ncRNAのケミカルタクソノミ

• 研究領域: ノンコーディングRNAネオタクソノミ
• 研究課題/領域番号: 26113003
• 研究種目: 新学術領域研究(研究領域提案型)
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 鈴木 勉 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (20292782)
• 研究期間 (年度): 2014-07-10 – 2019-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2018年度)
• 配分額: 133,900千円 (直接経費: 103,000千円、間接経費: 30,900千円); 2018年度: 26,520千円 (直接経費: 20,400千円、間接経費: 6,120千円); 2017年度: 26,520千円 (直接経費: 20,400千円、間接経費: 6,120千円); 2016年度: 26,520千円 (直接経費: 20,400千円、間接経費: 6,120千円); 2015年度: 26,520千円 (直接経費: 20,400千円、間接経費: 6,120千円); 2014年度: 27,820千円 (直接経費: 21,400千円、間接経費: 6,420千円)
• キーワード: RNA修飾 / マススペクトロメトリー / mRNA / ｔRNA / rRNA / リボソーム / エピトランスクリプトミクス / タンパク質合成 / tRNA修飾 / pre-tRNA capping / f5C修飾

研究成果の概要

本研究は、RNAの作動エレメントとして新規RNA修飾およびその機能を明らかにすることを目的とした。主な成果として、mRNAにおけるキャップ依存的な新規m6Aメチル化酵素の発見、酢酸イオンを基質とするRNAアセチル化酵素の発見、炭酸ガスに敏感なtRNA修飾とワールブルク効果との関係、メタボライト濃度に応じて変動するtRNA修飾、tRNA前駆体におけるキャップ修飾の発見、新規tRNA修飾の発見と生育相依存的なtRNA修飾の変動、ヒトミトコンドリアtRNAにおける5ホルミルシチジン修飾の生合成を明らかにした成果などが挙げられる。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究において、私たちは新規RNA修飾や修飾酵素を多数発見した。これらの成果は、RNA修飾が関与する生命現象の理解に貢献するだけでなく、RNA修飾が欠損することで生じるヒトの疾患（RNA修飾病）の発症原因の解明および具体的な治療法や創薬のための基盤的知見を提供する。

研究成果

• [国際共同研究] IMB Mainz/Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn(ドイツ)
• [国際共同研究] 浙江大学(中国)
• [国際共同研究] Thomas Jefferson Univ(米国)
• [国際共同研究] Lomonosov Moscow State University(ロシア連邦)
• [国際共同研究] Australian National University(オーストラリア)
• [国際共同研究]
• [国際共同研究] IMB Mainz/Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn(ドイツ)
• [国際共同研究] 浙江大学(中国)
• [国際共同研究] Thomas Jefferson Univ(米国)
• [国際共同研究] Lomonosov Moscow State University(ロシア連邦)
• [国際共同研究] Australian National University(オーストラリア)
• [国際共同研究]
• [国際共同研究] Lodz University of Technology(ポーランド)
• [国際共同研究] Ohio State University(米国)
• [国際共同研究] 浙江大学(中国)
• [国際共同研究] Queen's University(カナダ)
• [国際共同研究] Ben-Gurion University of the Negev(イスラエル)
• [国際共同研究]
• [雑誌論文] Impact of intron removal from tRNA genes on Saccharomyces cerevisiae (2019)
  • 著者名/発表者名: Hayashi Sachiko、Mori Shunsuke、Suzuki Takeo、Suzuki Tsutomu、Yoshihisa Tohru
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: - 号: 11 ページ: 5936-5949
  • DOI: 10.1093/nar/gkz270
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Depletion of S-adenosylmethionine impacts on ribosome biogenesis through hypomodification of a single rRNA methylation (2019)
  • 著者名/発表者名: Ishiguro Kensuke、Arai Taiga、Suzuki Tsutomu
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 47 号: 8 ページ: 4226-4239
  • DOI: 10.1093/nar/gkz111
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Random mutagenesis of a hyperthermophilic archaeon identified tRNA modifications associated with cellular hyperthermotolerance (2019)
  • 著者名/発表者名: Orita Izumi、Futatsuishi Ryohei、Adachi Kyoko、Ohira Takayuki、Kaneko Akira、Minowa Keiichi、Suzuki Miho、Tamura Takeshi、Nakamura Satoshi、Imanaka Tadayuki、Suzuki Tsutomu、Fukui Toshiaki
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 47 号: 4 ページ: 1964-1976
  • DOI: 10.1093/nar/gky1313
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Transcriptome-wide identification of A-to-I RNA editing sites using ICE-seq (2019)
  • 著者名/発表者名: Okada Shunpei、Ueda Hiroki、Noda Yuta、Suzuki Tsutomu
