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腫瘍に関連する完全長攪乱RNAの特徴付け

計画研究

研究領域攪乱RNA:RNAによる生命システムの攪乱とその適応機構の統合的理解
研究課題/領域番号 25H01312
研究種目

学術変革領域研究(A)

配分区分補助金
審査区分 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
研究機関京都大学

研究代表者

村川 泰裕  京都大学, 高等研究院, 教授 (50765469)

研究期間 (年度) 2025-04-01 – 2030-03-31
研究課題ステータス 交付 (2025年度)
配分額 *注記
101,270千円 (直接経費: 77,900千円、間接経費: 23,370千円)
2025年度: 29,250千円 (直接経費: 22,500千円、間接経費: 6,750千円)
キーワードperRNA / トランスクリプトーム解析 / バイオインフォマティクス
研究開始時の研究の概要

内在性ウイルス様配列は、過去に感染したウイルスが宿主ゲノムに組み込まれ、代々受け継がれてきたものである。興味深いことに、がん細胞においては内在性ウイルス様配列が再賦活化し、がん特有の攪乱RNA (perRNA) 分子が転写されている。しかし、内在性ウイルス様配列はゲノム上に類似配列が多数存在するため多くの未知が残されたままであった。そこで、申請者らが独自に開発した攪乱RNAシーケンシング技術をヒトの多様な腫瘍サンプルに適用し、perRNAを包括的に発見する。そして、perRNAの完全長構造を基に、本研究領域の専門家と連携して、腫瘍perRNA分子を多角的な観点から特徴付ける。

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公開日: 2025-04-17   更新日: 2025-06-20  

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