体色の多様化が生む脳遺伝子の発現変化と性行動不適合性の解析

• 研究領域: ゲノム・遺伝子相関：新しい遺伝学分野の創成
• 研究課題/領域番号: 23113008
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 首都大学東京 (2012-2015); 国立遺伝学研究所 (2011)
• 研究代表者: 高橋 文 首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (90370121)
• 研究分担者: 長田 直樹 北海道大学, 情報科学研究科, 准教授 (70416270)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 99,190千円 (直接経費: 76,300千円、間接経費: 22,890千円); 2015年度: 16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円); 2014年度: 16,120千円 (直接経費: 12,400千円、間接経費: 3,720千円); 2013年度: 17,030千円 (直接経費: 13,100千円、間接経費: 3,930千円); 2012年度: 16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円); 2011年度: 33,020千円 (直接経費: 25,400千円、間接経費: 7,620千円)
• キーワード: 体色変異 / 性行動 / ドーパミン代謝系 / 多面発現 / ショウジョウバエ / 種分化 / シス遺伝子発現制御 / トランス遺伝子発現制御 / ドーパミン / RNAseq / 生殖的隔離 / 次世代シークエンサー / ebony

研究成果の概要

本研究では、環境適応が引き金となって新たな生殖的隔離が生じるという種分化機構のモデルケースとしてショウジョウバエの体色と行動の両方に関与するドーパミン生合成系の遺伝子群の種内発現変異を研究材料とし、新たなシス制御領域の存在やの体色と行動の両方に影響を与える遺伝的な変異の存在が明らかとなった。また、新たな実験デザインによるゲノムワイドなトランスクリプトーム解析を行い、遺伝子発現制御に関わるゲノム因子の間の様々な相関関係が浮き彫りになった。

研究成果

• [国際共同研究] Universidade de Lisboa(ポルトガル)
• [国際共同研究] Chonnam National University(韓国)
• [雑誌論文] Factors underlying natural variation in body pigmentation of Drosophila melanogaster. (2016)
  • 著者名/発表者名: Sunaga S, Akiyama N, Miyagi R, Takahashi A
  • 雑誌名: Genes Genet. Syst. 巻: in press
  • NAID: 130005421207
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole genome sequencing reveals small genomic regions of introgression in an introduced crater lake population of threespine stickleback. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yoshida, K., Miyagi, R., Mori, S., Takahashi, A., Makino, T., Toyoda, A., Fujiyama, A., and Kitano, J.
  • 雑誌名: Ecol. Evol. 巻: 65 ページ: 2190-2204
  • DOI: 10.1002/ece3.2047
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Complex patterns of cis-regulatory polymorphisms in ebony underlie standing pigmentation variation in Drosophila melanogaster. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryutaro Miyagi, Noriyoshi Akiyama, Naoki Osada, Aya Takahashi
  • 雑誌名: Mol. Ecol. 巻: 24 ページ: 5829-5841
  • DOI: 10.1111/mec.13432
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] An individual-based diploid model predicts limited conditions under which stochastic gene expression becomes advantageous. (2015)
  • 著者名/発表者名: Tomotaka Matsumoto, Katsuhiko Mineta, Naoki Osada, Hitoshi Araki
  • 雑誌名: Front. Genet. 巻: 6 ページ: 336-336
  • DOI: 10.3389/fgene.2015.00336
  • NAID: 120005981380
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] Genetic diversity in humans and non-human primates and its evolutionary consequences. (2015)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 90 号: 3 ページ: 133-145
  • DOI: 10.1266/ggs.90.133
  • NAID: 130005105460
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ecological genomics in Xanthomonas: the nature of genetic adaptation with homologous recombination and host shifts. (2015)
  • 著者名/発表者名: Chao-Li Huang, Pei-Hua Pu, Hao-Jen Huang, Huang-Mo Sung, Hung-Jiun Liaw, Yi-Min Chen, Chien-Ming Chen, Ming-Ban Huang, Naoki Osada, Takashi Gojobori, Tun-Wen Pai, Yu-Tin Chen*, Chi-Chuan Hwang*, Tzen-Yuh Chiang
  • 雑誌名: BMC Genomics 巻: 16 ページ: 188-188
  • DOI: 10.1186/s12864-015-1369-8
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
• [雑誌論文] Population genetics of non-genetic traits: evolutionary roles of stochasticity in gene expression. (2015)
  • 著者名/発表者名: Katsuhiko Mineta, Tomotaka Matsumoto, Naoki Osada, Hitoshi Araki
  • 雑誌名: Gene 巻: 562 ページ: 16-21
  • DOI: 10.1016/j.gene.2015.03.011
  • 査読あり
• [雑誌論文] Model-based verification of hypotheses on the origin of modern Japanese revisited (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakagome S., Sato T., Ishida H., Hanihara T., Yamaguchi T., Kimura R., Mano S., Oota H., The Asian DNA Repository Consortium
