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RNAポリメラ-ゼの機能ドメインの解析

研究課題

研究課題/領域番号 01480530
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 代謝生物化学
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

石浜 明  国立遺伝学研究所, 分子遺伝研究系, 教授 (80019869)

研究分担者 永田 恭介  国立遺伝学研究所, 分子遺伝研究系, 助手 (40180492)
山岸 正裕  国立遺伝学研究所, 分子遺伝研究系, 助手 (00220252)
藤田 信之  国立遺伝学研究所, 分子遺伝研究系, 助手 (90173434)
研究期間 (年度) 1989 – 1990
研究課題ステータス 完了 (1990年度)
配分額 *注記
6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
1990年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
1989年度: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
キーワードRNAポリメラ-ゼ / 機能ドメイン / 転写制御 / サブユニット集合 / 転写因子 / 欠失突然変異 / 大腸菌 / 酵素再構成 / 緊縮制御 / 突然変異 / DNAシ-クエンス
研究概要

遺伝情報転写に関与する酵素RNAポリメラ-ゼのもつ複雑高次の情報処理機能を支える構造基盤とそれら諸機能の制御機構を解明する目的で、組織的・系統的研究を展開した。機能ドメインの解析は,主として大腸菌RNAポリメラ-ゼを改究対象としたが,併せて他の細菌やウイルス,分裂酵母RNAポリメラ-ゼの研究も行ない,比較検討する方法も採用した。大腸菌RNAポリメラ-ゼの機能地図作成に関しては,本年度下記の成果が得られた。
1)αサブユニットの機能ドメインを解析する目的で,C端からの欠失変異コレクションを作製し,各単離サブユニットから試験管内で変異酵素を再構成し,それらの機能欠損を調査した。その結果,N端側にサブユニット集合の機能部位,C端側に各種転写促進因子との相互作用に必須の領域があることが示唆された。これら転写因子はいずれもプロモ-タ-より上流に結合したRNAポリメラ-ゼに作用することから,RNAポリメラ-ゼはββ^1を失頭にしてプロモ-タ-に結合することが予想される。
2)βサブユニットの機能部位地図は,点突然変異コレクションを用いた解析によって大略が判明した。この結果を検証し,さらに詳細な機能地図づくりを目標に,内部小欠失作製を試みた。新たな方法開発についとは, 助手・藤田信之が英国に出向き共同研究によって確立した。
3)αサブユニットの機能地図については,大腸菌でも多数の分子種の存在が知られているので,更に未知の分子種を探索し,全分子種の構造・機能を比較する方法を採択した。また,σ分子種間でハイブリッドを作製し,機能部位を同定する試みも開始した。これもまた,日英共同研究の一環として実施している。

報告書

(3件)
  • 1990 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1989 実績報告書
  • 研究成果

    (43件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (43件)

  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Molecular assembly and functional modulation of Escherichia coli RNA polymerase." Adv.Biophys.26. 19-31 (1990)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi,K.: "Sequence determination of two temperatureーsensitive mutations in the alpha subunit gene (rpoA) of Eschericha coli RNA polymerase." Nucleic Adids Res.18. 5945-5948 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kobayashi,M.: "Promoter selectivity of Escherichia coli RNA polymerase:Effect of base substitutions in the promoter ー35 region on promoter strength." Nucleic Acids Res.18. 7367-7372 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi,K.: "Identification of a subunit assembly domain in the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase." J.Mol.Biol.218. 1-6 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakayma,M.: "Identification and characterization of RNA polymerase sigma subunit from Micrococcus luteus." J. Biol. Chem.266. 2911-2916 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hayward,R.S.: "Functional specialization within the alpha of subunit of Escherichia coli RNA polymerase." J.Mol.Biol.219. (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Control of Cell Growth and Division" Jpn.Sci.Soc.Press/SpringerーVerlag, 266 (1991)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Structure and Function of Nucleic Acids and Proteins" Raven Press, 336 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi, K., Fajita, N. and Ishihama, A.: "Promoter selectivity of Escherichia coli RNA polymerase : Omega factor is responsible for the ppGpp sensitivity" Nucleic Acids Res.17. 8755-8765 (1989)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakayama, M., Fujita, N., Osawa, S. and Ishihama, A.: "Micrococcus luteus, a bacteriu with a high G+C content, contains Escherichia coli-typepromoters." Mol. Gen. Genet.218. 384-389 (1989)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueshima, R., Fujita, N. and Ishihama, A.: "DNA supercoiling and temperature shift affect the promoter activity of the Escherichia coli rpoH gene encoding the heat-shock sigma subunit of RNA polymerase." Mol. Gen. Genet.215. 185-189 (1989)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi, K., Fujita, N. and Ishihama, A.: "Sequence analysis of two temperature-sensitive mutations in the alpha subunit gene (rpoA) of Escherichia coli RNA polymerase." Nucleic Acids Res.18. 5945-5948 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi, K., Fujita, N. and Ishihama, A.: "Identificataion of a subunit assembly domain in the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase." J. Mol. Biol.218. 1-6 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kobayashi, M., Nagata, K. and Ishihama, A.: "Promoter selectivity of Escherichia coli RNA polymerase : Effect of base substitution in the promoter -35 region on promoter strength." Nucleic Acids Res.18. 7367-7372 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wada, A., Yamazaki, Y., Fujita, N. and Ishihama, A.: "Structure and probable genetic location of a "ribosome modulation factor" associated with 100S ribosomes in stationary-phase Escherichia coli." Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 87. 2657-2661 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Azuma, Y., Yamagishi, M., Ueshima, R. and Ishijima, A.: "Cloning and sequence determination of the Schizosaccharomyces pombe rpb1 gene encoding the largest subunit of RNA polymerase II." Nucleic Acids Res.19. 461-468 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hayward, R. S., Igarashi, K. and Ishihama, A.: "Functional specialization within the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase." J. Mol. Biol.

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi, K. and Ishihama, A.: "Bipartite functional organization of the alpha subuni of Escherichia coli RNA polymerase : Involvement of the C-terminal region in the transcription activation by cAMP-CRP." Cell.

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Igarashi, K., Hanamura, A., Makino, K., Aiba, Hirofumi, Aiba, Hiroji, Mizuno, T., Nakata, A. and Ishihama, A.: "Bipartite functional organization of the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase : Two modes of transcription activation positive factors." Cell.

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ozaki, M., Wada, A., Fujita, N. and Ishihama, A.: "Growth phase-dependent conversion of RNA polymerase in Eschelichia coli." Mol. Gen. Genet.

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kajitani, M. and Ishihama, A.: "Identification and sequence determination of the host factor for bacteriophage Q" Nucleic Acids Rec.

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makayama, M., Fujita, N., Osawa, S. and Ishihama, A.: "Identification and characterization of RNA polymerase sigma factor from Microcuccus luteus." J. Biol. Chem. 266. 2911-2916 (1991)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama, A.: "Molecular assembly and functional modulation of Escherichia coli RNA polymerase." Adv. Biophys.Vol. 26. 19-31 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama, A., Fujita, N., Igarashi, K. and Ueshima, R.: "Structural and functional modulation of Escherichia coli RNA polymerase." Structure and Function of Nucleic Acids and Proteins (Wu, C-W. and Wu, F. Y. -H., eds.145-152 (1990)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama, A.: "Global control of gene expression in bacteria" Control of Cell Growth and Division (Ishihama, A. and Yoshikawa, H., eds.). 121-140 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama, A.: "Genes for cell growth and division in Eschrichia coli" Control of Cell Growth and Division (Ishihama, A. and Yoshikawa, H., eds.). 199-204 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama, A., Igarashi, K., Ozaki, M., Hayward, R, S. and Yamagishi, M.: "The promoter selectivity of Escherichia coli RNA polymerase" Gene Expression (Matsubara, K. et al., eds.), Mochida Memorial Found.

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Molecular assembly and functional modulation of <Escherichia>___ー <coli>___ー RNA polymerase." Adv.Biophys.26. 19-31 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Igarashi,K.: "Sequence determination of two temperatureーsensitive mutations in the alpha subunit gene (<rpoA>___ー) of <Eschericha>___ー <coli>___ー RNA polymerase." Nucleic Acids Res.18. 5945-5948 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Kobayashi,M.: "Promoter selectivity of <Escherichia>___ー <coli>___ー RNA polymerase:Effect of base substitutions in the promoter -35 region on promoter strengrh." Nucleic Acids Res.18. 7367-7372 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Igarashi,K.: "Identification of a subunit assembly domain in the alpha subunit of <Escherichia>___ー <coli>___ー RNA polymerase." J.Mol.Biol.218. 1-6 (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Nakayama,M.: "Identification and characterization of RNA polymerase sigma subunit from <Micrococcus>___ー <luteus>___ー." J.Biol.Chem.266. 2911-2916 (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Hayward,R.S: "Functional specialization within the alpha subunit of <Escherichia>___ー <coli>___ー RNA polymerase." J.Mol.Biol.219. (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Control of Cell Growth and Division" Jpn.Sci.Soc.Press/SpringerーVerlag, 266 (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Structure and Eunction of Nucleic Acids and Proteins" Raven Press, 336 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Promoter selectivity of prokaryotic RNA polymerases." Trends Genet.4. 282-286 (1988)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Igarashi,K.: "Promoter selectivity of Escherichi coli RNA polymerase:Omega factor is responsible for the ppGpp sensitivity." Nucleic Acids Res.17. 8755-8765 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Ueshima,R.: "DNA supercoiling and temperature shift affect the promoter activity of the Escherichia coli rpoH gene encoding the heatーshock sigma subunit of RNA polymerase." Mol.Gen.Genet.215. 185-189 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Nakayama,M.: "Micrococcus luteus,a bacterium with a high G+C content,contains Escherichia coliーtype promoters." Mol.Gen.Genet.218. 383-389 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Wada,A.: "Structure and probable genetic map of a ribosome modulation factor associated with 100s ribosome in stationaryーphase Escherichia coli." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. (1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Igarashi,K.: "Functional mapping of the alpha subunit of Escherichia coli RNA polymerase." J.Mol.Biol.(1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Switching and Movements of Protein Molecules and Their Assemblies" Jpn.Sci.Soc.Press,Tokyo/Elsevier,Amsterdam, (1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] Ishihama,A.: "Structure and Function of Nucleic Acids and Proteins" Raven Press,New,York, (1990)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書

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公開日: 1989-04-01   更新日: 2016-04-21  

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