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B型肝炎抗原蛋白の予測高次構造の精密化

研究課題

研究課題/領域番号 01490007
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 広領域
研究機関東京大学

研究代表者

長野 晃三  東京大学, 薬学部, 助教授 (30012636)

研究分担者 板井 昭子  東京大学, 薬学部, 助教授 (60012647)
研究期間 (年度) 1989 – 1990
研究課題ステータス 完了 (1990年度)
配分額 *注記
600千円 (直接経費: 600千円)
1990年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
キーワード正二十面体 / 糖鎖 / ジアシル型フオスフアチジルコリン / 分子充填モデル / 峡谷称構造 / 受容体 / 予測高次構造 / 原子差標 / 表面抗原 / preーS1領域 / preーS2領域 / コア抗原 / HBcAg dimer / HBsAg inner dimer / HBsAG outer dimer / B型肝炎ウィルス / ユア抗原 / アミノ酸配列 / 三次元構造予測 / 2分子会合体 / 小型球形粒子 / Dane粒子
研究概要

B型肝炎の小型球形粒子はHBsAgのinner dimer60分子とouter dimer60分子が正二十面体上にT=1の対称性で詰められることによって生成することが明らかとなった。inner dimerもouter dimerもすべて1分子1本ずつの糖鎖を持つことが明らかとなったので、中心部の空隙はすべて水であり、リピドはHBsAg dimerにつき22分子がβsheetの間にサンドイッチ状に結合するものだけで説明できることになった。ジアシル型フォスファチジルコリンを特異的に結合する理由は、保存されているグルタミンの側鎖の他に4本のβ鎖の端の酸アミドを考慮する必要がある。現在そのような合理的な分子充填モデルを構築中である。Dane粒子については先にHBcAg dimerがSS結合によって形成され、その上にHBsAgのinner dimerとouter dimerが乗ることによって、5回軸と擬6回軸が1:1の比率で存在する対称性T=3の正二十面体を形成することを予測した。Dane粒子の擬6回軸に形成されるpreーS1領域とpreーS2領域の峡谷称構造が肝細胞に存在すると思われる受容体によって特異的に認識される可能性がある。更にその部分がouter dimerが横すべりしてDane粒子の輪郭構造が崩れるのを防いで安定化していることも見出された。アジア型やアフリカ型の亜型によるアミノ酸の変異はすべて表面に現れるが、受容体に認識されることはないような凹みや陰にかくれるようになっている。一方、5回軸の方はHBsAgのsmall woleculeN端やC端がそのまま現れており、やはり峡谷称構造を形成しているが、こちらは肝細胞膜にHBsAgのN端が突入し、内部のDNAが注入されるように思われる。最近になってその部分の予測高次構造を組立てることが出来た。その原子座標を測定、合理的にし、既に組立てあるinneス dimerやouter dimerのDane粒子上の原子座標につないで、全体としても合理的な高次構造として仕上げて、発表する予定である。

報告書

(3件)
  • 1990 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1989 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (27件)

  • [文献書誌] K.NAGANO: "The Sideーbyーside Model of Two tRNA Molecules Allowing the αーHelical Conformation of the Nascent Polypeptid during the Ribosomal Transpeptdation" Biochimie. 印刷中. (1991)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 長野 晃三: "分子模型を利用したタンパク質高次構造の予側" バイオサイエンスとインダストリ-. 49(3). 111-116 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Predicted quaternary structure of hepatitis B Dane particle" Protein Engineering 2nd international Conference Kobe,August 20ー25,1989. 121-121 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Prediction of Threeーdimensional Model of Escherichia coli Ribosomal RNA" J.Theor.Biol.134. 199-256 (1988)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.ITAI: "A Receptor Model for Tumor Promotors,Rational Superposition of Teleocidins and Phorbol Esters" Proc.Natl.Acad.Sci.,U.S.A.85. 3688-3692 (1988)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 長野 晃三: "蛋白質の予測高次構造の立体的表示法" 病態生理. 6(10). 786-794 (1987)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Prediction of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation" PLENUM Publishing Corporation, 82 (1989)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Methods in Protein SEquence Analysis" SpringerーVerlag, 4 (1989)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K, Nagano, Takagi, and M. Harel: "The Side -by-side Model of Two tRNA Molecules Allowing the alpha-Helical Conformation of the Nascent Polypeptide during the Ribosomal Transpeptidation" Biochimie. (1991)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kozo Nagano: "Prediction of Higher-ordered Structure of Proteins by use of MARUZEN models" BIOSCIENCE AND INDUSTRY. 49(3). 111-116 (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Nagano, F. Iinuma, and A. Kano: "Predicted Quaternary Structre of Hepatitis B Dane Particle" Protein Engineering '89 Abstracts of 2nd Int. Conf. August 20-25, Kobe. 121 (1989)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Nagano, M. Harel, and M. Takezawa: "Prediction of Three-dimensional Model of Escherichia coli Ribosomal RNA" J. Theor. Biol. 134. 199-256 (1988)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Itai, Y. Kato, N. Tomioka, Y. Iitaka, E. Endo, M. Hasegawa, K. Shudo, H. Fujiki, and S. Sakai: "A receptor model for tumor promoters : Rational superposition of teleocidins and phorbol esters" Proc. Natl. Acad, Sci., U. S. A.85. 3688-3692 (1988)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kozo Nagano: "How to Display Three-dimensional Structures of Proteins by Predictive Methods" Medicina Philosophica (Byotai Seiri). 6(10). 786-794 (1987)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kozo Nagano: "A Computer Method of Finding Supersecondary Structures" Methods in Protein Sequence Analysis. Birkhauser Verlag. (1991)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kozo Nagano: "Prediction of Packing of Secondary Structure" Prediction of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation. PLENUM Publishing Coorporation. 467-548 (1989)

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      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Nagano, and F. Iinuma: "Membrane-controlled folding mechanism of hepatitis B surface antigens of human, woodchuck, ground squirrel and duck" Methods in Protein Sequence Analysis. Springer-Verlag. 385-388 (1989)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1990 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.NAGANO: "The Sideーbyーside Model of Two tRNA Molecules Allowing the αーHelical Conformation of the Nascent Polypeptide during the Ribosomal Transpeptidation" Biochimie. (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] 長野 晃三: "分子模型を利用したタンパク質高次構造の予測" バイオサイエンスとインダストリ-. 49(3). 111-116 (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Peptides,Chemistry,Structure and Biology" ESCOM, 2 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Methods in Protein Sequence Analysis" Birkhauser Verlag, 10 (1991)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Predicted quaternary structure of hepatitis B Dane particle" Protein Engineering 2nd International Conference Kobe,Angust 20-25,1989. 121-121 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Prediction of Three-dimensional Model of Escherichia coli Ribosomal RNA" J.Theor.Biol.134. 199-256 (1988)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] A.ITAI: "A Receptor Model for Tumor Promoters,Rational Superposition of Teleocidins and Phorbol Esters" Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85. 3688-3692 (1988)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] 長野晃三: "蛋白質の予測高次構造の立体的表示法" 病態生理. 6(10). 786-794 (1987)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Prediction of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation" PLENUM Publishing Corporation, 82 (1989)

    • 関連する報告書
      1989 実績報告書
  • [文献書誌] K.NAGANO: "Methods in Protein Sequence Analysis" Springer-Verlag, 4 (1989)

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      1989 実績報告書

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公開日: 1990-04-01   更新日: 2016-04-21  

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