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol. 巻: in press ページ: 1-11
  • DOI: 10.1093/molbev/msv045
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequencing of six Mauritian cynomolgus macaques (Macaca fascicularis) reveals a genome-wide pattern of polymorphisms under extreme population bottleneck. (2015)
  • 著者名/発表者名: Osada N., Hettiarachchi N., Babarinde I., Saitou N., Blancher A
  • 雑誌名: Genome Biol. Evol. 巻: 7 ページ: 821-830
  • DOI: 10.1093/gbe/evv033
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] CYP2D44 polymorphisms in cynomolgus and rhesus macaques. (2015)
  • 著者名/発表者名: Uno Y, Uehara S, Kohara S, Osada N, Murayama N, Yamazaki H
  • 雑誌名: Mol. Biol. Rep. 巻: 42 ページ: 1149-1155
  • DOI: 10.1007/s11033-015-3863-0
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cold tolerance and metabolic rate increased by cold acclimation in Drosophila albomicans from natural populations. (2014)
  • 著者名/発表者名: Isobe K., Takahashi A., Tamura K.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 88 号: 5 ページ: 289-300
  • DOI: 10.1266/ggs.88.289
  • NAID: 130003390810
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 年月日: 2014-04-03
  • 査読あり
• [雑誌論文] A novel cell death gene acts to repair patterning defects in Drosophila melanogaster. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tanaka K M, Takahashi A, Fuse N, Takano-Shimizu-Kouno T
  • 雑誌名: Genetics 巻: 197 ページ: 739-742
  • DOI: 10.1534/genetics.114.163337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Extracting population genetics information from a diploid genome sequence. (2014)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 雑誌名: Front. Ecol. Evol. 巻: 2 ページ: 7-7
  • DOI: 10.3389/fevo.2014.00007
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] The genome landscape of the African green monkey kidney-derived Vero cell line (2014)
  • 著者名/発表者名: Osada N, Kohara A, Yamaji T, Hirayama N, Kasai F, Sekizuka T, Kuroda M, Hanada K
  • 雑誌名: DNA Research 巻: 21 ページ: 673-683
  • DOI: 10.1093/dnares/dsu029
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dopamine receptor genes and evolutionary differentiation in the domestication of fighting cocks and long-crowing chickens. (2014)
  • 著者名/発表者名: Komiyama T, Iwama H, Osada N, Nakamura Y, Kobayashi H, Tateno Y, Gojobori T
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0101778
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] Whole genome sequencing of Tibetan macaque (Macaca thibetana) provides new insight into the macaque evolutionary history. (2014)
  • 著者名/発表者名: Zhenxin Fan, Guang Zhao, Peng Li, Naoki Osada, Jinchuan Xing, Yong Yi, Lianming Du, Pedro Silva, Hongxing Wang, Ryuichi Sakate, Xiuyue Zhang, Huailiang Xu, Bisong Yue*, Jing Li
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol. 巻: online advance ページ: 1475-1489
  • DOI: 10.1093/molbev/msu104
  • 査読あり / オープンアクセスとしている
• [雑誌論文] Prdm9 polymorphism unveils mouse Evolutionary tracks (2014)
  • 著者名/発表者名: Kono H, Tamura M, Osada N, Suzuki H, Abe K, Moriwaki K, Ohta K, Shiroishi T
  • 雑誌名: DNA Res. 巻: 21 ページ: 1-12
  • DOI: 10.1093/dnares/dst059
  • 査読あり / オープンアクセスとしている / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Adaptive divergence with gene flow in incipient speciation of Miscanthus floridulus/sinensis complex (Poaceae). (2014)
  • 著者名/発表者名: Huang C-L, Ho C-W, Chiang Y-C, Shigemoto Y, Hsu T-W, Hwang C-C, Ge X-J, Chen C, Wu T-H, Chou C-H, Huang H-J, Gojobori T, Osada N, Chiang T-Y
  • 雑誌名: Plant J. 巻: 80 ページ: 834-847
  • DOI: 10.1111/tpj.12676
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pigmentation and behavior: potential association through pleiotropic genes in Drosophila. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahashi A.
  • 雑誌名: Genes & Genetic Systems 巻: 88 号: 3 ページ: 165-174
  • DOI: 10.1266/ggs.88.165
  • NAID: 10031194256
  • ISSN: 1341-7568, 1880-5779
  • 査読あり
• [雑誌論文] Finding the factors of reduced genetic diversity on X chromosomes of Macaca fascicularis: male-driven evolution, demography, and natural selection. (2013)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 雑誌名: Genetics 巻: 195 ページ: 1007-1025
  • DOI: 10.1534/genetics.113.156703
  • 査読あり
• [雑誌論文] 有害な変異と偶然の効果―中立説とほぼ中立説 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 雑誌名: 生物の科学・遺伝 巻: ５月号 ページ: 322-326
• [雑誌論文] Systematic classification vertebrate chemokines based of on conserved synteny and evolutionary history (2013)
  • 著者名/発表者名: Hisayuki Nomiyama et al.
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 18(1) ページ: 1-16
  • DOI: 10.1111/gtc.12013
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cuticular hydrocarbon content that affects male mate preference of Drosophila melanogaster from West Africa. (2012)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, A., et al
  • 雑誌名: Int. J. Evol. Biol. 巻: 2012 ページ: 278903-278903
  • DOI: 10.1155/2012/278903
  • 査読あり
• [雑誌論文] Starvation-induced elevation of taste responsiveness and expression of a sugar taste receptor gene in Drosophila melanogaster. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishimura, A., Ishida, Y., Takahashi, A., Okamoto, H., Sakabe, M., Itoh, M., Takano-Shimizu, T., and Ozaki, M.
  • 雑誌名: J. Neurogenet. 巻: 26 ページ: 206-215
  • DOI: 10.3109/01677063.2012.694931
  • 査読あり
• [雑誌論文] Weak selection and protein evolution. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Akashi, Naoki Osada, Tomoko Ohta
  • 雑誌名: Genetics 巻: 192 ページ: 15-31
  • DOI: 10.1534/genetics.112.140178
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome sequencing and analysis of the Malaysian cynomolgus macaque (Macaca fascicularis) genome. (2012)
  • 著者名/発表者名: Atsunori Higashino, Ryuichi Sakate, Yosuke Kameoka, Ichiro Takahashi, Makoto Hirata, Reiko Tanuma, Tohru Masui, Yasuhiro Yasutomi and Naoki Osada
  • 雑誌名: Genome Biol. 巻: 13
  • DOI: 10.1186/gb-2012-13-7-r58
  • NAID: 130005471440
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary rates of commonly used nuclear and organelle markers of Arabidopsis relatives (Brassicaceae). (2012)
  • 著者名/発表者名: Chi-Chun Huan, Kuo-Hsiang Hung, Wei-KuangWang, Chao-Li Huang, Tsai-Wen Hsu, Naoki Osada, Chi-Chuan Hwang, Tzen-Yuh Chiang
  • 雑誌名: Gene 巻: 499 ページ: 194-201
  • DOI: 10.1016/j.gene.2012.02.037
  • 査読あり
• [雑誌論文] Footprints of natural and artificial selection for photoperiod pathway genes in Oryza. (2012)
  • 著者名/発表者名: Chao-Li Huang, Cheng-Yu Hung, Yu-Chung Chiang, Chi-Chuan Hwang, Tsai-Wen Hsu, Chi-Chun Huang, Kuo-Hsiang Hung, Kun-Chan Tsai, Kuo-HsiungWang, Naoki Osada, Barbara Anna Schaal, Tzen-Yuh Chiang
  • 雑誌名: Plant J. 巻: 70 ページ: 769-782
  • DOI: 10.1111/j.1365-313x.2012.04915.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial-nuclear interactions and accelerated compensatory evolution : Evidence from the primate cytochrome c oxidase complex (2012)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Hiroshi Akashi
  • 雑誌名: Mol.Biol.Evol. 巻: 29 ページ: 337-346
  • DOI: 10.1093/molbev/msr211
  • 査読あり
• [雑誌論文] Divergent enhancer haplotype of ebony on inversion In(3R)Payne associated with pigmentation variation in a tropical population of Drosophila melanogaster (2011)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, A., Takano-Shimizu, T.