  • 雑誌名: Methods 巻: 156 ページ: 66-78
  • DOI: 10.1016/j.ymeth.2018.12.007
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Cap-specific terminal N6-methylation of RNA by an RNA polymerase II?associated methyltransferase (2018)
  • 著者名/発表者名: Akichika Shinichiro、Hirano Seiichi、Shichino Yuichi、Suzuki Takeo、Nishimasu Hiroshi、Ishitani Ryuichiro、Sugita Ai、Hirose Yutaka、Iwasaki Shintaro、Nureki Osamu、Suzuki Tsutomu
  • 雑誌名: Science 巻: 363 号: 363 ページ: 1-7
  • DOI: 10.1126/science.aav0080
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Quantification of methylation efficiency at a specific N6-methyladenosine position in rRNA by using BNA probes (2018)
  • 著者名/発表者名: Oshima Takuya、Ishiguro Kensuke、Suzuki Tsutomu、Kawahara Yukio
  • 雑誌名: Chemical Communications 巻: 54 号: 69 ページ: 9627-9630
  • DOI: 10.1039/c8cc03713b
  • 査読あり
• [雑誌論文] Acetate-dependent tRNA acetylation required for decoding fidelity in protein synthesis (2018)
  • 著者名/発表者名: Taniguchi T, Miyauchi K, Sakaguchi Y, Yamashita S, Soma A, Tomita K, Suzuki T
  • 雑誌名: Nature Chemical Biology 巻: 14 号: 11 ページ: 1010-1020
  • DOI: 10.1038/s41589-018-0119-z
  • 査読あり
• [雑誌論文] CO2-sensitive tRNA modification associated with human mitochondrial disease (2018)
  • 著者名/発表者名: Lin, H., Kenjyo, M., Harada, T., Okita, R., Takeshita, E., Komaki, H., Yagasaki, H., Fujioka, K., Goto, Y., Yanaka, K., Nakagawa, S., Sakaguchi, Y. and *Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nature Commun. 巻: in press 号: 1 ページ: 1875-1875
  • DOI: 10.1038/s41467-018-04250-4
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Accurate estimation of 5-methylcytosine in mammalian mitochondrial DNA (2018)
  • 著者名/発表者名: Matsuda, S., *Yasukawa, T., Sakaguchi, Y., Ichiyanagi, K., Unoki, M., Gotoh, K., Fukuda, K., Sasaki, H., Suzuki, T. and Kang, D.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 8 号: 1 ページ: 5801-5801
  • DOI: 10.1038/s41598-018-24251-z
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] The ribosomal A-site finger is crucial for binding and activation of the stringent factor RelA (2018)
  • 著者名/発表者名: Kudrin, P., Dzhygyr, I., Ishiguro, K., Beljantseva, J., Maksimova, E., Sofia Raquel Alves Oliveira, Varik, V., Payoe, R., Konevega, A., Tenson, T., Suzuki, T. and Hauryliuk, V.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 46 号: 4 ページ: 1973-1983
  • DOI: 10.1093/nar/gky023
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Metabolic and chemical regulation of tRNA modification associated with taurine deficiency and human disease (2018)
  • 著者名/発表者名: Asano Kana、Suzuki Takeo、Saito Ayaka、Wei Fan-Yan、Ikeuchi Yoshiho、Numata Tomoyuki、Tanaka Ryou、Yamane Yoshihisa、Yamamoto Takeshi、Goto Takanobu、Kishita Yoshihito、Murayama Kei、Ohtake Akira、Okazaki Yasushi、Tomizawa Kazuhito、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 46 号: 4 ページ: 1565-1583
  • DOI: 10.1093/nar/gky068
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Defective Mitochondrial tRNA Taurine Modification Activates Global Proteostress and Leads to Mitochondrial Disease. (2018)
  • 著者名/発表者名: Fakruddin M, Wei FY, Suzuki T, Asano K, Kaieda T, Omori A, Izumi R, Fujimura A, Kaitsuka T, Miyata K, Araki K, Oike Y, Scorrano L, Suzuki T, Tomizawa K.
  • 雑誌名: Cell Rep. 巻: 22 号: 2 ページ: 482-496
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2017.12.051
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] ALKBH1 is an RNA dioxygenase responsible for cytoplasmic and mitochondrial tRNA modifications (2017)
  • 著者名/発表者名: Kawarada Layla、Suzuki Takeo、Ohira Takayuki、Hirata Shoji、Miyauchi Kenjyo、Suzuki Tsutomu
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 45 号: 12 ページ: 7401-7415
  • DOI: 10.1093/nar/gkx354
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Biochemical and structural characterization of oxygen-sensitive 2-thiouridine synthesis catalyzed by an iron-sulfur protein TtuA (2017)
  • 著者名/発表者名: Chen Minghao、Asai Shin-ichi、Narai Shun、Nambu Shusuke、Omura Naoki、Sakaguchi Yuriko、Suzuki Tsutomu、Ikeda-Saito Masao、Watanabe Kimitsuna、Yao Min、Shigi Naoki、Tanaka Yoshikazu
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences 巻: 114 号: 19 ページ: 4954-4959
  • DOI: 10.1073/pnas.1615585114
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Human BCDIN3D Monomethylates Cytoplasmic Histidine Transfer RNA. (2017)
  • 著者名/発表者名: Martinez A, Yamashita S, Nagaike T, Sakaguchi Y, Suzuki T, Tomita K
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: - ページ: 5423-5436
  • DOI: 10.1093/nar/gkx051
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] RNA editing enzyme ADAR2 is a mediator of neuropathic pain after peripheral nerve injury. (2017)
  • 著者名/発表者名: Uchida H, Matsumura S, Okada S, Suzuki T, Minami T and Ito S
  • 雑誌名: FASEB Journal 巻: 印刷中 号: 5 ページ: 1847-1855
  • DOI: 10.1096/fj.201600950r
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] S -Adenosylmethionine Synthesis Is Regulated by Selective N 6 -Adenosine Methylation and mRNA Degradation Involving METTL16 and YTHDC1 (2017)
  • 著者名/発表者名: Shima Hiroki、Matsumoto Mitsuyo、Ishigami Yuma、Ebina Masayuki、Muto Akihiko、Sato Yuho、Kumagai Sayaka、Ochiai Kyoko、Suzuki Tsutomu、Igarashi Kazuhiko
  • 雑誌名: Cell Rep. 巻: 21 号: 12 ページ: 3354-3363
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2017.11.092
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Biogenesis and iron-dependency of ribosomal RNA hydroxylation (2017)
  • 著者名/発表者名: Kimura, S., Sakai, Y., Ishiguro, K. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 45 号: 22 ページ: 12974-12986
  • DOI: 10.1093/nar/gkx969
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Intrinsic Ribosome Destabilization Underlies Translation and Provides an Organism with a Strategy of Environmental Sensing (2017)
  • 著者名/発表者名: Chadani Yuhei、Niwa Tatsuya、Izumi Takashi、Sugata Nobuyuki、Nagao Asuteka、Suzuki Tsutomu、Chiba Shinobu、Ito Koreaki、Taguchi Hideki
  • 雑誌名: Molecular Cell 巻: 68 号: 3 ページ: 528-539
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2017.10.020
  • 査読あり
• [雑誌論文] Hydroxylation of a conserved tRNA modification establishes non-universal genetic code in echinoderm mitochondria (2017)
  • 著者名/発表者名: Nagao, A., Ohara, M., Miyauchi, K., Yokobori, S., Yamagishi, A., Watanabe, K. and *Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nature Structural & Molecular Biology 巻: 24 号: 9 ページ: 778-782
  • DOI: 10.1038/nsmb.3449
  • 査読あり
• [雑誌論文] A hydantoin isoform of cyclic N6-threonylcarbamoyladenosine (ct6A) is present in tRNAs (2017)
  • 著者名/発表者名: Matuszewski, M., Wojciechowski, J., Miyauchi, K., Gdaniec, Z., Wolf, W. M., Suzuki, T. and Sochacka, E
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 45 号: 4 ページ: 2137-2149
  • DOI: 10.1093/nar/gkw1189
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Identification of 2-methylthio cyclic N6-threonylcarbamoyladenosine (ms2ct6A) as a novel RNA modification at position 37 of tRNAs (2017)
  • 著者名/発表者名: Kang, B. I., Miyauchi, K., Matuszewski, M., D'Almeida, G. S., Rubio, M. A., Alfonzo, J. D., Inoue, K., Sakaguchi, Y., Suzuki, T., Sochacka, E., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 巻: 45 号: 4 ページ: 2124-2136
  • DOI: 10.1093/nar/gkw1120
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Structural and functional characterization of the TYW3/Taw3 class of SAM-dependent methyltransferases (2017)
  • 著者名/発表者名: Currie, M. A., Brown, G., Wong, A., Ohira, T., Sugiyama, K., Suzuki, T.,Yakunin, A. F., and Jia, Z
  • 雑誌名: RNA 巻: 23 号: 3 ページ: 346-354
  • DOI: 10.1261/rna.057943.116
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Duplication of Drosophila melanogaster mitochondrial EF-Tu: pre-adaptation to T-arm truncation and exclusion of bulky aminoacyl residues (2017)
  • 著者名/発表者名: Sato, A., Suematsu, T., Aihara, K., Kita, K., Suzuki, T., Watanabe, K., Ohtsuki, T. and Watanabe, Y.
  • 雑誌名: Biochem. J. 巻: 474 号: 6 ページ: 957-969
  • DOI: 10.1042/bcj20160929
  • 査読あり
• [雑誌論文] RNA modifications: what have we learned and where are we headed? (2016)
  • 著者名/発表者名: Frye, M., Jaffrey, S., Pan, T., Rechavi, G. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nature Rev Genet 巻: 17 号: 6 ページ: 365-372
  • DOI: 10.1038/nrg.2016.47
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] NSUN3 methylase initiates 5-formylcytidine biogenesis in human mitochondrial tRNA(Met) (2016)
  • 著者名/発表者名: Nakano, S., Suzuki, T., Kawarada, L., Iwata, H., Asano, K., Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nat Chem Biol 巻: 12 号: 7 ページ: 546-51
  • DOI: 10.1038/nchembio.2099
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Precursors of tRNAs are stabilized by methylguanosine cap structures. (2016)
  • 著者名/発表者名: Ohira T, Suzuki T
  • 雑誌名: Nat Chem Biol. 巻: 12 号: 8 ページ: 648-55
  • DOI: 10.1038/nchembio.2117
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mitochondrial 16S rRNA Is Methylated by tRNA Methyltransferase TRMT61B in All Vertebrates (2016)
  • 著者名/発表者名: Bar-Yaacov D, Frumkin I, Yashiro Y, Chujo T, Ishigami Y, Chemla Y, Blumberg A, Schlesinger O, Bieri P, Greber B, Ban N, Zarivach R, Alfonta L, Pilpel Y, Suzuki T, Mishmar D.
  • 雑誌名: PLoS Biology 巻: - 号: 9 ページ: e1002557-e1002557
  • DOI: 10.1371/journal.pbio.1002557
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
• [雑誌論文] Mtu1-mediated thiouridine formation of mitochondrial tRNAs is required for mitochondrial translation and is involved in reversible infantile liver injury (2016)
  • 著者名/発表者名: Wu, Y., Wei, F. Y., Kawarada, L., Suzuki, T., Araki, K., Komohara, Y., Fujimura, A., Kaitsuka, T., Takeya, M., Oike, Y., Suzuki, T., Tomizawa, K.
  • 雑誌名: PLoS genetics 巻: 12 号: 9 ページ: e1006355-e1006355
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1006355
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A comprehensive genomic analysis reveals the genetic landscape of mitochondrial respiratory chain deficiency. (2016)
  • 著者名/発表者名: Kohda M, Mizuno Y, Hirata T, Yatsuka Y, Yamashita, Okuda A, Borna NN, Banshoya K, Ohnuma K, Suzuki T, Nagao A, Maehata H, Matsuda F, Higasa K, Nagasaki M, Yasuda J, Yamamoto M, Fushimi T, Shimura M, Kaiho-Ichimoto K, Harashima H, Yamazaki T, Mori M, Murayama K, Ohtake A, Okazaki Y.
  • 雑誌名: PLoS Genetics: 巻: 12(1) 号: 1 ページ: e1005679-e1005679
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1005679
  • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Biogenesis and growth phase-dependent alteration of 5-methoxycarbonylmethoxyuridine in tRNA anticodons (2016)
  • 著者名/発表者名: Yusuke Sakai, Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Tsutomu Suzuki
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 44 号: 2 ページ: 509-523
  • DOI: 10.1093/nar/gkv1470
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification and Functional Analysis of the Pre-piRNA 3' Trimmer in Silkworms (2016)
  • 著者名/発表者名: Izumi, N., Shoji, K., Sakaguchi, Y., Honda, S., Kirino, Y., Suzuki, T., Katsuma, S. and Tomari, Y.
  • 雑誌名: Cell 巻: 164 ページ: 962-973
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Iron-sulfur proteins responsible for RNA modifications (2015)
  • 著者名/発表者名: Kimura S., Suzuki T.
