| 研究課題/領域番号 |
05640793
|
|---|
| 研究種目 |
一般研究(C)
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 研究分野 |
系統・分類
|
|---|
| 研究機関 | 日本大学 |
|---|
研究代表者 |
井上 正 日本大学, 農獣医学部, 助教授 (90124213)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
1993 – 1994
|
| 研究課題ステータス |
完了 (1994年度)
|
| 配分額 *注記 |
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
1994年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
1993年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
|
|---|
| キーワード | Nosema bombycis / ribosomal RNA / Elongation factor / elongation factor / 微胞子虫 / rRNA遺伝子 / 分子進化 / 真核生物 |
|---|
| 研究概要 |
本研究は、最も早く成立した真核生物の一つではないかと推測されているMicrosporidia属の原生動物N.bombycisとその近縁種を材料として、複数の情報高分子について分析し、Microsporidia属の系統進化学的位置付けを再検討し、さらに真核生物の起源に関し、分子系統学的な考察を加えようとするものである。
Microsporidia試料としては、N.bombycis弱毒系、強毒系、Varimorpha sp.M12,Pleistophora sp.を選び、これらに関してrRNAおよび、分析の際に比較の対象となるデータが蓄積しつつあるelongation factor(EF)の遺伝子に関して、そのconsensussequenceに基づいて設計したprimerを用いてPCR法およびcloningにより配列を試み、これらの実験から選られた結果も含めて、データベースを援用して随時1次構造/高次構造の比較を複数の解析法を用いて行ない、真核生物の起源に関し検討を加えた。
得られたsmall ribosomal subunit RNAの全塩基配列をもとに2次構造モデルを構築したところ、Microsporidiaのsmall ribosomal subunit RNAは一般の原核生物に比較して短く、またそれを反映して真核生物に共通して見られるいくつかのstemを欠失していることが明らかになった。
一方、翻訳される遺伝子としてeleongation factorを選び、その配列を決定するべく各種のPCR primerの検討をおこなったが、現在までに報告されている各種生物のeleongation factorのアミノ酸配列に基づくprimerではdegeneracyが高く、目的のDNA断片を増幅することができなかった。
|
