機能を生み出す単位生体分子集団（機能モジュール）の動的秩序の探査

• 研究領域: 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
• 研究課題/領域番号: 25102003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 理工系
• 研究機関: 奈良先端科学技術大学院大学
• 研究代表者: 上久保 裕生 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (20311128)
• 研究分担者: 片岡 幹雄 一般財団法人総合科学研究機構(総合科学研究センター(総合科学研究室)及び中性子科学センター(研究開発, 中性子科学センター, サイエンスコーディネーター (30150254)
• 研究期間 (年度): 2013-06-28 – 2018-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2018年度)
• 配分額: 92,430千円 (直接経費: 71,100千円、間接経費: 21,330千円); 2017年度: 13,260千円 (直接経費: 10,200千円、間接経費: 3,060千円); 2016年度: 14,170千円 (直接経費: 10,900千円、間接経費: 3,270千円); 2015年度: 15,990千円 (直接経費: 12,300千円、間接経費: 3,690千円); 2014年度: 19,890千円 (直接経費: 15,300千円、間接経費: 4,590千円); 2013年度: 29,120千円 (直接経費: 22,400千円、間接経費: 6,720千円)
• キーワード: X線溶液散乱 / タンパク質 / 分子複合系 / 多成分平衡状態 / 相互作用解析 / μ流路 / 光センサータンパク質 / 情報伝達 / 蛋白質 / マイクロ流路 / 生物物理学 / 構造生物学 / 動的秩序 / マルチドメイン蛋白質 / 蛋白質集団

研究成果の概要

本研究では、タンパク質分子集団が示す動的秩序を解析するために新たな手法の開発を行った。我々は、X線溶液散乱測定法を用い、構成要素の濃度に変調を加え、タンパク質集団の平衡状態を冗長に測定することによって、多成分系であっても個々の複合体構造や相互作用を定量的に解析できることを見いだした。このような解析を実現するために、マイクロ流路技術を用いた極微量試料自動溶液散乱測定システムを開発し、多成分系を対象とした動的秩序の探査を実現した。さらに、本手法の有効性を実証するために、実在するタンパク質集団、特に、光センサータンパク質が関与する情報伝達系の動的秩序を明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

以上の研究を通じ、当初目的としていた多成分混合溶液の動的秩序を解析する新しい手法を提案することに成功した。更に、Native-MSや高速AFM等の測定手法を統合的に活用することによって、複雑な系であっても定量的な解析が可能であることを示すことができた。ここで示した統合解析は、タンパク質に一般的な性質、すなわち、分子量、分子形状、分子形状変化を指標としており対象を選ばない。今後は、より生理学的、薬理学的に重要度が高いタンパク質集団の動的秩序を解析し、生理活性や薬理活性の機序を分子論に明らかにすることで新たな作用機序に基づいた創薬の実現を目指す。

研究成果

• [国際共同研究] UC Davis(米国)
• [国際共同研究] Aarhus University(Denmark)
• [国際共同研究] University of Groningen(オランダ)
• [国際共同研究] Aarhus university(Denmark)
• [雑誌論文] Solution scattering approaches to dynamical ordering in biomolecular systems (2018)
  • 著者名/発表者名: Bernad? Pau、Shimizu Nobutaka、Zaccai Giuseppe、Kamikubo Hironari、Sugiyama Masaaki
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects 巻: 1862 号: 2 ページ: 253-274
  • DOI: 10.1016/j.bbagen.2017.10.015
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] 連続滴定X線溶液散乱測定を志向した<i>μ</i>流路型自動サンプリングシステムの開発 (2018)
  • 著者名/発表者名: KAMIKUBO Hironari
  • 雑誌名: Journal of Computer Chemistry, Japan 巻: 17 号: 1 ページ: 57-64
  • DOI: 10.2477/jccj.2018-0008
  • NAID: 130006555814
  • ISSN: 1347-1767, 1347-3824
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Active-Site pKa Determination for Photoactive Yellow Protein Rationalizes Slow Ground-State Recovery (2017)
  • 著者名/発表者名: Oktaviani Nur Alia、Pool Trijntje J.、Yoshimura Yuichi、Kamikubo Hironari、Scheek Ruud M.、Kataoka Mikio、Mulder Frans A.A.
  • 雑誌名: Biophysical Journal 巻: 112 号: 10 ページ: 2109-2116
  • DOI: 10.1016/j.bpj.2017.04.008
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Aggregation Control by Multi-stimuli-Responsive Poly(N-vinylamide) Derivatives in Aqueous System (2017)
  • 著者名/発表者名: Kawatani Ryo、Nishiyama Yasuhiro、Kamikubo Hironari、Kakiuchi Kiyomi、Ajiro Hiroharu
  • 雑誌名: Nanoscale Research Letters 巻: 12 号: 1 ページ: 461-461
  • DOI: 10.1186/s11671-017-2221-7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Heat-induced native dimerization prevents amyloid formation by variable domain from immunoglobulin light-chain REI (2017)
  • 著者名/発表者名: Nawata Marina、Tsutsumi Hirotaka、Kobayashi Yuta、Unzai Satoru、Mine Shouhei、Nakamura Tsutomu、Uegaki Koichi、Kamikubo Hironari、Kataoka Mikio、Hamada Daizo
  • 雑誌名: The FEBS Journal 巻: 284 号: 18 ページ: 3114-3127
  • DOI: 10.1111/febs.14181
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Neutron crystallography of photoactive yellow protein reveals unusual protonation state of Arg52 in the crystal (2017)
  • 著者名/発表者名: Yonezawa Kento、Shimizu Nobutaka、Kurihara Kazuo、Yamazaki Yoichi、Kamikubo Hironari、Kataoka Mikio
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 7 号: 1 ページ: 9361-9361
  • DOI: 10.1038/s41598-017-09718-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Visualisation of a flexible modular structure of the ER folding-sensor enzyme UGGT (2017)
  • 著者名/発表者名: Satoh Tadashi、Song Chihong、Zhu Tong、Toshimori Takayasu、Murata Kazuyoshi、Hayashi Yugo、Kamikubo Hironari、Uchihashi Takayuki、Kato Koichi
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 7 号: 1 ページ: 12142-12142
  • DOI: 10.1038/s41598-017-12283-w
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Statistical description of the denatured structure of a single protein, staphylococcal nuclease, by FRET analysis (2017)
  • 著者名/発表者名: Yamaguchi Mariko、Ohta Emi、Muto Takuya、Watanabe Takayoshi、Hohsaka Takahiro、Yamazaki Yoichi、Kamikubo Hironari、Kataoka Mikio
  • 雑誌名: Biophys Rev. 巻: 10(2) 号: 2 ページ: 145-152
  • DOI: 10.1007/s12551-017-0334-y
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Probing the early stages of photoreception in photoactive yellow protein with ultrafast time-domain Raman spectroscopy (2017)
  • 著者名/発表者名: H. Kuramochi , S. Takeuchi ,K. Yonezawa , H. Kamikubo , M. Kataoka, T.Tahara
  • 雑誌名: Nature Chemistry 巻: - 号: 7 ページ: 660-666
  • DOI: 10.1038/nchem.2717
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] VIPP1 has a disordered C-terminal tail necessary for protecting photosynthetic membranes against stress in Arabidopsis (2016)
  • 著者名/発表者名: L. Zhang, H. Kondo, H. Kamikubo, M. Kataoka, W. Sakamoto
  • 雑誌名: Plant Physiology 巻: 171 号: 3 ページ: 1983-1995
  • DOI: 10.1104/pp.16.00532
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Unambiguous Determination of the Ionization State of a Photoactive Protein Active Site Arginine in Solution by NMR Spectroscopy (2016)
  • 著者名/発表者名: Y. Yoshimura, N. A.Oktaviani, K.Yonezawa, H.Kamikubo, F. A. A. Mulder
  • 雑誌名: Angewandte Chemie 巻: 56 号: 1 ページ: 239-242
  • DOI: 10.1002/anie.201609605
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Polyglycine acts as a rejection signal for protein transport at the chloroplast envelope (2016)
  • 著者名/発表者名: J. K. Endow, A. G. Rocha , A. J. Baldwin , R. L. Roston , T. Yamaguchi, H. Kamikubo, K. Inoue
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 11(12) 号: 12 ページ: e0167802-e0167802
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0167802
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Vibrational analysis on the revised potential energy curve of the low-barrier hydrogen bond in photoactive yellow protein (2015)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Kanematsu, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Masanori Tachikawa
  • 雑誌名: Computational and Structural Biotechnology Journal 巻: 14 ページ: 16-19
  • DOI: 10.1016/j.csbj.2015.10.003
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Domain-swapped dimer of Pseudomonas aeruginosa cytochrome c551: Structural insights into domain swapping of cytochrome c family proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Nagao, Mariko Ueda, Hisao Osuka, Hirofumi Komori, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10 号: 4 ページ: e0123653-e0123653
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0123653
  • NAID: 120005716860
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Decreased amyloidogenicity by mutational modulation of surface properties of the immunoglobulin light chain BRE variable domain (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuta Kobayashi, Hirotaka Tsutsumi, Tetsuyuki Abe, Kyohei Ikeda, Yuki Tashiro, Satoru Unzai, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Hidekazu Hiroaki, Daizo Hamada
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 53(31) 号: 31 ページ: 5162-5173
