| 研究領域 | 日本列島域における先史人類史の統合生物考古学的研究ー令和の考古学改新ー |
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| 研究課題/領域番号 |
23H04846
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| 研究種目 |
学術変革領域研究(A)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 審査区分 |
学術変革領域研究区分(Ⅰ)
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| 研究機関 | 北海道大学 |
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研究代表者 |
長田 直樹 北海道大学, 情報科学研究院, 准教授 (70416270)
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| 研究分担者 |
佐藤 孝雄 慶應義塾大学, 文学部(三田), 教授 (20269640)
本郷 一美 総合研究大学院大学, 統合進化科学研究センター, 准教授 (20303919)
寺井 洋平 総合研究大学院大学, 統合進化科学研究センター, 准教授 (30432016)
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| 研究期間 (年度) |
2023-04-01 – 2028-03-31
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| 研究課題ステータス |
交付 (2024年度)
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| 配分額 *注記 |
74,360千円 (直接経費: 57,200千円、間接経費: 17,160千円)
2025年度: 15,600千円 (直接経費: 12,000千円、間接経費: 3,600千円)
2024年度: 15,470千円 (直接経費: 11,900千円、間接経費: 3,570千円)
2023年度: 12,480千円 (直接経費: 9,600千円、間接経費: 2,880千円)
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| キーワード | ゲノム / 日本列島 / 古代ゲノム / 家畜化 / 環境適応 / 動物考古学 / 哺乳類 / 進化 / 考古学 |
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| 研究開始時の研究の概要 |
本研究計画では，日本列島における人類と環境とのかかわりを明らかにするために，動物相に注目した研究を行う．以下の3つの動物群を中心的対象とする．①人類が作り出した環境に片利共生するコメンサルアニマルとして重要なネズミ類の遺伝的多様性をゲノム解析により調べ，渡来とその後のヒトの往来に伴う遺伝的交流についての推定を行う．②イヌの古代ゲノム情報から，時代ごとのイヌの形態と形質を復元し，その当時の人類との共生関係を明らかにする．③野生イノシシと家畜化されたブタとの関連を，動物考古学的手法や現代・古代ゲノム解析によって明らかにする．
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| 研究実績の概要 |
本年度は多くの動物を対象としたゲノム解析や古代ゲノム解析を行った．主要な成果を以下にまとめる．
１）世界中から集められたハツカネズミ全ゲノム解析を行い，日本列島および中国南部における亜種ゲノムの混合様式について明らかにした．日本列島においては，これまで北海道・東北にcastaneus亜種，それ以南にmusculus亜種が分布していると考えられてきたが，日本海側の個体がよりcastaneus亜種の遺伝的成分が高いことが示された．その他，日本列島の個体において，免疫にかかわる遺伝子やフェロモンの受容体において，castaneus亜種由来のゲノムが有意に多くなっている領域があることがわかった．これは，南方由来のゲノムが何らかの理由で日本列島において選択を受けて広がったせいだと考えられる．
２）沖縄や東南アジア由来の個体のジャコウネズミ全ゲノム解析を行い，１）沖縄の個体は自然分布ではなく東南アジアから渡来したものである．２）移入は一度ではなく，その後も繰り返し起こってきた．ということを示した．ミトコンドリアゲノムの解析では，最初の渡来時期は約3000年前と推定された．成果は次の論文で発表されました．
３）ニホンオオカミと日本犬の高深度ゲノム解析を通して，1）ニホンオオカミは単系統であり，遺伝的に他のオオカミと異なるグループであること．２）ニホンオオカミはイヌに最も遺伝的に近縁なオオカミであること．3）ユーラシア大陸東側のイヌにはニホンオオカミの祖先がもっていたゲノムが含まれていること．などが明らかになった．これらの結果はイヌの起源が東アジアであることをサポートしている．また，縄文時代の犬のミトコンドリア解析も行なった．
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| 現在までの達成度 (区分) |
現在までの達成度 (区分)
1: 当初の計画以上に進展している
理由
計画の中心として据えている動物種以外の生物種についても着実に成果が出ており，今後様々な成果について論文発表が可能であると期待することができる．
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| 今後の研究の推進方策 |
これまで成果のでたハツカネズミ，ジャコウネズミ，イヌ，オオカミについては，研究を更に進めより詳細な解析によって人とのかかわりを明らかにしていく．これらに加え，ヤマネコ，ラット，イノシシ，ブタなどについても研究を進めて行く．また，公募班と連携し，多くの生物について古代ゲノム解析等を進めていき，領域の発展に貢献する．
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