非コードＤＮＡ領域によるゲノムＤＮＡ再編成制御機構

• 研究領域: ゲノムを支える非コードＤＮＡ領域の機能
• 研究課題/領域番号: 23114003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 太田 邦史 東京大学, 総合文化研究科, 教授 (90211789)
• 研究分担者: 加藤 由起 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (50391917)
• 連携研究者: 山田 貴富 中央大学, 理工学部生命科学科, 助教 (30451850)
• 研究期間 (年度): 2011-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 181,350千円 (直接経費: 139,500千円、間接経費: 41,850千円); 2015年度: 34,320千円 (直接経費: 26,400千円、間接経費: 7,920千円); 2014年度: 34,320千円 (直接経費: 26,400千円、間接経費: 7,920千円); 2013年度: 36,140千円 (直接経費: 27,800千円、間接経費: 8,340千円); 2012年度: 35,880千円 (直接経費: 27,600千円、間接経費: 8,280千円); 2011年度: 40,690千円 (直接経費: 31,300千円、間接経費: 9,390千円)
• キーワード: DNA / ゲノム / 非コード領域 / 組換え / 転写 / クロマチン / エピゲノム / 遺伝 / 非コードDNA / 偽遺伝子 / ncDNA / 遺伝情報 / 減数分裂

研究成果の概要

非コードDNAの動的性質が、クロマチンやエピゲノム、ノンコーディングRNA転写などにより、どのように統合的に制御されているかを調べた。その結果、１）減数分裂期の遺伝的組換えホットスポットにおいて特徴的なヒストン修飾が生じ、これによりゲノム進化の空間的制御が行われていること、２）組換えホットスポットの活性化に「リエゾン因子」というタンパク質がもたらす非コードDNA領域の染色体高次構造変化が重要な役割を果たすこと、３）非コードDNA部分のRNA転写によりその近傍の遺伝子領域でクロマチン構造やエピゲノムの変化が誘発され、その変化を通じて遺伝子発現が正または負に制御されること、などを明らかにしてきた。

研究成果

• [国際共同研究] Boston College/Memorial Sloan Kettering Cancer Center/Kansas University(米国)
• [雑誌論文] Local potentiation of stress-responsive genes by upstream noncoding transcription. (2016)
  • 著者名/発表者名: Takemata N, Oda A, Yamada T, Galipon J, Miyoshi T, Suzuki Y, Sugano S, Hoffman CS, Hirota K, Ohta K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 印刷中 号: 11 ページ: 5174-89
  • DOI: 10.1093/nar/gkw142
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Analysis of novel Sir3 binding regions in Saccharomyces cerevisiae. (2016)
  • 著者名/発表者名: Mitsumori R., OhashI T., Kugou K., Ichino A., Taniguchi K., Ohta K., Uchida H., Oki M.
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 11-17
  • DOI: 10.1093/jb/mvw021
  • NAID: 40020880710
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] DNMT3A R882 mutants interact with polycomb proteins to block haematopoietic stem and leukaemic cell differentiation. (2016)
  • 著者名/発表者名: Koya J, Kataoka K, Sato T, Bando M, Kato Y, Tsuruta-Kishino T, Kobayashi H, Narukawa K, Miyoshi H, Shirahige K, Kurokawa M.
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 7 号: 1 ページ: 10924-10924
  • DOI: 10.1038/ncomms10924
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Shugoshin forms a specialized chromatin domain at subtelomeres that regulates transcription and replication timing. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tashiro S, Handa T, Matsuda A, Ban T, Takigawa T, Miyasato K, Ishii K, Kugou K, Ohta K, Hiraoka Y, Masukata H, Kanoh J.
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: 7 号: 1 ページ: 10393-10393
  • DOI: 10.1038/ncomms10393
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Glycerophospholipid regulation of modality-specific sensory axon guidance in the spinal cord. (2015)
  • 著者名/発表者名: Guy AT, Nagatsuka Y, Ooashi N, Inoue M, Nakata A, Greimel P, Inoue A, Nabetani T, Murayama A, Ohta K, Ito Y, Aoki J, Hirabayashi Y, Kamiguchi H
  • 雑誌名: Science 巻: 349 号: 6251 ページ: 974-977
  • DOI: 10.1126/science.aab3516
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Exome Sequencing Identification of EP300 Mutation in a Proband with Coloboma and Imperforate Anus: Possible Expansion of the Phenotypic Spectrum of Rubinstein-Taybi Syndrome (2015)
  • 著者名/発表者名: Koji Masuda, Kazuhiro Akiyama, Michiko Arakawa, Eriko Nishi, Noritaka Kitazawa, Tsukasa Higuchi, Yuki Katou, Katsuhiko Shirahige, Kosuke Izumi
  • 雑誌名: Molecular Syndromology 巻: 6 号: 2 ページ: 99-103
  • DOI: 10.1159/000375542
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Replication-Coupled PCNA Unloading by the Elg1 Complex Occurs Genome-wide and Requires Okazaki Fragment Ligation (2015)
  • 著者名/発表者名: Takashi Kubota, Yuki Katou, Ryuichiro Nakato, Katsuhiko Shirahige, Anne D. Donaldson
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 12 号: 5 ページ: 774-787
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2015.06.066
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Dynamic transition of transcription and chromatin landscape during fission yeast adaptation to glucose starvation (2015)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda, Naomichi Takemata, Yoshito Hirata, Tomoichiro Miyoshi, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Kunihiro Ohta
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 20 ページ: 392-407
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Antagonistic controls of chromatin and mrna start site selection by Tup family corepressors and the CCAAT-binding factor. (2015)
  • 著者名/発表者名: Asada R, Takemata N, Hoffman CS, Ohta K, Hirota K.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 巻: 35 号: 5 ページ: 847-855
  • DOI: 10.1128/mcb.00924-14
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Environmental factors that affect pupation decision in the horned flour beetle Gnatocerus cornutus (2015)
  • 著者名/発表者名: Takane Ozawa, Kunihiro Ohta, Masakazu Shimada, Kensuke Okada, Yasukazu Okada
  • 雑誌名: Zoological Science 巻: 32 号: 2 ページ: 183-187
  • DOI: 10.2108/zs140203
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Quantitative Dynamics of Chromatin Remodeling during Germ Cell Specification from Mouse Embryonic Stem Cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K., Yabuta, Y., Hayashi, K., Ohta, H., Kiyonari, H., Mitani, T., Moritoki, Y., Kohri, K., Kimura, H., Yamamoto, T., Katou, Y., Shirahige, K., Saitou, M.
  • 雑誌名: Cell Stem Cell 巻: 16 号: 5 ページ: 517-532
  • DOI: 10.1016/j.stem.2015.03.002
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Unique gene expression profile of the proliferating Xenopus tadpole tail blastema cells deciphered by RNA-sequencing analysis. (2015)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Tsujioka, Takekazu kunieda, Yuki Katou, Katsuhiko Shirahige, Takeo Kubo
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 10(3) 号: 3 ページ: e0111655-e0111655
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0111655
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Germline gain-of-function mutations in AFF4 cause a developmental syndrome functionally linking the super elongation complex and cohesin. (2015)
  • 著者名/発表者名: Izumi K, Nakato R, Zhang Z, Edmondson AC, Noon S, Dulik MC, Rajagopalan R, Venditti CP, Gripp K, Samanich J, Zackai EH, Deardorff MA, Clark D, Allen JL, Dorsett D, Misulovin Z, Komata M, Bando M, Kaur M, Katou Y, Shirahige K*, Krantz ID*.
  • 雑誌名: Nature Genetics 巻: 47 号: 4 ページ: 338-338
  • DOI: 10.1038/ng.3229
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The chromosomal association of the Smc5/6 complex depends on cohesion and predicts the level of sister chromatid entanglement. (2015)
  • 著者名/発表者名: Jeppsson K, Carlborg KK, Nakato R, Berta DG, Lilienthal I, Kanno T, Lindqvist A, Brink MC, Dantuma NP, Katou Y, Shirahige K, Sjögren C.
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 10 号: 10 ページ: e1004680-e1004680
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1004680
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] 5-Hydroxymethylcytosine plays a critical role in glioblastomagenesis by recruiting the CHTOP-Methylosome complex (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Takai, Tetsu Akiyama et al.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 48
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.08.071
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Dimeric combinations of MafB, cFos and cJun control the apoptosis-survival balance in limb morphogenesis (2014)
  • 著者名/発表者名: N. suda, T. Itoh, R. Nakato et. al.
  • 雑誌名: Development 巻: 141 号: 14 ページ: 2885-2894
  • DOI: 10.1242/dev.099150
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] BRCA2 coordinates the activities of cell-cycle kinases to promote genome stability. (2014)
  • 著者名/発表者名: Yata K, Bleuyard JY, Nakato R, Ralf C, Katou Y, Schwab RA, Niedzwiedz W, Shirahige K, Esashi F.
  • 雑誌名: Cell Rep. 巻: 7 号: 5 ページ: 1547-1559
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.04.023
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Population genomics of the fission yeast Schizosaccharomyces pombe (2014)
  • 著者名/発表者名: Jeffrey A. Fawcett, Tetsushi Iida, Shohei Takuno, Ryuichi P. Sugino, Tomoyuki Kado, Kazuto Kugou, Sachiko Mura, Takehiko Kobayashi, Kunihiro Ohta, Jun-ichi Nakayama, Hideki Innan
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 9 号: 8 ページ: e104241-e104241
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0104241
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Meiotic recombination cold spots in chromosomal cohesion sites (2014)
  • 著者名/発表者名: Masaru Ito, Kazuto Kugou, Jeffrey A. Fawcett, Sachiko Mura, Sho Ikeda, Hideki Innan, Kunihiro Ohta
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: (Published online) 号: 5 ページ: 359-378
  • DOI: 10.1111/gtc.12138
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prdm9 Polymorphism Unveils Mouse Evolutionary Tracks (2014)
  • 著者名/発表者名: Kono H, Tamura M, Osada N, Suzuki H, Abe K, Moriwaki K, Ohta K, Shiroishi T
  • 雑誌名: DNA Research 巻: - 号: 3 ページ: 315-326
  • DOI: 10.1093/dnares/dst059
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Initiation of meiotic recombination in chromatin structure (2013)
  • 著者名/発表者名: 山田貴富、太田邦史
  • 雑誌名: J. Biochem. 巻: 154 号: 2 ページ: 107-114
  • DOI: 10.1093/jb/mvt054
  • NAID: 40019731054
  • 査読あり
• [雑誌論文] patiotemporal regulation of meiotic recombination by Liaisonin. (2013)
  • 著者名/発表者名: 三好知一郎ら
  • 雑誌名: Bioarchitecture 巻: 3 号: 1 ページ: 20-24
  • DOI: 10.4161/bioa.23966
  • 査読あり
• [雑誌論文] 長鎖ノンコーディングRNAによる遺伝子発現・クロマチン修飾制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道、三木敦子、太田邦史
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 31 ページ: 1183-1188
• [雑誌論文] Stress-induced lncRNAs evade nuclear degradation and enter the translational machinery (2013)
  • 著者名/発表者名: Galipon, Josephine ; Miki, Atsuko ; Oda, Arisa ; Inada, Toshifumi ; Ohta, Kunihiro
  • 雑誌名: Genes to Cells 巻: 18 号: 5 ページ: 353-368
  • DOI: 10.1111/gtc.12042
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acetylated Histone H3K9 is associated with meiotic recombination hotspots, and plays a role in recombination redundantly with other factors including the H3K4 methylase Setl in fission yeast. (2013)
  • 著者名/発表者名: 山田真太郎
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 41 号: 6 ページ: 3504-3517
  • DOI: 10.1093/nar/gkt049
  • 査読あり
• [雑誌論文] A central coupler for recombination initiation linking chromosome architecture to S phase checkpoint. (2012)
  • 著者名/発表者名: 三好知一郎
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 14 号: 5 ページ: 722-733
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.06.023
  • 査読あり
• [雑誌論文] 次世代シークエンサーによる非コードDNA配列解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 雑誌名: 実験医学 2012年9月号「ヒトゲノム中98%の"未踏領域"非コードDNAに挑む」 巻: 30 ページ: 2209-2214
• [雑誌論文] Importance of Polη for damage-induced cohesion reveals differential regulation of cohesion establishment at the break site and genome-wide. (2012)
  • 著者名/発表者名: Enervald E
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 9(1) 号: 1 ページ: 1-17
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1003158
  • 査読あり
• [雑誌論文] HDAC8 mutations in Cornelia de Lange syndrome affect the cohesin acetylation cycle. (2012)
  • 著者名/発表者名: Deardorff MA
  • 雑誌名: Nature 巻: 489(7415) 号: 7415 ページ: 313-7
  • DOI: 10.1038/nature11316
  • 査読あり
• [雑誌論文] Endogenous DNA replication stress results in expansion of dNTP pools and a mutator phenotype (2012)
  • 著者名/発表者名: Davidson MB, Katou Y, Keszthelyi A, Sing TL, Xia T, Ou J, Vaisica JA, Thevakumaran N, Marjavaara L, Myers CL, Chabes A, Shirahige K, Brown GW
  • 雑誌名: EMBO J. 巻: 31(4) 号: 4 ページ: 895-907
  • DOI: 10.1038/emboj.2011.485
  • 査読あり
• [雑誌論文] 長鎖ncRNAによるクロマチン・転写活性化の制御 (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史、小田有沙, ら
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 29 ページ: 1722-1727
• [雑誌論文] 環境応答とエピゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 雑誌名: Endocrine Disrupter News Letter 巻: 14 ページ: 6-6
• [雑誌論文] Replisome stability at defective DNA replication forks is independent of S phase checkpoint kinases (2011)
  • 著者名/発表者名: De Piccoli G, Katou Y, Itoh T, Nakato R, Shirahige K, Labib K
  • 雑誌名: Mol Cell. 巻: 45 号: 5 ページ: 696-704
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2012.01.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Origin association of Sld3, Sld7, and Cdc45 proteins is a key step for determination of origin-firing timing (2011)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, S., Nakano, R., Katou, Y., Shirahige, K. and Araki, H.
  • 雑誌名: Curr. Biol 巻: 21 号: 24 ページ: 2055-2063
  • DOI: 10.1016/j.cub.2011.11.038
  • 査読あり
• [雑誌論文] The replication checkpoint protects fork stability by releasing trans cribed genes from nuclear pores (2011)
  • 著者名/発表者名: Bermejo R, Capra T, Jossen R, Colosio A, Frattini C, Carotenuto W, Cocito A, Doksani Y, Klein H, Gomez-Gonzalez B, Aguilera A, Katou Y, Shirahige K, Foiani M
  • 雑誌名: Cell 巻: 146 号: 2 ページ: 233-246
  • DOI: 10.1016/j.cell.2011.06.033
  • 査読あり
• [学会発表] Promoter-associated noncoding RNAs reorganize genomic distribution of the ATF/CREB transcription factor Atf1 (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: Keystone Symposia Conference"Chromatin and Epigenetics"
  • 発表場所: Whistler Conference Centre（バンクーバー、カナダ）
  • 年月日: 2016-03-20
  • 国際学会
• [学会発表] Artificial evolition of variable domains of antibody genes in chicken DT40 cells (2016)
  • 著者名/発表者名: 村山晃歩ら
  • 学会等名: The Fourth Annual Winter q-Bio Meeting
  • 発表場所: シェラトンワイキキ（ハワイ、アメリカ）
  • 年月日: 2016-02-15
  • 国際学会
• [学会発表] Transcriptional dynamics of long noncoding RNAs in glucose starvation stress response (2016)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: The Fourth Annual Winter q-Bio Meeting
  • 発表場所: シェラトンワイキキ（ハワイ、アメリカ）
  • 年月日: 2016-02-15
  • 国際学会
• [学会発表] 分裂酵母の飢餓ストレス応答性IncRNA (2016)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第３３回染色体ワークショップ・第１４回ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 松島一の坊（宮城県宮城郡松島町）
  • 年月日: 2016-01-12
• [学会発表] 長鎖非コードＲＮＡはストレスに応答して転写因子の結合をゲノムワイドに制御する (2016)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: 第３３回染色体ワークショップ・第１４回ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 松島一の坊（宮城県宮城郡松島町）
  • 年月日: 2016-01-12
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓における fbp1+センスアンチセンス lncRNA の分解制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス時のセンス・アンチセンス長鎖非コードＲＮＡを介した遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: BMB2015
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] Dose intersubspecific and -specific swapping of Prdm9 ZFA affect recombination and reproduction in mice? (2015)
  • 著者名/発表者名: 河野宏光ら
  • 学会等名: 29th International Mammalian Genome Comference
  • 発表場所: 横浜開港記念会館（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2015-11-08
  • 国際学会
• [学会発表] 耐熱性制限酵素による大規模ゲノム再編成 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村隆宏ら
  • 学会等名: 第２３回ＤＮＡ複製・組換え修復ワークショップ研究会
  • 発表場所: 焼津グランドホテル（静岡県焼津市）
  • 年月日: 2015-10-19
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス時の長鎖非コードＲＮＡを介した分裂酵母の遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第２７回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
  • 発表場所: 延暦寺会館（滋賀県大津市）
  • 年月日: 2015-08-26
• [学会発表] Transcriptional dynamics of sense and antisense long noncodings RNAs in stress response (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙
  • 学会等名: QBiC Symposium2015
  • 発表場所: 理化学研究所生命システム研究センター（大阪府吹田市）
  • 年月日: 2015-08-24
  • 国際学会
• [学会発表] Recombination Activity at Trasgenic Hotspots in Mice (2015)
  • 著者名/発表者名: 河野宏光ら
  • 学会等名: International Symposium on Chromatin Structure,Dynamics,and Function
  • 発表場所: 淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)
  • 年月日: 2015-08-23
  • 国際学会
• [学会発表] グルコース濃度変動ストレス応答時のセンス・アンチセンス長鎖非コード依存的な遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第１７回ＲＮＡ学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓における fbp1+センスアンチセンス lncRNA の分解制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: 第１７回ＲＮＡ学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス応答性のセンス・アンチセンス非コード RNA 依存 的な遺伝子発現制御機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井智子ら
  • 学会等名: 第１７回ＲＮＡ学会年会
  • 発表場所: ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
  • 年月日: 2015-07-15
• [学会発表] 抗体遺伝子迅速編集法の開発と抗体エンジニアリング (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋本講司ら
  • 学会等名: 2015年度生物工学若手研究者の集い（若手会）夏のセミナー
  • 発表場所: タナベ名古屋研修センター（愛知県北名古屋市）
  • 年月日: 2015-07-11
• [学会発表] 遺伝子導入で異所的に形成したマウス組換えホットスポットの活性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 河野宏光
  • 学会等名: モロシヌス研究会
  • 発表場所: かんぽの宿 有馬(兵庫県神戸市)
  • 年月日: 2015-07-03
• [学会発表] 分裂酵母のストレス応答性IncRNAの発現解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第４回ＮＧＳ現場の会
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-07-01
• [学会発表] Transcriptial dynamics of sense and antisense long noncoding RNAs in stress response (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Distinct decay dynamics of ribosome-bound lncRNA and mRNAs (2015)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21
  • 国際学会
• [学会発表] Long noncoding RNAs stimulate promoter binding of the transcription factor Atf1 by antagonizing the Grougho/Tup1-like corepressors Tup11 and Tup12 (2015)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: Pombe2015
  • 発表場所: 生田神社会館（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-06-21
  • 国際学会
• [学会発表] Transcriptional dynamics of antisense long noncoding RNAs in stress response (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: THIRD ANNUAL WINTER Q-BIO MEETING
  • 発表場所: The Westin Maui Resort & Spa （ハワイ、アメリカ）
  • 年月日: 2015-02-16
  • 国際学会
• [学会発表] Glucose starvation-dependent transcriptional switching by sense and antisense lncRNAs in fission yeast (2015)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science 2015
  • 発表場所: 一橋講堂（東京都千代田区）
  • 年月日: 2015-01-20
  • 国際学会
• [学会発表] 長鎖ノンコーディング RNA は転写因子の呼び込みをポジティブフィードバック的に促進する (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 安芸グランドホテル（ 広島県廿日市市）
  • 年月日: 2014-12-15
• [学会発表] センス及びアンチセンスlong noncoding RNAによる遺伝子発現の切り替え制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙ら
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+センス・アンチセンスlncRNAの制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] 染色体高次構造による組換えの開始制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将ら
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25
• [学会発表] Chromosome structure and meiotic recombination hot and cold spots (2014)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium (International Symposium on DNA Replication, Recombination and Repair)
  • 発表場所: 御殿場高原リゾート「時之栖」（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Promoter-associated lncRNA recruits transcriptional activator through a positive feedback mechanism (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium (International Symposium on DNA Replication, Recombination and Repair)
  • 発表場所: 御殿場高原リゾート「時之栖」（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17
  • 国際学会
• [学会発表] Rapid Chimeric Monoclonal Antibody Production with DT40 Cells” (2014)
  • 著者名/発表者名: 橋本講司ら
  • 学会等名: JAACT2014
  • 発表場所: 北九州国際会議場（福岡県北九州市）
  • 年月日: 2014-11-11
• [学会発表] DNA切断が引き起こすゲノム再編成 (2014)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜バイオ大学（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-09-17
• [学会発表] Balanced regulation of sense and antisense lncRNA transcripts in fission yeast glucose starvation (2014)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子ら
  • 学会等名: 2014 CSHL Conference on Regulatory & Non-Coding RNAs
  • 発表場所: Cold Spring Harbor（アメリカ）
  • 年月日: 2014-08-26
  • 国際学会
• [学会発表] Meiotic DSB Cold Spots in Yeast Chromosomal Axes (2014)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 2014 Meiosis Gordon Research Conference
  • 発表場所: Colby-Sawyer College（ニューロンドン、アメリカ）
  • 年月日: 2014-06-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Meiotic recombination cold spots in chromosomal cohesion sites (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将ら
  • 学会等名: 2014 Meiosis Gordon Research Conference
  • 発表場所: Colby-Sawyer College（ニューロンドン、アメリカ）
  • 年月日: 2014-06-01
  • 国際学会
• [学会発表] Epigenetics and dynamics of non-coding genome (2014)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 高等研カンファレンス2014「Chromatin Decoding」
  • 発表場所: 公益財団法人国際高等研究所(京都府木津川市)
  • 年月日: 2014-05-12
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] LncRNA transcription enhances interaction of transcriptional activator with chromatin through a positive feedback mechanism (2014)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道ら
  • 学会等名: 高等研カンファレンス2014「Chromatin Decoding」
  • 発表場所: 公益財団法人国際高等研究所(京都府木津川市)
  • 年月日: 2014-05-12
  • 国際学会
• [学会発表] Rapid Antibody Engineering Using DT40 Cells (2014)
  • 著者名/発表者名: 橋本講司ら
  • 学会等名: PEGS BOSTON the 10th Annual
  • 発表場所: World Trade Center Boston （ボストン、 アメリカ）
  • 年月日: 2014-05-05
  • 国際学会
• [学会発表] 栄養代謝・環境要素のエピゲノムへの影響 (2014)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第87回日本内分泌学会学術総会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2014-04-24
  • 招待講演
• [学会発表] Transcriptional regulation by glucose starvation stress-induced lncRNAs in yeast (2014)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda
  • 学会等名: the Second Annual Winter q-bio Meeting in Hawaii
  • 発表場所: Waikoloa village, Hawaii,USA(ハワイ、アメリカ)
• [学会発表] Spatio-temporal control of meiotic recombination initiation (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: EMBO Conference on Fission Yeast: pombe 2013
  • 発表場所: University of London（ロンドン、イギリス）
  • 招待講演
• [学会発表] Chromatin regulation by stress-induced lncRNAs. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: 酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ
  • 発表場所: グランディア芳泉(福井県あわら市）
  • 招待講演
• [学会発表] Determinants of meiotic recombination hotspots in S. pombe (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: EMBO Conference on Meiosis
  • 発表場所: Hotel Radisson Blu, Radebeul-Dresden（ドレスデン、ドイツ）
  • 招待講演
• [学会発表] Massive genome restructuring induced by conditional multiple DNA breaks (2013)
  • 著者名/発表者名: Kunihiro Ohta
  • 学会等名: 第29回放生研・放医研国際シンポジウム
  • 発表場所: コープイン京都（京都府京都市）
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母のグルコース飢餓応答性long noncoding RNAの発現制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
• [学会発表] Transcriptional regulation by Glucose starvation-induced lncRNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Arisa Oda
  • 学会等名: EMBO Conference on Fission Yeast: Pombe 2013
  • 発表場所: University of London（ロンドン、イギリス）
• [学会発表] A Rapid Method for Generation and Engineering a Monoclonal Antibody with the ADLib System (2013)
  • 著者名/発表者名: 黒澤恒平
  • 学会等名: IBC’S 8th Annual Next Generation Protein Therapeutics
  • 発表場所: Hotel del Coronado(サンディエゴ、アメリカ)
• [学会発表] Distinct stability control of metabolic stress-related sense and antisense long noncoding RNAs (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsuko Miki
  • 学会等名: EMBO Conference on Fission Yeast: pombe 2013
  • 発表場所: University of London（ロンドン、イギリス）
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+センス・アンチセンスlncRNAの分解制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 三木敦子
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] ADLibシステムを利用し た抗体遺伝子迅速改変技術による抗体エンジニアリング (2013)
  • 著者名/発表者名: 橋本講司
  • 学会等名: 第65回 日本生物工学会大会
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島県広島市）
• [学会発表] 染色体高次構造と複製チェックポイントの連係を介した減数分裂組換え開始制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: 第 30 回染色体ワークショップ・第 11 回核ダイナミクス研究会合同会議
  • 発表場所: 淡路夢舞台会議場（兵庫）
  • 年月日: 2012-12-19
• [学会発表] Directional RNA-seq及びChIP-seqによるグルコース飢餓応答性長鎖ノンコーディングRNAのゲノムワイド解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 染色体高次構造とS期チェックポイントを減数分裂期組換えの開始と連係させるリエゾン因子 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] 分裂酵母グルコース飢餓におけるfbp1+アンチセンスlncRNAの分解制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 三木 敦子
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] ヒストン修飾酵素Gcn5およびSet1はlncRNAの転写と協調してグルコース飢餓応答に働く (2012)
  • 著者名/発表者名: 竹俣 直道
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] A novel mediator for meiotic recombination initiation that links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: The 8th 3R Symposium
  • 発表場所: 淡路夢舞台会議場（兵庫）
  • 年月日: 2012-11-25
  • 招待講演
• [学会発表] A central coupler for recombination initiation linking chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: The 8th 3R Symposium
  • 発表場所: 淡路夢舞台会議場（兵庫）
  • 年月日: 2012-11-25
• [学会発表] The transcriptiome analysis of stress responsive long non-coding RNAs using directional RNA-seq in fission yeast (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: The 2012 CSHL Meeting on Dynamic Organization of Nuclear Function
  • 発表場所: Cold Spring Harbor（アメリカ）
  • 年月日: 2012-09-27
• [学会発表] A novel mediator for meiotic recombination initiation links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: The 2012 CSHL Meeting on Dynamic Organization of Nuclear Function
  • 発表場所: Cold Spring Harbor（アメリカ）
  • 年月日: 2012-09-27
  • 招待講演
• [学会発表] 複製チェックポイントと染色体高次構造を仲介する新規因子による遺伝的組換え開始制御 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: 日本遺伝学会第84回大会
  • 発表場所: 九州大学（福岡）
  • 年月日: 2012-09-24
• [学会発表] Long non-coding RNA による転写制御の RNA-seq 解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田 有沙
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学（仙台）
  • 年月日: 2012-07-18
• [学会発表] ADLibシステムを用いたシーズ抗体の開発 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第１２回日本蛋白質化学会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（名古屋）
  • 年月日: 2012-06-20
  • 招待講演
• [学会発表] A novel mediator for recombination initiation links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤 将
  • 学会等名: The 2012 Meiosis Gordon Research Conference
  • 発表場所: New London（アメリカ）
  • 年月日: 2012-06-03
• [学会発表] グルコース飢餓ストレス応答性の long noncoding RNA による分裂酵母の転写制御機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小田有沙
  • 学会等名: NGS現場の会 第二回研究会
  • 発表場所: ホテル阪急エキスポパーク（大阪）
  • 年月日: 2012-05-24
• [学会発表] Conditional induction of whole genome remodeling in plants and fungi (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: EMBO Genetic Stability and Change Workshop
  • 発表場所: Roscoff（フランス）
  • 年月日: 2012-05-02
  • 招待講演
• [学会発表] TAQingシステムを用いた酵母の大規模ゲノム改変 (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第１８３回酵母細胞研究会例会
  • 発表場所: 東京海洋大学（東京）
  • 招待講演
• [学会発表] Mde2 is a central coupler for meiotic recombination initiation that links chromosome architecture to S-phase checkpoint (2012)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 1st IGAKUKEN International Symposium on ”Regulation of Chromosome Cycle”
  • 発表場所: 東京都医学総合研究所（東京）
  • 招待講演
• [学会発表] Gene regulation by lncRNAs in response to low glucose stress (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史, ら
  • 学会等名: 分子生物学会
  • 発表場所: 神奈川、パシフィコ横浜
  • 年月日: 2011-12-16
• [学会発表] Rec15Mer2 bridges meiotic recombination initiation sites to chromosomeaxes to facilitate the assembly of recombination initiation complexes (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史, ら
  • 学会等名: EMBO workshop (Meiosis)
  • 発表場所: イタリア、Paestum
  • 年月日: 2011-09-19
• [学会発表] Role of long non-coding RNAs during glucose starvation in fission yeast (2011)
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道, ら
  • 学会等名: FASEB Summer Conferences (epigenetics)
  • 発表場所: アメリカ、Snowmass
  • 年月日: 2011-08-03
• [学会発表] 環境応答とエピゲノム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第5回環境ホルモン学会
  • 発表場所: 東京、東大(本郷)(招待講演)
  • 年月日: 2011-06-16
• [学会発表] 大規模ゲノム再編成システム (2011)
  • 著者名/発表者名: 太田邦史
  • 学会等名: 第7回よこはまバイオ・ス研究会
  • 発表場所: 神奈川、横浜市立大(招待講演)
  • 年月日: 2011-05-31
• [学会発表] t-haplotypeから見たマウスPrdm9遺伝子の分子進化
  • 著者名/発表者名: Hiromitsu Kono
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 慶應義塾大学日吉キャンパス（神奈川県横浜市）
• [学会発表] Role of lncRNAs in chromatin regulation during fission yeast gene activation
  • 著者名/発表者名: Naomichi Takemata
  • 学会等名: FASEB Science Research Conference(Epigenetics, Chromatin and Transcription)
  • 発表場所: シェラトン ナッソー ビーチリゾート&カジノ（ナッソー、バハマ）
• [学会発表] lncRNA transcription drives sequential recruitment of chromatin regulator proteins during gene activation in fission yeast
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ
  • 発表場所: グランディア芳泉（福井県あわら市）
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの転写を介したヒストンアセチル化制御機構
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 酵母遺伝学フォーラム 第46回研究報告会
  • 発表場所: 東北学院大学土樋キャンパス 押川記念ホール（宮城県仙台市）
• [学会発表] 長鎖ノンコーディングRNAの転写はクロマチン制御因子の呼び込みをポジティブフィードバック的に促進する
  • 著者名/発表者名: 竹俣直道
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] ADLibシステムとCre-loxPシステムを利用した迅速な抗体設計
  • 著者名/発表者名: 黒澤恒平
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] Exclution of meiotic DNA break sites around Rec8 binding sites
  • 著者名/発表者名: Masaru Ito
  • 学会等名: EMBO Conference on Meiosis
  • 発表場所: Hotel Radisson Blu, Radebeul-Dresden（ドレスデン、ドイツ）
• [学会発表] Reduced histone H3K4 trimetylation associates with meiotic recombination cold spots around cohesin binding sites
  • 著者名/発表者名: 伊藤将
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] 武器甲虫の形態可塑性とエピゲノム
  • 著者名/発表者名: 小澤高嶺
  • 学会等名: 日本進化学会第15回つくば大会
  • 発表場所: 筑波大学（茨城県つくば市）
• [学会発表] Epigenetic regulation of morphological plasticity in the broad-horned flour beetle
  • 著者名/発表者名: Takane Ozawa
  • 学会等名: 2013 ASCB Annual Meeting
  • 発表場所: The New Orleans Ernest N.Morial Convention Center（ニューオリンズ、アメリカ）
• [図書] 生命デザイン学入門 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小川（西秋）葉子、太田邦史
  • 総ページ数: 224
  • 出版者: 岩波ジュニア新書
• [図書] Human Monoclonal Antibodies (2013)
  • 著者名/発表者名: Kohei Kurosawa, Waka Lin,Kunihiro Ohta,Michael Steinitz 他
  • 出版者: Humana Press
• [図書] 進化分子工学―高速分子進化によるタンパク質・核酸の開発― (2013)
  • 著者名/発表者名: 黒澤恒平、橋本講司、瀬尾秀宗、 太田邦史、伏見譲 他
  • 出版者: 株式会社エヌ・ティー・エス
• [図書] エピゲノムと生命 (2013)
  • 著者名/発表者名: 太田 邦史
  • 総ページ数: 230
  • 出版者: 講談社
• [図書] “Chimeric antibodies” In “Human Monoclonal Antibodies: Methods and Protocols” (2013)
  • 著者名/発表者名: 黒澤恒平ら
  • 出版者: Springer
• [備考] 東京大学大学院総合文化研究科太田研究室
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/index.html
• [備考] 太田邦史教授（総合文化研究科広域科学専攻）親から子への遺伝子継承で中心的な役割を果たす遺伝子を発見
  • URL: http://www.c.u-tokyo.ac.jp/info/news/topics/20120727095047.html
• [備考] 太田邦史教授が第10回産学官連携功労者表彰・文部科学大臣賞を受賞
  • URL: http://www.c.u-tokyo.ac.jp/info/news/topics/20121005114516.html
• [備考] 太田邦史教授が平成24年度関東地方発明表彰・発明協会会長奨励賞を受賞
  • URL: http://www.c.u-tokyo.ac.jp/info/news/topics/20121206171324.html
• [備考]
  • URL: http://www.ohta-lab.c.u-tokyo.ac.jp/
• [産業財産権] 空間的な近さの概念を用いた生体分子データの３次元構造の再構成方法 (2016)
  • 発明者名: 平田祥人ら
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2016-023214
  • 出願年月日: 2016-02-10
• [産業財産権] 植物バイオマスの増産方法 (2013)
  • 発明者名: 村本伸彦ら
  • 権利者名: 豊田中央研究所、東京大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2013-049689
  • 出願年月日: 2013-03-12
• [産業財産権] 非誘導体型LPAに対して作製された抗LPA抗体 (2012)
  • 発明者名: 太田邦史ら
  • 権利者名: 東京大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-284612
  • 出願年月日: 2012-12-28
• [産業財産権] タンパク質の迅速改良法 (2012)
  • 発明者名: 黒澤恒平、太田邦史、瀬尾秀宗
  • 権利者名: 東京大学、カイオム・バイオサイエンス
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2012-138293
  • 出願年月日: 2012-06-20