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結核菌および非定型抗酸菌の特異的迅速DNA診断法の開発と臨床応用

研究課題

研究課題/領域番号 02557105
研究種目

試験研究(B)

配分区分補助金
研究分野 病態検査学
研究機関東京大学

研究代表者

永井 良三  東京大学, 医学部(病), 講師 (60207975)

研究分担者 黒尾 誠  東京大学, 医学部(病), 医員
中原 賢一  東京大学, 医学部(病), 医員
研究期間 (年度) 1990 – 1992
研究課題ステータス 完了 (1992年度)
配分額 *注記
11,100千円 (直接経費: 11,100千円)
1992年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
1991年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
1990年度: 7,000千円 (直接経費: 7,000千円)
キーワード結核菌 / 非定型抗酸菌 / PCR / ドットハイブリダイゼイション / dnaJ遺伝子 / オリゴヌクレオチドプローブ / dnaj遺伝子 / 結核 / 抗酸菌 / DNA診断 / RFLP
研究概要

本研究で我々は熱ショック蛋白をコードするdnaJ遺伝子から抗酸菌属を広く認識するPCRプライマーを開発した。このプライマーは臨床材料から見いだされる一般細菌44種のDNAとは反応せず、検討した19種の内M.cheloneiを除く18種抗酸菌DNAを増幅した。増幅された抗酸菌各種を同定するために、M.cheloneiを加えた全19種の増幅dnaJ遺伝子同一領域の塩基配列196bpを決定した。これら塩基配列を比較するとその制限酵素切断部位に多様性が認められ、SmaI、NaeI、HinfI、FokIの切断パターンにより、結核菌群と非定型抗酸菌の鑑別と非定型抗酸菌14種の9グループへの分別が可能であった(PCR-RFLP)。我々はさらに塩基配列の置換を詳細に検討し、臨床上重要な4種の抗酸菌DNA(M.tuberculosis、M.avium、M.intracellulare、M.kansasii)を特異的に認識する20塩基のオリゴヌクレオチドプローブを開発した。本PCRの検出感度は結核菌DNA約210fgでこれは50個の結核菌に相当する。PCR産物をさらに内側のプライマーで増幅することにより(Nested PCR)1個の結核菌の検出が可能となった。臨床材料98検体からPCR-RFLP法で抗酸菌DNAの検出を試みると、培養陽性21例では全て陽性、培養陰性77例中23例に抗酸菌DNAが検出された。これは本PCRの検出感度の高さを示す結果と考えられる。このように、PCR-RFLP法により、約1日で臨床材料からの抗酸菌DNAの高感度検出と、結核菌・非定型抗酸菌の鑑別同定が可能となった。さらに、塩基特異的オリゴヌクレオチドプローブを応用することで、本PCRは抗酸菌感染症の日常診断法として有用なシステムになりうると期待される。

報告書

(4件)
  • 1992 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1991 実績報告書
  • 1990 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (19件)

  • [文献書誌] 竹脇俊一・永井良三: "PCR法による抗酸菌のDNA診断" 医学のあゆみ. 158. 773-778 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 竹脇俊一・奥住捷子・永井良三・大久保昭行: "PCRによる抗酸菌の鑑別DNA診断" 臨床と微生物. 19. 175-182 (1992)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 竹脇俊一・奥住捷子・永井良三・大久保昭行: "感染症のDNA診断(2)PCRによる抗酸菌のDNA診断" 臨床科学. 28. 455-462 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 竹脇俊一・大久保昭行・永井良三: "PCRによる抗酸菌感染症診断" Biomedica. 7. 1190-1195 (1992)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takewaki S, Okuzumi K, Ishiko H, Ohkubo A, Nagai R.: "Genus-specific polymerase chainreaction for the mycobacterial dnaJ gene and species-specific oligonucleotide probes." J. Clin. Microbiol.31. 446-450 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 永井良三、竹脇俊一、和田昭仁、奥住捷子、飛田明子、大久保昭行: "PCRを用いた抗酸菌の迅速鑑別法の開発" 臨床病理. 38. 1247-1253 (1990)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ryozo Nagai, Shun-ichi Takewaki, Akihito Wada, Katsuko Okuzumi, Akiko Tobita and Akiyuki ohkubo: "Rapid Detection and Identification of Mycobacterial DNA BY PCR." Jpn.J.Clin.Pathol.Vol.38. 1247-1253 (1990)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shun-ichi Takewaki and Ryozo Nagai.: "Detection and Identification of Mycobacterial DNA by PCR." J.Clin.Exp.Med.(IGAKU NO AYUMI). Vol.158. 773-778 (1991)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shun-ichi Takewaki, Katsuko Okuzumi, Hiroaki Ishiko, Akiyuki Ohkubo and Ryozo Nagai: "Genus-specific polymerase chain reaction for the mycobacterial dnaJ gene and species-specific oligonucleotide probes." J.Clin.Microbiol.Vol.31. 446-450 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shun-ichi Takewaki, Katsuko Okuzumi, Ryozo Nagai, Akiyuki Ohkubo: "Differential diagnosis of tuberculosis and nontuberculous infectious diseases by PCR-RFLP." J.Clin.Sci. (Rinshou Kagaku). Vol.28. 455-462 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shun-ichi Takewaki, Katsuko Okuzumi, Ryozo Nagai, Akiyuki Ohkubo.: "Differential diagnosis of mycobacterial infections by PCR-RFLP and oligonucleotide probe." Biomedica.Vol.7. 1190-1195 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shun-ichi Takewaki, Katsko Okuzumi, Ryozo Nagai, Akiyuki Ohkubo.: "Rapid diagnosis of mycobacterial infections by PCR-RFLP." Clin.Microbiol. (Rinshou to Bisebutu). Vol.19. 175-182 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 竹脇 俊一・永井 良三: "PCR法による抗酸菌のDNA診断" 医学のあゆみ. 158.773-778. (1991)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 竹脇 俊一・奥住 捷子・永井 良三・大久保 昭行: "感染症のDNA診断(2)PCRによる抗酸菌のDNA診断" 臨床科学. 28.455-462. (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 竹脇 俊一・大久保 昭行・永井 良三: "PCRによる抗酸菌感染症診断" Biomedica. 7.1190-1195. (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Takewaki S,Okuzumi K,Ishiko H,Ohkubo A,Nagai R.: "Genus-specific polymerase chain reaction for the mycobacterial dnaj gene and species-specific oligonucleotide probes." J.Clin.Microbiol.Vol.31.(1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 竹脇 俊一,永井 良三: "臨床検査法の最前線:PCR法と臨床検査法の新らしい展開" 代謝. 27. 1029-1038 (1990)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Kuroo M.et al: "cDNA cloning of a myosin heavy Chain isoform in emhryomic smooth muscle and its expreuim during Vascular decelopment and in arterio sclerosis" J.Biol.Chem.266. 3768-3773 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 永井 良三,竹脇 俊一,和田 昭仁,奥住 捷子,飛田 明子,大久保 昭行: "PCRを用いた抗酸菌の迅速鑑別法の開発" 臨床病理. 38. 1247-1253 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書

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公開日: 1990-04-01   更新日: 2016-04-21  

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