• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

蛋白質が認識するDNA構造

研究課題

研究課題/領域番号 04254105
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関横浜市立大学

研究代表者

西村 善文  横浜市立大学, 大学院総合理学研究科, 教授 (70107390)

研究分担者 甲斐荘 正恒  東京都立大学, 理学部, 助教授 (20137029)
上杉 晴一  横浜国立大学, 工学部, 教授 (70028851)
神藤 平三郎  東京薬科大学, 薬学部, 助教授 (80138966)
京極 好正  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (90012632)
水野 猛  名古屋大学, 農学部, 教授 (10174038)
研究期間 (年度) 1992
研究課題ステータス 完了 (1992年度)
配分額 *注記
33,500千円 (直接経費: 33,500千円)
1992年度: 33,500千円 (直接経費: 33,500千円)
キーワードタンパク質 / DNA / 立体構造 / NMR / X線結晶解析 / DNA給合ドメイン / がん遺伝子産物 / Myb
研究概要

核内原がん遺伝子産物MybのDNA結合ドメインは3個のリピート構造からなり、N末から順にR1,R2,R3と呼ばれている。各リピートの立体構造と機能に関して以下の事がわかった。
1.R3の立体構造をNMRにより解析し、3個のヘリックスからなり、2番目と3番目のヘリックスは、ホメオドメインや細菌のリプレッサータンパク質のDNA認識モチーフであるヘリックス・ターン・ヘリックス構造と類似した構造をとっていた。3番目のヘリックスがDNAの大きな溝にはまり、AACの配列を認識していることが示唆された。
2.R1の立体構造をNMRにより解析し、R3と類忍した立体構造で、同じく3個のヘリックスからなっていた。保存性の高い3個のトリプトファンは他の脂肪族アミノ酸とともに疎水性コアを形成していたが、ヒスチジンは関与していなかった。
3.R2とR3の両方を含むR23,DNA結合ドメイン全体のR123のNMRの解析からR3単独の立体構造はR23やR123中に保存されていた。
4.特異的なDNAとの相互作用の結果、DNAとの特異的な結合にはR23が必須であることがわかった。
5.DNAの一連の変異実験から、特異的な配列としてAACXGX(C/T/A)配列が同定できた。またDNA側のデリーションの実験と組み合わせることにより、R3がAAC配列をR2がGX(C/T/A)配列を認識していることが示された。
6.そのほかOmpR、HーNS,HU等に関してもDNA認識機構を検討した。

報告書

(1件)
  • 1992 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] 緒方 一博: "Solution structure of a DNA-binding unit of Myb" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 89. 6428-6432 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 平尾 一郎: "Extra ordinary stable mini-hairpins" Nucleic Acids Res.20. 3891-3896 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 谷川 潤: "Interaction of a protooncogene product,Myb with DNA" Nucleic Acids Symposium Series. 27. 163-164 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 平尾 一郎: "Stability difference between DNA and RNA minihairpins containing two G-C pairs" Nucleic Acids Symposium Series. 27. 127-128 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 上杉 晴一: "NMR studies of a DNA containing 8-Methoxy-deoxy guanosine" Nucleosides Nucleotides. 11. 261-272 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 皿井 明倫: "Stress-strain analysis of the B-A conformation transition" Biochemistry.

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書

URL: 

公開日: 1992-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi