• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

蛋白質機能の合成化学的シミュレ-ション

研究課題

研究課題/領域番号 02650657
研究種目

一般研究(C)

配分区分補助金
研究分野 高分子合成
研究機関北海道大学

研究代表者

西 則雄  北海道大学, 理学部, 講師 (70001857)

研究分担者 堤 耀広  北海道大学, 工学部, 教授 (80000884)
戸倉 清一  北海道大学, 理学部, 教授 (40000806)
研究期間 (年度) 1990 – 1991
研究課題ステータス 完了 (1991年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
1991年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
1990年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワード蛋白質機能 / 合成化学的シミュレ-ション / DNA結合蛋白質 / プロタミン / RNAポリメラ-ゼ / アミノ酸配列 / コンホメ-ション / 折れ曲り構造 / 蛋白質類似物質(プロテノイド) / RNAポリメラ-ゼII
研究概要

プロタミン,RNAポリメラ-ゼII等のDNA結合蛋白質をタ-ゲットに選び、これらの機能の合成化学的シミュレ-ションを行った。
1.魚類精子核中のDNA結合蛋白質プロタミンの分子中央部付近は、DNA結合時に折れ曲り構造をとっていると推測された。この折れ曲り構造と機能発現メカニズムの関係を調べるため、この折れ曲り構造と思われる付近の化学構造を強調あるいは消去したより単純なペプチドを3種類合成した。
2.上記のペプチド類のコンホメ-ションをCD及び二次元NMRで調べ、またDNA安定化能,DNA凝集能等のプロタミン様機能を比較し、この折れ曲り構造部分に含まれるプロリン残基の役割につき考察した。
3.プロタミン分子中の折れ曲り構造と思われる部分には、多くの魚類種のプロタミンにつき大変保存性よくーSーRーPーVーというアミノ酸配列が存在している。この部分のコンホメ-ションやDNA結合時における役割に関する知見を得るため、この配列を含む3種類のペプチド(SーRーPーV,SーSーRーPーV,SーSーSーRーPーV)を合成した。
4.上記3種類のペプチドの水溶液中及び有機溶媒中でのコンホメ-ションをCD及び ^1HNMRで調べた。その結果,ある条件下ではタ-ン構造の存在が示され、これはDNAに結合しているプロタミン中のこの部分がタ-ン構造をとっている事を示唆する一つの現象と考えられる。
5.DNAよりRNAを転写する際の主役であるRNAポリメラ-ゼII分子中にはSーPーTーSーPーSーYのアミノ酸配列が繰り返し現れる部分があり、この部分の役割が不明である。この点に関する知見を得るためこの部分の化学合成を進め、最終目的物のPoly(SーPーTーSーPーSーY)の合成に成功した。現在これのコンホメ-ションやDNAとの相互作用につき調べるとともに、このポリペプチドの大量合成を行っている。

報告書

(3件)
  • 1991 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1990 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (24件)

  • [文献書誌] Norio Nishi: "Simulation of Protamine Function by Peptide Chemistry." Peptide Chem.1989. 325-330 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Rie Suzuki: "Inhibition of Actomyosin Subfragment 1 ATPase Activity by Analog Peptides of the Actin-binding Site around the Cys(SH1) of Myosin Heavy Chain" J.Biol.Chem.265. 4939-4943 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide(DPPA).Preparation of Poly-α-amino Acids by the Direct Polycondensa-tion of α-Amino ACids." Macromol.Chem.192. 1789-1798 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide(DPPA).Preparation of Sequential Polypeptides by the Direct Polycondensation of Peptides." Macromol.Chem.192. 1799-1809 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide(DPPA).Preparations of Polyamides,Polyureas and Polyurethanes." Macromol.Chem.192. 1811-1820 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshiko Okamoto: "Primary Structure of Sardaine Z1 and Z2,a Protamine Isolated from Striped Bonito(Sarda orientalis)" J.Biochem.111. 157-161 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishi, N., Ogawa, R., Hayasaka, H., Hasegawa, K.: "Simulation of Protamine Function by Peptide Chemistry." Peptide Chem.1989. 325-330 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, R., Morita, F., Nishi, N., Tokura, S.: "Inhibition of Actomyosin Subfragment 1 ATPase Activity by Analog Peptides of the Actin-binding Site around the Cys(SH1) of Myosin Heavy Chain" J. Biol. Chem.265. 4939-4943 (1990)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishi, N., Tsunemi, M., Hayasaka, H., Nakajima, B., Tokura, S.: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide(DPPA). Preparation of Poly-alpha-amino Acids by the Direct Polycondensation of alpha-Amino ACids." Macromol. Chem.192. 1789-1798 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishi, N., Naruse, T., Hagiwara, K., Nakajima, B., Tokura, S.: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide (DPPA). Preparation of Sequential Polypeptides by the Direct Polycondensation of Peptides." Macromol. Chem.192. 1799-1809 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishi, N., Tsunemi, M., Nakamura, K., Tokura, S.: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide (DPPA). Preparations of Polyamides, Polyureas and Polyurethanes." Macromol. Chem.192. 1811-1820 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Okamoto, Y., Kuno, K., Motohiro, T., Nishi, N., Muta, E., Ota, S.: "Primary Structure of Sardaine Z1 and Z2, a Protamine Isolated from Striped Bonito (Sarda orientalis)" J. Biochem.111. 157-161 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1991 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Gotthold Ebert: "Solubilization and Conformation of Protamines in Reverse Micelles" Prog.Colloid Polym.Sci.,. 83,. 181-187 (1990)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide(DPPA).Preparation of Polyーαーamino Acids by the Direct Polycondensation of αーAmino ACids." Macromol.Chem.192. 1789-1798 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide(DPPA).Preparation of Sequential Polypeptides by the Direct Polyーcondensation of Peptides." Macromol.Chem.192. 1799-1809 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with diphenylphosphoryl Azide(DPPA).Preparations of Polyamides,Polyureas and Polyurethanes." Macromol.Chem.192. 1811-1820 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Masumi Eto: "Actin Polymerization Promoted by a Heptapeptide,An Analog of the Actinーbinding SーSite on Myosin Head" J.Biol.Chem.266. 18233-18236 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshiko Okamoto: "Primary Structure of Sardaine Z1 and Z2,a Protamine Isolated from Striped Bonito(Sarda orientalis)" J.Biochem.111. 157-161 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Simulation of Protamine Function by Peptide Chemistry" Peptide Chem.1989. 325-330 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Masumi Eto: "Roles of the Amino Acid Side Chains in the Actinーbinding SーSite of Myosin Heavy Chain" J.Biochem.108. 499-504 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Gotthold Ebert: "Solubilization and Conformation of Protamines in Reverse Micelles" Prog.Colloid Polym.Sci.83. 181-187 (1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide (DPPA).Preparation of Polyーαーamino Acids by the Direct Polycondensation of αーAmino Acids." Macromol.Chem.(1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide (DPPA).Preparation of Sequential Polypeptides by the Direct Polycondensation of Peptide." Macromol.Chem.(1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書
  • [文献書誌] Norio Nishi: "Polymerization Reaction with Diphenylphosphoryl Azide (DPPA).Preparations of Polyamides,Polyureas and Polyurethanes." Macromol.Chem.(1990)

    • 関連する報告書
      1990 実績報告書

URL: 

公開日: 1990-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi