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核酸の膜透過を誘導するリン酸部修飾の探索と膜モジュレータ分子の機能評価

計画研究

研究領域膜透過学:膜モジュレータ分子が拓く核酸医薬の細胞膜透過の実証と理解
研究課題/領域番号 24H00840
研究種目

学術変革領域研究(B)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
研究機関大阪大学

研究代表者

大澤 昂志  大阪大学, 大学院薬学研究科, 助教 (00783226)

研究分担者 笠原 勇矢  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 創薬デザイン研究センター, 副センター長 (10740673)
研究期間 (年度) 2024-04-01 – 2027-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
64,350千円 (直接経費: 49,500千円、間接経費: 14,850千円)
2025年度: 20,670千円 (直接経費: 15,900千円、間接経費: 4,770千円)
2024年度: 22,880千円 (直接経費: 17,600千円、間接経費: 5,280千円)
キーワード膜モジュレータ / 核酸医薬 / 細胞膜透過 / 人工核酸
研究開始時の研究の概要

各研究班と密に連携して、我々の核酸の化学修飾技術と“細胞膜をゆらす”ことで膜透過を誘導する新概念を融合した核酸医薬を世界に先駆けて創製する。具体的には、B01班 (三木) が開発する膜モジュレータ分子の膜透過誘導能を核酸医薬の薬効を指標に評価し、C01班 (川口)、 D01班 (篠田) と連携して、実験と理論の両面から膜モジュレータ分子の機能、核酸の膜透過現象について理解を深める。また我々独自に、核酸医薬の膜透過能の向上するリン酸部修飾核酸を探索するため、オリゴ核酸中のリン酸部ピンポイント修飾法を開発し、化学構造に基づいて核酸医薬の膜透過能を向上する分子設計理論の構築を目指す。

研究実績の概要

アンチセンス核酸(ASO)に代表される核酸医薬は新しい創薬モダリティとして注目されている一方で、核酸医薬の細胞膜透過率は0.1%程度とも言われ、その実用化を促進するためには核酸に適した薬物送達システム(DDS)の整備が必要不可欠である。そこで本研究では、核酸医薬の膜透過現象の本質を理解し、核酸医薬のDDS基盤技術の確立につながるような概念を提唱、実証することを目的に、“細胞膜をゆらす”ことで膜透過を誘導する膜モジュレータと我々の核酸の修飾技術を融合した核酸医薬を創製する。また、膜透過能を向上するリン酸部修飾核酸を独自に開発し、核酸医薬の構造と膜透過能の相関解明を目指す。
令和6年度はリン酸部にカルボキシメチル基を有するホスホノアセタート(PACE)修飾オリゴ核酸と水溶性の縮合剤DMTMMを用いてオリゴ核酸中のPACEのアミド化検討を行った。種々検討の結果、pH 7.5のEPPS緩衝液中でPACE修飾オリゴ核酸とDMTMM、アミン類を混合することで、PACE部位選択的にアミド化することができた。本反応におけるアミン類の基質一般性は高いことが明らかになった。また、合成したアミド化PACE修飾オリゴ核酸が標的RNAと形成する二重鎖の熱安定性を評価した結果、アミド化PACEは天然のDNAに匹敵するRNA結合親和性を有することが明らかになった。
また、細胞内への導入方法の違いがASOの有効性に与える影響を精査し、新たな膜透過方法の有用性を評価するための基礎データを取得した。また、ASOの物性予測モデルを構築するとともに、ASOの活性に寄与する新たな因子としてRNA切断後の置換速度が重要であることを明らかにした。さらに、核分画技術を応用した選別方法によって、培地に添加するだけで核まで移行するアプタマー(核移行性アプタマー)を開発した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

年度内にPACEをアミド化する方法を確立でき、膜透過性のリン酸部修飾核酸を探索するための基盤を構築することができた。また、アミド化PACE修飾オリゴ核酸の合成から基礎物性評価に至る一連の研究成果については現在、学術論文を準備中である。このように概ね計画通りに研究は進展している。

今後の研究の推進方策

核酸医薬のリン酸部修飾の構造と膜透過性、活性等の相関を明らかにするための共同研究を推進する。核酸医薬の標的は所属研究室でプロトコルが確立されている脂質異常症の治療標的ApoBを想定しており、ApoB mRNAに対する核酸医薬を合成しPACEをアミド化する。先述の通り、核酸医薬の構造・膜透過性の関係を知るため、PACEは核酸医薬中のリン酸部に網羅的に導入する。また、アミド化に用いるアミンは現状、膜を構成するリン脂質と疎水性相互作用する長鎖アルキル基を有するアミン類を想定している。オリゴ核酸の膜透過能は川口と連携して評価、オリゴ核酸の膜透過現象を篠田と連携して解析する。これにより核酸の膜透過様式を理解し、核酸医薬の細胞膜透過能を向上するリン酸部修飾の設計指針を得る。合成した核酸医薬はヒト肝細胞由来細胞Huh-7に処理し、ApoB mRNAの発現量を指標に活性を評価する。
また、細胞内導入方法の違いやASOの物性がASOの有効性に与える影響を引き続き精査することで、新たな膜透過方法の有用性を評価するための基礎データを取得するとともに、開発した核移行性アプタマーのメカニズム解明とDDSキャリアとしての有用性を評価していく予定である。

報告書

(1件)
  • 2024 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて 2025 2024 その他

すべて 雑誌論文 (5件) (うち国際共著 1件、 査読あり 5件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (31件) (うち国際学会 7件、 招待講演 4件) 図書 (4件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] Synthesis and structural analysis of dinucleotides containing 2′,3′-trans-bridged nucleic acids with trans-5,6- or 5,7-fused ring skeleton2025

    • 著者名/発表者名
      Osawa Takashi、Nakanishi Ryota、Uda Keito、Muramoto So、Obika Satoshi
    • 雑誌名

      Communications Chemistry

      巻: 8 号: 1 ページ: 87-87

    • DOI

      10.1038/s42004-025-01486-2

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] DNAコード化ライブラリーへの応用を志向したクマリン–オリゴ核酸コンジュゲートの合成2024

    • 著者名/発表者名
      Osawa Takashi
    • 雑誌名

      薬学雑誌

      巻: 144 号: 10 ページ: 931-936

    • DOI

      10.1248/yakushi.24-00134

    • ISSN
      0031-6903, 1347-5231
    • 年月日
      2024-10-01
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] In vitro screening of chemically synthesized dipeptide-antisense oligonucleotide conjugates to identify ligand molecules enhancing their activity2024

    • 著者名/発表者名
      Osawa Takashi、Kita Ryosuke、Kasahara Yuuya、Yamaguma Harumi、Nakayama Taisuke、Kamada Haruhiko、Obika Satoshi
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      巻: 110 ページ: 117814-117814

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2024.117814

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] THF peroxide as a factor in generating desulphurised products from the solid-phase synthesis of phosphorothioate-modified oligonucleotides2024

    • 著者名/発表者名
      Ren Qin、Osawa Takashi、Tatsuno Michiaki、Obika Satoshi
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 14 号: 30 ページ: 21590-21596

    • DOI

      10.1039/d4ra03592e

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Light-controllable cell-membrane disturbance for intracellular delivery2024

    • 著者名/発表者名
      Huo Wenting、Miki Koji、Mu Huiying、Osawa Takashi、Yamaguma Harumi、Kasahara Yuuya、Obika Satoshi、Kawaguchi Yoshimasa、Hirose Hisaaki、Futaki Shiroh、Miyazaki Yusuke、Shinoda Wataru、Akai Shuji、Ohe Kouichi
    • 雑誌名

      Journal of Materials Chemistry B

      巻: in press 号: 17 ページ: 4138-4147

    • DOI

      10.1039/d3tb02956e

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [学会発表] アンチセンス核酸の活性を向上するジペプチドリガンドの探索を目的としたin vitroスクリーニング2025

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志;喜多良介;山隈晴美;笠原勇矢;小比賀聡
    • 学会等名
      日本薬学会第145年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 医薬応用を志向した機能性人工核酸材料およびリガンドコンジュゲート合成法の開発2025

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志
    • 学会等名
      日本薬学会第145年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 構造的に剛直な2-アダマンチル基の導入により固体化したアミダイト化試薬の開発及びそれを用いたH-ホスホネートの合成2025

    • 著者名/発表者名
      中筋颯也;大澤昂志;小比賀聡
    • 学会等名
      日本薬学会第145年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] RNA分解誘導型アンチセンス核酸開発基盤の構築と難治性疾患への創薬展開2025

    • 著者名/発表者名
      笠原勇矢
    • 学会等名
      日本薬学会第145年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] フィンガードメインにおけるDNAポリメラーゼの変異が修飾ヌクレオチドの取り組みに及ぼす効果2025

    • 著者名/発表者名
      田澤駿、片岡由佳、星野秀和、石田健太、笠原勇矢、小比賀聡、桒原正靖
    • 学会等名
      日本化学会 第105春季年会(2025)
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] KOD DNAポリメラーゼ変異体による5′位アルキル修飾チミジン誘導体を含むオリゴ核酸の酵素合成2025

    • 著者名/発表者名
      石田健太、星野秀和、山口卓男、小比賀聡、笠原勇矢
    • 学会等名
      日本化学会 第105春季年会(2025)
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] マンノシルエリスリトールリピッド含有LNPの合成と核酸導入活性2025

    • 著者名/発表者名
      伊波美鈴、安齋樹、渡辺登喜子、阿曽古都美、笠原勇矢、戸嶋一敦、高橋大介
    • 学会等名
      日本化学会 第105春季年会(2025)
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 宿主因子標的型アンチセンス核酸による新規抗インフルエンザ薬の開発2025

    • 著者名/発表者名
      下岡誠、桐野友美、山隈晴美、宮崎日菜、安齋樹、七戸新太郎、小比賀聡、笠原勇矢、渡辺登喜子
    • 学会等名
      日本薬学会第145年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] トランス5-6または5-7縮環骨格を有する2′,3′-架橋型核酸の合成2024

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志;中西亮太;小比賀聡
    • 学会等名
      第50回反応と合成の進歩シンポジウム
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] DNAコード化ライブラリーへの応用を志向したクマリン-オリゴ核酸コンジュゲートの合成2024

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志
    • 学会等名
      第74回日本薬学会関西支部総会・大会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Development of simple purification method of chemically synthesized oligonucleotides using highly lipophilic phosphoramidites as capping reagents2024

    • 著者名/発表者名
      Qin Ren;Takashi Osawa;Michiaki Tatsuno;Satoshi Obika
    • 学会等名
      IRT2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Synthesis of peptide oligonucleotide conjugates based on the condensation of a lysine side-chain and a thioester2024

    • 著者名/発表者名
      So Muramoto;Takashi Osawa;Satoshi Obika
    • 学会等名
      IRT2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Synthesis of oligonucleotides containing an S-methyl thioimidate-bridged nucleic acid (Me-TIBNA) that control their ability to form duplexes in response to pH and complementary strand2024

    • 著者名/発表者名
      Takashi Osawa;Kosuke Miyata;Sayoko Ito;Keito Uda;Satoshi Obika
    • 学会等名
      IRT2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] オリゴ核酸の固相合成プロセスにおける亜リン酸トリエステルのTHF過酸化物による酸化2024

    • 著者名/発表者名
      仁 欽;大澤昂志;辰野道昭;小比賀聡
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 1-オキサスピロ[4.5]デカン構造を有する2′-O-メチル-5-メチルウリジンおよび2′-デオキシ-2′-フルオロウリジン誘導体の合成と物性評価2024

    • 著者名/発表者名
      伊藤瑳謡子;矢野夏実;大澤昂志;小比賀聡
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] オリゴ核酸への導入効率向上を目指した架橋型人工核酸ENAアミダイトの合成2024

    • 著者名/発表者名
      村口清輝;大澤 昂志;市川 彩夏;仁 欽;小比賀 聡
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] Ugi反応を基盤とした化学修飾ジペプチド-アンチセンス核酸コンジュゲートライブラリーの合成とin vitro活性評価2024

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志;喜多良介;山隈晴美;笠原勇矢;小比賀聡
    • 学会等名
      オリゴ核酸への導入効率向上を目指した架橋型人工核酸ENAアミダイトの合成
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] Masataka Kuroda, Yuuya Kasahara, Masako Hirose, Harumi Yamaguma, Masayuki Oda, Chioko Nagao and Kenji Mizuguchi、A Tm-value prediction system and molecular dynamics analysis of AmNA-containing gapmer antisense oligonucleotides2024

    • 著者名/発表者名
      Masataka Kuroda, Yuuya Kasahara, Masako Hirose, Harumi Yamaguma, Masayuki Oda, Chioko Nagao and Kenji Mizuguchi
    • 学会等名
      Brazilian Symposium on Bioinformatics 2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 人工核酸アンチセンスオリゴDNAを用いたがん細胞選択的なシスプラチン増感剤としてのMCM8阻害剤の創出2024

    • 著者名/発表者名
      内堀友紀、末國雅貴、小梶優子、吉田和真、笠原勇矢、藤田雅俊
    • 学会等名
      第47回 日本分子生物学会年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] Tm-Value Prediction Model Construction of AmNA-Containing Gapmer Antisense Oligonucleotide2024

