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イネミトコンドリアゲノムの機能解析による分子育種学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 05404007
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関東京大学

研究代表者

平井 篤志  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (60023470)

研究分担者 堤 伸浩  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (00202185)
多々良 敦  東京大学, 農学部, 助教授 (60114542)
武田 元吉  東京大学, 農学部, 教授 (90134501)
研究期間 (年度) 1993 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
33,500千円 (直接経費: 33,500千円)
1996年度: 4,800千円 (直接経費: 4,800千円)
1995年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
1994年度: 4,400千円 (直接経費: 4,400千円)
1993年度: 21,500千円 (直接経費: 21,500千円)
キーワードイネ / ミトコンドリアゲノム / 転写制御 / 転写開始点 / 転写地図 / 反復配列 / PRS
研究概要

ミトコンドリアは呼吸を通して、貯蔵エネルギーを生物が利用しやすいATPに変換する。しかし高等植物のミトコンドリアゲノムは構造が複雑で、ゲノムの分子構造と機能の関係が余り解明されておらず、育種へ応用が限定されている。本研究ではイネのミトコンドリアゲノム全体の遺伝子の位置を特定し、転写を調べ、それから遺伝子発現の制御因子についても解明し、その改変による育種への応用の基礎データを得ることをめざした。
ミトコンドリアゲノム全体の転写領域を特定し、詳しく解析しゲノムの物理地図上に位置を示した。その過程で、ABC型ヘム輸送タンパク質の遺伝子であるhelC(orf240)とNADH脱水素酵素のサブユニット6の遺伝子であるnad6をtrnN遺伝子の近傍に新たに見つけ、遺伝子の塩基配列を決定した。
次に転写単位の転写開始点を、in vitro キャッピング法とRNaseプロテクション法で調べた。その結果、イネにおいてもCRTAがミトコンドリアのプロモーターの中心配列であることが明らかになった。さらにミトコンドリアゲノムにおける遺伝子発現を解析した結果は、その機構は非常に柔軟であることを示している。たとえば、trnfM遺伝子はrrn26の上流から複製された76塩基の共通配列をプロモーターにして転写される。また葉緑体から転移したtrnHの転写にミトコンドリア特異配列がプロモーターとして働いたり、葉緑体転移配列がミトコンドリア固有の遺伝子であるnad9を発現させていたことも明らかになっている。これらはゲノムの構造変異に対応して遺伝子発現も柔軟になっていることを示している。ミトコンドリアはエネルギーの消費器官であり、その活動は必要最小限に限られるべきである。これらの機構は微妙な発現制御を可能にし、移動の自由がない植物が種々の環境かで生き延びるための戦略であると思われる。

報告書

(5件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 1994 実績報告書
  • 1993 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (36件)

