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植物ゲノムの動的解析

研究課題

研究課題/領域番号 04304012
研究種目

総合研究(A)

配分区分補助金
研究分野 育種学
研究機関東京大学

研究代表者

平井 篤志  東京大学, 農学部, 教授 (60023470)

研究分担者 渡辺 昭  東京大学, 大学院・理学系, 教授 (70023471)
三上 哲夫  北海道大学, 農学部, 教授 (50133715)
亀谷 寿昭  東北大学, 遺伝子生態研究センター, 教授 (70006013)
常脇 恒一郎  福井県立大学, 生物資源学部, 教授 (20026438)
杉浦 昌弘  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 教授 (80027044)
研究期間 (年度) 1992 – 1994
研究課題ステータス 完了 (1994年度)
配分額 *注記
16,000千円 (直接経費: 16,000千円)
1994年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
1993年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
1992年度: 7,000千円 (直接経費: 7,000千円)
キーワード植物ゲノム / 核 / 葉緑体 / ミトコンドリア / 核ゲノム / 葉緑体ゲノム / ミトコンドリアゲノム / 構造変異 / RFLP分析 / 移行シグナル / 種間変異 / 遺伝子地図
研究概要

高等植物ゲノムの動的側面を主に分子レベルで多方面から解析し、過去の変異の延長上にある未来における有用な変異を予測し、将来の育種に役立たせることを目的とした。
植物細胞には細胞核の他に、葉緑体とミトコンドリアに遺伝情報が納められているが、これらオルガネラゲノムの動的側面の解析は、まずイネを用いて葉緑体ゲノムとミトコンドリアゲノムの両方で研究を行った。従来保守的と言われ、変異が少ないとされてきた、葉緑体ゲノムでは属内のみならず、種内においてもdirect repeatによる組換えにより欠失が起こることが確認され、変異に対する概念が改められた。ミトコンドリアゲノムは他の生物のそれに比べて、ゲノムサイズが大きいことと、複数の環状DNAから成るなど構造が複雑であることが知られている。構造を複雑にしている理由の一つに葉緑体からの転移した配列があるが、これらの配列をすべて同定し、転移がいろいろな時期に起きていること、転移した配列は変異しやすいことなどを明らかにした。またミトコンドリアゲノムには約60塩基でステム・ループ構造をとりうる反復配列が多数挿入されており、これがイネ属の進化の過程で、組換えを起こし、ゲノムの構造変異の引き金になっていることが明らかになった。
核ゲノムの進化では倍数性があげられる。コムギ属の2倍種、4倍種、6倍種の間の核ゲノムの分子的構造を比較し、倍数性によるゲノム分化は、主として非転写領域の変化に依存すること、この変異性を定量的に測定すると系統関係が推定できること、転写領域はゲノム間にほとんど分化がないこと、などが明らかにされた。

報告書

(4件)
  • 1994 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1993 実績報告書
  • 1992 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (30件)

  • [文献書誌] Nakazono,M.et el.: "Identification of the entire set of transferred chloroplast DNA sequences in the mitochondrial genome of rice." Mol.Gen.Genet.236. 341-346 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe,N.et al.: "Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Graminae." Curr.Genet.26. 512-518 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kanazawa,A.,et al.: "Reversible changes in the composition of the population of mtDNAs during dedifferentiation and regeneration in tobacco." Genetics. 138. 865-870 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wakasugi,T.et al.: "Loss of all ndh genes as determined by sequencing the entire chloroplast genome of the black pine,Pinus thunbergii." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 91. 9794-9798 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokoyama,R.et al.: "The rolC promoter of Agrobacterium rhizogenes Ri plasmid is activated by sucrose in transgenic tobacco plants." Mol.Gen.Genet.244. 15-12 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fukuoka,H.et al.: "Molecular changes of organelle DNA sequences in rice through dedifferentiation,long-term culture or the morphogenesis process." Plant Mol.Biol.26. 899-907 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono, M.et al. :"Identification of the entire set of transferred chloroplast DNA sequences in the mitochondrial genome of rice." Mol.Gen.Genet.236. 341-346 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe, N.et al. :"Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Graminae." Cuur.Genet.26. 512-518 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kanazawa, A., et al. :"Reversible changes in the composition of the population of mtDNAs during dedifferentiation and regeneration in tobacco." Genetics. 138. 865-870 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wakasugi, T.et al. :"Loss of all ndh genes as determined by sequencing the entire chloroplast genome of the black pine, Pinus thunbergii." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 91. 9794-9798 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yokoyama, R.et al. :"The rolC promoter of Agrobacterium rhizogenes Ri plasmid is activated by sucrose in transgenic tobacco plants." Mol.Gen.Genet.244. 15-22 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fukuoka, H.et al. :"Molecular changes of organelle DNA sequences in rice through dedifferentiation, long-term culture or the morphogenesis process." Plant Mol.Biol.26. 899-907 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe,N.et al.: "Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Graminae." Curr.Genet.26. 512-518 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "The rps3-rpl16-nad3-rps12 gene cluster in rice mitochondrial DNA is transcribed from alternative promoters." Curr.Genet.27. 184-189 (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Mori,N.et al.: "Wheat phylogeny determined by RFLP analysis of nuclear DNA.2.Wild tetraploid wheats." Theor.Appl.Genet.(in press).

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Wakasugi,T.et al.: "Loss of all ndh genes as determined by sequencing the entire chloroplast genome of the black pine,Pinus thunbergii." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 91. 9794-9798 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Fushimi,T.et al.: "Nucleotide sequence of a rice cDNA similar to a maize NADP-dependent malic enzyme." Plant Mol.Biol.24. 965-967 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Senda,M.,et al.: "Mitochondrial gene variation and phylogenetic relationships in the genus Beta." Theor.Appl.Genet.(in press).

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.: "Identification of the entire set of transferred chlorplast DNA sequences in the mitochondrial genome of rice." Mol.Gen.Genet.236. 341-346 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Murayama,Y.: "Purification of chloroplast elongation factor Tu and cDNA analysis in tobacco:the existence of two chloropast elongation factor Tu species." Plant Mol.Biol.22. 767-774 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Kidou,S.: "Molecular structure of ras-related small GTP-binding protein genes of rice plants and GTPase activities of gene products in Escherichia coli." FEBS Letter. 332. 282-286 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Kang,K.: "Selection and characterization of a 5-methyltryptophan resistant mutant in Zea mays." Euphytica. 69. 95-101 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Kubo,T.: "The sugar beet mitochondrial genome contains ORF sharing sequence homology with the gene for the 30kDa subunit of bovine mitochondrial complex I." Mol.Gen.Genet.241. 479-482 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Tsunewaki,K.: "Use of RFLP analyses for wheat germplasm evaluation." Biodiversity and Wheat Improvement. 17-30 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Kanno,A.: "Comtarative studies on the structure of chloroplast DNA from four species of Oryza:Cloning and physical map." Theor.Appl.Genet.83. 791-798 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Senda,M.: "The sugar beet mitochondrial gene for ATPase a-subunit:sequence,transcription and rearrangements in cytoplasmic male sterile plants." Curr.Genet.

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Konishi,T.: "Protein transport into thylakoid lumen-A stromal processing and the energy requirement for the import of the precursor for the 23-KD protein of PS II." Plant Cell Physiol.in press.

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Ye,L.: "Domeins required for nucleic acid binding activities in chloroplast ribonucleoproteins." Nucleic Acids Res.20. 6275-6279 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Liu,Y.: "Moderaately repeated,dispersed,and highly variable(MRDHV)genomic sequences of common wheat usable for cultivar identification." Theor.Appl.Gent.84. 535-543 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Kanno,A.: "Variations in chloroplast DNA from rice(Oryza sativa)differences between deletions mediated by short direct-repeat sequences within a single species." Theor.Appl.Genet.

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書

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公開日: 1992-04-01   更新日: 2016-04-21  

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