  • 雑誌名: Molecular Ecology 巻: 20 ページ: 4277-87
  • DOI: 10.1111/j.1365-294x.2011.05260.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] CpG site degeneration triggered by the loss of functional constraint created a highly polymorphic macaque drug-metabolizing gene, CYP1A2 (2011)
  • 著者名/発表者名: Uno, Y., Osada, N.
  • 雑誌名: BMC Evol.Biol. 巻: 11 ページ: 283-283
  • DOI: 10.1186/1471-2148-11-283
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phylogenetic inconsistency caused by ancient sex-biased migration (2011)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 雑誌名: PloS ONE 巻: 6
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0025549
  • 査読あり
• [学会発表] 種分化と適応の遺伝学: モデル生物の利点 (2016)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 日本生態学会第63回大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2016-03-21
  • 招待講演
• [学会発表] Genetic architecture of gene expression variation in fruit flies. (2015)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 日独先端科学シンポジウム
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2015-10-02
  • 国際共著/国際学会である / 招待講演
• [学会発表] キイロショウジョウバエ種内体色変異の適応的意義と関与する分子機構の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 秋山礼良、宮城竜太郎、高橋文
  • 学会等名: 日本遺伝学会第87回大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2015-09-24
• [学会発表] ショウジョウバエ自然集団における体色多型を生み出すメラニン合成遺伝子群のcis発現量解 (2015)
  • 著者名/発表者名: 宮城竜太郎、秋山礼良、長田直樹、高橋文
  • 学会等名: 日本進化学会第17回東京大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-08-20
• [学会発表] キイロショウジョウバエ種内体色変異の適応的意義と関与する分子機構の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 秋山礼良、宮城竜太郎、高橋文
  • 学会等名: 日本進化学会第17回東京大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-08-20
• [学会発表] Nucleotide polymorphism and physiological diversity underlying pigmentation variation in Drosophila melanogaster. (2015)
  • 著者名/発表者名: Aya Takahashi
  • 学会等名: 2015 Meeting of the European Society of Evolutionary Biology
  • 発表場所: Lausanne, Switzerland
  • 年月日: 2015-08-10
  • 国際共著/国際学会である / 招待講演
• [学会発表] モーリシャス島産カニクイザルの全ゲノムシークエンス解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹、Hettiarachchi Nilmini、Babarinde Isaac Adeyemi、斎藤成也、Blancher Antoine
  • 学会等名: 第31回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2015-07-18
• [学会発表] ボトルネックがゲノムに与える現象の解析：モーリシャス産カニクイザルを例に (2015)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 遺伝研研究集会「ビッグデータ時代の分子進化」
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2015-06-27
  • 招待講演
• [学会発表] Quantification of cis-regulatory variation in Drosophila melanogaster. (2015)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Ryutaro Miyagi, Aya Takahashi
  • 学会等名: International Symposium: "Establishing Next-Generation Genetics"
  • 発表場所: Nara
  • 年月日: 2015-05-28
  • 国際共著/国際学会である / 招待講演
• [学会発表] Complex cis-regulatory polymorphisms in ebony and tan underlying standing pigmentation variation in Drosophila melanogaster. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ryutaro Miyagi, Naoki Osada, Aya Takahashi
  • 学会等名: International Symposium: "Establishing Next-Generation Genetics"
  • 発表場所: Nara
  • 年月日: 2015-05-28
  • 国際共著/国際学会である
• [学会発表] 集団遺伝学データ解析：ABCのABC (2014)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: ゲノム多様性データの統計解析ワークショップ
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2014-12-05
  • 招待講演
• [学会発表] Evolution of transcription regulation of genes in an insect model organism. (2014)
  • 著者名/発表者名: Aya Takahashi
  • 学会等名: 14th Japanese-American Frontiers of Science Symposium
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-12-04 – 2014-12-07
  • 招待講演
• [学会発表] Challenge of population genomics in non-model organisms (2014)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 学会等名: Frontiers in Genomic Research, National Chen-Kung University
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
  • 年月日: 2014-12-02
  • 招待講演
• [学会発表] 遺伝子発現調節領域の集団内変異 (2014)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 木村資生博士生誕90周年記念シンポジウム
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2014-11-14
  • 招待講演
• [学会発表] 木村先生の研究に関連した、私の二つの研究トピック: 優性度による選択圧の違いと補完的進化 (2014)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 木村資生博士生誕90周年記念シンポジウム
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2014-11-14
  • 招待講演
• [学会発表] キイロショウジョウバエにおける体色変異と低温，乾燥耐性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 秋山礼良，宮城竜太郎，高橋文
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜
  • 年月日: 2014-09-19
• [学会発表] ショウジョウバエ自然集団における体色多型を生み出すメラニン合成遺伝子群のcis発現量解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮城竜太郎，長田直樹，高橋文
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜
  • 年月日: 2014-09-18
• [学会発表] ショウジョウバエ自然集団における体色多型を生み出すメラニン合成遺伝子群のcis発現量解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮城竜太郎，長田直樹，高橋文
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大阪大会
  • 発表場所: 高槻
  • 年月日: 2014-08-22
• [学会発表] キイロショウジョウバエにおける体色変異と低温，乾燥耐性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 秋山礼良，宮城竜太郎，高橋文
  • 学会等名: 日本進化学会第16回大阪大会
  • 発表場所: 高槻
  • 年月日: 2014-08-22
• [学会発表] 進化遺伝学研究に熱意をそそぎ続けるために (2014)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第5回研究会
  • 発表場所: 千葉
  • 招待講演
• [学会発表] Pleiotropic effect and conflict resolution in cis-regulatory mutations elucidated by genome-wide allelic gene rxpression profiles from a natural population of Drosophila melanogaster. (2014)
  • 著者名/発表者名: Takahashi A.
  • 学会等名: SMBE Satellite Meeting/NIG International Symposium
  • 発表場所: 三島
  • 招待講演
• [学会発表] Access Array System及び 454 GS junior を利用したショウジョウバエ自然集団内アレルサンプルの遺伝子発現解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮城竜太郎
  • 学会等名: 生命情報科学若手の会第4回研究会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2013-03-01
• [学会発表] Evolution of rice photoperiod genes (2013)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: NIG collaborative research meeting: Evolutionary Genetics and Proteomics of Natural Resources in Asia
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2013-02-04
• [学会発表] Genome-wide expression analyses using allelic samples from Drosophila Genomic Resource Panel constructed from a natural population of Drosophila melanogaster. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahashi A.
  • 学会等名: The 2nd Asia-Pacific Drosophila Research Conference.
  • 発表場所: ソウル
• [学会発表] Genome-wide expression analyses using allelic samples from a natural population of Drosophila. (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahashi A.
  • 学会等名: Evolution of Junk DNAs
  • 発表場所: 三島
  • 招待講演
• [学会発表] Expression variation analyses of the dopamine biosynthesis pathway genes within Drosophila melanogaster population using Fluidigm 48.48 Access Array system. (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyagi R., Osada N., Takahashi A.
  • 学会等名: SMBE 2013
  • 発表場所: シカゴ
• [学会発表] ショウジョウバエ自然集団内アレルサンプルにおけるドーパミン合成遺伝子群の発現解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 宮城竜太郎, 長田直樹, 高橋文
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] キイロショウジョウバエにおける集団内でのcisおよびtrans遺伝子発現変異の定量 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹, 宮城竜太郎, 高橋文
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] 霊長類のゲノム進化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 日本人類学会
  • 発表場所: つくば
• [学会発表] 帰無モデルとしての中立説と歴史推定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 統計数理研究所研究集会 ゲノム多様性のデータ解析
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] Ecological and Evolutionary Genomics of non-model organisms in Asia (2012)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: CKJ meeting: Genomics, Proteomics, and Bioinformatics with the Asian Perspective
  • 発表場所: 三島
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 実験用霊長類のゲノムとその多様性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第8回霊長類医科学研究フォーラム
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2012-11-29
  • 招待講演
• [学会発表] 霊長類でのX染色体と常染色体との遺伝的多様性の比について (2012)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第66回日本人類学会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2012-11-02
• [学会発表] ゲノムの分岐パターンから探る-歴史，種分化，適応 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: みちのく進化生物セミナー
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-10-19
  • 招待講演
• [学会発表] ショウジョウバエの進化遺伝学研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 第84回日本遺伝学会大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-09-24
• [学会発表] ショウジョウバエ自然集団内アレルサンプルを用いたゲノムワイドな遺伝子発現解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 第84回日本遺伝学会大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-09-24
• [学会発表] Inference of population history from genomic data. (2012)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: First Arabidopsis Symposium
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
  • 年月日: 2012-09-24
  • 招待講演
• [学会発表] ゲノム情報を用いた集団の歴史の推定：霊長類や植物の例 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 統計数理研究所研究集会：生物集団に関する遺伝データと集団遺伝学
  • 発表場所: 立川
  • 年月日: 2012-08-30
• [学会発表] ショウジョウバエ自然集団内アレルサンプルを用いた遺伝子発現解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 日本進化学会第14回大会
  • 発表場所: 八王子
  • 年月日: 2012-08-21
• [学会発表] Inferring natural selection by stratifying a single genome sequence. (2012)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: SMBE2012
  • 発表場所: Dublin, Ireland
  • 年月日: 2012-06-23
• [学会発表] Association between Color and Behavior due to Expression Variants of a Pleiotropic Gene, ebony, in Drosophila (2012)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, A.
  • 学会等名: The 8^<th> Okazaki Biological Conference
  • 発表場所: 基礎生物学研究所(岡崎市)(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-21
• [学会発表] Compensatory Evolution between Mitochondrial and Nuclear Genomes (2012)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: The 8^<th> Okazaki Biological Conference
  • 発表場所: 基礎生物学研究所(岡崎市)(招待講演)
  • 年月日: 2012-03-20
• [学会発表] 多座位データを用いたゲノムヒストリーの推定 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 統計数理研究所共同利用研究集会
  • 発表場所: 統計数理研究所(立川市)
  • 年月日: 2011-12-19
• [学会発表] Inference of population history using a single genome data (2011)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: 日本分子生物学会,第34回大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜市)
  • 年月日: 2011-12-14
• [学会発表] Genetic diversity and population history of macaque monkeys (2011)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 学会等名: Genomic Conservation and Diversity of Organisms : Beyond the NGS time of Life Science
  • 発表場所: Tainan, Taiwan
  • 年月日: 2011-12-09
• [学会発表] メタゲノム解析とその応用 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: メタゲノム解析を利用した下水道情報網基盤構築に関する研究集会
  • 発表場所: 諏訪市
  • 年月日: 2011-11-27
• [学会発表] 機能喪失とCpGサイトの崩壊による旧世界ザルCYP1A2遺伝子の高い遺伝的多様性 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹, 宇野泰広
  • 学会等名: 日本遺伝学会,第83回大会
  • 発表場所: 京都大学(京都市)
  • 年月日: 2011-09-22
• [学会発表] ショウジョウバエ脳におけるebony発現量変異と性行動の日周活動性について (2011)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 学会等名: 日本遺伝学会,第83回大会
  • 発表場所: 京都大学(京都市)
  • 年月日: 2011-09-20
• [学会発表] Association between Color and Behavior in Drosophila (2011)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, A.
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都大学(京都市)(招待講演)
  • 年月日: 2011-07-27
• [学会発表] Compensatory evolution between mitochondrial and nuclear genomes : evidence from primate respiratory chain complex genes (2011)
  • 著者名/発表者名: Osada, N., Akashi, H.
  • 学会等名: SMBE2011
  • 発表場所: 京都大学(京都市)
  • 年月日: 2011-07-27
• [学会発表] 霊長類の中のヒト:ゲノム多様性の種間比較 (2011)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 遺伝研共同研究集会:ヒト形質のゲノム発掘による新しい進化人類学の創成
  • 発表場所: 国立遺伝学研究所(三島市)
  • 年月日: 2011-07-01
• [学会発表] ヒトゲノムの進化における自然選択と遺伝的浮動の役割
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: インシリコ・メガバンク研究会
  • 発表場所: 仙台
  • 招待講演
• [学会発表] Finding evidence for weak compensatory evolution.
  • 著者名/発表者名: Osada N.
  • 学会等名: Evolution of Junk DNAs
  • 発表場所: 三島
• [学会発表] Dissecting regulatory mechanisms of transcriptome variation in Drosophila melanogaster.
  • 著者名/発表者名: Osada N.
  • 学会等名: TIGP retreat
  • 発表場所: Taipei, Taiwan
  • 招待講演
• [学会発表] Dissecting regulatory mechanisms of transcriptome variation in Drosophila melanogaster.
  • 著者名/発表者名: Osada N.
  • 学会等名: ISEGB2013
  • 発表場所: Taichung, Taiwan
  • 招待講演
• [学会発表] Finding evidence for weak compensatory evolution
  • 著者名/発表者名: Osada N.,Akashi H.
  • 学会等名: SMBE Satellite Meeting/NIG International Workshop
  • 発表場所: 三島
  • 招待講演
• [学会発表] Genome-wide analysis of cis-regulatory mutations affecting gene expression in males and females of Drosophila melanogaster:
  • 著者名/発表者名: Takahashi A.
  • 学会等名: RCGB conference: Prospect of Genomics and Bioinformatics
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Allele-specific gene expression among Drosophila melanogaster hybrid lines revealed abundant cis-regulatory mutations.
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: ゲノム進化分野におけるビッグデータ情報解析の新展開
  • 発表場所: 東京
• [図書] 『遺伝子が語る生命38億年の謎-なぜ，ゾウはネズミより長生きか？』第7章「遺伝子多型の謎-ABO式血液型はなぜ生き残ったのか？」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 総ページ数: 227
  • 出版者: 悠書館
• [図書] 遺伝子図鑑 「遺伝子図鑑」編集委員会編 第七章3節 (2013)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 出版者: 悠書館
• [図書] 遺伝子図鑑 「遺伝子図鑑」編集委員会編 第七章1,2,11節 (2013)
  • 著者名/発表者名: 明石裕，長田直樹
  • 出版者: 悠書館
• [図書] ヒトは病気とともに進化した 太田博樹・長谷川眞理子編著 第二章 (2013)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 出版者: 勁草書房
• [図書] 「生殖隔離と種分化遺伝子」 In 『シリーズ現代の生態学7 エコゲノムクスー遺伝子からみた適応ー』（森長真一、工藤洋編集 (2012)
  • 著者名/発表者名: 高橋文
  • 出版者: 共立出版
• [図書] An overview of transcriptome studies in nonhuman primates. In: Post genome Biology of primates (Primatology monographs). Go, Y., Imai, H., Hirai, H. Eds. (2012)
  • 著者名/発表者名: Osada, N.
  • 出版者: Springer-Verlag
• [図書] An overview of transcriptome studies in nonhuman primates. In : Post genome Biology of primates (Primatology monographs) (2012)
  • 著者名/発表者名: Osada N.
  • 出版者: Springer-Verlag
• [図書] Bucentaur (Bent) Gene Family : Gene Duplication and Retrotransposon Insertion In Gene Duplication (2011)
  • 著者名/発表者名: Iwashita, S., Osada, N.
  • 出版者: InTech
• [備考] 首都大学東京 進化遺伝学研究室
  • URL: http://www.biol.se.tmu.ac.jp/labo.asp?ID=evogen
• [備考] 新学術研究領域「ゲノム・遺伝子相関」
  • URL: http://www.ige.tohoku.ac.jp/prg/genetics/
• [備考] 新学術研究領域「ゲノム・遺伝子相関」高橋班研究内容
  • URL: http://www.ige.tohoku.ac.jp/prg/genetics/study07.html
• [備考] 首都大学東京 理工学研究科 生命科学専攻 進化遺伝学研究室
  • URL: http://www.biol.se.tmu.ac.jp/labo.asp?ID=evogen
• [備考] 新学術研究領域「ゲノム・遺伝子相関」高橋班研究内容
  • URL: http://www.ige.tohoku.ac.jp/prg/genetics/study07.html
• [備考] 首都大学東京 理工学研究科 生命科学専攻 進化遺伝学研究室
  • URL: http://www.biol.se.tmu.ac.jp/labo.asp?ID=evogen
• [備考]
  • URL: http://www.ige.tohoku.ac.jp/prg/genetics/study07.html
• [学会・シンポジウム開催] International Symposium: "Establishing Next-Generation Genetics" (2015)
  • 発表場所: Nara
  • 年月日: 2015-05-28