  • 雑誌名: Biochimica et Biophysica Acta 巻: 1853 号: 6 ページ: 1272-1283
  • DOI: 10.1016/j.bbamcr.2014.12.010
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Defining fundamental steps in the assembly of Drosophila RNAi enzyme complex (2015)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Iwasaki, Hiroshi M. Sasaki, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Hisashi Tadakuma, & Yukihide Tomari
  • 雑誌名: Nature 巻: NA 号: 7553 ページ: 0-0
  • DOI: 10.1038/nature14254
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Transcriptome-wide identification of adenosine-to-inosine editing using the ICE-seq method (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki, T., Ueda, H., Okada, S. and Sakurai, M.
  • 雑誌名: Nature Protocol 巻: 10 号: 5 ページ: 715-732
  • DOI: 10.1038/nprot.2015.037
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Biochemical and transcriptome-wide identification of A-to-I RNA editing sites by ICE-seq (2015)
  • 著者名/発表者名: Okada, S., Sakurai, M., Ueda, H. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Methods in Enzymol 巻: 560 ページ: 331-353
  • DOI: 10.1016/bs.mie.2015.03.014
  • ISBN: 9780128021927
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nucleoside analysis by hydrophilic interaction liquid chromatography coupled with mass spectrometry (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakaguchi, Y., Miyauchi, K., Kang, B. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Methods in Enzymol 巻: 560 ページ: 19-28
  • DOI: 10.1016/bs.mie.2015.03.015
  • ISBN: 9780128021927
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ribosomal RNA methyltransferases contribute to Staphylococcus aureus virulence (2015)
  • 著者名/発表者名: Kyuma T, Kimura S, Hanada Y, Suzuki T, Sekimizu K, Kaito C
  • 雑誌名: FEBS J. 巻: 282 号: 13 ページ: 2570
  • DOI: 10.1111/febs.13302
  • URL: https://pure.teikyo.jp/en/publications/fc32efa5-06e5-4013-80a5-f23105024de8
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] RlmCD-mediated U747 methylation promotes efficient G748 methylation by methyltransferase RlmAⅡ in 23S rRNA in Streptococcus pneumoniae; interplay between two rRNA methylations responsible for telithromycin susceptibility. (2015)
  • 著者名/発表者名: Shoji T, Takaya A, Sato Y, Kimura S, Suzuki T, Yamamoto T
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 43 号: 18 ページ: 8964-72
  • DOI: 10.1093/nar/gkv609
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Destabilization of microRNA-122 in human cells by 3’ deadenylation mediated by PARN and CUGBP1 (2015)
  • 著者名/発表者名: Katoh, T., Hojo, H. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 43 号: 15 ページ: 7521-7534
  • DOI: 10.1093/nar/gkv669
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A single methylation of 23S rRNA triggers late steps of 50S ribosomal subunit assembly (2015)
  • 著者名/発表者名: Arai, T., Ishiguro, K., Kimura, S., Sakaguchi, Y., Suzuki, T. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 巻: 112 号: 34
  • DOI: 10.1073/pnas.1506749112
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Regulation of gene expression via retrotransposon insertions and the noncoding RNA 4.5S RNAH. (2015)
  • 著者名/発表者名: Ishida K, Miyauchi K, Kimura Y, Mito M, Okada S, Suzuki T, Nakagawa S.
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 20 号: 11 ページ: 887-901
  • DOI: 10.1111/gtc.12280
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Rectifier of aberrant mRNA splicing recovers tRNA modification in familial dysautonomia. (2015)
  • 著者名/発表者名: Yoshida M, Kataoka N, Miyauchi K, Ohe K, Iida K, Yoshida S, Nojima T, Okuno Y, Onogi H, Usui T, Takeuchi A, Hosoya T, Suzuki T, Hagiwara M.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 112（9） 号: 9 ページ: 2764-2769
  • DOI: 10.1073/pnas.1415525112
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Cdk5rap1-mediated 2-methylthio modification of mitochondrial tRNAs governs protein translation and contributes to myopathy in mice and humans. (2015)
  • 著者名/発表者名: Wei FY, Zhou B, Suzuki T, Miyata K, Ujihara Y, Horiguchi H, Takahashi N, Xie P, Michiue H, Fujimura A, Kaitsuka T, Matsui H, Koga Y, Mohri S, Suzuki T, Oike Y, Tomizawa K.
