• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

DNAと塩基配列特異的に相互作用する多機能金属錯体

研究課題

研究課題/領域番号 01470047
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 無機・錯塩・放射化学
研究機関東京大学

研究代表者

黒田 玲子  東京大学, 教養学部, 助教授 (90186552)

研究分担者 山岸 晧彦 (山岸 皓彦)  東京大学, 教養学部, 助教授 (70001865)
岩本 振武  東京大学, 教養学部, 教授 (60011532)
研究期間 (年度) 1989 – 1990
研究課題ステータス 完了 (1990年度)
配分額 *注記
5,700千円 (直接経費: 5,700千円)
1990年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
1989年度: 4,500千円 (直接経費: 4,500千円)
キーワードDNA / インタ-カレ-ション / ポルフィリン錯体 / インタカレ-ション
研究概要

我々は天然のタンパク質や生理活性動質の示すDNA塩基配列認識機構を解明し、複数の機能を合わせ持つことにより新しい機能を発現する化合物の開発をめざしている。本研究ではプロ-ブとして優れた特徴をもつポルフィリン金属錯体を対象に選んだ。
前年度に合成した新しい一連のポルフィリン錯体とDNAとの相互作用の塩基配列特異性を制限酵素の切断阻害度で調べた。基質DNAにポルフィリン錯体を結合させた後に酵素で切断すると、二つの認識切断部位中、隣接部位がGCリッチなサイト1の方が特異的に阻害されることを発見した。これはマンガン錯体では起こらない。DNAのみでは二ツのサイトの切断速度がほぼ等しいので、切断速度の違いはポルフィリンがDNAにインタ-カレ-トしたためである。各サイトでの結合を、 ^<32>Pで標識したDNAの DNase I およびOHラジカルによるフットプリンティングで比較した。サイト1の 5'側隣接部位 5'ーTTATGCCGGTACTー3'に DNase I より保護された部分が見つかったが、3'近傍にある同じ5'ーGCCGー3' にはフットプリントが全く見られなかった。サイト2近傍にはフットプリントが見られない。保護された配列は予測に反してATリッチであった。この矛盾の解明は、これからの面白い課題である。
さらに、ポルフィリンより伸ばしたペンタあるいはヘキサメチレン鎖の先にDNAの塩基配列を認識する化合物を第2の結合物位としてつけた化合物の合成に成功し、DNAとの相互作用を検討した。現在、鉄錯体の精製を行っているが、DNA鎖切断の塩基配列特異性を調べる予定である。また、DNAオリゴマ-とポルフィリン錯体との複合体の単結晶の調製にも成功した模様である。結晶が小さすぎるので、目下、解析に適した単結晶の調製の努力しているが、相互作用の詳細な情報が得られると期待される。

報告書

(3件)
  • 1990 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1989 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (24件)

  • [文献書誌] R.Kuroda: "DNA binding and Interaction by Novel Porphyrins:Role of Charge and Substituents Probed by DNase I footprinting and Topoisomerase I Unwinding." FEBS Letters. 262. 293-298 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.SKelly: "Conformational Effects of Nucleotide Exchange in Ras P21 Proteins as Studied by Fluorescence Spectroscopy." FEBS Letters. 262. 127-130 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] O.M.Ni.Dhubhghaill: "Gold(I) Complexes of 1ーDiphenylphosphinoー2ーdiphenyl arsinoethane(appe):Solution Studies, Xーray Crystal Structures and Cytotoxicity of[(AuCl)_2(appe)]・0.5DMA and [Au(appe)_2]Cl・2H_2O." J.Chem.Soc.Dalton Transaction. 2913-2921 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Chiral Discriminations of Complexes with D_3 Symmetry.Molecular Structure and Crystal Packing Mode of (ー)_<589>ー Tris (ー)ーcyclicー0,0'ー1(R),2(R)dimethylethylenedithioー Phosphato Chromium(III),{Cr[(ー)bdtp]_3}." J.Chem.Soc.Dalton Transaction. 3393-3397 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Photocleavage of DNA by the pーNitrobenzoyl Group:Selective Attack in the Major or the Minor Groove of DNA." Nucleic Acids Research.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Structures of Two Novel photonucleases: 3,6ーDiaminoー10ー[6ー(4ーnitrobenzoyloxy)hexyl]acridinium Chloride and 9ー[6ー(4ーNitrobenzoyloxy)hexylamino]acridine Hydrochloride." Acta Crystallographica.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R. Kuroda, E. Takahashi, C. A. Austin and L. M Fisher: "DNA binding and Interaction by Novel Porphyrins : Role of Charge and Substituents Probed by DNase I footprinting and Topoisomerase I Unwinding." FEBS Letters,. 262,. 293-298 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J. V. Skelly, D. A. Suter, R. Kuroda, S. Neidle, J. F. Hancock and A. F. Drake: "Conformational Effects of Nucleotide Exchange in Ras P21 Proteins as Studied by Fluorescence Spectroscopy." FEBS Letters,. 262,. 127-130 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] O. M. Ni. Dhubhghaill, P. J. Sadler and R. Kuroda: "Gold (I) Complexes of 1-Diphenylphosphino-2-diphenyl-arsinoethane (appe) : Solution Studies, X-ray Crystal Structures and Cytotoxicity of [(AuCl)_2(appe)]・0.5DMA and [Au(appe)_2]Cl・2H_2O." J. Chem. Soc. Dalton,. 2913-2921 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R. Kuroda and P. Biscarini: "Chiral Discriminations of Complexes with D_3 Symmetry. Molecular Structure and Crystal Packing Mode of (-)_<589>- Tris (-)-cyclic-0, 0'-1(R), 2(R)dimethylethylenedithiophosphato Chromium (III), {Cr[(-)bdtp]_3}." J. Chem. Soc. Dalton,. 3393-3397 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R. Kuroda and M. H. shinomiya: "Photocleavage of DNA by the p-Nitrobenzoyl Group : Selective Attack in the Major or the Minor Groove of DNA." Nucleic Acids Research,.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R. Kuroda and M. H. Shinomiya: "Structures of Two Novel photonucleases : 3, 6-Diamino-10-[6-(4-nitrobenzoyloxy)hexyl] acridinium Chloride and 9-[6-(4-Nitrobenzoyloxy)hexylamino] acridine Hydrochloride." Acta Crystallographica,.

