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冥王代類似環境微生物

計画研究

研究領域冥王代生命学の創成
研究課題/領域番号 26106004
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

鎌形 洋一  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究部門付 (70356814)

研究分担者 玉木 秀幸  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究グループ付 (00421842)
西原 秀典  東京工業大学, 生命理工学院, 助教 (10450727)
鈴木 志野  国立研究開発法人海洋研究開発機構, 高知コア研究所, 特任主任研究員 (10557002)
柿澤 茂行  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (10588669)
黒川 顕  国立遺伝学研究所, 情報研究系, 教授 (20343246)
大島 拓  富山県立大学, 工学部, 准教授 (50346318)
研究協力者 森 宙史  
研究期間 (年度) 2014-07-10 – 2019-03-31
研究課題ステータス 完了 (2018年度)
配分額 *注記
245,570千円 (直接経費: 188,900千円、間接経費: 56,670千円)
2018年度: 47,450千円 (直接経費: 36,500千円、間接経費: 10,950千円)
2017年度: 47,450千円 (直接経費: 36,500千円、間接経費: 10,950千円)
2016年度: 47,580千円 (直接経費: 36,600千円、間接経費: 10,980千円)
2015年度: 47,320千円 (直接経費: 36,400千円、間接経費: 10,920千円)
2014年度: 55,770千円 (直接経費: 42,900千円、間接経費: 12,870千円)
キーワード冥王代 / 生命の起源 / 生命の誕生場 / 蛇紋岩熱水系 / 未知未培養微生物 / メタゲノム / 嫌気性微生物 / 原始エネルギー代謝 / OD1 / エネルギー代謝 / Wood-Ljungdahl 経路 / 人工生命系 / ATPase / 特殊環境微生物 / 生命進化 / 原始生命体 / 細菌 / 古細菌 / アルカリ環境 / 共生 / 微生物初期進化 / ミニマムゲノム / ゲノム解析 / 化学進化 / 難培養性微生物 / 初期エネルギー代謝 / 人工生命体 / 原始地球 / ゲノムインフォマティックス / 難培養微生物 / 独立栄養微生物
研究成果の概要

冥王代類似環境に棲息する微生物のメタゲノム解析、生理生態機能の解明を進めた。細胞密度が希薄な白馬ならびに米国の蛇紋岩熱水系から濃縮操作を経てゲノム解析に必要な微生物菌体を得た。大規模なメタゲノム解析により白馬ならびに米国蛇紋岩熱水系には未知門として知られているOD1やWS2など特異な微生物が主要構成集団であることが明らかとなった。また、エネルギー代謝に関しては、原始エネルギー代謝の中枢を担っていたと考えられているWood-Ljungdahl 経路ならびにその多様な変型代謝系が見出された。OD1を初めとする主要未知微生物のゲノム全体は極めて不完全で単独では生存が困難と思える解析結果を得た。

研究成果の学術的意義や社会的意義

生命の最初の誕生場は地球深くに沈み込み地上にはもはや存在しない。それでも鉱物と水から生命誕生に必要だった水素が生まれている地下熱水環境は少ないながらも現存しており、そうしたところに生存する現世の微生物のゲノム構造を解析したり、生理学的特徴を明らかにできれば、生命誕生の痕跡に触れることができるかもしれない。本研究はそうした人類の知的好奇心と想像力をかき立てるものである。また、生命を地球化学の反応から考察することは地球の歴史や生命の歴史を辿るばかりではなく、すべての生物反応は触媒反応である、という今日の化学工業やバイオテクノロジーの原点に直結する命題を与えるものである。

報告書

(6件)
  • 2018 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2017 実績報告書
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (77件)

すべて 2019 2018 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 雑誌論文 (38件) (うち国際共著 10件、 査読あり 37件、 オープンアクセス 24件、 謝辞記載あり 6件) 学会発表 (34件) (うち国際学会 13件、 招待講演 30件) 図書 (2件) 備考 (1件) 産業財産権 (1件) (うち外国 1件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [雑誌論文] Reconsidering plasmid maintenance factors for computational plasmid design2019

    • 著者名/発表者名
      Yano H, Shintani M, Tomita M, Suzuki H, and Oshima T
    • 雑誌名

      Comput. Struct. Biotechnol. J.

      巻: 17 ページ: 70-81

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2018.12.001

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Small RNA Esr41 inversely regulates expression of LEE and flagellar genes in enterohaemorrhagic Escherichia coli2018

    • 著者名/発表者名
      Sudo Naoki、Soma Akiko、Iyoda Sunao、Oshima Taku、Ohto Yui、Saito Kenta、Sekine Yasuhiko
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 164 号: 5 ページ: 821-834

    • DOI

      10.1099/mic.0.000652

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Essential cellular modules for the proliferation of the primitive cell2018

    • 著者名/発表者名
      Higashi Koichi、Kawai Yoshikazu、Baba Tomoya、Kurokawa Ken、Oshima Taku
    • 雑誌名

      Geoscience Frontiers

      巻: 9 号: 4 ページ: 1155-1161

    • DOI

      10.1016/j.gsf.2016.11.013

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] GeF-seq: A Simple Procedure for Base Pair Resolution ChIP-seq2018

    • 著者名/発表者名
      Chumsakul Onuma、Nakamura Kensuke、Ishikawa Shu、Oshima Taku
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 1837 ページ: 33-47

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8675-0_3

    • ISBN
      9781493986743, 9781493986750
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enlargement of Deinococcus grandis spheroplasts requires Mg2+ or Ca2+2018

    • 著者名/発表者名
      Koki Nishino, Yusuke Morita, Sawako Takahashi, Mai Okumura, Shusaku Shiratani, Kousuke Umemura, Issay Narumi, Chie Kondo, Ryosuke Ochiai, Taku Oshima, Hiromi Nishida
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 164 号: 11 ページ: 1361-1371

    • DOI

      10.1099/mic.0.000716

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genomic and in-situ Transcriptomic Characterization of the Candidate Phylum NPL-UPL2 From Highly Alkaline Highly Reducing Serpentinized Groundwater2018

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Shino、Nealson Kenneth H.、Ishii Shun’ichi
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 9 ページ: 646-649

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.03141

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Tuning Gene Activity by Inducible and Targeted Regulation of Gene Expression in Minimal Bacterial Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Mariscal Ana M.、Kakizawa Shigeyuki et al
    • 雑誌名

      ACS Synthetic Biology

      巻: 7 号: 6 ページ: 1538-1552

    • DOI

      10.1021/acssynbio.8b00028

    • 関連する報告書
      2018 実績報告書 2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] VITCOMIC2: Visualization tool for the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing.2018

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K
    • 雑誌名

      BMC Syst. Biol.

      巻: 12 号: S2 ページ: 30-30

    • DOI

      10.1186/s12918-018-0545-2

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the Nonheterocystous Cyanobacterium Pseudanabaena sp. ABRG5-32018

    • 著者名/発表者名
      Tajima Naoyuki、Kanesaki Yu、Sato Shusei、Yoshikawa Hirofumi、Maruyama Fumito、Kurokawa Ken、Ohta Hiroyuki、Nishizawa Tomoyasu、Asayama Munehiko、Sato Naoki
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 6 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.01608-17

    • NAID

      120006457123

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Differently localized lysophosphatidic acid acyltransferases crucial for triacylglycerol biosynthesis in the oleaginous alga Nannochloropsis2017

    • 著者名/発表者名
      Nobusawa Takashi、Hori Koichi、Mori Hiroshi、Kurokawa Ken、Ohta Hiroyuki
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 90 号: 3 ページ: 547-559

    • DOI

      10.1111/tpj.13512

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Genome-Wide Analysis of ResD, NsrR, and Fur Binding in Bacillus subtilis during Anaerobic Fermentative Growth by In Vivo Footprinting2017

    • 著者名/発表者名
      Chumsakul O, Anantsri DP, Quirke T, Oshima T, Nakamura K, Ishikawa S and Nakano MM
    • 雑誌名

      Journal of Bacteriology

      巻: 199 号: 13

    • DOI

      10.1128/jb.00086-17

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of H-box region mutants of WalK inert to the action of waldiomycin in <i>Bacillus subtilis</i>2017

    • 著者名/発表者名
      A. Kato, S. Ueda, T. Oshima, Y. Inukai, T. Okajima, M. Igarashi, Y. Eguchi and R. Utsumi
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 63 号: 4 ページ: 212-221

