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安定同位体を利用したNMRによるRNAの立体構造解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 04226203
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関東京大学

研究代表者

河合 剛太  東京大学, 工学部, 助手 (70211860)

研究期間 (年度) 1992
研究課題ステータス 完了 (1992年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
1992年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワードRNA / NMR / 立体構造解析 / 安定同位体標識 / tRNA
研究概要

[1]複合標識オリゴヌクレオチドの調製 D-グルコース-^<13>C_6、塩化アンモニウム-^<15>Nを含む合成培地を用いて大腸菌を培養し、複合標識RNAを得た。これをRNaseT_1によって分解し、これまでに、^<13>C、^<15>Nによって複合標識されたモノヌクレオチド(Gp)およびジヌクレオチド(ApGp)を単離精製した。
[2]核磁気共鳴の手法の開発 [1]で得られた複合標識ヌクレオチド(Gp、ApGpなど)を用いて、二重共鳴および三重共鳴NMRの測定を行うことにより、^<13>Cおよび ^<15>N核の化学シフトあるいは異核種間のスピン結合定数を決定することができた。
[3]複合標識tRNAの立体構造解析 D-2-^<13>C-グルコース、塩化アンモニウム-^<15>Nを含む合成培地を用いて大腸菌を培養し、得られた菌体よりリボースの1'位が選択的 ^<13>C標識され、さらに ^<15>Nによって均一に標識されたtRNAを抽出し、HPLCをもちいてグルタミン酸に特異的なtRNA(tRNa^<Glu>)を精製した。得られた複合標識tRNA^<Glu>を用いて、H1'のNMRシグナルのみを選択的に観測する実験を行い、さらに、それを ^<13>C核の化学シフトで展開した二次元スペクトルを測定することに成功した。今後は、このようなtRNAを用いて、リボースシグナルの分解能を向上させ、それらの帰属、さらには構造情報を抽出を行う予定である。

報告書

(1件)
  • 1992 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (2件)

  • [文献書誌] Kawai,G.: "Conformational rigidity of N^4-acetyl-2'-O-methylcytidine found in tRNA of extremely thermophilic archaebacteria (Archaea)" Nucleosides & Nucleotides. 11. 759-771 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Kawai,G.: "Conformational rigidity of specific pyrimidine residues in tRNA arises from posttranscriptional modifications that enhance steric interaction between the base and the 2'-hydroxyl group" Biochemistry. 31. 1040-1046 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書

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公開日: 1992-04-01   更新日: 2016-04-21  

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