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] R.Kuroda: "DNA bindind and Interaction by Novel Porphyrins:Role of Charge and Substituents Probed by DNase I footprinting and Topoisomerase I Unwinding." FEBS Letters. 262. 293-298 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] J.Skelly: "Conformational Effects of Nucleotide Exchange in Ras P21 Proteins as Studied by Fluorescence Spctroscopy." FEBS Letters. 262. 127-130 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] O.M.Ni.Dhubhghaill: "Gold(I) Complexes、of 1ーDiphenylphosphinoー2ーdiphenylarsinoethane(appe):Solution Studies,Xーray Crystal Structures and Cytotoxicity of[(AuCl)_2(aPPe)]・0.5DMA and [Au(appe)_2]Cl・2H_2O." J.Chem.Soc.Dalton Transaction. 2913-2921 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Chiral Discriminations of Complexes with D_3 Symmetry.Molecular Structure and Crystal Packing Mode of (-)_<589>Tris (-)ーcyclicー0,0'-1(R),2(R)dimethylethylenedithiophosphato Chromium(III),{Cr[(-)bdtp]_3}." J.Chem.Soc.Dalton Transaction. 3393-3397 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Photocleavage of DNA by the pーNitrobenzoyl Group:Selective Attack in the Major or the Minor Groove of DNA." Nucleic Acids Research.

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Structures of Two Novel photonucleases:3,6ーDiaminoー10ー[6ー(4ーnitrobenzoyloxy)hexyl]acridinium Chloride and 9ー[6ー(4ーNitrobenzoyloxy)hexylamino]acridine Hydrochloride." Acta Crystallographica.

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] R.Kuroda: "DNA Binding and Interaction by Novel Porphyrins:Role of Charge and Substituents Probed by DNase I footprinting and Topoisomerase I Unwinding" FEBS Letters. in-press (1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] R.C.McKenna: "Structure of Three DNA Cross-Linking Agents,Ethane-1,2-di(methylsulfonate),Propane-1,3-di(methlsulfonate)and n-Butane-1,4-di(methylsulfonate)." Acta Crystallographica. C45. 311-314 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Host-Guest Chemistry in Biological Systems:Molecular Basis of DNA-Ligand Interactions." J.Synthetic Organic Chemistry. 47. 547-556 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] P.Biscarini: "Stereoselective Synthesis and Characterization of the Optically Labile Chiral Cr(III) Complex -(+)_<589>-(Cr((-)bdtp)_3)." Inorganic Chimica Acta. 154. 209-214 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] M.E.Cullen: "Cloning and Characterization of a DNA Gyrase A Gene from Escherichia coli that Confers Clinical Resistanceto 4-Quinolones." Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 33. 886-894 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yamamura: "Synthesis and Structure of a Thiolato Amine Nickel Complex.(N,N!-Ethylenebis(thiosalicylidenaminato) Nickel(II)." Chemistry Letters. 1245-1246 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書

URL: 

公開日: 1989-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi