7
  • DOI: 10.1002/ece3.10319
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genome sequencing reveals the genetic architecture of heterostyly and domestication history of common buckwheat (2023)
  • 著者名/発表者名: Fawcett JA, Takeshima R, Kikuchi S, Yazaki E, Katsube-Tanaka T, Dong Y, Li M, Hunt HV, Jones MK, Lister DL, Ohsako T, Ogiso-Tanaka E, Fujii K, Hara T, Matsui K, Mizuno N, Nishimura K, Nakazaki T, Saito H, Takeuchi N, Ueno M, Matsumoto D, Norizuki M, Shirasawa K, Li C, Hirakawa H, Ota T, Yasui Y.
  • 雑誌名: Nature Plants 巻: 9 号: 8 ページ: 1236-1251
  • DOI: 10.1038/s41477-023-01474-1
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] From green to red: Urban heat stress drives leaf color evolution (2023)
  • 著者名/発表者名: Fukano Yuya、Yamori Wataru、Misu Hayata、Sato Mitsuhiko P.、Shirasawa Kenta、Tachiki Yuuya、Uchida Kei
  • 雑誌名: Science Advances 巻: 9 号: 42 ページ: 3542-3542
  • DOI: 10.1126/sciadv.abq3542
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Ongoing Rapid Evolution of a Post-Y Region Revealed by Chromosome-Scale Genome Assembly of a Hexaploid Monoecious Persimmon (<i>Diospyros kaki</i>) (2023)
  • 著者名/発表者名: Horiuchi Ayano、Masuda Kanae、Shirasawa Kenta、Onoue Noriyuki、Fujita Naoko、Ushijima Koichiro、Akagi Takashi
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 40 号: 7 ページ: 1-10
  • DOI: 10.1093/molbev/msad151
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genetic basis of lineage-specific evolution of fruit traits in hexaploid persimmon (2023)
  • 著者名/発表者名: Horiuchi, A., K. Masuda, K. Shirasawa, N. Onoue, R. Matsuzaki, R. Tao, Y. Kubo, K. Ushijima, and T. Akagi.
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 30 号: 5 ページ: 1-9
  • DOI: 10.1093/dnares/dsad015
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Recurrent neo-sex chromosome evolution in kiwifruit (2023)
  • 著者名/発表者名: Akagi Takashi、Varkonyi-Gasic Erika、Shirasawa Kenta、Catanach Andrew、Henry Isabelle M.、Mertten Daniel、Datson Paul、Masuda Kanae、Fujita Naoko、Kuwada Eriko、Ushijima Koichiro、Beppu Kenji、Allan Andrew C.、Charlesworth Deborah、Kataoka Ikuo
  • 雑誌名: Nature Plants 巻: 9 号: 3 ページ: 393-402
  • DOI: 10.1038/s41477-023-01361-9
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Chromosome-scale genome assembly of a Japanese chili pepper landrace, <i>Capsicum annuum</i> ‘Takanotsume’ (2022)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa Kenta、Hosokawa Munetaka、Yasui Yasuo、Toyoda Atsushi、Isobe Sachiko
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 30 号: 1
  • DOI: 10.1093/dnares/dsac052
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Haplotype-resolved<i>de novo</i>genome assemblies of four coniferous tree species (2022)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa Kenta、Mishima Kentaro、Hirakawa Hideki、Hirao Tomonori、Tsubomura Miyoko、Nagano Soichiro、Iki Taiichi、Isobe Sachiko、Takahashi Makoto
  • 雑誌名: bioRxiv 巻: 2022.11.16 ページ: 516598-516598
  • DOI: 10.1101/2022.11.16.516598
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] Ongoing rapid evolution of a post-Y region revealed by chromosome-scale genome assembly of a hexaploid monoecious persimmon (<i>Diospyros kaki</i>) (2022)
  • 著者名/発表者名: Horiuchi Ayano、Masuda Kanae、Shirasawa Kenta、Onoue Noriyuki、Fujita Naoko、Ushijima Koichiro、Akagi Takashi
  • 雑誌名: bioRxiv 巻: 2022.12.29 ページ: 522208-522208
  • DOI: 10.1101/2022.12.29.522208
  • オープンアクセス
• [学会発表] Genomics on ornamental plants and flowers decorating the Japanese culture and traditions (2024)
  • 著者名/発表者名: Kenta Shirasawa
  • 学会等名: 5th International Symposium on Woody Ornamentals of the Temperate Zone (WOTZ2024)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 生態系に必要不可欠な生物・遺伝子の解明に向けたゲノム科学的アプローチ (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 日本地球惑星科学連合2024年大会
• [学会発表] Near telomere-to-telomere genomes scaffolded using gap-targeted sequencing (GAP-seq) and genetic variation within cultivar reveal the genetic basis determining cultivar-specific traits in Egyptian clover (Trifolium alexandrinum) (2024)
  • 著者名/発表者名: Mitsuhiko P. Sato, Ramadan Arafa, Sachiko Isobe, Kenta Shirasawa
  • 学会等名: PAG ASIA
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Unveiling the Evolution of Thermogenic Mechanisms: Comparative Genomics in Symplocarpus (2024)
  • 著者名/発表者名: Mitsuhiko P. Sato, Hiroyuki Tanaka, Kohei Takenaka-Takano, Atsushi Toyoda, Takehiko Itoh, Kenta Shirasawa, Yasuko Ito-inaba
  • 学会等名: 日本進化学会
  • 招待講演
• [学会発表] T2Tゲノム時代に取り残された植物の特殊事情 (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 多様な生物のゲノム解析の現状、解析手法の共有
  • 招待講演
• [学会発表] 被子植物のすべての目（もく）でT2Tゲノム解読を目指す (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 佐藤光彦, 青柳優太, 飯村秀明, 平川英樹, 磯部祥子
  • 学会等名: NGS EXPO 2024
• [学会発表] Kazusa Genome Project to Sequence All Orders of Angiosperm (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K., Sato MP, Iimura H., Aoyagi Y., Hirakawa H., Isobe S.
  • 学会等名: PAG Australia 2024
  • 国際学会
• [学会発表] T2T Genome Project Across All Orders of Angiosperm (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K
  • 学会等名: International Weed Genomics Consortium Seminar
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] アサガオを題材としたアウトリーチ活動への取り組みと開催報告 (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 藤井壮太, 平岡桐子
  • 学会等名: 第12回アサガオ研究集会
• [学会発表] アセロラの全ゲノム配列と集団構造の解析 (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 原田和彦, 原本典明, 青木仁史, 勘米良祥多, 山本雅史, 西澤 優
  • 学会等名: 園芸学会
• [学会発表] Genome and phenotype variations in a tomato (Solanum lycopersicum) cultivar Micro-Tom (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K., Nagasaki H., Hoshikawa K., Isobe S., Ezura H., Aoki K., Ariizumi T., Hirakawa H.
  • 学会等名: XIX International Solanaceae Conference (SOL2024)
  • 国際学会
• [学会発表] 異質4倍体水田雑草タイヌビエのT2Tゲノム解析 (2024)
  • 著者名/発表者名: 佐藤光彦, 岩上哲史, 保田謙太郎, 磯部祥子, 白澤健太
  • 学会等名: 日本生態学会第71回大会
  • 招待講演
• [学会発表] トウガラシの種間雑種にみられる座止に関するゲノム領域のターゲット配列解析 (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 細川宗孝
  • 学会等名: 園芸学会
• [学会発表] ゲノム科学で探る生態系を構成・維持するために必要不可欠な生物・遺伝子 (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 生態工学会定例研究会
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム研究で植物の未来を予想する ー品種改良と開花予想ー (2024)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 科学工学技術委員会
  • 招待講演
• [学会発表] Kazusa GP: Genome Project across All Orders of Angiosperm (2024)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K, Sato MP, Hirakawa H, Isobe S
  • 学会等名: International Plant and Animal Genome Conference (PAG 31)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 植物の発熱誘導・制御の遺伝基盤の解明 (2023)
  • 著者名/発表者名: 佐藤光彦
  • 学会等名: 日本進化学会第25回大会
• [学会発表] ロングリードおよび単一花粉シークエンス技術による アブラナ科植物Malcolmia littoreaのゲノム解読 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 吉武和敏, 菊池真司, 小祝敬一郎, 藤井壮太
  • 学会等名: NGS EXPO 2023
• [学会発表] Near-complete genome assembly of a tomato cultivar Micro-Tom. (2023)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K, Ariizumi T
  • 学会等名: 日本ナス科コンソーシアム年会
• [学会発表] 東京大学XかずさDNA研究所がゲノム科学で迫る身近な植物の謎 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 藤井壮太
  • 学会等名: 会いに行ける科学者フェス
• [学会発表] Kenta Shirasawa, Mitsuhiko P. Sato, Hideki Hirakawa, Sachiko Isobe (2023)
  • 著者名/発表者名: Kazusa GP: Genome Project Across All Orders of Angiosperm
  • 学会等名: Biodiversity Genomics 2023
  • 国際学会
• [学会発表] 生態系を構成・維持するために必要不可欠な生物・遺伝子の適応進化実験 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 宇宙生物科学会
• [学会発表] ロングリード技術を利用したトマト品種「マイクロトム」のゲノム解読 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 有泉亨
  • 学会等名: 日本育種学会
• [学会発表] すべての植物のゲノムを解読するために必要なこと (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 日本植物学会・ランチョンセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Chromosome-scale genome assembly of an orphan plant species, Malcolmia littorea, by long-read and single-pollen sequencing technologies (2023)
  • 著者名/発表者名: Shirasawa K, Yoshitake K, Kikuchi S, Koiwai K, Fujii S
  • 学会等名: アジア園芸学会議2023
  • 国際学会
• [学会発表] 小石川植物園のソメイヨシノ老木の全ゲノム解析 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 磯部祥子
  • 学会等名: 日本育種学会
• [学会発表] ゲノム編集トマト‘シシリアンルージュハイギャバ’の全ゲノム解析 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 磯部祥子
  • 学会等名: 園芸学会
• [学会発表] ロングリード技術による針葉樹4種の全ゲノム解読 (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 三嶋賢太郎, 平川英樹, 平尾知士, 坪村美代子, 永野聡一郎, 井城泰一, 磯部祥子, 高橋 誠
  • 学会等名: 日本森林学会
• [学会発表] タイヌビエの高精度ゲノム解読からわかる日本国内の遺伝的多様性 (2023)
  • 著者名/発表者名: 佐藤光彦，岩上哲史，福西詩奏，杉浦快，保田謙太郎，磯部祥子，白澤健太
  • 学会等名: 日本雑草学会
• [学会発表] みんなでカタバミプロジェクト with かずさ あなたの街では何色ですか (2023)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 日本育種学会ランチョンセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] ニホングリのゲノム解析から見えた植物のゲノム進化の謎 (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 日本進化学会年大会
  • 招待講演
• [学会発表] マツタケ胞子のシングルセルゲノム解析に向けた取り組み (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 黒河内寛之, 田島直幸, 佐藤光彦, 吉武和敏, 浅川修一, 磯部祥子
  • 学会等名: シングルセルゲノミクス研究会
• [学会発表] トウガラシ品種‘タカノツメ’の全ゲノム解読 (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 細川宗孝, 安井康夫, 磯部祥子
  • 学会等名: 園芸学会
• [学会発表] マツタケのテロメア・ツー・テロメアでのゲノム解読 (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 黒河内寛之, 田島直幸, 佐藤光彦, 吉武和敏, 浅川修一, 磯部祥子
  • 学会等名: 日本育種学会
• [学会発表] Chromosome-scale genome assembly of Capsicum annuum ‘Takanotsume’ (2022)
  • 著者名/発表者名: Kenta Shirasawa, Munetaka Hosokawa, Yasuo Yasui, Sachiko Isobe
  • 学会等名: 18th Japan Solanaceae Consortium Symposium
• [学会発表] かずさ植物ゲノムプロジェクト (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太, 佐藤光彦, 磯部祥子
  • 学会等名: NGS EXPO 2022
• [学会発表] ゲノム科学で迫る身近なサイエンス (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: 宇都宮大学C-Bioセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] Genome projects with a long-read sequencing technology (2022)
  • 著者名/発表者名: Kenta Shirasawa
  • 学会等名: Agilent Ignite Confidence - Quality Matters Virtual Summit
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 全ゲノム解析で分かった「ゆうだい21」 (2022)
  • 著者名/発表者名: 白澤健太
  • 学会等名: ゆうだい21サミット
  • 招待講演
• [備考] イチジクの雄株・雌株を決める遺伝子の探索 ～食用となる雌株選抜の効率化～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/240704a/
• [備考] 小さなトマト「マイクロトム」の変化の軌跡 ～遺伝子型の比較と高精度全ゲノム解読から品種改良へ～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/240719/
• [備考] ゲノム解析で解き明かすソメイヨシノのルーツに関する論文が発表されました
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/240912/
• [備考] アセロラの研究促進に期待～最新ロングリード技術によるアセロラ全ゲノム解読～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/pr241011/
• [備考] エジプシャンクローバーの高精度全ゲノム解読 ～品種の特性を最新ロングリード技術で解明～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/pr20250124/
• [備考] 栽培柿の全ゲノムを高精度に解読 ～育種や進化研究のための研究基盤を構築～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/230712/
• [備考] 発熱植物ザゼンソウの生存戦略に手がかり～ザゼンソウは積雪に強く多様性が高いことが明らかに～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/230801/
• [備考] ソバゲノムの解読 ～高精度ゲノム解読がソバの過去と未来を紡ぐ～
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/230811/
• [備考] 都市の熱さで植物は赤く進化する ―ヒートアイランドへの急速な適応進化を初めて実証―
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/231023/
• [備考] タイヌビエのゲノムを高精度解読
  • URL: https://www.kazusa.or.jp/news/231107/
• [備考] 巨大なゲノムをもつ針葉樹4種のゲノム解読に成功 ～時間のかかる林木育種の効率化・加速化へ～
  • URL: http://www.kazusa.or.jp/news/pr20221130/
• [備考] 日本を代表するトウガラシ「鷹の爪」の全ゲノムを解読 ～多様なトウガラシを生み出すための基盤に～
  • URL: http://www.kazusa.or.jp/news/pr20230111/
• [備考] 植物の性決定機構に新しい発見 ～マタタビ属のゲノム解読を通じて～
  • URL: http://www.kazusa.or.jp/news/pr20230307/
• [備考] マツタケゲノムの完全解読～ 希少化するマツタケの保全に向けて ～
  • URL: http://www.kazusa.or.jp/news/230508/