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PCR法を応用した水の安全性評価手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 05453200
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 環境保全
研究機関東京大学

研究代表者

大垣 眞一郎  東京大学, 工学部, 教授 (20005549)

研究分担者 神子 直之  東京大学, 工学部, 助手 (70251345)
山本 和夫  東京大学, 工学部, 助教授 (60143393)
研究期間 (年度) 1993 – 1994
研究課題ステータス 完了 (1994年度)
配分額 *注記
7,100千円 (直接経費: 7,100千円)
1994年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
1993年度: 4,500千円 (直接経費: 4,500千円)
キーワードPCR法 / RNAファージ / MPN / ウイルス指標 / 紫外線消毒 / モニタリング
研究概要

PCR法の定量的検出法としての開発を、その前処理を含めて検討を行い、さらに、紫外線消毒を例とした処理プロセスを経た水へのPCR法の適用を試みた。モデルウイルスとしては、RNAフア-ジQβを用いた。
「PCR法の定量性に関する手法の改良」を行うために、逆転写酵素を用いた逆転写プロセスと、DNA複製酵素を用いたPCRサイクルの両プロセスにおける、緩衝液濃度の最適化、および、定量限界をできるだけ下げるための二重にPCRを行うネステッドPCRの開発研究を行った。その結果、希釈終点法によるQβの定量限界が1PFUであることが確認でき、さらに、n段階n本法における最確値をコンピュータープログラムを用いて求めることにより、PCR法の結果を定量的に扱える道筋を示した。
また、「処理方式がPCR法に与える影響の調査」を実験的に検討した。すなわち、消毒手法の一例として紫外線消毒法を取り上げ、消毒効果の定量を従来法であるブラック法と多段希釈のPCR法とで比較を行った。その結果、紫外線照射によって不活化されたQβの多くをPCR法は検出してしまい、その程度が、Qβの全塩基対の長さと、PCRによる増幅の標的塩基対の長さの差に起因している可能性が示唆された。
その結果、多段希釈PCR法によって紫外線消毒法の効果の監視を行うことは現段階では難しく、さらに検討を要することが明らかになった。

報告書

(3件)
  • 1994 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1993 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (11件)

  • [文献書誌] 片山浩之,神子直之,大垣眞一郎: "水中のRNAファージのポリメラーゼチェインリアクション(PCR)法による検出" 土木学会第48回年次学術講演会講演概要集第2部. 1246-1247 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 片山浩之,大垣眞一郎,神子直之: "紫外線によって不活化されたファージのPCR法による検出" 第28回日本水環境学会年会講演集. 494-495 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] L Sunun,N Kamiko,K.Yamamoto,S.Ohgaki: "Application of Polymerase Chain Reaction to Detect RNA coliphage Qβ in Environmental water Samples" IAWQ 17th Biennial International Conference Conference Preprint Book 3. 89-96 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 片山浩之,神子直之,大垣眞一郎: "RT-PCR法による水中の大腸菌RNAファージの定量的測定" 第29回日本水環境学会年会講演集. (発表予定). (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroyuki Katayama, Naoyuki Kamiko and Shinichiro Ohgaki: "Detection of RNA phage in water by PCR method" Proc. of Annual Conf. JSCE. 48-II. 1246-1247 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroyuki Katayama, Shinichiro Ohgaki and Naoyuki Kamiko: "Detection of phages inactivated by ultraviolet light" Proc. of Annual Conf. Jap. Soc. of Water Environ. 28. 494-495 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] L.Sunun, N.Kamiko, K.Yamamoto and S,Ohgaki: "Application of polymerase chain reaction to detect RNA coliphage Q-beta in environmental water samples" Water Sci. and Tech.(in press). (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroyuki Katayama, Naoyuki Kamiko , Shinichiro Ohgaki: "Quantitative measurement of RNA coliphage Q beta by using PCR method" Proc. of Annual Conf. Jap. Soc. of Water Environ.29. (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] L.Sunun: "Application of Polymerase ChainReaction to Detect RNAColiphage Qβ inEnrironmental Water Samples)" Water Science and Technology. (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 片山浩之.神子直之.大垣眞一郎: "紫外線によって不活化されたファージのPCR法による検出" 日本水環境学会年会講演集. 第28回(発表予定). (1994)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Sunun Limsawat,Shinichiro Ohgaki: "Application of Polymerase Chain Reaction to Detect RNA Coliphage Qβ in Environmtal Water Sample" Health-Related Water Microbiology Symposium 1994. (発表予定). (1994)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書

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公開日: 1993-04-01   更新日: 2016-04-21  

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