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安定なヘアピン様構造を形成するRNA断片の合成と構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 03242202
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関東京大学

研究代表者

平尾 一郎  東京大学, 工学部, 助手 (50173216)

研究期間 (年度) 1991
研究課題ステータス 完了 (1991年度)
配分額 *注記
2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
1991年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワードDNA・RNAの安定なヘアピン構造 / in vitroタンパク質合成系
研究概要

我々は,すでにGCGAAAGCという配列のDNA断片が異常に安定なヘアピン構造を形成することを発見している。本年度は,この配列のRNA,および一部配列を変えたDNAやRNAの断片を種々合成しそれらの構造を調べた。
まずGCGAAAGC配列のRNA断片は,DNAほどではないが,ある程度安定なヘアピン構造を形成することがわかった。DNAとRNAでのこの安定性の違いを調べるために,ステム部分のGC配列に注目し,この部分の配列を変えて種々の断片を合成した。その結果,ステム部分の配列の違いは,DNAとRNAでそれほど差はなく,すべてDNAの断片の方が安定なヘアピン構造を形成することがわかった。これらは,DNAの場合はB型構造,RNAの場合はA型構造の安定性とそれぞれのヘアピン構造の安定性に相関性があることがわかった。
またGCGAAGCのDNA断片を合成し,その構造を調べた。この配列は,Aが3つあるGCGAAAGCと同程度の高い安定性を示したので,さらにNMRスペクトルを測定した。その結果このd(GCGAAGC)断片は,d(GCGAAAGC)とは異なったかなり特異な構造を形成していることがわかった。
これらのヘアピンDNAの一部は,in vitroのタンパク質合成系でそのタンパク質の合成量に影響をおよぼすことがわかり,種々の工学的応用につながる可能性がでてきた。
以上のように申請した内容の大半を達成することが出来た。

報告書

(1件)
  • 1991 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (4件)

  • [文献書誌] Satoko Yoshizawa: "Ettect of hairpin DNA on poly(phenylalanine)synthesis" Nucleic Acids Symp.Ser.25. 167-168 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Ichiro Hirao: "Extraordinarily stable miniーhairpins formed by the DNA fragment d(GCGAAAGC)and its sequence variants" Nucleic Acids Res.

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Ichiro Hirao: "Stabilization of mRNA in an Escherichia coli cellーfree translation system" FEBS Letter.

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 平尾 一郎: "核酸分子内の異常に安定なヘアピン構造について" 日本化学会「化学と工業」2月号, 5 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書

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公開日: 1991-04-01   更新日: 2016-04-21  

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