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抗原受容体遺伝子の組換え認識配列に結合するRBP-Jk蛋白質の特異性の研究

研究課題

研究課題/領域番号 04670142
研究種目

一般研究(C)

配分区分補助金
研究分野 医化学一般
研究機関奈良先端科学技術大学院大学 (1993)
京都大学 (1992)

研究代表者

川市 正史  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (00195041)

研究期間 (年度) 1992 – 1993
研究課題ステータス 完了 (1993年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
1993年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1992年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードRBP-Jk蛋白質 / VDJ-組換えシグナル / 認識DNA配列 / NF-kB認識配列 / E(spl)遺伝子 / 転写因子 / ゲルシフトアッセイ / コア認識配列 / ランダムオリゴマー
研究概要

両端にPRC用のプライマー部分を持ち中央に20塩基対のランダムな配列を導入したDNAを合成し、マウスの精製したRBP-Jk蛋白質と反応させてゲルシフトアッセイで蛋白質に結合したオリゴマーを回収しPCRで増幅する。このステップを繰り返してRBP-Jk蛋白質に強く結合するオリゴマーを得てその配列を決定したところ、結合オリゴマーはCGTGGGAAをコンセンサスとする配列を共有していることが明らかになった。このようにして得られたオリゴマーを標識してプローベとしゲルシフトアッセイを行なったところ、コンセンサス配列に近い配列を持つオリゴマーほど強く結合し、V(D)J組換えのシグナル配列プローベに比べて最大12倍強く結合した。この結果は、RBP-Jk蛋白質の認識配列はV(D)J-組換えのシグナルそのものではなくCGTGGGAAをコアとする配列であることを示している。このコア配列は、転写因子NF-kBの認識配列と類似している。実際、マウスのb-2-ミクログロブリン遺伝子プロモーターのNF-kB配列はRBP-Jk蛋白質と結合した。さらに、この配列に類似した配列をプロモーター領域に持つ遺伝子を核酸のデータベースの中から検索したところ、ショウジョウバエのEnhancer of Split遺伝子群のm8遺伝子がこの配列を持っていることが明らかになった。m8遺伝子は末梢神経系の発生に関与するneurogenic遺伝子の一つであり、遺伝学的解析からRBP-Jk遺伝子機能の標的遺伝子である可能性が高いことが示されている。これらの結果はRBP-Jk蛋白質は転写因子として機能している可能性を強く示唆している。

報告書

(2件)
  • 1993 実績報告書
  • 1992 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (4件)

  • [文献書誌] 尼川龍一ほか: "Human Jk recombination signal binding protein gene(IGKJRB):comparison with its mouse homologue" Genomics. 17. 306-315 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Tin Tun ほか: "Recognition sequence of a highly conserved DNA binding protein RBP-Jk" Nucleic Acids Res.(in press).

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] 古川 貴久: "The drosophila homolog of the immunoglobulin recombination signal-binding protein regulates peripheral nervous system development" Cell. 69. 1191-1197 (1992)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書
  • [文献書誌] 尼川 龍一: "Human Jk recombination signal binding protein (RBP-Jk)gene:comparison with its murine homologue" Genomics. (1993)

    • 関連する報告書
      1992 実績報告書

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公開日: 1992-04-01   更新日: 2016-04-21  

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