  • 雑誌名: Cell Metab 巻: 21 号: 3 ページ: 413-6
  • DOI: 10.1016/j.cmet.2015.01.019
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A complete landscape of post-transcriptional modifications in mammalian mitochondrial tRNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: Suzuki T. and Suzuki T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: (in press) 号: 11 ページ: 7346-7357
  • DOI: 10.1093/nar/gku390
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Discovery of the b-barrel-type RNA methyltransferase responsible for N6-methylation of N6-threonylcarbamoyladenosine in tRNAs (2014)
  • 著者名/発表者名: Kimura S., Miyauchi K., Ikeuchi Y., Thiaville PC., Crecy-Lagard Vd., Suzuki T.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Research 巻: 42 号: 14 ページ: 9350-9365
  • DOI: 10.1093/nar/gku618
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A single acetylation of 18S rRNA is essential for biogenesis of the small ribosomal subunit in Saccharomyces cerevisiae (2014)
  • 著者名/発表者名: Ito, S., Akamatsu, Y., Noma, A., Kimura, S., Miyauchi, K., Ikeuchi, Y., Suzuki, T. and Suzuki, T
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 289 号: 38 ページ: 26201-26212
  • DOI: 10.1074/jbc.m114.593996
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Human NAT10 is an ATP-dependent RNA acetyltransferase responsible for N4-acetylcytidine formation in 18S rRNA (2014)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Ito, Sayuri Horikawa, Tateki Suzuki, Hiroki Kawauchi, Yoshikazu Tanaka, Takeo Suzuki, and Tsutomu Suzuki
  • 雑誌名: The Journal of Biological Chemistry 巻: 289 号: 52 ページ: 35724-35730
  • DOI: 10.1074/jbc.c114.602698
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 5-Hydroxymethylcytosine plays a critical role in glioblastomagenesis by recruiting the CHTOP-Methylosome complex (2014)
  • 著者名/発表者名: Hiroki Takai, Tetsu Akiyama et al.
  • 雑誌名: Cell Reports 巻: 9 号: 1 ページ: 48
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.08.071
  • URL: https://localhost/en/publications/faa4b7c1-5309-40ea-a2ad-a9e0a109b0d2
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Convergent evolution of AUA decoding in bacteria and archaea (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki and Tomoyuki Numata
  • 雑誌名: RNA Biology 巻: 11 号: 12 ページ: 1586-1596
  • DOI: 10.4161/15476286.2014.992281
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] Quality control of protein synthesis by peptidyl-tRNA drop off in the early elongation stage (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Ribosome Structure and Function 2019
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] RNA modification, a chemical diversity for biological function (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 20th Takeda Science Foundation Symposium on Bioscience“RNA Neobiology”
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Dynamic regulation of RNA modification in health and disease (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Translation Machinery in Health and Disease (Gordon Research Conference)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metabolic and Chemical Regulation of RNA Modifications Associated with Various Biological Processes (2019)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: RNA Editing, Next-Generation Epitranscriptomics in Health and Disease (Gordon Research Conference)
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metabolic regulation of tRNA modifications associated with mitochondrial diseases (2018)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: EMBO workshop on "Molecular Biology of Mitochondrial Gene Expression" in 2018
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] RNA修飾によるエピトランスクリプトーム制御と疾患 (2018)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 日本筋学会第4回学術集会
  • 招待講演
• [学会発表] Dynamic regulation of tRNA modification under physiological and pathological conditions (2018)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 27th tRNA conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metabolic regulation of RNA modification associated with human disease (2018)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 熊大発生医学研HIGOセミナー
  • 招待講演
• [学会発表] RNA modification, a chemical diversity for biological function (2018)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 2nd Joint Australia-Japan joint RNA meeting 2018
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of mitochondrial disease caused by tRNA modification deficiency (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: FASEB science research conferences-Mitochondrial Biogenesis and Dynamics in Health, Disease and Aging
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of human disease caused by tRNA modification deficiency (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 43rd Naito Conference- Noncoding RNA：Biology, Chemistry, & Diseases
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] RNA修飾によるエピトランスクリプトーム制御と疾患 (2017)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 千里ライフサイエンスセミナー: 生命を司り、操る～ノンコーディングRNAの底知れぬ力
  • 招待講演
• [学会発表] Metabolic regulation of tRNA modification associated with human disease (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: IMB symposium on Nucleic Acid Modification
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 細胞内メタボライトを感知するRNA修飾と疾患 (2017)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: IIBMP2017シンポジウム「ポストゲノム時代のRNAバイオロジー」
  • 招待講演
• [学会発表] "Metabolic regulation of RNA modification associated with human disease " (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Cold Spring Harbor Asia "RNA modification and epitranscriptome"
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Metabolic regulation of RNA modification associated with human disease (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: ConBio2017 "Emerging world of RNA modifications and epitranscriptome"
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] RNA mass spectrometry: a platform technology for emerging world of RNA modifications and epitranscriptome (2017)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第1回京都生体質量分析研究会シンポジウム
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] RNA修飾によるエピトランスクリプトーム制御と疾患 (2017)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 富山RNAワークショップ（富山大生命融合科学教育部セミナー）
  • 招待講演
• [学会発表] Pre-tRNA capping in yeast and mammals (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: IBS-CNRS Joint RNA Symposium
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2016-03-21
  • 招待講演
• [学会発表] RNA修飾の多彩な機能と疾患 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 国際高等研究所プロジェクト「生命活動を生体高分子への修飾から俯瞰する」平成27年度研究会
  • 発表場所: 国際高等研究所、京都府木津川市
  • 年月日: 2016-02-09
  • 招待講演
• [学会発表] RNAから病気の原因を探る (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 東京大学化学生命工学専攻公開講座「化学生命工学―未来への挑戦－」
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス、東京都文京区
  • 年月日: 2016-01-23
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of human mitochondrial diseases associated with decoding disorder (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: RNA2016 satellite-symposium 'Nascent biology and Ribosome functions'
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Insights into molecular pathogenesis of mitochondrial diseases caused by tRNA modification deficiency (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 26th tRNA conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Biogenesis and physiological role of 5-formylcytidine in human mitochondrial tRNA (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: RNA modifications and epitranscriptomics conference
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 翻訳初期段階におけるペプチジルtRNAの脱落と校正機構 (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 第89回日本生化学会大会
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of mitochondrial diseases caused by tRNA modification deficiency (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: The 13th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research and Medicine
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of human diseases caused by RNA modification deficiency (2016)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 第39回日本分子生物学会年会
  • 招待講演
• [学会発表] Post-transcriptional modifications in human mitochondrial tRNAs associated with pathological consequences (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: MitoClub
  • 発表場所: Cologne, Germany
  • 年月日: 2015-11-18
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of mitochondrial disease caused by tRNA modification deficiency (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 12th Conference of the Asian Society of Mitochondrial Research and Medicine (ASMRM)
  • 発表場所: Zhejiang, China
  • 年月日: 2015-11-14
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular pathogenesis of mitochondrial disease caused by tRNA modification deficiency (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: MitoCross Symposium 2015: mitochondria at the crossroad
  • 発表場所: Strasbourg, France
  • 年月日: 2015-09-21
  • 招待講演
• [学会発表] RlmE-mediated methylation of 23S rRNA triggers late steps of 50S ribosomal subunit assembly (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: EMBO Conference on Ribosome Synthesis
  • 発表場所: Brussels, Belgium
  • 年月日: 2015-08-19
• [学会発表] RNA修飾の多彩な機能と疾患 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 名古屋市立大学薬学会特別講演会
  • 発表場所: 名古屋市立大、愛知県名古屋市
  • 年月日: 2015-06-04
  • 招待講演
• [学会発表] 質量分析装置(MS)を使いこなす－核酸の修飾を見る－ (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 高知大学ESPO 教育プログラム
  • 発表場所: 高知大学、高知県高知市
  • 年月日: 2015-06-03
  • 招待講演
• [学会発表] RNA修飾の生合成と機能―硫黄代謝との関連を中心に― (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 文部科学省 新学術領域研究（研究領域提案型）「酸素生物学」「第２回新学術領域技術支援セミナー」
  • 発表場所: 東北大学医学部、宮城県仙台市
  • 年月日: 2015-04-30
  • 招待講演
• [学会発表] Essential RNA acetyltransferase required for ribosome biogenesis and tRNA modification (2015)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: GRC on RNA editing and modification（招待講演）
  • 発表場所: Lucca, Italy
  • 年月日: 2015-03-09
• [学会発表] RNA修飾の多彩な機能と疾患 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター学術集会（招待講演）
  • 発表場所: 埼玉医科大学ゲノム医学研究センター、埼玉県日高市
  • 年月日: 2015-01-27
  • 招待講演
• [学会発表] Mitochondrial diseases caused by deficient tRNA modifications (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: AussieMit2014（招待講演）
  • 発表場所: Perth, Australia
  • 年月日: 2014-12-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] A single acetylation of 18S rRNA regulates ribosome biogenesis by sensing cellular energy status (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: Joint Australia and Japan RNA meeting (JAJRNA2014)（招待講演）
  • 発表場所: Sydney, Australia
  • 年月日: 2014-11-05
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Biogenesis and function of cyclic t6A and derivatives (2014)
  • 著者名/発表者名: Tsutomu Suzuki
  • 学会等名: 25th tRNA conference（招待講演）
  • 発表場所: Kyllini, Greece
  • 年月日: 2014-09-22
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] ヒトはなぜ病気になるのでしょう？～病気の原因を分子レベルで探る～ (2014)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 学会等名: 高校生のためのオープンキャンパス2014（招待講演）
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス、東京都文京区
  • 年月日: 2014-08-06
  • 招待講演
• [図書] RNA修飾の変動と生命現象／実験医学 2018年12月号 (2018)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 総ページ数: 7
  • 出版者: 羊土社
  • ISBN: 9784758125147
• [図書] シュードウリジン化／生体の科学2018年10月号 (増大号) タンパク質・核酸の分子修飾 (2018)
  • 著者名/発表者名: 北川 翔・鈴木 勉
  • 総ページ数: 1
  • 出版者: 医学書院
• [図書] ヒドロキシル化／生体の科学2018年10月号 (増大号) タンパク質・核酸の分子修飾 (2018)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 健夫・鈴木 勉
  • 総ページ数: 1
  • 出版者: 医学書院
• [図書] ミトコンドリアtRNA修飾の機能と疾患 (医学のあゆみ) (2017)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 総ページ数: 8
  • 出版者: 医歯薬出版株式会社
• [図書] RNA修飾のケミカルバイオロジー (現代化学4月号) (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉
  • 総ページ数: 4
  • 出版者: 東京化学同人
• [図書] RNA修飾の多彩な機能と疾患 (ノンコーディングRNA-RNA分子の全体像を俯瞰する) (2016)
  • 著者名/発表者名: 鈴木 勉, 大平 高之
  • 総ページ数: 39
  • 出版者: 化学同人
• [備考] 意外な小分子がRNAの化学修飾に関与していた－酢酸イオンを基質とするtRNAアセチル化酵素の発見
  • URL: https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/articles/z0508_00075.html
• [備考] 炭酸ガスに敏感なRNAの化学修飾―tRNA修飾とワールブルク効果の関係性
  • URL: https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/articles/z0508_00026.html
• [備考] メチルは端だが役に立つ？ ―mRNA のキャップ構造における m6A 修飾酵素の同定
  • URL: https://www.t.u-tokyo.ac.jp/shared/press/data/setnws_201811270918295542170205_190437.pdf#search=%27%E3%83%A1%E3%83%81%E3%83%AB%E3%81%AF%E7%AB%AF%27
• [備考] RNAの化学修飾が遺伝暗号を変える 変則遺伝暗号の成立に関わる新規tRNA修飾塩基の発見
  • URL: https://www.u-tokyo.ac.jp/focus/ja/articles/a_00613.html
• [備考] 変則暗号の成立に寄与する新規のtRNA修飾の発見
  • URL: https://first.lifesciencedb.jp/16978
• [備考] 転移RNAの成熟を助ける意外な方法 出芽酵母のtRNA前駆体はキャップ修飾により安定化されている
  • URL: https://www.u-tokyo.ac.jp/ja/utokyo-research/research-news/unexpected-modification-to-support-maturation-of-transfer-RNA.html
• [備考] tRNA前駆体は5’キャップ構造により安定化されている
  • URL: http://first.lifesciencedb.jp/archives/12799
• [備考] 変則的な暗号を解読するためのはじめの一歩 ミトコンドリアゲノムの解読に必須なメチル化酵素を同定
  • URL: https://www.u-tokyo.ac.jp/ja/utokyo-research/research-news/first-step-to-deciphering-a-non-universal-genetic-code.html
• [備考] 変則的な遺伝暗号の解読をつかさどるf5C修飾はNSUN3によるメチル化からはじまる
  • URL: http://first.lifesciencedb.jp/archives/12537
• [備考] http://rna.chem.t.u-tokyo.ac.jp/
• [備考] http://rna.chem.t.u-tokyo.ac.jp/
• [学会・シンポジウム開催] Cold Spring Harbor Asia "RNA modification and epitranscriptome" (2017)
• [学会・シンポジウム開催] ConBio2017 "Emerging world of RNA modifications and epitranscriptome" (2017)