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時間分解共鳴ラマン分光法によるタンパク質の速い構造変化の検出

研究課題

研究課題/領域番号 05453212
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物物理学
研究機関岡崎国立共同研究機構

研究代表者

北川 禎三  岡崎国立共同研究機構, 分子科学研究所, 教授 (40029955)

研究分担者 小倉 尚志  岡崎国立共同研究機構, 分子科学研究所, 助手 (70183770)
研究期間 (年度) 1993 – 1994
研究課題ステータス 完了 (1994年度)
配分額 *注記
7,500千円 (直接経費: 7,500千円)
1994年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
1993年度: 5,500千円 (直接経費: 5,500千円)
キーワード共鳴ラマン / 時間分解ラマン分光 / ミオグロビン / チトクロム酸化酵素 / 蛋白質分子動力学 / タンパク質ダイナミクス
研究概要

酵素が示す特異的反応性は、反応中心における触媒活性に加えて、そとりまく蛋白質の合目的的な構造変化が重要である。未反応の基質を取り込み、生成放出するメカニズムがあって初めて酵素は繰り返し反応できる。その役割を担うのが質部分であり、それはかなり速いコンフォメーション変化を含む。本研究では呼吸系いて酵素を水に変える酵素であるチトクロム酸化酵素と、酸素貯蔵タンパクであるミロビンの反応中間体を時間分解共鳴ラマン分光法で追跡した。ウシ心筋チトクロム酸素と一酸化炭素との複合体をレーザー光で光解離させることによりO_2反応をスタートさせ、a_3ヘムに結合するO_2に4個の電伝達していった各段階における共鳴ラマンスペクトルを測定した。酸素同位体でシフるバンドを調べ、Fe^<III>-O^-_2→Fe^<III>-O-O-Cu^<II>→Fe^<IV>=O→Fe^<III>-OHと変化していくことを初めて確立し、本酵素の60年間に及ぶ研究の歴史にブクスルーを作った。ミオグロビンの分子構造はdeoxy型もoxy型も1.5Å分解能のX線結晶解析で明らかにされているが、そのいづれにおいてもO_2が蛋白の外側からヘム鉄に到達する道筋が存在しない。リガンドの脱着に伴う蛋白の速造変化をナノ秒のポンプ/プローブ時間分解ラマン分光法で追跡した。リガンドと一酸化炭素を用いた。COはサブピコ秒で光解離し、100ナノ秒からミリ秒にかけ結合する。再結合した分子のFe-co伸縮振動を観測するシステムを組立て、まずミオグロビンとその遠位ヒスチヂン変異体6種について上記の測定をした。続いてクミオグロビンの人工変異体についても数種測定し、静的なFe-co伸縮振動数が〜0cm^<-1>のものの再結合が〜510cm^<-1>のものより速いことを見つけた。しかし再結合途中で、いわゆるオープン形に対応するバンドはされなかった。この結果の解決のため、蛋白質の分子動力学計算をする一方で、非経分子軌道計算をも実施した。

報告書

(3件)
  • 1994 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1993 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

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すべて 文献書誌 (27件)

  • [文献書誌] T.Kitagawa and Y.Mizutani: "Resonance Raman Spectra of High Oxidized Metalloporphyrins and Hene Pteins" Coordination Chemistry Reviews. 135. 685-735 (1994)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Nakajima and T.Kitagawa: "Recombination Intermediates of otodissociated CO Myoglobins at AmbienTemperatures Detected by Time-Resolvedesonance Raman" Journal of the American ClemicaSociety. 116. 10318-10319 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] D.A.Proshlyakov,T.Ogura,K.Shinza-Itoh,S.Yoshikawa,E.H.Appelman and T.tagawa: "Selective Resonance Enhancementf the “607nm"Form Generated in the Reaion of Oxidized Cytochrome c Oxidase wh Hydrogen Peroxide" Journal of Biological Chemistry22GD03:269. 29385-29388 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] P.Jewsbury,S.Yamamoto,T.Minato,Saito and T.Kitagawa: "The Proximal Residue Largely Dermines the CO Orientation in Carbonmony Globin Proteins.An ab initio Stuty oa Haem Prosthetic Unit." Journal of the American ChemicaSociety. 116. 11586-11587 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] P.Jewsbury and T.Kitagawa: "The DistalResidue-CO Interacionn Carbonmonoxy Myoglobins:A Molecula Damics Study of Two Distol Histidine Taomers" Biophysical Journals. 67. 2236-2250 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Hirota,T.Ogura,E.H.Appelman,Khinzawa,S.Yoshikawa,& T.Kitagawa: "Observation of a New Oxygen-Isope-Sensitive Raman Band for Oxy-hemopreins and Its Implications in Heme Pock Structures" Journal of the American ChemicaSociety. 116. 10564-10572 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Ogura, S.Takahashi, S.Hirota, K.Shinzawa-Itoh, S.Yoshikawa, E.H.Appelman, and T.Kitaqawa: "Time-resolved resonance Raman elucidation of the pathway for dioxygen reduction by cytochrome c oxidase." J.Am.Chem.Soc. 115. 8527-8536 (1993)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Kitagawa and T.Ogura: "Time-resolved resonance Ramen spectroscopy of heme proteins : Visible to UV and ns to ms." Advances in Spectroscopy. 21, Part B. 139-188 (1993)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Mizutani, S.Tokutomi, and T.Kitagawa: "Resonance Raman spectra of the photointermediates in phytochrome phototransformation : Deprotonation of the chromophore in the bleached intermediate" Bi ochemistry. 33. 153-158 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Hirota, T.Mogi, T.Ogura, T.Hirano, Y.Anraku, and T.Kitagawa: "Observation of the Fe-O_2 and Fe^<IV>=O stretching Raman bands for dioxygen reduction intermediates of cytochrome bo isolated from Escherichia coli." FEBS Lett. 352. 67-70 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Nakashima and T.Kitagawa: "Recombination intermediates of photodissociated CO myoglobin at ambient temperatures detected by time-resolved resonance Raman spectroscopy." J.Am.Chem.Soc. 116. 10318-10319 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Hirota, T.Ogura, K.Shinzawa-Itoh, S.Yoshikawa, M.Nagai, and T.Kitagawa: "Vibrational assignments of the FeCO unit of CO-bound heme proteins revisited : Observation of a new CO-isotope-sensitive Raman band assignable to the FeCO bending fundamental." J.Phys.Chem.98. 6652-6660 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] D.A.Proshlyakov, T.Ogura, K.Shinzawa-Itoh, S.Yoshikawa, E.H.Appelman, and T.Kitagawa: "Selective resonance Raman observation of the "607 nm" form generated in the reaction of oxidized cytochrome c oxidase with hydrogen peroxide." J Biol.Chem.269. 29385-29388 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Hirota, T.Ogura, E.H.Appelmen, K.Shinzawa-Itoh, S.Yoshikawa, and T.Kitagawa.: "Observation of a new oxygen-isotope-sensitive Raman band for oxyhemoproteins and its implications in heme pocket structures." J.Am.Chem.Soc.116. 10564-10572 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] P.Jewbury and T.Kitagawa: "The distal residue-CO interaction in carbonmonoxy myoglobins : a molecular dynamics study of two distal histidine tautomers." Biophys.J.67. 2236-2250 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] P.Jewsbury, S.Yamamoto, T.Minato, M.Saito, and T.Kitagawa: "The proximal residue largely determines the CO orientation in carbonmonoxy globin proteins. An ab initio study of a haem prosthetic unit." J,Am.Chem.Soc.116. 11586-11587 (1994)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Lian, B.Locke, T.Kitagawa, M.Nagai, and R.M.Hochstrasser: "Determination of Fe-CO geometry in the subunits of carbonmonoxy hemoglobin M Boston using femtosecond infrared spectroscopy." Biochemi stry. 32. 5809-5914 (1993)

