| 研究概要 |
ニワトリ・ゲノムDNA(雌)の制限酵素Sau3AI部分消化物とコスミドベクターSuper Cos1を用いて構築したニワトリ・ゲノムライブラリーのうち約5ゲノム相当(約1.5×10^5)を,2種類のニワトリW染色体特異的反復配列pUGDO601(a0.7kb unit of the XhoI family)および pUGD1201(a1.2kb unit of the EcoRI family)によりスクリーニングしたところ,XhoIファミリーおよびEcoRIファミリーそれぞれ約900,約600の組換え体よりなるニワトリW染色体特異的遺伝子ライブラリーが作製された。ドットブロットハイブリダイゼーションの結果,約85%の組換え体がW染色体特異的DNAフラグメントを有しており,このライブラリーは全体としてはニワトリW染色体ゲノムの約72%の大きさをカバーするものと推察された。
このW染色体特異的コスミドクローンうちXhoIファミリーおよびEcoRIファミリー各々24体について、10種類の6塩基対認識制限酵素BamHI,EcoRI,EcoRV,HindIII,KpnI,PstI,PvuII,SalI,XbaIおよびXhoIによる部分消化物とSuper Cos1のshort armおよびlong armとのサザンハイブリダイゼーションによって各クローンの制限酵素地図を作成した。さらに,4塩基対認識制限酵素HaeIII,HinfIおよびMspIによる完全消化によって各クローンのDNAフィンガープリントを作成した。これらのデータより,このライブラリーの挿入断片サイズは平均として約40kbであった。またコンティグクローンの検索を試みたところ,XhoIファミリーにおいて3islandsまたEcoRIファミリーにおいて2islandsよりなる部分的なコンティグマップが作成された。これらのコンティグクローンの大きさは平均して約150kbであり,XhoIファミリーの約2.2%およびEcoRIファミリーの約2.7%の大きさをカバーするものと推察され,これは全W染色体の約2.1%に相当するのもと考えられた。
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