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古細菌の進化的位置と真核生物の起源

研究課題

研究課題/領域番号 03454562
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 分子遺伝学・分子生理学
研究機関統計数理研究所

研究代表者

長谷川 政美  統計数理研究所, 予測制御研究系, 教授 (60011657)

研究分担者 橋本 哲男  統計数理研究所, 統計教育情報センター, 助手 (50208451)
宮田 隆  京都大学, 理学部, 教授 (20022692)
研究期間 (年度) 1991 – 1992
研究課題ステータス 完了 (1992年度)
配分額 *注記
4,700千円 (直接経費: 4,700千円)
1992年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
1991年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワード古細菌 / 真正細菌 / 真核生物 / ギアルディア / 分子系統樹 / ミトコンドリア / ペプチド鎖伸長因子 / 最犬法 / 真性細菌 / 延長因子 / ア-ケゾア / エントアメ-バ / 共生説 / 分子系統学 / 最尤法
研究概要

前年度までの研究で,メタン細菌,好塩菌,エオサイトなどの古細菌が,真正細菌によりは真核生物に近縁であることが確かめられたが,これら3つの古細菌のグループと真核生物との関係は不明であった.今年度は,ペプチド鎖伸長因子のアミノ酸配列データを,われわれが開発した最犬法にもとづいて解析した結果,これらの古細菌がすべて系統的に一つのグループとしてまとまるという可能性のほかに,エオサイトが特に真核生物に近いという可能性も浮上した.
ミトコンドリアなどのオルガネラをもたない真核原生生物の系統学的な位置づけは,真核生物の初期進化をさぐる上で極めて重要である.従来この問題は,リボソームRNAの配列データにもとづいて研究されてきたが,われわれはリボソームRNA分子系統樹の問題点を指摘した.最大の問題は,近縁な生物の間ででも,塩基組成が大きく異なることがあり,このことが間違った系統樹を導くことがあるということである。われわれは,ペプチド鎖伸長因子やRNA合成酵素などといった保存的なたんぱく質のアミノ酸配列データを解析し,塩基組成が大きく違っているような場合でも,たんぱく質のアミノ酸配列はその影響を受けず,そのようなデータからえられる分子系統樹の信頼性が高いことを示した。
ミトコンドリアをもたない真核原生生物の一種であるギアルディアのペプチド鎖伸長因子EF-1αの遺伝子の塩基配列を決定し,この原生生物が真核生物の祖先型生物に近い可能性のあることを示した.

報告書

(3件)
  • 1992 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1991 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (28件)

  • [文献書誌] T.Hashimoto,J.Adachi,M.Hasegawa: "Phylogenetic place of Giardia lamblia,a protozoan that lacks mitochondria" Endocytobiosis and Cell Research. 9. 59-69 (1992)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Hasegawa,T.Hashimoto: "Ribosomal RNA trees misleading?" Nature. 361. 23-23 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Adachi,Y.Cao,M.Hasegawa: "Tempo and mode of mitochondrial DNA evolution in vertebrates at the amino acid sequence level" Journal of Molecular Evolution. 36. 270-281 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Hasegawa,T.Hashimoto,J.Adaci,N.Iwabe,T.Miyata: "Early divergences in the evolution of eukaryotos:ancient divergence of Entamveba that lacks mitochondria vevculed by protein sequence data" Journal of Molecular Evolution. 36. (1993)

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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Hasegawa,M.Fujiwara: "Relative efficieucies of the maximum likelihood,maximum parsimony,and neighbor joining methods for estimating protein phylogeny" Molecular Phylogenetics and Evolution. (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Hasegawa,H.Kishino: "Simple methods for estimating bootstrap probability of a maximum likelihood tree" Molecular Biology and Evolution. (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, M., Cao, Y., Adachi, J., Yano, T.: "Rodent polyphyly?" Nature. 355. 595-595 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Adachi, J., Hasegawa, M.: "MOLPHY:Programs for Molecular Phylogenetics, I.-PROTML: Maximum Likelihood Inference of Protein Phylogeny" Computer Science Monographs. 27. 1-77

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Adachi, J., Hasegawa, M.: "Amino acid substitution of proteins coded for in mitochondrial DNA during mammalian evolution" Japanese Journal of Genetics. 67. 187-197 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hashimoto, T., Adachi, J., Hasegawa, M.: "Phylogenetic place of Giardia lamblia, a protozoan that lacks mitochondria" Endocytobiosis & Cell Research. 9. 59-69 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, M., Hashimoto, T.: "Ribosomal RNA trees misleading?" Nature. 361. 23-23 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Adachi, J., Cao, Y., Hasegawa, M.: "Tempo and mode of mitochondrial DNA evolution in vertebrates at the amino acid sequence level: rapid evolution in warm-blooded vertebrates" Journal of Molecular Evolution. 36. 270-281 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, M., Hashimoto, T., Adachi, J., Iwabe, N., Miyata, T.: "Early divergences in the evolution of eukaryotes: Ancient divergence of Entamoeba that lacks mitochondria revealed by protein sequence data" Journal of Molecular Evolution. 36.

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, M., Fujiwara, M.: "Relative efficiencies of the maximum likelihood, maximum parsimony, and neighbor joining methods for estimating protein phylogeny" Molecular Phylogenetics and Evolution.

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, M., Kishino, H.: "Simple methods for estimating bootstrap probability of a maximum likelihood tree" Molecular Biology and Evolution.

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1992 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Hashimoto J.Adachi M.Hasegawa: "Phylogenetic place of Giardia lamblia,a protogoan that lacks mitochondria" Endocytobiosis and Cell Research. 9. 59-69 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hasegawa T.Hashimoto: "Ribosomal RNA trees misleading?" Nature. 361. 23-23 (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] J.Adachi Y.Cao M.Hasegawa: "Tempo and mode of mitochondrial DNA evolution in vertebrates at the amino acid sequence level" Journal of Molecular Evolution. 36. 270-281 (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hasegawa,T.Hashimoto J.Adachi,N.Iwabe,T.Miyata: "Early divergences in the evolution of eukaryotes:ancient divergence,of Entamoeba that lacks mitochondria revealed by protein sequence data" Journal of Molecular Evolution. 36. (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hasegawa M.Fujiwara: "Relative efficiencies of the maximum likelihood,maximum parsimony,and neighbor joining methods for estimating protein phylogeny" Molecular Phylogenetics and Evolution. (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] M.Hasegawa H.Kishino: "Simple methods for estimating bootstrap probability of a maximum likelihood tree" Molecular Biology and Evolution. (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Hasegawa,M.,Kishino,H.,Saitou,N.: "On the maximum likelihood method in molecular phylogenetics" Journal of Molecular Evolution. 32. 443-445 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Miyata,T.,Iwabe,N.,Kuma,K.,Kawanishi,Y.,Hasegawa,M.,Kishino,H.,Mukohata,Y.Ihara,K.,Osawa,S.: "Evolution of archaebacteria:Phylogenetic relationships among archaebacteria,eubacteria,and eukaryotes." Evolution of Life:Fossils,Molecules,and Culture.eds.Osawa,S.and Honjo,T.(Springer-Verlag,Tokyo). 337-351 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Miyata,T.,Iwabe,N.,Kuma,K.,Kawanishi,Y.,Mukohata,Y.,Ihara,K.,Hasegawa,M.: "Phylogenetic position of archaebacteria and branching patterns among three archaebacterial groups and eukaryotes" New Aspects of the Genetics of Molecular Evolution.eds.Kimura,M.and Takahata,N.(Japan Scientific Societies Press). 279-290 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Iwabe,N.,Kuma,K.,Kishino,H.,Hasegawa,M.,Miyata,T.: "Evolution of RNA polymerases and branching patterns of the three major groups of archaebacteria" Journal of Molecular Evolution. 32. 70-78 (1991)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Hasegawa,M.,Cao,Y.,Adachi,J.,Yano,T.: "Rodent polyphyly?" Nature. 355. 595-595 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Hasegawa,M.,Hashimoto,T.,Adachi,J.,Iwabe,N.,Miyata,T.: "Early divergences in the evolution of eukaryotes:ancient divergence of Entamaeba that lacks mitochondria revealed by protein sequence data" Journal of Molecular Evolution.

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書
  • [文献書誌] Adachi,J.,Hasegawa,M.: "Computer Science Monographs.No.27.MOLPHY:Programs for Molecular Phylogenetics,I.PROTML:Maximum Likelihood Inference of Protein Phylogeny." Institute of Statistical Mathematics, 76 (1992)

    • 関連する報告書
      1991 実績報告書

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公開日: 1991-04-01   更新日: 2016-04-21  

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