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      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Sakan, T.Ogura, T.Kitagawa, F.A.Fraunfelter, R.Mattera, and M.Ikeda-Saito: "Time-resolved resonance Raman study on the binding of carbonmonoxide to recombinant human myoglobin and its distal histidine mutants." Biochemi stry. 32. 5815-5824 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1994 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Kitagawa and Y.Mizutani: "Resonance Raman Spectra of Highly Oxidized Metalloporphyrins and Heme Proteins" Coordination Chemistry Reviews. 135. 685-735 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] S.Nakashima and T.Kitagawa: "Recombination Intermediates of Photodissociated CO Myoglobins at Ambient Temperatures Detected by Time-Resolved Resonance Raman Spectroscopy" Journal of tha American Chemical Society. 116. 10318-10319 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] D.A.Phoshlyadov,T.Ogura,K.Shinzawa-Itoh,S.Yoshikawa,E.H.Appelman,and T.Kitagawa: "Selective Resonance Enhancement of the “607nm" Form Generated in the Reaction of Oxidized Cytochrome c Oxidase with Hydrogen Peroxide" Journal of Biological Chemistry. 269. 29385-29388 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] P.Jewsbury,S.Yamamoto,T.Minato,M.Saito,and T.Kitagawa: "The Proximal Residue Largely Determines the CO Orientation in Carbonmonoxy Globin Proteins.An ab intio Study of a Haem Prosthetic Unit" Journal of the American Chemical Society. 116. 11586-11587 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] P.Jewsbury and T.Kitagawa: "The Distal Residue-CO Interaction in Carbonmonoxy Myoglobins:A Molecular Dynamics Study of Two Distal Histidine Tautomers" Biophysical Journals. 67. 2236-2250 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] S.Hirota,T.Ogura,E.H.Appelman,K.Shinzawa-Itoh,S.Yoshikawa,and T.Kitagawa: "Observation of a New Oxygen-Isotope-Sensitive Raman Band for Oxy-Hemoproteins and Its Implications in Heme Pocket Structures" Journal of the American Chemical Society. 116. 10564-10572 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] T.Ogura.S.Takaheshi,S.Hirota,K.Shinzawa,S.Yoshikawa,T.Kitagawa: "Time‐Rasdved Resonance Raman,Elucidarion of the Pathway for Dioxyyen Reduction by Cytochrome c Oxidase" Journal of the American chenical Society. 115. 8527-8536 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Sakan,T.Ogur,T.Kitagawa,F.A.Fraunifelter,R.Mattera,M.Ikeda: "Time‐Resdved Resonance Raman Study on the Binding of Carbon Monokede to Recombinent Human Myoglobin and its Distal Histidine Mutants" Biochemistry. 32. 5815-5824 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] S.Takahashi,J.S.Ahn,s.asaka T.Kitagawa: "Multichannel Fourier Transtorm Spectroscopy Using Two‐Dinensional Detection of the Itorferogram and Its Application to Raman Spectroscopy" Applied Spectroscopy. 47. 863-868 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書

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公開日: 1993-04-01   更新日: 2019-02-28  

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