  • DOI: 10.1021/bi5007892
  • 査読あり
• [雑誌論文] Formation of Domain-Swapped Oligomer of Cytochrome c from Its Molten Globule State Oligomer (2014)
  • 著者名/発表者名: Megha Deshpande, Partha Parui, Hironari Kamikubo, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Mikio Kataoka, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 53(28) 号: 28 ページ: 4696-4703
  • DOI: 10.1021/bi500497s
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preferential domain orientation of HMGB2 determined by the weak intramolecular interactions mediated by the interdomain linker (2013)
  • 著者名/発表者名: J. Uewaki, H. Kamikubo, J. Kurita, N. Hiroguchi, H. Moriuchi, M. Yoshida, M. Kataoka, N. U.-Tate, S. Tate
  • 雑誌名: Chem.Phys 巻: 419 ページ: 212
  • DOI: 10.1016/j.chemphys.2013.02.004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Fingerprint signatures of lanthanide circularly polarized luminescence from proteins covalently labeled by a β -diketonate europium(III) chelate (2013)
  • 著者名/発表者名: Junpei Yuasa
  • 雑誌名: Chem. Commn. 巻: 49 号: 41 ページ: 4604-4606
  • DOI: 10.1039/c3cc40331a
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular dissection of IZUMO1, a sperm protein essential for sperm-egg fusion (2013)
  • 著者名/発表者名: Inoue N, Hamada D, Kamikubo H, Hirata K, Kataoka M, Yamamoto M, Ikawa M, Okabe M, Hagihara Y
  • 雑誌名: Development 巻: 140(15) 号: 15 ページ: 3221-3229
  • DOI: 10.1242/dev.094854
  • NAID: 120006957398
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Basis of α-Catenin Recognition by EspB from Enterohaemorrhagic E. coli Based on Hybrid Strategy Using Low-Resolution Structural and Protein Dissection (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsuhide Hamaguchi
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8 号: 8 ページ: 71618-71618
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0071618
  • 査読あり
• [雑誌論文] Excited-State Proton Transfer in Fluorescent Photoactive Yellow Protein Containing 7-Hydroxycoumarin (2013)
  • 著者名/発表者名: Dian Novitasari
  • 雑誌名: Advanced Materials Reserch 巻: 896 ページ: 85-88
  • 査読あり
• [雑誌論文] Theoretical analysis of the geometrical isotope effect on the hydrogen bonds in photoactive yellow protein with multi-component density functional theory (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Kita, H. Kamikubo, M. Kataoka, M. Tachikawa
  • 雑誌名: Chem. Phys 巻: 419 ページ: 50-53
  • DOI: 10.1016/j.chemphys.2012.11.022
  • 査読あり
• [学会発表] Structural Exploring Multi-component Equilibrium in Biological Systems by using Continuous Titration SAXS (2018)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 国際学会
• [学会発表] Multiple phosphorylation and structural alteration of shootin1 (2018)
  • 著者名/発表者名: Shoki Nakata , Kentarou Baba, Yugo Hayashi,Yoichi Yamazaki, Naoyuki Inagaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 国際学会
• [学会発表] Structure and interaction analysis of the complex molecular systems (GGA/Arf/MPR/Ub) involved in Clathrin-coated vesicles (2018)
  • 著者名/発表者名: Endo Natsumi, Yugo Hayashi, Miho Shinohara, Keito Yoshida, Yoichi Yamazaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 国際学会
• [学会発表] 光による蛋白質分子複合系の自由エネルギーランドスケープの変調 (2018)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 日本化学会 第98回春季年会（2018）
  • 招待講演
• [学会発表] Multi-component equilibrium in biological systems explored by using continuous titration SAXS (2017)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: Frontier Bioorganization Forum 2017 Dynamical ordering and integrated functions of biomolecular systems
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査 (2017)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 平成29年度新学術領域研究「動的秩序と機能」全体班会議
• [学会発表] Structure-based analysis on the equilibrium state of a multi-component system (2017)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生, 山崎 洋一
  • 学会等名: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Photoproducts of PYP Phytochrome Related (Ppr) protein accumulated under various illumination conditions (2017)
  • 著者名/発表者名: Jia-Siang Sum、山崎 洋一 、林 有吾、上久保 裕生
  • 学会等名: 第17回日本蛋白質科学会年会
• [学会発表] Structural Exploring Multi-component Equilibrium in Biological Systems (2017)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: the 24th Congress & General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Light dependent multiple complex formation of Rc-PYP (2017)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Yamazaki, Yohei Shibata, Yugo Hayashi, Nathumi Endo, Kentaro Ishii, Susumu Uchiyama, Takayuki Uchihashi, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Self-assembly of nanofibers from spider silk fibroin (2017)
  • 著者名/発表者名: Yugo Hayashi, Tomoaki Murakami, Mai Arakawa, Keito Yoshida, Yoichi Yamazaki, Takehiro K. Sato, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Structure elements are closely related to intramolecular residue-residue contacts (2017)
  • 著者名/発表者名: Yasumichi Takase, Yugo Hayashi, Yoichi Yamazaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Influence of the PYP domain on Photoreaction of the phytochrome domain in Ppr (2017)
  • 著者名/発表者名: Jia Siang Sum, Yoichi Yamazaki, Yugo Hayashi, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Multiple phosphorylated species of shootin1 and their solution structure (2017)
  • 著者名/発表者名: Shoki Nakata, Kentarou Baba, Yugo Hayashi, Yoichi Yamazaki, Naoyuki Inagaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第55回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 複数混合溶液中に存在する生体高分子の構造・相互作用評価 (2017)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 分子・物質合成プラットフォーム、大学連携研究設備ネットワーク主催 「ソフトでウェットな素材のやさしい観察」
  • 招待講演
• [学会発表] 連続滴定溶液散乱測定による蛋白質分子複合系の多成分平衡状態の解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 第40回溶液化学シンポジウム
  • 招待講演
• [学会発表] 混合溶液中の蛋白質分子複合系の構造・相互作用評価～デバイス開発とその応用～ (2017)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 日本学術振興会 構造生物第169委員会 第54回研究会
  • 招待講演
• [学会発表] イエロープロテインの中性子結晶構造解析 (2017)
  • 著者名/発表者名: 片岡幹雄、米澤健人、清水伸隆、栗原和夫、上久保裕生
  • 学会等名: 日本中性子科学会 第17回年会
• [学会発表] 連続滴定溶液散乱による多成分系解析の標準化 (2017)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 第4回タンパク質X線溶液散乱講習会
  • 招待講演
• [学会発表] 蛋白質溶液散乱を用いた多成分平衡状態の構造/相互作用解析の試み (2016)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: PF研究会「徹底討論！小角散乱の魅力～基礎・応用・産業利用」
  • 発表場所: 高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所( 茨城県つくば市)
  • 年月日: 2016-03-30
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin (2016)
  • 著者名/発表者名: Chiaki Ota, Hiroko Tanaka, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The Biophycial Society 60th Annual Meeting
  • 発表場所: Los Angeles, USA
  • 年月日: 2016-03-01
  • 国際学会
• [学会発表] Development of auto-sampling system designed for titration-saxs to investigate protein complexes under an equilibrium condition (2016)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo, Keito Yoshida, Nobutaka Shimizu, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: The Biophycial Society 60th Annual Meeting
  • 発表場所: Los Angeles, USA
  • 年月日: 2016-02-28
  • 国際学会
• [学会発表] 機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査 (2016)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 平成28年度新学術領域研究「動的秩序と機能」全体班会議
• [学会発表] システムズバイオロジーを指向した構造生物学的手法の開発 (2016)
  • 著者名/発表者名: 上久保 裕生
  • 学会等名: 平成28年度第1回生物構造学研究会
  • 招待講演
• [学会発表] Dynamical characterization of a denaturant denatured state by using the lifetime measurement of Trp-triplet state (2016)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 9th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Rhodobacter capsulatus PYP の複合体形成に伴う構造変化 Complex induced structural changes of Rhodobacter capsulatus Photoactive Yellow Protein (2016)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Yamazaki, Yohei Shibata, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Rc-PYP の光依存的に形成する複数種の複合体解析 Analysis of light dependent multiple complex formation of Rc-PYP (2016)
  • 著者名/発表者名: Yohei Shibata, Yoichi Yamazaki, Keito Yoshida, Shoki Nakata, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会年会
• [学会発表] キメラカルシトニンによるヒトカルシトニンアミロイド凝集阻害機構の解明 Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin by chimera calcitonin (2016)
  • 著者名/発表者名: Chiaki Ota, Hiroko Tanaka, Tomoyasu Aizawa, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会年会
• [学会発表] 滴定X 線溶液散乱測定を用いたアダプター蛋白質GGA-ユビキチン相互作用の解析 An analysis of the interaction of GGA with ubiquitin by using titration SAXS measurement (2016)
  • 著者名/発表者名: Yugo Hayashi, Miho Shinohara, Keito Yoshida, Yoichi Yamazaki, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会年会
• [学会発表] X 線小角散乱法を用いた神経軸索伸長系関連蛋白質shootin1 の動的な構造変化の解析 Structural alteration of shootin1 upon phosphorylation revealed by using small angle x-ray scattering (2016)
  • 著者名/発表者名: Shoki Nakata, Keito Yoshida, Kentarou Baba, Yohei Shibata, Yoichi Yamazaki, Naoyuki Inagaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第54回日本生物物理学会年会
• [学会発表] Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module (2016)
  • 著者名/発表者名: Yohei Shibata, Yoichi Yamazaki, Keito Yoshida, Shoki Nakata, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 5th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 国際学会
• [学会発表] Structural change of shootin1 upon phosphorylation revealed by using small angle x-ray scattering (2016)
  • 著者名/発表者名: Shoki Nakata, Yugo Hayashi, Kentarou Baba, Keito Yoshida, Yohei Shibata, Yoichi Yamazaki, Naoyuki Inagaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 5th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin by chimera calcitonin (2016)
  • 著者名/発表者名: Chiaki Ota, Yasumichi Yakase, Kentaro Ishii, Tomoyasu Aizawa, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka, Susumu Uchiyama, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 5th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 国際学会
• [学会発表] An analysis of the interaction of gga with ubiquitin by using titration saxs measurement (2016)
  • 著者名/発表者名: Endo Natsumi, Yugo Hayashi, Miho Shinohara, Keito Yoshida, Yoichi Yamazaki, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 5th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
• [学会発表] Structural Exploring Multi-component Equilibrium in Biological Systems by using Continuous Titration SAXS (2016)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第78回岡崎コンファレンス Grand Challenges in Small-angle Scattering
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Mechanism of amyloid formation of human calcitonin (2015)
  • 著者名/発表者名: Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
  • 発表場所: Honolulu, USA
  • 年月日: 2015-12-18
  • 国際学会
• [学会発表] Picosecond photobiology: Watching a signaling protein function in real time via 150-picosecond time-resolved X-ray diffraction and solution scattering (2015)
  • 著者名/発表者名: Philip Anfinrud, Friedrich Schotte, Hyun Sun Cho, John Kyndt, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
  • 発表場所: Honolulu, USA
  • 年月日: 2015-12-15
  • 国際学会
• [学会発表] Femtosecond time-resolved impulsive stimulated Raman study of the primary process of photoactive yellow protein (2015)
  • 著者名/発表者名: Hikaru Kuramochi, Satoshi Takeuchi, Kento Yonezawa, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Tahei Tahara
  • 学会等名: The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
  • 発表場所: Honolulu, USA
  • 年月日: 2015-12-15
  • 国際学会
• [学会発表] Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module (2015)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 4rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 西新プラザ（福岡県福岡市)
  • 年月日: 2015-11-22
  • 国際学会
• [学会発表] Structural investigation of direct interaction between Shootin1 and cortactin by the titration SAXS measurements (2015)
  • 著者名/発表者名: J. Makino, K. Yoshida, Y. Kubo, K. Baba, Y. Yamazaki, N. Inagaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  • 学会等名: The 4rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 西新プラザ（福岡県福岡市)
  • 年月日: 2015-11-22
  • 国際学会
• [学会発表] Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin (2015)
  • 著者名/発表者名: C. Ota, H. Tanaka, T. Aizawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka, H. Kamikubo
  • 学会等名: The 4rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 西新プラザ（福岡県福岡市)
  • 年月日: 2015-11-22
  • 国際学会
• [学会発表] BioSAX論文投稿規定に関して (2015)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第3回タンパク質X線溶液散乱講習会
  • 発表場所: 高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所（茨城県つくば市)
  • 年月日: 2015-11-19
  • 招待講演
• [学会発表] 水-蛋白質界面の電荷状態と蛋白質内部で生じる化学反応 (2015)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第64回高分子討論会
  • 発表場所: 東北大学川内キャンパス（宮城県仙台市)
  • 年月日: 2015-09-16
  • 招待講演
• [学会発表] Effects of chromophores of PYP - Phytochrome Related Protein on the structure (2015)
  • 著者名/発表者名: Keito Yoshida, Kento Yonezawa, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-15
• [学会発表] Interaction/Structure analysis of GGA-Ubiquitin complex by using titration SAXS Measurement (2015)
  • 著者名/発表者名: Miho Shinohara, Hironari Kamikubo, Keito Yoshida, Yoichi Yamazaki, Kazuhisa Nakayama, Soichi Wakatsuki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-15
• [学会発表] Structural characterization of a denaturant denatured state (2015)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-14
• [学会発表] Analysis of interaction sites on &beta;-scaffold region of Rhodobacter capsulatus Photoactive Yellow Protein (2015)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Yamazaki, Atsuhiro Kawamura, Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-14
• [学会発表] Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein (2015)
  • 著者名/発表者名: Kento Yonezawa, Hironari Kamikubo, Yusuke Kanematsu, Yoichi Yamazaki, Masanori Tachikawa, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-14
• [学会発表] Intramolecular interaction as a determination factor for structure elements of proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: Yuji Konno, Takeshi Inagaki, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-14
• [学会発表] Structural investigation of direct interaction between Shootin1 and cortactin by the titration SAXS measurements (2015)
  • 著者名/発表者名: Junko Makino, Hironari Kamikubo, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka, Keito Yoshida, Naoyuki Inagaki, Yusuke Kubo, Kentarou Baba
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-13
• [学会発表] The role of N-terminal region of PYP binding protein at the formation of complex with Rc-PYP (2015)
  • 著者名/発表者名: Tomoyuki Yasumuro, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka, Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市)
  • 年月日: 2015-09-13
• [学会発表] 滴定溶液散乱測定用自動サンプリングシステムの開発と応用 Development of auto-sampling system designed for titration-SAXS and its applications. (2015)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生、岡部龍二、吉田佳人、山崎洋一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市)
