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球状ウイルスの高分解能X線結晶構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 03403025
研究種目

一般研究(A)

配分区分補助金
研究分野 結晶学
研究機関徳島大学

研究代表者

月原 冨武  徳島大学, 工学部, 教授 (00032277)

研究分担者 佐滝 真紀  徳島大学, 工学部, 教務員
和田 正徳  鳥取大学, 工学部, 教授 (30029053)
研究期間 (年度) 1991 – 1994
研究課題ステータス 完了 (1994年度)
配分額 *注記
24,100千円 (直接経費: 24,100千円)
1994年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
1993年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
1992年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円)
1991年度: 16,100千円 (直接経費: 16,100千円)
キーワード球状ウイルス / 結晶構造 / X線解析 / 立体構造 / 形態形成 / タバコネクロシスウイルス / イネ萎縮病ウイルス / X線期析 / 二重殻ウイルス / ウイルス / 分子置換法 / 結晶構造解析
研究概要

タバコネクロシスウイルス(TNV)はT=3の正二十面体対称を持ち、180個のタンパク質サブユニットと1本のRNAで構成されている。X線回折強度データは高エネルギー研究所放射光実験施設の巨大分子用ワイセンベルグカメラを用いて収集した。結晶は立方晶系、空間群はP4_232、格子定数はa=338Åである。単位格子中に2個のウイルス粒子が含まれており、非対称単位中には15分子のサブユニットが含まれている。8Å分解能で分子置換法によって初期位相を決定し、非結晶学的対称による平均(NCSA)法によって精密化及び位相の拡張を行い5Å分解能の解析を完結した。R値は0.1 7,相関係数は0.92になった。5Å分解能の電子密度図に基づいて正二十面体対称の非対称単位にある3サブユニットの分子モデルを作成することが出来た。TNVと同じくT=3ウイルスであるSouther Bean Mosaic Virus(SBMV)との比較をすると、殻タンパク質の3個所でアミノ酸残基の欠損が有ることがわかった。またウイルス殻タンパク質のRNAと相互作用する領域には特異的に核酸と相互作用するとされているアミノ酸が集まっている。この特異的なタンパク質と核酸の相互作用がTNVの形態形成において重要な役割を果たしているものと思われる。これらの結果はActa Cryst.の論文として報告した。
RDV分子量は約6500万であり、結晶化に成功した最大の粒子である。結晶は立方晶系、空間群はI23,格子定数はa=789Åである。TNVと同様に放射光を用いて回折実験を行った。回折強度データ処理にも成功して、20Å分解能で二重殻構造を決定した。

報告書

(5件)
  • 1994 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1993 実績報告書
  • 1992 実績報告書
  • 1991 実績報告書
  • 研究成果

    (47件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (47件)

  • [文献書誌] H.Mizuno et al: "Crystallization and Preliminary X-ray Study of a Double-Shelled Spherical Virus,Rice Dwarf Virus." J.Mol.Biol.219. 665-669 (1991)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Yoshikawa et al: "Strategies for Crystallization of Large Membrane Protein Complexes." J.Crystal Growth. 122. 298-302 (1992)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Shinzawa-Itoh et al: "Single Crystals of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase at Fully Reduced States are Isomorphous with Each Other." J.Mol.Biol.228. 987-990 (1992)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 福山恵一,月原冨武: "ウイルスの立体構造" バイオサイエンスと工業. 50. 27-32 (1992)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Mizuno et al: "Crystallization and Preliminary X-ray Studies of Wild Type and Catalytic-site Mutant Amylase from Bacillus subtilis." J.Mol.Biol.234. 1282-1283 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 月原冨武,福山恵一: "分子置換法による球状ウイルスのX線結晶構造解析." 放射光. 6. 37-48 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 月原冨武 他: "超分子複合体のX線結晶構造解析." 蛋白質・核酸・酵素. 38. 1247-1253 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 月原冨武: "超分子複合体の構造解析." 生物物理. 33. 24-29 (1993)

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    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Ikemizu et al: "Crystal Structural Analysis of [2Fe-2S]Ferredoxin I from Equistum Arvense at 1.8Å Resolution." Acta Crystallgr.D50. 167-174 (1994)

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    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Bando et al: "Crystal Structure Analysis of Tobacco Necrosis Virus(TNV) at 5Å Resolution." Acta Crystallgr.D50. 878-883 (1994)

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    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 月原冨武: "X線結晶構造解析." 蛋白質・核酸・酵素. 39. 1263-1273 (1994)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Mizuno, H.Kano, T.Omura, M.Koizumi, M.Kondoh and T.Tsukihara: "Crystallization and Preliminary X-ray Study of a Double-Shelled Spherical Virus, Rice Dwarf Virus." J.Mol.Biol.219. 665-669 (1991)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Yoshikawa, K.Shinzawa-Itoh, H.Ueda, T.Tsukihara, Y.Fukumoto, T.Kubota, M.Kawamoto, K.Fukuyama and H.Matsubara: "Strategies for Crystallization of Large Mambrane Protein Complexes." J.Crystal Growth. 122. 298-302 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Shinzawa-Itoh, H.Yamashita, S.Yoshikawa, Y.Fukumoto, T.Abe and T.Tsukihara: "Single Crystals of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase at Fully Oxidized Resting, Fully Reduced and CO-bound Fully Reduced States are Isomorphous with Each other." J.Mol.Biol.228. 987-990 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Fukuyama and T.Tsukihara: "Three-dimensional Structure of Viruses." Sioscience and Industry. 50. 27-32 (1992)

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    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Mizuno, Y.Morimoto, T.Tsukihara, T.Matsumoto and K.Takase: "Crystallization and Preliminary X-ray Studies of Wild Type and Catalytic-site Mutant Amylase from Bacillus subtilis." J.Mol.Biol.234. 1282-1283 (1993)

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    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tsukihara and K.Fukuyama: "X-ray Crystal Structure Analysis of Spherical Viruses by the Molecular Replacement Method.p.37-48 (1993)." Synchrotron Radiation. 6. 37-48 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tsukihara, Y.Morimoto and E.Yamashita: "X-ray Crystal Structure Analysis of Biological Supramolecules." Protein-Nucleic Acid-Enzyme. 38. 1247-1253 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tsukihara: "Structure Analysis of Biological Supramolecules" Biophysics. 33. 24-29 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Ikemizu, M.Bando, T.Sato, Y.Morimoto, T.Tsukihara and K.Fukuyama: "Crystal Structural Analysis of [2Fe-2S] Ferredoxin I from Equistum arvense at 1.8* Resulution." Acta Crystallgr.D50. 167-174 (1994)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Bando, Y.Morimoto, T.Sato, T.Tsukihara, Y.Yokota, K.Fukuyama and H.Matsubara: "Crystal Structure Analysis of Tobacco Nectrosis Virus (TNV) at 5* Resolution." Acta Crystallogr.D50. 878-883 (1994)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tsukihara: "X-ray Crystal Structure Analysis." Protein-Nucleic Acid-Enzyme. 39. 1263-1273 (1994)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Mizuno et al: "Crystallization and Preliminary X-ray Study of a Double-Shelled Sphevical Virus,Rice Dwarf Virus." J.Mol.Biol.219. 665-669 (1991)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] S.Yoshikawa et al: "Strategies for Crystallization of Large Membrane Protein Complexes." J.Crystal Growth. 122. 298-302 (1992)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] K.Shinzawa-Itoh et al: "Single Crystals of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase at Fully Reduced States are Isomorphous with Each Other." J.Mol.Biol.228. 987-990 (1992)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 福山恵一,月原冨武: "ウイルスの立体構造." バイオサイエンスと工業. 50. 27-32 (1992)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] H.Mizuno et al: "Crystallization and PreliminaryX-ray Studies of Wild Type and Catalytic-site Mutant Amylase from Bacillus subtilis." J.Mol.Biol.234. 1282-1283 (1993)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武,福山恵一: "分子置換法による球状ウイルスのX線結晶構造解析." 放射光. 6. 37-48 (1993)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武 他: "超分子複合体のX線結晶構造解析." 蛋白質・核酸・酵素. 38. 1247-1253 (1993)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武: "超分子複合体の構造解析." 生物物理. 33. 24-29 (1993)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] S.Ikemizu et al: "Crystal Structural Aanlysis of[2Fe-2S]Ferredoxin I from Equistum Arvense at 1.8Å Resolution." Acta Crystallgr.D50. 167-174 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] M.Bando et al: "Crystal Structure Analysis of Tobacco Nerosis Virus(TNV)at 5Å Resolution." Acta Crystallgr.D50. 878-883 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武: "X線結晶構造解析." 蛋白質・核酸・酵素. 39. 1263-1273 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] H.Mizuno et al.: "Crystallization and Preliminary X-ray study of a Double-Shelled Spherical Virus,Rne Dwarf Virus" J.Mol.Biol.219. 665-669 (1991)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] S.Ikemizu et al: "Crystal Structure Analysis of [2Fe-2S]Ferredoxin from Equisetum arvense at 1.8A resolution" Acta Crystallographica D. (印刷中). (1994)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武: "分子置換法による球状ウイルスのX線結晶構造解析" 放射光. 6. 37-48 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 福山恵一,月原冨武: "ウイルスの立体構造" バイオサイエンスとインダストリー. 50. 27-32 (1992)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武 他: "超分子複合体のX線結晶構造解析" 蛋白質核酸酵素. 38. 1247-1253 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 月原冨武: "超分子複合体の構造決定-どこまで大きな分子に迫れるか?" 生物々理. 33. 24-29 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 月原 冨武,森本 幸生,山下 英樹: "超分子複合体のX線結晶構造解析" 蛋白質核酸酵素. (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 月原 冨武,福山 恵一: "分子置換法による球状ウイルスのX線結晶構造解析" 放射光. 6. 37-48 (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] K.Shinzawa-Itoh,H.Yamashita,S.Yoshikawa,Y.Fukumoto,T.Abe and T.Tsukihara: "Single Crystal of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase at Fully Oxidized Resting Fully Reduced and CO-bound Fully Reduced States are Isomorphous with Each Other." J.Mol.Biol.228. 987-990 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] S.Yoshikawa,K.Shinzawa-Itoh,H.Ueda,T.Tsukihara,T.Kubota,M.Kawamoto,K.Fukuyama and H.Matsubara: "Strategies for Crystallization of Large Membrane Protein Complexes." J.Crystal Growth. 122. 298-302 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 福山 恵一,月原 冨武: "ウイルスの立体構造" バイオサイエンスとインダストリー. 50. 27-30 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Hitoshi Mizuno,Hiromi Kano,Toshihiro Omura,Mika Koizumi,Masahiko Kondoho,Tomitake Tsukihara: "Crystallization and Preliminary Xーray Study of a DoubleーShelled Spherical Virus,Rice Dwarf Virus" J.Mol.Biol.219. 665-669 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Tomitake Tsukihara,Yukio Yokota,Takayuki Koyama,Keiichi Fukuyama,Hiroshi Matsubara: "Symmetry and Subunit Arrangement of Tabacco Necrosis Virus(TNV)" Acta Crystallographica. B46. 855-860 (1990)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] 福山 恵一,月原 冨武: "ウイルスの立体構造" バイオサイエンスとインダストリ-. 50. 27-32 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書

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公開日: 1991-04-01   更新日: 2016-04-21  

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