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塩基非特異的リボヌクレアーゼの触媒機構・塩基認識機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 05454574
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物系薬学
研究機関星薬科大学

研究代表者

入江 昌親  星薬科大学, 薬学部, 教授 (70061265)

研究分担者 中村 和郎  明治大学, 薬学部, 教授 (00012675)
岩間 正典  星薬科大学, 薬学部, 講師 (50130753)
扇 和子  星薬科大学, 薬学部, 助教授 (90061291)
研究期間 (年度) 1993 – 1995
研究課題ステータス 完了 (1995年度)
配分額 *注記
5,400千円 (直接経費: 5,400千円)
1995年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
1994年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
1993年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
キーワードリボヌクレアーゼ / RNase / 遺伝子工学 / X線結晶解析 / 改変体 / 活性中心 / 反応機構 / 塩基認識機構 / 触媒機構 / 塩基非特異的リボヌクレアーゼ
研究概要

1.塩基非特異的リボヌクレアーゼ(RNasae T2 family RNase)に属する種々の起原の酵素(ウスバタケ、カキ、牛脾臓、ウシガエル肝、イカ肝、ニワトリ肝)について一次構造の解明を試み、前4者については全構造を後2者については大半の構造を決定した。何れの酵素についても活性中心を構成するアミノ酸残基は2箇所の短いペプチド鎖中に集中しており一種のカセット状になっている。これらの酵素中動物由来の酵素のN-末端付近の配列及びCys残基の位置は真菌の酵素と異なり、むしろ植物の酵素に似た配列を示しRNase T2 family酵素の分子進化の筋道を示している。2.RNase RhのX線結晶解析をRNase Rh-2′-AMP及び-d(ApC)複合体について行ったところB1部位はTyr57とTrp49の間にスタッキングしており、Asp51が直接塩基と水素結合していることがわかった。またB2部位に関してPhe101が塩基とスタッキングしておりその他にGln95等が一種の蓋の様に働いている事も明らかとなった。またLys108がリン酸基に近接している場合があることも分かった。3.真菌由来のRNase Rhの活性中心及び塩基認識部位のアミノ酸残基の改変により、各アミノ酸残基の役割の推定を行った。Lys108はLeuに置換すると活性を失う。Ang,Thr,Ser等のプロトン供与能を持った残基への置換は能率は減少するがLys108の代わりとなった。Asp51はGlu,Gln,Asn等に置換することで塩基優先性がアデニンからグアニンに変わる。この事はAsp51がRNase Rhのアデニン塩基優先性に極めて重要であることを示している。塩基認識部位のTyr57は必ずしも芳香環である必要はないが芳香環である方が触媒能が高い。Trp49は活性中心の構造を維持するために必須であり、この改変は活性を極端に減少させる。4.トマトのRNase LEを酵母で発現させることが出来、結晶化にも成功している。現在X線結晶解析中である。近く植物酵素と真菌酵素の差異を明らかにしうると考える。

報告書

(4件)
  • 1995 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1994 実績報告書
  • 1993 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (20件)

  • [文献書誌] Watanabe,H.,Narumi,H.,Inaba,T.,Ohgi,K. &Irie,M.: "Purification,some properties and primary structure of a base non-specific ribonuclease from oyster(Crussdstrea grigus)." J. Biochem.114. 800-807 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Irie,M.,Ohgi,K. Watanabe,H.,Iwama,M.,Nakamura,T. K.,et. al.: "pH-profile of kinetic constants of RNase Rh from Rhizopus niveus and its mutant enzymes towards UpU and possible mechanisms of RNase Rh." J. Biochem.115. 1083-1087 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi,K.,Iwama,M. Tada,K.,Takizawa,R. & Irie,M.: "Role of Lys108 in the enzymatic activity of RNase Rh from Rhizopus niveus." J. Biochem.117. 27-33 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yagi,H.,Kobayashi,H.,Inokuchi,N.,Koyama,T. & Irie,M.: "Purification and properties of a base non-specific acid ribonuclease from bullfrog(Rana catesbeiana)." Biol. Pharm. Bull.18. 219-222 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe,H.,Hamid Fauzi,Iwama,M.,Onda,T.,Ohgi,K. & Irie,M.: "Base non-specific acid ribonuclease from Irpex lacteus. Primary structure,phylogenetic relationship in RNase T2 family enzyme." Biosci. Biotech. Biochem.59. 2097-2103 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi,K.,Takeuchi,M.,Iwama,M. & Irie,m.: "Enzymatic properties of mutant enzymes at Trp49 and Tyr57 of RNase Rh from Rhizopus niveus." J. Biochem.119. 9-15 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi,K.,Takeuchi,M.,Iwama,M. & Irie,M.: "Enzymatic properties of mutant forms of RNase Rh from Rhizopus niveus at to Asp51." J. Biochem.119(in press). (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe, H.: "Purification, some properties and primary structure of a base non-specific ribonuclease from oyster (Crussdstrea grigus)." J.Biochem.114. 800-807 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Irie, M.: "pH-profile of kinetic constants of RNase Rh from Rhizopus niveus and its mutant enzymes towerds UpU and possible mechanisms of RNase Rh." J.Biochem.115. 1083-1087 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi, K.: "Role of Lys108 in the enzymatic activity of RNase Rh from Rhizopus niveus." J.Biochem.117. 27-33 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yagi, H.: "Purification and properties of a base nonspecific acid ribonuclease from bullfrog (Rana catesbeiana)" Biol. Pharm. Bull.18. 219-222 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Watanabe, H.: "Base non-specific acid ribonuclease from Irpex lacteus. Primary structure, phylogenetic relationship in RNase T2 family enzyme." Biosci. Biotech. Biochem.59. 2097-2103 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi, K.: "Enzymatic properties of mutant enzymes at Trp49 and Tyr57 of RNase Rh from Rhizopus niveus." J.Biochem.119. 9-15 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi, K.: "Enzymatic properties of mutant forms of RNase Rh from Rhizopus niveus as to Asp51." J.Biochem.119 (in press). (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohgi, K., Takeuchi, K., Iwama, M. & Irie, M.: "Enzymatic properties of mutant enzymes at Trp49 and Tyr57 of RNase Rh from Rhizopus niveus." J. Biochem.119. 9-15 (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Ohgi, K., Takeuchi, K., Iwama, M. & Irie, M.: "Enzymatic properties of mutant forms of RNase Rh from Rhizopus niveus as to Asp51." J. Biochem.119. No.3 (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ohgi: "Role of Lys108 in the Enzymatic Activity of RNase Rh from Rhizopus niveus." J.Biochem.117. 27-33 (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] H.Yagi: "Purification of a base non-specific acid ribonuclease from bullfrog(Rana catesbeiana)." Biol.Pharm.Bull.18. 219-220 (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Inokuchi,N.: "Purification,some properties,and primary structure of base non-specific ribonuclease from physarum polycephalum." Journal of Biochemistry. 113. 425-432 (1993)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書
  • [文献書誌] Irie,M.: "pH-profile of kinetic constants of RNase Rh from Rhizopus niveus & it′s mutant enzymes towards UpU & possible mechanism of RNase Rh." Jouranl of Biochemistry. 116(掲載予定). (1994)

    • 関連する報告書
      1993 実績報告書

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公開日: 1993-04-01   更新日: 2016-04-21  

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