  • 年月日: 2015-06-24
• [学会発表] Designing an Artificial Protein by Using a Kind of Building Blocks Responsible for Structure and Function (2015)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: IMS Asian International Symposium
  • 発表場所: 分子科学研究所（愛知県岡崎市)
  • 年月日: 2015-06-12
  • 招待講演
• [学会発表] X線溶液散乱測定用AUTO-SAMPLING装置の開発と応用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第3回物構研サイエンスフェスタ
  • 発表場所: つくば国際会議場(茨城県つくば市)
  • 年月日: 2015-03-17 – 2015-03-18
• [学会発表] Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kamikubo, M.Kataoka
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 合歓の郷(三重県志摩市)
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-11
• [学会発表] Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Ptotein (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 合歓の郷(三重県志摩市)
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-11
• [学会発表] Relationship of the photoreactions of two sensor domains in PYP-Phytochrome Related Protein (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Keito, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 合歓の郷(三重県志摩市)
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-11
• [学会発表] Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Tanaka, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 合歓の郷(三重県志摩市)
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-11
• [学会発表] The elucidation of the relationship between b4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs (2015)
  • 著者名/発表者名: A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 合歓の郷(三重県志摩市)
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-11
• [学会発表] Characterization of the denatured structure of staphylococcal nuclease by tryptophan triplet state lifetime measurements (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Aoyagi, M. Yamaguchi, H. Kamikubo, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  • 学会等名: The 3rd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: 合歓の郷(三重県志摩市)
  • 年月日: 2015-01-10 – 2015-01-11
• [学会発表] 溶液散乱の出版ガイドラインについて (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 分子システム研究における溶液散乱
  • 発表場所: 分子科学研究所(愛知県岡崎市)
  • 年月日: 2014-12-20
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular actions in the light sensor protein, Photoactive Yellow Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Kamikubo
  • 学会等名: The 7th Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations
  • 発表場所: Seoul (Korea)
  • 年月日: 2014-11-26 – 2014-11-28
  • 招待講演
• [学会発表] Analysis for different property of light induced structural changes between two PYPs (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Yamazaki, Y. Matsumoto, H. Kamikubo, M. Kataoka
  • 学会等名: 16th International Conference on Retinal Proteins
  • 発表場所: 長浜ロイヤルホテル（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-10-05 – 2014-10-10
• [学会発表] Structural change in Arginine 52 of photoactive yellow protein during the photoreaction (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Yonezawa, H. Kamikubo, K. Yoshida, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  • 学会等名: 16th International Conference on Retinal Proteins
  • 発表場所: 長浜ロイヤルホテル（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-10-05 – 2014-10-10
• [学会発表] Light-induced structural change of PYP-phytochrome related protein (2014)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, H. Kamikubo, K. Yonezawa, Y. Yamazaki, M. Kataoka
  • 学会等名: 16th International Conference on Retinal Proteins
  • 発表場所: 長浜ロイヤルホテル（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-10-05 – 2014-10-10
• [学会発表] The elucidation of the relationship between β4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs (2014)
  • 著者名/発表者名: A. Kawamura, Y. Yamazaki, H. Kamikubo, M. Kataoka
  • 学会等名: 16th International Conference on Retinal Proteins
  • 発表場所: 長浜ロイヤルホテル（滋賀県長浜市）
  • 年月日: 2014-10-05 – 2014-10-10
• [学会発表] 機能性を生み出す複雑系分子システムの動作機構と構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第270回 光ナノサイエンス特別講義
  • 発表場所: 奈良先端科学技術大学院大学（奈良県生駒市）
  • 年月日: 2014-10-01
• [学会発表] Photoactive Yellow Proteinにおけるアルギニン52のプロトン化状態 (2014)
  • 著者名/発表者名: 米澤健人, 上久保裕生, 吉田桂人, 山崎洋一, 片岡幹雄
  • 学会等名: 第1回「動的秩序と機能」若手研究会
  • 発表場所: ラフォーレ蔵王(宮城県刈田郡蔵王町）
  • 年月日: 2014-09-28 – 2014-09-30
• [学会発表] トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの変性構造の評価 (2014)
  • 著者名/発表者名: 青柳貞利, 山口真理子, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄
  • 学会等名: 第1回「動的秩序と機能」若手研究会
  • 発表場所: ラフォーレ蔵王(宮城県刈田郡蔵王町）
  • 年月日: 2014-09-28 – 2014-09-30
• [学会発表] マイクロ流路を用いたX線溶液散乱測定サンプルチェンジャーの開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 岡部龍二, 上久保裕生, 山崎洋一, 片岡幹雄
  • 学会等名: 第1回「動的秩序と機能」若手研究会
  • 発表場所: ラフォーレ蔵王(宮城県刈田郡蔵王町）
  • 年月日: 2014-09-28 – 2014-09-30
• [学会発表] Molecular actions of the light sensor protein, Photoactive Yellow Protein, as a prototype for sensor proteins (2014)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Analysis for different property of light induced structural changes between two PYPs (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Yamazaki, Yoshiaki Matsumoto, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Kento Yonezawa, Hironari Kamikubo, Keito Yoshida, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Relationship of the photoreactions between two sensor domains in PYP-Phytochrome Related Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Keito Yoshida, Hironari Kamikubo, Kento Yonezawa, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Development of a microfluidics-based auto-sample changer for solution X-ray scattering (2014)
  • 著者名/発表者名: Ryuji Okabe, Hironari Kamikubo, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Analysis of amyloid formation and inhibition mechanisms of human calcitonin (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroko Tanaka, Hironari Kamikubo, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Characterization of the denatured structure of staphylococcal nuclease by tryptophan triplet state lifetime measurements (2014)
  • 著者名/発表者名: Sadatoshi Aoyagi, Mariko Yamaguchi, Hironari Kamikubo, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] The elucidation of the relationship between β4-5 loop region and the chromophore environment in PYPs (2014)
  • 著者名/発表者名: Atuhiro Kawamura, Yoichi Yamazaki, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Acid induced proton transfer in Photoactive Yellow Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Masayoshi Noji, Mai Arakawa, Hironari Kamikubo, Yoichi Yamazaki, Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第52回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 札幌コンベションセンター(北海道札幌市）
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] The potential uses of structure and function elements (2014)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka
  • 学会等名: The 14th KIAS Conference on Protein Structure and Function
  • 発表場所: Seoul (Korea)
  • 年月日: 2014-09-17 – 2014-09-20
  • 招待講演
• [学会発表] 演習「タンパク質の形を見てみよう」講義「光散乱・小角散乱に関する基礎」「X線溶液散乱デモデータの処理」 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 「第8回大学生のための素粒子・原子核、物質・生命スクール」サマーチャレンジ2014
  • 発表場所: 高エネルギー加速器研究機構(茨城県つくば市）
  • 年月日: 2014-08-23 – 2014-08-24
• [学会発表] 機能を生み出す単位生体分子集団(機能モジュール）の動的秩序の探査 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 新学術領域研究「動的秩序と機能」班会議
  • 発表場所: 粟津温泉 おびし荘(石川県小松市）
  • 年月日: 2014-08-04 – 2014-08-07
• [学会発表] 弱い相互作用で関連づけられたタンパク質分子集団の特性と制御 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 東京理科大学総合研究機構「分子連関相乗系研究部門」セミナー
  • 発表場所: 東京理科大学(東京都新宿区）
  • 年月日: 2014-07-26
  • 招待講演
• [学会発表] マルチドメイン蛋白質におけるドメイン再配置と結合調整/Domain rearrangement of a multi-domain protein regulates the association and dissociation of its interaction partners (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第14 回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-18 – 2014-06-22
• [学会発表] Rhodobacter capsulatus PYP結晶構造に見られる活性中間体様構造の解析/Crystal structural analysis for active-state like structure of Rhodobacter capsulatus PYP (2014)
  • 著者名/発表者名: 山崎洋一、松本寛史、上久保裕生、片岡幹雄
  • 学会等名: 第14 回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-18 – 2014-06-22
• [学会発表] 共役した蛋白質分子内プロトン移動反応の実験的検証 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第47 回量子物理化学セミナー兼理数GP セミナー
  • 発表場所: 横浜市立大（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-06-04
  • 招待講演
• [学会発表] BioSAXS論文投稿規定に関して (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第2回タンパク質X線溶液散乱講習会
  • 発表場所: 高エネルギー加速器研究機構 物質構造科学研究所(茨城県つくば市）
  • 年月日: 2014-06-03
  • 招待講演
• [学会発表] Exploring regulatory association and dissociation processes of biological molecules constituting a functional module (2014)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Interaction sites analysis for the photoactive yellow protein of Rhodobacter capsulatus (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Yamazaki
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Local disordered structure of staphylococcal nuclease studied by tryptophan triplet state lifetime measurement (2014)
  • 著者名/発表者名: Mariko Yamaguchi
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Loop dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale (2014)
  • 著者名/発表者名: Takahiro Matsumoto
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Local flexibility around tryptophan140 and its relationship to non-local interaction in disordered staphylococcal nuclease (2014)
  • 著者名/発表者名: Toshiyuki Minemura
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Extraction of function elements from green fluorescent protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Toshio Morimoto
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Protonation state of R52 at the pypm intermediate state (2014)
  • 著者名/発表者名: Masayoshi Noji
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Matsumoto
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Analysis of Equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins (2014)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Matsumoto
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Statistical characteristics of unfolded staphylococcal nuclease studied (2014)
  • 著者名/発表者名: Emi Ohta
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme (2014)
  • 著者名/発表者名: Mai Arakawa
  • 学会等名: The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
  • 発表場所: キャンパスプラザ京都、京都府京都市
• [学会発表] 溶液散乱を用いた多成分平衡系における構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: Spring-8ワークショップ「Spring-8とユーザーのさらなる連携をめざして」
  • 発表場所: 理化学研究所播磨事業所、兵庫県、佐用町
• [学会発表] X線溶液散乱法を用いたタンパク質構造の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 分子・物質合成プラットフォーム技術研修会－先端施設の利用機会と高度な技術支援の提供－
  • 発表場所: ホテル京阪 京都、京都府京都市
  • 招待講演
• [学会発表] Excited-state proton transfer in fluorescent Photoactive Yellow Protein containing 7-hydroxycoumarin (2013)
  • 著者名/発表者名: Dian Novitasari
  • 学会等名: International Conference on Advanced Materials Science and Technology 2013
  • 発表場所: University Gadjah Mada，Yogyakarta, Indonesia
• [学会発表] トリプトファン三重項寿命を用いたStaphylococcal nucleaseの主鎖の運動性評価 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松本昇紘
  • 学会等名: 日本物理学会 2013年秋季大会
  • 発表場所: 徳島大学、常三島キャンパス徳島県徳島市
• [学会発表] Time-resolved Laue crystallography of photoactive yellow protein with 150psec time resolution (2013)
  • 著者名/発表者名: Mikio Kataoka
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Domain-Swapped Oligomerization and Molten Globule State of Cytochrome c (2013)
  • 著者名/発表者名: Megha Deshpande
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Analysis of interaction sites on the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoichi Yamazaki
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] The role of the flexible loop in Staphylococcal nuclease on its catalytic activity (2013)
  • 著者名/発表者名: Rumi Shiba
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Exited State Proton Transfer of Fluorescent Photoactive Yellow Protein Reconstituted with Hydroxycoumarin (2013)
  • 著者名/発表者名: Dian Novitasari
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Protonation State of Arginine 52 in Photoactive Yellow Protein (2013)
  • 著者名/発表者名: Kento Yonezawa
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] X-ray Solution Scattering Studies of PYP-Phytochrome Related Protein (2013)
  • 著者名/発表者名: Keito Yoshida
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Analysis of unfolded structure of Staphylococcal nuclease mutants by using FRET (2013)
  • 著者名/発表者名: Emi Ohta
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Main-chain dynamics of staphylococcal nuclease in microsecond timescale (2013)
  • 著者名/発表者名: Takahiro Matsumoto
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Local flexibility of denatured structure and its relationship to non-local interaction in staphylococcal nuclease (2013)
  • 著者名/発表者名: Toshiyuki Minemura
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Extraction of Function Elements from Green Fluorescent Protein (2013)
  • 著者名/発表者名: Toshio Morimoto
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Roles of functional elements transplanted into the artificial enzyme (2013)
  • 著者名/発表者名: Mai Arakawa
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] X-ray crystal structure analysis of the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus (2013)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Matsumoto
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Analysis of equilibrium of intermediate states of PYP by use of chimera proteins (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshiaki Matsumoto
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Protonation state of R52 at the PYPM intermediate state (2013)
  • 著者名/発表者名: Masayoshi Noji
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館、京都府京都市
• [学会発表] Functional modification of a protein by using element implantation (2013)
  • 著者名/発表者名: Hironari Kamikubo
  • 学会等名: Sixth Korea-Japan Seminars on Biomdecular Sciences; Experiments and Simulations
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンタ－、愛知県岡崎市
  • 招待講演
• [学会発表] 光センサー蛋白質の局所状態変化と全体構造変化
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 第3回CIMoSセミナー
  • 発表場所: 分子科学研究所協奏分子システム研究センター、愛知県岡崎市
  • 招待講演
• [学会発表] 光センサー蛋白質からみた階層間の連続性
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 国際高等研究所研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能への揺らぎとダイナミックネットワークの解明」2013年度第2回研究会プログラム
  • 発表場所: 国際高等研究所、京都府木津川市
• [学会発表] 折り畳み機構を踏まえた蛋白質分子設計方の開発
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: NAIST未来開発コロキウム－明日をつくる分子・人材ネットワーク
  • 発表場所: 奈良先端科学技術大学院大学 物質創成科学研究科、奈良県生駒市
  • 招待講演
• [学会発表] 機能を生み出す単位生体分子集団
  • 著者名/発表者名: 上久保裕生
  • 学会等名: 生命システムにおける動的秩序形成と高次機能発現 第1回公開シンポジウム
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンタ－、愛知県岡崎市
  • 招待講演