    • DOI

      10.2323/jgam.2016.10.007

    • NAID

      130006067744

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Unusual metabolic diversity of hyperalkaliphilic microbial communities associated with subterranean serpentinization at The Cedars2017

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Shino、Ishii Shun'ichi、Hoshino Tatsuhiko、Rietze Amanda、Tenney Aaron、Morrill Penny L、Inagaki Fumio、Kuenen J Gijs、Nealson Kenneth H
    • 雑誌名

      The ISME Journal

      巻: 11 号: 11 ページ: 2584-2598

    • DOI

      10.1038/ismej.2017.111

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Water-rock Interaction Ascribed to Hyperalkaline Mineral Waters in the Cabeco de Vide Serpentinized Ultramafic Intrusive Massif (Central Portugal)2017

    • 著者名/発表者名
      Marques J.M.、Neves Maria O.、Miller Ana Z.、Rocha Carla、Vance Steve、Christensen Lance、Etiope Giuseppe、Carreira Paula M.、Suzuki Shino
    • 雑誌名

      Procedia Earth and Planetary Science

      巻: 17 ページ: 646-649

    • DOI

      10.1016/j.proeps.2016.12.173

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Petrothermobacter organivorans gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic, strictly anaerobic bacterium of the phylum Deferribacteres isolated from a deep subsurface oil reservoir2017

    • 著者名/発表者名
      73.Tamazawa S, Mayumi D, Mochimaru H, Sakata S, Maeda H, Wakayama T, Ikarashi M, Kamagata Y, Tamaki H
    • 雑誌名

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol.

      巻: 67 号: 10 ページ: 3982-3986

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.002234

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] 超微小微生物の実態と多様性2017

    • 著者名/発表者名
      中井 亮佑、玉木 秀幸
    • 雑誌名

      日本微生物生態学会誌

      巻: 32 号: 2 ページ: 43-50

    • DOI

      10.20709/jsmeja.32.2_43

    • NAID

      130006186005

    • ISSN
      2424-1989
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Phosphate-Catalyzed Hydrogen Peroxide Formation from Agar, Gellan, and κ-Carrageenan and Recovery of Microbial Cultivability via Catalase and Pyruvate2017

    • 著者名/発表者名
      Kawasaki Kosei、Kamagata Yoichi
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 83 号: 21

    • DOI

      10.1128/aem.01366-17

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Restoration of the growth of Escherichia coli under K+-deficient conditions by Cs+ incorporation via the K+ transporter Kup2017

    • 著者名/発表者名
      Kato Souichiro、Kanata Yoshiki、Kitagawa Wataru、Sone Teruo、Asano Kozo、Kamagata Yoichi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1 ページ: 195-195

    • DOI

      10.1038/s41598-017-02024-4

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Operation-driven heterogeneity and overlooked feed-associated populations in global anaerobic digester microbiome2017

    • 著者名/発表者名
      Mei Ran、Nobu Masaru K.、Narihiro Takashi、Kuroda Kyohei、 Sierra Julian、Wu Zhuoying、Ye Lin、Lee Patrick K.H.、Lee Po-Heng、van Lier Jules B.、McInerney Michael J.、Kamagata Yoichi、Liu Wen-Tso
    • 雑誌名

      Water Research

      巻: 124 ページ: 77-84

    • DOI

      10.1016/j.watres.2017.07.050

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Methane production from coal by a single methanogen2016

    • 著者名/発表者名
      Mayumi D, Mochimaru H, Tamaki H, Yamamoto K, Yoshioka H, Suzuki Y, Kamagata Y, Sakata S
    • 雑誌名

      Science

      巻: 354 号: 6309 ページ: 222-225

    • DOI

      10.1126/science.aaf8821

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Methanomicrobium antiquum sp. nov., a hydrogenotrophic methanogen isolated from deep sedimentary aquifers in a natural gas field2016

    • 著者名/発表者名
      Mochimaru H, Tamaki H, Katayama T, Imachi H, Sakata S and Kamagata Y
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evoltionary Microbiology

      巻: 66 号: 11 ページ: 4873-4877

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.001444

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In situ gene expression responsible for sulfide oxidation and CO2 fixation of an uncultured large sausage-shaped Aquificae bacterium in a sulfidic hot spring2016

    • 著者名/発表者名
      Tamazawa S, Yamamoto K, Takasaki K, Mitani Y, Hanada S, Kamagata Y, Tamaki H
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 31 ページ: 194-198