  • [文献書誌] Watanabe,N.et al.: "Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Graminae." Curr.Genet.26. 512-518 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "A small repeated sequence contains the transcription initiation sites for both trnfM and rrn26 in rice mitochondria." Plant Mol.Biol.28. 345-348 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "Multiple initiation sites for transcription of a gene for subunit 1 of F1-ATPase(atp1) in rice mitochondria." Curr. Genet.29. 417-422 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Zeltz,P.et al: "A promiscuous chloropast DNA fragment is transcribed in plant mitochondria but the encoded RNA is not edited." Plant Mol.Biol.31. 647-656 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "A chloroplast-derived sequence is utilized as a source of promoter sequences for the gene for subunit 9 of NADH dehydrogenase (nad9) in rice mitochondria." Mol.Gen.Genet.252. 371-378 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kadowaki,K.et al.: "Targeting presequence acquisiton after mitochondrial gene transfer to the nucleus occurs by duplication of existing targeting signal." EMBO J.15. 6652-6661 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe, N.et al.: "Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Graminae." Curr. Genet. 26. 512-518 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono, M.et al.: "A small repeated sequence contains the transcription initiation sites for both trnfM and rrn26 in rice mitochondria." Plant Mol. Biol.28. 345-348 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono, M.et al.: "Multiple initiation sites for transcription of a gene for subunit 1 of F1-ATPase (atp1) in rice mitochondria." Curr. Genet.29. 417-422 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Zeltz, P.et al.: "A promiscuous chloropast DNA fragment is transcribed in plant mitochondria but the encoded RNA is not edited." Plant Mol. Biol.31. 647-656 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono, M.et al.: "A chloroplast-derived sequence is utilized as a source of promoter sequences for the gene for subunit 9 of NADH dehydrogenase (nad9) in rice mitochondria." Mol. Gen. Genet.252. 371-378 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kadowaki, K.et al.: "Targeting presequence acquisiton after mitochondrial gene transfer to the nucleus occurs by duplication of existing targeting signal." EMBO J.15. 6652-6661 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "The gene for a subunit of the ABC-type heme transporter is transcribed together with the gene for subunit 6 of NADH dehydrogenase in rice mitochondria." Curr.Genet.29. 412-416 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "Multiple initiation sites for transcription of a gene for subunit 1 of F1-ATPase(atp1) in rice mitochondria." Curr.Genet.29. 417-422 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Zeltz,P.et al.: "A promiscuous chloropast DNA fragment is transcribed in plant mitochondria but the encoded RNA is not edited." Plant Mol.Biol.31. 647-656 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M:et al.: "A chloroplast-derived sequence is utilized as a source of promoter sequences for the gene for subunit 9 of NADH dehydrogenase (nad9) in rice mitochondria." Mol.Gen.Genet.252. 371-378 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Kadowaki,K.et al.: "Targeting presequence acquisiton after mitochondrial gene transfer to the nucleus occurs by duplication of existing targeting signal" EMBO J.15. 6652-6661 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Miyata,S.et al.: "Four kinds of plasmid-like DNA of rice mitochondria are transcribed." Breed.Sci.47. 51-55 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Itadani,H.et al.: "Nucleotide sequence of a 28 kbp portion of rice mitochondrial DNA:the exitence of many sequences that correspond to parts of mitochondrial genes in intergenic regions." Plant Cell Physiol.35. 1239-1244 (1994)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "The rps3-rpl16-nad3-rps12 gene cluster in rice mitochondrial DNA is transcribed from alternative promoters." Curr.Genet.27. 184-189 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "Nomologous reconmbination mediated by two palindromic repeated sequences in the mitochondrial genome of Oryza." Theor.Appl.Genet.91. 1-8 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "A small repeated sequence contains the transcription initiation sites for both trnfM and rrn 26 in rice mitochondria." Plant Mol.Biol.28. 345-348 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "The CRTA motif is present in the promoters of mitochondrial genes of rice." Palnt Sci.105. 227-234 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nishiwaki,S.et al.: "Structure of a gene for subunit 9 of NADH dehydrogenase (nad9) in rice mitochondria and RNA editing of its transcript." Plant Cell Physiol.36. 1135-1138 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Watanabe,N.et al.: "Evolutionary variation in DNA sequences transferred from chloroplast genomes to mitochondrial genomes in the Graminae." Curr.Genet.26. 512-518 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Kanazawa,A.,et al.: "Reversible changes in the composition of the population of mtDNAs during dedifferentiation and regeneration in to bacco." Genetics. 138. 865-870 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Itadani,H.,et al.: "Nucleotide sequence of a 28 kbp portion of rice mitochondrial DNA:the existence of many sequences that correspond to parts of mitochondrial genes in intergenic regions." Plant Cell Physiol.35. 1239-1244 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "The rps3-rpl16-nad3-rps12 gene cluster in rice mitochondrial DNA is transcribed from alternative promoters." Curr.Genet.27. 184-189 (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "Homologous recombination mediated by two palindromic repeated sequences in the mitochondrial genome of Oryza." Theor.Appl.Genet.(in press.).

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.et al.: "The CRTA motif is present in the promoters of mitochondrial genes of rice." Plant Sci.(in press.).

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Kanno,A.: "A transcription map of the chloroplast genome from rice(Oryza sativa)." Curr.Genet.23. 166-174 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.: "Identification of the entire set of transferred chloroplast DNA sequences in the mitochondrial genome of rice." Mol.Gen.Genet.236. 341-346 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Kanno,A.: "Variations in chloroplast DNA from rice(Oryza sativa):differences between deletions mediated by short direct-repeat sequences within a single species." Theor.Appl.Genet.86. 579-584 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Kanazawa,A.: "Restriction fragments homologous to mitochondrial plasmid-like DNAs are located within limited chromosomal regions on the rice nuclear genome." Theor.Appl.Genet.(in press).

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Nakazono,M.: "Palindromic repeated sequences(PRSs)in the mitochondrial genome of rice:evidence for their insertion after divergence of the genus Oryza from the other Gramineae." Plant Mol.Biol.(in press.).

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Hirai,A.: "Six percent of the mitochondrial genome in rice came from chloroplast DNA." Plant Mol.Biol.Reporter. 11. 98-100 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書

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公開日: 1993-04-01   更新日: 2016-04-21  

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