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DNAセンシングシステムの開発

研究課題

研究課題/領域番号 03205022
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関東京大学

研究代表者

軽部 征夫  東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (50089827)

研究分担者 鈴木 正康  東京大学, 先端科学技術研究センター, 助手 (70226554)
民谷 栄一  東京大学, 先端科学技術研究センター, 助教授 (60179893)
研究期間 (年度) 1991
研究課題ステータス 完了 (1991年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
1991年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワード遺伝子検出 / 蛍光偏光解消 / ハイブリダイゼ-ション / DNAプロ-ブ / PCR / DNA診断
研究概要

本研究ではまず蛍光偏光解消を応用したDNAの検知システムについて検討した。すなわち、蛍光物質を標識したプロ-ブDNAとハイブリダイズした後の蛍光物質は、回転運動などの運動モ-ドが大きく異なる。したがって偏光解消度を指標としてハイブリダイズしたDNAの量を推定することが可能と考えられた。 まずハイブリダイゼ-ションの過程でどのように偏光度が変化していくかを調べた。その結果、偏光解消は時間とともに増加していき、しだい定常値に達することがわかった。この変化はハイブリダイゼ-ションの進行度を示している。いま、タ-ゲットとなるDNAとして、pBR322プラスミドDNAを540bp断片中の3個あるいは6個のシトシンをチミンに変化させた試料を用いて、これにプロ-ブDNAを作用させ、ハイブリダイゼ-ションの時間経過を調べた。その結果、ミスマッチの塩基数が増加することにつれ、蛍光解消度の増加率が小さいことが明かになった。 PCR増幅反応は、超微量のDNAを検出するきわめて有効な方法である。そこで蛍光偏光解消法をPCR増幅反応に適用した。まず、16merのオリゴマ-にFITCを標識したDNAプロ-ブを合成し、タ-ゲットDNAとしてpUC119プラスミドを用い、遺伝病の診断を考え、200bpから1kbpまでの範囲を選んだ。PCR増幅回数を5回より30回まで5回おきに測定したところ、5回以降蛍光偏光異方度が上昇していることが判った。これは、FITCで標識されたDNAプロ-ブがPCR増幅反応の進行にともなって、16merから目的の長さの2本鎖DNAへと伸長し、FITCの動的挙動が変化したことを示すと考えられた。またPCR増幅の初期の段階でより迅速に、タ-ゲットDNAの存在を確認できることも示された。さらに測定温度を高くすると偏光異方度が下がることもわかった。これは、溶液の粘度変化が反映しているものと考えられた。

報告書

(1件)
  • 1991 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (8件)

  • [文献書誌] T.Herning,E.Tamiya,S.Kobayashi,I.Karube: "Specific liguid DNA hybridization kinetics measured by fluorescence polarization" Anal.Chim.Acta. 244. 207-213 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] M.Tsuruoka,E.Tamiya,I.Karube: "Fluorescence polarization immunoassay employing immobilized antibody" Biosensors&Bioelectronics. 6. 501-505 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] S.M.Lel,M.Suzuki,E.Tamiya,I.Karube: "Anovel microbial sensor for the determination of toxic compounds utilizing recombinant DNA technology and Bioluminescence" Chemistry Express. 6. 415-418 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] A.Seki,E.Tamiya,I.Karube: "Amplification immunoassay for the determination of HBs" Appl.Biochem.Biotech.27. 259-265 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] S.M.Lee,M.Suzuki,E.Tamiya,I.Karube: "Microbial detection of toxic compounds utilizing recombinant DNA technology and Bioluminesconce" Anal.Chim.Acta. 244. 201-206 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] H.Endo,M.Suzuki,K.Sode,E.Tamiya,I.Karube: "Rapid determination of plasmed‐carrying yeast cells by using an image sensor system" Biotechnol.Bioeng.,. 38. 1331-1336 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 軽部 征夫: "バイオのはなし" 日本実業出版社, 241 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 軽部 征夫: "バイオエレクトロニクスの未来" NTT出版, 226 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書

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公開日: 1991-04-01   更新日: 2016-04-21  

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