    • NAID

      130005158507

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Comparative Genomics of Syntrophic Branched-Chain Fatty Acid Degrading Bacteria2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T, Nobu MK, Tamaki H, Kamagata Y, Sekiguchi Y, Liu WT
    • 雑誌名

      Microbes and environments

      巻: 31 号: 3 ページ: 288-292

    • DOI

      10.1264/jsme2.ME16057

    • NAID

      130005265098

    • ISSN
      1342-6311, 1347-4405
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] A key genetic factor for fucosyllactose utilization affects infant gut microbiota development2016

    • 著者名/発表者名
      Matsuki T, Yahagi K, Mori H, Matsumoto H, Hara T, Tajima S, Ogawa E, Kodama H, Yamamoto K, Yamada T, Matsumoto S, Kurokawa K
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 7 号: 1 ページ: 11939-11939

    • DOI

      10.1038/ncomms11939

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High-affinity monoclonal IgA regulates gut microbiota and prevents colitis in mice.2016

    • 著者名/発表者名
      Okai S, Usui F, Yokota S, Hori-I Y, Hasegawa M, Nakamura T, Kurosawa M, Okada S, Yamamoto K, Nishiyama E, Mori H, Yamada T, Kurokawa K, Matsumoto S, Nanno M, Naito T, Watanabe Y, Kato T, Miyauchi E, Ohno H, Shinkura R.
    • 雑誌名

      Nature Microbiology

      巻: 1 号: 9 ページ: 16103-16103

    • DOI

      10.1038/nmicrobiol.2016.103

    • NAID

      120005818448

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Exploring the metabolic potential of microbial communities in ultra‐basic, reducing springs at The Cedars, CA, USA: Experimental evidence of microbial methanogenesis and heterotrophic acetogenesis2016

    • 著者名/発表者名
      Kohl L, Cumming, E, Cox A., Rietze A. Morrissey L. Lang QS, Richter A, Suzuki S, Nealson HK, Morrill LP
    • 雑誌名

      Journal of Geophysical Research: Biogeosciences

      巻: 121 号: 4 ページ: 1203-1220

    • DOI

      10.1002/2015jg003233

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] H-NS Facilitates Sequence Diversification of Horizontally Transferred DNAs during Their Integration in Host Chromosomes2016

    • 著者名/発表者名
      Higashi K., Tobe T., Kanai A., Uyar E., Ishikawa S., Suzuki Y., Ogasawara N., Kurokawa K., and Oshima T
    • 雑誌名

      PLoS genetics

      巻: 12 号: 1 ページ: e1005796-e1005796

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1005796

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] MetaSINEs: Broad Distribution of a Novel SINE Superfamily in Animals.2016

    • 著者名/発表者名
      Nishihara, H., Plazzi, F., Passamonti, M. and Okada, N.
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 8 号: 3 ページ: 528-539

    • DOI

      10.1093/gbe/evw029

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] The role of genome sequencing in phytoplasma research2015

    • 著者名/発表者名
      Kakizawa S., Yoneda Y.
    • 雑誌名

      Phytopathogenic Mollicutes

      巻: 5 号: 1 ページ: 19-24

    • DOI

      10.5958/2249-4677.2015.00058.4

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] DomSign: a top-down annotation pipeline to enlarge enzyme space in the protein universe.2015

    • 著者名/発表者名
      Wang T, Mori H, Zhang C, Kurokawa K, Xing X, Yamada T
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 16 号: 1 ページ: 96-96

    • DOI

      10.1186/s12859-015-0499-y

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] FuncTree: Functional Analysis and Visualization for Large-Scale Omics Data.2015

    • 著者名/発表者名
      Uchiyama T, Irie M, Mori H, Kurokawa K, Yamada T.
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 10 号: 5 ページ: e0126967-e0126967

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0126967

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Physicochemical impacts associated with natural gas development on methanogenesis in deep sand aquifers2015

    • 著者名/発表者名
      Taiki Katayama, Hideyoshi Yoshioka, Yoshiyuki Muramoto, Jun Usami, Kazuhiro Fujiwara, Satoshi Yoshida, Yoichi Kamagata, Susumu Sakata
    • 雑誌名

      The ISME Journal

      巻: 9 号: 2 ページ: 436-446

    • DOI

      10.1038/ismej.2014.140

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of microorganisms involved in reduction of crystalline iron (III) oxides in natural environments2015

    • 著者名/発表者名
      Hori T., Aoyagi T., Itoh, H., Narihiro T., Oikawa A., Suzuki K., Ogata A., Friedrich, M.W., Conrad R., Kamagata Y.
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 6

    • DOI

      10.3389/fmicb.2015.00386

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Keys to cultivating uncultured microbes: elaborate enrichment strategies and resuscitation of dormant cells2015

    • 著者名/発表者名
      Kamagata Y.
    • 雑誌名

      Microbes and Environments

      巻: 30 号: 4 ページ: 289-290

    • DOI

      10.1264/jsme2.me3004rh

    • NAID

      130005116032

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Isolation of acetogenic bacteria that induce biocorrrosion by utilizing metallic irons as the sole electron donor2015

    • 著者名/発表者名
      Kato, S., I. Yumoto, Y. Kamagata
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 81 号: 1 ページ: 67-73

    • DOI

      10.1128/aem.02767-14

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] CLAST: CUDA implemented large-scale alignment search tool.2014

    • 著者名/発表者名
      Yano M, Mori H, Akiyama Y, Yamada T, Kurokawa K
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 15 号: 1 ページ: 406-406

    • DOI

      10.1186/s12859-014-0406-y

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish2014

    • 著者名/発表者名
      Brawand D et al. (Nikaido M 75人中45番目)
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 513 号: 7518 ページ: 375-381

    • DOI

      10.1038/nature13726

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A hidden pitfall in agar media preparation undermines cultivability of microorganisms,2014

    • 著者名/発表者名
      Tanaka T, Kawasaki K, Daimon S, Kitagawa W, Yamamoto K, Tamaki H, Tanaka M, Nakatsu CH, Kamagata Y
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 80 号: 24 ページ: 7659-7666

    • DOI

      10.1128/aem.02741-14

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] L型大腸菌の増殖機構の解明2019

    • 著者名/発表者名
      大島拓
    • 学会等名
      第92回日本細菌学会総会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 冥王代類似環境微生物:環境ゲノム情報と培養技術で紐解くその存在と未知機能2018

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      日本進化学会第20回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 未知の微生物を”培養”して深淵な生物機能を探る2018

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第32回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 岩に生かされる生命たち:地球深部強アルカリ環境をすみかとする微生物の生き様に迫る2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      第61回海中海底工学フォーラム
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Unusual metabolic strategies identified in a hyperalkaliphilic microbial community associated with the serpentinization2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      JpGU2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Microbial adaptive evolution to the oxic/anoxic interfaces in serpentinizing systems2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      JpGU2018
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ミニマムゲノム細菌の遺伝子機能解明に向けたCRIPSRi による遺伝子ノックダウン系の開発2018

    • 著者名/発表者名
      柿澤茂行、田中 一己、Yo Suzuki
    • 学会等名
      日本進化学会第20回大会
    • 関連する報告書
      2018 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 未知の微生物を”培養”して新たな生命機能を探る2018

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      日本細菌学会総会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 培養とゲノミクスで紐解く生命の生存戦略2018

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      日本細菌学会総会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] なぜ多くの微生物は固体培地で生育しないのか?2018

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      日本細菌学会総会シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 休眠・覚醒・培養手法の研究を通して見えた微生物の生き様2018

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 眠れる微生物の秘めた力2017

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      日本細菌学会総会シンポジウム
    • 発表場所
      東北大学(仙台市)
    • 年月日
      2017-03-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Cultivation and metagenomics of yet-to-be cultured acetogens in natural ecosystems including terrestrial serpentinizing hot springs2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一、玉木秀幸
    • 学会等名
      Workshop on The Origin of Life
    • 発表場所
      New Castle University Upon Tyne (英国)
    • 年月日
      2017-01-18
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ミニマムゲノム細菌の遺伝子機能解明に向けたCRIPSRiによる遺伝子ノックダウン2017

    • 著者名/発表者名
      S. Kakizawa, K Tanaka, Y Suzuki
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 未知の微生物を”培養”して生命の新機能を探る2017

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      環境微生物系合同大会2017 シンポジウム
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 培養技術と環境ゲノム情報で紐解く未知アーキアの新機能2017

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      日本ゲノム微生物学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] シス制御システムの進化をもたらした転移因子の重要性2017

    • 著者名/発表者名
      西原秀典
    • 学会等名
      日本遺伝学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 転移因子レトロトランスポゾンが拡大させたシス制御配列の多様性2017

    • 著者名/発表者名
      西原秀典
    • 学会等名
      ConBio2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Microbial community associated with subterranean serpentinization2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      KIOST international seminar 2017 Symposium
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Metabolic Diversity of Hyperalkaliphilic Microbial Communities Associated with Serpentinization at The Cedars2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      Goldschmidt 2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Microbial adaptation to the extreme environment revealed by genome-centric metagenomics2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木志野
    • 学会等名
      国際ゲノム会議
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Novel methanogens: Looking into the depths of syntrophs and methanogens that have eluded cultivation2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      International Conference on Biogas Microorganisms
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Factors affecting cultivability of microorganisms on solidified media2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Why do microbes dislike growing on agar?2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      Annual Conference of Chinese Society of Microbial Ecology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 地下根源有機物からの生物的メタン生成2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      石油学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Why microbes do not like to grow on agar?2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      Taiwan Society of Microbial Ecology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Why do microbes dislike growing on agar?2017

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      Sendai Asian forum on environmental microbiology
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Syntrophy vs individualism2016

    • 著者名/発表者名
      鎌形洋一
    • 学会等名
      The 9th Asia-Pacific Landfill Symposium Syntrophy session
    • 発表場所
      Hong Kong University(香港・中国)
    • 年月日
      2016-11-10
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Comparative genomics identifies Serpentinomonas adaptation to the calcium-rich highly-alkaline serpentinizing ecosystem2016

    • 著者名/発表者名
      Shino Suzuki, Shunichi Ishii, Yuichi Hanada, Lina J. Bird, J. Gijs Kuenen, Kenneth H. Nealson
    • 学会等名
      Extremophiles
    • 発表場所
      京都大学(京都市)
    • 年月日
      2016-09-15
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Metabolic Diversity of Microorganisms Associated with Active Subsurface Serpentinization2016

    • 著者名/発表者名
      Shino Suzuki, Shunichi Ishii, Yuichi Hanada, Lina J. Bird, J. Gijs Kuenen, Kenneth H. Nealson
    • 学会等名
      Goldschmidt 2016
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • 年月日
      2016-06-29
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 全ゲノム操作による生命機能の解明: マイコプラズマと冥王代生命学2015

    • 著者名/発表者名
      柿澤茂行
    • 学会等名
      札幌微生物研究者合同セミナー
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2015-12-10
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 環境オミクス情報と培養技術で解き明かすその存在と未知機能2015

    • 著者名/発表者名
      玉木秀幸
    • 学会等名
      2015年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      京都大学宇治キャンパス
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ファイトプラズマの生態と進化2015

    • 著者名/発表者名
      柿澤茂行
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第30 回大会
    • 発表場所
      茨城県土浦市
    • 年月日
      2015-10-19
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 深部地下高温油層環境に生息する新規Deferribacteres門酢酸酸化細菌の分離と生理生態機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      玉澤聡、眞弓大介、持丸華子、坂田将、前田治男、若山樹、五十嵐雅之、鎌形洋一、玉木秀幸
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第30回大会
    • 発表場所
      茨城県土浦市
    • 年月日
      2015-10-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] Anaerobic Cultivation (in Manual of Environmental Microbiology, Fourth Edition)2016

    • 著者名/発表者名
      Narihiro T., Kamagata Y.
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      American Society for Microbiology
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] Syntrophy in anaerobic digestion (in Anaerobic Biotechnology)2015

    • 著者名/発表者名
      Kamagata Y.
    • 総ページ数
      18
    • 出版者
      World Scientific
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [備考] 冥王代生命学の創成

    • URL

      http://www.hadean.jp

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [産業財産権] 情報処理システム、情報処理方法、及びプログラム2017

    • 発明者名
      黒川顕、東光一、森宙史
    • 権利者名
      黒川顕、東光一、森宙史
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2017
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 外国
  • [学会・シンポジウム開催] Workshop on The Origin of Life2017

    • 発表場所
      New Castle Upon Tyne(英国)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2014-11-20   更新日: 2020-03-30  

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