| 研究課題/領域番号 |
04J03636
|
|---|
| 研究種目 |
特別研究員奨励費
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 応募区分 | 国内 |
|---|
| 研究分野 |
物理系薬学
|
|---|
| 研究機関 | 千葉大学 |
|---|
研究代表者 |
森 健一 千葉大学, 大学院医学薬学府, 特別研究員(DC1)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2004 – 2006
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2006年度)
|
| 配分額 *注記 |
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2006年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2005年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2004年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
|
|---|
| キーワード | Gタンパク質 / マグネシウム / シミュレーション / 生体膜 / モデリング / データベース / Mgイオン / ラフト / 分子動力学 / 糖鎖 / 糖脂質 / G蛋白質 / 糖脂質膜 |
|---|
| 研究概要 |
Mg^<2+>イオンの局所的濃度変化によるG蛋白質の制御機構を解明すべく、以下のことを行った。
1.G蛋白質・生体膜・イオン複合体モデルの自動構築プログラムの開発
2.ラフトモデルの分子動力学シミュレーションによる生体膜界面の特性の検討
3.脂質二重膜モデルのライブラリー拡充とデータベースの構築
1.の結果、および、これまでの研究成果を博士論文としてまとめあげた。今後、同内容に追加計算の結果を加え、国際誌に投稿する予定である。
2.は、前年度に開発した生体膜構築プログラムGLYMMを用いて、ラフトモデルを構築し、その分子動力学シミュレーションを行い、生体膜界面の電気特性、および、イオン濃度を解析した。その結果を、アルツハイマー病の主因であるアミロイドβのラフト上凝集と絡め、論文としてまとめ、国際誌に投稿した。Reviewerからの意見を参考に再計算をし、再投稿を予定している。
脂質分子の違いによって、膜界面でのMg^<2+>イオンの局所的濃度変化が起こるかを明らかにするため、GLYMMを用いて、計90種類の異なる脂質分子から成る脂質二重膜モデルのシミュレーションを行い、3.の膜ライブラリーを構築した。結果をデータベースとして構築し、膜界面でのMg^<2+>イオンの挙動を追う基盤を構築した。データベースは学外の研究者にも使ってもらえるよう公開している。
http://bukka.p.chiba-u.jp/glvmm/database1/index.html
3.の内容も博士論文としてまとめた。今後、加筆修正し、国際誌に投稿する予定である。
|
