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大腸菌ゲノムの全体像・ゲノムの機能的全体像

研究課題

研究課題/領域番号 03221104
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関大阪大学

研究代表者

中田 篤男  大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (80029769)

研究分担者 由良 隆  京都大学, ウイルス研究所, 教授 (20027311)
松橋 通生  東海大学, 開発工学部, 教授 (40013297)
二井 将光  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (50012646)
饗場 弘二  名古屋大学, 理学部, 教授 (20025662)
安楽 泰宏  東京大学, 理学部, 教授 (20012643)
研究期間 (年度) 1989 – 1991
研究課題ステータス 完了 (1991年度)
配分額 *注記
21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
1991年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
キーワードリン酸レギュロン / CRPレギュロン / チトクロ-ムc552 / シグマーF / SSBレギュロン / シグマー32 / H+ーATPase / 細胞の成長と分裂
研究概要

本研究班は「大腸菌ゲノムの全体像」の中で(ゲノムの機能的全体像)を分担しており、大腸菌の遺伝子群の機能とその発現制御系を中心に研究を進めてきた。中田と牧野はugpオペロン(snーグリセロ-ル3ーリン酸能動輸送系をコ-ド)の発現が、リン酸レギュロンの調節遺伝子であるphoR/phoBと、cAMPーCRP複合体とによる二重の調節を受け、また、ackA(アセテ-トキナ-ゼをコ-ド)の過剰発現がリン酸レギュロンの発現を誘導するなど、リン酸レギュロンが他の調節系とも関連して統合的に制御されていることを示した。饗場はcrp(cAMP受容体蛋白質をコ-ド)の転写の正の自己制御機能が働くことを証明し、菌の成育条件の変動に応じて正負双方の自己制御でcrpの転写が調節されていることを示した。安楽は嫌気性亜硝酸還元酵素(チトクロ-ムc552)の正の調節遺伝子dniRをクロ-ニングして塩基配列を決定史、チトク-ムbo複合体の活性中心の解析から電子伝達の複核中心モデルを提唱した。沓掛はゲノムデ-タベ-スから鞭毛遺伝子特異的シグマ因子(RpoR)依存性プロモ-タ-と相同性の塩基配列を7個見いだし、その1個は実際にRpoF依存的に転写されることを証明した。嶋本は一本鎖DNA結合蛋白質(SSB)の過剰産生菌の蛋白質を二次元電気泳動法で分析し、その発現量に反比例して発現する蛋白質を7種類発見した。二井はATP合成酵素の活性中心と構造、H^+輸送路およびATP合成/分解とH^+輸送の共役機構の解析を行なった。松橋は細胞の成長と分裂に関与するmra遺伝子群(遺伝子地図上2分)の上流のmraRが細胞成長と分裂に重要な役割を演じていることを証明した。由良は熱ショック応答遺伝子の転写に必須のシグマー32のmRNAが定常期では二次構造を形成して殆ど翻訳されず、熱ショックなどのストレスにより、それが一次的に解けて翻訳誘導が起こるというモデルを提唱した。

報告書

(1件)
  • 1991 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (18件)

  • [文献書誌] Kasahara,M.,K,Makino,M.Amemura.A.Nakata,and H.Shinagawa: "Dual regulation of ugp operon by phosphate and carbon starvation at two interspaced promoters." Journal of Bacteriology. 173. 549-558 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Makino,K.,S.-K.Kim,H.Shinagawa,M.Amemura.and A.Nakata: "Molecular analysis of the cryptic and functional phn operons for phosphonate use in Escherichia coli K-12." Journal of Bacteriology. 173. 2665-2672 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Kasahara,M.,A.Nakata,and H.Shinagawa: "Molecular analysis of the Salmonella typhimurium phoN gene,which encodes nonspecific acid phosphatase." Journal of Bacteriology. 173. 6760-6765 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Aiba,H.: "Molecular mechanism of negative autoregulation of Escherichi coli crp gene." Nucleic Acids Reseach. 19. 4413-4419 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Aiba,H.: "Transcriptional terminator is a positive regulatory element in the expression of the Escherichia coli crp gene." Journal of Biological Chemistry. 266. 1721-1727 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Kajie,S.,R.Ideta,I.Yamato,and Y,Anraku: "Molecular cloning and DNA sequence of dniR,a gene affecting anaerobic expression of the Escherichia coli hexaheme nitrite reductase." FEMS Microbiology Letters. 83. 205-212 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Minagawa,J.,T.Mogi,R.B.Gennis,and Y.Anraku: "Identification of heme and copper ligands in subunit I of the cytochrome bo complex in Escherichia coli." Journal of Biological Chemistry. 267. 2096-2104 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Fujita,M.,T.Hirata,and N.Shinamoto: "Requirement for the β,γ-pyrophosphate bond of ATP in a stage between transcription initiation and elongation by Escherichia coli RNA polymerase." Biochemistry. 30. 1801-1807 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 寺田 博之、嶋本 伸雄: "固定化オペロンによる転写の動的解析" 生物物理. 31. 335-338 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Shimamoto,N.,T.Terada,and M.Fujioka: "An early period in elongation by prokaryotic RNA polymerases is specified by the requirement for β,γ-phosphodiester bond of ATP." Journal of Cellular Biochemistry. Suppl.15G. 245 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Moriyama,Y.,A.Iwamoto,H.Hanada,M.Maeda,and M.Futai: "One-step purification of Escherichia coli H^+-ATPase (F_0F_1) and its reconstitution into liposomes with neurotransmitter transporters." Journal of Biological Chemistry. 266. 22145-22146 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Ida,K.,T.Noumi,M.Maeda,T.Fukui,and M.Futai: "Catalytic site of F_1-ATPase of Escherichia coli:Lys-155 and Lys201 of the β subunit are located near the γ phosphate group of ATP in the presence of Mg^<2+>." Journal of Biological Chemistry. 266. 5424-5429 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Iwamoto,A.,H.Omote,H.Hanada,N.Tomioka,A.Itai,M.Maeda,and M.Futai: "Mutation in Ser-174 and the glycine-rich sequence(Gly-149,Gly-150 and Thr-156) in the β subunit of Escherichia coli H^+-ATPase." Joumal of Biochemistry. 266. 16350-16355 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Wachi,M.,M.Doi,T.Ueda,M.Ueki,K.Tsuritani,K.Nagai,and M.Matsuhashi: "Sequence of the downstream flanking region of the shape-determining genes mreBCD of Escherichia coli." Gene. 106. 135-136 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Ikeda,M.,M.Wachi,and M.Matsuhashi: "The murG gene of the E.coli chromosome encoding UDP-N-acetylglucosamine:undecaprenyl-pyrophosphoryl-Nacety-muramoyl-pentapeptide N-acetylglucosaminyl transferase." Jourmal of Genetal and Applied Microbiology. 38. (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Nagai,H.,H.Yuzawa,and T.Yura: "Interplay of two cis-acting mRNA regions in translational control of sigma 32 synthesis during the heat shock response of Escherichia coli." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 88. 10515-10519 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Kitagawa,M.,C.Waka,S.Yoshioka,and T.Yura: "Expression of clpB,and analog of the ATP-dependent protease regulatory subunit in Escheichia coli,is controlled by heat shock sigma factor(sigma 32)." Journal of Bacteriology. 173. 4247-4253 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Kogoma,T.,and T.Yura: "Sensitization of Esdherichia coli cells to exidative stress by deletion of the rpoH gene,which encodes the heat shock sigma factor." Journal of Bacteriology. 174. 630-632 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書

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公開日: 1991-04-01   更新日: 2016-04-21  

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