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ダイズ根粒菌超反復配列保有株の遺伝的解析

研究課題

研究課題/領域番号 04660066
研究種目

一般研究(C)

配分区分補助金
研究分野 土壤・肥料
研究機関茨城大学

研究代表者

南澤 究  茨城大学, 農学部, 助教授 (70167667)

研究期間 (年度) 1992 – 1993
研究課題ステータス 完了 (1993年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
1993年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
1992年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
キーワードダイズ / 根粒菌 / 反復配列 / 挿入因子 / 超反復配列保有株
研究概要

ダイズ根粒菌超反復配列保有株のゲノム当りのRSα・RSβ配列のコピー数をハイブリダイゼーション時の放射能強度から推定した。新潟農業試験場から多数単離された超反復配列保有株はいずれもRSα配列がゲノム当り80〜200コピーであり、通常株のRSα配列の1〜12コピーと比較して異常の多いことが明らかとなった。しかし、新潟農試の超反復配列保有株のRSβ配列は20コピー前後で通常株の数倍にすぎなかった。一方、十勝農業試験場の圃場に生息していた超反復配列保有株では、RSα・RSβ配列ともに通常株の数倍のコピー数であった。以上の結果より、超反復配列保有株の反復配列のコピー数は圃場によって異なっており、超反復配列保有株の生成されやすい環境が存在すると考えられた。
次に、超反復配列保有株と正常株の共生状態の諸性質と単生状態の生育速度を比較検討した。両者は共生状態において同等の根粒形成能・窒素固定活性・ヒドロゲナーゼ活性を示した。しかし、YM液体培地における対数期の増殖速度は超反復配列保有株において明らかに遅くなっていた。ちなみに同じ土壌の通常株の世代時間が4〜6時間であるのに対し、RSαのコピー数の極端に多い新潟農試の超反復配列保有株の世代時間は5〜9時間となった。パルスフィールド電気泳動によってダイズ根粒菌超反復配列保有株と通常株におけるRSα・RSβ配列の分布の検討を行ったところ、ゲノム上におけるRSαとRSβの分布域は、通常株で17%(RSα)、8%(RSβ)であったが、超反復配列保有株では74%(RSα)、42%(RSβ)となっていた。また、超反復配列保有株のゲノムサイズは通常株より大きい傾向が観察された。hup・nif遺伝子をプローブとしたハイブリダイゼーションにおいて超反復配列保有株のバンド数および位置は正常株と明らかに異なっていた。以上の結果より、超反復配列保有株ゲノムでは、RSα・RSβ配列の転移とそれに伴うゲノムの再構成が起きている可能性が強く示唆された。

報告書

(3件)
  • 1993 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1992 実績報告書
  • 研究成果

    (17件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (17件)

  • [文献書誌] Kiwamu Minamisawa: "Genetic relatedness of Bradyrhizobium japonicum field isolates as revealed by repeated sequences and various other characteristics" Appl.Environ.Microbiol.58. 2832-2839 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 南沢 究: "インドール酢酸生産能によるダイズ根粒菌の系統分類法" 日本土壌肥料学会誌. 63. 459-462 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 南沢 究: "ダイズ根粒菌の系統と生態" 土と微生物. 40. 37-46 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 南沢 究: "根粒菌の遺伝生態" 日本農芸化学会誌. 67. 1070-1072 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 南沢 究: "微生物の生態21微生物共生系をめぐって" 学会出版センター(出版予定),

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Minamisawa: "New horizons in nitrogen fixation" Kluwer Academic Publishers, 788 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Minamisawa, T.Seki, S.Onodera, M.Kubota, T.Asami: "Genetic relatedness of Bradyrhizobium japonicum field isolates as revealed by repeated sequences and various other characteristics." Appl.Environ.Microbiol.58. 2832-2839 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Minamisawa, H.Iino, N.Saito, S.Onodera, Y.Nakatsuka, S.Nakazima, M.Kubota, T.Asami: "Determination of genotype group of Bradyrhizobium japonicum by indole-3-acetic acid production" Jpn.J.Soil Sci.Plant Nutr.63. 459-462 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Minamisawa: "Phylogeny and ecology of Bradyrhizobium japonicum" Soil Microorganisms. 40. 37-46 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Minamisawa: "Genetic ecology of Rhizobium and Bradyrhizobium" Nippon Nougeikagaku Kaisi. 67. 1070-1072 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1993 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 南沢 究: "根粒菌の遺伝生態" 日本農芸化学会誌. 67. 1070-1072 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 南沢 究: "「窒素固定の遺伝生態」IGEシリーズNo19" 東北大学遺伝生態研究センター, 80 (1994)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] K.Minamisawa et al.: "New horizons in nitrogen fixation" Kluwer Academic Publishers, 788 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 南沢 究: "ダイズ根粒菌の系統と生態" 土と微生物. 40. 37-46 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 南沢 究: "根粒菌の遺伝生態" 日本農芸化学会誌. 67. (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] Kiwamu Minamisawa: "Genetic relatodness of Bradyrhizobium japonicum field isolates as revealed by repeated sequences and various other characteristics." Applied and Environmental Microbiology. 58. 2832-2839 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 南沢 究: "微生物の生態21ー微生物共生系をめぐって 根粒菌の宿主植物相互作用と生態(発表予定,分担執筆" 編者 日本微生物生態学会 発行所 学会出版センター,

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書

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公開日: 1992-04-01   更新日: 2016-04-21  

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