計画研究
新学術領域研究(研究領域提案型)
代謝は生命現象の基盤であるが、代謝ネットワークのダイナミクスおよび個体発生における役割についての理解は不十分である。本研究は、メタボロミクスを駆使し、数理解析によって植物代謝システムのダイナミクスを理解すること、および分子遺伝学的手法によって発生過程を制御する代謝経路を明らかにすることを目的とした。理論構築とその適用、予測と検証などの数理的手法と生物学的実験を組み合わせた研究を行なって、いくつかの発生過程の原理を明らかにした。また、分子遺伝学的手法による研究を行ない、代謝酵素CYP77A4が関与する代謝経路がシロイヌナズナ胚のパターニングを制御していることを明らかにした。
代謝が発生過程を制御するという概念を導入することで、発生生物学および代謝生理学における新たな研究戦略を確立した。また、数理的手法を取り入れることで、発生と代謝のダイナミクスの解明を可能とした。
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すべて 雑誌論文 (28件) (うち国際共著 3件、 査読あり 28件、 オープンアクセス 18件、 謝辞記載あり 5件) 学会発表 (34件) (うち国際学会 9件、 招待講演 7件) 備考 (4件)
Development
巻: 145 号: 17 ページ: 168369-168369
10.1242/dev.168369
Scientific Reports
巻: 8 号: 1 ページ: 14696-14696
10.1038/s41598-018-32894-1
Frontiers in Plant Science
巻: 9 ページ: 956-956
10.3389/fpls.2018.00956
120006554787
Sci. Rep.
巻: 8 号: 1 ページ: 11542-11542
10.1038/s41598-018-29543-y
巻: 7 号: 1 ページ: 3533-3533
10.1038/s41598-017-03807-5
American Journal of Botany
巻: 104 号: 6 ページ: 905-914
10.3732/ajb.1600419
Planta
巻: 247 号: 2 ページ: 405-412
10.1007/s00425-017-2794-5
Metabolomics
巻: 13 号: 6 ページ: 75-75
10.1007/s11306-017-1211-1
Journal of Theoretical Biology
巻: 404 ページ: 206-214
10.1016/j.jtbi.2016.06.005
Physical Review Letters
巻: 117 号: 4 ページ: 048101-048101
10.1103/physrevlett.117.048101
Nucleic Acids Research
巻: 44 号: W1 ページ: W205-W211
10.1093/nar/gkw415
New Neg. Plant Sci.
巻: 1-2 ページ: 53-61
10.1016/j.neps.2015.06.001
PLOS One.
巻: 2015 号: 7 ページ: 1-18
10.1371/journal.pone.0131408
Bio-protocol
巻: 5 ページ: 18-18
Journal of Plant Research
巻: 128 号: 1 ページ: 17-25
10.1007/s10265-014-0692-5
Journal of Experimental Botany.
巻: 66 号: 4 ページ: 1055-1063
10.1093/jxb/erv028
J. Theor. Biol.
巻: 365 ページ: 12-22
10.1016/j.jtbi.2014.09.039
巻: 367 ページ: 189-202
10.1016/j.jtbi.2014.10.025
Plant Science
巻: 232 ページ: 49-56
10.1016/j.plantsci.2014.12.009
Proteomics
巻: 15 号: 7 ページ: 1196-1201
10.1002/pmic.201400467
BMC Research Notes
巻: 7 号: 1 ページ: 761-761
10.1186/1756-0500-7-761
Evolutionary Ecology
巻: 28 号: 3 ページ: 545-559
10.1007/s10682-013-9686-3
120005351861
Metabolites
巻: 4 号: 3 ページ: 599-611
10.3390/metabo4030599
Plant Molecular Biology
巻: 85 号: 4-5 ページ: 411-428
10.1007/s11103-014-0194-9
Environ Microbiol
巻: 16 号: 2 ページ: 512-524
10.1111/1462-2920.12170
DNA Res.
巻: 6 号: 6 ページ: 525-535
10.1093/dnares/dst028
J Plant Nutr
巻: 36 号: 7 ページ: 1138-1159
10.1080/01904167.2013.780613
BMC Plant Biol.
巻: 13 号: 1 ページ: 143-143
10.1186/1471-2229-13-143
http://www.riken.jp/pr/press/2018/20180913_1/
http://www.riken.jp/pr/press/2016/20161226_1/
http://www.riken.jp/pr/press/2017/20170614_2/
http://www.oib.orion.ac.jp/metabolo/