    • 著者名/発表者名
      Masataka Kuroda, Yuuya Kasahara, Masako Hirose, Harumi Yamaguma, Masayuki Oda, Chioko Nagao and Kenji Mizuguchi
    • 学会等名
      Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference 2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Development of the polymerase mutants towards screening of functional oligonucleotides using bridged nucleic acids containing an amide bond or a guanidino group2024

    • 著者名/発表者名
      Hidekazu Hoshino, Yuuya Kasahara, Satoshi Obika
    • 学会等名
      20th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society (OTS) 2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] A novel selection method generating nuclear localization aptamers2024

    • 著者名/発表者名
      Kaito Nitatouge, Kenta Ishida, Hidekazu Hoshino, Yuuya Kasahara, Satoshi Obika
    • 学会等名
      20th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society (OTS) 2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 高活性かつ低毒性なRNA分解誘導型アンチセンス核酸を迅速・高確度に創出可能な配列設計技術の開発2024

    • 著者名/発表者名
      笠原勇矢、山隈晴美、亀岡なつ実、小比賀聡
    • 学会等名
      第74回 日本薬学会関西支部総会・大会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 悪性脳腫瘍における発癌性因子RESTに対するギャップマー型アンチセンス核酸の開発2024

    • 著者名/発表者名
      爲則裕介、笠原勇矢、下條正仁、小比賀聡
    • 学会等名
      第83回 日本癌学会学術総会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 塩基修飾におけるリンカーアーム構造がDNAポリメラーゼ反応の効率に及ぼす影響2024

    • 著者名/発表者名
      片岡由佳、永谷恵梨佳、星野秀和、笠原勇矢、小比賀聡、桒原正靖
    • 学会等名
      第18回バイオ関連化学シンポジウム
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 胃癌腹膜播種治療に向けたSYT13標的アンチセンス核酸の非臨床安全性試験2024

    • 著者名/発表者名
      笠原勇矢、神田光郎、清水大、小比賀聡
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会 第9回年会 若手シンポジウム
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Gapmer型アンチセンス核酸のLNA導入パターンが標的RNAとの結合速度およびターンオーバーステップにおける標的RNA置換速度に与える影響2024

    • 著者名/発表者名
      尾田ちひろ、笠原勇矢、小比賀聡
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] ンチセンス核酸の核への送達を志向した核移行性アプタマーの開発2024

    • 著者名/発表者名
      仁田峠海斗、石田健太、星野秀和、宮本洋一、小比賀聡、笠原勇矢
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] アミド結合あるいはグアニジノ基を架橋部位に有する糖部架橋型人工核酸を伸長可能な改変ポリメラーゼの開発と性能評価2024

    • 著者名/発表者名
      星野秀和、小比賀聡、笠原勇矢
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 新規TRPC3/C6(Transient Receptor Potential C3/C6)チャネル選択的活性化剤L687によるアンチセンス核酸の細胞内取り込み亢進2024

    • 著者名/発表者名
      永田龍、小橋博人、為則裕介、尼谷明日路、植田誉志文、森泰生、笠原勇矢、小比賀聡、下條正仁
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [学会発表] 胃癌腹膜播種治療に向けたSYT13標的アンチセンス核酸の非臨床安全性試験2024

    • 著者名/発表者名
      笠原勇矢、神田光郎、清水大、小比賀聡
    • 学会等名
      日本核酸医薬学会第9回年会
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [図書] Sustainability in Tides Chemistry: Green Approaches to Oligonucleotides and Oligopeptides Synthesis2024

    • 著者名/発表者名
      T. Osawa, S. Obika.
    • 総ページ数
      406
    • 出版者
      The Royal Society of Chemistry
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [図書] The Lipid2024

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志, 小比賀聡
    • 総ページ数
      98
    • 出版者
      メディカルレビュー
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [図書] 核酸医薬:モダリティ・合成・分析・DDSの最新動向2024

    • 著者名/発表者名
      大澤昂志
    • 総ページ数
      324
    • 出版者
      NTS
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [図書] 医薬品モダリティにおける創薬技術開発と展望2024

    • 著者名/発表者名
      笠原勇矢
    • 総ページ数
      286
    • 出版者
      情報機構
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [備考] 膜透過学ホームページ

    • URL

      https://membrane-modulator.org

    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
  • [産業財産権] 化合物、細胞膜透過促進剤及び化合物の細胞膜内部への導入方法2024

    • 発明者名
      三木康嗣,他13名
    • 権利者名
      三木康嗣,他13名
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2024
    • 関連する報告書
      2024 実績報告書
    • 外国

URL: 

公開日: 2024-04-05   更新日: 2025-12-26  

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